stringtranslate.com

Гаплогруппа R-M124

Гаплогруппа R2a , или гаплогруппа R-M124 , представляет собой гаплогруппу Y-хромосомы, характеризующуюся генетическими маркерами M124, P249, P267, L266, и в основном встречается в Южной Азии , а также в Центральной Азии , на Кавказе , в Западной Азии и Северной Африке / на Ближнем Востоке и в Северной Африке .

История термина

Гаплогруппа R2a также известна как гаплогруппа R-M124. [2] Первое упоминание о недавно определенной гаплогруппе «R-M124» датируется 25 августа 2010 года. [4]

До публикации филогенетического древа Y-хромосомы 2005 года гаплогруппа R-M124 была известна как гаплогруппа P1 и ранее считалась сестринской кладой гаплогруппы R, а не произошедшей от нее. [5]

Гаплогруппа R2 чаще всего наблюдается в Азии, особенно на Индийском субконтиненте и в Центральной Азии . [5] Она также с заметной частотой встречается на Кавказе .

Происхождение

По данным Сенгупты и др. (2006),

неопределенность нейтрализует предыдущие выводы о том, что вторжение HGs R1a1 и R2 [теперь R-M124] с северо-запада в дравидийские южные племена можно отнести к одному недавнему событию. Скорее, эти HGs содержат значительную демографическую сложность, как следует из их высокого гаплотипического разнообразия. В частности, они могли фактически прибыть в южную Индию из юго-западного азиатского региона-источника несколько раз, причем некоторые эпизоды произошли значительно раньше других.

Субклады

Парагруппа Р-М124*

Парагруппа — термин, используемый в популяционной генетике для описания линий внутри гаплогруппы , которые не определяются никакими дополнительными уникальными маркерами . Они обычно обозначаются звездочкой ( * ) , которая ставится после основной гаплогруппы.

Y-хромосомы, которые являются положительными для SNP M124, P249, P267 и L266 и отрицательными для SNP L295, L263 и L1069, классифицируются как принадлежащие к парагруппе R-M124*. Она обнаружена в Ираке, до сих пор.

Гаплогруппа R-L295

Гаплогруппа R-L295 — гаплогруппа Y-хромосомы, характеризующаяся генетическим маркером L295. Она обнаружена в Южной Азии , Анатолии , Аравийском полуострове , Европе и Центральной Азии .

Гаплогруппа R-L263

Гаплогруппа R-L263 — гаплогруппа Y-хромосомы, характеризующаяся генетическим маркером L263. Она обнаружена в греческой Малой Азии и Армении до сих пор. [6]

Гаплогруппа R-L1069

Гаплогруппа R-L1069 — гаплогруппа Y-хромосомы, характеризующаяся генетическим маркером L1069. Она обнаружена в Кувейте до сих пор. [6]

Распределение

R-M124 чаще всего наблюдается в Азии, особенно на Индийском субконтиненте и в Центральной Азии [5]. Он также с заметной частотой встречается на Кавказе .

Исторический

Древние образцы гаплогруппы R2a были обнаружены в останках людей из неолита, халколита и бронзового века в Иране и Туране ; и железного века в Южной Азии . R2a также была обнаружена в раскопанных останках в южноазиатских поселениях Саиду Шариф и Буткара более позднего периода. [7]

Южная Айя

Гаплогруппа R-M124, наряду с гаплогруппами H , L , R1a1 и J2 , формирует большинство мужского населения Южной Азии. Частота составляет около 10-15% в Индии и Шри-Ланке и 7-8% в Пакистане . Ее распространение в Южной Азии очень обширно, от Белуджистана на западе до Бенгалии на востоке; Хунзы на севере до Шри-Ланки на юге.

Индия

Среди региональных групп он обнаружен среди западных бенгальцев (23%), индусов Нью-Дели (20%), пенджабцев (5%) и гуджаратцев (3%). [8] Среди племенных групп самый высокий процент показали кармалы Западной Бенгалии - 100% (16/16) [9], за ними следуют лодхи (43%) [10] на востоке, в то время как бхил Гуджарата на западе - 18%, [11] тхару на севере - 17%, [12] ченчу и паллан на юге - 20% и 14% соответственно. [9] [13] Среди кастовых групп высокие проценты показывают джаунпурские кшатрии (87%), камма чаудхари (73%), бихарские ядавы (50%), кхандаяты (46%) и каллары (44%). [9]

