stringtranslate.com

ДНК-метилтрансфераза

В биохимии семейство ферментов ДНК -метилтрансферазы ( ДНК-МТазы , DNMT ) катализирует перенос метильной группы в ДНК . Метилирование ДНК выполняет широкий спектр биологических функций. Все известные ДНК-метилтрансферазы используют S-аденозилметионин (SAM) в качестве донора метильной группы.

Классификация

Субстрат

МТазы можно разделить на три различные группы на основе химических реакций, которые они катализируют:

Метилтрансферазы m6A и m4C обнаружены в основном у прокариот (хотя недавние данные свидетельствуют о том, что m6A широко распространен у эукариот [1] ). Метилтрансферазы m5C обнаружены у некоторых низших эукариот, у большинства высших растений и у животных, начиная с иглокожих .

Метилтрансферазы m6A (N-6 аденин-специфическая ДНК-метилаза) (A-Mtase) — это ферменты , которые специфически метилируют аминогруппу в положении C-6 аденинов в ДНК. Они встречаются в трех существующих типах бактериальных систем рестрикции-модификации (в системе типа I A-Mtase является продуктом гена hsdM, а в типе III — продуктом гена mod). Эти ферменты отвечают за метилирование определенных последовательностей ДНК , чтобы не допустить переваривания хозяином собственного генома с помощью его рестриктаз . Эти метилазы имеют ту же специфичность последовательности , что и соответствующие им рестриктазы. Эти ферменты содержат консервативный мотив Asp / Asn - Pro -Pro- Tyr / Phe в своем N-концевом участке, этот консервативный участок может быть вовлечен в связывание субстрата или в каталитическую активность. [2] [3] [ 4] [5] Структура N6-MTase TaqI ( M.TaqI ) была разрешена до 2,4 А. Молекула сворачивается в 2 домена, N-концевой каталитический домен, который содержит каталитические и кофакторные сайты связывания и включает центральный 9-цепочечный бета-лист, окруженный 5 спиралями; и C-концевой домен распознавания ДНК, который образован 4 небольшими бета-листами и 8 альфа-спиралями . N- и C-концевые домены образуют щель, вмещающую субстрат ДНК . [6] Была предложена классификация N-MTases, основанная на расположении консервативных мотивов (CM). [5] Согласно этой классификации, N6-MTases, которые имеют мотив DPPY (CM II), расположенный после мотива FxGxG (CM I), обозначаются как N6-адениновые MTases класса D12. Система рестрикции и модификации типа I состоит из трех полипептидов R, M и S. Субъединицы M (hsdM) и S вместе образуют метилтрансферазу , которая метилирует два остатка аденина в комплементарных цепях двудольной последовательности распознавания ДНК . В присутствии субъединицы R комплекс может также действовать как эндонуклеаза , связываясь с той же целевой последовательностью , но разрезая ДНК на некотором расстоянии от этого сайта. Разрезается ли ДНК или модифицируется, зависит от состояния метилирования целевой последовательности . Когда целевой сайт не модифицирован, ДНК разрезается. Когда целевой сайт полуметилирован, комплекс действует как поддерживающая метилтрансфераза, модифицируя ДНК так, что обе цепи становятся метилированными . hsdM содержит альфа-спиральный домен на N-конце , N-концевой домен HsdM. [7]

Среди метилтрансфераз m6A (N-6 аденин-специфическая ДНК-метилаза) есть группа сиротских МТаз, которые не участвуют в бактериальной системе рестрикции/метилирования. [8] Эти ферменты играют регуляторную роль в экспрессии генов и регуляции клеточного цикла. EcoDam из E. coli [9] и CcrM из Caulobacter crescentus [10] являются хорошо охарактеризованными членами этого семейства. Совсем недавно было показано, что CamA из Clostridioides difficile играет ключевые функциональные роли в споруляции , образовании биопленки и адаптации хозяина. [11]

