Супергруппа (биология)

Классификационный ранг живых существ

Супергруппа в эволюционной биологии — это большая группа организмов, имеющих одного общего предка и имеющие важные определяющие характеристики. Это неформальный, в основном произвольный ранг в биологической таксономии , который часто превосходит тип или царство , хотя некоторые супергруппы также рассматриваются как типы . ^[1]

Эукариотические супергруппы

Начиная с десятилетия 2000-х годов эукариотическое древо жизни (сокращенно eToL) было разделено на 5–8 основных групп, называемых «супергруппами». Эти группировки были созданы после идеи о том, что в качестве рангов следует принимать только монофилетические группы, в качестве альтернативы использованию парафилетического царства Protista . ^[2] На заре существования eToL рассматривались шесть традиционных супергрупп: Amoebozoa , Opisthokonta , « Excavata », Archaeplastida , « Chromalveolata » и Rhizaria . С тех пор eToL претерпела глубокие изменения, и большинство этих групп оказались парафилетическими или не имели определяющих морфологических характеристик, объединяющих их членов, что делает ярлык «супергруппа» более произвольным. ^[1]

Филогеномное древо эукариот по состоянию на 2020 год. Супергруппы выделены цветом.

В настоящее время добавление многих линий недавно обнаруженных протистов (таких как Telonemia , Picozoa , Hemimastigophora , Rigifilida ...) и использование филогеномного анализа привели к появлению новой, более точной модели супергруппы. Это текущие супергруппы эукариотов: ^[1]

• ЦАР , составленный Телонемией и кладой САР ( Stramenopiles , Alveolata и Rhizaria ). ^[3] По оценкам, он занимает до половины всего эукариотического разнообразия, поскольку включает несколько основных групп, таких как диатомовые водоросли , динофлагелляты , морские водоросли , инфузории , фораминиферы , радиолярии , а также апикомплексаны и оомицеты- паразиты. ^[1] По существу он содержит большую часть « Chromalveolata ».
• Haptista (также рассматриваемый как тип ), ранее входивший в состав « Chromalveolata », включающий гаптофитные водоросли и центрохелиды .
• Cryptista (также рассматриваемый как тип ), ранее входивший в « Chromalveolata », включающий криптомонады , катаблефариды и загадочные Palpitomonas .
• Археопластиды (также рассматриваемые как царство ), состоящие из линий, которые приобрели хлоропласты посредством первичного эндосимбиоза : Chloroplastida ( зеленые водоросли и наземные растения ), Rhodophyta , Glaucophyta и Rhodelphis .
• Amorphea , состоящая из Amoebozoa и Opisthokonta ( животных , грибов и родственных им протистов). Они родственны бревиатам и апусомонадам и вместе образуют кладу Обазоа .
• CRuMs , состоящие из свободноживущих групп простейших Collodictyonidae , Rigifilida и Mantamonas .
• Дискоба , состоящая из Discicristata ( Euglenozoa и Heterolobosea ), Jakobida и Tsukubamonas . Это самая большая сохранившаяся клада « Раскопок ».
• Метамонада , ранее входившая в состав « Раскопок », полностью содержащая анаэробных протистов.
• Hemimastigophora , ранее принадлежавшая к группе-сироте, но недавно включенная в Diaphoretickes . ^[4]
• Provora , самая последняя супергруппа, в которую входит ранее осиротевшая Ancoracysta . ^[4]

Многие группы-сироты свободноживущих простейших остаются позади и не могут быть добавлены в супергруппу, такие как: Picozoa (возможно, принадлежит к Archaeplastida с ограниченной уверенностью), Malawimonadida (считается родственной Metamonada ), Ancyromonadida , Breviatea , Apusomonadida , и т. д. ^[1]

Возможная современная топология eToL может быть следующей (супергруппы выделены жирным шрифтом ): ^{[5] [4]}

Прокариотические супергруппы

Термин «супергруппа» используется в филогенетических исследованиях бактерий в меньшем смысле, чем у эукариот. По состоянию на 2021 год он очень часто используется для обозначения клад внутри рода Wolbachia . ^{[6] [7] [8]}

Рекомендации

1. Burki F, Роджер AJ, Браун MW, Симпсон AGB (январь 2020 г.). «Новое дерево эукариотов». Тенденции Эколь Эвол . 35 (1): 43–55. дои : 10.1016/j.tree.2019.08.008 . ПМИД  31606140.
2. Симпсон, Аластер ГБ; Роджер, Эндрю Дж. (2004). «Настоящие «царства» эукариотов». Современная биология . 14 (17): Р693–Р696. дои : 10.1016/j.cub.2004.08.038 . PMID  15341755. S2CID  207051421.
3. Штрассерт Дж.Ф.Х., Джейми М., Мыльников А.П., Тихоненков Д.В., Бурки Ф. (апрель 2019 г.). «Новый филогеномический анализ загадочного типа телонемии еще больше раскрывает древо жизни эукариот». Молекулярная биология и эволюция . 36 (4): 757–765. дои : 10.1093/molbev/msz012 . ПМК 6844682 . 
4. Тихоненков, Денис В.; Михайлов Кирилл В.; Гаврилюк, Райан М.Р.; Беляев Артем О.; Матур, Варша; Карпов Сергей А.; Загумённый Дмитрий Георгиевич; Бородина Анастасия С.; Прокина Кристина И.; Мыльников Александр П.; Алеошин Владимир Владимирович; Килинг, Патрик Дж. (2022). «Микробные хищники образуют новую супергруппу эукариот». Природа . дои : 10.1038/s41586-022-05511-5. ПМИД  36477531.
5. Браун MW и др. (2018), «Филогеномика помещает сиротские линии протистанов в новую супергруппу эукариот», Genome Biology and Evolution , 10 (2): 427–433, doi : 10.1093/gbe/evy014 , PMC 5793813 
6. Бальдо Л., Веррен Дж. Х. (2007). «Возвращаясь к типированию супергруппы Wolbachia на основе WSP: ложные линии происхождения и разногласия с MLST». Карр Микробиол . 55 : 81–87. дои : 10.1007/s00284-007-0055-8.
7. Конечка, Эдита; Ольшановский, Зиемовит (2021). «Супергруппа E Wolbachia обнаружена у Hypochthonius rufulus (Acari: Oribatida) в Польше». Инфекция, генетика и эволюция . 91 (104829). дои : 10.1016/j.meegid.2021.104829 . ISSN  1567-1348.
8. Ковацин С, Баркер SC (2007). «Бактерии супергруппы F Wolbachia паразитируют на вшах (Insecta: Phthiraptera)». Паразитол Рес . 100 : 479–485. дои : 10.1007/s00436-006-0309-6.