stringtranslate.com

Филум

LifeDomainKingdomPhylumClassOrderFamilyGenusSpecies
Иерархия восьми основных таксономических рангов биологической классификации . Царство содержит один или несколько типов. Промежуточные второстепенные ранги не показаны.

В биологии филум ( / ˈ f aɪ l əm / ; мн. ч. : phyla ) — уровень классификации или таксономического ранга ниже царства и выше класса . Традиционно в ботанике термин « разделение» использовался вместо «филума», хотя Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений принимает эти термины как эквивалентные. [1] [2] [3] В зависимости от определений, царство животных Animalia содержит около 31 типа, царство растений Plantae содержит около 14 типов, а царство грибов Fungi содержит около 8 типов. Текущие исследования в области филогенетики раскрывают связи между типами в пределах более крупных клад, таких как Ecdysozoa и Embryophyta .

Общее описание

Термин «филюм» был придуман в 1866 году Эрнстом Геккелем от греческого слова phylon ( φῦλον , «раса, род»), связанного с phyle ( φυλή , «племя, клан»). [4] [5] Геккель отмечал, что виды постоянно эволюционировали в новые виды, которые, казалось, сохраняли мало постоянных черт между собой и, следовательно, мало черт, которые отличали их как группу («самодостаточное единство»): «возможно, таким реальным и полностью самодостаточным единством является совокупность всех видов, которые постепенно эволюционировали из одной и той же общей исходной формы, как, например, все позвоночные. Мы называем эту совокупность [a] Stamm [т. е. род] ( Phylon )». [a] В таксономии растений Август В. Эйхлер (1883) классифицировал растения на пять групп, называемых подразделениями, термин, который используется и сегодня для групп растений, водорослей и грибов. [1] [6] Определения зоологических типов изменились по сравнению с их истоками в шести классах Линнея и четырех ветвях Жоржа Кювье . [7]

Неформально, филумы можно рассматривать как группировки организмов, основанные на общей специализации плана тела . [8] В самом базовом смысле филум можно определить двумя способами: как группу организмов с определенной степенью морфологического или онтогенетического сходства ( фенетическое определение) или как группу организмов с определенной степенью эволюционного родства ( филогенетическое определение). [9] Попытка определить уровень иерархии Линнея без ссылки на (эволюционное) родство неудовлетворительна, но фенетическое определение полезно при рассмотрении вопросов морфологического характера, таких как насколько успешными были различные планы тела. [ необходима цитата ]

Определение, основанное на генетическом родстве

Самая важная объективная мера в приведенных выше определениях — это «определенная степень», которая определяет, как разные организмы должны быть членами разных филумов. Минимальное требование заключается в том, что все организмы в филуме должны быть явно более тесно связаны друг с другом, чем с любой другой группой. [9] Даже это проблематично, поскольку требование зависит от знания взаимоотношений организмов: по мере того, как становится доступно больше данных, особенно из молекулярных исследований, мы лучше можем определять взаимоотношения между группами. Таким образом, филумы могут быть объединены или разделены, если становится очевидным, что они связаны друг с другом или нет. Например, бородатые черви были описаны как новый филум (Pogonophora) в середине 20-го века, но молекулярные исследования почти полвека спустя обнаружили, что они являются группой кольчатых червей , поэтому филумы были объединены (бородатые черви теперь являются семейством кольчатых червей ). [10] С другой стороны, высокопаразитический тип Mesozoa был разделен на два типа ( Orthonectida и Rhombozoa ), когда было обнаружено, что Orthonectida, вероятно, являются вторичноротыми , а Rhombozoa — первичноротыми . [11]

Эта изменчивость типов привела к тому, что некоторые биологи призвали отказаться от концепции типа в пользу размещения таксонов в кладах без какого-либо формального ранжирования размера группы. [9]

Определение, основанное на плане тела

Определение типа, основанное на плане тела, было предложено палеонтологами Грэмом Баддом и Сёреном Йенсеном (как это сделал Геккель столетием ранее). Определение было предложено, потому что вымершие организмы труднее всего классифицировать: они могут быть ответвлениями, которые отделились от линии типа до того, как были приобретены все признаки, определяющие современный тип. По определению Бадда и Йенсена, тип определяется набором признаков, общих для всех его ныне живущих представителей.