Метилтрансферазы m4C (N-4 цитозин-специфические ДНК-метилазы) — это ферменты , которые специфически метилируют аминогруппу в положении C-4 цитозинов в ДНК. [5] Такие ферменты встречаются в качестве компонентов систем рестрикции-модификации типа II у прокариот . Такие ферменты распознают определенную последовательность в ДНК и метилируют цитозин в этой последовательности . Этим действием они защищают ДНК от расщепления ферментами рестрикции типа II, которые распознают ту же последовательность [ требуется ссылка ]

Метилтрансферазы m5C (специфическая для цитозина ДНК-метилаза C-5) (C5 Mtase) — это ферменты, которые специфически метилируют углерод C-5 цитозинов в ДНК для получения C5-метилцитозина . [12] [13] [14] В клетках млекопитающих специфичные для цитозина метилтрансферазы метилируют определенные последовательности CpG , которые, как полагают , модулируют экспрессию генов и дифференциацию клеток . У бактерий эти ферменты являются компонентом систем рестрикции-модификации и служат ценными инструментами для манипуляции ДНК. [13] [15] Структура метилтрансферазы HhaI (M.HhaI) была разрешена до 2,5 A : молекула сворачивается в 2 домена — более крупный каталитический домен, содержащий каталитические и кофакторные сайты связывания, и меньший домен распознавания ДНК. [16]

Сообщалось о высококонсервативных ДНК-метилтрансферазах типов m4C, m5C и m6A [17] , которые представляются перспективными целями для разработки новых эпигенетических ингибиторов для борьбы с бактериальной вирулентностью, устойчивостью к антибиотикам и другими биомедицинскими приложениями.

De novo против поддержания

Метилтрансферазы de novo распознают что-то в ДНК, что позволяет им заново метилировать цитозины. Они экспрессируются в основном на ранних стадиях развития эмбриона и устанавливают схему метилирования. Метилтрансферазы de novo также активны, когда клетка, реагирующая на сигнал, такая как нейрон , должна изменить экспрессию белка. [18] Например, когда условно-рефлекторное состояние страха создает новую память у крысы, 9,17% генов в геноме нейрона гиппокампа крысы дифференциально метилированы. [19]

Поддерживающие метилтрансферазы добавляют метилирование к ДНК, когда одна из цепей уже метилирована. Они работают на протяжении всей жизни организма, поддерживая схему метилирования, которая была установлена ​​de novo метилтрансферазами. [ необходима цитата ]

Млекопитающие

По крайней мере четыре ДНК-метилтрансферазы с разной активностью были идентифицированы у млекопитающих. Они называются DNMT1 , [20] две изоформы, транскрибированные с гена DNMT3a : DNMT3a1 и DNMT3a2, [21] и DNMT3b . [22] Недавно был обнаружен еще один фермент DNMT3c, специфически экспрессируемый в мужской зародышевой линии у мышей. [23]

Некоторые сигналы активации на нуклеосоме . Нуклеосомы состоят из четырех пар гистоновых белков в плотно собранной центральной области плюс до 30% каждого гистона, остающегося в слабо организованном хвосте (показан только один хвост каждой пары). ДНК обернута вокруг гистоновых ядерных белков в хромосомах . Лизины (K) обозначены номером, показывающим их положение, например (K4), что указывает на лизин как на 4-ю аминокислоту от амино (N) конца хвоста в гистоновом белке. Метилирование {Me} и ацетилирование [Ac] являются распространенными посттрансляционными модификациями лизинов гистоновых хвостов.

[ необходима ссылка ]

Некоторые сигналы репрессии на нуклеосоме .

Манзо и др. [24] наблюдали различия в геномном связывании DNMT3a1, DNMT3a2 и DNMT3b. Они обнаружили 3970 областей, исключительно обогащенных для DNMT3a1, 3838 исключительно обогащенных для DNMT3a2 и 3432 исключительно обогащенных для DNMT3b.

