stringtranslate.com

Шиповый белок коронавируса

Гликопротеин спайка (S) (иногда также называемый белком шипа , [2] ранее известный как E2 [3] ) является крупнейшим из четырех основных структурных белков , обнаруженных у коронавирусов . [4] Белок-шип собирается в тримеры , которые образуют большие структуры, называемые шипами или пепломерами , [3] которые выступают из поверхности вириона . [4] [5] Характерный внешний вид этих шипов при визуализации с помощью просвечивающей электронной микроскопии с негативным окрашиванием , «напоминающий солнечную корону », [6] дал семейству вирусов его основное название. [2]

Функция спайкового гликопротеина заключается в обеспечении проникновения вируса в клетку-хозяина путем сначала взаимодействия с молекулами на внешней поверхности клетки, а затем слияния вирусной и клеточной мембран . Спайковый гликопротеин представляет собой слитый белок класса I , который содержит две области, известные как S1 и S2, отвечающие за эти две функции. Область S1 содержит рецепторсвязывающий домен , который связывается с рецепторами на поверхности клетки. Коронавирусы используют очень разнообразный набор рецепторов; SARS-CoV (который вызывает SARS ) и SARS-CoV-2 (который вызывает COVID-19 ) взаимодействуют с ангиотензинпревращающим ферментом 2 (ACE2). Область S2 содержит слитый пептид и другую инфраструктуру слияния, необходимую для слияния мембраны с клеткой-хозяином, что является необходимым этапом для заражения и репликации вируса . Спайковый гликопротеин определяет круг хозяев вируса (какие организмы он может заразить) и клеточный тропизм (какие клетки или ткани внутри организма он может инфицировать). [4] [5] [7] [8]

Спайковый гликопротеин обладает высокой иммуногенностью . Антитела против спайкового гликопротеина обнаруживаются у пациентов, перенесших SARS и COVID-19. Нейтрализующие антитела нацелены на эпитопы рецепторсвязывающего домена. [9] Большинство усилий по разработке вакцины против COVID-19 в ответ на пандемию COVID-19 направлены на активацию иммунной системы против белка-шипа. [10] [11] [12]

Состав

Криоэлектронная микроскопия: структура тримера шиповидного белка SARS-CoV-2 в конформации перед слиянием, с выделенным единственным мономером. NTD S1 показан синим цветом, а CTD S1 (который служит доменом, связывающим рецептор) — розовым. Спирали показаны оранжевым и голубым цветом и образуют части S2, которые претерпят конформационные изменения во время слияния. Черная полоса внизу указывает положение вирусной мембраны. Из PDB : 6VSB . [13]

Белок-шип очень большой, часто имеет длину от 1200 до 1400 аминокислотных остатков; [8] в SARS-CoV-2 он составляет 1273 остатка . [5] Это однопроходной трансмембранный белок с коротким С-концевым хвостом внутри вируса, трансмембранной спиралью и большим N-концевым эктодоменом, открытым снаружи вируса. [5] [7]

Спайковый гликопротеин образует гомотримеры , в которых три копии белка взаимодействуют через свои эктодомены. [5] [7] Структуры тримера были описаны как булаво-грушевидные или лепесткообразные. [3] Каждый белок-шип содержит две области, известные как S1 и S2, и в собранном тримере области S1 на N-конце образуют часть белка, наиболее удаленную от поверхности вируса, а области S2 образуют гибкий «стебель». содержащий большую часть белок-белковых взаимодействий , удерживающих тример на месте. [7]

С1

Область S1 спайкового гликопротеина отвечает за взаимодействие с рецепторными молекулами на поверхности клетки-хозяина на первом этапе проникновения вируса . [4] [7] S1 содержит два домена , называемые N-концевым доменом (NTD) и C-концевым доменом (CTD), [2] [7], иногда также известными как домены A и B. [14] В зависимости от коронавируса один или оба домена могут использоваться в качестве рецептор-связывающих доменов (RBD). Рецепторы-мишени могут быть очень разнообразными, включая белки рецепторов клеточной поверхности и сахара, такие как сиаловые кислоты, в качестве рецепторов или корецепторов. [2] [7] В целом, NTD связывает молекулы сахара, тогда как CTD связывает белки, за исключением вируса гепатита мыши , который использует свой NTD для взаимодействия с белковым рецептором, называемым CEACAM1 . [7] NTD имеет галектиноподобную белковую складку , но связывает молекулы сахара несколько иначе, чем галектины . [7]

CTD отвечает за взаимодействие MERS-CoV с его рецептором дипептидилпептидазой-4 [7] , а также за взаимодействие SARS-CoV [7] и SARS-CoV-2 [5] с их рецептором ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2). ). CTD этих вирусов можно дополнительно разделить на два субдомена, известные как ядро ​​и расширенная петля или мотив связывания рецептора (RBM), где расположено большинство остатков, которые непосредственно контактируют с целевым рецептором. [5] [7] Существуют тонкие различия, в основном в RBM, между взаимодействием шиповых белков SARS-CoV и SARS-CoV-2 с ACE2. [5] Сравнение шиповых белков нескольких коронавирусов позволяет предположить, что расхождение в области RBM может объяснять различия в целевых рецепторах, даже если ядро ​​S1 CTD структурно очень похоже. [7]

В линиях коронавируса, а также в четырех основных подгруппах коронавирусов, регион S1 менее консервативен , чем S2, что соответствует его роли во взаимодействии с вирус-специфичными рецепторами клеток-хозяев. [4] [5] [7] В регионе S1 NTD более консервативен, чем CTD. [7]

С2

Область S2 спайкового гликопротеина отвечает за слияние мембран между оболочкой вируса и клеткой-хозяином , обеспечивая проникновение генома вируса в клетку. [5] [7] [8] Область S2 содержит слитый пептид , участок в основном гидрофобных аминокислот, функция которых заключается в проникновении и дестабилизации мембраны клетки-хозяина. [5] [8] S2 также содержит два субдомена гептадных повторов , известные как HR1 и HR2, иногда называемые областью «слитого ядра». [5] Эти субдомены претерпевают драматические конформационные изменения в процессе слияния с образованием пучка из шести спиралей , что является характерной особенностью слитых белков класса I. [5] [8] Также считается, что область S2 включает трансмембранную спираль и C-концевой хвост, расположенный внутри вириона. [5]

По сравнению с S1 регион S2 очень хорошо консервативен среди коронавирусов. [5] [7]

Посттрансляционные модификации

Спайковый белок проиллюстрирован с гликозилированием и без него . [15] [16]

Спайковый гликопротеин сильно гликозилируется посредством N-связанного гликозилирования . [4] Исследования шиповидного белка SARS-CoV-2 также показали O-связанное гликозилирование в области S1. [17] С-концевой хвост, расположенный внутри вириона, обогащен остатками цистеина и пальмитоилирован . [5] [18]

Спайковые белки активируются посредством протеолитического расщепления . Они расщепляются протеазами клетки-хозяина на границе S1-S2, а затем в так называемом сайте S2' на N-конце слитого пептида. [4] [5] [7] [8]

Конформационные изменения

Как и другие слитые белки класса I , белок-шип претерпевает очень большие конформационные изменения в процессе слияния. [4] [5] [7] [8] Как до, так и после слияния нескольких коронавирусов, особенно SARS-CoV-2 , были изучены с помощью криоэлектронной микроскопии . [5] [19] [20] [21] Функционально важная динамика белков также наблюдалась в состоянии до слияния, в котором относительная ориентация некоторых областей S1 относительно S2 в тримере может варьироваться. В закрытом состоянии все три области S1 упакованы плотно, и область, которая контактирует с рецепторами клетки-хозяина, стерически недоступна, в то время как в открытых состояниях есть один или два RBD S1, более доступные для связывания рецептора, в открытой или «верхней» конформации. . [5]

Трансмиссионная электронная микрофотография вириона SARS-CoV-2 , демонстрирующая характерный вид «короны» с белками-шипами (зелеными), образующими заметные выступы на поверхности вириона (желтого).

