stringtranslate.com

Онтология (информатика)

В информационной науке онтология охватывает представление, формальное наименование и определения категорий, свойств и отношений между концепциями, данными или сущностями, которые относятся к одной, многим или всем областям дискурса . Проще говоря, онтология — это способ показать свойства предметной области и то, как они связаны, путем определения набора терминов и реляционных выражений, которые представляют сущности в этой предметной области. Область, которая изучает онтологии, задуманные таким образом, иногда называют прикладной онтологией . [1]

Каждая академическая дисциплина или область, создавая свою терминологию, тем самым закладывает основу для онтологии. Каждая использует онтологические предположения для формулирования явных теорий, исследований и приложений. Улучшенные онтологии могут улучшить решение проблем в этой области, взаимодействие систем данных и обнаруживаемость данных. Перевод исследовательских работ в каждой области — это проблема, которая упрощается, когда эксперты из разных стран поддерживают контролируемый словарь жаргона между каждым из своих языков. [2] Например, определение и онтология экономики являются основной проблемой в марксистской экономике , [3] но также и в других подотраслях экономики . [4] Пример экономики, полагающейся на информатику, возникает в случаях, когда моделирование или модель предназначены для принятия экономических решений, таких как определение того, какие капитальные активы подвержены риску и в какой степени (см. управление рисками ).

Общим для онтологий как в информатике, так и в философии является попытка представить сущности, включая как объекты, так и события, со всеми их взаимозависимыми свойствами и отношениями, в соответствии с системой категорий. В обеих областях существует значительная работа по проблемам инженерии онтологий (например, Куайн и Крипке в философии, Сова и Гуарино в информатике), [5] и дебаты относительно того, в какой степени возможна нормативная онтология (например, фундаментализм и когерентизм в философии, BFO и Cyc в искусственном интеллекте).

Некоторые считают прикладную онтологию преемницей предшествующих работ в философии. Однако многие текущие усилия больше связаны с установлением контролируемых словарей узких областей, чем с философскими первыми принципами , или с такими вопросами, как способ существования фиксированных сущностей или могут ли устойчивые объекты (например, пердурантизм и эндурантизм ) быть онтологически более первичными, чем процессы . Искусственный интеллект сохранил значительное внимание к прикладной онтологии в таких подобластях, как обработка естественного языка в машинном переводе и представлении знаний , но редакторы онтологий часто используются в ряде областей, включая биомедицинскую информатику, [6] промышленность. [7] Такие усилия часто используют инструменты редактирования онтологий, такие как Protégé . [8]

Онтология в философии

Онтология — это раздел философии , пересекающий такие области, как метафизика , эпистемология и философия языка , поскольку он рассматривает, как знание, язык и восприятие связаны с природой реальности. Метафизика занимается такими вопросами, как «что существует?» и «какова природа реальности?». Метафизика, одна из пяти традиционных ветвей философии, занимается исследованием существования через свойства, сущности и отношения, такие как отношения между частностями и универсалиями , внутренними и внешними свойствами или сущностью и существованием . Метафизика была постоянной темой для обсуждения с момента письменной истории.

Этимология

Сложное слово онтология объединяет онто- , от греческого ὄν, на ( род. ὄντος , онтос ), т. е. «бытие; то, что есть», которое является настоящим причастием глагола εἰμί, eimí , т. е. «быть, я есмь», и -λογία, -logia , т. е. «логический дискурс», см. классические соединения для этого типа словообразования. [9] [10]

Хотя этимология греческая, самая старая сохранившаяся запись самого слова, неолатинская форма ontologia , появилась в 1606 году в работе Ogdoas Scholastica Якоба Лорхарда ( Lorhardus ) и в 1613 году в Lexicon philosophicum Рудольфа Гёккеля ( Goclenius ). [11]

Первое упоминание слова «онтология» в английском языке , зафиксированное в Оксфордском словаре английского языка ( Oxford English Dictionary , электронное издание, 2008 г.), встречается в работе «Archeologia Philosophica Nova» или «Новые принципы философии» Гидеона Харви .