Ферменты DNMT регулируются не только в своих метилирующих местах на геноме тем, где они связываются с ДНК, [24] , но они также регулируются посттрансляционными модификациями гистоновых белков нуклеосом, вокруг которых обернута геномная ДНК (см. рисунки). Роуз и Клозе [25] рассмотрели связь между метилированием ДНК и метилированием лизина гистонов . Например, они указали, что H3K4me3, по-видимому , блокирует метилирование ДНК, в то время как H3K9me3 играет роль в содействии метилированию ДНК.

DNMT3L [26] — это белок, тесно связанный по структуре с DNMT3a и DNMT3b и имеющий решающее значение для метилирования ДНК, но, по-видимому, сам по себе неактивен.

DNMT1

DNMT1 является наиболее распространенной ДНК-метилтрансферазой в клетках млекопитающих и считается ключевой поддерживающей метилтрансферазой у млекопитающих . Она преимущественно метилирует полуметилированные динуклеотиды CpG в геноме млекопитающих. Мотив распознавания для человеческого фермента включает только три основания в паре динуклеотидов CpG: C на одной нити и CpG на другой. Это смягченное требование к субстратной специфичности позволяет ему метилировать необычные структуры, такие как промежуточные продукты проскальзывания ДНК, со скоростями de novo, которые равны его скорости поддержания. [27] Как и другие ДНК-цитозин-5-метилтрансферазы, человеческий фермент распознает вывернутые цитозины в двухцепочечной ДНК и действует по механизму нуклеофильной атаки. [28] В раковых клетках человека DNMT1 отвечает как за de novo , так и за поддерживающее метилирование генов-супрессоров опухолей. [29] [30] Длина фермента составляет около 1620 аминокислот . Первые 1100 аминокислот составляют регуляторный домен фермента, а остальные остатки составляют каталитический домен. Они соединены повторами Gly - Lys . Оба домена необходимы для каталитической функции DNMT1. [ необходима цитата ]

DNMT1 имеет несколько изоформ : соматическую DNMT1, вариант сплайсинга (DNMT1b) и ооцит -специфическую изоформу (DNMT1o). DNMT1o синтезируется и хранится в цитоплазме ооцита и транслоцируется в ядро ​​клетки во время раннего эмбрионального развития, в то время как соматическая DNMT1 всегда находится в ядре соматической ткани. [ необходима цитата ]

Эмбриональные стволовые клетки с нулевым мутантом DNMT1 были жизнеспособны и содержали небольшой процент метилированной ДНК и метилтрансферазной активности. Эмбрионы мышей, гомозиготные по делеции в Dnmt1, умирают на 10–11 день беременности. [31]

ТРДМТ1

Хотя этот фермент имеет сильное сходство последовательностей с 5-метилцитозинметилтрансферазами как прокариот, так и эукариот, в 2006 году было показано, что фермент метилирует положение 38 в РНК-переносчике аспарагиновой кислоты и не метилирует ДНК. [32] Название этой метилтрансферазы было изменено с DNMT2 на TRDMT1 (тРНК аспарагиновая кислота метилтрансфераза 1), чтобы лучше отразить ее биологическую функцию. [33] TRDMT1 является первой РНК цитозинметилтрансферазой, идентифицированной в клетках человека.

DNMT3

DNMT3 — это семейство ДНК -метилтрансфераз, которые могут метилировать полуметилированные и неметилированные CpG с одинаковой скоростью. Архитектура ферментов DNMT3 похожа на архитектуру DNMT1, с регуляторной областью, прикрепленной к каталитическому домену. Существует по крайней мере пять членов семейства DNMT3: DNMT3a1, DNMT3a2, 3b, 3c и 3L. [ необходима цитата ]

