stringtranslate.com

Гаплогруппа C-M130

Гаплогруппа C — это основная гаплогруппа Y-хромосомы , определяемая UEPs M130/RPS4Y 711 , P184, P255 и P260, которые все являются мутациями SNP . Это одна из двух основных ветвей гаплогруппы CF наряду с гаплогруппой F. Гаплогруппа C встречается у древних популяций на всех континентах, кроме Африки, и является преобладающей гаплогруппой Y-ДНК среди мужчин, принадлежащих ко многим народам, коренным народам Восточной Азии , Центральной Азии , Сибири , Северной Америки и Австралии , а также у некоторых популяций в Европе . Левант , а позднее Япония . [1]

Гаплогруппа также встречается с умеренной и низкой частотой среди многих современных популяций Юго-Восточной Азии , Южной Азии и Юго-Западной Азии .

Помимо базальной парагруппы C*, эта гаплогруппа теперь имеет две основные ветви: C1 (F3393/Z1426; ранее CxC3, т.е. старый C1, старый C2, старый C4, старый C5 и старый C6) и C2 (M217; бывший C3). ).

Происхождение

Гаплогруппа C-M130, вероятно, возникла в результате исхода современных людей из Африки , которые распространились на восток из Юго-Западной Азии и постепенно колонизировали Южную Азию, Восточную Азию и Океанию. Исследования относительно того, как произошла эта миграция, разделились; большинство исследований поддерживают Северный путь через Сибирь, в то время как другие поддерживают гипотезу Южного пути, согласно которой носители гаплогруппы C мигрировали вдоль побережий Индии и Юго-Восточной Азии, чтобы добраться до Китая. [2]

Гаплогруппа C-M130, по-видимому, возникла вскоре после того, как впервые произошла мутация SNP M168, что привело к появлению современной гаплогруппы CT , от которой произошли гаплогруппа CF и, в свою очередь, гаплогруппа C. Это было, вероятно, по крайней мере 60 000 лет назад.

Гаплогруппа C-M130 достигает наибольшей частоты среди коренного населения Казахстана , Монголии , Дальнего Востока России , Полинезии , некоторых групп Австралии , а также умеренной частоты у коренного населения Кореи и маньчжуров . Поэтому предполагается, что гаплогруппа C-M130 либо возникла, либо прошла самый длительный период эволюции в регионе Большой Центральной Азии или в регионах Юго-Восточной Азии. Предполагается, что его распространение в Восточной Азии началось примерно 40 000 лет назад. [2]

Считается, что самцы, несущие C-M130, мигрировали в Америку около 6000–8000 лет назад и были занесены народами, говорящими на языке на-дене, на северо-западное тихоокеанское побережье Северной Америки .

Азия также является территорией, в которой сосредоточена гаплогруппа D-M174 . Однако D-M174 более тесно связан с гаплогруппой E, чем с C-M130, а географическое распространение гаплогрупп C-M130 и D-M174 полностью и совершенно различно, причем различные подтипы гаплогруппы C-M130 встречаются с высокой частотой среди современные казахи и монголы , а также у некоторых коренных народов Америки , маньчжуры . Он также встречается со средней частотой у корейцев , коренных жителей Дальнего Востока России , некоторых групп австралийских аборигенов и с умеренной частотой в других местах по всей Азии и Океании. Носители гаплогруппы C среди более позднего народа Дзёмон в Японии и некоторых европейцев эпохи палеолита и неолита несли C1a, C1b и C1a2. Тогда как гаплогруппа D встречается с высокими частотами только среди тибетцев, японцев и жителей Андаманских островов и не обнаружена ни в Индии, ни среди коренных жителей Америки или Океании. [1]

По мнению Сакитани и др., гаплогруппа C-M130 возникла в Центральной Азии и распространилась оттуда в другие части Евразии и в части Австралии. Предполагается, что С-М130 был обнаружен у охотников-собирателей Восточной Евразии , а также в древних образцах Восточной и Юго-Восточной Азии и Европы. [1]

Состав

С* (M130/Страница51/RPS4Y711, M216)

(Приведенная выше филогенетическая структура субкладов гаплогруппы C-M130 основана на дереве ISOGG 2015, дереве YCC 2008 и последующих опубликованных исследованиях. [7] [8] ).

