stringtranslate.com

Дупликация генов

Дупликация генов (или хромосомная дупликация или амплификация генов ) является основным механизмом, посредством которого генерируется новый генетический материал в ходе молекулярной эволюции . Ее можно определить как любую дупликацию области ДНК , содержащей ген . Дупликации генов могут возникать как продукты нескольких типов ошибок в репликации ДНК и механизмах восстановления , а также в результате случайного захвата эгоистичными генетическими элементами. Распространенными источниками дупликации генов являются эктопическая рекомбинация , событие ретротранспозиции , анеуплоидия , полиплоидия и проскальзывание репликации . [1]

Механизмы дублирования

Эктопическая рекомбинация

Дупликации возникают из-за события, называемого неравным кроссинговером , которое происходит во время мейоза между невыровненными гомологичными хромосомами. Вероятность того, что это произойдет, зависит от степени совместного использования повторяющихся элементов между двумя хромосомами. Продуктами этой рекомбинации являются дупликация в месте обмена и взаимная делеция. Эктопическая рекомбинация обычно опосредована сходством последовательностей в точках разрыва дубликатов, которые образуют прямые повторы. Повторяющиеся генетические элементы, такие как транспонируемые элементы, предлагают один из источников повторяющейся ДНК, которая может способствовать рекомбинации, и они часто встречаются в точках разрыва дупликации у растений и млекопитающих. [2]

Схема участка хромосомы до и после дупликации

Проскальзывание репликации

Проскальзывание репликации — это ошибка в репликации ДНК, которая может приводить к дупликациям коротких генетических последовательностей. Во время репликации ДНК-полимераза начинает копировать ДНК. В какой-то момент процесса репликации полимераза отделяется от ДНК, и репликация останавливается. Когда полимераза снова присоединяется к цепи ДНК, она выравнивает реплицирующую цепь в неправильном положении и случайно копирует один и тот же участок более одного раза. Проскальзывание репликации также часто облегчается повторяющимися последовательностями, но требует всего нескольких оснований сходства. [ необходима цитата ]

Ретротранспозиция

Ретротранспозоны , в основном L1 , могут иногда воздействовать на клеточную мРНК. Транскрипты подвергаются обратной транскрипции в ДНК и вставляются в случайное место генома, создавая ретрогены. Полученная последовательность обычно не содержит интронов и часто содержит поли(А)-последовательности, которые также интегрированы в геном. Многие ретрогены демонстрируют изменения в регуляции генов по сравнению с их родительскими генными последовательностями, что иногда приводит к новым функциям. Ретрогены могут перемещаться между различными хромосомами, формируя хромосомную эволюцию. [3]

Анеуплоидия

Анеуплоидия происходит, когда нерасхождение в одной хромосоме приводит к аномальному числу хромосом. Анеуплоидия часто вредна и у млекопитающих регулярно приводит к спонтанным абортам (выкидышам). Некоторые анеуплоидные особи жизнеспособны, например, трисомия 21 у людей, которая приводит к синдрому Дауна . Анеуплоидия часто изменяет дозировку генов способами, которые пагубны для организма; поэтому маловероятно, что она распространится в популяции.

Полиплоидия

Полиплоидия , или дупликация всего генома, является продуктом нерасхождения во время мейоза, что приводит к появлению дополнительных копий всего генома. Полиплоидия распространена среди растений, но она также наблюдалась у животных, с двумя раундами дупликации всего генома ( событие 2R ) в линии позвоночных, ведущей к человеку. [4] Она также наблюдалась у дрожжей-гемиаскомицетов ~100 млн лет назад. [5] [6]

После дупликации всего генома наступает относительно короткий период нестабильности генома, обширной потери генов, повышенных уровней замены нуклеотидов и перестройки регуляторной сети. [7] [8] Кроме того, значительную роль играют эффекты дозировки генов. [9] Таким образом, большинство дубликатов теряются в течение короткого периода, однако значительная часть дубликатов выживает. [10] Интересно, что гены, участвующие в регуляции, преимущественно сохраняются. [11] [12] Более того, сохранение регуляторных генов, в первую очередь генов Hox , привело к адаптивным инновациям.

