stringtranslate.com

АДФ-рибозилирование

АДФ-рибоза

АДФ-рибозилирование представляет собой добавление одного или нескольких остатков АДФ-рибозы к белку . [1] [2] Это обратимая посттрансляционная модификация , которая участвует во многих клеточных процессах, включая клеточную сигнализацию , репарацию ДНК , регуляцию генов и апоптоз . [3] [4] Неправильное АДФ-рибозилирование было связано с некоторыми формами рака. [5] Оно также является основой токсичности бактериальных соединений, таких как холерный токсин , дифтерийный токсин и другие. [6]

История

Первое предположение об АДФ-рибозилировании появилось в начале 1960-х годов. В это время Пьер Шамбон и его коллеги наблюдали включение АТФ в экстракт ядер печени курицы. [7] После обширных исследований кислотонерастворимой фракции несколько различных исследовательских лабораторий смогли идентифицировать АДФ-рибозу , полученную из НАД + , как включенную группу. Несколько лет спустя были идентифицированы ферменты, ответственные за это включение, и им было дано название поли(АДФ-рибоза)полимераза. Первоначально считалось, что эта группа представляет собой линейную последовательность единиц АДФ-рибозы, ковалентно связанных через рибозную гликозидную связь. Позже было сообщено, что разветвление может происходить каждые 20–30 остатков АДФ. [8]

Первое появление моно(АДФ-рибозил)ирования произошло год спустя во время исследования токсинов: было показано, что дифтерийный токсин Corynebacterium diphtheriae зависит от НАД + для того, чтобы быть полностью эффективным [9] , что привело к открытию ферментативной конъюгации одной группы АДФ-рибозы моно(АДФ-рибозил)трансферазой.

Первоначально считалось, что АДФ-рибозилирование является посттрансляционной модификацией, вовлеченной исключительно в регуляцию генов. Однако, по мере того, как было обнаружено больше ферментов, способных АДФ-рибозилировать белки, многофункциональная природа АДФ-рибозилирования стала очевидной. Первый фермент млекопитающих с активностью поли(АДФ-рибозо)трансферазы был обнаружен в конце 1980-х годов. В течение следующих 15 лет он считался единственным ферментом, способным добавлять цепь АДФ-рибозы в клетки млекопитающих. [10] В конце 1980-х годов были открыты АДФ-рибозилциклазы, которые катализируют добавление циклических АДФ-рибозных групп к белкам. Наконец, было обнаружено, что сиртуины , семейство ферментов, которые также обладают НАД + -зависимой деацилирующей активностью, также обладают активностью моно(АДФ-рибозил)трансферазы. [11] [12]

Каталитический механизм

Механизм АДФ-рибозилирования, остатки катализирующего фермента показаны синим цветом. [ спорный – обсудить ]

Источником АДФ-рибозы для большинства ферментов, которые выполняют эту модификацию, является окислительно-восстановительный кофактор НАД + . В этой реакции переноса N- гликозидная связь НАД + , которая соединяет молекулу АДФ-рибозы и никотинамидную группу, расщепляется, после чего следует нуклеофильная атака целевой боковой цепи аминокислоты. (АДФ-рибозил)трансферазы могут выполнять два типа модификаций: моно(АДФ-рибозил)ирование и поли(АДФ-рибозил)ирование.

Моно(АДФ-рибозил)ация

Моно(АДФ-рибозил)трансферазы обычно катализируют добавление АДФ-рибозы к боковым цепям аргинина, используя высококонсервативный мотив RS-EXE фермента. [13] Реакция протекает путем разрыва связи между никотинамидом и рибозой с образованием иона оксония . Затем боковая цепь аргинина целевого белка действует как нуклеофил, атакуя электрофильный углерод, соседствующий с ионом оксония. Для того чтобы этот шаг произошел, нуклеофил аргинина депротонируется остатком глутамата на катализирующем ферменте [ оспаривается – обсудить ] . Другой консервативный остаток глутамата образует водородную связь с одной из гидроксильных групп на цепи рибозы, чтобы еще больше облегчить эту нуклеофильную атаку. В результате реакции расщепления высвобождается никотинамид. Модификацию можно обратить с помощью (АДФ-рибозил)гидролаз, которые расщепляют N- гликозидную связь между аргинином и рибозой, высвобождая АДФ-рибозу и немодифицированный белок; НАД + не восстанавливается в результате обратной реакции.

