stringtranslate.com

Онтология (информатика)

В информатике онтология включает в себя представление, формальное наименование и определения категорий, свойств и отношений между понятиями, данными или сущностями, которые относятся к одной, многим или всем областям дискурса . Проще говоря, онтология — это способ показать свойства предметной области и то, как они связаны между собой, путем определения набора терминов и выражений отношений, которые представляют объекты в этой предметной области. Область, которая изучает онтологии, понимаемые таким образом, иногда называют прикладной онтологией . [1]

Каждая академическая дисциплина или область, создавая свою терминологию, тем самым закладывает основу для онтологии. Каждый использует онтологические предположения для создания явных теорий, исследований и приложений. Улучшенные онтологии могут улучшить решение проблем в этой области, совместимость систем данных и возможность обнаружения данных. Перевод научных статей в каждой области становится проблемой, которая упрощается, когда эксперты из разных стран поддерживают контролируемый словарный запас жаргона на каждом из своих языков. [2] Например, определение и онтология экономики является основной задачей марксистской экономики , [3] но также и в других областях экономики . [4] Пример экономики, опирающейся на информатику, возникает в тех случаях, когда моделирование или модель предназначены для принятия экономических решений, например, для определения того, какие капитальные активы подвергаются риску и в какой степени (см. Управление рисками ).

Что общего в онтологиях как в информатике, так и в философии , — это попытка представить сущности, включая объекты и события, со всеми их взаимозависимыми свойствами и отношениями, в соответствии с системой категорий. В обеих областях ведется значительная работа по проблемам разработки онтологий (например, Куайн и Крипке в философии, Сова и Гуарино в информатике) [5] и споры о том, в какой степени возможна нормативная онтология (например, фундаментализм и когерентизм в философия, BFO и Cyc в области искусственного интеллекта).

Некоторые считают прикладную онтологию преемником предшествующих работ в области философии. Однако многие текущие усилия больше связаны с созданием контролируемых словарей узких областей, чем с философскими основными принципами или такими вопросами, как способ существования фиксированных сущностей или могут ли устойчивые объекты (например, пердурантизм и эндюрантизм ) быть онтологически более первичными, чем процессы . . Искусственный интеллект по -прежнему уделяет значительное внимание прикладной онтологии в таких областях, как обработка естественного языка в рамках машинного перевода и представление знаний , но редакторы онтологий часто используются в ряде областей, включая биомедицинскую информатику и [6] промышленность. [7] В таких усилиях часто используются инструменты редактирования онтологий, такие как Protégé. [8]

Онтология в философии

Онтология является отраслью философии и пересекает такие области, как метафизика, эпистемология и философия языка, поскольку она рассматривает, как знание, язык и восприятие связаны с природой реальности. Метафизика занимается такими вопросами, как «что существует?» и «Какова природа реальности?». Метафизика, одна из пяти традиционных ветвей философии, занимается исследованием существования через свойства, сущности и отношения, например, между частностями и универсалиями , внутренними и внешними свойствами или сущностью и существованием . Метафизика была постоянной темой дискуссий со времен письменной истории.

Этимология

Сложное слово онтология объединяет онто- , от греческого ὄν, он ( род. ὄντος, онтос ), т.е. « бытие; то, что есть», что является причастием настоящего времени глагола εἰμί, eimí , т.е. « быть, я есмь». ", и -λογία, -logia , т.е. "логический дискурс", см. классические составные слова для этого типа словообразования. [9] [10]

Хотя этимология греческая, старейшая сохранившаяся запись самого слова, неолатинская форма онтологии , появилась в 1606 году в работе « Огдоас Схоластика» Якоба Лорхарда ( Лорхардус ) и в 1613 году в « Философском лексиконе» Рудольфа Гёккеля ( Гоклениус ). [11]

Первое упоминание онтологии на английском языке , зафиксированное OED ( Оксфордский словарь английского языка , онлайн-издание, 2008 г.), произошло в «Archeologia Philosophica Nova» или «Новые принципы философии» Гидеона Харви .