Распределение

Прогнозируемое пространственное распределение частот гаплогруппы C в Восточной Азии. [9]

Распространение гаплогруппы C-M130 обычно ограничивается населением Сибири, некоторых частей Восточной Азии, Океании и Америки . Из-за огромного возраста гаплогруппы C успели накопиться многочисленные вторичные мутации, и было идентифицировано множество регионально важных подветвей гаплогруппы C-M130.

По данным исследования 2015 года, до 46% австралийских аборигенов -мужчин несли базальный C* (C-M130*), C1b2b* (C-M347*) или C1b2b1 (C-M210) до контакта с европейцами и значительной иммиграции со стороны европейцев. Нэгл и др. [10] То есть 20,0% Y-хромосом 657 современных людей, до этого 56% этих выборок были исключены как «некоренные». До колонизации C-M130*, по-видимому, носили до 2,7% мужчин-аборигенов; 43% имели C-M347, который не был обнаружен за пределами Австралии. Остальные гаплогруппы аборигенов Австралии сходны с папуасами и другими негритосами ( гаплогруппы S-M230 и M-P256 ). [10] [11]

Низкие уровни C-M130* переносят самцы:

Базальный C1a* (CTS11043) был обнаружен у европейцев верхнего палеолита ( ориньякцев ), GoyetQ116-1 и Pestera Muerii2. [13]

C1b был идентифицирован в доисторических останках, датируемых 34 000 лет назад, найденных в России и известных как « Костенки 14 ». [14]

Когда-то считалось, что гаплогруппа C2 (M217) — самая многочисленная и широко распространенная линия C — возникла в Центральной Азии , распространилась оттуда в Северную Азию и Америку, в то время как по другой теории она возникла из Восточной Азии. [7] C-M217 простирается в продольном направлении от Центральной Европы и Турции до народа вайу в Колумбии и Венесуэле , а в широтном направлении от атабаскских народов Аляски до Вьетнама и Малайского архипелага . Встречается в небольших концентрациях в Восточной Европе , где может быть наследием вторжений/миграций гуннов , тюрков и /или монголов в средние века. Особенно часто встречается у бурятов , дауров , хазарейцев , ительменов , калмыков , коряков , маньчжуров , монголов , орокенцев и сибесов , с умеренным распространением среди других тунгусских народов , корейцев , айнов , нивхов , алтайцев , тувинцев , узбеков , ханьских китайцев. , Туцзя , Хани и Хуэй . [15] [16] [17] [18] [19] [20] [21] Самые высокие частоты гаплогруппы C-M217 встречаются среди населения Монголии и Дальнего Востока России , где она является модальной гаплогруппой. Гаплогруппа C-M217 — единственная разновидность гаплогруппы C-M130, встречающаяся среди коренных американцев , среди которых она достигает наибольшей частоты в популяциях На-Дене .

Другие субклады специфичны для определенных популяций в пределах ограниченного географического ареала; даже там, где эти другие ветви встречаются, они имеют тенденцию проявляться как очень низкочастотный, второстепенный компонент палитры разнообразия Y-хромосомы на этих территориях:

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

Известные участники

Один конкретный гаплотип в гаплогруппе C-M217 привлек большое внимание из-за возможности того, что он может представлять прямое отцовское происхождение от Чингисхана .

Опубликованная в 2017 году исследовательская статья «Генетический след ранних миграций Айсин Гиоро, императорского дома династии Цин» [42] подтвердила, что клан Айсин Гиоро принадлежит к гаплогруппе C3b1a3a2-F8951, братской ветви C3*-Star. Кластер (в настоящее время называемый C3b1a3a1-F3796, когда-то связанный с Чингисханом ).