Этот подход приносит некоторые небольшие проблемы — например, предковые признаки, общие для большинства членов типа, могли быть утеряны некоторыми членами. Кроме того, это определение основано на произвольной точке времени: настоящем. Однако, поскольку оно основано на признаках, его легко применить к ископаемой летописи. Более серьезная проблема заключается в том, что оно опирается на субъективное решение о том, какие группы организмов следует считать типами.

Подход полезен, поскольку он позволяет легко классифицировать вымершие организмы как « стволовые группы » по филам, с которыми они имеют наибольшее сходство, основываясь только на таксономически важных сходствах. [9] Однако доказать, что ископаемое принадлежит к коронной группе филума, сложно, поскольку оно должно демонстрировать характер, уникальный для подмножества коронной группы. [9] Более того, организмы в стволовой группе филума могут обладать «планом тела» филума без всех характеристик, необходимых для попадания в него. Это ослабляет идею о том, что каждый из филумов представляет собой отдельный план тела. [12]

На классификацию, использующую это определение, может сильно повлиять случайное выживание редких групп, что может сделать тип гораздо более разнообразным, чем он был бы в противном случае. [13]

Известные типы

Животные

Общее количество оценивается; цифры разных авторов сильно различаются, не в последнюю очередь потому, что некоторые основаны на описанных видах, [14] некоторые на экстраполяции на количество неописанных видов. Например, было описано около 25 000–27 000 видов нематод, в то время как опубликованные оценки общего количества видов нематод включают 10 000–20 000; 500 000; 10 миллионов; и 100 миллионов. [15]

Растения

Царство Plantae определяется разными биологами по-разному (см. Текущие определения Plantae ). Все определения включают живые эмбриофиты (наземные растения), к которым можно добавить два отдела зеленых водорослей, Chlorophyta и Charophyta , чтобы сформировать кладу Viridiplantae . Таблица ниже следует влиятельной (хотя и спорной) системе Кавальера-Смита в приравнивании «Plantae» к Archaeplastida , [21] группе, содержащей Viridiplantae и водорослевые отделы Rhodophyta и Glaucophyta .

Определение и классификация растений на уровне отдела также различаются от источника к источнику и постепенно менялись в последние годы. Так, некоторые источники помещают хвощи в отдел Arthrophyta, а папоротники в отдел Monilophyta, [22], в то время как другие помещают их оба в Monilophyta, как показано ниже. Отдел Pinophyta может использоваться для всех голосеменных (т. е. включая саговники, гинкговые и гнетофиты), [23] или только для хвойных, как показано ниже.

С момента первой публикации системы APG в 1998 году, которая предложила классификацию покрытосеменных вплоть до уровня порядков , многие источники предпочли рассматривать ранги выше порядков как неформальные клады. Там, где были предоставлены формальные ранги, традиционные подразделения, перечисленные ниже, были сокращены до гораздо более низкого уровня, например, подклассов . [24]

Грибы

Филум Microsporidia обычно включается в царство Fungi, хотя его точные связи остаются неопределенными, [44] и он считается простейшим Международным обществом протистологов [45] (см. Protista, ниже). Молекулярный анализ Zygomycota показал, что он полифилетический (его члены не имеют общего непосредственного предка), [46] что многие биологи считают нежелательным. Соответственно, есть предложение отменить тип Zygomycota. Его члены будут разделены между типом Glomeromycota и четырьмя новыми подтипами incertae sedis (неопределенного размещения): Entomophthoromycotina , Kickxellomycotina , Mucoromycotina и Zoopagomycotina . [44]

Протисты

Царство Protista (или Protoctista) включено в традиционную модель пяти или шести царств, где его можно определить как содержащее всех эукариот , которые не являются растениями, животными или грибами. [16] : 120  Protista — это парафилетический таксон, [47] который менее приемлем для современных биологов, чем в прошлом. Были сделаны предложения разделить его между несколькими новыми царствами, такими как Protozoa и Chromista в системе Кавалье-Смита . [48]

Таксономия протистов долгое время была нестабильной, [49] с различными подходами и определениями, что привело к появлению множества конкурирующих схем классификации. Многие из перечисленных ниже типов используются в Catalogue of Life , [50] и соответствуют схеме Protozoa-Chromista, [45] с обновлениями из последней (2022) публикации Кавальер-Смита . [51] Другие типы обычно используются другими авторами и адаптированы из системы, используемой Международным обществом протистологов (ISP). Некоторые описания основаны на пересмотре эукариот 2019 года ISP. [52]