Формальная онтология

С середины 1970-х годов исследователи в области искусственного интеллекта (ИИ) осознали, что инженерия знаний является ключом к созданию больших и мощных систем ИИ [ необходима ссылка ] . Исследователи ИИ утверждали, что они могут создавать новые онтологии как вычислительные модели , которые позволяют выполнять определенные виды автоматизированных рассуждений , что было лишь отчасти успешным . В 1980-х годах сообщество ИИ начало использовать термин онтология для обозначения как теории смоделированного мира, так и компонента систем, основанных на знаниях . В частности, Дэвид Пауэрс ввел слово онтология в ИИ для обозначения реального мира или роботизированного заземления, [12] [13] [14] опубликовав в 1990 году обзоры литературы, подчеркивающие обоснованную онтологию в связи с призывом к докладам для летнего симпозиума AAAI по машинному обучению естественному языку и онтологии, с расширенной версией, опубликованной в бюллетене SIGART и включенной в качестве предисловия к материалам. [15] Некоторые исследователи, черпая вдохновение из философских онтологий, рассматривали вычислительную онтологию как своего рода прикладную философию. [16]

В 1993 году широко цитируемая веб-страница и статья «К принципам проектирования онтологий, используемых для обмена знаниями» Тома Грубера [17] использовали онтологию как технический термин в компьютерной науке, тесно связанный с более ранней идеей семантических сетей и таксономий . Грубер ввел этот термин как спецификацию концептуализации :

Онтология — это описание (подобно формальной спецификации программы) концепций и отношений, которые могут формально существовать для агента или сообщества агентов. Это определение согласуется с использованием онтологии как набора определений концепций, но более общее. И это другой смысл слова, чем его использование в философии. [18]

Пытаясь дистанцировать онтологии от таксономий и аналогичных усилий по моделированию знаний , которые опираются на классы и наследование , Грубер заявил (1993):

Онтологии часто приравниваются к таксономическим иерархиям классов, определениям классов и отношению подчинения , но онтологии не обязательно должны ограничиваться этими формами. Онтологии также не ограничиваются консервативными определениями  , то есть определениями в традиционном логическом смысле, которые только вводят терминологию и не добавляют никаких знаний о мире. [19] Чтобы указать концептуализацию, нужно сформулировать аксиомы , которые ограничивают возможные интерпретации для определенных терминов. [20]

Файльмайр и Вёсс (2016) уточняют определение Грубера: «Онтология — это формальная, явная спецификация общей концептуализации, которая характеризуется высокой семантической выразительностью, необходимой для повышенной сложности» [21] .

Формальные компоненты онтологии

Современные онтологии имеют много структурных сходств, независимо от языка, на котором они выражены. Большинство онтологий описывают индивидов (экземпляры), классы (концепции), атрибуты и отношения.

Типы

Онтология домена

Онтология предметной области (или предметно-ориентированная онтология) представляет понятия, которые принадлежат к области мира, например биологии или политике. Каждая предметная онтология обычно моделирует предметно-ориентированные определения терминов. Например, слово карта имеет много разных значений. Онтология о предметной области покера будет моделировать значение слова « игральная карта », в то время как онтология о предметной области компьютерного оборудования будет моделировать значения « перфокарта » и « видеокарта ».

Поскольку онтологии доменов пишутся разными людьми, они представляют концепции очень специфическими и уникальными способами и часто несовместимы в рамках одного проекта. По мере расширения систем, которые полагаются на онтологии доменов, им часто приходится объединять онтологии доменов, вручную настраивая каждую сущность или используя комбинацию программного слияния и ручной настройки. Это представляет собой сложную задачу для разработчика онтологий. Различные онтологии в одном домене возникают из-за разных языков, разного предполагаемого использования онтологий и разного восприятия домена (на основе культурного фона, образования, идеологии и т. д.) [ требуется цитата ] .

В настоящее время объединение онтологий, которые не разрабатываются из общей верхней онтологии, является в значительной степени ручным процессом, а потому требует много времени и затрат. Доменные онтологии, которые используют одну и ту же верхнюю онтологию для предоставления набора базовых элементов, с помощью которых можно указать значения сущностей онтологии домена, могут быть объединены с меньшими усилиями. Существуют исследования обобщенных методов объединения онтологий, [22], но эта область исследований все еще продолжается, и недавнее событие — увидеть, как проблема была обойдена с помощью наличия нескольких онтологий домена, использующих одну и ту же верхнюю онтологию, как OBO Foundry .

Верхняя онтология

Верхняя онтология (или фундаментальная онтология) — это модель общих отношений и объектов, которые обычно применимы в широком диапазоне онтологий доменов. Обычно она использует базовый глоссарий , который охватывает термины и связанные описания объектов, используемые в различных соответствующих онтологиях доменов.

