Молекулярный логический вентиль — это молекула, которая выполняет логическую операцию на основе одного или нескольких физических или химических входных данных и одного выходного сигнала. Эта область продвинулась от простых логических систем, основанных на одном химическом или физическом входе, к молекулам, способным выполнять комбинаторные и последовательные операции, такие как арифметические операции (т.е. молекулярные устройства и алгоритмы хранения памяти). [1] Молекулярные логические элементы работают с входными сигналами, основанными на химических процессах , и с выходными сигналами, основанными на спектроскопических явлениях.
Логические вентили являются фундаментальными строительными блоками электрических цепей. Их можно использовать для построения цифровых архитектур различной степени сложности с помощью каскада от нескольких до нескольких миллионов логических элементов. Логические вентили — это, по сути, физические устройства, которые выдают единый двоичный выход после выполнения логических операций , основанных на логических функциях, на одном или нескольких двоичных входах. Концепция молекулярных логических элементов, расширяющая применимость логических элементов к молекулам, направлена на преобразование химических систем в вычислительные единицы. [2] [3] За последние три десятилетия эта область развилась, чтобы реализовать несколько практических приложений в молекулярной электронике , биосенсорстве , вычислениях ДНК , наноробототехнике и визуализации клеток , среди других.
Для логических элементов с одним входом существует четыре возможных шаблона вывода. Когда входной сигнал равен 0, выходной сигнал может быть либо 0, либо 1. Когда входной сигнал равен 1, выходной сигнал снова может быть 0 или 1. Четыре возможных комбинации выходных битов соответствуют определенному типу логики: PASS 0, YES , NOT и PASS 1. PASS 0 всегда выводит 0, независимо от входных данных. PASS 1 всегда выводит 1, независимо от входных данных. YES выводит 1, когда входной сигнал равен 1, а NOT является обратным YES – он выводит 0, когда входной сигнал равен 1. [ нужна ссылка ]
AND , OR , XOR , NAND , NOR , XNOR и INH — логические элементы с двумя входами. Вентиляторы AND , OR и XOR являются фундаментальными логическими вентилями, а вентили NAND , NOR и XNOR дополняют вентили AND, OR и XOR соответственно. Вентиль INHIBIT (INH) — это специальный условный логический вентиль, включающий запрещающий вход. Когда запрещающий входной сигнал отсутствует, производимый результат зависит исключительно от другого входного сигнала. [ нужна цитата ]
Одна из самых ранних идей использования π -сопряженных молекул в молекулярных вычислениях была предложена Ари Авирамом из IBM в 1988 году . -связанные молекулы и исследовать их стереохимические свойства для потенциального применения в молекулярных устройствах. Система состояла из двух π-сопряженных систем, 1 и 2, состоящих из олиготиофенов, соединенных спиросвязью и соединенных с золотыми электродами тиоловыми линкерами . π-система 1 непроводит в нейтральном состоянии, тогда как система 2 является электропроводной в катион-радикальной форме. Искривленная структура системы благодаря спиросвязям препятствует транспорту электронов между двумя π-системами. Однако через электроды, направленные к связи, сильное электрическое поле может способствовать переносу электронов из системы 1 в систему 2, при этом катион-радикал движется в противоположном направлении. [ нужна цитата ]