DNMT3a1, DNMT3a2 и DNMT3b могут опосредовать метилирование участков CpG в промоторах генов, что приводит к репрессии генов . Эти ДНК-метилтрансферазы также могут метилировать участки CpG в кодирующих областях генов, где такое метилирование может усиливать транскрипцию генов. [34] Работа с DNMT3a1 показала, что он преимущественно локализуется на островах CpG, бивалентно маркированных H3K4me3 (маркер, способствующий транскрипции) и H3K27me3 (маркер, подавляющий транскрипцию), совпадающих с промоторами многих факторов транскрипции . Работа с DNMT3a2 в нейронах показала, что изменения метилирования ДНК, вызванные DNMT3a2, преимущественно происходят в межгенных и интронных областях. Считалось, что эти межгенные и интронные метилирования ДНК, вероятно, регулируют активность энхансера , альтернативный сплайсинг или экспрессию некодирующих РНК . [35]

DNMT3a1 может совместно локализоваться с гетерохроматиновым белком (HP1) и метил-CpG-связывающим белком (MeCBP), среди ряда других факторов. [36] Они также могут взаимодействовать с DNMT1, что может быть кооперативным событием во время метилирования ДНК. DNMT3a предпочитает метилирование CpG метилированию CpA, CpT и CpC, хотя, по-видимому, существует некоторая предпочтительность последовательности метилирования для DNMT3a и DNMT3b. DNMT3a метилирует сайты CpG со скоростью, намного меньшей, чем DNMT1, но большей, чем DNMT3b.

Экспрессия DNMT3a2 отличается от DNMT3a1 и DNMT3b, поскольку экспрессия DNMT3a2 происходит по схеме немедленного раннего гена . DNMT3a2 индуцируется для экспрессии в нейронах, например, новой нейронной активностью. [37] [35] Это может иметь значение для установления долговременной памяти . [38] У крысы высокие уровни новых метилирований ДНК в нейронах гиппокампа происходят после того, как крысе навязывается памятное событие, такое как контекстное условно-рефлекторное страх . [19] Байрактар ​​и Крейц [39] обнаружили , что ингибиторы DNMT, примененные в мозге, предотвращают формирование долговременных воспоминаний.

DNMT3L содержит мотивы ДНК-метилтрансферазы и необходим для установления материнских геномных импринтов , несмотря на то, что он каталитически неактивен. DNMT3L экспрессируется во время гаметогенеза , когда происходит геномный импринтинг . Потеря DNMT3L приводит к биаллельной экспрессии генов, которые обычно не экспрессируются материнским аллелем. DNMT3L взаимодействует с DNMT3a и DNMT3b и локализуется в ядре. Хотя DNMT3L, по-видимому, не способен к метилированию , он может участвовать в репрессии транскрипции .