Формальная онтология

С середины 1970 - х годов исследователи в области искусственного интеллекта (ИИ) осознали, что инженерия знаний является ключом к созданию больших и мощных систем ИИ . Исследователи искусственного интеллекта утверждали, что они могут создавать новые онтологии в виде вычислительных моделей , которые позволяют осуществлять определенные виды автоматизированных рассуждений , но успех был лишь незначительным . В 1980-х годах сообщество ИИ начало использовать термин «онтология» для обозначения как теории моделируемого мира, так и компонента систем, основанных на знаниях . В частности, Дэвид Пауэрс ввел в понятие ИИ слово « онтология» для обозначения реального мира или роботизированного заземления, [12] [13] [14] опубликовав в 1990 году обзоры литературы, в которых особое внимание уделяется обоснованной онтологии в связи с приглашением к подаче статей для Летнего симпозиума AAAI Machine. «Изучение естественного языка и онтологии» с расширенной версией, опубликованной в бюллетене SIGART и включенной в качестве предисловия к материалам. [15] Некоторые исследователи, черпая вдохновение из философских онтологий, рассматривали вычислительную онтологию как разновидность прикладной философии. [16]

В 1993 году широко цитируемая веб-страница и статья Тома Грубера «К принципам проектирования онтологий, используемых для обмена знаниями» [17] использовали онтологию как технический термин в информатике , тесно связанный с более ранней идеей семантических сетей и таксономий . Грубер ввел этот термин как спецификацию концептуализации :

Онтология — это описание (например, формальная спецификация программы) концепций и отношений, которые формально могут существовать для агента или сообщества агентов. Это определение согласуется с использованием онтологии как набора определений понятий, но является более общим. И это слово имеет иной смысл, чем его использование в философии. [18]

Пытаясь дистанцировать онтологии от таксономий и аналогичных усилий по моделированию знаний , основанных на классах и наследовании , Грубер заявил (1993):

Онтологии часто приравниваются к таксономическим иерархиям классов, определениям классов и отношению включения , но онтологии не обязательно ограничиваются этими формами. Онтологии также не ограничиваются консервативными определениями  — то есть определениями в традиционном логическом смысле, которые только вводят терминологию и не добавляют никаких знаний о мире. [19] Чтобы конкретизировать концептуализацию, необходимо сформулировать аксиомы , которые ограничивают возможные интерпретации определенных терминов. [20]

В уточнении определения Грубера Фейлмайр и Вёсс (2016) заявили: «Онтология - это формальная, явная спецификация общей концептуализации, которая характеризуется высокой семантической выразительностью, необходимой для повышенной сложности». [21]

Формальные компоненты онтологии

Современные онтологии имеют много структурных сходств, независимо от языка, на котором они выражены. Большинство онтологий описывают индивидов (экземпляры), классы (концепции), атрибуты и отношения.

Типы

Онтология предметной области

Онтология предметной области (или онтология предметной области) представляет концепции, принадлежащие какой-либо сфере мира, например биологии или политике. Онтология каждой предметной области обычно моделирует определения терминов, специфичные для предметной области. Например, словесная карточка имеет много разных значений. Онтология области покера будет моделировать значение слова « игральная карта », тогда как онтология области компьютерного оборудования будет моделировать значения « перфокарта » и « видеокарта ».

Поскольку онтологии предметной области пишутся разными людьми, они представляют концепции очень специфическими и уникальными способами и часто несовместимы в рамках одного проекта. По мере расширения систем, основанных на онтологиях предметной области, им часто приходится объединять онтологии предметной области путем ручной настройки каждого объекта или использования комбинации слияния программного обеспечения и ручной настройки. Это представляет собой проблему для разработчика онтологий. Различные онтологии в одной и той же области возникают из-за разных языков, различного предполагаемого использования онтологий и различного восприятия предметной области (на основе культурного происхождения, образования, идеологии и т. д . ) .