Первая практическая реализация молекулярной логики была любезно предоставлена де Сильвой и его коллегами в их плодотворной работе, в которой они построили молекулярный фотоионный вентиль И с флуоресцентным выходом. [6] Хотя молекулярный логический вентиль YES, как описано ранее, может преобразовывать сигналы из ионной формы в фотонную (отсюда и термин «фотоионный»), они представляют собой системы с сингулярным входом и сингулярным выходом. Для построения более сложных архитектур молекулярной логики необходимы вентили с двумя входами, а именно вентили И и ИЛИ. Некоторые ранние работы достигли определенного прогресса в этом направлении, но не смогли реализовать полную таблицу истинности, поскольку их ионные формы (протонированные) не во всех случаях могли связываться с субстратом. [7] [8] Де Сильва и компания. сконструировали вентиль AND на основе антрацена , состоящий из единиц третичного амина и бензо-18-крауна-6, которые, как известно, демонстрируют процессы фотоиндуцированного электронного переноса (ПЭТ). В показанной системе они оба действовали как рецепторы, связанные с флуорофором на основе антрацена посредством алкильных спейсеров. ПЭТ гасится при координации с протонами [9] и ионами натрия [10] соответственно для двух рецепторов и приводит к флуоресценции антраценового звена . Таблица истинности для вентиля И была полностью реализована, поскольку система будет демонстрировать выход флуоресценции только в присутствии как протонов, так и ионов натрия в системе. [ нужна цитата ]
Пример логического элемента YES включает бензокраун-эфир, соединенный с цианозамещенным антраценовым звеном. Выходной сигнал 1 (флуоресценция) получается только тогда, когда в растворе присутствуют ионы натрия (что указывает на входной сигнал 1). Ионы натрия инкапсулируются краун-эфиром, что приводит к тушению процесса ПЭТ и флуоресценции антраценового звена. [11]
Этот молекулярный логический элемент иллюстрирует переход от окислительно-восстановительно-флуоресцентных переключателей к многовходовым логическим элементам с электрохимическим переключателем, обнаруживающим присутствие кислот. Этот логический вентиль И с двумя входами включает в себя рецептор протонов третичного амина и окислительно-восстановительный донор тетратиафульвалена. Эти группы, присоединенные к антрацену, могут одновременно обрабатывать информацию о концентрации кислоты и окислительной способности раствора. [12]
Де Сильва и др. сконструировали молекулярный логический вентиль ИЛИ, используя рецептор азакраун -эфира и ионы натрия и калия в качестве входных данных. Любой из двух ионов может связываться с краун-эфиром, вызывая гашение ПЭТ и включение флуоресценции. Поскольку любой из двух ионов (вход «1») мог включить флуоресценцию (выход «1»), система напоминала логический элемент ИЛИ. [6]
Логический элемент INHIBIT включает в себя ион Tb 3+ в хелатном комплексе. Этот логический вентиль с двумя входами является первым в своем роде [ тоновым ] и демонстрирует некоммутативное поведение с химическими входами и выходом фосфоресценции . При наличии дикислорода (вход «1») система гасится и фосфоресценция не наблюдается (выход «0»). Второй вход, H + , также должен присутствовать, чтобы можно было наблюдать выход «1». Это можно понять из таблицы истинности INHIBIT с двумя входами, представленной в Таблице 2. [13]
Паркер и Уильямс сконструировали логический вентиль И-НЕ, основанный на сильном излучении тербиевого комплекса фенантридина . При отсутствии кислоты и кислорода (два входа) (вход «0») включается флуоресценция тербиевого центра (выход «1»). Следовательно, система действует как молекулярный вентиль И-НЕ. [14]
Аккая и его коллеги продемонстрировали молекулярные ворота NOR с использованием борадиазаиндаценовой системы. Установлено, что флуоресценция высокоэмиссионного борадиазаиндацена (вход «1») гасится в присутствии либо соли цинка [Zn(II)], либо трифторуксусной кислоты (ТФУ). Таким образом, система может реализовать таблицу истинности логического элемента ИЛИ-НЕ. [15]