Он также значительно высок во многих группах брахманов , включая пенджабских брахманов (25%), бенгальских брахманов (22%), конканастха- брахманов (20%), чатурведи (32%), бхаргавов (32%), кашмирских пандитов (14%) и лингаятских брахманов (30%). [11] [14] [12] [9]

У североиндийских мусульман частота составляет 19% ( сунниты ) и 13% ( шииты ) [14] , в то время как у мусульман Дауди Бохра в западном штате Гуджарат частота составляет 16%, а у мусульман Маппила в Южной Индии частота составляет 5%. [15]

Пакистан

Гаплогруппа R2 в северных регионах Пакистана встречается среди народов бурушо (14%), пуштунов (10%) и хазарейцев (4%). [16] [13]

В южных регионах он встречается среди белуджей (12%), брахуи (12%) и синдхов (5%). [13]

Афганистан

Гаплогруппа R2-M124 встречается с гораздо большей частотой в северных районах Афганистана (11,4%). [17] Хотя истинный процент остается спорным, известно, что гаплогруппа встречается на повышенном уровне среди памирской популяции (число варьируется от 6 до 17% в зависимости от группы). Одно исследование нуристанцев показывает 20% частоту R2 (1/5), хотя и с небольшим размером выборки. [18]

Шри-Ланка

Согласно исследованию 2003 года, 38% сингалов Шри -Ланки оказались R2-положительными. [8]

Центральная Азия

В казахских племенах этот показатель варьируется от 1% до 12%, однако среди племени торе/потомков Чингисхана он достигает более высокого процента – около 25%. [19]

В Центральной Азии, в Таджикистане гаплогруппа R-M124 составляет 6%, в то время как в других «станских» государствах она варьируется около 2%. У бартангисов Таджикистана высокая частота R-M124 — около 17%, у ишкашимцев — 8%, у ходжантов — 9% и у душанбинцев — 6%.

В частности, гаплогруппа R-M124 была обнаружена примерно у 7,5% (4/53) недавних иранских эмигрантов, проживающих в Самарканде , [20] 7,1% (7/99) памирцев , [20] 6,8% (3/44) каракалпаков , [20] 5,1% (4/78) таджиков , [20] 5% (2/40) дунган в Киргизии , [20] 3,3% (1/30) туркмен , [20] 2,2% (8/366) узбеков , [20] и 1,9% (1/54) казахов . [20]

Восточная Азия

Генетическое исследование 2011 года обнаружило R-M124 у 6,7% китайцев-хань из западной провинции Хэнань , 3,4% китайцев-хань из Ганьсу и 2,1–4,2% уйгуров из Синьцзяна . [21]

В статье 2014 года R-M124 был обнаружен в 0,9% (1/110) образцов китайцев хань из Китая . Образец принадлежал человеку из провинции Цзилинь . [22]

Западная Азия и Северная Африка

Частота гаплогруппы R-M124 в 6,1% (6/114) была обнаружена среди всех курдов [23], в то время как в одном исследовании, которое было проведено с 25 образцами курдских курманджи из Грузии , частота R-M124 наблюдалась на уровне 44% (11/25) [24].

На Кавказе высокая частота наблюдалась у армян из Сасона - 17% (18/104) [25], тогда как у армян из Вана она наблюдалась на уровне 1%. R2 был обнаружен у чеченцев - 16%. [26] R-M124 был обнаружен примерно у 8% (2/24) выборки осетин из Алагира . [27]

На Кавказе около 16% горских евреев , 8% балкарцев , [28] 6% калмыков , [29] 3% азербайджанцев , [26] 2,6% кумыков , [30] 2,4% аварцев , [30] 2% армян , [26] и от 1% до 6% грузин [26] [28] [31] принадлежат к гаплогруппе R-M124. Примерно 1% турок [32] и от 1% до 3% иранцев [33] также принадлежат к этой гаплогруппе.

В Иране R-M124 следует аналогичному распределению, как R1a1 , с более высокими процентами в юго-восточном Иране. Он был обнаружен с частотами 9,1% в Исфахане , 6,9% в Хормозгане и 4,2% в Мазандаране. [34]

В проектах R2-M124-WTY и R-Arabia Y-DNA [6] [35] гаплогруппа R-M124 появилась в следующих арабских странах : Кувейт (3 кластера), Объединенные Арабские Эмираты (1 кластер), Сирийская Арабская Республика (1 кластер) и Тунис (1 кластер).