В настоящее время объединение онтологий, не разработанных на основе общей верхней онтологии, является в основном ручным процессом и, следовательно, трудоемким и дорогостоящим. Онтологии предметной области, которые используют одну и ту же верхнюю онтологию для предоставления набора базовых элементов, с помощью которых можно определить значения объектов онтологии предметной области, могут быть объединены с меньшими усилиями. Существуют исследования по обобщенным методам слияния онтологий, [22] но эта область исследований все еще продолжается, и это недавнее событие, когда проблему удалось обойти, используя несколько онтологий предметной области, использующих одну и ту же верхнюю онтологию, как OBO Foundry .

Верхняя онтология

Верхняя онтология (или базовая онтология) — это модель общих отношений и объектов, которые обычно применимы в широком диапазоне онтологий предметной области. Обычно он использует основной глоссарий , который охватывает термины и связанные с ними описания объектов, поскольку они используются в различных онтологиях соответствующих предметных областей.

Доступные для использования стандартизированные верхние онтологии включают BFO , метод BORO , Dublin Core , GFO , Cyc , SUMO , UMBEL и DOLCE . [23] [24] Некоторые считают WordNet верхней онтологией и используют его в качестве лингвистического инструмента для изучения онтологий предметной области. [25]

Гибридная онтология

Онтология Геллиша является примером комбинации онтологии верхнего уровня и онтологии предметной области.

Визуализация

Обзор методов визуализации онтологий представлен Katifori et al. [26] Обновленный обзор методов и инструментов визуализации онтологий был опубликован Dudás et al. [27] Наиболее признанные методы визуализации онтологий, а именно визуализация дерева с отступом и графа, оценены Fu et al. [28] Визуальный язык для онтологий, представленных в OWL , определяется Визуальной нотацией для онтологий OWL (VOWL) . [29]

Инженерное дело

Проектирование онтологий (также называемое построением онтологий) — это набор задач, связанных с разработкой онтологий для конкретной предметной области. [30] Это подобласть инженерии знаний , которая изучает процесс разработки онтологий, жизненный цикл онтологий, методы и методологии построения онтологий, а также инструменты и языки, которые их поддерживают. [31] [32]

Проектирование онтологий направлено на то, чтобы сделать явными знания, содержащиеся в программных приложениях и организационных процедурах для конкретной области. Разработка онтологий предлагает направление для преодоления семантических препятствий, например, связанных с определениями бизнес-терминов и классов программного обеспечения. Известные проблемы, связанные с разработкой онтологий, включают:

  1. Обеспечение актуальности онтологии с учетом знаний предметной области и использования терминов.
  2. Обеспечение достаточной конкретики и концептуального охвата интересующей области, что сводит к минимуму проблему полноты контента.
  3. Обеспечение того, чтобы онтология могла поддерживать варианты использования.

Редакторы

Редакторы онтологий — это приложения, предназначенные для помощи в создании онтологий или манипулировании ими. Редакторы онтологий обычно используют один или несколько языков онтологий .

Аспекты редакторов онтологий включают: возможности визуальной навигации внутри модели знаний , механизмы вывода и извлечение информации ; поддержка модулей; импорт и экспорт иностранных языков представления знаний для сопоставления онтологий ; и поддержка мета-онтологий, таких как OWL-S , Dublin Core и т. д. [33]

Обучение

Обучение онтологии — это автоматическое или полуавтоматическое создание онтологий, включая извлечение терминов предметной области из текста на естественном языке. Поскольку построение онтологий вручную чрезвычайно трудоемко и занимает много времени, существует большая мотивация автоматизировать этот процесс. Извлечение информации и анализ текста были исследованы для автоматического связывания онтологий с документами, например, в контексте задач BioCreative. [34]

Исследовать

Эпистемологические предположения, которые в ходе исследования задаются вопросом: «Что вы знаете?» или «Откуда вы это знаете?», создают основу, которую исследователи используют при подходе к определенной теме или области потенциального исследования. Говоря о принятии определенных истин, люди , проводящие академические исследования, должны понимать, что позволяет им начать построение теории .