Де Сильва и МакКленаган разработали арифметическое устройство, проверяющее принцип работы, основанное на молекулярных логических элементах. Как показано на Фигуре 10А , Соединение А представляет собой двухтактный олефин с верхним рецептором, содержащим четыре анионные группы карбоновой кислоты (и неуказанные противокатионы), способные связываться с кальцием . Нижняя часть представляет собой молекулу хинолина , которая является рецептором ионов водорода. Логический вентиль работает следующим образом. Без какого-либо химического введения Ca 2+ или H + хромофор демонстрирует максимальное поглощение в УФ/ВИД-спектроскопии при 390 нм . При введении кальция происходит гипсохромный сдвиг ( синий сдвиг ) и оптическая плотность при 390 нм уменьшается. Аналогично, добавление протонов вызывает батохромный сдвиг ( красное смещение ), и когда оба катиона находятся в воде, конечным результатом является поглощение при исходной длине волны 390 нм. Эта система представляет собой логический вентиль «ИСКЛЮЧАЮЩЕЕ ИЛИ» при поглощении и логический вентиль «ИСКЛЮЧАЮЩЕЕ ИЛИ» при пропускании . [16]
В другой системе логических элементов XOR химический состав основан на псевдоротаксане , изображенном на рисунке 11 . В органическом растворе электронодефицитная соль диазапирения (стержень) и богатые электронами 2,3-диоксинафталиновые звенья краун -эфира (кольцо) самособираются путем образования комплекса с переносом заряда . Добавленный третичный амин, такой как трибутиламин, образует аддукт 1:2 с диазапиреном, и комплекс разрушается. Этот процесс сопровождается увеличением интенсивности излучения при 343 нм, обусловленного освобожденным краун-эфиром. Добавленная трифторметансульфоновая кислота реагирует с амином, и процесс обращается вспять. Избыток кислоты блокирует краун-эфир путем протонирования , и комплекс снова разрывается. [17]
В соединении B на рисунке 10B нижняя часть содержит третичную аминогруппу, также способную связываться с протонами. В этой системе флуоресценция имеет место только тогда, когда доступны оба катиона. Присутствие обоих катионов препятствует фотоиндуцированному переносу электронов (ПЭТ), позволяя соединению B флуоресцировать. В отсутствие обоих или любого из ионов флуоресценция гасится ПЭТ, который включает перенос электрона либо от атома азота, либо от атомов кислорода, либо от обоих к антраценильной группе. Когда оба рецептора связаны с ионами кальция и протонами соответственно, оба канала ПЭТ отключаются. Общий результат Соединения B представляет собой логику И, поскольку выходной сигнал «1» (флуоресценция) возникает только тогда, когда в растворе присутствуют и Ca 2+ , и H + , то есть имеют значения «1». При параллельной работе обеих систем и мониторинге пропускания для системы A и флуоресценции для системы B в результате получается полусумматор, способный воспроизводить уравнение 1 + 1 = 2. [16]
В модификации системы Б в логическом элементе «И» одновременно обрабатываются не два, а три химических входа. Усиленный сигнал флуоресценции наблюдается только в присутствии избытка протонов, ионов цинка и натрия за счет взаимодействия с соответствующими амино- , фенилдиаминокарбоксилатными и краун-эфирными рецепторами. Режим обработки работает аналогично рассмотренному выше – флуоресценция наблюдается за счет предотвращения конкурирующих реакций фотоиндуцированного переноса электрона от рецепторов к возбужденному антраценовому флуорофору. Отсутствие одного, двух или всех трех ионных входов приводит к низкому выходу флуоресценции. Каждый рецептор селективен в отношении своего конкретного иона, поскольку увеличение концентрации других ионов не приводит к высокой флуоресценции. Конкретный порог концентрации каждого входа должен быть достигнут для достижения флуоресцентного выхода в соответствии с комбинаторной логикой И. [18]