Поли(АДФ-рибозил)ация

Поли(АДФ-рибозо)полимеразы (PARP) встречаются в основном у эукариот и катализируют перенос нескольких молекул АДФ-рибозы к целевым белкам. Как и в случае с моно(АДФ-рибозил)ированием, источником АДФ-рибозы является НАД + . PARP используют каталитическую триаду His-Tyr-Glu для облегчения связывания НАД + и позиционирования конца существующей цепи поли(АДФ-рибозы) на целевом белке; Glu облегчает катализ и образование (1''→2') O -гликозидной связи между двумя молекулами рибозы. Существует несколько других ферментов, которые распознают цепи поли(АДФ-рибозы), гидролизуют их или образуют ответвления; более 800 белков были аннотированы как содержащие слабо определенный мотив связывания поли(АДФ-рибозы); Таким образом, в дополнение к этой модификации, изменяющей конформацию и структуру целевого белка, ее также можно использовать в качестве метки для привлечения других белков или для регулирования целевого белка. [14]

Аминокислотная специфичность

Многие различные боковые цепи аминокислот были описаны как акцепторы АДФ-рибозы. С химической точки зрения эта модификация представляет собой гликозилирование белка : перенос АДФ-рибозы происходит на боковые цепи аминокислот с нуклеофильным кислородом, азотом или серой, что приводит к образованию N- , O- или S -гликозидной связи с рибозой АДФ-рибозы. [15] Первоначально кислые аминокислоты ( глутамат и аспартат ) были описаны как основные сайты АДФ-рибозилирования. Однако в последующих работах были идентифицированы многие другие сайты акцепторов АДФ-рибозы, такие как серин , [16] [17] аргинин , [18] цистеин , [19] лизин , [20] дифтамид , [21] фосфосерин , [22] и аспарагин [23] .

Функция

Апоптоз

Во время повреждения ДНК или клеточного стресса PARP активируются, что приводит к увеличению количества поли(АДФ-рибозы) и уменьшению количества НАД + . [24] Более десятилетия считалось, что PARP1 является единственной поли(АДФ-рибозо)полимеразой в клетках млекопитающих, поэтому этот фермент был наиболее изучен. Каспазы представляют собой семейство цистеиновых протеаз , которые, как известно, играют важную роль в запрограммированной гибели клеток . Эта протеаза расщепляет PARP-1 на два фрагмента, оставляя его полностью неактивным, чтобы ограничить производство поли(АДФ-рибозы). Один из его фрагментов мигрирует из ядра в цитоплазму и, как полагают, становится мишенью аутоиммунитета.

Во время апоптоза , независимого от каспазы , также называемого партанатосом, накопление поли(АДФ-рибозы) может происходить из-за активации PARP или инактивации поли(АДФ-рибоза)гликогидролазы , фермента, который гидролизует поли(АДФ-рибозу) с образованием свободной АДФ-рибозы. Исследования показали, что поли(АДФ-рибоза) управляет транслокацией белка фактора, индуцирующего апоптоз, в ядро, где он будет опосредовать фрагментацию ДНК . Было высказано предположение, что если произойдет сбой активации каспазы в условиях стресса, произойдет некроптоз. Сверхактивация PARP привела к некротической гибели клеток , регулируемой белком фактора некроза опухоли . Хотя механизм еще не изучен, было показано, что ингибиторы PARP влияют на некроптоз. [25]

Регуляция генов

АДФ-рибозилирование может влиять на экспрессию генов практически на каждом уровне регуляции, включая организацию хроматина, набор и связывание факторов транскрипции, а также процессинг мРНК.

Организация нуклеосом является ключом к регуляции экспрессии генов: расположение и организация нуклеосом изменяют, какие области ДНК доступны для транскрипционного аппарата для связывания и транскрипции ДНК. Было показано, что PARP1 , поли-АДФ-рибозополимераза, влияет на структуру хроматина и способствует изменениям в организации нуклеосом посредством модификации гистонов .