Смотрите также

Генетика

Субклады Y-ДНК C

Основополагающее дерево Y-ДНК

Рекомендации

  1. ^ abcd 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』（勉誠出版 2009年） (на японском языке)
  2. ^ abcdefgh Чжун Х, Ши Х, Ци XB и др. (июль 2010 г.). «Глобальное распространение гаплогруппы Y-хромосомы C-M130 раскрывает доисторические маршруты миграции африканцев и раннего расселения в Восточной Азии». Дж. Хум. Жене . 55 (7): 428–35. дои : 10.1038/jhg.2010.40 . ПМИД  20448651.
  3. ^ «В настоящее время большая часть археологических и генетических данных подтверждает, что самый ранний исход африканцев произошел из Африки через Красное море, а затем быстро мигрировал в материковую часть Юго-Восточной Азии через береговую линию Индии и в конечном итоге достиг Океании.36, 37, 38, 39 Недавний анализ Y-хромосомы и митохондриальной ДНК в Австралии и Новой Гвинее показал, что Hg C, вероятно, является одним из самых ранних типов-основателей за пределами Африки,12 что также было предложено в другом исследовании6, и что линии митохондриальной ДНК, состоящие из типы-основатели (M и N) датируются приблизительно 50–70 годами тыс. лет назад.12" ... "Мы предполагаем, что Hg C возникла в результате исхода из Африки и постепенно колонизировала Южную Азию, Юго-Восточную Азию, Океанию и Восточную Азию одним Палеолитическая миграция из Африки в Азию и Океанию, произошедшая более 40 тыс. лет назад».
  4. ^ "ISOGG 2018 Гаплогруппа C Y-ДНК" .
  5. ^ abc Тумонггор, Мерианн К; Карафет Татьяна М; Дауни, Шон; и другие. (2014). «Изоляция, контакты и социальное поведение сформировали генетическое разнообразие в Западном Тиморе». Журнал генетики человека . 59 (9): 1–10. дои : 10.1038/jhg.2014.62. ПМК 4521296 . ПМИД  25078354. 
  6. ^ Аб Шейнфельдт, Л.; Фридлендер, Ф; Фридлендер, Дж; Лэтэм, К; Коки, Г; Карафет, Т; Хаммер, М; Лоренц, Дж (2006). «Неожиданная хромосомная вариация NRY на Северном острове Меланезия». Молекулярная биология и эволюция . 23 (8): 1628–41. дои : 10.1093/molbev/msl028 . ПМИД  16754639.
  7. ^ abcdefgh ISOGG, 2015 «Гаплогруппа C Y-ДНК и ее субклады - 2015» (15 сентября 2015 г.).
  8. ^ Карафет ТМ, Мендес Флорида, Мейлерман МБ, Андерхилл П.А., Зегура С.Л., Хаммер М.Ф. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои :10.1101/гр.7172008. ПМК 2336805 . ПМИД  18385274. 
  9. ^ Ван, CC; Ли, Х (2013). «Выводы об истории человечества в Восточной Азии на основе Y-хромосом». Расследование Жене . 4 (1): 11. дои : 10.1186/2041-2223-4-11 . ПМЦ 3687582 . ПМИД  23731529. 
  10. ^ аб Нэгл, Н.; и другие. (2015). «Древность и разнообразие Y-хромосом аборигенов Австралии». Американский журнал физической антропологии . 159 (3): 367–81. дои : 10.1002/ajpa.22886. PMID  26515539. S2CID  2225529.
  11. ^ Худжашов Г., Кивисилд Т., Андерхилл П.А. и др. (май 2007 г.). «Выявление доисторического поселения Австралии с помощью Y-хромосомы и анализа мтДНК». Учеб. Натл. акад. наук. США . 104 (21): 8726–30. Бибкод : 2007PNAS..104.8726H. дои : 10.1073/pnas.0702928104 . ПМК 1885570 . ПМИД  17496137. 
  12. ^ Cognoms Catalans, без даты, Результат (15 сентября 2015 г.). (Проект Cognoms Catalans, который исследует «генетические фамилии» в Каталонии, Валенсии и на Балеарских островах, базируется в Университете Помпеу Фабра в Барселоне.)
  13. ^ Фу, К.; Пост, К.; Хайдиняк, М.; Петр, М.; Маллик, С.; Фернандес, Д.; Фуртвенглер, А.; Хаак, В.; Мейер, М.; Миттник, А.; Никель, Б.; Пельтцер, А.; Роланд, Н.; Слон, В.; Таламо, С.; Лазаридис, И.; Липсон, М.; Мэтисон, И.; Шиффельс, С.; Скоглунд, П.; Деревянко А.П.; Дроздов Н.; Славинский В.; Цыбанков А.; Кремонези, РГ; Маллени, Ф.; Жели, Б.; Вакка, Э.; Гонсалес Моралес, MR; и другие. (2016). «Генетическая история Европы ледникового периода». Природа . 534 (7606): 200–205. Бибкод : 2016Natur.534..200F. дои : 10.1038/nature17993. ПМЦ 4943878 . ПМИД  27135931. 