Быстрая эволюция и функциональная дивергенция наблюдались на уровне транскрипции дублированных генов, обычно за счет точечных мутаций в коротких мотивах связывания факторов транскрипции. [13] [14] Кроме того, быстрая эволюция мотивов фосфорилирования белков, обычно встроенных в быстро развивающиеся внутренне неупорядоченные области, является еще одним фактором, способствующим выживанию и быстрой адаптации/неофункционализации дублированных генов. [15] Таким образом, по-видимому, существует связь между регуляцией генов (по крайней мере на посттрансляционном уровне) и эволюцией генома. [15]

Полиплоидия также является хорошо известным источником видообразования, поскольку потомство, имеющее разное количество хромосом по сравнению с родительскими видами, часто неспособно скрещиваться с неполиплоидными организмами. Считается, что дупликации всего генома менее пагубны, чем анеуплоидия, поскольку относительная дозировка отдельных генов должна быть одинаковой.

Как эволюционное событие

Эволюционная судьба дублирующихся генов

Скорость дупликации генов

Сравнение геномов показывает, что дупликации генов распространены у большинства исследованных видов. На это указывают переменные числа копий ( вариации числа копий ) в геноме людей [16] [17] или плодовых мушек. [18] Однако было трудно измерить скорость, с которой происходят такие дупликации. Недавние исследования дали первую прямую оценку скорости дупликации генов по всему геному у C. elegans , первого многоклеточного эукариота, для которого такая оценка стала доступна. Скорость дупликации генов у C. elegans составляет порядка 10−7 дупликаций /ген/поколение, то есть в популяции из 10 миллионов червей у одного будет дупликация гена на поколение. Эта скорость на два порядка больше, чем спонтанная скорость точечной мутации на нуклеотидный участок у этого вида. [19] Более ранние (косвенные) исследования сообщали о локус-специфических показателях дупликации у бактерий, дрозофилы и людей в диапазоне от 10−3 до 10−7 / ген/поколение. [20] [21] [22]

Неофункционализация

Генные дупликации являются важным источником генетической новизны, которая может привести к эволюционным инновациям. Дупликация создает генетическую избыточность, где вторая копия гена часто свободна от селективного давления — то есть ее мутации не оказывают пагубного воздействия на организм-хозяин. Если одна копия гена испытывает мутацию, которая влияет на ее первоначальную функцию, вторая копия может служить «запасной частью» и продолжать правильно функционировать. Таким образом, дублированные гены накапливают мутации быстрее, чем функциональный ген с одной копией, на протяжении поколений организмов, и возможно, что одна из двух копий разовьет новую и иную функцию. Некоторые примеры такой неофункционализации — это очевидная мутация дублированного пищеварительного гена в семействе ледяных рыб в ген антифриза и дупликация, приводящая к новому гену змеиного яда [23] и синтез 1 бета-гидрокситестостерона у свиней. [24]

Считается, что дупликация генов играет важную роль в эволюции ; эта позиция поддерживается членами научного сообщества уже более 100 лет. [25] Сусуму Оно был одним из самых известных разработчиков этой теории в своей классической книге «Эволюция путем дупликации генов» (1970). [26] Оно утверждал, что дупликация генов является самой важной эволюционной силой с момента появления универсального общего предка . [27] Крупные события дупликации генома могут быть довольно распространенными. Считается, что весь геном дрожжей подвергся дупликации около 100 миллионов лет назад. [28] Растения являются самыми плодовитыми дупликаторами генома. Например, пшеница является гексаплоидом (разновидностью полиплоида ), что означает, что у нее есть шесть копий ее генома.

Субфункционализация

Другая возможная судьба для дублирующихся генов заключается в том, что обе копии одинаково свободны накапливать дегенеративные мутации, пока любые дефекты дополняются другой копией. Это приводит к нейтральной « субфункционализации » (процесс конструктивной нейтральной эволюции ) или модели DDC (дублирование-дегенерация-комплементация), [29] [30] , в которой функциональность исходного гена распределяется между двумя копиями. Ни один из генов не может быть потерян, поскольку оба теперь выполняют важные не избыточные функции, но в конечном итоге ни один из них не способен достичь новой функциональности.