Число типов протистов сильно варьируется от одной классификации к другой. Каталог жизни включает Rhodophyta и Glaucophyta в царство Plantae, [50] но другие системы считают эти типы частью Protista. [71] Кроме того, менее популярные схемы классификации объединяют Ochrophyta и Pseudofungi в один тип, Gyrista , а всех альвеолят, за исключением инфузорий , в один тип Myzozoa , позже пониженный в ранге и включенный в парафилетический тип Miozoa . [51] Даже внутри типа появляются другие ранги на уровне типа, например, случай Bacillariophyta (диатомовые водоросли) в пределах Ochrophyta . Эти различия стали неактуальными после принятия кладистического подхода ISP, где таксономические ранги исключаются из классификаций после того, как считаются излишними и нестабильными. Многие авторы предпочитают такое использование, что приводит к тому, что схема Chromista-Protozoa становится устаревшей. [52]

Бактерии

В настоящее время существует 40 бактериальных типов (не включая « цианобактерии »), которые были опубликованы в соответствии с Бактериологическим кодексом [72].

  1. Abditibacteriota
  2. Acidobacteriota , фенотипически разнообразные и в основном некультивируемые
  3. Актиномицеты , грамположительные виды с высоким содержанием G+C
  4. Aquificota , глубоко разветвленный
  5. Арматимонадота
  6. Атрибактериота
  7. Bacillota , грамположительные виды с низким содержанием G+C, такие как спорообразующие Bacilli (аэробные) и Clostridia (анаэробные)
  8. Бактероидота
  9. Бальнеолота
  10. Bdellovibrionota
  11. Caldisericota , бывший кандидат дивизиона OP5, Caldisericum exile является единственным представителем
  12. Калдитрихота
  13. Кампилобактеро́та
  14. Хламидиоты
  15. Хлоробиота , зеленые серные бактерии
  16. Chloroflexota , зеленые несерные бактерии
  17. Chrysiogenota , только 3 рода ( Chrysiogenes arsenatis , Desulfurispira natronophila , Desulfurispirillum alkaliphilum )
  18. Копротермобактериота
  19. Деферрибактериота
  20. Deinococcota , Deinococcus radiodurans и Thermus aquaticus являются «общеизвестными» видами этого типа.
  21. Диктиогломота
  22. Elusimicrobiota , бывший кандидат на подразделение Thermite Group 1
  23. Фибробактериота
  24. Фузобактериоты
  25. Gemmatimonadota
  26. Игнавибактериота
  27. Киритиматьеллота
  28. Lentisphaerota , ранее клад VadinBE97
  29. Mycoplasmatota , известный род: Mycoplasma
  30. Миксокококки
  31. Нитроспинота
  32. Нитроспирота
  33. Планктомицеты
  34. Pseudomonadota — наиболее известный тип, содержащий такие виды, как Escherichia coli или Pseudomonas aeruginosa.
  35. Родотермота
  36. Spirochaetota , виды включают Borrelia burgdorferi , вызывающую болезнь Лайма.
  37. Синергистота
  38. Термодесульфобактериота
  39. Термомикробиота
  40. Термотогота , глубоко разветвленная
  41. Веррукомикробиота

Археи

В настоящее время существует 2 типа, которые были опубликованы в соответствии с Бактериологическим кодексом [72]

  1. Нитрососферота
  2. Thermoproteota , второй по распространенности тип архей

Другие типы, которые были предложены, но не имеют обоснованных названий, включают:

  1. « Эвриархеоты », наиболее распространенный тип архей
  2. " Корархеота "
  3. « Наноархеоты », сверхмалые симбионты, единственный известный вид

Смотрите также

Примечания

  1. ^ "Wohl aber ist eine solche reale und vollkommen abgeschlossene Einheit die Summe aller Species, welche aus einer und derselbgemeinschaftlichen Stammform allmählig sich entwickelt haben, wie z. B. alle Wirbelthiere. Diese Summe nennen wir Stamm (Phylon)".

