stringtranslate.com

Деметилаза

Деметилазы — это ферменты , которые удаляют метильные (CH 3 ) группы из нуклеиновых кислот , белков (особенно гистонов ) и других молекул. Деметилазы — важные эпигенетические белки, поскольку они отвечают за транскрипционную регуляцию генома , контролируя метилирование ДНК и гистонов, и, в более широком смысле, состояние хроматина в определенных локусах генов .

Деметилирование лизина гистона

Механизмы деметилирования лизина гистонлизиндеметилазы 1A (KDM1A) и гистонлизиндеметилаз, содержащих домен JmjC (JHDMs). Оба механизма включают окисление метильной группы (с FAD или α-кетоглутаратом в качестве кофакторов) с последующим устранением формальдегида . Механизм KDM1A и KDM1B зависит от образования промежуточного иминиевого соединения, и поэтому они могут деметилировать только моно- и диметилированные лизиновые субстраты.

Метилирование гистонов изначально считалось фактически необратимым процессом, поскольку период полураспада метилирования гистонов был приблизительно равен периоду полураспада гистона. [1] Гистонлизиндеметилаза LSD1 (позже классифицированная как KDM1A) была впервые идентифицирована в 2004 году как гомолог ядерной аминоксидазы. [2] Существуют два основных класса гистонлизиндеметилаз, определяемых их механизмами: флавинадениндинуклеотид (FAD) -зависимые аминоксидазы и α-кетоглутарат-зависимые гидроксилазы .

Гистоновые лизиновые деметилазы обладают множеством доменов , которые отвечают за распознавание гистонов, связывание ДНК, связывание метилированного аминокислотного субстрата и каталитическую активность. Они включают:

Гистоновые лизиновые деметилазы классифицируются в соответствии с их доменами и уникальными субстратными специфичностями. Лизиновые субстраты идентифицируются в соответствии с их положением в соответствующей аминокислотной последовательности гистона и состоянием метилирования (например, H3K9me3 относится к триметилированному гистону 3 лизину 9.)