Молекулярный логический вентиль может обрабатывать модуляторы так же, как установка, показанная в доказательстве принципа де Сильвы [16] , но включение разных логических вентилей в одну и ту же молекулу является сложной задачей. Такая функция называется интегрированной логикой и иллюстрируется логическим элементом полувычитателя на основе BODIPY , проиллюстрированным Коскуном, Аккая и их коллегами. При мониторинге на двух разных длинах волн, 565 и 660 нм, операции логического вентиля XOR и INHIBIT реализуются на соответствующих длинах волн. Оптические исследования этого соединения в ТГФ выявили пик поглощения при 565 нм и пик эмиссии при 660 нм. Добавление кислоты приводит к гипсохромному сдвигу обоих пиков, поскольку протонирование третичного амина приводит к внутреннему переносу заряда. Цвет наблюдаемого излучения желтый. При добавлении сильного основания фенольная гидроксильная группа депротонируется, что приводит к фотоиндуцированному переносу электрона, что, в свою очередь, делает молекулу неэмиссионной. При добавлении как кислоты, так и основания излучение молекулы наблюдается в красном цвете, поскольку третичный амин не будет протонирован, а гидроксильная группа останется протонированной, что приведет к отсутствию как ПЭТ, так и внутримолекулярного переноса заряда (ВКТ). . Благодаря большой разнице в интенсивности излучения эта единственная молекула способна выполнять арифметическую операцию — вычитание — на наноуровне. [19]
Полная сумматорная система на основе флуоресцеина также была создана Шанзером и др. Система способна вычислить 1+1+1=3. [1]
На протяжении многих лет полезность молекулярных логических вентилей исследовалась в широком спектре областей, таких как химическое и биологическое обнаружение, фармацевтическая и пищевая промышленность, а также в новых областях наноматериалов и химических вычислений . [20] [21] [22] [23] [24]
Анионы фторида (F - ) и ацетата (CH 3 COO - ) являются одними из наиболее важных с точки зрения здоровья и благополучия человека. Первый, хотя и широко используется в здравоохранении, известен своей токсичностью и коррозионной активностью. Последний может вызвать алкалоз и повлиять на метаболические пути за пределами определенной концентрации. Следовательно, крайне важно разработать методы обнаружения этих анионов в водных средах. Бхат и др. . сконструировали ворота INHIBIT с рецепторами, которые избирательно связываются с анионами F‑ и CH 3 COO – . Система использовала изменения оптической плотности в качестве колориметрического результата для определения концентрации анионов. [25]
Вэнь и его коллеги также разработали молекулярный логический вентиль INHIBIT с Fe 3+ и ЭДТА в качестве входов и выходом флуоресценции для обнаружения ионов железа в растворах. Флуоресценция системы тушится тогда и только тогда, когда присутствует вход Fe 3+ и отсутствует ЭДТА. [26]
Ионы тяжелых металлов представляют постоянную угрозу здоровью человека из-за присущей им токсичности и низкой способности к разложению. Было создано несколько систем на основе молекулярных логических элементов для обнаружения ионов, таких как Cd 2+ , [27] Hg 2+ / Pb 2+ , [28] и Ag + . [29] В своей работе Чен и его коллеги продемонстрировали, что системы на основе логических вентилей могут использоваться для обнаружения ионов Cd 2+ в образцах риса, тем самым расширяя сферу применения и до обнаружения безопасности в пищевых материалах. [27]
Эффективность таких методов лечения рака, как химиотерапия, имеет тенденцию к стабилизации через некоторое время, поскольку клетки претерпевают молекулярные изменения, которые делают их нечувствительными к действию противораковых препаратов. [30] Следовательно, крайне важно обнаружить наличие раковых клеток на ранней стадии. Важный биомаркер, микроРНК (миРНК), имеет решающее значение в этом обнаружении благодаря характеру его экспрессии. [31] Чжан и др. продемонстрировали для этой цели каскад вентилей INHIBIT-OR, [32] Yue and co. использовали вентиль AND для создания системы с двумя входами микроРНК и выходом фотолюминесценции квантовых точек [33] и Peng et al. также построили систему двойного входа на основе AND-ворота для одновременного обнаружения микроРНК из опухолевых клеток. [34]