Выражение и локализация

Ген , кодирующий белок-шип, расположен на 3'-конце генома положительной смысловой РНК вируса , наряду с генами трех других структурных белков и различных специфичных для вируса вспомогательных белков . [4] [5] Белковый транспорт шиповых белков, по-видимому, зависит от подгруппы коронавируса: при экспрессии в изоляции без других вирусных белков шиповые белки бета-коронавирусов способны достигать поверхности клетки , тогда как белки альфа-коронавирусов и гамма-коронавирусов сохраняются внутриклеточно. В присутствии белка М транспортировка шиповидного белка изменяется и вместо этого сохраняется в ERGIC , месте, в котором происходит сборка вируса. [18] В SARS-CoV-2 и белок M, и белок E модулируют транспортировку спайковых белков посредством различных механизмов. [22]

Иллюстрация вириона коронавируса в слизистой оболочке дыхательных путей , показывающая положения четырех структурных белков и компонентов внеклеточной среды. [23]

Белок-шип не требуется для сборки вируса или образования вирусоподобных частиц ; [18] , однако наличие шипа может влиять на размер конверта. [24] Включение белка-шипа в вирионы во время сборки и почкования зависит от белок-белковых взаимодействий с белком М через С-концевой хвост. [18] [22] Исследование вирионов с помощью криоэлектронной микроскопии показывает, что на вирион приходится примерно от 25 [25] до 100 шипов-тримеров. [20] [24]

Функция

Белок-шип отвечает за проникновение вируса в клетку-хозяина , что является необходимым ранним этапом репликации вируса . Это необходимо для репликации. [2] Он выполняет эту функцию в два этапа: сначала связывается с рецептором на поверхности клетки-хозяина посредством взаимодействия с областью S1, а затем объединяет вирусную и клеточную мембраны посредством действия области S2. [7] [8] [9] Место слияния варьируется в зависимости от конкретного коронавируса: некоторые из них могут проникать через плазматическую мембрану , а другие - из эндосом после эндоцитоза . [8]

Вложение

Взаимодействие рецептор-связывающего домена в области S1 с его рецептором-мишенью на поверхности клетки инициирует процесс проникновения вируса. Различные коронавирусы нацелены на разные рецепторы клеточной поверхности, иногда используя молекулы сахара, такие как сиаловые кислоты , или образуя белок-белковые взаимодействия с белками, экспонированными на поверхности клетки. [7] [9] Различные коронавирусы сильно различаются по своим целевым рецепторам. Наличие рецептора-мишени, с которым может связываться S1, является определяющим фактором диапазона хозяев и тропизма клеток . [7] [9] [26] Сывороточный альбумин человека связывается с областью S1, конкурируя с ACE2 и, следовательно, ограничивая проникновение вируса в клетки. [27]

Протеолитическое расщепление

Для слияния мембран требуется протеолитическое расщепление белка-шипа, иногда называемое «праймингом». По сравнению с другими слитыми белками класса I этот процесс является сложным и требует двух расщеплений в разных сайтах: одного на границе S1/S2 и одного в S2'-сайте для высвобождения слитого пептида . [5] [7] [9] Коронавирусы различаются в зависимости от того, в какой части жизненного цикла вируса происходит это расщепление, особенно расщепление S1/S2. Многие коронавирусы расщепляются по S1/S2 перед выходом вируса из клетки, продуцирующей вирус, с помощью фурина и других пропротеинконвертаз ; [7] у SARS-CoV-2 в этом положении присутствует сайт расщепления многоосновного фурина. [5] [9] Другие могут расщепляться внеклеточными протеазами, такими как эластаза , протеазами, расположенными на поверхности клетки после связывания с рецептором, или протеазами, обнаруживаемыми в лизосомах после эндоцитоза . [7] Конкретные протеазы, ответственные за это расщепление, зависят от вируса, типа клеток и местной среды. [8] При SARS-CoV в этом процессе важна сериновая протеаза TMPRSS2 с дополнительным вкладом цистеиновых протеаз катепсина B и катепсина L в эндосомах. [8] [9] [34] Сообщалось также, что трипсин и трипсиноподобные протеазы вносят свой вклад. [8] В SARS-CoV-2 TMPRSS2 является основной протеазой для расщепления S2', и, как сообщается, ее присутствие важно для вирусной инфекции, [5] [9] при этом протеаза катепсина L является функциональной, но не обязательной. [34]

Слияние мембран

Сравнение конформаций тримера шипового белка SARS-CoV до слияния (оранжевый, голубой) и после слияния (красный, темно-синий). В конформации перед слиянием центральная спираль (оранжевая) и гептадный повтор 1 (HR1, голубой) свернуты друг на друга в антипараллельной ориентации. В конформации после слияния центральная спираль (красная) и последовательность HR1 (темно-синяя) реорганизуются, образуя расширенную тримерную спиральную спираль. Вирусная мембрана находится внизу, а мембрана клетки-хозяина — вверху. Показаны только ключевые части субъединицы S2. Из PDB : 6NB6 (до слияния) [35] и PDB : 6M3W (после слияния). [36]

Как и другие слитые белки класса I , белок-шип в своей конформации до слияния находится в метастабильном состоянии. [7] Происходит резкое конформационное изменение , вызывающее повторную складку гептадных повторов в области S2 в расширенный пучок из шести спиралей , заставляя слитый пептид взаимодействовать с клеточной мембраной и сближать вирусную и клеточную мембраны в непосредственной близости. [5] [7] Требуются связывание с рецептором и протеолитическое расщепление (иногда называемое «праймированием»), но дополнительные триггеры для этого конформационного изменения варьируются в зависимости от коронавируса и местной среды. [37] Исследования SARS-CoV in vitro предполагают зависимость от концентрации кальция . [8] В отличие от коронавирусов, вирус инфекционного бронхита , поражающий птиц, может быть вызван только низким уровнем pH ; для других коронавирусов низкий pH сам по себе не является триггером, но может быть необходим для активности протеаз, которые, в свою очередь, необходимы для слияния. [8] [37] Местоположение слияния мембран — на плазматической мембране или в эндосомах — может варьироваться в зависимости от наличия этих триггеров конформационных изменений. [37] Слияние вирусной и клеточной мембран позволяет проникнуть геному положительной смысловой РНК вируса в цитозоль клетки-хозяина , после чего начинается экспрессия вирусных белков. [2] [4] [9]

Помимо слияния мембран вируса и клетки-хозяина, некоторые спайковые белки коронавируса могут инициировать слияние мембран между инфицированными клетками и соседними клетками, образуя синцитии . [38] Такое поведение можно наблюдать в инфицированных клетках в клеточной культуре . [39] Синцитии наблюдались в образцах тканей пациентов, зараженных SARS-CoV , MERS-CoV и SARS-CoV-2 , [39] хотя в некоторых сообщениях подчеркивается разница в образовании синцитий между SARS-CoV и SARS-CoV. -2 пика объясняются различиями в последовательностях вблизи сайта расщепления S1/S2. [40] [41] [42]

Иммуногенность

Поскольку белок-шип находится на поверхности вируса, он является основным антигеном , к которому вырабатываются нейтрализующие антитела . [2] [9] [43] [44] Его обширное гликозилирование может служить гликановым щитом , который скрывает эпитопы от иммунной системы . [9] [16] В связи со вспышкой атипичной пневмонии и пандемией COVID-19 антитела к шиповым белкам SARS-CoV и SARS-CoV-2 были тщательно изучены. [43] Были идентифицированы антитела к белкам-шипам SARS-CoV и SARS-CoV-2, которые нацелены на эпитопы в рецептор-связывающем домене [9] [43] [45] или мешают процессу конформационных изменений. [9] Большинство антител инфицированных людей нацелены на рецептор-связывающий домен. [43] [46] [47] Совсем недавно сообщалось, что антитела, нацеленные на субъединицу S2 белка-шипа, обладают широкой нейтрализующей активностью против вариантов. [48]

Ответ на COVID-19

Вакцина

В ответ на пандемию COVID-19 был разработан ряд вакцин против COVID-19 с использованием различных технологий, включая мРНК-вакцины и вирусные векторные вакцины . Большинство разработок вакцин нацелено на белок-шип. [10] [11] [12] Основываясь на методах, ранее использовавшихся в исследованиях вакцин, направленных на респираторно-синцитиальный вирус и SARS-CoV , во многих усилиях по разработке вакцины против SARS-CoV-2 использовались конструкции, которые включают мутации для стабилизации предварительного слияния белка-шипа. конформации, способствуя выработке антител против эпитопов, находящихся в этой конформации. [49] [50]