Структура JmJDA (координаты из файла PDB: 2UXX); Некоторые домены сверху выделены: JmJ (N-конец, красный; C-конец, желтый), домен цинкового пальца (светло-фиолетовый), бета-шпилька (светло-голубой) и линкер смешанного домена (зеленый).
Структура KDM1A (координаты из файла PDB:2Z5U)
КДМ1
Гомологи KDM1 включают KDM1A и KDM1B . KDM1A деметилирует H3K4me1/2 и H3K9me1/2, а KDM1B эметилирует H3K4me1/2. Активность KDM1 имеет решающее значение для эмбриогенеза и тканеспецифической дифференциации , а также для роста ооцитов. [1] Удаление гена KDM1A может оказывать влияние на рост и дифференциацию эмбриональных стволовых клеток и является универсально летальным у нокаутированных мышей . [5] [6] Наблюдается, что экспрессия гена KDM1A повышается при некоторых видах рака, [7] [8] поэтому ингибирование KDM1A поэтому рассматривается как возможное эпигенетическое лечение рака. [9] [10] [11] :KDM1B, однако, в основном участвует в развитии ооцитов . Удаление этого гена приводит к летальности по материнскому эффекту у мышей. [12] Ортологи KDM1 у D. melanogaster и C. elegans , по-видимому, функционируют аналогично KDM1B, а не KDM1A. [13] [14]
КДМ2
Гомологи KDM2 включают KDM2A и KDM2B . KDM2A и KDM2B деметилируют H3K4me3 и H3K36me2/3. KDM2A играет роль либо в стимулировании, либо в ингибировании функции опухоли, а KDM2B играет роль в онкогенезе . [1] KDM2A и KDM2B обладают доменами цинковых пальцев CXXC, ответственными за связывание с неметилированными островками CpG, и считается, что они могут связываться со многими регуляторными элементами генов при отсутствии факторов транскрипции, специфичных для последовательности. [15] : Сверхэкспрессия KDM2B наблюдалась в человеческой лимфоме и аденокарциноме , а недостаточно экспрессированная KDM2B наблюдалась в раке предстательной железы и глиобластоме человека. Было также показано, что KDM2B предотвращает старение в некоторых клетках посредством эктопической экспрессии . [16]
КДМ3
Гомологи KDM3 включают KDM3A , KDM3B и KDM3C . KDM3A, KDM3B и KDM3C деметилируют H3K9me1/2. KDM3A играет роль в сперматогенезе и метаболических функциях, однако активность KDM3B и KDM3C конкретно не известна. [1] : Исследования нокдауна KDM3A у мышей привели к мужскому бесплодию и ожирению во взрослом возрасте. Дополнительные исследования показали, что KDM3A может играть роль в регуляции генов, зависящих от андрогенных рецепторов, а также генов, участвующих в плюрипотентности , что указывает на потенциальную роль KDM3A в онкогенезе. [17]
КДМ4
Гомологи KDM4 включают KDM4A , KDM4B , KDM4C , KDM4D , KDM4E и KDM4F. KDM4A, KDM4B и KDM4C деметилируют H3K9me2/3, H3K9me3 и H3K36me2/3, а KDM4D, KDM4E и KDM4F деметилируют H3K9me2/3. KDM4A, KDM4B, KDM4C и KDM4D играют роль в онкогенезе , однако активность KDM4E и KDM4F конкретно не известна. [1] Повышение регуляции KDM4B наблюдалось при медуллобластоме, а амплификация KDM4C была задокументирована при плоскоклеточной карциноме пищевода, медуллобластоме и раке молочной железы. [18] [19] [20] [21] Другие данные об экспрессии генов также предполагают, что KDM4A, KDM4B и KDM4C сверхэкспрессируются при раке предстательной железы. [22]
КДМ5
Гомологи KDM5 включают KDM5A , KDM5B , KDM5C и KDM5D . KDM5A, KDM5B, KDM5C и KDM5D деметилируют H3K4me2/3. [1] Семейство KDM5, по-видимому, регулирует ключевые функции развития, включая клеточную дифференцировку, митохондриальную функцию и прогрессию клеточного цикла . [23] [24] [25] [26] [27] [28] KDM5B и KDM5C также взаимодействуют с белками PcG, которые участвуют в репрессии транскрипции. Мутации KDM5C на X-хромосоме также наблюдались у пациентов с X-сцепленной интеллектуальной инвалидностью. [29] Истощение гомологов KDM5C у D. rerio показало дефекты мозгового паттерна и гибель нейронных клеток. [30]
КДМ6
Семейство KDM6 включает KDM6A , KDM6B и KDM6C . KDM6A и KDM6B деметилируют H3K27me2/3, а KDM4C деметилирует H3K27me3. KDM6A и KDM6B обладают свойствами подавления опухолей. Снижение уровня KDM6A в фибробластах приводит к немедленному увеличению популяции фибробластов. KDM6B, экспрессируемый в фибробластах, индуцирует онкогены пути Ras/Raf/MEK/ERK. [31] Точечные мутации KDM6A были идентифицированы как одна из причин синдрома Кабуки , врожденного заболевания, приводящего к умственной отсталости. [32] [33] Удаление KDM6A у D. rerio приводит к снижению экспрессии генов HOX, которые играют роль в регуляции паттерна тела во время развития. [34] В исследованиях млекопитающих было показано, что KDM6A также регулирует гены HOX. [35] [36] Мутация KDM5B нарушает развитие гонад у C.elegans . [35] Другие исследования показали, что экспрессия KDM6B повышается в активированных макрофагах и динамически экспрессируется во время дифференциации стволовых клеток . [37] [38]

Деметилирование эфира

Мультяшное изображение молекулярной структуры белка, зарегистрированного под кодом 1A2O pdb.