Таким образом, гаплогруппа R-M124 наблюдалась среди арабов с низкой частотой в 11 странах/территориях ( Египет , Иордания , Кувейт , Ливан , Палестина , Катар , Сирия , Тунис , Объединенные Арабские Эмираты и Йемен ) из 22 арабских стран /территорий на данный момент. В Королевстве Саудовская Аравия на данный момент одна семья идентифицирована с гаплогруппой R2A (R-M124) ее отцовского генома или Y-хромосомы обновлено 5 января; 2018.

Положение на дереве ISOGG и соответствующие SNP

Гаплогруппа R-M124 является подгруппой гаплогруппы R-M479 (M479):

Прогнозирование с помощью гаплотипов

Гаплотип может быть использован для предсказания гаплогруппы. Шансы любого человека быть частью этой гаплогруппы самые высокие, если DYS391 =10, DYS392 =10 и DYS426 =12.

Смотрите также

Субклады Y-ДНК R-M207

Y-ДНК остовное дерево

Примечания

  1. ^ ab YFull Haplogroup YTree v5.05 на 30 июля 2017 г.
  2. ^ ab ISOGG (2010), «Y-ДНК гаплогруппа R и ее субклады - 2010».
  3. ^ Проект филогенного древа FTDNA, «Проект филогенного древа FTDNA, архив 2011-07-10 на Wayback Machine ».
  4. ^ Майрес и др. (2010), «Основная гаплогруппа Y-хромосомы R1b эпохи голоцена: эффект основателя в Центральной и Западной Европе - 2010».
  5. ^ abc Манукян, Жан-Грегуар (2006), «Синтез гаплогруппы R2 - 2006».
  6. ^ Проект abc R2-M124-WTY (Прогулка по Y), «Проект R2-M124-WTY (Прогулка по Y)».
  7. ^ Нарасимхан, Вагиш М.; Паттерсон, Ник .; Мурджани, Прия; Лазаридис, Иосиф; Марк, Липсон; Маллик, Свапан; Роланд, Надин; Бернардос, Ребекка; Ким, Александр М. (31 марта 2018 г.). «Геномное формирование Южной и Центральной Азии». bioRxiv : 292581. doi : 10.1101/292581 . hdl : 21.11116/0000-0001-E7B3-0 .
  8. ^ ab Kivisild, T. ; et al. (2003), «Генетическое наследие самых ранних поселенцев сохраняется как в индейских племенах, так и в кастовых популяциях», The American Journal of Human Genetics , 72 (2): 313–32, doi :10.1086/346068, PMC 379225 , PMID  12536373 
  9. ^ abcd Sahoo, S.; et al. (2006), «Предыстория индийских Y-хромосом: оценка сценариев демической диффузии», Труды Национальной академии наук , 103 (4): 843–8, Bibcode : 2006PNAS..103..843S, doi : 10.1073/pnas.0507714103 , PMC 1347984 , PMID  16415161 
  10. ^ Кумар, Викрант и др. (2007). «Данные по Y-хромосоме указывают на общее отцовское наследие австро-азиатских популяций». BMC Evolutionary Biology . 7 : 47. doi : 10.1186/1471-2148-7-47 . PMC 1851701. PMID  17389048 . 
  11. ^ ab Sharma, Swarkar; et al. (2009). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1* подтверждает автохтонное происхождение брахманов и кастовой системы». Journal of Human Genetics . 54 (1): 47–55. doi : 10.1038/jhg.2008.2 . PMID  19158816.
  12. ^ ab Tripathy, Vikal; Nirmala, A.; Reddy, B. Mohan (2008), «Тенденции в молекулярных антропологических исследованиях в Индии» (PDF) , Международный журнал генетики человека , 8 (1–2): 1–20, doi :10.1080/09723757.2008.11886015, S2CID  12763485
  13. ^ abc Sengupta, Sanghamitra; et al. (2006). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы с высоким разрешением в Индии выявляют как коренные, так и экзогенные экспансии и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека . 78 (2): 202–21. doi :10.1086/499411. PMC 1380230. PMID  16400607 . 
  14. ^ ab Zhao, Zhongming; et al. (2009). «Наличие трех различных отцовских линий среди северных индийцев: исследование 560 Y-хромосом». Annals of Human Biology . 36 (1): 46–59. doi :10.1080/03014460802558522. PMC 2755252. PMID  19058044 . 