Языки

Язык онтологии — это формальный язык , используемый для кодирования онтологии. Существует ряд таких языков для онтологий, как собственных, так и основанных на стандартах:

Опубликованные примеры

Проект сообщества W3C Linking Open Data координирует попытки объединить различные онтологии во всемирную семантическую сеть .

Библиотеки

Развитие онтологий привело к появлению сервисов, предоставляющих списки или каталоги онтологий, называемых библиотеками онтологий.

Ниже приведены библиотеки онтологий, выбранных человеком.

Ниже приведены как каталоги, так и поисковые системы.

Примеры приложений

В общем, онтологии можно с пользой использовать в нескольких областях.

Смотрите также

Связанные философские концепции

Рекомендации

  1. ^ Онтология. Макгилл – Издательство Королевского университета . 26 ноября 2002 г. п. 4. ISBN 9780773582675. Прикладная онтология как дисциплина или область науки является научной в том смысле, что она применяет определение бытия для определения онтологических обязательств других дисциплин, особенно, но не исключительно, в естественных науках, во многом таким же образом, как прикладная математика в инженерии связана с чистой наукой. математика.
  2. ^ Г. Будин (2005), «Управление переводами, основанное на онтологии», в Хелле В. Дам (редактор), « Системы знаний и перевод» , Ян Энгберг, Хайдрун Герзимиш-Арбогаст, Вальтер де Грюйтер, стр. 113, ISBN 978-3-11-018297-2
  3. ↑ Палермо, Джулио (10 января 2007 г.). «Онтология экономической власти при капитализме: господствующая экономика и Маркс». Кембриджский экономический журнал . 31 (4): 539–561. doi : 10.1093/cje/bel036 – через Oxford Journals.
  4. ^ Зунига, Глория Л. (2 февраля 1999 г.). «Онтология экономических объектов». Мпра Бумага . Исследовательский отдел Федерального резервного банка Сент-Луиса . Проверено 16 июня 2013 г.
  5. ^ Сова, JF (1995). «Онтологические категории верхнего уровня». Международный журнал человеко-компьютерных исследований . 43 (5–6 (ноябрь/декабрь)): 669–85. дои : 10.1006/ijhc.1995.1068.
  6. ^ {Биопортал
  7. ^ Литейный цех промышленных онтологий
  8. ^ Мусен, Марк (2015). «Проект Протеже: взгляд назад и взгляд вперед». ИИ имеет значение . 1 (4): 4–12. дои : 10.1145/2757001.2757003. ПМЦ 4883684 . ПМИД  27239556. 
  9. ^ «Онтология». Интернет-словарь этимологии .
  10. ^ εἰμί. Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
  11. ^ Смит, Барри (2022). «Рождение онтологии». Журнал структур и систем знаний . 3 : 57–66.
  12. ^ Пауэрс, Дэвид (1983). «Интеллект роботов». Электроника сегодня Интернэшнл .
  13. ^ Пауэрс, Дэвид (1984). «Естественный язык естественным путем». Компьютерные компакты . 2 (3–4): 100–109. дои : 10.1016/0167-7136(84)90088-X.
  14. ^ Пауэрс, Дэвид; Терк, Крис (1989). Машинное обучение естественного языка . Спрингер-Верлаг. ISBN 978-1-4471-1697-4.
  15. ^ Пауэрс, Дэвид (1991). Предисловие: Цели, проблемы и направления машинного обучения естественного языка и онтологий . Весенний симпозиум AAAI по машинному обучению естественного языка и онтологии. ДФКИ.