Другим примером деметилазы является протеин-глутаматметилэстераза , также известная как белок CheB (EC 3.1.1.61), которая деметилирует MCP ( метил -акцепторные белки хемотаксиса ) посредством гидролиза связей карбоксильных эфиров. Ассоциация рецептора хемотаксиса с агонистом приводит к фосфорилированию CheB. Фосфорилирование белка CheB усиливает его каталитическую активность деметилирования MCP, что приводит к адаптации клетки к стимулам окружающей среды. [39] MCP реагируют на внеклеточные аттрактанты и репелленты в бактериях, таких как E. coli, в регуляции хемотаксиса . CheB более конкретно называется метилэстеразой , поскольку она удаляет метильные группы из остатков метилглутамата, расположенных на MCP, посредством гидролиза, производя глутамат, сопровождаемый высвобождением метанола . [40]

CheB представляет особый интерес для исследователей, поскольку он может быть терапевтической мишенью для смягчения распространения бактериальных инфекций. [41]

Сигнализация хемотаксиса. Хемоаттрактанты или репелленты воспринимаются трансмембранными рецепторами. Обратите внимание на роль CheB (B) в деметилировании рецепторов MCP. [39]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abcdef Pedersen MT, Helin K (ноябрь 2010). «Гистоновые деметилазы в развитии и болезнях». Trends in Cell Biology . 20 (11): 662–71. doi :10.1016/j.tcb.2010.08.011. PMID  20863703.
  2. ^ Shi Y, Lan F, Matson C, Mulligan P, Whetstine JR, Cole PA, Casero RA, Shi Y (декабрь 2004 г.). «Деметилирование гистонов, опосредованное гомологом ядерной аминоксидазы LSD1». Cell . 119 (7): 941–53. doi : 10.1016/j.cell.2004.12.012 . PMID  15620353.
  3. ^ Mosammaparast N, Shi Y (2010). «Обратное метилирование гистонов: биохимические и молекулярные механизмы гистоновых деметилаз». Annual Review of Biochemistry . 79 : 155–79. doi : 10.1146/annurev.biochem.78.070907.103946. PMID  20373914.
  4. ^ Aprelikova O, Chen K, El Touny LH, Brignatz-Guittard C, Han J, Qiu T, Yang HH, Lee MP, Zhu M, Green JE (апрель 2016 г.). «Эпигенетический модификатор JMJD6 усиливается в опухолях молочной железы и взаимодействует с c-Myc для усиления клеточной трансформации, прогрессирования опухоли и метастазирования». Clin Epigenetics . 8 (38): 38. doi : 10.1186/s13148-016-0205-6 . PMC 4831179 . PMID  27081402. 
  5. ^ Wang J, Hevi S, Kurash JK, Lei H, Gay F, Bajko J, Su H, Sun W, Chang H, Xu G, Gaudet F, Li E, Chen T (январь 2009 г.). «Лизиндеметилаза LSD1 (KDM1) необходима для поддержания глобального метилирования ДНК». Nature Genetics . 41 (1): 125–9. doi :10.1038/ng.268. PMID  19098913. S2CID  2010695.
  6. ^ Wang J, Scully K, Zhu X, Cai L, Zhang J, Prefontaine GG, Krones A, Ohgi KA, Zhu P, Garcia-Bassets I, Liu F, Taylor H, Lozach J, Jayes FL, Korach KS, Glass CK, Fu XD, Rosenfeld MG (апрель 2007 г.). «Противоположные комплексы LSD1 функционируют в программах активации и репрессии генов развития». Nature . 446 (7138): 882–7. Bibcode :2007Natur.446..882W. doi :10.1038/nature05671. PMID  17392792. S2CID  4387240.