Субфункционализация может происходить посредством нейтральных процессов, в которых мутации накапливаются без каких-либо вредных или полезных эффектов. Однако в некоторых случаях субфункционализация может происходить с явными адаптивными преимуществами. Если ген предка является плейотропным и выполняет две функции, часто ни одна из этих двух функций не может быть изменена без воздействия на другую функцию. Таким образом, разделение функций предка на два отдельных гена может обеспечить адаптивную специализацию подфункций, тем самым обеспечивая адаптивное преимущество. [31]

Потеря

Часто возникающая геномная вариация приводит к неврологическим расстройствам, зависящим от дозы гена, таким как синдром Ретта и болезнь Пелицеуса-Мерцбахера . [32] Такие вредные мутации, скорее всего, будут утрачены из популяции и не сохранятся или не разовьют новые функции. Однако многие дупликации на самом деле не являются вредными или полезными, и эти нейтральные последовательности могут быть утрачены или могут распространяться в популяции посредством случайных колебаний посредством генетического дрейфа .

Выявление дупликаций в секвенированных геномах

Критерии и сканирование отдельного генома

Два гена, которые существуют после события дупликации гена, называются паралогами и обычно кодируют белки со схожей функцией и/или структурой. Напротив, ортологичные гены, присутствующие в разных видах, каждый из которых изначально произошел от одной и той же предковой последовательности. (См. Гомология последовательностей в генетике ).

Важно (но часто трудно) различать паралоги и ортологи в биологических исследованиях. Эксперименты по функции генов человека часто можно проводить на других видах , если гомолог гена человека может быть найден в геноме этого вида, но только если гомолог является ортологичным. Если они являются паралогами и возникли в результате события дупликации гена, их функции, вероятно, будут слишком разными. Одна или несколько копий дуплицированных генов, которые составляют семейство генов, могут быть затронуты вставкой мобильных элементов , что вызывает значительные различия между ними в их последовательности и в конечном итоге может стать причиной дивергентной эволюции . Это также может сделать шансы и скорость генной конверсии между гомологами дубликатов генов из-за меньшего или отсутствующего сходства в их последовательностях.

Паралоги могут быть идентифицированы в отдельных геномах посредством сравнения последовательностей всех аннотированных моделей генов друг с другом. Такое сравнение может быть выполнено на транслируемых аминокислотных последовательностях (например, BLASTp, tBLASTx) для идентификации древних дупликаций или на последовательностях нуклеотидов ДНК (например, BLASTn, megablast) для идентификации более поздних дупликаций. Большинство исследований для идентификации дупликаций генов требуют взаимных лучших совпадений или нечетких взаимных лучших совпадений, где каждый паралог должен быть единственным лучшим совпадением другого в сравнении последовательностей. [33]

Большинство генных дупликаций существуют в виде низкокопийных повторов (LCR), довольно высокоповторяющихся последовательностей, таких как транспозируемые элементы. Они в основном встречаются в перицентрономных , субтеломерных и интерстициальных областях хромосомы. Многие LCR из-за своего размера (>1 Кб), сходства и ориентации очень восприимчивы к дупликациям и делециям.

Геномные микрочипы обнаруживают дупликации

Такие технологии, как геномные микрочипы , также называемые массивом сравнительной геномной гибридизации (массив CGH), используются для обнаружения хромосомных аномалий, таких как микродупликации, в высокопроизводительном режиме из образцов геномной ДНК. В частности, технология ДНК- микрочипов может одновременно контролировать уровни экспрессии тысяч генов во многих обработках или экспериментальных условиях, что значительно облегчает эволюционные исследования регуляции генов после дупликации генов или видообразования . [34] [35]

Секвенирование нового поколения

Генные дупликации также могут быть идентифицированы с помощью платформ секвенирования следующего поколения. Самый простой способ идентифицировать дупликации в данных геномного ресеквенирования — это использование прочтений парного конца. Тандемные дупликации определяются парами прочтений секвенирования, которые отображаются в аномальных ориентациях. Благодаря сочетанию увеличенного покрытия последовательностей и аномальной ориентации картирования можно идентифицировать дупликации в данных геномного секвенирования.

Номенклатура

Кариотип человека с аннотированными полосами и подполосами, используемыми для номенклатуры хромосомных аномалий. Он показывает темные и белые области, как видно на G-бэндинге . Каждый ряд вертикально выровнен на уровне центромеры . Он показывает 22 гомологичные пары аутосомных хромосом, как женские (XX), так и мужские (XY) версии двух половых хромосом , а также митохондриальный геном (внизу слева).

