Омики

Суффикс в биологии

Диаграмма, иллюстрирующая геномику

Научные направления , неформально известные как омика , представляют собой различные дисциплины в биологии , названия которых заканчиваются на суффикс -омика , например , геномика , протеомика , метаболомика , метагеномика , феномика и транскриптомика . Омика направлена ​​на коллективную характеристику и количественную оценку пулов биологических молекул, которые транслируются в структуру, функцию и динамику организма или организмов. ^[1]

Связанный суффикс -ome используется для обозначения объектов изучения таких областей, как геном , протеом или метаболом соответственно. Суффикс -ome , используемый в молекулярной биологии, относится к совокупности некоторого рода; это пример «нео-суффикса», образованного путем абстрагирования от различных греческих терминов в -ωμα , последовательности, которая не образует идентифицируемого суффикса в греческом языке.

Функциональная геномика направлена ​​на выявление функций как можно большего числа генов данного организма. Она объединяет различные методы -омики, такие как транскриптомика и протеомика с насыщенными коллекциями мутантов. ^[2]

Источник

«Омикум»: Здание Эстонского биоцентра , в котором размещаются Эстонский центр генома и Институт молекулярной и клеточной биологии Тартуского университета в Тарту, Эстония .

Оксфордский словарь английского языка ( OED ) различает три различные области применения суффикса -ome :

1. в медицине, образование существительных со значением «опухоль, опухоль»
2. в ботанике или зоологии, образование существительных в значении «часть животного или растения с определенной структурой»
3. в клеточной и молекулярной биологии, образование существительных со значением «все составляющие, рассматриваемые в совокупности»

Суффикс -ome возник как вариант -oma и стал продуктивным в последней четверти 19-го века. Первоначально он появился в таких терминах, как sclerome ^[3] или rhizome . ^[4] Все эти термины происходят от греческих слов в -ωμα , ^[5] последовательности, которая не является одним суффиксом, но может быть проанализирована как -ω-μα , где -ω- принадлежит основе слова (обычно глаголу), а -μα является подлинным греческим суффиксом, образующим абстрактные существительные.

В Оксфордском словаре английского языка предполагается , что его третье определение возникло как обратное образование от митома ^[6]. Ранние подтверждения включают биом (1916) ^[7] и геном (впервые введенный в употребление как немецкий Genom в 1920 году ^[8] ). ^[9]

Ассоциация с хромосомой в молекулярной биологии происходит из -за ложной этимологии . Слово хромосома происходит от греческих основ χρωμ(ατ)- «цвет» и σωμ(ατ)- «тело». ^[9] В то время как σωμα «тело» действительно содержит суффикс -μα , предшествующий -ω- не является суффиксом, образующим основу, а частью корня слова . Поскольку геном относится к полному генетическому составу организма, нео-суффикс -ome сам по себе напрашивается как относящийся к «целостности» или «завершенности». ^[10]

Биоинформатики и молекулярные биологи были среди первых ученых, которые широко использовали суффикс «-ome». ^{[ требуется ссылка ]} Среди первых сторонников были биоинформатики из Кембриджа , Великобритания, где было много ранних лабораторий биоинформатики, таких как центр MRC , центр Сенгера и EBI ( Европейский институт биоинформатики ); например, центр MRC реализовал первые проекты по геному и протеому. ^[11]

Текущее использование

Многие «омы» за пределами оригинального « генома » стали полезными и широко приняты исследователями. « Протеомика » стала общепризнанным термином для изучения белков в больших масштабах. «Омы» могут обеспечить простое сокращение для обозначения области; например, исследование интерактомики четко распознается как относящееся к крупномасштабному анализу взаимодействий ген-ген, белок-белок или белок-лиганд. Исследователи быстро берут на вооружение омы и омиксы, как показывает взрыв использования этих терминов в PubMed с середины 1990-х годов. ^[12]

Виды омических исследований

Геномика

• Геномика : изучение геномов организмов .
  • Когнитивная геномика : изучение изменений когнитивных процессов, связанных с генетическими профилями.
  • Сравнительная геномика : изучение взаимосвязи структуры и функции генома у различных биологических видов и штаммов.
  • Функциональная геномика : описывает функции и взаимодействия генов и белков (часто использует транскриптомику).
  • Метагеномика : изучение метагеномов , т. е. генетического материала, полученного непосредственно из образцов окружающей среды.
  • Нейрогеномика : изучение генетических влияний на развитие и функционирование нервной системы.
  • Пангеномика : изучение всей совокупности генов или геномов, обнаруженных в пределах данного вида. ^[13]
  • Персональная геномика : Раздел геномики, занимающийся секвенированием и анализом генома человека. После того, как генотипы известны, генотип человека можно сравнить с опубликованной литературой, чтобы определить вероятность проявления признаков и риск заболевания. Помогает в персонализированной медицине
  • Электромика: Раздел геномики, изучающий роль экзогенных электрических полей в потенцировании профилей экспрессии генов клеток, тканей и органоидов. ^[14]

Эпигеномика

Эпигеном — это поддерживающая структура генома, включающая связывающие белки и РНК, альтернативные структуры ДНК и химические модификации ДНК.