Аккая и др. проиллюстрировали применение логического вентиля для фотодинамической терапии в своей работе. Краситель бодипи , присоединенный к краун-эфиру и двум пиридильным группам, разделенным спейсерами, работает по логическому принципу «И». Молекула действует как фотодинамический агент при облучении длиной волны 660 нм в условиях относительно высоких концентраций ионов натрия и протонов, превращая триплетный кислород в цитотоксический синглетный кислород . В этом прототипном примере будут использованы преимущества более высоких уровней натрия и более низкого pH в опухолевой ткани по сравнению с уровнями в нормальных клетках. Когда эти два клеточных параметра, связанных с раком, удовлетворяются, в спектре поглощения наблюдается изменение. Этот метод может быть полезен для лечения злокачественных опухолей, поскольку он неинвазивный и специфичный. [35]
Концепция ДНК-вычислений возникла как способ решения проблем с плотностью хранения данных из-за стремительного роста объемов данных. Теоретически грамм одноцепочечной ДНК способен хранить более 400 эксабайт (порядка 10–20 байт ) данных при плотности два бита на нуклеотид . [36] Леонарду Адлеману приписывают открытие этой области в 1994 году. [37] Недавно системы молекулярных логических вентилей стали использоваться в вычислительных моделях ДНК. [38]
Мэсси и его коллеги построили молекулярные логические схемы фотонной ДНК, используя каскады молекулярных логических элементов И, ИЛИ, И-НЕ и НИ-НЕ. [39] Они использовали комплексы лантаноидов в качестве флуоресцентных маркеров, а их люминесцентное излучение было обнаружено с помощью устройств на основе FRET на концах нитей ДНК. Работы Кэмпбелла и др. по демонстрации логических систем НЕ, И, ИЛИ и НЕ-НЕ, основанных на плитках пересечения ДНК, [40] Bader and co. по манипулированию структурой G-квадруплекса ДНК для реализации логических операций ДА, И и ИЛИ, [41] и Чаттерджи с коллегами по построению логических вентилей с использованием реактивных шпилек ДНК на поверхностях ДНК-оригами - вот некоторые примеры, которые отмечают прогресс в области логики. ДНК-вычисления на основе вентилей. [42]
Нанороботы обладают потенциалом трансформировать процессы доставки лекарств и биологические вычисления . [43] Ллопис-Лоренте и компания. разработали наноробота, способного выполнять логические операции и обрабатывать информацию о глюкозе и мочевине. [44] Тубагер и его коллеги разработали ДНК- молекулярный наноробот, способный сортировать химические грузы. Система могла работать без дополнительной энергии, поскольку робот мог ходить по поверхности ДНК-оригами на двух ногах. У него также был рычаг для перевозки грузов. [45]
Примером молекулярной последовательной логики являются Margulies et al. , где они демонстрируют молекулярный замок клавиатуры, напоминающий возможности обработки электронного устройства безопасности, которое эквивалентно включению нескольких взаимосвязанных логических элементов И параллельно. Молекула имитирует электронную клавиатуру банкомата ( АТМ). Выходные сигналы зависят не только от комбинации входов, но и от правильного порядка входов; т.е. необходимо ввести правильный пароль. Молекула была разработана с использованием флуорофоров пирена и флуоресцеина , соединенных сидерофором , который связывается с Fe(III) , и кислота раствора изменяет флуоресцентные свойства флуорофора флуоресцеина. [46]
Системы молекулярных логических вентилей теоретически могут решить проблемы, возникающие при приближении полупроводников к наноразмерам . Молекулярные логические элементы более универсальны, чем их кремниевые аналоги, поскольку такие явления, как наложенная логика, недоступны полупроводниковой электронике. [24] Сухие молекулярные ворота, такие как тот, что продемонстрировали Авурис и его коллеги, оказываются возможными заменителями полупроводниковых устройств благодаря их небольшому размеру, аналогичной инфраструктуре и возможностям обработки данных. Авурис обнаружил логический вентиль НЕ, состоящий из пучка углеродных нанотрубок . Нанотрубки по-разному легируются в соседних областях, создавая два дополняющих друг друга полевых транзистора , и пучок работает как логический вентиль НЕ только при выполнении удовлетворительных условий. [47]
{{cite journal}}
: Требуется цитировать журнал |journal=
( помощь )