Международная система цитогеномной номенклатуры человека (ISCN) — это международный стандарт номенклатуры хромосом человека , который включает в себя названия полос, символы и сокращенные термины, используемые при описании хромосом человека и аномалий хромосом. Сокращения включают dup для дупликации частей хромосомы. [36] Например, dup(17p12) вызывает болезнь Шарко-Мари-Тута типа 1A. [37]

Как усиление

Генная дупликация не обязательно представляет собой долгосрочное изменение в геноме вида. Фактически, такие изменения часто не сохраняются после первоначального организма-хозяина. С точки зрения молекулярной генетики , амплификация гена является одним из многих способов, с помощью которых ген может быть сверхэкспрессирован . Генетическая амплификация может происходить искусственно, как при использовании метода полимеразной цепной реакции для амплификации коротких цепей ДНК in vitro с использованием ферментов , или может происходить естественным образом, как описано выше. Если это естественная дупликация, она все равно может происходить в соматической клетке , а не в клетке зародышевой линии (что было бы необходимо для долгосрочного эволюционного изменения).

Роль в раке

Дупликации онкогенов являются распространенной причиной многих типов рака . В таких случаях генетическая дупликация происходит в соматической клетке и влияет только на геном самих раковых клеток, а не на весь организм, не говоря уже о каком-либо последующем потомстве. Недавняя комплексная классификация на уровне пациента и количественная оценка драйверных событий в когортах TCGA показали, что в среднем на опухоль приходится 12 драйверных событий, из которых 1,5 являются амплификациями онкогенов. [38]