Стандартизированные верхние онтологии, доступные для использования, включают BFO , метод BORO , Dublin Core , GFO , Cyc , SUMO , UMBEL и DOLCE . [23] [24] WordNet некоторыми рассматривается как верхняя онтология и используется в качестве лингвистического инструмента для изучения онтологий предметной области. [25]

Гибридная онтология

Онтология Gellish является примером сочетания верхней и предметной онтологии.

Визуализация

Обзор методов визуализации онтологий представлен Катифори и др. [26] Обновленный обзор методов и инструментов визуализации онтологий был опубликован Дудасом и др. [27] Наиболее известные методы визуализации онтологий, а именно визуализация с помощью отступов в виде дерева и графа, оцениваются Фу и др. [28] Визуальный язык для онтологий, представленных в OWL, определен Визуальной нотацией для онтологий OWL (VOWL) ​​[ 29]

Инженерное дело

Инженерия онтологии (также называемая построением онтологий) — это набор задач, связанных с разработкой онтологий для определенной области. [30] Это подраздел инженерии знаний , который изучает процесс разработки онтологий, жизненный цикл онтологии, методы и методологии построения онтологий, а также инструменты и языки, которые их поддерживают. [31] [32]

Онтологическая инженерия направлена ​​на то, чтобы сделать явными знания, содержащиеся в программных приложениях, и организационные процедуры для определенной области. Онтологическая инженерия предлагает направление для преодоления семантических препятствий, таких как те, которые связаны с определениями бизнес-терминов и классов программного обеспечения. Известные проблемы с онтологической инженерией включают:

  1. Обеспечение актуальности онтологии с учетом знаний предметной области и использования терминов
  2. Обеспечение достаточной конкретности и охвата концепций для интересующей области, что позволяет минимизировать проблему полноты контента
  3. Обеспечение поддержки онтологией вариантов ее использования

Редакторы

Редакторы онтологий — это приложения, разработанные для помощи в создании или манипулировании онтологиями. Обычно редакторы онтологий используют один или несколько языков онтологий .

Аспекты редакторов онтологий включают: возможности визуальной навигации в рамках модели знаний , механизмы вывода и извлечения информации ; поддержку модулей; импорт и экспорт иностранных языков представления знаний для сопоставления онтологий ; и поддержку метаонтологий, таких как OWL-S , Dublin Core и т. д. [33]

Обучение

Обучение онтологии — это автоматическое или полуавтоматическое создание онтологий, включая извлечение терминов домена из текста на естественном языке. Поскольку создание онтологий вручную является чрезвычайно трудоемким и занимает много времени, существует большая мотивация для автоматизации этого процесса. Извлечение информации и интеллектуальный анализ текста были исследованы для автоматического связывания онтологий с документами, например, в контексте задач BioCreative. [34]

Исследовать

Эпистемологические предположения, которые в исследовании спрашивают «Что вы знаете?» или «Откуда вы это знаете?», создают основу, которую исследователи используют при подходе к определенной теме или области для потенциального исследования. Поскольку эпистемология напрямую связана со знаниями и тем, как мы приходим к принятию определенных истин, люди, проводящие академические исследования, должны понимать, что позволяет им начать строить теории. Проще говоря, эпистемологические предположения заставляют исследователей задаваться вопросом, как они приходят к имеющимся у них знаниям. [ необходима цитата ]

Языки

Язык онтологии — это формальный язык, используемый для кодирования онтологии. Существует ряд таких языков для онтологий, как собственных, так и основанных на стандартах:

Опубликованные примеры

Проект сообщества W3C Linking Open Data координирует попытки объединить различные онтологии в мировую семантическую паутину .

Библиотеки

Развитие онтологий привело к появлению сервисов, предоставляющих списки или каталоги онтологий, называемых библиотеками онтологий.

Ниже приведены библиотеки онтологий, выбранных человеком.

Ниже приведены как каталоги, так и поисковые системы.

Примеры применения

В целом онтологии могут быть с пользой использованы в нескольких областях.