Согласно исследованию, опубликованному в январе 2023 года, у людей, у которых развился поствакцинальный миокардит, были обнаружены заметно повышенные уровни полноразмерного белка-шипа, не связанного антителами (по сравнению с контрольной группой, которая осталась здоровой). Однако эти результаты не меняют соотношение риска и пользы в пользу вакцинации против COVID-19 для предотвращения тяжелых клинических исходов. [51] [ нужен неосновной источник ]

Моноклональные антитела

Казиривимаб (синий) и имдевимаб (оранжевый) взаимодействуют с рецептор-связывающим доменом белка-шипа (розовый). [13] [52]

Моноклональные антитела , нацеленные на рецептор-связывающий домен белка-шипа, были разработаны в качестве лечения COVID-19 . По состоянию на 8 июля 2021 г. в США получили разрешение на экстренное использование три препарата моноклональных антител: [53] бамланивимаб/этесевимаб , [54] [55] казиривимаб/имдевимаб , [56] и сотровимаб . [57] Бамланивимаб/этезевимаб не рекомендовался в США из-за увеличения числа вариантов SARS-CoV-2 , которые менее чувствительны к этим антителам. [53]

Варианты SARS-CoV-2

На протяжении всей пандемии COVID-19 геном вирусов SARS-CoV-2 секвенировали много раз, в результате чего были идентифицированы тысячи различных вариантов . [58] Многие из них обладают мутациями , которые изменяют аминокислотную последовательность белка-шипа. По данным анализа Всемирной организации здравоохранения, проведенного в июле 2020 года, ген spike ( S ) был вторым по частоте мутаций в геноме после ORF1ab (который кодирует большинство неструктурных белков вируса ). [58] Скорость эволюции гена спайка выше, чем скорость эволюции всего генома. [59] Анализ геномов SARS-CoV-2 позволяет предположить, что некоторые участки в последовательности белка-шипа, особенно в рецептор-связывающем домене, имеют эволюционное значение [60] и подвергаются позитивному отбору . [46] [61]

Мутации шиповидных белков вызывают беспокойство, поскольку они могут влиять на инфекционность или заразность , а также способствовать ускользанию от иммунитета . [46] Мутация D 614 G возникла независимо во многих вирусных линиях и стала доминантной среди секвенированных геномов; [62] [63] он может иметь преимущества в инфекционности и трансмиссивности [46], возможно, за счет увеличения плотности шипов на вирусной поверхности, [64] увеличения доли связывающих компетентных конформаций или улучшения стабильности, [65] но это не влияет на вакцины. [66] Мутация N501Y является общей для вариантов альфа, бета, гамма и омикрон SARS-CoV-2 и способствует усилению инфекции и передачи вируса, [67] снижению эффективности вакцины, [68] и способности SARS-CoV -2 для заражения новых видов грызунов. [69] N501Y увеличивает сродство Spike к человеческому ACE2 примерно в 10 раз, [70] что может лежать в основе некоторых преимуществ приспособленности, обеспечиваемых этой мутацией, хотя взаимосвязь между сродством и инфекционностью сложна. [71] Мутация P681R изменяет сайт расщепления фурином и отвечает за повышенную инфекционность, передачу и глобальное воздействие дельта-варианта SARS-CoV-2 . [72] [73] Мутации в положении E 484, особенно E 484 K , были связаны с ускользанием от иммунного ответа и снижением связывания антител . [46] [59]

Вариант SARS-CoV-2 Omicron отличается необычно большим количеством мутаций в белке-шипе. [74] Мутация 69–70del (Δ69-70) гена спайка SARS CoV-2 (ген S, S-ген) приводит к тому, что тестовый зонд TaqPath PCR не связывается с мишенью гена S, что приводит к отказу мишени гена S (SGTF). ) в положительных образцах SARS CoV-2. Этот эффект использовался в качестве маркера для мониторинга распространения варианта Альфа [75] [76] и варианта Омикрон . [77]

Дополнительная ключевая роль в болезни

В 2021 году компании Circulation Research и Salk провели новое исследование, которое доказывает, что COVID-19 может быть также сосудистым заболеванием, а не только респираторным заболеванием. Ученые создали «псевдовирус», окруженный белками-шипами SARS-CoV-2, но без какого-либо настоящего вируса. А псевдовирус привел к повреждению легких и артерий животных моделей. Оно показывает, что спайковый белок SARS-CoV-2 сам по себе может вызывать сосудистые заболевания и может объяснить некоторых пациентов с Covid-19, перенесших инсульты или другие сосудистые проблемы в других частях человеческого тела одновременно. Команда воспроизвела этот процесс, устранив способность вируса к репликации, и снова продемонстрировала такое же повреждающее воздействие на сосудистые клетки. [78] [79]

Дезинформация

Во время пандемии COVID-19 на платформах социальных сетей распространялась дезинформация против вакцинации о COVID-19, связанная с ролью белка-шипа в вакцинах против COVID-19 . Утверждалось, что спайковые белки являются опасными « цитотоксичными », и мРНК-вакцины, содержащие их, поэтому опасны сами по себе. Спайковые белки не являются цитотоксичными или опасными. [80] [81] Несмотря на то, что исследования показали, что спайковые белки вызывают амилоидную болезнь, связанную с свертыванием крови и фибринолитическими нарушениями, а также неврологические и сердечные проблемы. [ нужно отредактировать копию ] [82] Утверждалось также, что спайковые белки «выделяются» вакцинированными людьми, что является ошибочным намеком на феномен вызванного вакцинацией выделения вируса , что является редким эффектом вакцин с живыми вирусами, в отличие от тех, которые используются для вакцинации. COVID-19. «Отпадение» белков-шипов невозможно. [83] [84]

Эволюция, сохранение и рекомбинация

Считается , что слитые белки класса I , группа, хорошо охарактеризованные примеры которой включают в себя шиповый белок коронавируса, гемагглютинин вируса гриппа и Gp41 ВИЧ , эволюционно родственны. [7] [85] Область S2 белка-шипа, ответственная за слияние мембран, более консервативна , чем область S1, ответственная за взаимодействия с рецепторами. [4] [5] [7] Регион S1, похоже, подвергся значительному диверсифицирующему отбору . [86]

В регионе S1 N-концевой домен (NTD) более консервативен, чем C-концевой домен (CTD). [7] Складка галектин -подобного белка NTD предполагает связь со структурно сходными клеточными белками, из которых он, возможно, развился посредством захвата гена от хозяина. [7] Было высказано предположение, что CTD мог возникнуть из NTD в результате дупликации генов . [7] Положение CTD на поверхности, уязвимое для иммунной системы хозяина , может поставить эту область под высокое селективное давление . [7] Сравнение структур различных CTD коронавирусов позволяет предположить, что они могут находиться в стадии диверсифицированного отбора [87] , а в некоторых случаях отдаленно родственные коронавирусы, которые используют один и тот же рецептор клеточной поверхности, могут делать это посредством конвергентной эволюции . [14]