• Эпигеномика : Современные технологии включают в себя определение конформации хромосом с помощью Hi-C , различные методы ChIP-seq и другие методы секвенирования в сочетании с протеомным фракционированием, а также методы секвенирования, которые обнаруживают химическую модификацию цитозинов, такие как бисульфитное секвенирование.
• Нуклеомика: изучение полного набора геномных компонентов, которые образуют «ядро клетки как сложную, динамическую биологическую систему, называемую нуклеомом». ^{[15] [16]} Консорциум 4D Nucleome официально присоединился к IHEC ( Международному консорциуму по эпигеному человека ) в 2017 году.

Микробиомика

• Микробиом определяется как характерное микробное сообщество, занимающее достаточно четко определенную среду обитания, которая имеет различные физико-химические свойства. Микробиом относится не только к вовлеченным микроорганизмам, но и охватывает их сферу деятельности, что приводит к образованию определенных экологических ниш . Микробиом , который образует динамическую и интерактивную микроэкосистему, подверженную изменениям во времени и масштабе, интегрирован в макроэкосистемы, включая эукариотических хозяев, и здесь имеет решающее значение для их функционирования и здоровья. ^[17]
• Культуромика (микробиология) — это высокопроизводительное культивирование клеток бактерий , целью которого является комплексная идентификация штаммов или видов в образцах, полученных из тканей, таких как кишечник человека , или из окружающей среды . ^{[18] [19] [20]}

Липидомика

Липидом представляет собой полный набор клеточных липидов , включая модификации , внесенные в определенный набор липидов, вырабатываемые организмом или системой.

• Липидомика : масштабное исследование путей и сетей липидов. Используются методы масс-спектрометрии.

Протеомика

Протеом — это полный набор белков , включая модификации , внесенные в определенный набор белков, вырабатываемый организмом или системой.

• Протеомика : крупномасштабное изучение белков, в частности их структур и функций. Используются методы масс-спектрометрии.
  • Хемопротеомика : набор методов, используемых для изучения взаимодействия белков с малыми молекулами.
  • Иммунопротеомика : изучение больших наборов белков (протеомика), участвующих в иммунном ответе.
  • Нутрипротеомика: Определение молекулярных мишеней питательных и непищевых компонентов рациона. Использует данные протеомной масс-спектрометрии для исследований экспрессии белков
  • Протеогеномика : развивающаяся область биологических исследований на стыке протеомики и геномики. Данные протеомики, используемые для аннотаций генов.
  • Структурная геномика : изучение трехмерной структуры каждого белка, кодируемого данным геномом, с использованием комбинации экспериментальных и модельных подходов.

Гликомикс

Гликомика — это комплексное изучение гликома , т.е. сахаров и углеводов.

Фудомика

В 2009 году Алехандро Сифуэнтес определил фудомику как «дисциплину, изучающую пищевые продукты и питание посредством применения и интеграции передовых технологий омики для улучшения благополучия, здоровья и знаний потребителей». ^{[21] [22]}

Транскриптомика

Транскриптом — это набор всех молекул РНК , включая мРНК, рРНК, тРНК и другие некодирующие РНК, вырабатываемые в одной клетке или популяции клеток.

• Транскриптомика : изучение транскриптомов, их структур и функций.

Метаболомика

Метаболом — это совокупность небольших молекул, обнаруженных в биологической матрице .

• Метаболомика : научное изучение химических процессов с участием метаболитов. Это «систематическое изучение уникальных химических отпечатков, которые оставляют определенные клеточные процессы», изучение их профилей метаболитов малых молекул.
• Метабономика : количественное измерение динамического многопараметрического метаболического ответа живых систем на патофизиологические стимулы или генетическую модификацию.

Питание, фармакология и токсикология

• Пищевая геномика : наука, изучающая взаимосвязь между геномом человека, питанием и здоровьем.
  • Нутригенетика изучает влияние генетических вариаций на взаимодействие между диетой и здоровьем с учетом восприимчивых подгрупп.
  • Нутригеномика : изучение влияния продуктов питания и их компонентов на экспрессию генов. Изучает влияние питательных веществ на геном, протеом и метаболом.
• Фармакогеномика изучает влияние суммы вариаций в геноме человека на лекарственные препараты;
• Фармакомикробиомика изучает влияние изменений в микробиоме человека на лекарственные препараты и наоборот.
• Токсикогеномика : область науки, которая занимается сбором, интерпретацией и хранением информации об активности генов и белков в конкретной клетке или ткани организма в ответ на токсичные вещества.