  16. ^ Грубер, Т. (2008). «Онтология». Ин Лю, Лин ; Озсу, М. Тамер (ред.). Энциклопедия систем баз данных . Спрингер-Верлаг. ISBN 978-0-387-49616-0.
  17. ^ Грубер, Т. (1993). «К принципам проектирования онтологий, используемых для обмена знаниями». Международный журнал человеко-компьютерных исследований . 43 (5–6): 907–928. дои : 10.1006/ijhc.1995.1081 . S2CID  1652449.
  18. ^ Грубер, Т. (2001). «Что такое онтология?». Стэндфордский Университет . Архивировано из оригинала 16 июля 2010 г. Проверено 9 ноября 2009 г.
  19. ^ Эндертон, HB (12 мая 1972 г.). Математическое введение в логику (1-е изд.). Сан-Диего, Калифорния: Academic Press. п. 295. ИСБН 978-0-12-238450-9.2-е издание; 5 января 2001 г.
  20. ^ Грубер, Томас Р. (июнь 1993 г.). «Подход к переводу спецификаций переносимых онтологий» (PDF) . Приобретение знаний . 5 (2): 199–220. CiteSeerX 10.1.1.101.7493 . дои : 10.1006/knac.1993.1008. S2CID  15709015. 
  21. ^ Фейлмайр, Кристина; Вёсс, Вольфрам (2016). «Анализ онтологий и факторов их успеха для применения в бизнесе». Инженерия данных и знаний . 101 : 1–23. дои :10.1016/j.datak.2015.11.003.
  22. ^ «Проект: динамическое восстановление онтологии» . Факультет информатики Эдинбургского университета . Проверено 2 января 2012 г.
  23. ^ ab «Лаборатория прикладной онтологии - DOLCE». Лаборатория прикладной онтологии (ЛОА) . Проверено 10 февраля 2011 г.
  24. ^ ab "СОВОВАЯ версия DOLCE+DnS". Лаборатория семантических технологий . Проверено 21 февраля 2013 г.
  25. ^ Навильи, Роберто; Веларди, Паола (2004). «Изучение онтологий домена из хранилищ документов и специализированных веб-сайтов». Компьютерная лингвистика . МТИ Пресс. 30 (2): 151–179. CiteSeerX 10.1.1.329.6965 . дои : 10.1162/089120104323093276. S2CID  2453822. 
  26. ^ Катифори, А.; Халацис, К.; Лепурас, Г.; Василакис, К.; Джаннопулу, Э. (2007). «Методы визуализации онтологий. Обзор» (PDF) . Обзоры вычислительной техники ACM . 39 (4): 10. CiteSeerX 10.1.1.330.3281 . дои : 10.1145/1287620.1287621. S2CID  14205872. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 года. 
  27. ^ Дудас, М.; Ломанн, С.; Сватек, В.; Павлов, Д. (2018). «Методы и инструменты визуализации онтологий: обзор современного состояния». Обзор инженерии знаний . 33 (е10). дои : 10.1017/S0269888918000073. S2CID  52965103.
  28. ^ Фу, Бо; Ной, Наталья Ф.; Стори, Маргарет-Энн (2013). «Дерево с отступом или график? Исследование удобства использования методов визуализации онтологий в контексте оценки сопоставления классов». Семантическая сеть – ISWC 2013: 12-я Международная конференция по семантической сети, Сидней, Новый Южный Уэльс, Австралия, 21–25 октября 2013 г., Материалы, часть I. Конспекты лекций по информатике. Том. 8218. Берлин: Шпрингер. стр. 117–134. дои : 10.1007/978-3-642-41335-3_8 . ISBN 978-3-642-41335-3.
  29. ^ Негру, Стефан; Ломанн, Штеффен; Хааг, Флориан (7 апреля 2014 г.). «VOWL: Визуальная нотация для онтологий OWL: Спецификация версии 2.0». Сеть визуальных данных .
  30. ^ Паучард, Лайн; Ивезич, Ненад; Шленофф, Крейг (март 2000 г.). «Разработка онтологий для распределенного сотрудничества в производстве» (PDF) . Материалы конференции AIS2000 .