Кристаллическая структура домена цинкового пальца PARP1, связанного с ДНК (фиолетовый). PDB: 4AV1

Было показано, что PARP влияют на структуру факторов транскрипции и вызывают набор многих факторов транскрипции для формирования комплексов на ДНК и вызывают транскрипцию. Также показано, что моно(АДФ-рибозил)трансферазы влияют на связывание факторов транскрипции на промоторах. Например, было показано, что PARP14, моно(АДФ-рибозил)трансфераза, влияет на связывание факторов транскрипции STAT .

Было показано, что другие (АДФ-рибозил)трансферазы модифицируют белки, связывающие мРНК , что может вызвать подавление транскрипта этого гена. [26]

восстановление ДНК

Поли(АДФ-рибозо)полимеразы (PARP) могут функционировать при восстановлении одноцепочечных разрывов ДНК , а также двухцепочечных разрывов. При восстановлении одноцепочечных разрывов ( репарация с удалением оснований ) PARP может либо способствовать удалению окисленного сахара, либо расщеплению цепи. PARP1 связывает одноцепочечные разрывы и подтягивает любые близлежащие промежуточные продукты репарации с удалением оснований. Эти промежуточные продукты включают XRCC1 и APLF, и они могут быть привлечены напрямую или через домен PBZ APLF. [27] Это приводит к синтезу поли(АДФ-рибозы). Домен PBZ присутствует во многих белках, участвующих в восстановлении ДНК, и обеспечивает связывание PARP и, таким образом, АДФ-рибозилирование, которое привлекает факторы восстановления для взаимодействия в месте разрыва. PARP2 является вторичным ответчиком на повреждение ДНК, но служит для обеспечения функциональной избыточности при восстановлении ДНК. [28]

Репарация ДНК, облегчаемая привлечением PARP1 ферментов репарации. Репарация одноцепочечного разрыва ДНК инициируется связыванием PARP1. PARP1 связывает одноцепочечные разрывы и сближает промежуточные продукты эксцизионной репарации оснований, что приводит к синтезу поли(АДФ-рибозы). XRCC1 — это перекрестно-комплементарный белок репарации рентгеновских лучей 1. XRCC1 образует комплексы с полинуклеотидкиназой (PNK), которая обрабатывает концы ДНК. PCNA — это ядерный антиген пролиферирующих клеток, который служит в качестве зажима ДНК, помогающего в активности ДНК-полимеразы (DNA pol). Затем рекрутируется FEN1 (эндонуклеаза лоскута 1) для удаления выступающего 5'-лоскута. Последний этап репарации ДНК включает ДНК-лигазу, которая объединяет конечные цепи ДНК в фосфодиэфирную связь.

Существует множество механизмов восстановления поврежденной двухцепочечной ДНК. PARP1 может функционировать как фактор синапсиса в альтернативном негомологичном соединении концов. Кроме того, было высказано предположение, что PARP1 требуется для замедления репликативных вилок после повреждения ДНК и способствует гомологичной рекомбинации в репликативных вилках , которые могут быть дисфункциональными. Возможно, что PARP1 и PARP3 работают вместе при восстановлении двухцепочечной ДНК, и было показано, что PARP3 имеет решающее значение для разрешения двухцепочечных разрывов. Существуют две гипотезы, согласно которым PARP1 и PARP3 совпадают. Первая гипотеза утверждает, что две (АДФ-рибозил)трансферазы служат для функционирования при неактивности друг друга. Если PARP3 теряется, это приводит к одноцепочечным разрывам и, таким образом, к привлечению PARP1. Вторая гипотеза предполагает, что два фермента работают вместе; PARP3 катализирует моно(АДФ-рибозил)ацию и короткую поли(АДФ-рибозил)ацию и служит для активации PARP1. [28]

PARP имеют много белковых мишеней в месте повреждения ДНК. Белок KU и DNA-PKcs являются компонентами репарации двухцепочечных разрывов с неизвестными сайтами АДФ-рибозилирования. Гистоны являются еще одной белковой мишенью PARP. Все основные гистоны и линкерный гистон H1 подвергаются АДФ-рибозилированию после повреждения ДНК. Функция этих модификаций до сих пор неизвестна, но было высказано предположение, что АДФ-рибозилирование модулирует структуру хроматина более высокого порядка , стремясь облегчить миграцию более доступных сайтов для факторов репарации к повреждению ДНК.