Клиническое значение

ингибиторы DNMT

Из-за эпигенетических эффектов семейства DNMT некоторые ингибиторы DNMT исследуются для лечения некоторых видов рака: [40]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Айер Л. М., Чжан Д., Аравинд Л. (январь 2016 г.). «Метилирование аденина у эукариот: понимание сложной эволюционной истории и функционального потенциала эпигенетической модификации». BioEssays . 38 (1): 27–40. doi :10.1002/bies.201500104. PMC  4738411 . PMID  26660621.
  2. ^ Лоенен В.А., Дэниел А.С., Браймер Х.Д., Мюррей Н.Е. (ноябрь 1987 г.). «Организация и последовательность генов hsd Escherichia coli K-12». Журнал молекулярной биологии . 198 (2): 159–70. дои : 10.1016/0022-2836(87)90303-2. ПМИД  3323532.
  3. ^ Нарва К.Э., Ван Эттен Дж.Л., Слатко Б.Е., Беннер Дж.С. (декабрь 1988 г.). «Аминокислотная последовательность эукариотической ДНК [N6-аденин] метилтрансферазы, M.CviBIII, имеет области сходства с прокариотическим изошизомером M.TaqI и другими ДНК [N6-аденин] метилтрансферазами». Джин . 74 (1): 253–9. дои : 10.1016/0378-1119(88)90298-3. ПМИД  3248728.
  4. ^ Lauster R (март 1989). «Эволюция ДНК-метилтрансфераз типа II. Модель дупликации генов». Журнал молекулярной биологии . 206 (2): 313–21. doi :10.1016/0022-2836(89)90481-6. PMID  2541254.
  5. ^ abc Тиминскас А, Буткус В, Янулайтис А (май 1995). "Мотивы последовательности, характерные для ДНК [цитозин-N4] и ДНК [аденин-N6] метилтрансфераз. Классификация всех ДНК метилтрансфераз". Gene . 157 (1–2): 3–11. doi :10.1016/0378-1119(94)00783-O. PMID  7607512.
  6. ^ Labahn J, Granzin J, Schluckebier G, Robinson DP, Jack WE, Schildkraut I, Saenger W (ноябрь 1994 г.). «Трехмерная структура аденин-специфической ДНК-метилтрансферазы M.Taq I в комплексе с кофактором S-аденозилметионином». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (23): 10957–61. doi : 10.1073/pnas.91.23.10957 . PMC 45145. PMID  7971991 . 
  7. ^ Kelleher JE, Daniel AS, Murray NE (сентябрь 1991 г.). «Мутации, которые придают de novo активность поддерживающей метилтрансферазы». Журнал молекулярной биологии . 221 (2): 431–40. doi :10.1016/0022-2836(91)80064-2. PMID  1833555.
  8. ^ Adhikari S, Curtis PD (сентябрь 2016 г.). «ДНК-метилтрансферазы и эпигенетическая регуляция у бактерий». FEMS Microbiology Reviews . 40 (5): 575–91. doi : 10.1093/femsre/fuw023 . PMID  27476077.
  9. ^ Чахар С., Элсави Х., Рагозин С., Джелч А. (январь 2010 г.). «Изменение специфичности распознавания ДНК ДНК-(аденин-N6)-метилтрансферазы EcoDam путем направленной эволюции». Журнал молекулярной биологии . 395 (1): 79–88. doi :10.1016/j.jmb.2009.09.027. PMID  19766657.
  10. ^ Майер Дж.А., Албу Р.Ф., Юрковски Т.П., Елч А. (декабрь 2015 г.). «Исследование С-концевого домена бактериальной ДНК-(аденин N6)-метилтрансферазы CcrM». Биохимия . 119 : 60–7. дои : 10.1016/j.biochi.2015.10.011. ПМИД  26475175.
  11. ^ Oliveira PH, Ribis JW, Garrett EM, Trzilova D, Kim A, Sekulovic O и др. (январь 2020 г.). «Эпигеномная характеристика Clostridioides difficile обнаруживает консервативную ДНК-метилтрансферазу, которая опосредует споруляцию и патогенез». Nature Microbiology . 5 (1): 166–180. doi :10.1038/s41564-019-0613-4. PMC 6925328 . PMID  31768029. 
  12. ^ Pósfai J, Bhagwat AS, Roberts RJ (декабрь 1988 г.). "Мотивы последовательности, специфичные для цитозиновых метилтрансфераз". Gene . 74 (1): 261–5. doi :10.1016/0378-1119(88)90299-5. PMID  3248729.