  31. ^ Гомес-Перес, Аскуньон; Фернандес-Лопес, Мариано; Корчо, Оскар (2004). Онтологическая инженерия: с примерами из областей управления знаниями, электронной коммерции и семантической сети (1-е изд.). Спрингер. п. 403. ИСБН 978-1-85233-551-9.
  32. ^ Де Никола, Антонио; Миссикофф, Мишель; Навильи, Роберто (2009). «Подход программной инженерии к построению онтологий» (PDF) . Информационные системы . Эльзевир. 34 (2): 258–275. дои : 10.1016/j.is.2008.07.002.
  33. ^ Алатриш, Эмхимед (2013). «Сравнение некоторых редакторов онтологий» (PDF) . Информационные системы управления . 8 (2): 18–24.
  34. ^ Краллингер, М; Лейтнер, Ф; Васкес, М; Сальгадо, Д; Марсель, К; Тайерс, М; Валенсия, А; Чатр-Арьямонтри, А (2012). «Как связать онтологии и белок-белковые взаимодействия с литературой: подходы к анализу текста и опыт биокреативности». База данных . 2012 : bas017. doi : 10.1093/база данных/bas017. ПМК 3309177 . ПМИД  22438567. 
  35. ^ "САДЛ". СоурсФордж . Проверено 10 февраля 2011 г.
  36. ^ Джаррар, Мустафа (2021). «Арабская онтология - арабская сеть слов с онтологически чистым содержанием». Прикладная онтология . 16 :1–26. arXiv : 2205.09664 . дои : 10.3233/AO-200241. S2CID  231886117.
  37. ^ "АУРУМ - Онтология информационной безопасности" . Проверено 29 января 2016 г.
  38. ^ «Базовая формальная онтология (BFO)» . Институт формальной онтологии и медицинской информатики (IFOMIS).
  39. ^ "БиоПАКС" . Проверено 10 февраля 2011 г.
  40. ^ Остервальдер, Александр; Пиньёр, Ив (17–19 июня 2002 г.). Онтология модели электронного бизнеса для моделирования электронного бизнеса (PDF) . 15-я электронная конференция в Бледе , Словения . Архивировано из оригинала (PDF) 19 апреля 2011 г.
  41. ^ Вверх, Антоний; Джонс, Питер (2016). «Онтология для сильно устойчивых бизнес-моделей: определение структуры предприятия, совместимой с естественными и социальными науками». Организация и окружающая среда . 29 (1): 97–123. дои : 10.1177/1086026615592933. S2CID  145089240.
  42. ^ «О CCO и GexKB» . Семантическая системная биология. Архивировано из оригинала 30 июля 2012 г.
  43. ^ "ККонтология" . Проверено 10 февраля 2011 г.
  44. ^ «Концептуальная эталонная модель CIDOC (CRM)» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  45. ^ "КОСМО". Компания МИКРА . Проверено 10 февраля 2011 г.
  46. ^ Осборн, JD; Флатов, Дж; Холко, М; Лин, С.М.; Киббе, Вашингтон; Чжу, LJ; Данила, Мичиган; Фэн, Дж; Чисхолм, Р.Л. (2009). «Аннотирование генома человека с помощью онтологии болезней». БМК Геномика . 10 (Приложение 1): S6. дои : 10.1186/1471-2164-10-S1-S6 . ПМК 2709267 . ПМИД  19594883. 
  47. ^ Дамиано, Россана; Ломбардо, Винченцо; Пиццо, Антонио (2005). «Формальное кодирование онтологии драмы» (PDF) . В Субсоле, Жерар (ред.). Виртуальное повествование. Использование технологий виртуальной реальности для рассказывания историй . Конспекты лекций по информатике. Том. 3805. Шпрингер Берлин Гейдельберг. стр. 95–104. дои : 10.1007/11590361_11. hdl : 2318/148510 . ISBN 9783540322856. S2CID  29113893.