Ссылки

  1. ^ ab McNeill, J.; et al., eds. (2012). Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (Мельбурнский кодекс), принятый Восемнадцатым Международным ботаническим конгрессом в Мельбурне, Австралия, июль 2011 г. (электронное издание). Международная ассоциация по таксономии растений. Архивировано из оригинала 10 октября 2020 г. . Получено 14 мая 2017 г. .
  2. ^ "Науки о жизни". Новый словарь культурной грамотности Американского наследия (третье изд.). Компания Houghton Mifflin. 2005. Получено 4 октября 2008. Типы в царстве растений часто называются отделами.
  3. ^ Берг, Линда Р. (2 марта 2007 г.). Введение в ботанику: растения, люди и окружающая среда (2-е изд.). Cengage Learning. стр. 15. ISBN 9780534466695. Получено 23 июля 2012 г.
  4. ↑ Валентайн 2004, стр. 8.
  5. ^ Геккель, Эрнст (1866). Generelle Morphologie der Organismen [ Общая морфология организмов ] (на немецком языке). Том. 1. Берлин, (Германия): Г. Раймер. стр. 28–29.
  6. ^ Наик, В. Н. (1984). Таксономия покрытосеменных. Tata McGraw-Hill. стр. 27. ISBN 9780074517888.
  7. ^ Collins AG, Valentine JW (2001). «Определение типов: эволюционные пути к планам строения тела метазойных животных». Эволюция и развитие . 3 : 432–442. Архивировано из оригинала (PDF) 27 апреля 2020 г. Получено 5 марта 2013 г.
  8. ^ Валентайн, Джеймс У. (2004). О происхождении Phyla . Чикаго: Издательство Чикагского университета. стр. 7. ISBN 978-0-226-84548-7. Классификации организмов в иерархических системах использовались в семнадцатом и восемнадцатом веках. Обычно организмы группировались в соответствии с их морфологическим сходством, как это воспринималось теми ранними исследователями, а затем эти группы группировались в соответствии с их сходством и так далее, чтобы сформировать иерархию.
  9. ^ abcde Budd, GE; Jensen, S. (май 2000 г.). «Критическая переоценка ископаемых фил билатерий». Biological Reviews . 75 (2): 253–295. doi :10.1111/j.1469-185X.1999.tb00046.x. PMID  10881389. S2CID  39772232. Архивировано из оригинала 15 сентября 2019 г. Получено 26 мая 2007 г.
  10. ^ Рауз, Г. В. (2001). «Кладистический анализ Siboglinidae Caullery, 1914 (Polychaeta, Annelida): ранее типы Pogonophora и Vestimentifera». Зоологический журнал Линнеевского общества . 132 (1): 55–80. doi : 10.1006/zjls.2000.0263 .
  11. ^ Pawlowski J, Montoya-Burgos JI, Fahrni JF, Wüest J, Zaninetti L (октябрь 1996 г.). «Происхождение мезозойских животных, выведенное из последовательностей генов 18S рРНК». Молекулярная биология и эволюция . 13 (8): 1128–32. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025675 . PMID  8865666.
  12. ^ Бадд, GE (сентябрь 1998 г.). «Эволюция плана тела членистоногих в кембрии на примере мышц аномалокаридид». Lethaia . 31 (3): 197–210. doi :10.1111/j.1502-3931.1998.tb00508.x.
  13. ^ Бриггс, DEG ; Форти, RA (2005). «Чудесная борьба: систематика, стволовые группы и филогенетический сигнал кембрийской радиации». Палеобиология . 31 (2 (Suppl)): 94–112. doi :10.1666/0094-8373(2005)031[0094:WSSSGA]2.0.CO;2. S2CID  44066226.
  14. ^ abcdefghijkl Чжан, Чжи-Цян (30 августа 2013 г.). "Биоразнообразие животных: обновление классификации и разнообразия в 2013 г. В: Чжан, З.-К. (ред.) Биоразнообразие животных: план высокоуровневой классификации и обзор таксономического богатства (дополнения 2013 г.)". Zootaxa . 3703 (1): 5. doi : 10.11646/zootaxa.3703.1.3 .