  13. ^ ab Kumar S, Cheng X, Klimasauskas S, Mi S, Posfai J, Roberts RJ, Wilson GG (январь 1994). "ДНК (цитозин-5) метилтрансферазы". Nucleic Acids Research . 22 (1): 1–10. doi :10.1093/nar/22.1.1. PMC 307737. PMID  8127644 . 
  14. ^ Lauster R, Trautner TA, Noyer-Weidner M (март 1989). «Цитозин-специфические ДНК-метилтрансферазы типа II. Консервативное ядро ​​фермента с вариабельными доменами распознавания цели». Журнал молекулярной биологии . 206 (2): 305–12. doi :10.1016/0022-2836(89)90480-4. PMID  2716049.
  15. ^ Cheng X (февраль 1995). «Модификация ДНК метилтрансферазами». Current Opinion in Structural Biology . 5 (1): 4–10. doi :10.1016/0959-440X(95)80003-J. PMID  7773746.
  16. ^ Cheng X, Kumar S, Posfai J, Pflugrath JW, Roberts RJ (июль 1993 г.). «Кристаллическая структура метилтрансферазы ДНК HhaI в комплексе с S-аденозил-L-метионином». Cell . 74 (2): 299–307. doi :10.1016/0092-8674(93)90421-L. PMID  8343957. S2CID  54238106.
  17. ^ Oliveira PH, Fang G (май 2020 г.). «Консервативные ДНК-метилтрансферазы: окно в фундаментальные механизмы эпигенетической регуляции у бактерий». Trends in Microbiology . 29 (1): 28–40. doi :10.1016/j.tim.2020.04.007. PMC 7666040 . PMID  32417228. 
  18. ^ McClung CA, Nestler EJ (январь 2008 г.). «Нейропластичность, опосредованная измененной экспрессией генов». Neuropsychopharmacology . 33 (1): 3–17. doi : 10.1038/sj.npp.1301544 . PMID  17728700. S2CID  18241370.
  19. ^ ab Duke CG, Kennedy AJ, Gavin CF, Day JJ, Sweatt JD (июль 2017 г.). «Зависящая от опыта эпигеномная реорганизация в гиппокампе». Learn Mem . 24 (7): 278–288. doi :10.1101/lm.045112.117. PMC 5473107. PMID  28620075 . 
  20. ^ "DNMT1". Отчет о символах генов . Комитет по номенклатуре генов HUGO . Архивировано из оригинала 2012-10-06 . Получено 2012-09-27 .
  21. ^ Chen T, Ueda Y, Xie S, Li E (октябрь 2002 г.). «Новая изоформа Dnmt3a, полученная из альтернативного промотора, локализуется в эухроматине, и ее экспрессия коррелирует с активным метилированием de novo». J Biol Chem . 277 (41): 38746–54. doi : 10.1074/jbc.M205312200 . PMID  12138111.
  22. ^ "DNMT3B". Отчет о символах генов . Комитет по номенклатуре генов HUGO . Архивировано из оригинала 2012-11-20 . Получено 27-09-2012 .
  23. ^ Барау Дж., Тейсандье А., Самудио Н., Рой С., Налессо В., Эро Ю. и др. (ноябрь 2016 г.). «ДНК-метилтрансфераза DNMT3C защищает мужские половые клетки от активности транспозонов». Наука . 354 (6314): 909–912. Бибкод : 2016Sci...354..909B. дои : 10.1126/science.aah5143. PMID  27856912. S2CID  30907442.
  24. ^ ab Manzo M, Wirz J, Ambrosi C, Villaseñor R, Roschitzki B, Baubec T (декабрь 2017 г.). «Изоформ-специфическая локализация DNMT3A регулирует точность метилирования ДНК на двухвалентных CpG-островках». EMBO J . 36 (23): 3421–3434. doi :10.15252/embj.201797038. PMC 5709737 . PMID  29074627. 
  25. ^ Rose NR, Klose RJ (декабрь 2014 г.). «Понимание взаимосвязи между метилированием ДНК и метилированием лизина гистонов». Biochim Biophys Acta . 1839 (12): 1362–72. doi :10.1016/j.bbagrm.2014.02.007. PMC 4316174. PMID  24560929 . 
  26. ^ "DNMT3L". Отчет о символах генов . Комитет по номенклатуре генов HUGO . Получено 27.09.2012 .
  27. ^ Kho MR, Baker DJ, Laayoun A, Smith SS (январь 1998). «Остановка метилтрансферазы ДНК человека (цитозин-5) на одноцепочечных конформерах из места динамической мутации». Журнал молекулярной биологии . 275 (1): 67–79. doi :10.1006/jmbi.1997.1430. PMID  9451440.