Культура

Вдохновленная основополагающими вопросами эволюционной биологии, группа ученых из Гарварда под руководством Жана-Батиста Мишеля и Эреза Либермана Эйдена создала американский неологизм «культуромика» для применения сбора и анализа больших данных в культурных исследованиях . ^[23]

Разнообразный

Ученый Национального управления океанических и атмосферных исследований использует микробиомику для изучения морских экосистем

• Митоинтерактом
• Психогеномика : процесс применения мощных инструментов геномики и протеомики для лучшего понимания биологических субстратов нормального поведения и заболеваний мозга, которые проявляются как поведенческие отклонения. Применяя психогеномику к изучению наркомании, конечной целью является разработка более эффективных методов лечения этих расстройств, а также объективных диагностических инструментов, профилактических мер и, в конечном итоге, излечений.
• Геномика стволовых клеток : Помогает в биологии стволовых клеток. Цель — сделать стволовые клетки ведущей модельной системой для понимания биологии человека и состояний болезни и в конечном итоге ускорить прогресс в направлении клинического перевода.
• Коннектомика : изучение коннектома, совокупности нейронных связей в мозге.
• Микробиомика : изучение геномов сообществ микроорганизмов, обитающих в определенной экологической нише.
• Целломика : количественный анализ и исследование клеток с использованием методов биовизуализации и биоинформатики.
• Томомика: сочетание методов томографии и омикс для понимания биохимии тканей или клеток с высоким пространственным разрешением, обычно с использованием данных масс-спектрометрии изображений. ^[24]
• Вирусная метагеномика : использование методов «омики» в почве, морской воде и людях для изучения вирома и человеческого вирома .
• Этомика: Высокопроизводительное машинное измерение поведения животных. ^[25]
• Видеомика (или видео-омика): парадигма анализа видео, вдохновленная принципами геномики, где непрерывная последовательность изображений (или видео) может быть интерпретирована как захват одного изображения, развивающегося с течением времени посредством мутаций, раскрывающих «сцену».
• Мультиомика : интеграция различных омик в единый процесс исследования или анализа. ^[26]

1. Геномика: изучение генома, полного набора генов в организме.

2. Протеомика: изучение протеома, всей совокупности белков в клетках организма.

3. Метаболомика : изучение метаболизма, а также функций и взаимодействий продуктов метаболического распада, или метаболитов.

4. Транскриптомика: изучение полного набора РНК в клетках организма.

5. Липидомика: изучение липидов и путей, участвующих в липидной сигнализации.

6. Эпигеномика: изучение химических модификаций ДНК и гистоновых белков, которые регулируют экспрессию генов без изменения последовательности ДНК.

7. Гликомика: изучение гликома, полного набора сахаров, или гликанов, в организме.

8. Феномика: изучение феноменов, физических и биохимических свойств организмов.

9. хармакогеномика: изучение того, как гены влияют на реакцию человека на лекарственные препараты.

10. Токсикогеномика: изучение воздействия токсичных химических веществ на геном и экспрессию генов.

11. Нутригеномика: изучение взаимодействия между питанием и генами.

12. Микробиомика: изучение микробных сообществ (микробиоты) и их коллективных геномов (микробиома).

13. Виромика: изучение вирусного сообщества и его взаимодействия в организме хозяина.

14. Экспозомика: изучение совокупности воздействий окружающей среды на человека и их влияния на здоровье.

15. Коннектомика: изучение нейронных связей в мозге.

16. Иммуномика: изучение иммунной системы в масштабе омики.

17. Интерактомика: изучение взаимоотношений и взаимодействий между белками и другими молекулами.

18. Флюксомика: изучение скоростей метаболических реакций в биологической системе.

19. *Фосфопротеомика: изучение фосфорилированных белков и их роли в передаче сигналов и функционировании клеток.

20. Сплайкомика: изучение сплайсинга РНК и его вариаций в различных тканях или условиях.

21. Секретомика: изучение секретома, всего набора белков, секретируемых клеткой, тканью или организмом.

22. Деградомика: изучение протеолитических ферментов (протеаз) и их субстратов.

23. Убиквитиномика: изучение модификаций убиквитина и убиквитиноподобных белков в других белках.

24. Металломика: изучение роли ионов металлов в биологических системах.

25. Редоксомика**: изучение окислительно-восстановительных состояний и роли активных форм кислорода в клеточных процессах.

26. Волатиломика**: изучение летучих органических соединений, вырабатываемых живыми организмами.

27. Тераностика**: сочетание терапии и диагностики, часто изучаемое на уровне «омики».

28. Цитомика**: изучение клетки и ее функций на молекулярном уровне.

29. Сенсомика**: изучение сенсорного восприятия и связанных с ним молекул и путей.