  48. ^ «Онтология бизнеса финансовой индустрии (FIBO)» . Проверено 15 марта 2017 г.
  49. ^ «Основные, основные и лингвистические онтологии» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  50. ^ «Основная модель анатомии» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  51. ^ «Продление автомобиля» . Проверено 15 июня 2017 г.
  52. ^ "ЗОЛОТО" . Проверено 10 февраля 2011 г.
  53. ^ «Обобщенная верхняя модель» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  54. ^ "Сайт группы IDEAS" . Архивировано из оригинала 16 декабря 2018 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  55. ^ "База ссылок". Архивировано из оригинала 18 сентября 2008 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  56. ^ Справочное руководство консоли конфигурации: Язык шаблонов ориентиров (LPL). Проверено 4 февраля 2020 г.
  57. ^ "Биопортал". Национальный центр биологической онтологии (NCBO). Архивировано из оригинала 12 июня 2009 г. Проверено 24 октября 2013 г.
  58. ^ «Браузер онтологий для большинства открытых биологических и биомедицинских онтологий» . Проект с открытым исходным кодом по биоинформатике Беркли (BBOP).
  59. ^ «Открытые биологические и биомедицинские онтологии». Проект с открытым исходным кодом по биоинформатике Беркли (BBOP).
  60. ^ "Онтология OMNIBUS" . Архивировано из оригинала 19 июля 2012 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  61. ^ "ОНСТР". Архивировано из оригинала 16 апреля 2014 года . Проверено 16 апреля 2014 г.
  62. ^ "Онтология растений" . Проверено 10 февраля 2011 г.
  63. ^ "ПРО". Архивировано из оригинала 10 марта 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  64. ^ "ПробОнто" . Проверено 1 июля 2017 года .
  65. ^ Сват, MJ; Гренон, П; Вималаратне, С (2016). «ProbOnto: онтология и база знаний вероятностных распределений». Биоинформатика . 32 (17): 2719–21. doi : 10.1093/биоинформатика/кстати,170. ПМК 5013898 . ПМИД  27153608. 
  66. ^ «Онтология белка». Архивировано из оригинала 10 марта 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  67. ^ Нембавер, Виктория; Мазанду, Гастон К.; Хочкисс, Джейд; Сафари Серуфури, Жан-Мишель; Кент, Джилл; Кенгне, Андре Паскаль; Ани, Кофи; Мунунг, Нчангви Синтия; Букини, Дайма; Битунги, Валентина Жозиан Нго; Мунубе, Деогратиас (01 октября 2020 г.). «Онтология серповидноклеточной болезни: обеспечение возможности совместных исследований и совместной разработки новых приложений для планетарного здравоохранения». OMICS: Журнал интегративной биологии . 24 (10): 559–567. дои : 10.1089/omi.2020.0153. ПМК 7549008 . ПМИД  33021900. 
  68. ^ Эйлбек К., Льюис С.Э. , Мангалл С.Дж., Янделл М., Штейн Л. , Дурбин Р. , Эшбернер М. (2005). «Онтология последовательностей: инструмент для унификации аннотаций генома». Геномная биология . 6 (5): Р44. дои : 10.1186/gb-2005-6-5-r44 . ПМЦ 1175956 . ПМИД  15892872. 
  69. ^ Найлз И. и Пиз А. (2001), К стандартной верхней онтологии, в материалах 2-й Международной конференции по формальной онтологии в информационных системах (FOIS-2001), Крис Велти и Барри Смит, ред., стр. 2 -9.