  28. ^ Смит СС, Каплан BE, Сауэрс LC, Ньюман EM (май 1992). «Механизм человеческой метил-направленной ДНК-метилтрансферазы и точность метилирования цитозина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (10): 4744–8. Bibcode : 1992PNAS...89.4744S. doi : 10.1073/pnas.89.10.4744 . PMC 49160. PMID  1584813. 
  29. ^ Jair KW, Bachman KE, Suzuki H, Ting AH, Rhee I, Yen RW и др. (январь 2006 г.). «De novo CpG-островковое метилирование в человеческих раковых клетках». Cancer Research . 66 (2): 682–92. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-1980. PMID  16423997.
  30. ^ Ting AH, Jair KW, Schuebel KE, Baylin SB (январь 2006 г.). «Дифференциальная потребность в ДНК-метилтрансферазе 1 при поддержании гиперметилирования промотора гена раковой клетки человека». Cancer Research . 66 (2): 729–35. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-1537. PMID  16424002.
  31. ^ Li E, Bestor TH, Jaenisch R (июнь 1992). «Целевая мутация гена ДНК-метилтрансферазы приводит к эмбриональной летальности». Cell . 69 (6): 915–26. doi :10.1016/0092-8674(92)90611-F. PMID  1606615. S2CID  19879601.
  32. ^ Goll MG, Kirpekar F, Maggert KA, Yoder JA, Hsieh CL, Zhang X и др. (январь 2006 г.). «Метилирование тРНКAsp гомологом ДНК-метилтрансферазы Dnmt2». Science . 311 (5759): 395–8. Bibcode :2006Sci...311..395G. doi :10.1126/science.1120976. PMID  16424344. S2CID  39089541.
  33. ^ "TRDMT1 тРНК аспарагиновая кислота метилтрансфераза 1 (Homo sapiens)". Entrez Gene . NCBI. 2010-11-01 . Получено 2010-11-07 .
  34. ^ Yang X, Han H, De Carvalho DD, Lay FD, Jones PA, Liang G (октябрь 2014 г.). «Метилирование генного тела может изменять экспрессию генов и является терапевтической целью при раке». Cancer Cell . 26 (4): 577–90. doi :10.1016/j.ccr.2014.07.028. PMC 4224113 . PMID  25263941. 
  35. ^ ab Karaca KG, Kupke J, Brito DV, Zeuch B, Thome C, Weichenhan D, Lutsik P, Plass C, Oliveira AM (январь 2020 г.). «Метилирование ДНК, специфичное для нейронного ансамбля, усиливает стабильность энграмм». Nat Commun . 11 (1): 639. Bibcode : 2020NatCo..11..639G. doi : 10.1038/s41467-020-14498-4. PMC 6994722. PMID  32005851 . 
  36. ^ Хегде М, Джоши МБ (апрель 2021 г.). «Комплексный анализ регуляции изоформ ДНК-метилтрансферазы в опухолях молочной железы человека». J Cancer Res Clin Oncol . 147 (4): 937–971. doi :10.1007/s00432-021-03519-4. PMC 7954751. PMID  33604794 . 
  37. ^ Oliveira AM, Hemstedt TJ, Bading H (июль 2012 г.). «Спасение связанного со старением снижения экспрессии Dnmt3a2 восстанавливает когнитивные способности». Nat Neurosci . 15 (8): 1111–3. doi :10.1038/nn.3151. PMID  22751036. S2CID  10590208.
  38. ^ Бернстайн К (2022). «Метилирование ДНК и установление памяти». Epigenet Insights . 15 : 25168657211072499. doi :10.1177/25168657211072499. PMC 8793415. PMID  35098021 . 
  39. ^ Bayraktar G, Kreutz MR (2018). «Роль деметилирования ДНК, зависящего от активности, во взрослом мозге и при неврологических расстройствах». Front Mol Neurosci . 11 : 169. doi : 10.3389/fnmol.2018.00169 . PMC 5975432. PMID  29875631 . 
  40. ^ Mack GS (декабрь 2010 г.). «К селективности и далее». Nature Biotechnology . 28 (12): 1259–66. doi :10.1038/nbt.1724. PMID  21139608. S2CID  11480326.
  41. ^ "EC одобряет разрешение на продажу препарата DACOGEN для лечения острого миелоидного лейкоза". 2012-09-28 . Получено 28 сентября 2012 г.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR001525
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR003356
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR012327
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR002941