Рекомендации

  1. ^ Солодовников, Алексей; Архипова Валерия (29 июля 2021 г.). «Достоверно красиво: как мы сделали 3D-модель SARS-CoV-2». Н+1. Архивировано из оригинала 30 июля 2021 года . Проверено 30 июля 2021 г.
  2. ^ abcdefg Дэн, X .; Бейкер, Южная Каролина (2021). «Коронавирусы: молекулярная биология (Coronaviridae)». Энциклопедия вирусологии : 198–207. дои : 10.1016/B978-0-12-814515-9.02550-9 . ISBN 9780128145166.
  3. ^ abc Masters, Пол С. (2006). «Молекулярная биология коронавирусов». Достижения в области исследования вирусов . 66 : 193–292. дои : 10.1016/S0065-3527(06)66005-3. ISBN 9780120398690. ПМК  7112330 . ПМИД  16877062.
  4. ^ abcdefghijklmnop Ван, Юхан; Грюневальд, Мэтью; Перлман, Стэнли (2020). «Коронавирусы: обновленный обзор их репликации и патогенеза». Коронавирусы . Методы молекулярной биологии. Том. 2203. стр. 1–29. дои : 10.1007/978-1-0716-0900-2_1. ISBN 978-1-0716-0899-9. ПМЦ  7682345 . ПМИД  32833200.
  5. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz аа Чжу, Чаоген; Он, Гуйюнь; Инь, Циньцинь; Цзэн, Линь; Да, Сянли; Ши, Юнчжун; Сюй, Вэй (14 июня 2021 г.). «Молекулярная биология шиповидного белка SARs-CoV-2: обзор современных знаний». Журнал медицинской вирусологии . 93 (10): 5729–5741. дои : 10.1002/jmv.27132 . ПМК 8427004 . ПМИД  34125455. 
  6. ^ «Вирусология: Коронавирусы». Природа . 220 (5168): 650. Ноябрь 1968 г. Бибкод : 1968Natur.220..650.. doi :10.1038/220650b0. ПМК 7086490 . 
  7. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag Ли, Фанг (29 сентября 2016 г.). «Структура, функции и эволюция шиповых белков коронавируса». Ежегодный обзор вирусологии . 3 (1): 237–261. doi : 10.1146/annurev-virology-110615-042301. ПМЦ 5457962 . ПМИД  27578435. 
  8. ^ abcdefghijklmn Милле, Жан Каору; Уиттакер, Гэри Р. (апрель 2018 г.). «Физиологические и молекулярные триггеры слияния мембран SARS-CoV и проникновения в клетки-хозяева». Вирусология . 517 : 3–8. doi :10.1016/j.virol.2017.12.015. ПМК 7112017 . ПМИД  29275820. 
  9. ^ abcdefghijklmn Вьковски, Филипп; Кратцель, Анника; Штайнер, Сильвио; Сталдер, Ханспетер; Тиль, Волкер (март 2021 г.). «Биология и репликация коронавируса: последствия для SARS-CoV-2». Обзоры природы Микробиология . 19 (3): 155–170. дои : 10.1038/s41579-020-00468-6. ПМЦ 7592455 . ПМИД  33116300. 
  10. ^ аб Фланаган, Кэти Л.; С уважением, Эмма; Кроуфорд, Найджел В.; Джайлз, Мишель; Койрала, Арчана; Макартни, Кристина; Рассел, Фиона; Тех, Бенджамин В.; Вэнь, Софи Ч. (2 октября 2020 г.). «Прогресс и подводные камни в поисках эффективных вакцин против SARS-CoV-2 (COVID-19)». Границы в иммунологии . 11 : 579250. дои : 10.3389/fimmu.2020.579250 . hdl : 11343/251733 . ПМЦ 7566192 . ПМИД  33123165. 
  11. ^ Аб Ле, Тунг Тхань; Крамер, Якоб П.; Чен, Роберт; Мэйхью, Стивен (октябрь 2020 г.). «Эволюция ландшафта разработки вакцин против COVID-19». Nature Reviews Открытие лекарств . 19 (10): 667–668. дои : 10.1038/d41573-020-00151-8 . PMID  32887942. S2CID  221503034.
  12. ^ аб Кириакидис, Николаос К.; Лопес-Кортес, Андрес; Гонсалес, Эдуардо Васконес; Гримальдос, Алехандра Баррето; Прадо, Эстебан Ортис (декабрь 2021 г.). «Стратегии вакцин против SARS-CoV-2: всесторонний обзор кандидатов фазы 3». НПЖ Вакцины . 6 (1): 28. дои : 10.1038/s41541-021-00292-w. ПМК 7900244 . ПМИД  33619260. 
  13. ^ аб Ропп, Дэниел; Ван, Няньшуан; Корбетт, Кизмекия С.; Голдсмит, Джори А.; Се, Чинг-Лин; Абиона, Олубукола; Грэм, Барни С.; Маклеллан, Джейсон С. (13 марта 2020 г.). «Крио-ЭМ структура всплеска 2019-nCoV в префузионной конформации». Наука . 367 (6483): 1260–1263. Бибкод : 2020Sci...367.1260W. doi : 10.1126/science.abb2507. ПМЦ 7164637 . ПМИД  32075877. 
  14. ^ аб Халсвит, RJG; де Хаан, CAM; Бош, Б.-Ж. (2016). «Коронавирусный пик белка и изменения тропизма». Достижения в области исследования вирусов . 96 : 29–57. doi :10.1016/bs.aivir.2016.08.004. ISBN 9780128047361. ПМЦ  7112277 . ПМИД  27712627.
  15. ↑ Циммер, Карл (9 октября 2020 г.). «Коронавирус раскрыт». Нью-Йорк Таймс . Проверено 12 августа 2021 г.
  16. ^ аб Казалино, Лоренцо; Гайеб, Зид; Голдсмит, Джори А.; Хьёрт, Кристи К.; Доммер, Эбигейл К.; Харбисон, Аойф М.; Фогарти, Карл А.; Баррос, Эмилия П.; Тейлор, Брин С.; Маклеллан, Джейсон С.; Фадда, Элиза; Амаро, Ромми Э. (28 октября 2020 г.). «Помимо защиты: роль гликанов в белке шипов SARS-CoV-2». Центральная научная служба ACS . 6 (10): 1722–1734. doi : 10.1021/accentsci.0c01056. ПМЦ 7523240 . ПМИД  33140034. 
  17. ^ Шаджахан, Асиф; Супекар, Нитин Т; Глейнич, Энн С; Азади, Парастоо (9 декабря 2020 г.). «Определение профиля N- и O-гликозилирования шиповидного белка нового коронавируса SARS-CoV-2». Гликобиология . 30 (12): 981–988. doi : 10.1093/гликоб/cwaa042. ПМК 7239183 . ПМИД  32363391. 
  18. ^ abcd Удзике, Макото; Тагучи, Фумихиро (3 апреля 2015 г.). «Включение шиповых и мембранных гликопротеинов в вирионы коронавируса». Вирусы . 7 (4): 1700–1725. дои : 10.3390/v7041700 . ПМЦ 4411675 . ПМИД  25855243. 
  19. ^ Уоллс, Александра К.; Пак Ён-Джун; Торторичи, М. Алехандра; Уолл, Эбигейл; Макгуайр, Эндрю Т.; Вислер, Дэвид (апрель 2020 г.). «Структура, функция и антигенность спайкового гликопротеина SARS-CoV-2». Клетка . 181 (2): 281–292.e6. doi :10.1016/j.cell.2020.02.058. ПМЦ 7102599 . ПМИД  32155444. 
  20. ^ аб Кляйн, Штеффен; Кортезе, Мирко; Зима, Софи Л.; Ваксмут-Мельм, Мориц; Нойфельдт, Кристофер Дж.; Серикан, Берати; Станифер, Меган Л.; Булан, Стив; Бартеншлагер, Ральф; Хланда, Петр (декабрь 2020 г.). «Структура и репликация SARS-CoV-2, охарактеризованная с помощью криоэлектронной томографии in situ». Природные коммуникации . 11 (1): 5885. Бибкод : 2020NatCo..11.5885K. дои : 10.1038/s41467-020-19619-7. ПМЦ 7676268 . ПМИД  33208793. 
  21. ^ Цай, Юнфэй; Чжан, Цзюнь; Сяо, Тяньшу; Пэн, Ханцинь; Стерлинг, Сара М.; Уолш, Ричард М.; Роусон, Шон; Риц-Воллох, София; Чен, Бин (25 сентября 2020 г.). «Различные конформационные состояния шиповидного белка SARS-CoV-2». Наука . 369 (6511): 1586–1592. Бибкод : 2020Sci...369.1586C. doi : 10.1126/science.abd4251. ПМЦ 7464562 . ПМИД  32694201. 