  14. ^ Сеген-Орландо, А.; и другие. (2014). «Геномная структура европейцев насчитывает не менее 36 200 лет» (PDF) . Наука . 346 (6213): 1113–1118. Бибкод : 2014Sci...346.1113S. дои : 10.1126/science.aaa0114. PMID  25378462. S2CID  206632421. Архивировано из оригинала (PDF) 29 августа 2016 г.
  15. ^ Аб Сюэ Ю, Зержал Т, Бао В и др. (апрель 2006 г.). «Мужская демография в Восточной Азии: контраст между севером и югом во времени роста населения». Генетика . 172 (4): 2431–9. дои : 10.1534/генетика.105.054270. ПМЦ 1456369 . ПМИД  16489223. 
  16. ^ abc Hammer MF, Karafet TM, Park H и др. (2006). «Двойное происхождение японцев: общая основа для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров». Дж. Хум. Жене . 51 (1): 47–58. дои : 10.1007/s10038-005-0322-0 . ПМИД  16328082.
  17. ^ Тадзима, Ацуши; Хаями, Масанори; Токунага, Кацуши; Джуджи, Т; Мацуо, М; Марзуки, С; Омото, К; Хорай, С. (2004). «Генетическое происхождение айнов, выведенное на основе комбинированного анализа ДНК материнской и отцовской линии». Журнал генетики человека . 49 (4): 187–193. дои : 10.1007/s10038-004-0131-x . ПМИД  14997363.
  18. ^ abcd Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р. и др. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения Y-хромосомы в Индии с высоким разрешением определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411. ПМК 1380230 . ПМИД  16400607. 
  19. ^ аб Лелль Дж.Т., Сукерник Р.И., Стариковская Ю.Б. и др. (январь 2002 г.). «Двойное происхождение и сибирское сходство Y-хромосом коренных американцев». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 70 (1): 192–206. дои : 10.1086/338457. ПМЦ 384887 . ПМИД  11731934. 
  20. ^ Уэллс Р.С., Юлдашева Н., Рузибакиев Р. и др. (август 2001 г.). «Центр Евразии: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (18): 10244–9. Бибкод : 2001PNAS...9810244W. дои : 10.1073/pnas.171305098 . ПМК 56946 . ПМИД  11526236. 
  21. ^ Насидзе И., Куинке Д., Дюпанлуп И., Кордо Р., Кокшунова Л., Стоункинг М. (декабрь 2005 г.). «Генетические доказательства монгольского происхождения калмыков». Являюсь. Дж. Физ. Антрополь . 128 (4): 846–54. дои : 10.1002/ajpa.20159. PMID  16028228. S2CID  27115596.
  22. ^ Скоццари Р., Массая А., Д'Атанасио Э., Майрес Н.М., Перего Ю.А. и др. (2012). «Молекулярное рассечение базальных клад филогенетического дерева Y-хромосомы человека». ПЛОС ОДИН . 7 (11): e49170. Бибкод : 2012PLoSO...749170S. дои : 10.1371/journal.pone.0049170 . ПМЦ 3492319 . ПМИД  23145109. 
  23. ^ «Блог антропологии Диенекеса: коричневый, голубоглазый, европейский охотник-собиратель с Y-гаплогруппой C из Испании (Olalde et al. 2014)» . 26 января 2014 г.
  24. ^ http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/02/10/013433.full.pdf [ пустой URL-адрес PDF ]
  25. ^ Фу, Цяомэй; и другие. (2016). «Генетическая история Европы ледникового периода». Природа . 534 (7606): 200–5. Бибкод : 2016Natur.534..200F. дои : 10.1038/nature17993. ПМЦ 4943878 . ПМИД  27135931. 
  26. ^ abc Гайден, Тензин; Каденас, Алисия М.; Регейро, Мария; Сингх, Северная Каролина; Животовский, Л.А.; Андерхилл, Пенсильвания; Кавалли-Сфорца, LL; Эррера, Р.Дж. (2007). «Гималаи как направленный барьер на пути потока генов». Американский журнал генетики человека . 80 (5): 884–894. дои : 10.1086/516757. ПМЦ 1852741 . ПМИД  17436243. 
  27. ^ аб Форнарино, Симона; Пала, Мария; Батталья, Винченца; и другие. (2009). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие Таруса (Непал): резервуар генетических вариаций». Эволюционная биология BMC . 9 (1): 154. Бибкод : 2009BMCEE...9..154F. дои : 10.1186/1471-2148-9-154 . ПМК 2720951 . ПМИД  19573232. 