  15. ^ Фелдер, Даррил Л.; Кэмп, Дэвид К. (2009). Происхождение, воды и биота Мексиканского залива: биоразнообразие. Texas A&M University Press. стр. 1111. ISBN 978-1-60344-269-5.
  16. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am Маргулис, Линн ; Чепмен, Майкл Дж. (2009). Королевства и домены: Иллюстрированное руководство по типам жизни на Земле (4-е исправленное издание). Лондон: Academic Press. ISBN 9780123736215.
  17. ^ Фельдкамп, С. (2002) Современная биология . Холт, Райнхарт и Уинстон, США. (стр. 725)
  18. ^ Хань, Цзянь; Моррис, Саймон Конвей; Оу, Цян; Шу, Деган; Хуан, Хай (2017). «Вторичноротые мейофауны из базального кембрия Шэньси (Китай)». Nature . 542 (7640): 228–231. Bibcode :2017Natur.542..228H. doi :10.1038/nature21072. ISSN  1476-4687. PMID  28135722. S2CID  353780.
  19. ^ Лю, Юньхуань; Карлайл, Эмили; Чжан, Хуацяо; Ян, Бен; Штайнер, Майкл; Шао, Тецюань; Дуань, Байчуань; Мароне, Федерика; Сяо, Шухай; Донохью, Филипп CJ (17 августа 2022 г.). «Saccorhytus — ранний экдизозой, а не самый ранний дейтеростом». Nature . 609 (7927): 541–546. Bibcode :2022Natur.609..541L. doi :10.1038/s41586-022-05107-z. hdl : 1983/454e7bec-4cd4-4121-933e-abeab69e96c1 . ISSN  1476-4687. PMID  35978194. S2CID  251646316.
  20. ^ Кэннон, Дж. Т.; Веллутини, BC; Смит, Дж.; Ронквист, Ф.; Йонделиус, У.; Хейнол, А. (4 февраля 2016 г.). «Xenacoelomorpha — сестринская группа для Nephrozoa». Nature . 530 (7588): 89–93. Bibcode :2016Natur.530...89C. doi :10.1038/nature16520. PMID  26842059. S2CID  205247296.
  21. ^ ab Кавальер-Смит, Томас (22 июня 2004 г.). «Только шесть царств жизни». Труды: Биологические науки . 271 (1545): 1251–1262. doi :10.1098/rspb.2004.2705. PMC 1691724. PMID  15306349 . 
  22. ^ Маусет 2012, стр. 514, 517.
  23. ^ ab Cronquist, A.; A. Takhtajan; W. Zimmermann (апрель 1966 г.). «О высших таксонах Embryobionta». Taxon . 15 (4): 129–134. doi :10.2307/1217531. JSTOR  1217531.
  24. ^ Чейз, Марк У. и Ревил, Джеймс Л. (октябрь 2009 г.), «Филогенетическая классификация наземных растений, сопровождающая APG III», Ботанический журнал Линнеевского общества , 161 (2): 122–127, doi : 10.1111/j.1095-8339.2009.01002.x
  25. ^ abc Mauseth, James D. (2012). Ботаника: Введение в биологию растений (5-е изд.). Садбери, Массачусетс: Jones and Bartlett Learning. ISBN 978-1-4496-6580-7.стр. 489
  26. ^ Маусет 2012, стр. 540.
  27. ^ Маусет 2012, стр. 542.
  28. ^ Маусет 2012, стр. 543.
  29. ^ Маусет 2012, стр. 509.
  30. ^ Crandall-Stotler, Barbara; Stotler, Raymond E. (2000). "Морфология и классификация Marchantiophyta". В A. Jonathan Shaw; Bernard Goffinet (ред.). Bryophyte Biology . Cambridge: Cambridge University Press. стр. 21. ISBN 978-0-521-66097-6.
  31. ^ Маусет 2012, стр. 535.
  32. ^ Wyatt, T.; Wösten, H.; Dijksterhuis, J. (2013). «Достижения в прикладной микробиологии Глава 2 — Споры грибов для рассеивания в пространстве и времени». Достижения в прикладной микробиологии . 85 : 43–91. doi :10.1016/B978-0-12-407672-3.00002-2. PMID  23942148.
  33. ^ "Классификации грибов | Безграничная биология". courses.lumenlearning.com . Получено 5 мая 2019 г. .
  34. ^ ab "Генетика архей | Безграничная микробиология". courses.lumenlearning.com .
  35. ^ Холт, Джек Р.; Иудика, Карлос А. (1 октября 2016 г.). «Blastocladiomycota». Разнообразие жизни . Университет Саскуэханна . Получено 29 декабря 2016 г.