  22. ^ аб Бозон, Бертран; Легрос, Винсент; Чжоу, Бинцзе; Сирет, Эглантин; Матье, Сирил; Коссе, Франсуа-Лоик; Лавиллетт, Дмитрий; Денолли, Солен (январь 2021 г.). «Белки оболочки и мембраны SARS-CoV-2 модулируют созревание и удержание белка-шипа, обеспечивая сборку вирусоподобных частиц». Журнал биологической химии . 296 : 100111. doi : 10.1074/jbc.RA120.016175 . ПМЦ 7833635 . ПМИД  33229438. 
  23. ^ Гудселл, Дэвид С.; Фойгт, Мария; Зардецки, Кристина; Берли, Стивен К. (6 августа 2020 г.). «Интегративная иллюстрация работы с коронавирусом». ПЛОС Биология . 18 (8): e3000815. дои : 10.1371/journal.pbio.3000815 . ПМЦ 7433897 . ПМИД  32760062. 
  24. ^ аб Нойман, Бенджамин В.; Поцелуй, Габриэлла; Кундинг, Андреас Х.; Бхелла, Дэвид; Бакш, М. Фазиль; Коннелли, Стивен; Дроз, Бен; Клаус, Джозеф П.; Макино, Синдзи; Савицкий, Стэнли Г.; Сидделл, Стюарт Г.; Стаму, Димитриос Г.; Уилсон, Ян А.; Кун, Питер; Бухмайер, Майкл Дж. (апрель 2011 г.). «Структурный анализ белка М в сборке и морфологии коронавируса». Журнал структурной биологии . 174 (1): 11–22. дои : 10.1016/j.jsb.2010.11.021. ПМК 4486061 . ПМИД  21130884. 
  25. ^ Кэ, Цзуньлун; Отон, Хоакин; Цюй, Кун; Кортезе, Мирко; Зила, Войтех; Маккин, Лесли; Накане, Таканори; Живанов, Ясенко; Нойфельдт, Кристофер Дж.; Серикан, Берати; Лу, Джон М.; Пеукес, Джулия; Сюн, Сяоли; Краусслих, Ханс-Георг; Шерес, Сьорс Х.В.; Бартеншлагер, Ральф; Бриггс, Джон А.Г. (17 декабря 2020 г.). «Структура и распределение шиповых белков SARS-CoV-2 на интактных вирионах». Природа . 588 (7838): 498–502. Бибкод : 2020Natur.588..498K. дои : 10.1038/s41586-020-2665-2. ПМК 7116492 . ПМИД  32805734. 
  26. ^ Аб Лим, Ивонн; Нг, Ян; Тэм, Джеймс; Лю, Дин (25 июля 2016 г.). «Коронавирусы человека: обзор взаимодействия вируса и хозяина». Болезни . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . ПМЦ 5456285 . ПМИД  28933406. 
  27. ^ Варриккьо, Ромуальдо; Де Симона, Джованна; Вита, Джан Марко; Ночера Кариола, Уолтер; Вискарди, Маурицио; Брэнди, Серджио; Пикацио, Херардо; Зербато, Верена; Конкан, Рафаэлла; Сегат, Людовика; Ди Белла, Стефано; Фуско, Джованна; Асенци, Паоло; ди Маси, Алессандра (2024). «Человеческий сывороточный альбумин связывает спайковый белок и защищает клетки от инфекции SARS-CoV-2, модулируя путь RAS». Аспекты молекулярной медицины . 3 : 100033. doi : 10.1016/j.amolm.2023.100033 .
  28. ^ Йегер, Кертис Л.; Ашмун, Ричард А.; Уильямс, Ричард К.; Карделличио, Кристина Б.; Шапиро, Линда Х.; Смотри, А. Томас; Холмс, Кэтрин В. (июнь 1992 г.). «Человеческая аминопептидаза N является рецептором человеческого коронавируса 229E». Природа . 357 (6377): 420–422. Бибкод : 1992Natur.357..420Y. дои : 10.1038/357420a0. ПМК 7095410 . ПМИД  1350662. 
  29. ^ Хофманн, Х.; Пирк, К.; ван дер Хук, Л.; Гейер, М.; Берхаут, Б.; Полманн, С. (31 мая 2005 г.). «Человеческий коронавирус NL63 использует рецептор коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома для проникновения в клетку». Труды Национальной академии наук . 102 (22): 7988–7993. Бибкод : 2005PNAS..102.7988H. дои : 10.1073/pnas.0409465102 . ПМЦ 1142358 . ПМИД  15897467. 
  30. ^ Хуан, Синчуань; Донг, Вэньцзюань; Милевская, Александра; Голда, Анна; Ци, Юнхэ; Чжу, Цюань К.; Мараско, Уэйн А.; Барик, Ральф С.; Симс, Эми К.; Пирц, Кшиштоф; Ли, Вэньхуэй; Суй, Цзяньхуа (15 июля 2015 г.). «Протеин шипа HKU1 человеческого коронавируса использует O-ацетилированную сиаловую кислоту в качестве детерминанты рецептора прикрепления и использует белок гемагглютинин-эстеразы в качестве фермента, разрушающего рецептор». Журнал вирусологии . 89 (14): 7202–7213. дои : 10.1128/JVI.00854-15. ПМЦ 4473545 . ПМИД  25926653. 
  31. ^ Кюнкель, Франк; Херрлер, Георг (июль 1993 г.). «Структурный и функциональный анализ поверхностного белка коронавируса человека OC43». Вирусология . 195 (1): 195–202. дои : 10.1006/виро.1993.1360. ПМК 7130786 . ПМИД  8317096. 
  32. ^ Радж, В. Сталин; Моу, Хуэйхуэй; Смитс, Саския Л.; Деккерс, Дик Х.В.; Мюллер, Марсель А.; Дейкман, Рональд; Мут, Дорин; Деммерс, Йерун А.А.; Заки, Али; Фушье, Рон AM; Тиль, Волкер; Дростен, Кристиан; Ротье, Питер Дж. М.; Остерхаус, Альберт ДМЕ; Босх, Беренд Ян; Хаагманс, Барт Л. (март 2013 г.). «Дипептидилпептидаза 4 является функциональным рецептором нового человеческого коронавируса-EMC». Природа . 495 (7440): 251–254. Бибкод :2013Natur.495..251R. дои : 10.1038/nature12005. ПМК 7095326 . ПМИД  23486063. 
  33. ^ Ли, Вэньхуэй; Мур, Майкл Дж.; Васильева, Наталья; Суй, Цзяньхуа; Вонг, Суи Ки; Берн, Майкл А.; Сомасундаран, Мохан; Салливан, Джон Л.; Лузуриага, Кэтрин; Гриноф, Томас К.; Чхве, Хёрён; Фарзан, Майкл (ноябрь 2003 г.). «Ангиотензинпревращающий фермент 2 является функциональным рецептором коронавируса SARS». Природа . 426 (6965): 450–454. Бибкод : 2003Natur.426..450L. дои : 10.1038/nature02145. ПМК 7095016 . ПМИД  14647384. 
  34. ^ Аб Джексон CB, Фарзан М, Чен Б, Чой Х (2022). «Механизмы проникновения SARS-CoV-2 в клетки». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 23 (1): 3–20. дои : 10.1038/s41580-021-00418-x. ПМЦ 8491763 . ПМИД  34611326. 
  35. ^ Уоллс, Александра К.; Сюн, Сяоли; Пак Ён-Джун; Торторичи, М. Алехандра; Снейдер, Йост; Киспе, Джоэл; Камерони, Элизабетта; Гопал, Робин; Дай, Миан; Ланзавеккья, Антонио; Замбон, Мария; Рей, Феликс А.; Корти, Давиде; Вислер, Дэвид (февраль 2019 г.). «Неожиданная функциональная мимикрия рецептора объясняет активацию слияния коронавируса». Клетка . 176 (5): 1026–1039.e15. дои : 10.1016/j.cell.2018.12.028. ПМК 6751136 . ПМИД  30712865. 
  36. ^ Фань, Сяои; Цао, Дуаньфан; Конг, Линфэй; Чжан, Синьчжэн (декабрь 2020 г.). «Крио-ЭМ-анализ постслитой структуры гликопротеина шипа SARS-CoV». Природные коммуникации . 11 (1): 3618. Бибкод : 2020NatCo..11.3618F. дои : 10.1038/s41467-020-17371-6. ПМЦ 7367865 . ПМИД  32681106. 