30. Фудомика**: применение омикс-технологий в исследованиях продуктов питания и питания.

31. Хрономика**: изучение биологических ритмов и их молекулярных механизмов.

32. Пептидомика**: изучение пептидов, их структур, функций и роли в биологии.

33. Экогеномика**: изучение генетического состава экологических сообществ и их взаимодействия с окружающей средой.

34. Патогеномика**: изучение геномов патогенов для понимания их биологии и взаимодействия с хозяевами.

35. Нуклеомика**: изучение ядерных компонентов клеток, включая хроматин и ядерные тельца.

36. Омика отдельных клеток**: изучение данных омики на уровне отдельных клеток для понимания клеточной гетерогенности.

37. Онкомикс**: изучение генов, белков и путей, связанных с раком.

38. Биомеханика омика**: изучение механических свойств биологических молекул и структур.

39. Симбиомика**: изучение симбиотических отношений на молекулярном уровне.

40. Интерактомика**: изучение молекулярных взаимодействий в биологических системах, включая взаимодействия белок-белок, белок-ДНК и белок-РНК.

41. Палеомика**: изучение древних биологических материалов с помощью омикс-технологий.

42. Метиломикс**: изучение закономерностей метилирования ДНК по всему геному.

43. Токсикоэпигеномика**: изучение влияния токсинов окружающей среды на эпигенетические модификации.

44. Нейрогеномика**: изучение генетических основ структуры и функций нервной системы.

45. Иммунопептидомика**: изучение пептидов, представленных иммунной системой, особенно тех, которые связаны с молекулами MHC.

46. ​​Фитомика**: изучение геномов растений и их взаимодействия с окружающей средой.

47. Аутоиммуномика**: изучение молекулярных механизмов, лежащих в основе аутоиммунных заболеваний.

48. Агрогеномика**: применение геномики в сельском хозяйстве для улучшения производства сельскохозяйственных культур и животноводства.

49. Термогеномика**: изучение генетических основ терморегуляции и теплопродукции в организмах.

50. Биомемикс**: изучение генетического и молекулярного состава целых биомов (крупных экологических областей).

51. Метагеномика**: изучение генетического материала, полученного непосредственно из образцов окружающей среды, минуя необходимость выделения и культивирования отдельных видов.

52. Астробиомика**: изучение потенциальной жизни и биологических молекул в космической среде.

53. Коннектомика**: изучение комплексных карт нейронных связей в мозге.

54. Киномика**: изучение киназ и их роли в клеточной сигнализации.

55. Феномика**: изучение фенотипов в масштабе «омики», охватывающее физические и биохимические признаки организмов.

56. Гликопротеомика**: изучение гликопротеинов, представляющих собой белки с присоединенными углеводными группами.

57. Нутрипротеомика**: изучение влияния питательных веществ на протеом.

58. Эпитранскриптомика**: изучение химических модификаций молекул РНК и их влияния на экспрессию и функцию генов.

59. Гликолипидомика**: изучение гликолипидов, сложных молекул, состоящих из углеводов и липидов.

60. Эндокриномика**: изучение эндокринной системы и гормонально-омических данных.

61. Психомика**: изучение молекулярных основ психологических и психиатрических состояний.

62. Интерактомика**: комплексное изучение всех молекулярных взаимодействий в клетке.

63. Дистрибутомика**: изучение закономерностей распределения молекул внутри клеток или организмов.

64. Пангеномика**: изучение полного набора генов внутри вида, включая основные и вспомогательные гены.

65. Адаптомика**: изучение адаптивных изменений организмов на молекулярном уровне.

66. Серомика**: исследование сывороточных белков и метаболитов.

67. Нейропротеомика**: изучение протеома нервной системы.

68. Фитохемика**: изучение сложных химических соединений в растениях.

69. Агиномика**: изучение молекулярных и генетических факторов, участвующих в старении.

70. Радиогеномика**: изучение взаимосвязи между генетической изменчивостью и реакцией на лучевую терапию.

71. Иммуногеномика**: изучение генетических основ функционирования и разнообразия иммунной системы.

72. Биогеомика**: изучение геномной основы биоразнообразия и функционирования экосистем.

73. Вирогеномика**: изучение вирусных геномов и их взаимодействия с организмами-хозяевами.

74. Дермомика**: изучение молекулярных и генетических аспектов биологии кожи.

75. Аллергомика**: изучение молекулярно-генетических основ аллергических реакций.

76. Плантомика**: комплексное изучение биологии растений с использованием подходов «омики».

77. Океаномика**: изучение морских организмов и экосистем с использованием омикс-технологий.

78. Геномика паразитов**: изучение геномов паразитических организмов.

79. Аквакультура омика**: применение омических технологий для улучшения практики аквакультуры.

80. Эпигеномика**: изучение полного набора эпигенетических изменений генетического материала клетки.