Деградация белка

Система убиквитин-протеасомы (UPS) играет важную роль в деградации белков. Протеасома 26S состоит из каталитической субъединицы (коровая частица 20S) и регуляторной субъединицы (колпачок 19S). [29] Полиубиквитиновые цепи помечают белки для деградации протеасомой, что вызывает гидролиз помеченных белков на более мелкие пептиды.

Физиологически PI31 атакует каталитический домен 20S протеасомы 26S, что приводит к снижению активности протеасомы. (АДФ-рибозил)трансфераза Танкираза (TNKS) вызывает АДФ-рибозилирование PI31, что в свою очередь увеличивает активность протеасомы. Ингибирование TNK дополнительно показывает снижение сборки 26S протеасомы. Таким образом, АДФ-рибозилирование способствует активности 26S протеасомы как в клетках Drosophila , так и в клетках человека. [30]

Регуляция ферментов

Активность некоторых ферментов регулируется АДФ-рибозилированием. Например, активность ди-нитрогеназа-редуктазы Rodospirillum rubrum отключается АДФ-рибозилированием остатка аргинина и реактивируется удалением АДФ-рибозильной группы. [31]

Клиническое значение

Рак

PARP1 участвует в репарации удаления оснований (BER), репарации одно- и двухцепочечных разрывов и стабильности хромосом. Он также участвует в регуляции транскрипции посредством содействия белок-белковым взаимодействиям . PARP1 использует NAD + для выполнения своей функции при апоптозе. Если PARP становится сверхактивным, клетка будет иметь пониженные уровни кофактора NAD + , а также пониженные уровни АТФ и, таким образом, подвергнется некрозу . Это важно в канцерогенезе , поскольку может привести к отбору клеток с дефицитом PARP1 (но не истощенных) из-за их преимущества в выживании во время роста рака. [32]

Восприимчивость к канцерогенезу при дефиците PARP1 в значительной степени зависит от типа полученного повреждения ДНК. Существует множество выводов о том, что различные PARP участвуют в предотвращении канцерогенеза. Как было сказано ранее, PARP1 и PARP2 участвуют в BER и хромосомной стабильности. PARP3 участвует в регуляции центросомы . Танкираза — это еще одна (АДФ-рибозил)полимераза, которая участвует в регуляции длины теломер . [5]

Ингибирование PARP1 также широко изучалось в противораковой терапии. Механизм действия ингибитора PARP1 заключается в усилении повреждения, наносимого химиотерапией раковой ДНК, путем блокирования репаративной функции PARP1 у лиц с дефицитом BRCA1/2.

PARP14 — еще один фермент АДФ-рибозилирования, который был хорошо изучен в отношении целей терапии рака; он является передатчиком сигнала и активатором белка, взаимодействующего с транскрипцией STAT6 , и, как было показано, связан с агрессивностью В-клеточных лимфом. [32]

Бактериальные токсины

Бактериальные АДФ-рибозилирующие экзотоксины (bARE) ковалентно переносят АДФ-рибозную часть НАД + к целевым белкам инфицированных эукариот, чтобы получить никотинамид и свободный ион водорода. bARE производятся как предшественники ферментов , состоящие из доменов «A» и «B»: домен «A» отвечает за активность АДФ-рибозилирования; и домен «B» за транслокацию фермента через мембрану клетки. Эти домены могут существовать совместно в трех формах: во-первых, как отдельные полипептидные цепи с доменами A и B, ковалентно связанными; во-вторых, в многобелковых комплексах с доменами A и B, связанными нековалентными взаимодействиями; и, в-третьих, в многобелковых комплексах с доменами A и B, не взаимодействующими напрямую, до обработки. [6]

Кристаллическая структура дифтерийного токсина. PDB: 1MDT

При активации bAREs АДФ-рибозилируют любое количество эукариотических белков; такой механизм имеет решающее значение для инициирования болезненных состояний, связанных с АДФ-рибозилированием. ГТФ-связывающие белки , в частности, хорошо известны в патофизиологии bAREs. Например, холера и термолабильный энтеротоксин нацелены на α-субъединицу Gs гетеротримерных ГТФ-связывающих белков . Поскольку α-субъединица АДФ-рибозилирована, она постоянно находится в «активном», ГТФ-связанном состоянии; последующая активация внутриклеточного циклического АМФ стимулирует высвобождение жидкости и ионов из эпителиальных клеток кишечника. Кроме того, C. Botulinum C3 АДФ-рибозилирует ГТФ-связывающие белки Rho и Ras , а коклюшный токсин АДФ-рибозилирует Gi , Go и Gt. Дифтерийный токсин АДФ-рибозилирует рибосомальный фактор удлинения EF-2 , что ослабляет синтез белка. [6]