  7. ^ Kahl P, Gullotti L, Heukamp LC, Wolf S, Friedrichs N, Vorreuther R, Solleder G, Bastian PJ, Ellinger J, Metzger E, Schüle R, Buettner R (декабрь 2006 г.). «Коактиваторы андрогеновых рецепторов лизин-специфическая гистондеметилаза 1 и четыре с половиной белка домена LIM 2 предсказывают риск рецидива рака простаты». Cancer Research . 66 (23): 11341–7. doi :10.1158/0008-5472.CAN-06-1570. PMID  17145880.
  8. ^ Lim S, Janzer A, Becker A, Zimmer A, Schüle R, Buettner R, Kirfel J (март 2010 г.). «Лизин-специфическая деметилаза 1 (LSD1) высоко экспрессируется в ER-отрицательных раковых опухолях груди и является биомаркером, предсказывающим агрессивную биологию». Carcinogenesis . 31 (3): 512–20. doi :10.1093/carcin/bgp324. PMID  20042638.
  9. ^ Мецгер Э., Виссманн М., Инь Н., Мюллер Дж.М., Шнайдер Р., Петерс А.Х., Гюнтер Т., Бюттнер Р., Шюле Р. (сентябрь 2005 г.). «LSD1 деметилирует репрессивные метки гистонов, чтобы способствовать транскрипции, зависимой от андрогенных рецепторов». Природа . 437 (7057): 436–9. Бибкод : 2005Natur.437..436M. дои : 10.1038/nature04020. PMID  16079795. S2CID  4308627.
  10. ^ Schulte JH, Lim S, Schramm A, Friedrichs N, Koster J, Versteeg R, Ora I, Pajtler K, Klein-Hitpass L, Kuhfittig-Kulle S, Metzger E, Schüle R, Eggert A, Buettner R, Kirfel J (март 2009 г.). «Лизин-специфическая деметилаза 1 сильно выражена в слабодифференцированной нейробластоме: последствия для терапии». Cancer Research . 69 (5): 2065–71. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-08-1735 . PMID  19223552.
  11. ^ Wang Y, Zhang H, Chen Y, Sun Y, Yang F, Yu W, Liang J, Sun L, Yang X, Shi L, Li R, Li Y, Zhang Y, Li Q, Yi X, Shang Y (август 2009 г.). «LSD1 является субъединицей комплекса NuRD и нацелен на программы метастазирования при раке молочной железы». Cell . 138 (4): 660–72. doi : 10.1016/j.cell.2009.05.050 . PMID  19703393.
  12. ^ Ciccone DN, Su H, Hevi S, Gay F, Lei H, Bajko J, Xu G, Li E, Chen T (сентябрь 2009 г.). "KDM1B — это деметилаза гистона H3K4, необходимая для установления материнских геномных импринтов". Nature . 461 (7262): 415–8. Bibcode :2009Natur.461..415C. doi :10.1038/nature08315. PMID  19727073. S2CID  1143128.
  13. ^ Rudolph T, Yonezawa M, Lein S, Heidrich K, Kubicek S, Schäfer C, Phalke S, Walther M, Schmidt A, Jenuwein T, Reuter G (апрель 2007 г.). «Формирование гетерохроматина у дрозофилы инициируется активным удалением метилирования H3K4 гомологом LSD1 SU(VAR)3-3». Molecular Cell . 26 (1): 103–15. doi : 10.1016/j.molcel.2007.02.025 . PMID  17434130.
  14. ^ Di Stefano L, Ji JY, Moon NS, Herr A, Dyson N (май 2007 г.). «Мутация Drosophila Lsd1 нарушает метилирование H3-K4, что приводит к тканеспецифическим дефектам во время развития». Current Biology . 17 (9): 808–12. doi :10.1016/j.cub.2007.03.068. PMC 1909692 . PMID  17462898. 