81. Патофизиомика**: изучение молекулярных и клеточных механизмов патологических процессов.

82. Квантовая омика**: изучение квантово-механических свойств биологических молекул и их влияния на биологические функции.

83. Термогеномика**: изучение генетических основ регуляции температуры в организмах.

84. Хрономика**: изучение биологических ритмов и их молекулярных основ.

85. Синтеомика**: изучение подходов синтетической биологии с использованием данных омикс для проектирования и создания новых биологических деталей, устройств и систем.

86. Холобионты омика**: изучение данных омики хозяина и связанной с ним микробиоты как единой экологической единицы.

87. Экофизиомика**: изучение взаимодействий между физиологическими функциями организмов и окружающей их средой на уровне омиксов.

88. Резистомика**: изучение генов устойчивости к антибиотикам и их механизмов.

89. Аптамеромика**: изучение аптамеров, коротких молекул ДНК или РНК, которые связываются со специфическими мишенями, и их применение.

90. Вируломика**: изучение факторов вирулентности и механизмов патогенности микробов.

91. Микомика**: изучение геномов грибов и их биологических функций.

92. Фотомика**: изучение взаимодействия света и биологических систем.

93. Наноника**: изучение наноматериалов и их взаимодействия с биологическими системами с использованием омикс-подходов.

94. Аллергеномика**: изучение аллергенов и молекулярных основ аллергических реакций.

95. Ксенобиомика**: изучение воздействия чужеродных веществ (ксенобиотиков) на биологические системы.

96. Физиомика**: изучение физиологических аспектов биологических систем в масштабе омикс.

97. Психогеномика**: изучение генетических и молекулярных основ психологических черт и расстройств.

98. Метиломикс**: изучение закономерностей метилирования ДНК и их влияния на экспрессию генов.

99. Кардиомика**: изучение молекулярных и генетических основ сердечно-сосудистых функций и заболеваний.

100. Деградомика**: изучение протеолитических процессов и путей деградации белков.

101. Астробиомика**: изучение потенциала жизни и биологических процессов во внеземных средах.

102. Геономика**: изучение генетической основы геологических и геобиологических процессов.

103. Радиомика**: изучение количественных характеристик медицинских изображений и их связи с клиническими результатами.

104. Биомемикс**: изучение генетических, молекулярных и экологических взаимодействий внутри биомов.

105. Аллостеромика**: изучение аллостерических участков и их регуляторной роли в функционировании белков.

106. Биотермодинамика**: изучение термодинамических свойств биологических молекул и систем с использованием омиксных подходов.

107. Антропомика**: изучение человеческого разнообразия и эволюции с использованием данных омикс.

108. Коннектомика**: изучение нейронных связей в мозге и нервной системе.

109. Аутофагомика**: изучение процесса аутофагии на уровне омиксов.

110. Фотогеномика**: изучение влияния света на экспрессию генов и клеточные функции.

111. Аэромика**: изучение биологических частиц в воздухе и их влияния на здоровье и окружающую среду.

112. Эпитранскриптомика**: изучение химических модификаций молекул РНК и их влияния на экспрессию и функцию генов.

113. Радиогеномика**: изучение взаимосвязи между особенностями генома и реакцией на лучевую терапию.

114. Нефромика**: изучение почек и их функций на молекулярном уровне.

115. Дерматомика**: изучение кожи, ее молекулярного состава и функций.

116. Ксеномика**: изучение эффектов и взаимодействий чужеродного генетического материала, введенного в организм.

117. МикроРНКомика**: изучение микроРНК и их роли в регуляции экспрессии генов.

118. Синтетическая омика**: изучение и проектирование синтетических биологических систем с использованием данных омики.

119. Энвирономика**: изучение взаимодействия организмов с окружающей средой с использованием омикс-технологий.

120. Палеомика**: изучение древних биологических материалов и их молекулярной информации.

121. Регуломика**: изучение регуляторных сетей и их роли в экспрессии генов.

122. Патобиомика**: изучение путей и механизмов заболеваний в масштабе «омики».

123. Эволюмика**: изучение эволюционных процессов и закономерностей с использованием данных омикс.

124. Термобиомика**: изучение влияния температуры на биологические молекулы и системы.

125. Циркадомика**: изучение циркадных ритмов и их молекулярных основ.

126. Наномика**: изучение биологических процессов и материалов в наномасштабе.

127. Метапротеомика**: изучение коллективного содержания белков в образцах окружающей среды.

128. Биомеханика омика**: изучение механических свойств биологических молекул и систем.

129. Раковая омика**: изучение молекулярных основ рака, включая онкогеномику и раковую протеомику.

130. Синтетическая биология омика**: применение технологий омики для проектирования и создания новых биологических деталей, устройств и систем.

131. Гутомика**: изучение микробиома кишечника и его взаимодействия с хозяином.