Существует множество бактерий, которые используют bARE при инфекции: токсин CARDS Mycoplasma pneumoniae , холерный токсин Vibrio cholerae ; термолабильный энтеротоксин E. coli ; экзотоксин A Pseudomonas aeruginosa ; коклюшный токсин B. pertussis ; токсин C3 C. botulinum ; и дифтерийный токсин Corynebacterium diphtheriae . [33]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Беленький П., Боган КЛ., Бреннер С. (2007). "Метаболизм НАД+ в здоровье и болезни" (PDF) . Trends Biochem. Sci . 32 (1): 12–9. doi :10.1016/j.tibs.2006.11.006. PMID  17161604.
  2. ^ Циглер М (2000). «Новые функции давно известной молекулы. Новые роли НАД в клеточной сигнализации». Eur. J. Biochem . 267 (6): 1550–64. doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01187.x . PMID  10712584.
  3. ^ Бергер Ф., Рамирес-Эрнандес М. Х., Циглер М. (2004). «Новая жизнь столетнего человека: сигнальные функции НАД(Ф)». Trends Biochem. Sci . 29 (3): 111–8. doi :10.1016/j.tibs.2004.01.007. PMID  15003268. S2CID  8820773.
  4. ^ Corda D, Di Girolamo M (2003). "ОБЗОР НОВОГО УЧАСТНИКА EMBO: Функциональные аспекты моно-АДФ-рибозилирования белка". EMBO J. 22 ( 9): 1953–8. doi :10.1093/emboj/cdg209. PMC 156081. PMID  12727863 . 
  5. ^ ab Scarpa ES, Fabrizio G, Di Girolamo M (2013). ". Роль внутриклеточного моно-АДФ-рибозилирования в биологии рака". FEBS Journal . 280 (15): 3551–3562. doi : 10.1111/febs.12290 . PMID  23590234.
  6. ^ abc Krueger, KM; Barbieri, JT (январь 1995). «Семейство бактериальных АДФ-рибозилирующих экзотоксинов». Clinical Microbiology Reviews . 8 (1): 34–47. doi : 10.1128/CMR.8.1.34. PMC 172848. PMID  7704894. 
  7. ^ Chambon, P; Weill, JD; Mandel, P. (1963). «Активация никотинамидмононуклеотида нового ДНК-зависимого полиаденилового кислотного синтезирующего ядерного фермента». Biochem. Biophys. Res. Commun . 11 : 39–43. doi :10.1016/0006-291x(63)90024-x. PMID  14019961.
  8. ^ Хаяиси, О.; Уэда, К. (2012). Реакции поли- и моно(АДФ-рибозил)ирования: их значение в молекулярной биологии. В Реакции АДФ-рибозилирования: биология и медицина . Нью-Йорк: Academic Press.
  9. ^ Collier RJ, Pappenheimer, Jr AM (1964). "ИССЛЕДОВАНИЯ ПО СПОСОБУ ДЕЙСТВИЯ ДИФТЕРИЙНОГО ТОКСИНА* II. ВЛИЯНИЕ ТОКСИНА НА ВКЛЮЧЕНИЕ АМИНОКИСЛОТ В БЕСКЛЕТОЧНУЮ СИСТЕМУ". Журнал экспериментальной медицины . 120 (6): 1019–1039. doi : 10.1084/jem.120.6.1019 . PMC 2137798. PMID  14238922 . 
  10. ^ Хасса, PO; Хаенни, SS; Элсер, M.; Хоттигер, MO (2006). "Хасса, PO; Хаенни, SS; Элсер, M.; Хоттигер, MO (2006) "Ядерные реакции АДФ-рибозилирования в клетках млекопитающих: где мы сегодня и куда мы идем". Microbiol. Mol. Biol. Rev. 70 ( 3): 789–829. doi :10.1128/mmbr.00040-05. PMC 1594587. PMID 16959969  . 