Полногеномные дупликации также часто встречаются при раке, обнаруживаясь в 30–36 % опухолей наиболее распространенных типов рака. [40] [41] Их точная роль в канцерогенезе неясна, но в некоторых случаях они приводят к потере сегрегации хроматина, что приводит к изменениям конформации хроматина, которые в свою очередь приводят к онкогенным эпигенетическим и транскрипционным модификациям. [42]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Чжан Дж (2003). «Эволюция путем дупликации генов: обновление» (PDF) . Тенденции в экологии и эволюции . 18 (6): 292–8. doi :10.1016/S0169-5347(03)00033-8.
  2. ^ "Определение дупликации гена". Медицинский словарь medterms . MedicineNet. 2012-03-19. Архивировано из оригинала 2014-03-06 . Получено 2008-12-01 .
  3. ^ Миллер, Дункан; Чэнь, Цзяньхай; Лян, Цзянтао; Бетран, Эстер; Лонг, Маньюань; Шарахов, Игорь В. (2022-05-28). «Дупликация ретрогенов и паттерны экспрессии, сформированные эволюцией половых хромосом у малярийных комаров». Гены . 13 (6): 968. doi : 10.3390/genes13060968 . ISSN  2073-4425. PMC 9222922. PMID 35741730  . 
  4. ^ Dehal P, Boore JL (октябрь 2005 г.). «Два раунда дупликации всего генома у предковых позвоночных». PLOS Biology . 3 (10): e314. doi : 10.1371/journal.pbio.0030314 . PMC 1197285. PMID  16128622 . 
  5. ^ Вулф, К. Х.; Шилдс, Д. К. (1997-06-12). «Молекулярные доказательства древней дупликации всего генома дрожжей». Nature . 387 (6634): 708–713. Bibcode :1997Natur.387..708W. doi : 10.1038/42711 . ISSN  0028-0836. PMID  9192896. S2CID  4307263.
  6. ^ Келлис, Манолис; Биррен, Брюс В.; Ландер, Эрик С. (2004-04-08). «Доказательство и эволюционный анализ древней дупликации генома у дрожжей Saccharomyces cerevisiae». Nature . 428 (6983): 617–624. Bibcode :2004Natur.428..617K. doi :10.1038/nature02424. ISSN  1476-4687. PMID  15004568. S2CID  4422074.
  7. ^ Отто, Сара П. (2007-11-02). «Эволюционные последствия полиплоидии». Cell . 131 (3): 452–462. doi : 10.1016/j.cell.2007.10.022 . ISSN  0092-8674. PMID  17981114. S2CID  10054182.
  8. ^ Конант, Гэвин К.; Вулф, Кеннет Х. (апрель 2006 г.). «Функциональное разделение сетей коэкспрессии дрожжей после дупликации генома». PLOS Biology . 4 (4): e109. doi : 10.1371/journal.pbio.0040109 . ISSN  1545-7885. PMC 1420641. PMID 16555924  . 
  9. ^ Папп, Балаж; Пал, Чаба; Херст, Лоренс Д. (2003-07-10). «Дозовая чувствительность и эволюция семейств генов у дрожжей». Nature . 424 (6945): 194–197. Bibcode :2003Natur.424..194P. doi :10.1038/nature01771. ISSN  1476-4687. PMID  12853957. S2CID  4382441.
  10. ^ Линч, М.; Конери, Дж. С. (10.11.2000). «Эволюционная судьба и последствия дублирования генов». Science . 290 (5494): 1151–1155. Bibcode :2000Sci...290.1151L. doi :10.1126/science.290.5494.1151. ISSN  0036-8075. PMID  11073452.
  11. ^ Freeling, Michael; Thomas, Brian C. (июль 2006 г.). «Гено-сбалансированные дупликации, такие как тетраплоидия, обеспечивают предсказуемый стимул для увеличения морфологической сложности». Genome Research . 16 (7): 805–814. doi : 10.1101/gr.3681406 . ISSN  1088-9051. PMID  16818725.
  12. ^ Дэвис, Джерел К.; Петров, Дмитрий А. (октябрь 2005 г.). «Добавляют ли разрозненные механизмы дупликации схожие гены в геном?». Trends in Genetics . 21 (10): 548–551. doi :10.1016/j.tig.2005.07.008. ISSN  0168-9525. PMID  16098632.
  13. ^ Каснев, Тинеке; Де Бодт, Стефани; Раес, Йерун; Маере, Стивен; Ван де Пер, Ив (2006). «Неслучайное расхождение экспрессии генов после дупликации генов и геномов у цветущего растения Arabidopsis thaliana». Геномная биология . 7 (2): Р13. дои : 10.1186/gb-2006-7-2-r13 . ISSN  1474-760X. ПМЦ 1431724 . ПМИД  16507168. 
  14. ^ Ли, Вэнь-Сюн; Ян, Цзин; Гу, Сюнь (ноябрь 2005 г.). «Расхождение экспрессии между дубликатами генов». Trends in Genetics . 21 (11): 602–607. doi :10.1016/j.tig.2005.08.006. ISSN  0168-9525. PMID  16140417.