132. Нутригеномика**: изучение взаимосвязи между питанием и геномом.

133. Растительная омика**: комплексное изучение биологии растений с использованием подходов омики.

134. Инфектомика**: изучение молекулярных механизмов инфекционных заболеваний.

135. Микробиомика**: изучение микробных сообществ и их функций.

136. Сексомика**: изучение молекулярной основы половых различий в биологии.

137. Биомеханика**: изучение взаимодействия механических сил и биологических систем.

138. Нейрогеномика**: изучение генетической основы неврологических функций и расстройств.

139. Омеомика**: изучение взаимоотношений и взаимодействий между различными омами (геном, протеом и т. д.).

140. Иммунотранскриптомика**: изучение транскриптома иммунных клеток.

141. Нервомика**: изучение нервной системы и ее молекулярных компонентов.

142. Эмбриомика**: изучение молекулярных и генетических процессов во время эмбрионального развития.

143. Агиномика**: изучение молекулярных основ старения.

144. Фотопротеомика**: изучение белков, участвующих в восприятии света и реагировании на него.

145. Гематомика**: изучение молекулярного состава и функций крови.

146. Биофотоника омика**: изучение взаимодействия света с биологическими материалами на уровне омики.

147. Анатомия**: изучение молекулярных основ анатомических структур.

148. Микобиомика**: изучение грибковых сообществ и их взаимодействия с хозяином или окружающей средой.

149. Патогеномика**: изучение геномов патогенов.

150. Симбиомика**: изучение симбиотических отношений на молекулярном уровне.

151. Аквомика**: изучение водных организмов и их молекулярной биологии.

152. Бактериомика**: изучение бактерий и их геномов.

153. Биомаркеромика**: изучение биомаркеров с использованием омикс-технологий для обнаружения и мониторинга заболеваний.

154. Кардиомика**: изучение сердечно-сосудистой системы на молекулярном уровне.

155. Целломика**: изучение структуры, функций и поведения клеток с использованием высокопроизводительных методов.

156. Хемогеномика**: изучение реакции генома на химические соединения.

157. Криомика**: изучение биологических молекул и систем в условиях низких температур.

158. Дистрибутомика**: изучение пространственного распределения молекул внутри клеток или тканей.

159. Экосистемная омика**: изучение целых экосистем с использованием подходов омики.

160. Энергетика-омика**: изучение потока энергии и метаболизма в биологических системах.

161. Гастроомика**: изучение желудочно-кишечного тракта и его микробиоты.

162. Генная терапия омика**: изучение подходов генной терапии и их эффектов на уровне омики.

163. Гормономика**: изучение гормонов и их молекулярных путей.

164. Гидротомика**: изучение состояния гидратации биологических молекул и систем.

165. Инфламомика**: изучение воспаления и его молекулярных путей.

166. Металлопротеомика**: изучение металлопротеинов и их роли в биологии.

167. Морфомика**: изучение формы и структуры организмов и их молекулярной основы.

168. Нервомика**: изучение нервной системы и ее молекулярного состава.

169. Нейрохемика**: изучение химических процессов в нервной системе.

170. Нутриомика**: изучение взаимодействия питательных веществ и генома.

171. Окуляромика**: изучение глаза и его молекулярной биологии.

172. Оптогеномика**: изучение генетической основы восприятия света и реакции на него.

173. Органомика**: изучение конкретных органов на молекулярном уровне.

174. Паразитомика**: изучение паразитов и их взаимодействия с хозяевами.

175. Патофеномика**: изучение фенотипов болезней и их молекулярной основы.

176. Фармакология**: изучение лекарственных средств и их влияния на геном и протеом.

177. Полиомика**: изучение сложных взаимодействий между несколькими омами (геном, протеом и т. д.).

178. Психомика**: изучение молекулярных основ психологических черт и расстройств.

179. Пульмономика**: изучение легких и дыхательной системы на молекулярном уровне.

180. Репродуктомика**: изучение репродуктивных систем и их молекулярной биологии.

181. Респиромика**: изучение дыхательной системы и ее молекулярных функций.

182. Селеномика**: изучение роли селена в биологии.

183. Сексомика**: изучение молекулярных основ половых различий и полового развития.

184. Спатиомика**: изучение пространственного распределения молекул в биологических системах.

185. Спортомика**: изучение молекулярных основ спортивных результатов и физической активности.

186. Стемцелломика**: изучение стволовых клеток и их молекулярных свойств.

187. Стромомика**: изучение стромы, опорной ткани органов и ее молекулярных компонентов.

188. Субцелломика**: изучение молекулярного состава субклеточных компартментов.

189. Синаптомика**: изучение синапсов и их молекулярных компонентов.

190. Токсиномика**: изучение токсинов и их воздействия на геном и протеом.

191. Травмомикс**: изучение молекулярных основ травм и повреждений.