  15. ^ Blackledge NP, Zhou JC, Tolstorukov MY, Farcas AM, Park PJ, Klose RJ (апрель 2010 г.). «CpG-островки рекрутируют деметилазу лизина 36 гистона H3». Molecular Cell . 38 (2): 179–90. doi :10.1016/j.molcel.2010.04.009. PMC 3098377 . PMID  20417597. 
  16. ^ He J, Kallin EM, Tsukada Y, Zhang Y (ноябрь 2008 г.). «Деметилаза H3K36 Jhdm1b/Kdm2b регулирует пролиферацию и старение клеток через p15(Ink4b)». Nature Structural & Molecular Biology . 15 (11): 1169–75. doi :10.1038/nsmb.1499. PMC 2612995 . PMID  18836456. 
  17. ^ Loh YH, Zhang W, Chen X, George J, Ng HH (октябрь 2007 г.). «Деметилазы гистона H3 Lys 9 Jmjd1a и Jmjd2c регулируют самообновление в эмбриональных стволовых клетках». Genes & Development . 21 (20): 2545–57. doi :10.1101/gad.1588207. PMC 2000320 . PMID  17938240. 
  18. ^ Ehrbrecht A, Müller U, Wolter M, Hoischen A, Koch A, Radlwimmer B, Actor B, Mincheva A, Pietsch T, Lichter P, Reifenberger G, Weber RG (март 2006 г.). «Комплексный геномный анализ десмопластических медуллобластом: идентификация новых амплифицированных генов и отдельная оценка различных гистологических компонентов». The Journal of Pathology . 208 (4): 554–63. doi :10.1002/path.1925. PMID  16400626. S2CID  1463027.
  19. ^ Liu G, Bollig-Fischer A, Kreike B, van de Vijver MJ, Abrams J, Ethier SP, Yang ZQ (декабрь 2009 г.). «Геномная амплификация и онкогенные свойства гена гистондеметилазы GASC1 при раке груди». Oncogene . 28 (50): 4491–500. doi :10.1038/onc.2009.297. PMC 2795798 . PMID  19784073. 
  20. ^ Northcott PA, Nakahara Y, Wu X, Feuk L, Ellison DW, Croul S, Mack S, Kongkham PN, Peacock J, Dubuc A, Ra YS, Zilberberg K, McLeod J, Scherer SW, Sunil Rao J, Eberhart CG, Grajkowska W, Gillespie Y, Lach B, Grundy R, Pollack IF, Hamilton RL, Van Meter T, Carlotti CG, Boop F, Bigner D, Gilbertson RJ, Rutka JT, Taylor MD (апрель 2009 г.). «Множественные повторяющиеся генетические события сходятся в контроле метилирования лизина гистонов при медуллобластоме». Nature Genetics . 41 (4): 465–72. doi :10.1038/ng.336. PMC 4454371 . PMID  19270706. 
  21. ^ Ян ZQ, Имото И, Фукуда Ю, Пимхаокхам А, Симада Ю, Имамура М, Сугано С, Накамура Ю, Инадзава Дж (сентябрь 2000 г.). «Идентификация нового гена, GASC1, в ампликоне 9p23-24, часто обнаруживаемого в клеточных линиях рака пищевода». Исследования рака . 60 (17): 4735–9. ПМИД  10987278.
  22. ^ Cloos PA, Christensen J, Agger K, Maiolica A, Rappsilber J , Antal T, Hansen KH, Helin K (июль 2006 г.). «Предполагаемый онкоген GASC1 деметилирует три- и диметилированный лизин 9 на гистоне H3». Nature . 442 (7100): 307–11. Bibcode :2006Natur.442..307C. doi :10.1038/nature04837. PMID  16732293. S2CID  2874903.
  23. ^ Lee N, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Jones RS, Zhang Y (март 2009). «Крышка деметилазы H3K4 ассоциируется с гистондеацетилазой Rpd3 и ингибирует ее». Молекулярная и клеточная биология . 29 (6): 1401–10. doi :10.1128/MCB.01643-08. PMC 2648242. PMID  19114561 . 