  11. ^ Frye, RA (24 июня 1999 г.). «Характеристика пяти человеческих кДНК с гомологией с геном дрожжей SIR2: белки, подобные Sir2 (сиртуины), метаболизируют НАД и могут обладать активностью АДФ-рибозилтрансферазы белка». Biochemical and Biophysical Research Communications . 260 (1): 273–9. doi :10.1006/bbrc.1999.0897. PMID  10381378.
  12. ^ Rack, Johannes Gregor Matthias; Morra, Rosa; Barkauskaite, Eva; Kraehenbuehl, Rolf; Ariza, Antonio; Qu, Yue; Ortmayer, Mary; Leidecker, Orsolya; Cameron, David R. (16 июля 2015 г.). «Идентификация класса белковых АДФ-рибозилирующих сиртуинов у микробных патогенов». Molecular Cell . 59 (2): 309–320. doi :10.1016/j.molcel.2015.06.013. ISSN  1097-4164. PMC 4518038 . PMID  26166706. 
  13. ^ Лэйнг, Сабрина; Унгер, Мэнди; Кох-Нолте, Фридрих; Хааг, Фридрих (21 июля 2010 г.). «АДФ-рибозилирование аргинина». Аминокислоты . 41 (2): 257–269. doi : 10.1007/s00726-010-0676-2. PMC 3102197. PMID  20652610. 
  14. ^ Žaja, Roko; Mikoč, Andreja; Barkauskaite, Eva; Ahel, Ivan (21 декабря 2012 г.). «Molecular Insights into Poly(ADP-ribose) Recognition and Processing». Biomolecules . 3 (1): 1–17. doi : 10.3390/biom3010001 . PMC 4030884 . PMID  24970154. 
  15. ^ Лю, Цян; Флореа, Богдан И.; Филиппов, Дмитрий В. (2017). «ADP-рибозилирование становится нормальным: серин как основной сайт модификации». Cell Chemical Biology . 24 (4): 431–432. doi : 10.1016/j.chembiol.2017.04.003 . PMID  28431224.
  16. ^ Leidecker, Orsolya; Bonfiglio, Juan José; Colby, Thomas; Zhang, Qi; Atanassov, Ilian; Zaja, Roko; Palazzo, Luca; Stockum, Anna; Ahel, Ivan; Matic, Ivan (2016). «Серин — новый целевой остаток для эндогенного АДФ-рибозилирования гистонов». Nature Chemical Biology . 12 (12): 998–1000. doi :10.1038/nchembio.2180. PMC 5113755 . PMID  27723750. 
  17. ^ Бонфиглио, Хуан Хосе; Фонтана, Пьетро; Чжан, Ци; Колби, Томас; Гиббс-Сеймур, Ян; Атанасов, Илиан; Бартлетт, Эдвард; Зая, Роко; Ахель, Иван; Матич, Иван (2017). «Серин-АДФ-рибозилирование зависит от HPF1». Молекулярная клетка . 65 (5): 932–940.e6. doi : 10.1016/j.molcel.2017.01.003 . ПМЦ 5344681 . ПМИД  28190768. 
  18. ^ Laing S, Koch-Nolte F, Haag F, Buck F. «Стратегии идентификации участков АДФ-рибозилирования аргинина». Журнал протеомики. 2011;75:169–176.
  19. ^ Макдональд Л. Дж., Мосс Дж. «Ферментативное и неферментативное АДФ-рибозилирование цистеина». Mol Cell Biochem. 1994;138:221–226.
  20. ^ Месснер, Саймон; Альтмейер, Маттиас; Чжао, Хонгтао; Позивил, Андреа; Рошицки, Бернд; Гериг, Питер; Рутисхаузер, Доротея; Хуан, Данжи; Кафлиш, Амедео; Хоттигер, Майкл О. (2010). "PARP1 ADP-рибозилирует остатки лизина в хвостах основных гистонов". Nucleic Acids Research . 38 (19): 6350–6362. doi :10.1093/nar/gkq463. PMC 2965223 . PMID  20525793. 
  21. ^ Оппенгеймер Н. Дж., Бодли Дж. В. Дифтерийный токсин. «Место и конфигурация АДФ-рибозилирования дифтамида в факторе удлинения 2». J Biol Chem. 1981;256:8579–8581.
  22. ^ Смит JA, Стокен LA. «Химические и метаболические свойства производных аденозиндифосфатрибозы ядерных белков». Biochem J. 1975;147:523–529.