192. Васкуляромика**: изучение сосудистой системы и ее молекулярной биологии.

193. Виросомомика**: изучение структуры и функций вирусных частиц.

194. Зоономика**: изучение зоонозных заболеваний и их молекулярной основы.

Несвязанные слова в-омика

Слово «комический» не использует суффикс «омик»; оно происходит от греческого «κωμ(ο)-» ( веселье ) + «-ικ(ο)-» (суффикс прилагательного), а не представляет собой усечение «σωμ(ατ)-».

Аналогично, слово «экономика» образовано от греческого «οικ(ο)-» ( домашнее хозяйство ) + «νομ(ο)-» ( закон или обычай ), а «экономический(ые)» — от «οικ(ο)-» + «νομ(ο)-» + «-ικ(ο)-». Суффикс -омика иногда используется для создания названий школ экономики , таких как Рейганомика .

Смотрите также

• Системная биология
• Паномика

Примечания

1. Subedi, Prabal; Moertl, Simone; Azimzadeh, Omid (2022). «Омикс в радиационной биологии: удивление, но не разочарование». Radiation . 2 : 124–129. doi : 10.3390/radiation2010009 .
2. Холторф, Хауке; Гиттон, Мари-Кристин; Рески, Ральф (2002). «Функциональная геномика растений». Naturwissenschaften . 89 (6): 235–249. Бибкод : 2002NW.....89..235H. дои : 10.1007/s00114-002-0321-3. PMID  12146788. S2CID  7768096.
3. "scleroma, n : Oxford English Dictionary" . Получено 2011-04-25 .
4. "rhizome, n : Оксфордский словарь английского языка" . Получено 25.04.2011 .
5. "-oma, расч. форма : Оксфордский словарь английского языка" . Получено 25.04.2011 .
6. "Главная : Оксфордский словарь английского языка" . Получено 25.04.2011 .
7. "биом, сущ. : Оксфордский словарь английского языка" . Получено 25.04.2011 .
8. Ганс Винклер (1920). Verbreitung und Ursache der Parthenogenic im Pflanzen – und Tierreiche. Верлаг Фишер, Йена. п. 165. Ich schlage vor, für den haploiden Chromosomensatz , der im Verein mit dem zugehörigen Protoplasma die materielle Grundlage der systematischen Einheit darstellt den Ausdruck: das Genom zu verwenden... » По-английски: «Я предлагаю выражение Genom для гаплоидного набора хромосом. , которая вместе с соответствующей протоплазмой определяет материальные основы вида...
9. Coleridge, H.; et alii . Оксфордский словарь английского языка
10. Лидделл, Х. Г.; Скотт, Р.; и др . Греко-английский лексикон [1996]. (Поиск в проекте Perseus.)
11. Грив, IC; Диккенс, NJ; Правенек, M; Крен, V; Хабнер, N; Кук, SA; Эйтман, TJ; Петретто, E; Манджон, J (2008). "Анализ коэкспрессии в геноме во многих тканях". PLOS ONE . ​​3 (12): e4033. Bibcode :2008PLoSO...3.4033G. doi : 10.1371/journal.pone.0004033 . ISSN  1932-6203. PMC 2603584 . PMID  19112506. 
12. "OMES Table". Gerstein Lab . Yale. 2002. Архивировано из оригинала 15 апреля 2023 года.
13. О'Коннелл, Мэри Дж.; МакНалли, Алан; МакИнерни, Джеймс О. (2017-03-28). "Почему у прокариот есть пангеномы" (PDF) . Nature Microbiology . 2 (4): 17040. doi :10.1038/nmicrobiol.2017.40. ISSN  2058-5276. PMID  28350002. S2CID  19612970.
14. , Сара; Джейн, Абишек; Кук, Джон П.; Джузеппи-Эли, Энтони (2023-05-04). «Электрически стимулированная экспрессия генов под воздействием экзогенно приложенных электрических полей». Frontiers in Molecular Biosciences . 10. doi : 10.3389/fmolb.2023.1161191 . PMC 10192815. PMID  37214334 . 
15. Таширо, Сатоши; Ланкто, Кристиан (2015-03-04). «Международный консорциум нуклеома». Nucleus . 6 (2): 89–92. doi :10.1080/19491034.2015.1022703. PMC 4615172 . PMID  25738524. 
16. Кремер, Томас; Кремер, Мэрион; Хюбнер, Барбара; Стрикфаден, Хилмар; Смитс, Дэниел; Попкен, Йенс; Стерр, Майкл; Маркаки, ​​Иоланда; Риппе, Карстен (2015-10-07). «4D нуклеом: доказательства динамического ядерного ландшафта на основе совместно выровненных активных и неактивных ядерных компартментов». FEBS Letters . 589 (20PartA): 2931–2943. doi : 10.1016/j.febslet.2015.05.037 . ISSN  1873-3468. PMID  26028501. S2CID  10254118.