  36. ^ Холт, Джек Р.; Иудика, Карлос А. (9 января 2014 г.). «Chytridiomycota». Разнообразие жизни . Университет Саскуэханна . Получено 29 декабря 2016 г.
  37. ^ "Chytridiomycota | тип грибов". Encyclopedia Britannica . Получено 5 мая 2019 г.
  38. ^ Макконахи, М. (2014). Физические и химические свойства грибов . doi :10.1016/B978-0-12-801238-3.05231-4. ISBN 9780128012383.
  39. ^ Тейлор, Томас; Крингс, Майкл; Тейлор, Эдит (2015). "Ископаемые грибы. Глава 4 - Хитридиомицеты". Ископаемые грибы : 41–67. doi :10.1016/b978-0-12-387731-4.00004-9.
  40. ^ Холт, Джек Р.; Иудика, Карлос А. (12 марта 2013 г.). «Микроспоридии». Разнообразие жизни . Университет Саскуэханна . Получено 29 декабря 2016 г.
  41. ^ Холт, Джек Р.; Иудика, Карлос А. (23 апреля 2013 г.). "Neocallimastigomycota". Разнообразие жизни . Университет Саскуэханна . Получено 29 декабря 2016 г.
  42. ^ ab "Типы грибов". BiologyWise . 22 мая 2009 г. Получено 5 мая 2019 г.
  43. ^ Ван, Сюэвей; Лю, Синчжун; Гроенвальд, Йоханнес З. (2017). «Филогения анаэробных грибов (филюм Neocallimastigomycota) с участием яков в Китае». Антони ван Левенгук . 110 (1): 87–103. doi :10.1007/s10482-016-0779-1. PMC 5222902. PMID  27734254 . 
  44. ^ ab Hibbett DS, Binder M, Bischoff JF, Blackwell M, Cannon PF, Eriksson OE, et al. (май 2007 г.). "Филогенетическая классификация грибов более высокого уровня" (PDF) . Mycological Research . 111 (Pt 5): 509–47. CiteSeerX 10.1.1.626.9582 . doi :10.1016/j.mycres.2007.03.004. PMID  17572334. S2CID  4686378. Архивировано из оригинала (PDF) 26 марта 2009 г. 
  45. ^ ab Ruggiero, Michael A.; Gordon, Dennis P.; Orrell, Thomas M.; et al. (29 апреля 2015 г.). «Высшая классификация всех живых организмов». PLOS ONE . 10 (6): e0119248. Bibcode : 2015PLoSO..1019248R. doi : 10.1371/journal.pone.0119248 . PMC 4418965. PMID  25923521 . 
  46. ^ Уайт, Мерлин М.; Джеймс, Тимоти Й.; О'Доннелл, Керри; и др. (ноябрь–декабрь 2006 г.). «Филогения зигомикот на основе данных о ядерной рибосомальной последовательности». Mycologia . 98 (6): 872–884. doi :10.1080/15572536.2006.11832617. PMID  17486964. S2CID  218589354.
  47. ^ Хаген, Джоэл Б. (январь 2012 г.). «Пять королевств, больше или меньше: Роберт Уиттакер и широкая классификация организмов». BioScience . 62 (1): 67–74. doi : 10.1525/bio.2012.62.1.11 .
  48. ^ Блэквелл, Уилл Х.; Пауэлл, Марта Дж. (июнь 1999 г.). «Согласование королевств с кодами номенклатуры: необходимо ли это?». Систематическая биология . 48 (2): 406–412. doi : 10.1080/106351599260382 . PMID  12066717.
  49. ^ Davis, RA (19 марта 2012 г.). «Королевство PROTISTA». Колледж Маунт-Сент-Джозеф . Получено 28 декабря 2016 г.
  50. ^ ab "Таксономическое дерево". Catalogue of Life . 23 декабря 2016 г. Архивировано из оригинала 1 августа 2021 г. Получено 28 декабря 2016 г.
  51. ^ ab Cavalier-Smith T (2022). «Эволюция зоны перехода ресничек и корень дерева эукариот: значение для происхождения опистоконтов и классификации царств простейших, растений и грибов». Protoplasma . 259 : 487–593. doi :10.1007/s00709-021-01665-7. PMC 9010356 . 