  15. ^ ab Amoutzias, Grigoris D.; He, Ying; Gordon, Jonathan; Mossialos, Dimitris; Oliver, Stephen G.; Van de Peer, Yves (2010-02-16). "Посттрансляционная регуляция влияет на судьбу дублированных генов". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (7): 2967–2971. Bibcode : 2010PNAS..107.2967A. doi : 10.1073/pnas.0911603107 . ISSN  1091-6490. PMC 2840353. PMID 20080574  . 
  16. ^ Sebat J, Lakshmi B, Troge J, Alexander J, Young J, Lundin P и др. (июль 2004 г.). «Масштабный полиморфизм числа копий в геноме человека». Science . 305 (5683): ​​525–8. Bibcode :2004Sci...305..525S. doi :10.1126/science.1098918. PMID  15273396. S2CID  20357402.
  17. ^ Iafrate AJ, Feuk L, Rivera MN, Listewnik ML, Donahoe PK, Qi Y и др. (сентябрь 2004 г.). «Обнаружение крупномасштабных вариаций в геноме человека». Nature Genetics . 36 (9): 949–51. doi : 10.1038/ng1416 . PMID  15286789.
  18. ^ Emerson JJ, Cardoso-Moreira M, Borevitz JO, Long M (июнь 2008 г.). «Естественный отбор формирует общегеномные паттерны полиморфизма числа копий у Drosophila melanogaster». Science . 320 (5883): 1629–31. Bibcode :2008Sci...320.1629E. doi :10.1126/science.1158078. PMID  18535209. S2CID  206512885.
  19. ^ Lipinski KJ, Farslow JC, Fitzpatrick KA, Lynch M, Katju V, Bergthorsson U (февраль 2011 г.). «Высокая спонтанная скорость дупликации генов у Caenorhabditis elegans». Current Biology . 21 (4): 306–10. Bibcode : 2011CBio ... 21..306L. doi : 10.1016/j.cub.2011.01.026. PMC 3056611. PMID  21295484. 
  20. ^ Андерсон П., Рот Дж. (май 1981 г.). «Спонтанные тандемные генетические дупликации в Salmonella typhimurium возникают в результате неравной рекомбинации между цистронами рРНК (ррн)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 78 (5): 3113–7. Bibcode : 1981PNAS...78.3113A. doi : 10.1073/pnas.78.5.3113 . PMC 319510. PMID  6789329 . 
  21. ^ Watanabe Y, Takahashi A, Itoh M, Takano-Shimizu T (март 2009 г.). «Молекулярный спектр спонтанных мутаций de novo в мужских и женских зародышевых клетках Drosophila melanogaster». Genetics . 181 (3): 1035–43. doi :10.1534/genetics.108.093385. PMC 2651040 . PMID  19114461. 
  22. ^ Turner DJ, Miretti M, Rajan D, Fiegler H, Carter NP, Blayney ML и др. (январь 2008 г.). «Уровни зародышевых делеций и дупликаций de novo мейоза, вызывающих несколько геномных нарушений». Nature Genetics . 40 (1): 90–5. doi :10.1038/ng.2007.40. PMC 2669897 . PMID  18059269. 
  23. ^ Lynch VJ (январь 2007 г.). «Изобретение арсенала: адаптивная эволюция и неофункционализация генов фосфолипазы A2 змеиного яда». BMC Evolutionary Biology . 7 : 2. doi : 10.1186/1471-2148-7-2 . PMC 1783844. PMID  17233905 . 
  24. ^ Conant GC, Wolfe KH (декабрь 2008 г.). «Превращение хобби в работу: как дублированные гены находят новые функции». Nature Reviews. Genetics . 9 (12): 938–50. doi :10.1038/nrg2482. PMID  19015656. S2CID  1240225.
  25. ^ Тейлор Дж. С., Раес Дж. (2004). «Дупликация и расхождение: эволюция новых генов и старых идей». Annual Review of Genetics . 38 : 615–43. doi : 10.1146/annurev.genet.38.072902.092831. PMID  15568988.
  26. ^ Ohno, S. (1970). Эволюция путем дупликации генов . Springer-Verlag . ISBN 978-0-04-575015-3.
  27. ^ Ohno, S. (1967). Половые хромосомы и гены, сцепленные с полом . Springer-Verlag. ISBN 978-91-554-5776-1.
  28. ^ Kellis M, Birren BW, Lander ES (апрель 2004 г.). «Доказательство и эволюционный анализ древней дупликации генома у дрожжей Saccharomyces cerevisiae». Nature . 428 (6983): 617–24. Bibcode :2004Natur.428..617K. doi :10.1038/nature02424. PMID  15004568. S2CID  4422074.