17. Берг, Габриэле ; Рыбакова Дарья; Фишер, Дорин; Чернава, Томислав; Вержес, Мари-Кристин Шампомье; Чарльз, Тревор; Чен, Сяоюлун; Коколин, Лука; Эверсол, Келли; Коррал, Хема Эрреро; Казу, Мария; Кинкель, Линда; Ланге, Лене; Лима, Нельсон; Лой, Александр; МакКлин, Джеймс А.; Маген, Эммануэль; Моклин, Тим; МакКлюр, Райан; Миттер, Биргит; Райан, Мэтью; Саранд, Инга; Смидт, Хауке; Шелкле, Беттина; Рум, Хьюго; Киран, Г. Сегал; Селвин, Джозеф; Соуза, Рафаэль Соарес Корреа де; Ван Овербек, Лео; и др. (2020). «Пересмотр определения микробиома: старые концепции и новые проблемы». Микробиом . 8 (1): 103. doi : 10.1186/s40168-020-00875-0 . PMC 7329523 . PMID  32605663.  Материал скопирован из этого источника, который доступен по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International.
18. Lagier J, Armougom F, Million M и др. (декабрь 2012 г.). «Микробная культуромика: сдвиг парадигмы в исследовании микробиома кишечника человека». Клиническая микробиология и инфекция . 18 (12): 1185–1193. doi : 10.1111/1469-0691.12023 .
19. Lagier J, Khelaifia S, Alou M и др. (декабрь 2016 г.). «Культура ранее некультивированных представителей микробиоты кишечника человека методом культуромики». Nature Microbiology . 1 (12): 16203. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.203 .
20. Greub, G. (декабрь 2012 г.). «Культуромика: новый подход к изучению микробиома человека». Клиническая микробиология и инфекция . 18 (12): 1157–1159. doi : 10.1111/1469-0691.12032 .
21. Ганн, Шарон (27 ноября 2020 г.). «Foodomics: The science of food». Front Line Genomics . Получено 2 июня 2022 г.
22. Cifuentes, Alejandro (октябрь 2009 г.). "Анализ пищевых продуктов и фудомика". Journal of Chromatography A . 1216 (43): 7109. doi :10.1016/j.chroma.2009.09.018. hdl : 10261/154212 . PMID  19765718 . Получено 2 июня 2022 г. .
23. Мишель, Дж. Б.; Шен, Ю. К.; Эйден, А. П.; Верес, А.; Грей, МК; Команда Google Books; Пикетт, Дж. П.; Хойберг, Д.; Клэнси, Д.; Норвиг, П.; Орвант, Дж. (2011). «Количественный анализ культуры с использованием миллионов оцифрованных книг». Science . 331 (6014): 176–182. Bibcode :2011Sci...331..176M. doi :10.1126/science.1199644. ISSN  1095-9203. PMC 3279742 . PMID  21163965. 
24. Кампсон, Питер; Флетчер, Ян; Сано, Наоко; Барлоу, Андерс (2016). «Быстрый многомерный анализ данных 3D ToF-SIMS: графические процессоры (GPU) и подвыборка с низким расхождением для крупномасштабного анализа главных компонент». Анализ поверхности и интерфейса . 48 (12): 1328. doi : 10.1002/sia.6042 .
25. Райзер, Майкл (2009). «Эпоха этомики?». Nature Methods . 6 (6): 413–414. doi :10.1038/nmeth0609-413. PMID  19478800. S2CID  5151763.
26. Чу, Су Х.; Хуан, Менгна; Келли, Рэйчел С.; Бенедетти, Элиза; Сиддики, Джалал К.; Железник, Оана А.; Перейра, Александр; Херрингтон, Дэвид; Уилок, Крейг Э.; Крумсик, Ян; Макгичи, Майкл (18.06.2019). «Интеграция метаболомных и других омических данных в популяционные исследования: эпидемиологическая перспектива». Метаболиты . 9 (6): E117. doi : 10.3390/metabo9060117 . ISSN  2218-1989. PMC 6630728. PMID 31216675  . 

Дальнейшее чтение

• Ледерберг, Джошуа ; МакКрей, Алекса Т. (2 апреля 2001 г.). «Комментарий: 'Ome Sweet 'Omics — A Genealogical Treasury of Words». The Scientist . 15 (7): 8. Получено 1 июня 2014 г.
• Хотц, Роберт Ли (13 августа 2012 г.). «Вот омическая история: ученые обнаружили распространяющийся суффикс». The Wall Street Journal .

Внешние ссылки

• Omics.org Домашняя страница терминов и концепций омики. Вероятно, первая созданная веб-страница омики.
• Список омик, включая ссылки/источники. Поддерживается (CHI) Кембриджским институтом здравоохранения.