  28. ^ аб Каденас, Алисия М; Животовский Лев А; Кавалли-Сфорца, Лука Л; Андерхилл, Пенсильвания; Эррера, Р.Дж. (2008). «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив». Европейский журнал генетики человека . 16 (3): 374–386. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . ПМИД  17928816.
  29. ^ аб Абу-Амеро, Халед К; Хеллани, Али; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М; Андерхилл, Питер А. (2009). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с близлежащими регионами». БМК Генетика . 10:59 . дои : 10.1186/1471-2156-10-59 . ПМК 2759955 . ПМИД  19772609. 
  30. ^ Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, МФ (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои :10.1101/гр.7172008. ПМК 2336805 . ПМИД  18385274. 
  31. ^ Кокс MP, Redd AJ, Karafet TM и др. (октябрь 2007 г.). «Полинезийский мотив на Y-хромосоме: структура населения в отдаленной Океании». Хм. Биол . 79 (5): 525–35. дои : 10.1353/hub.2008.0004. hdl : 1808/13585 . PMID  18478968. S2CID  4834817.
  32. ^ Андерхилл П.А., Шен П., Лин А.А. и др. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Нат. Жене . 26 (3): 358–61. дои : 10.1038/81685. PMID  11062480. S2CID  12893406.
  33. ^ Зегура С.Л., Карафет ТМ, Животовский Л.А., Хаммер М.Ф. (январь 2004 г.). «SNP высокого разрешения и микросателлитные гаплотипы указывают на единственное недавнее проникновение Y-хромосом коренных американцев в Америку». Мол. Биол. Эвол . 21 (1): 164–75. дои : 10.1093/molbev/msh009 . ПМИД  14595095.
  34. ^ Пакендорф Б, Новгородов И.Н., Осаковский В.Л., Данилова А.П., Протодьаконов А.П., Стоункинг М. (октябрь 2006 г.). «Исследование последствий доисторических миграций в Сибири: генетическая изменчивость и происхождение якутов». Хм. Жене . 120 (3): 334–53. дои : 10.1007/s00439-006-0213-2. PMID  16845541. S2CID  31651899.
  35. ^ Харьков В.Н., Степанов В.А., Медведев О.Ф. и др. (2008). «[Происхождение якутов: анализ гаплотипов Y-хромосомы]». Мол. Биол. (Моск.) (на русском языке). 42 (2): 226–37. ПМИД  18610830.
  36. ^ abc Борис Малярчук, Мирослава Деренко, Галина Денисова и др. , «Филогеография гаплогруппы С Y-хромосомы в Северной Евразии». Анналы генетики человека (2010) 74 539–546. doi: 10.1111/j.1469-1809.2010.00601.x.
  37. ^ Манфред Кайзер, Силке Брауэр, Ришар Кордо и др. (2006), «Меланезийское и азиатское происхождение полинезийцев: градиенты мтДНК и Y-хромосомы в Тихом океане». Мол. Биол. Эвол. 23(11):2234–2244. doi:10.1093/molbev/msl093
  38. ^ Мона, Стефано; Грунц, Катарина Э.; Брауэр, Силке; и другие. (2009). «История генетических примесей Восточной Индонезии, выявленная с помощью анализа Y-хромосомы и митохондриальной ДНК». Мол. Биол. Эвол . 26 (8): 1865–1877. дои : 10.1093/molbev/msp097 . ПМИД  19414523.
  39. ^ Карафет Татьяна М.; Отличительный Брайан; Кокс Мюррей П.; и другие. (2010). «Основное разделение Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии». Мол. Биол. Эвол . 27 (8): 1833–1844. дои : 10.1093/molbev/msq063 . PMID  20207712. S2CID  4819475.
  40. ^ JD Cristofaro et al., 2013, «Афганский Гиндукуш: где сходятся потоки генов на евразийском субконтиненте», http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0076748
  41. ^ ab Wang CC, Wang LX, Shrestha R, Zhang M, Huang XY и др. (2014), «Генетическая структура цянских популяций, проживающих в Западном Сычуаньском коридоре». PLoS ONE 9(8): e103772. doi:10.1371/journal.pone.0103772
  42. ^ Вэй, Лан-Хай; Ян, Ши; Ю, Ге; Хуан, Юн-Чжи; Яо, Да-Ли; Ли, Ши-Лин; Джин, Ли; Ли, Хуэй (2017). «Генетический след ранних миграций Айсин Гиоро, императорского дома династии Цин». Джей Хум Жене . 62 (62 марта (3)): 407–411. дои : 10.1038/jhg.2016.142. PMID  27853133. S2CID  7685248.

Источники таблиц преобразования

Внешние ссылки

Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой C Y-ДНК .