  52. ^ abcdefghijklmnop Адл С.М., Басс Д., Лейн CE, Лукеш Дж., Шох С.Л., Смирнов А., Агата С., Берни С., Браун М.В., Бурки Ф., Карденас П., Чепичка И., Чистякова Л., дель Кампо Дж., Данторн М., Эдвардсен Б. , Эглит Ю, Гийу Л, Хампл В, Хейсс А.А., Хоппенрат М, Джеймс Тай, Карнковска А, Карпов С, Ким Е, Колиско М, Кудрявцев А, Лар DJG, Лара Е, Ле Галл Л, Линн Д.Х., Манн Д.Г., Массана Р., Митчелл И.А.Д., Морроу С., Парк Дж.С., Павловски Дж.В., Пауэлл М.Дж., Рихтер Дж.Д., Рюкерт С., Шедвик Л., Шимано С., Шпигель Ф.В., Торруэлла Дж., Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019). «Пересмотр классификации, номенклатуры и разнообразия эукариот». Журнал эукариотической микробиологии . 66 (1): 4–119. doi :10.1111/jeu.12691. PMC 6492006 . PMID  30257078. 
  53. ^ ab Pawlowski J, Audic S, Adl S, Bass D, Belbahri L, Berney C и др. (6 ноября 2012 г.). "Рабочая группа CBOL protist: штрихкодирование эукариотического богатства за пределами царств животных, растений и грибов". PLOS Biology . 10 (11): e1001419. doi : 10.1371/journal.pbio.1001419 . PMC 3491025. PMID  23139639 . 
  54. ^ ab Вотыпка Дж, Модри Д, Оборник М, Шлапета Дж, Лукеш Дж (2016). «Апикомплекса». В Арчибальд Дж., Симпсон А.Г.Б., Сламовиц Ч., Маргулис Л., Мелконян М., Чепмен Д.Д., Корлисс Дж.О. (ред.). Справочник протистов . Чам: Спрингер. дои : 10.1007/978-3-319-32669-6_20-1.
  55. ^ Ян Яноушковец; Денис Тихоненков; Фабьен Бурки; Алексис Т. Хоу; Мартин Колиско; Александр П. Мыльников; Патрик Джон Килинг (25 февраля 2015 г.). «Факторы, опосредующие зависимость от пластид и происхождение паразитизма у апикомплексонов и их близких родственников». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (33): 10200–10207. Bibcode : 2015PNAS..11210200J. doi : 10.1073/PNAS.1423790112. ISSN  0027-8424. PMC 4547307. PMID 25717057.  Wikidata Q30662251  . 
  56. ^ abcdef Майкл Д. Гайри (21 января 2024 г.). «Сколько видов водорослей существует? Повтор. Четыре царства, 14 типов, 63 класса и все еще растут». Журнал Phycology . 00 : 1–15. doi :10.1111/JPY.13431. ISSN  0022-3646. PMID  38245909. Wikidata  Q124684077.
  57. ^ Фойсснер, В.; Хоксворт, Дэвид, ред. (2009). Разнообразие простейших и географическое распространение. Темы в области биоразнообразия и охраны природы. Том 8. Springer Netherlands. стр. 111. doi :10.1007/978-90-481-2801-3. ISBN 9789048128006.
  58. ^ abc T Cavalier-Smith (март 2002 г.). «Фаготрофное происхождение эукариот и филогенетическая классификация простейших». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (2): 297–354. doi :10.1099/00207713-52-2-297. ISSN  1466-5026. PMID  11931142. Wikidata  Q28212529.
  59. ^ abcd Кавальер-Смит Т (2013). «Ранняя эволюция способов питания эукариот, структурное разнообразие клеток и классификация простейших типов Loukozoa, Sulcozoa и Choanozoa». Европейский журнал протистологии . 49 (2): 115–178. doi :10.1016/j.ejop.2012.06.001. PMID  23085100.
  60. ^ ab W Foissner; H Blatterer; I Foissner (1 октября 1988 г.). "The hemimastigophora (Hemimastix amphikineta nov. gen., nov. spec.), новый тип протистов из гондванских почв". European Journal of Protistology . 23 (4): 361–383. doi :10.1016/S0932-4739(88)80027-0. ISSN  0932-4739. PMID  23195325. Wikidata  Q85570914.
  61. ^ Гордон Лакс; Яна Эглит; Лора Эме; Эрин М. Бертран; Эндрю Дж. Роджер ; Аластер Дж. Б. Симпсон (14 ноября 2018 г.). «Hemimastigophora is a novel supra- kingdom-level lineage of eukaryotes». Nature . 564 (7736): 410–414. doi :10.1038/S41586-018-0708-8. ISSN  1476-4687. PMID  30429611. Wikidata  Q58834974.