  37. ^ abc Уайт, Джудит М.; Уиттакер, Гэри Р. (июнь 2016 г.). «Слияние вирусов с оболочкой в ​​эндосомах». Трафик . 17 (6): 593–614. дои : 10.1111/tra.12389. ПМЦ 4866878 . ПМИД  26935856. 
  38. ^ Белузард, Сандрин; Милле, Жан К.; Лицитра, Бет Н.; Уиттакер, Гэри Р. (20 июня 2012 г.). «Механизмы проникновения в клетку коронавируса, опосредованные вирусным спайковым белком». Вирусы . 4 (6): 1011–1033. дои : 10.3390/v4061011 . ПМЦ 3397359 . ПМИД  22816037. 
  39. ^ аб Бухризер, Джулиан; Дюфло, Жереми; Юбер, Матье; Монель, Бландин; Планас, Дельфина; Раджа, Мааран Майкл; Планше, Сирил; Порро, Франсуаза; Гивель-Бенассин, Флоренция; Ван дер Верф, Сильви; Казартелли, Николетта; Муке, Гюго; Брюэль, Тимоти; Шварц, Оливье (декабрь 2020 г.). «Образование синцитиев клетками, инфицированными SARS-CoV-2». Журнал ЭМБО . 39 (23): e106267. дои : 10.15252/embj.2020106267. ПМК 7646020 . ПМИД  33051876. 
  40. ^ Чжан, Чжэнжун; Чжэн, Ю; Ню, Цзубяо; Чжан, Бо; Ван, Чэньси; Яо, Сяохун; Пэн, Хаоран; Франка, Дель Нонно; Ван, Юньюнь; Чжу, Ичао; Су, Ян; Тан, Мэн; Цзян, Сяои; Рен, Он; Он, Мэйфан; Ван, Юци; Гао, Лихуа; Чжао, Пин; Ши, Ханпин; Чен, Чжаоли; Ван, Сяонин; Пьячентини, Мауро; Бянь, Сюу; Мелино, Джерри; Лю, Лян; Хуан, Хунъянь; Сунь, Цян (20 апреля 2021 г.). «Белок-шип SARS-CoV-2 диктует опосредованную синцитием элиминацию лимфоцитов». Смерть клеток и дифференциация . 28 (9): 2765–2777. дои : 10.1038/s41418-021-00782-3. ПМК 8056997 . ПМИД  33879858. 
  41. ^ Брага, Лука; Али, Хашим; Секко, Илария; Кьяваччи, Елена; Невес, Гильерме; Голдхилл, Дэниел; Пенн, Ребекка; Хименес-Гуарденьо, Хосе М.; Ортега-Прието, Ана М.; Буссани, Россана; Канната, Антонио; Риццари, Джорджия; Коллези, Кьяра; Шнайдер, Эдоардо; Арозио, Даниэле; Шах, Аджай М.; Барклай, Венди С.; Малим, Майкл Х.; Бурроне, Хуан; Джакка, Мауро (3 июня 2021 г.). «Препараты, которые ингибируют белки TMEM16, блокируют синцитии, индуцированные шипами SARS-CoV-2». Природа . 594 (7861): 88–93. Бибкод : 2021Natur.594...88B. дои : 10.1038/s41586-021-03491-6 . ПМК 7611055 . ПМИД  33827113. 
  42. ^ Линь, Лянъюй; Ли, Цин; Ван, Ин; Ши, Юфан (июнь 2021 г.). «Образование синцитий во время инфекции легких SARS-CoV-2: катастрофическое единство для уничтожения лимфоцитов». Смерть клеток и дифференциация . 28 (6): 2019–2021. дои : 10.1038/s41418-021-00795-y. ПМЦ 8114657 . ПМИД  33981020. 
  43. ^ abcd Хо, Митчелл (апрель 2020 г.). «Перспективы разработки нейтрализующих антител против SARS-CoV-2». Терапия антителами . 3 (2): 109–114. дои : 10.1093/abt/tbaa009. ISSN  2516-4236. ПМК 7291920 . ПМИД  32566896. 
  44. ^ Ян, Лайфэй; Лю, Вэйхан; Ю, Синь; Ву, Мэн; Райхерт, Дженис М.; Хо, Митчелл (июль 2020 г.). «Отслеживание терапевтических антител к COVID-19: глобальная онлайн-база данных о терапевтических препаратах на основе антител для профилактики и лечения COVID-19». Терапия антителами . 3 (3): 205–212. дои : 10.1093/abt/tbaa020. ISSN  2516-4236. ПМЦ 7454247 . ПМИД  33215063. 
  45. ^ Премкумар, Лакшманане; Сеговия-Чумбез, Бруно; Джади, Рамеш; Мартинес, Дэвид Р.; Раут, Раджендра; Маркманн, Алена; Корнаби, Калеб; Бартельт, Лютер; Вайс, Сьюзен; Парк, Яра; Эдвардс, Кейтлин Э.; Веймер, Эрик; Шерер, Эрин М.; Руфаэль, Надин; Эдупуганти, Шрилатха; Вайскопф, Даниэла; Цзе, Лунпин В.; Хоу, Исюань Дж.; Марголис, Дэвид; Сетте, Алессандро; Коллинз, Мэтью Х.; Шмитц, Джон; Барик, Ральф С.; де Сильва, Аравинда М. (11 июня 2020 г.). «Рецептор-связывающий домен вирусного шипового белка является иммунодоминантной и высокоспецифичной мишенью антител у пациентов с SARS-CoV-2». Наука Иммунология . 5 (48): eabc8413. doi : 10.1126/sciimmunol.abc8413. ПМЦ 7292505 . ПМИД  32527802. 
  46. ^ abcde Харви, Уильям Т.; Карабелли, Алессандро М.; Джексон, Бен; Гупта, Равиндра К.; Томсон, Эмма С.; Харрисон, Юэн М.; Ладден, Кэтрин; Рив, Ричард; Рамбо, Эндрю; Пикок, Шэрон Дж.; Робертсон, Дэвид Л. (июль 2021 г.). «Варианты SARS-CoV-2, шиповые мутации и ускользание от иммунитета». Обзоры природы Микробиология . 19 (7): 409–424. дои : 10.1038/s41579-021-00573-0. ПМЦ 8167834 . ПМИД  34075212. 
  47. ^ Хонг, Джессика; Квон, Хён Джун; Качау, Рауль; Чен, Кэтрин З.; Бутай, Кевин Джон; Дуань, Чжицзянь; Ли, Дэн; Рен, Хуа; Лян, Тяньючжоу; Чжу, Цзянхай; Дэнди, Венката П.; Мартин, Негин П.; Эспозито, Доминик; Ортега-Родригес, Уриэль; Сюй, Мяо (3 мая 2022 г.). «Нанотела одногорбого верблюда в целом нейтрализуют варианты SARS-CoV-2». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 119 (18): e2201433119. Бибкод : 2022PNAS..11901433H. дои : 10.1073/pnas.2201433119 . ISSN  1091-6490. ПМК 9170159 . ПМИД  35476528. 
  48. ^ Баффингтон, Джесси; Дуань, Чжицзянь; Квон, Хён Джун; Хонг, Джессика; Ли, Дэн; Фэн, Минцянь; Се, Ханг; Хо, Митчелл (июнь 2023 г.). «Идентификация однодоменных антител VNAR акулы-няньки, нацеленных на субъединицу шипа S2 SARS-CoV-2». Журнал ФАСЭБ . 37 (6): e22973. дои : 10.1096/fj.202202099RR . ISSN  1530-6860. ПМЦ 10715488 . PMID  37191949. S2CID  258717083. 
  49. ↑ Фаучи, Энтони С. (9 апреля 2021 г.). «История создания вакцин против COVID-19». Наука . 372 (6538): 109. Бибкод : 2021Sci...372..109F. дои : 10.1126/science.abi8397. PMID  33833099. S2CID  233186026.
  50. ^ Кениг, Поль-Альбер; Шмидт, Флориан И. (17 июня 2021 г.). «Spike D614G — кандидатный вакцинный антиген против Covid-19». Медицинский журнал Новой Англии . 384 (24): 2349–2351. дои : 10.1056/NEJMcibr2106054 . ПМИД  34133867.