  23. ^ Manning DR, Fraser BA, Kahn RA, Gilman AG. «АДФ-рибозилирование трансдуцина белком активации островков. Идентификация аспарагина как места АДФ-рибозилирования». J Biol Chem. 1984;259:749–756.
  24. ^ Scovassi, AI; Denegri, M; Donzelli, M; Rossi, L; Bernardi, R; Mandarino, A; Frouin, I; Negri, C (1998). «Синтез поли(АДФ-рибозы) в клетках, подвергающихся апоптозу: попытка встретить смерть до деградации PARP». European Journal of Histochemistry . 42 (4): 251–8. PMID  10068897.
  25. ^ Aredia, F; Scovassi, AI (1 июня 2014 г.). «Участие PARP в гибели клеток». Frontiers in Bioscience . 6 (2): 308–17. doi : 10.2741/707 . PMID  24896207.
  26. ^ Рю, Кын Ву; Ким, Дэ-Сок; Краус, В. Ли (9 января 2015 г.). «Новые грани в регуляции экспрессии генов с помощью АДФ-рибозилирования и поли(АДФ-рибозо) полимераз». Chemical Reviews . 115 (6): 2453–2481. doi :10.1021/cr5004248. PMC 4378458 . PMID  25575290. 
  27. ^ Schreiber, V; Amé, JC; Dollé, P; Schultz, I; Rinaldi, B; Fraulob, V; Ménissier-de Murcia, J; de Murcia, G (21 июня 2002 г.). "Поли(АДФ-рибоза) полимераза-2 (PARP-2) необходима для эффективной репарации ДНК путем эксцизии оснований в сочетании с PARP-1 и XRCC1". Журнал биологической химии . 277 (25): 23028–36. doi : 10.1074/jbc.m202390200 . PMID  11948190.
  28. ^ ab Pears, Catherine J.; Couto, C. Anne-Marie; Wang, Hong-Yu; Borer, Christine; Kiely, Rhian; Lakin, Nicholas D. (28 октября 2014 г.). «Роль АДФ-рибозилирования в регуляции репарации двухцепочечных разрывов ДНК». Cell Cycle . 11 (1): 48–56. doi :10.4161/cc.11.1.18793. PMC 3272231 . PMID  22186780. 
  29. ^ Чэн, Ифань (апрель 2009 г.). «К атомной модели протеасомы 26S». Current Opinion in Structural Biology . 19 (2): 203–208. doi :10.1016/j.sbi.2009.02.004. PMC 2743420. PMID  19286367 . 
  30. ^ Чо-Парк, Парк Ф.; Стеллер, Герман (25 апреля 2013 г.). «Регуляция протеасомы с помощью АДФ-рибозилирования». Cell . 153 (3): 614–627. doi :10.1016/j.cell.2013.03.040. ISSN  0092-8674. PMC 3676968 . PMID  23622245. 
  31. ^ Поуп, MR; Саари, LL; Ладден, PW (5 августа 1986 г.). "N-гликогидролиз связей аденозина дифосфорибозил аргинина динитрогеназа-редуктазой, активирующей гликогидролазу (активирующий фермент) из Rhodospirillum rubrum". Журнал биологической химии . 261 (22): 10104–10111. doi : 10.1016/S0021-9258(18)67497-6 . ​​ISSN  0021-9258. PMID  3090031.
  32. ^ ab Boulares HA, Yakovlev AG, Smulson ME (2000). «Деградация генома эндонуклеазой DNAS1L3: ключевое событие, регулируемое PARP-1, в апоптозе». База данных бионауки мадам Кюри .
  33. ^ Дэн, Цин; Барбьери, Джозеф Т. (октябрь 2008 г.). «Молекулярные механизмы цитотоксичности АДФ-рибозилирующих токсинов». Annual Review of Microbiology . 62 (1): 271–288. doi :10.1146/annurev.micro.62.081307.162848. PMID  18785839.

Дальнейшее чтение