  62. ^ Шɨшкин, Егор (2022). " Spironematella terricola comb. n. и Spironematella goodeyi comb. n. (Hemimastigida = Hemimastigea = Hemimastigophora) для Spironema terricola и Spironema goodeyi с исправленными диагнозами рода и семейства Spironematellidae". Zootaxa . 5128 (2): 295–297. doi :10.11646/zootaxa.5128.2.8. PMID  36101172. S2CID  252220401.
  63. ^ Heiss AA, Warring SD, Lukacs K, Favate J, Yang A, Gyaltshen Y, Filardi C, Simpson AGB, Kim E (декабрь 2020 г.). «Описание Imasa heleensis, gen. nov., sp. nov. (Imasidae, fam. nov.), глубоко ветвящейся морской малавимонады и возможного ключевого таксона в понимании ранней эволюции эукариот». Журнал эукариотической микробиологии . 68 : e12837. doi :10.1111/jeu.12837.
  64. ^ Карпов, Сергей; Мамкаева, Мария А.; Алеошин, Владимир; Нассонова, Елена; Лилье, Осу; Глисон, Фрэнк Х. (1 января 2014 г.). "Морфология, филогения и экология афелид (Aphelidea, Opisthokonta) и предложение о новом надтипе Opisthosporidia". Frontiers in Microbiology . 5 : 112. doi : 10.3389/fmicb.2014.00112 . PMC 3975115 . PMID  24734027. 
  65. ^ abc Денис В. Тихоненков, Кирилл В. Михайлов, Райан М. Р. Гаврилюк, Артем О. Беляев, Варша Матур, Сергей А. Карпов, Дмитрий Г. Загуменный, Анастасия С. Бородина, Кристина И. Прокина, Александр П. Мыльников, Владимир В. Алеошин и Патрик Дж. Килинг (7 декабря 2022 г.). «Микробные хищники образуют новую супергруппу эукариот». Природа . 612 : 714–719. дои : 10.1038/S41586-022-05511-5. ISSN  1476-4687. Викиданные  Q115933632.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  66. ^ Томас Кавальер-Смит ; Эма EY Чао (апрель 2006 г.). «Филогения и мегасистематика фаготрофных гетероконтов (царство Chromista)». Журнал молекулярной эволюции . 62 (4): 388–420. doi :10.1007/S00239-004-0353-8. ISSN  0022-2844. PMID  16557340. Wikidata  Q28303534.
  67. ^ Тинес М (2018). «Оомицеты». Current Biology . 28 (15): R812–R813. doi : 10.1016/j.cub.2018.05.062 .
  68. ^ T Cavalier-Smith (1999). «Принципы нацеливания белков и липидов во вторичном симбиогенезе: происхождение пластид эвгленоидных, динофлагеллятных и споровых и генеалогическое древо эукариот». Журнал эукариотической микробиологии . 46 (4): 347–66. doi :10.1111/J.1550-7408.1999.TB04614.X. ISSN  1066-5234. PMID  18092388. Wikidata  Q28261633.
  69. ^ ab Shalchian-Tabrizi, K; Eikrem, W; Klaveness, D; Vaulot, D; Minge, MA; Le Gall, F; Romari, K; Throndsen, J; Botnen, A; Massana, R; Thomsen, HA; Jakobsen, KS (28 апреля 2006 г.). "Telonemia, a new protist phylum with affinity to chromist lineages". Труды Королевского общества B: Биологические науки . 273 (1595): 1833–1842. doi :10.1098/rspb.2006.3515. PMC 1634789. PMID  16790418 . 
  70. ^ ab Тихоненков, Денис В.; Джейми, Махваш; Бородина, Анастасия С.; Беляев, Артем О.; Загумённый, Дмитрий Г.; Прокина, Кристина И.; Мыльников, Александр П.; Бурки, Фабьен; Карпов, Сергей А. (2022). "О происхождении TSAR: морфология, разнообразие и филогения телонемии". Open Biology . 12 (3). Королевское общество. doi : 10.1098/rsob.210325 . ISSN  2046-2441. PMC 8924772 . PMID  35291881. 
  71. ^ Корлисс, Джон О. (1984). «Царство протистов и его 45 типов». BioSystems . 17 (2): 87–176. doi :10.1016/0303-2647(84)90003-0. PMID  6395918.
  72. ^ ab Euzéby JP, Parte AC. "Имена типов". Список прокариотических названий со стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 3 апреля 2022 г.

Внешние ссылки

Wikispecies содержит информацию, связанную с типом .
Найдите понятие «Филум» в Викисловаре, бесплатном словаре.