  51. ^ Йонкер, Лаэль М.; Суонк, Зоя; Барч, Янник К.; Бернс, Мадлен Д.; Кейн, Эбигейл; Борибонг, Бриттани П.; Дэвис, Джеймсон П.; Луазель, Мэгги; Новак, Таня; Сенусси, Ясмин; Ченг, Чи-Ань; Берджесс, Элеонора; Эдлоу, Андреа Г.; Чоу, Джанет; Дионн, Одри; Балагуру, Дурайсами; Лахуд-Раме, Мануэлла; Ардити, Моше; Юлг, Борис; Рэндольф, Адриенн Г.; Альтер, Галит ; Фазано, Алессио; Уолт, Дэвид Р. (4 января 2023 г.). «Циркулирующий спайковый белок, обнаруженный при миокардите мРНК вакцины после COVID-19». Тираж . 147 (11): 867–876. doi : 10.1161/CIRCULATIONAHA.122.061025. ПМЦ 10010667 . PMID  36597886. S2CID  255475007. Обширное определение профиля антител и Т-клеточные реакции у лиц, у которых развился поствакцинальный миокардит, по существу не отличались от таковых у вакцинированных контрольных субъектов, [...] Примечательным открытием было то, что заметно повышены уровни полноразмерного шипового белка. (33,9±22,4 пг/мл), несвязанные антителами, были обнаружены в плазме лиц с поствакцинальным миокардитом, [...] (непарный t-критерий; P<0,0001). 
  52. ^ Хансен, Джоанна; Баум, Алина; Паскаль, Кристен Э.; Руссо, Винченцо; Джордано, Стефани; Влога, Эльжбета; Фултон, Бенджамин О.; Ян, Ин; Кун, Катрина; Патель, Крунал; Чунг, Кён Мин; Германн, Айнур; Ульман, Эрика; Круз, Джонатан; Рафик, Ашике; Хуанг, Тэмми; Фэрхерст, Жанетт; Либертини, Кристен; Мальбек, морской пехотинец; Ли, Вэнь-и; Валлийский, Ричард; Фарр, Глен; Пеннингтон, Сет; Дешпанде, Дипали; Ченг, Джемми; Уотти, Анке; Буффар, Паскаль; Бэбб, Роберт; Левенкова, Наташа; Чен, Кальвин; Чжан, Боцзе; Ромеро Эрнандес, Аннабель; Саотоме, Кей; Чжоу, И; Франклин, Мэтью; Шивапаласингам, Сумати; Лай, Дэвид Чиен; Уэстон, Стюарт; Лог, Джеймс; Хаупт, Роберт; Фриман, Мэтью; Чен, Банда; Олсон, Уильям; Мерфи, Эндрю Дж.; Шталь, Нил; Янкопулос, Джордж Д.; Кирацус, Христос А. (21 августа 2020 г.). «Исследования на гуманизированных мышах и выздоравливающих людях позволили получить коктейль антител к SARS-CoV-2». Наука . 369 (6506): 1010–1014. Бибкод : 2020Sci...369.1010H. doi : 10.1126/science.abd0827. ПМК 7299284 . ПМИД  32540901. 
  53. ^ ab «Терапевтическое лечение негоспитализированных взрослых с COVID-19». Рекомендации по лечению Covid-19 . Национальные институты здоровья. Архивировано из оригинала 4 декабря 2021 года . Проверено 11 августа 2021 г.
  54. ^ «Этесевимаб». Руководство IUPHAR/BPS по фармакологии . Проверено 10 февраля 2021 г.
  55. ^ «Лилли объявляет о соглашении с правительством США на поставку 300 000 флаконов исследовательского нейтрализующего антитела бамланивимаба (LY-CoV555) в целях борьбы с COVID-19» . Эли Лилли и компания (пресс-релиз). 28 октября 2020 г.
  56. ^ «Инъекция казиривимаба, раствор, концентрат. Инъекция имдевимаба, раствор, концентрат REGEN-COV- казиривимаб и набор имдевимаба» . ДейлиМед . Проверено 18 марта 2021 г.
  57. ^ «Сотровимаб для инъекций, раствор, концентрат» . ДейлиМед . Проверено 15 июня 2021 г.
  58. ^ Аб Кояма, Такахико; Платт, Дэниел; Парида, Лакшми (1 июля 2020 г.). «Вариантный анализ геномов SARS-CoV-2». Бюллетень Всемирной организации здравоохранения . 98 (7): 495–504. дои : 10.2471/BLT.20.253591. ПМЦ 7375210 . ПМИД  32742035. 
  59. ^ аб Вингер, Анна; Каспари, Томас (27 мая 2021 г.). «Всплеск беспокойства — новые варианты SARS-CoV-2». Вирусы . 13 (6): 1002. дои : 10.3390/v13061002 . ПМК 8229995 . ПМИД  34071984. 
  60. ^ Сапутри, Дианита С.; Ли, Сунлин; ван Эрден, Флорис Дж.; Розевицкий, Джон; Сюй, Цзычан; Исманто, Хендра С.; Давила, Ана; Терагути, Сюнсукэ; Като, Казутака; Стэндли, Дарон М. (17 сентября 2020 г.). «Гибкий, функциональный и знакомый: характеристики эволюции шиповидного белка SARS-CoV-2». Границы микробиологии . 11 : 2112. дои : 10.3389/fmicb.2020.02112 . ПМК 7527407 . ПМИД  33042039. 
  61. ^ Кальяни, Рэйчел; Форни, Диего; Клеричи, Марио; Сирони, Мануэла (июнь 2020 г.). «Вычислительный вывод отбора, лежащего в основе эволюции нового коронавируса, коронавируса 2 тяжелого острого респираторного синдрома». Журнал вирусологии . 94 (12): e00411-20. дои : 10.1128/JVI.00411-20. ПМК 7307108 . ПМИД  32238584. 
  62. ^ Изабель, Сандра; Гранья-Миралья, Люсия; Гутьеррес, Джахир М.; Бундалович-Торма, Чедолюб; Гроувс, Хелен Э.; Изабель, Марк Р.; Эшаги, АлиРеза; Патель, Самир Н.; Губбей, Джонатан Б.; Путанен, Томи; Гуттман, Дэвид С.; Путанен, Сьюзен М. (декабрь 2020 г.). «Эволюционный и структурный анализ мутации шиповидного белка SARS-CoV-2 D614G теперь документирован во всем мире». Научные отчеты . 10 (1): 14031. Бибкод : 2020NatSR..1014031I. doi : 10.1038/s41598-020-70827-z. ПМЦ 7441380 . ПМИД  32820179. 
  63. ^ Корбер, Бетт; Фишер, Уилл М.; Гнанакаран, Сандрасегарам; Юн, Хеджин; Тайлер, Джеймс; Абфальтерер, Вернер; Хенгартнер, Ник; Георгий, Елена Евгеньевна; Бхаттачарья, Танмой; Фоли, Брайан; Хасти, Кэтрин М.; Паркер, Мэтью Д.; Партридж, Дэвид Г.; Эванс, Кариад М.; Фриман, Тимоти М.; де Сильва, Тушан И.; МакДэнал, Шарлин; Перес, Лаутаро Г.; Тан, Хайли; Лунный Уокер, Алекс; Уилан, Шон П.; ЛаБранш, Селия К.; Сапфир, Эрика О.; Монтефиори, Дэвид К.; Ангьял, Адриенн; Браун, Ребекка Л.; Каррилеро, Лаура; Грин, Люк Р.; Гроувс, Даниэль С.; Джонсон, Кэти Дж.; Кили, Александр Дж.; Линдси, Бенджамин Б.; Парсонс, Пол Дж.; Раза, Мохаммед; Роуленд-Джонс, Сара; Смит, Никки; Такер, Рэйчел М.; Ван, Деннис; Уайлс, Мэтью Д. (август 2020 г.). «Отслеживание изменений в пике SARS-CoV-2: доказательства того, что D614G увеличивает инфекционность вируса COVID-19». Клетка . 182 (4): 812–827.e19. doi :10.1016/j.cell.2020.06.043. ПМЦ 7332439 . ПМИД  32697968. 
  64. ^ Чжан, Личжоу; Джексон, Коди Б.; Моу, Хуэйхуэй; Оджа, Амрита; Пэн, Хайюн; Куинлан, Брайан Д.; Рангараджан, Эрумби С.; Пан, Энди; Вандерхайден, Эбигейл; Сутар, Мехул С.; Ли, Вэньхуэй; Изард, Тина; Рейдер, Кристоф; Фарзан, Майкл; Чхве, Хёрён (декабрь 2020 г.). «Мутация белка-шипа SARS-CoV-2 D614G увеличивает плотность и инфекционность вириона». Природные коммуникации . 11 (1): 6013. Бибкод : 2020NatCo..11.6013Z. дои : 10.1038/s41467-020-19808-4. ПМЦ 7693302 . ПМИД  33243994. 
  65. ^ Джексон, Коди Б.; Чжан, Личжоу; Фарзан, Майкл; Чхве, Херён (январь 2021 г.). «Функциональная значимость мутации D614G в белке-шипе SARS-CoV-2». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 538 : 108–115. дои : 10.1016/j.bbrc.2020.11.026. ПМЦ 7664360 . ПМИД  33220921. 