  70. ^ "СЛАДКОЕ" . Проверено 11 марта 2022 г.
  71. ^ "ССН" . Проверено 10 ноября 2021 г.
  72. ^ Мангалл, CJ; Торняй, К; Гкутос, Г.В.; Льюис, SE; Гендель, Массачусетс (2012). «Уберон, интегративная онтология анатомии многих видов». Геном Биол . 13 (1): С5. дои : 10.1186/gb-2012-13-1-r5 . ПМЦ 3334586 . ПМИД  22293552. 
  73. ^ "ЯМАТО". Архивировано из оригинала 3 марта 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  74. ^ "ЦВЕТ" . Проверено 4 мая 2011 г.
  75. ^ "Библиотека онтологий DAML" . Проверено 10 февраля 2011 г.
  76. ^ "Библиотека ODP" . Проверено 21 февраля 2013 г.
  77. ^ "Библиотека онтологий Protege" . Проверено 10 февраля 2011 г.
  78. ^ "СхемаВеб". Архивировано из оригинала 10 августа 2011 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  79. ^ "Литейный завод ОБО" . Проверено 10 февраля 2011 г.
  80. ^ Смит, Б .; Эшбернер, М .; Росс, К.; Бард, Дж.; Баг, В.; Сестерс, В.; Голдберг, LJ; Эйлбек, К.; Ирландия, А.; Мунгалл, CJ; Леонтис, Н.; Рокка-Серра, П.; Руттенберг, А.; Сансоне, ЮАР; Шойерманн, Р.Х.; Шах, Н.; Ветцель, Польша; Льюис, С. (2007). «OBO Foundry: скоординированная эволюция онтологий для поддержки интеграции биомедицинских данных». Природная биотехнология . 25 (11): 1251–1255. дои : 10.1038/nbt1346. ПМК 2814061 . ПМИД  17989687.  Значок открытого доступа
  81. ^ «Добро пожаловать на биопортал NCBO | Биопортал NCBO» . bioportal.bioontology.org . Проверено 28 марта 2019 г.
  82. ^ "Онтоселект". Архивировано из оригинала 11 ноября 2010 года . Проверено 10 февраля 2011 г.
  83. ^ «Онтария» . Проверено 10 февраля 2011 г.
  84. ^ "OpenOntologyRepository - OntologPSMW" . ontlogforum.org . Проверено 28 марта 2019 г.
  85. ^ Хан, Зубейда Касмод; Кит, К. Мария (2013). «Фундаментальная библиотека онтологий ROMULUS». Модель и инженерия данных . Конспекты лекций по информатике. Том. 8216. стр. 200–211. дои : 10.1007/978-3-642-41366-7_17. ISBN 978-3-642-41365-0. Проверено 25 июня 2023 г.
  86. ^ Оберле, Дэниел (2014). «Как онтологии приносят пользу корпоративным приложениям» (PDF) . Семантическая сеть . ИОС Пресс. 5 (6): 473–491. дои : 10.3233/SW-130114.
  87. ^ Фрэнк, Эндрю У. (2001). «Уровни онтологии и ограничения согласованности в географических информационных системах». Международный журнал географической информатики . 15 (7): 667–678. Бибкод : 2001IJGIS..15..667F. дои : 10.1080/13658810110061144. S2CID  6616354.
  88. ^ Стивенсон, Марк; Го, Икунь (2010). «Устранение неоднозначности неоднозначных биомедицинских терминов с использованием примеров, полученных из метатезавра UMLS». Журнал биомедицинской информатики . 43 (5): 762–773. дои : 10.1016/j.jbi.2010.06.001 . ПМИД  20541624.
  89. ^ Боденрейдер, О.; Митчелл, Дж.А.; Маккрей, AT (2003). «Биомедицинские онтологии». Биокомпьютинг 2004 . стр. 164–165. дои : 10.1142/9789812704856_0016. ISBN 978-981-238-598-7. ПМК  4300097 . ПМИД  15759615.

дальнейшее чтение

Внешние ссылки

Викискладе есть медиафайлы по теме Онтология .
У Схолии есть тематический профиль Онтология (информатика) .