  29. ^ Force A, Lynch M, Pickett FB, Amores A, Yan YL, Postlethwait J (апрель 1999 г.). «Сохранение дублирующихся генов с помощью комплементарных дегенеративных мутаций». Genetics . 151 (4): 1531–45. doi :10.1093/genetics/151.4.1531. PMC 1460548 . PMID  10101175. 
  30. ^ Stoltzfus A (август 1999). «О возможности конструктивной нейтральной эволюции». Journal of Molecular Evolution . 49 (2): 169–81. Bibcode :1999JMolE..49..169S. CiteSeerX 10.1.1.466.5042 . doi :10.1007/PL00006540. PMID  10441669. S2CID  1743092. 
  31. ^ Des Marais DL, Rausher MD (август 2008 г.). «Избегание адаптивного конфликта после дупликации гена пути антоцианина». Nature . 454 (7205): 762–5. Bibcode :2008Natur.454..762D. doi :10.1038/nature07092. PMID  18594508. S2CID  418964.
  32. ^ Lee JA, Lupski JR (октябрь 2006 г.). «Геномные перестройки и изменения числа копий генов как причина расстройств нервной системы». Neuron . 52 (1): 103–21. doi : 10.1016/j.neuron.2006.09.027 . PMID  17015230. S2CID  22412305.
  33. ^ Hahn MW, Han MV, Han SG (ноябрь 2007 г.). «Эволюция семейства генов в 12 геномах дрозофилы». PLOS Genetics . 3 (11): e197. doi : 10.1371/journal.pgen.0030197 . PMC 2065885. PMID  17997610 . 
  34. ^ Mao R, Pevsner J (2005). «Использование геномных микрочипов для изучения хромосомных аномалий при умственной отсталости». Обзоры исследований умственной отсталости и нарушений развития . 11 (4): 279–85. doi :10.1002/mrdd.20082. PMID  16240409.
  35. ^ Gu X, Zhang Z, Huang W (январь 2005 г.). «Быстрая эволюция экспрессии и регуляторные расхождения после дупликации генов дрожжей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (3): 707–12. Bibcode : 2005PNAS..102..707G . doi : 10.1073/pnas.0409186102 . PMC 545572. PMID  15647348. 
  36. ^ "Символы и сокращенные термины ISCN". Институт медицинских исследований Кориелла . Получено 27 октября 2022 г.
  37. ^ Кассандра Л. Книффин. «БОЛЕЗНЬ ХАРКО-МАРИ-ТУТА, ДЕМИЕЛИНИЗИРУЮЩАЯ, ТИП 1А; ШМТ1А». OMIM .Обновлено: 23.04.2014
  38. ^ Вяткин, Алексей Д.; Отнюков, Данила В.; Леонов, Сергей В.; Беликов, Алексей В. (14 января 2022 г.). «Комплексная классификация на уровне пациента и количественная оценка событий, связанных с драйверами, в когортах TCGA PanCanAtlas». PLOS Genetics . 18 (1): e1009996. doi : 10.1371/journal.pgen.1009996 . PMC 8759692 . PMID  35030162. 
  39. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac Кинцлер К.В., Фогельштейн Б. (2002). Генетическая основа рака человека. МакГроу-Хилл. п. 116. ИСБН 978-0-07-137050-9.
  40. ^ Бельски, Крейг М.; Зехир, Ахмет; Пенсон, Александр В.; Донохью, Марк ТА; Шатила, Валид; Армения, Джошуа; Чанг, Мэтью Т.; Шрам, Элисон М.; Йонссон, Филипп; Бандламуди, Чайтанья; Разави, Педрам; Айер, Гопа; Робсон, Марк Э.; Штадлер, София К.; Шульц, Николаус (2018). «Удвоение генома формирует эволюцию и прогноз прогрессирующих видов рака». Nature Genetics . 50 (8): 1189–1195. doi :10.1038/s41588-018-0165-1. ISSN  1546-1718. PMC 6072608 . PMID  30013179. 
  41. ^ Куинтон, Райан Дж.; ДиДомицио, Аманда; Виттория, Марк А.; Котынкова Кристина; Тикас, Карлос Дж.; Патель, Шина; Кога, Юсуке; Вахшурзаде, Жасмин; Эрманс, Николь; Курода, Тарухо С.; Парулекар, Неха; Тейлор, Элисон М.; Мэннинг, Эмити Л.; Кэмпбелл, Джошуа Д.; Ганем, Нил Дж. (2021). «Удвоение всего генома придает опухолевым клеткам уникальную генетическую уязвимость». Природа . 590 (7846): 492–497. Бибкод : 2021Natur.590..492Q. дои : 10.1038/s41586-020-03133-3. ISSN  1476-4687. PMC 7889737. PMID  33505027 . 
  42. ^ Ламбута, Руксандра А.; Нанни, Лука; Лю, Юаньлун; Диас-Мияр, Хуан; Айер, Арвинд; Тавернари, Даниэле; Катанаева, Наталья; Чириелло, Джованни; Ориккио, Элиза (2023-03-15). «Удвоение всего генома приводит к онкогенной потере сегрегации хроматина». Nature . 615 (7954): 925–933. Bibcode :2023Natur.615..925L. doi : 10.1038/s41586-023-05794-2 . ISSN  1476-4687. PMC 10060163 . PMID  36922594. 

Внешние ссылки