  24. ^ Беневоленская EV, Murray HL, Branton P, Young RA, Kaelin WG (июнь 2005 г.). «Связывание pRB с белком PHD RBP2 способствует клеточной дифференцировке». Molecular Cell . 18 (6): 623–35. doi : 10.1016/j.molcel.2005.05.012 . PMID  15949438.
  25. ^ Lopez-Bigas N, Kisiel TA, Dewaal DC, Holmes KB, Volkert TL, Gupta S, Love J, Murray HL, Young RA, Benevolenskaya EV (август 2008). "Genome-wide analysis of the H3K4 histone demethylase RBP2 reveals a transcriptional program controlingdifferentiation". Molecular Cell . 31 (4): 520–30. doi :10.1016/j.molcel.2008.08.004. PMC 3003864 . PMID  18722178. 
  26. ^ Pasini D, Hansen KH, Christensen J, Agger K, Cloos PA, Helin K (май 2008 г.). «Скоординированная регуляция транскрипционной репрессии деметилазой RBP2 H3K4 и комплексом Polycomb-Repressive 2». Genes & Development . 22 (10): 1345–55. doi :10.1101/gad.470008. PMC 2377189 . PMID  18483221. 
  27. ^ ван Овелен С., Ван Дж., Асп П., Ян К., Кэлин В.Г., Клюгер Ю., Динлахт Б.Д. (ноябрь 2008 г.). «Роль Sin3 млекопитающих в постоянном молчании генов». Молекулярная клетка . 32 (3): 359–70. doi :10.1016/j.molcel.2008.10.015. ПМК 3100182 . ПМИД  18995834. 
  28. ^ Zeng J, Ge Z, Wang L, Li Q, Wang N, Björkholm M, Jia J, Xu D (март 2010 г.). «Гистондеметилаза RBP2 сверхэкспрессируется при раке желудка, и ее ингибирование вызывает старение раковых клеток». Гастроэнтерология . 138 (3): 981–92. doi :10.1053/j.gastro.2009.10.004. PMID  19850045.
  29. ^ Jensen LR, Amende M, Gurok U, Moser B, Gimmel V, Tzschach A, Janecke AR, Tariverdian G, Chelly J, Fryns JP, Van Esch H, Kleefstra T, Hamel B, Moraine C, Gecz J, Turner G, Reinhardt R, Kalscheuer VM, Ropers HH, Lenzner S (февраль 2005 г.). «Мутации в гене JARID1C, который участвует в регуляции транскрипции и ремоделировании хроматина, вызывают умственную отсталость, связанную с Х-хромосомой». American Journal of Human Genetics . 76 (2): 227–36. doi :10.1086/427563. PMC 1196368 . PMID  15586325. 
  30. ^ Iwase S, Lan F, Bayliss P, de la Torre-Ubieta L, Huarte M, Qi HH, Whetstine JR, Bonni A, Roberts TM, Shi Y (март 2007 г.). «Ген умственной отсталости, связанный с Х-хромосомой SMCX/JARID1C, определяет семейство деметилаз лизина 4 гистона H3». Cell . 128 (6): 1077–88. doi : 10.1016/j.cell.2007.02.017 . PMID  17320160.
  31. ^ Agger K, Cloos PA, Rudkjaer L, Williams K, Andersen G, Christensen J, Helin K (май 2009 г.). «Деметилаза H3K27me3 JMJD3 способствует активации локуса INK4A-ARF в ответ на старение, вызванное онкогенами и стрессом». Genes & Development . 23 (10): 1171–6. doi :10.1101/gad.510809. PMC 2685535 . PMID  19451217. 
  32. ^ Lederer D, Grisart B, Digilio MC, Benoit V, Crespin M, Ghariani SC, Maystadt I, Dallapiccola B, Verellen-Dumoulin C (январь 2012 г.). «Деление KDM6A, гистоновой деметилазы, взаимодействующей с MLL2, у трех пациентов с синдромом Кабуки». American Journal of Human Genetics . 90 (1): 119–24. doi :10.1016/j.ajhg.2011.11.021. PMC 3257878 . PMID  22197486. 