  15. ^ Eaaswarkhanth, Muthukrishnan; et al. (2009). «Следы южнее Сахары и ближневосточных линий в индийских мусульманских популяциях». European Journal of Human Genetics . 18 (3): 354–63. doi :10.1038/ejhg.2009.168. PMC 2859343. PMID  19809480 . 
  16. ^ Фирасат, Садаф и др. (2006). «Y-хромосомные доказательства ограниченного греческого вклада в пуштунское население Пакистана». Европейский журнал генетики человека . 15 (1): 121–6. doi :10.1038/sj.ejhg.5201726. PMC 2588664. PMID 17047675  . 
  17. ^ Lacau, Harlette (18 апреля 2012 г.). «Афганистан с точки зрения Y-хромосомы». European Journal of Human Genetics . 20 (10): 1063–1070. doi :10.1038/ejhg.2012.59. PMC 3449065. PMID  22510847 . 
  18. ^ Хабер, Марк (28 марта 2012 г.). «Этнические группы Афганистана разделяют Y-хромосомное наследие, структурированное историческими событиями». PLOS ONE . 7 (3): e34288. Bibcode : 2012PLoSO...734288H. doi : 10.1371 /journal.pone.0034288 . PMC 3314501. PMID  22470552. 
  19. ^ Джабагин Максат Кизатович. ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ОБЩЕЙ ГЕНЕТИКИ им. Н.И. ВАВИЛОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК (PDF) (PhD). Российская академия наук.
  20. ^ abcdefgh Уэллс, Р. Спенсер; Юлдашева, Надира; Рузибакиев Руслан; Андерхилл, Питер А.; Евсеева Ирина; Блю-Смит, Джейсон; Джин, Ли; Су, Бинг; Питчаппан, Рамасами; Шанмугалакшми, Садагопал; Балакришнан, Каруппиа; Читай, Марк; Пирсон, Натаниэль М.; Зержал, Татьяна; Вебстер, Мэтью Т.; Жолошвили, Ираклий; Джамарджашвили, Елена; Гамбаров, «Спартак»; Никбин, Бехруз; Достиев, Ашур; Акназаров, Огоназар; Заллуа, Пьер; Цой, Игорь; Китаев Михаил; Миррахимов, Мирсаид; Чариев, Ашир; Бодмер, Уолтер Ф. (28 августа 2001 г.). «Евразийский Heartland: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Труды Национальной академии наук . 98 (18): 10244–10249. Bibcode : 2001PNAS...9810244W. doi : 10.1073/pnas.171305098 . PMC 56946 . PMID  11526236. 
  21. ^ Zhong H, Shi H, Qi XB и др. (январь 2011 г.). «Расширенное исследование Y-хромосомы предполагает постледниковые миграции современных людей в Восточную Азию по северному маршруту». Молекулярная биология и эволюция . 28 (1): 717–27. doi : 10.1093/molbev/msq247 . PMID  20837606.
  22. ^ Ян, Ши; Ван, Чуан-Чао; Чжэн, Хун-Сян; Ван, Вэй; Цинь, Чжэнь-Дун; Вэй, Лан-Хай; Ван, Йи; Пан, Сюэ-Донг; Фу, Вэнь-Цин; Он, Юн-Ганг; Сюн, Ли-Цзюнь; Цзинь, Вэнь-Фей; Ли, Ши-Лин; Ан, Ю; Ли, Хуэй; Джин, Ли; Су, Бинг (29 августа 2014 г.). «Y-хромосомы 40% китайцев происходят от трех неолитических супердедушек». ПЛОС ОДИН . 9 (8): e105691. arXiv : 1310.3897 . Бибкод : 2014PLoSO...9j5691Y. doi : 10.1371/journal.pone.0105691 . PMC 4149484. PMID  25170956 . 
  23. ^ "Курдская генетика - ДНК курдов Курдистана (Ирак-Иран-Турция)". www.khazaria.com . Получено 20 декабря 2019 г. .
  24. ^ "[1]".
  25. ^ "[2]".
  26. ^ abcd Насидзе И, Саркисян Т, Керимов А, Стоункинг М (март 2003 г.). «Проверка гипотез языковой замены на Кавказе: доказательства из Y-хромосомы». Генетика человека . 112 (3): 255–61. doi :10.1007/s00439-002-0874-4. PMID  12596050. S2CID  13232436.[3] Архивировано 10 ноября 2007 г. в Wayback Machine
    Manoukian (2006)
  27. ^ И. Насидзе, Д. Куинк, И. Дюпанлуп и др. , «Генетические доказательства происхождения южных и северных осетин», Annals of Human Genetics (2004) 68, 588–599
  28. ^ ab Винченца Батталья, Симона Форнарино, Надя Аль-Захери и др. , «Y-хромосомные свидетельства культурного распространения сельского хозяйства в юго-восточной Европе», Европейский журнал генетики человека (2008), 1–11