  66. ^ Маколи, Александр Дж. (октябрь 2020 г.). «Экспериментальные данные и данные in silico показывают, что на вакцины вряд ли повлияет мутация D614G в белке-шипе SARS-CoV-2». НПЖ Вакцины . 5 : 96. дои : 10.1038/s41541-020-00246-8. ПМК 7546614 . ПМИД  33083031. 
  67. ^ Лю, Ян (ноябрь 2021 г.). «Замена N501Y Spike усиливает заражение и передачу SARS-CoV-2». Природа . 602 (7896): 294–299. дои : 10.1038/s41586-021-04245-0. ПМК 8900207 . PMID  34818667. S2CID  244647259. 
  68. ^ Абдул Карим, СС (2021). «Новые варианты SARS-CoV-2 — последствия для клинического применения, общественного здравоохранения и вакцин». Медицинский журнал Новой Англии . 384 (19): 1866–1868. doi : 10.1056/NEJMc2100362. ПМЦ 8008749 . ПМИД  33761203. 
  69. ^ Койпер, Майкл (2021). «Но Маус, ты не одинок: о некоторых вариантах тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2, заражающих мышей». Журнал ИЛАР . 62 (1–2): 48–59. doi : 10.1093/ilar/ilab031. ПМЦ 9236659 . ПМИД  35022734. 
  70. ^ Бартон, Майкл I; Макгоуэн, Стюарт А; Кутузов Михаил А; Душек, Омер; Бартон, Джеффри Джон; ван дер Мерве, П. Антон (26 августа 2021 г.). Фушье, Рон AM; Ван дер Меер, Йос В.; Фушье, Рон А.М. (ред.). «Влияние распространенных мутаций в SARS-CoV-2 Spike RBD и его лиганде, рецепторе ACE2 человека, на аффинность связывания и кинетику». электронная жизнь . 10 : е70658. дои : 10.7554/eLife.70658 . ISSN  2050-084X. ПМЦ 8480977 . ПМИД  34435953. 
  71. ^ Макгоуэн, Стюарт А.; Бартон, Майкл И.; Кутузов Михаил; Душек, Омер; Мерве, П. Антон ван дер; Бартон, Джеффри Дж. (2 марта 2022 г.). «Миссенс-варианты человеческого ACE2 сильно влияют на связывание со спайком SARS-CoV-2, обеспечивая механизм опосредованного ACE2 генетического риска при Covid-19: тематическое исследование по прогнозированию аффинности вариантов интерфейса». PLOS Вычислительная биология . 18 (3): e1009922. Бибкод : 2022PLSCB..18E9922M. дои : 10.1371/journal.pcbi.1009922 . ISSN  1553-7358. ПМЦ 8920257 . ПМИД  35235558. 
  72. ^ Каллауэй, Юэн (2021). «Мутация, которая помогает Дельте распространяться со скоростью лесного пожара». Природа . 596 (7873): 472–473. Бибкод : 2021Natur.596..472C. дои : 10.1038/d41586-021-02275-2. PMID  34417582. S2CID  237254466.
  73. ^ Павлин, TP (2021). «Варианты SARS-CoV-2, связанные с инфекциями в Индии, B.1.617, демонстрируют усиленное расщепление Спайка фурином» (PDF) . биоRxiv . дои : 10.1101/2021.05.28.446163. S2CID  235249387.
  74. ^ «Классификация Омикрона (B.1.1.529): вызывающий беспокойство вариант SARS-CoV-2» . Всемирная организация здравоохранения . 26 ноября 2021 года. Архивировано из оригинала 26 ноября 2021 года . Проверено 26 ноября 2021 г.
  75. ↑ Браун К.А., Губбай Дж., Хопкинс Дж., Патель С., Бьюкен С.А., Дейнман Н., Гоно Л.В. (25 мая 2021 г.). «Неспособность целевого S-гена как маркер варианта B.1.1.7 среди изолятов SARS-CoV-2 в районе Большого Торонто, с декабря 2020 г. по март 2021 г.». ДЖАМА . 325 (20): 2115–2116. дои : 10.1001/jama.2021.5607. ISSN  0098-7484. ПМК 8033504 . ПМИД  33830171. 
  76. ^ Методы обнаружения и идентификации вариантов SARS-CoV-2 (Технический отчет). Стокгольм и Копенгаген: Европейский центр профилактики и контроля заболеваний/Европейское региональное бюро Всемирной организации здравоохранения. 3 марта 2021 г. Диагностический скрининг известных ЛОС.
  77. ^ Варианты SARS-CoV-2, вызывающие беспокойство, и варианты, находящиеся на стадии расследования в Англии. Вариант, вызывающий беспокойство: Omicron, VOC21NOV-01 (B.1.1.529), технический брифинг 30 (PDF) (Брифинг). Общественное здравоохранение Англии. 3 декабря 2021 г. GOV-10547. Архивировано (PDF) из оригинала 11 декабря 2021 года . Проверено 15 декабря 2021 г.
  78. ^ «Протеин-шип нового коронавируса играет дополнительную ключевую роль в заболевании» . Исследователи Солка. 30 апреля 2021 года. Архивировано из оригинала 1 декабря 2022 года.
  79. ^ Лей, Юян; Чжан, Цзяо; Скьявон, Кара Р.; Он, Мин; Чен, Лили; Шен, Хуэй; Чжан, Ичи; Инь, Цянь; Чо, Ёситаке; Андраде, Леонардо; Шадель, Джеральд С.; Хепокоски, Марк; Лей, Тинг; Ван, Хунлян; Чжан, Цзинь; Юань, Джейсон X.-J.; Малхотра, Атул; Поместье, Ури; Ван, Шэнпэн; Юань, Цзу-И; Шай, Джон YJ. (31 марта 2021 г.). «Белок-шип SARS-CoV-2 нарушает функцию эндотелия за счет снижения уровня АПФ 2». Исследование кровообращения . 128 (9). Журналы AHA: 1323–1326. doi : 10.1161/CIRCRESAHA.121.318902. ПМК 8091897 . PMID  33784827. S2CID  232430540. 
  80. ^ «Вакцины против COVID-19 не являются« цитотоксичными »» (проверка фактов). Рейтер. 18 июня 2021 г.
  81. ↑ Горский Д.Х. (24 мая 2021 г.). «Смертельный» белок-шип коронавируса (по мнению антипрививочников)». Научная медицина .
  82. ^ Нистрем, Софи; Хаммарстрем, Пер (2022). «Амилоидогенез шиповидного белка SARS-CoV-2». Журнал Американского химического общества . 144 (20): 8945–8950. doi : 10.1021/jacs.2c03925. ПМЦ 9136918 . ПМИД  35579205. 
  83. ↑ Маккарти Б (5 мая 2021 г.). «Разоблачение антипрививочного обмана о« выделении вакцины »». ПолитиФакт . Проверено 11 мая 2021 г.
  84. ↑ Фиоре К (29 апреля 2021 г.). «Последний миф против вакцинации:« выделение вакцины »». МедПейдж сегодня . Проверено 11 мая 2021 г.
  85. ^ Вэнс, Тайлер Д.Р.; Ли, Джеффри Э. (июль 2020 г.). «Суперсемейства фузогенов вирусов и эукариот». Современная биология . 30 (13): 750–754 рэндов. Бибкод : 2020CBio...30.R750V. дои : 10.1016/j.cub.2020.05.029. ПМЦ 7336913 . ПМИД  32634411. 
  86. ↑ Ли, Ф. (1 марта 2012 г.). «Доказательства общего эволюционного происхождения субъединиц, связывающих рецепторы шиповидного белка коронавируса». Журнал вирусологии . 86 (5): 2856–2858. дои : 10.1128/jvi.06882-11. ПМЦ 3302248 . ПМИД  22205743. 
  87. ^ Шан, Цзянь; Чжэн, Юань; Ян, Ян; Лю, Чанг; Гэн, Цибинь; Ло, Чумин; Чжан, Вэй; Ли, Фанг (23 апреля 2018 г.). «Крио-ЭМ структура шиповидного белка коронавируса инфекционного бронхита раскрывает структурную и функциональную эволюцию шиповидных белков коронавируса». ПЛОС Патогены . 14 (4): e1007009. дои : 10.1371/journal.ppat.1007009 . ПМЦ 5933801 . ПМИД  29684066. 

Внешние ссылки