  33. ^ Мияке Н., Мизуно С., Окамото Н., Охаси Х., Шиина М., Огата К., Цурусаки Ю., Накашима М., Сайтсу Х., Ниикава Н., Мацумото Н. (январь 2013 г.). «Точковые мутации KDM6A вызывают синдром Кабуки». Человеческая мутация . 34 (1): 108–10. дои : 10.1002/humu.22229 . PMID  23076834. S2CID  1745473.
  34. ^ Лан Ф., Бейлисс П.Е., Ринн Дж.Л., Уэтстайн Дж.Р., Ван Дж.К., Чен С., Ивасе С., Алпатов Р., Исаева И., Канаани Э., Робертс Т.М., Чанг ХИ, Ши Ю (октябрь 2007 г.). «Деметилаза лизина 27 гистона H3 регулирует заднее развитие животных». Природа . 449 (7163): 689–94. Бибкод : 2007Natur.449..689L. дои : 10.1038/nature06192. PMID  17851529. S2CID  612144.
  35. ^ ab Agger K, Cloos PA, Christensen J, Pasini D, Rose S, Rappsilber J, Issaeva I, Canaani E, Salcini AE, Helin K (октябрь 2007 г.). «UTX и JMJD3 представляют собой деметилазы гистонов H3K27, участвующие в регуляции и развитии гена HOX». Природа . 449 (7163): 731–4. Бибкод : 2007Natur.449..731A. дои : 10.1038/nature06145. PMID  17713478. S2CID  4413812.
  36. ^ Wang JK, Tsai MC, Poulin G, Adler AS, Chen S, Liu H, Shi Y, Chang HY (февраль 2010 г.). «Гистондеметилаза UTX обеспечивает RB-зависимый контроль судьбы клеток». Genes & Development . 24 (4): 327–32. doi :10.1101/gad.1882610. PMC 2816731 ​​. PMID  20123895. 
  37. ^ De Santa F, Totaro MG, Prosperini E, Notarbartolo S, Testa G, Natoli G (сентябрь 2007 г.). «Деметилаза лизина-27 гистона H3 Jmjd3 связывает воспаление с ингибированием подавления генов, опосредованного поликомбом». Cell . 130 (6): 1083–94. doi : 10.1016/j.cell.2007.08.019 . PMID  17825402.
  38. ^ Burgold T, Spreafico F, De Santa F, Totaro MG, Prosperini E, Natoli G, Testa G (2008). "Деметилаза Jmjd3, специфичная для лизина 27 гистона H3, необходима для нейронной фиксации". PLOS ONE . ​​3 (8): e3034. Bibcode :2008PLoSO...3.3034B. doi : 10.1371/journal.pone.0003034 . PMC 2515638 . PMID  18716661. 
  39. ^ ab Владимиров Н, Левдок Л, Лебедь Д, Суржик В (декабрь 2008 г.). "Зависимость бактериального хемотаксиса от формы градиента и скорости адаптации". PLOS Computational Biology . 4 (12): e1000242. Bibcode :2008PLSCB...4E0242V. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000242 . PMC 2588534. PMID  19096502 . 
  40. ^ Park SY, Borbat PP, Gonzalez-Bonet G, Bhatnagar J, Pollard AM, Freed JH, Bilwes AM, Crane BR (май 2006 г.). «Реконструкция сборки рецептора хемотаксиса-киназы». Nature Structural & Molecular Biology . 13 (5): 400–7. doi :10.1038/nsmb1085. PMID  16622408. S2CID  859928.
  41. ^ West AH, Martinez-Hackert E, Stock AM (июль 1995). «Кристаллическая структура каталитического домена метилэстеразы рецептора хемотаксиса, CheB». Журнал молекулярной биологии . 250 (2): 276–90. doi :10.1006/jmbi.1995.0376. PMID  7608974.