  29. ^ Иван Насидзе, Доминик Квинк, Изабель Дюпанлу, Ричард Кордо, Людмила Кокшунова и Марк Стоункинг, «Генетические доказательства монгольского происхождения калмыков», Американский журнал физической антропологии 126:000–000 (2005).
  30. ^ Аб Юнусбаев и др. (2006): 2/76 = 2,6% R-M124 кумыки, 1/42 = 2,4% R-M124 аварцы
  31. ^ Семино О, Пассарино Г, Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Е., Де Бенедиктис Г., Франкалаччи П., Коуваци А., Лимборска С., Марсикиае М., Мика А., Мика Б., Приморак Д., Сантакьяра-Бенеректи А.С., Кавалли -Сфорца Л.Л., Андерхилл, Пенсильвания (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: взгляд на Y-хромосому» (PDF) . Наука . 290 (5494): 1155–9. Бибкод : 2000Sci...290.1155S. дои : 10.1126/science.290.5494.1155. PMID  11073453. Архивировано из оригинала (PDF) 25 ноября 2003 г.
  32. ^ Cinnioğlu et al. (2003), «Раскопки слоев гаплотипа Y-хромосомы в Анатолии. Архивировано 19 июня 2006 г. в Wayback Machine ».
  33. ^ Regueiro M, Cadenas AM, Gayden T, Underhill PA, Herrera RJ (2006). «Иран: трехконтинентальный узел миграции, вызванной Y-хромосомой». Human Heredity . 61 (3): 132–43. doi :10.1159/000093774. PMID  16770078. S2CID  7017701.
  34. ^ "[4]".
  35. ^ Проект Y-ДНК R-Arabia, «Проект Y-ДНК R-Arabia».
  36. ^ Alshamali, Farida; Pereira, Luísa; Budowle, Bruce; Poloni, Estella S.; Currat, Mathias (2009). «Структура местного населения на Аравийском полуострове, выявленная с помощью Y-STR-разнообразия». Human Heredity . 68 (1): 45–54. doi : 10.1159/000210448 . ISSN  0001-5652. PMID  19339785. S2CID  2751928.
  37. ^ ab Каденас, Алисия М.; Животовский, Лев А.; Кавалли-Сфорца, Лука Л.; Андерхилл, Питер А.; Эррера, Рене Дж. (март 2008 г.). «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив». European Journal of Human Genetics . 16 (3): 374–386. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . ISSN  1476-5438. PMID  17928816. S2CID  32386262.
  38. ^ Mohammad, T.; Xue, Y.; Evison, M.; Tyler-Smith, C. (ноябрь 2009 г.). «Генетическая структура кочевых бедуинов из Кувейта». Heredity . 103 (5): 425–433. doi :10.1038/hdy.2009.72. ISSN  1365-2540. PMC 2869035 . PMID  19639002. 
  39. ^ Флорес, Карлос; Мака-Мейер, Николь; Ларруга, Хосе М.; Кабрера, Висенте М.; Карадшех, Наиф; Гонсалес, Ана М. (сентябрь 2005 г.). «Изоляты в коридоре миграций: высокоразрешающий анализ вариации Y-хромосомы в Иордании». Журнал генетики человека . 50 (9): 435–441. doi : 10.1007/s10038-005-0274-4 . ISSN  1435-232X. PMID  16142507. S2CID  6490283.
  40. ^ Заллуа, Пьер А.; Сюэ, Яли; Халифе, Джейд; Махул, Надин; Дебиан, Лабиб; Платт, Дэниел Э.; Ройюру, Аджай К.; Эррера, Рене Дж.; Эрнанц, Дэвид Ф. Сориа; Блю-Смит, Джейсон; Уэллс, Р. Спенсер; Комас, Дэвид; Бертранпети, Жауме; Тайлер-Смит, Крис (11 апреля 2008 г.). «Y-хромосомное разнообразие в Ливане структурировано недавними историческими событиями». Американский журнал генетики человека . 82 (4): 873–882. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.01.020. ISSN  0002-9297. ПМЦ 2427286 . ПМИД  18374297. 
  41. ^ Майрес и др. (2010), «Основная гаплогруппа Y-хромосомы R1b эпохи голоцена: эффект основателя в Центральной и Западной Европе».
  42. ^ Луис и др. (2004), «Левант против Африканского Рога: доказательства двунаправленных коридоров человеческих миграций. Архивировано 16 февраля 2012 г. на Wayback Machine ».

Ссылки

Внешние ссылки