Смотрите также

Связанные философские концепции

Ссылки

  1. ^ Дейл Жакетт (2002-11-26). Онтология. McGill–Queen's University Press . стр. 4. ISBN 9780773582675. Прикладная онтология как дисциплина или область является научной в том смысле, что она применяет определение бытия для определения онтологических обязательств других дисциплин, в частности, но не исключительно, в естественных науках, во многом таким же образом, как прикладная математика в инженерии связана с чистой математикой.
  2. ^ Г. Будин (2005), «Управление переводами на основе онтологий», в Хелле В. Дам (редактор), « Системы знаний и перевод» , Ян Энгберг, Хайдрун Герзимиш-Арбогаст, Вальтер де Грюйтер, стр. 113, ISBN 978-3-11-018297-2
  3. ^ Палермо, Джулио (10 января 2007 г.). «Онтология экономической власти при капитализме: мейнстримная экономика и Маркс». Cambridge Journal of Economics . 31 (4): 539–561. doi :10.1093/cje/bel036 – через Oxford Journals.
  4. ^ Зунига, Глория Л. (1999-02-02). "Онтология экономических объектов". Mpra Paper . Исследовательский отдел Федерального резервного банка Сент-Луиса . Получено 2013-06-16 .
  5. ^ Sowa, JF (1995). «Онтологические категории верхнего уровня». International Journal of Human-Computer Studies . 43 (5–6 (ноябрь/декабрь)): 669–85. doi :10.1006/ijhc.1995.1068.
  6. ^ ab {Биопортал
  7. ^ Промышленные онтологии Foundry
  8. ^ Musen, Mark (2015). «Проект Protégé: взгляд назад и взгляд вперед». AI Matters . 1 (4): 4–12. doi :10.1145/2757001.2757003. PMC 4883684. PMID  27239556 . 
  9. ^ "онтология". Онлайн-словарь этимологии .
  10. ^ εἰμί. Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
  11. ^ Смит, Барри (2022). «Рождение онтологии». Журнал структур и систем знаний . 3 : 57–66.
  12. ^ Пауэрс, Дэвид (1983). «Интеллектуальные роботы». Electronics Today International .
  13. ^ Пауэрс, Дэвид (1984). «Естественный язык естественным образом». Computer Compacts . 2 (3–4): 100–109. doi :10.1016/0167-7136(84)90088-X.
  14. ^ Пауэрс, Дэвид; Турк, Крис (1989). Машинное обучение естественному языку . Springer-Verlag. ISBN 978-1-4471-1697-4.
  15. ^ Пауэрс, Дэвид (1991). Предисловие: Цели, проблемы и направления в машинном обучении естественному языку и онтологии . Весенний симпозиум AAAI по машинному обучению естественному языку и онтологии. DFKI.
  16. ^ Грубер, Т. (2008). «Онтология». В Лю, Лин ; Озсу, М. Тамер (ред.). Энциклопедия систем баз данных . Springer-Verlag. ISBN 978-0-387-49616-0.
  17. ^ Грубер, Т. (1993). «К принципам проектирования онтологий, используемых для обмена знаниями». Международный журнал исследований взаимодействия человека и компьютера . 43 (5–6): 907–928. doi : 10.1006/ijhc.1995.1081 . S2CID  1652449.
  18. ^ Грубер, Т. (2001). «Что такое онтология?». Стэнфордский университет . Архивировано из оригинала 2010-07-16 . Получено 2009-11-09 .
  19. ^ Эндертон, Х. Б. (1972-05-12). Математическое введение в логику (1-е изд.). Сан-Диего, Калифорния: Academic Press. стр. 295. ISBN 978-0-12-238450-9.2-е издание; 5 января 2001 г.
  20. ^ Грубер, Томас Р. (июнь 1993 г.). «Подход к переводу спецификаций переносимых онтологий» (PDF) . Приобретение знаний . 5 (2): 199–220. CiteSeerX 10.1.1.101.7493 . doi :10.1006/knac.1993.1008. S2CID  15709015. 
  21. ^ Файльмайр, Кристина; Вёсс, Вольфрам (2016). «Анализ онтологий и их факторов успеха для применения в бизнесе». Data & Knowledge Engineering . 101 : 1–23. doi :10.1016/j.datak.2015.11.003.
  22. ^ "Проект: Динамическое восстановление онтологии". Эдинбургский университет, кафедра информатики . Получено 2 января 2012 г.
  23. ^ ab "Лаборатория прикладной онтологии - DOLCE". Лаборатория прикладной онтологии (LOA) . Получено 10 февраля 2011 г.
  24. ^ ab "OWL-версия DOLCE+DnS". Semantic Technology Lab . Получено 21 февраля 2013 г.
  25. ^ Навильи, Роберто; Веларди, Паола (2004). «Изучение онтологий предметной области из хранилищ документов и специализированных веб-сайтов». Computational Linguistics . 30 (2). MIT Press: 151–179. CiteSeerX 10.1.1.329.6965 . doi :10.1162/089120104323093276. S2CID  2453822. 
  26. ^ Катифори, А.; Халацис, К.; Лепурас, Г.; Василакис, К.; Джаннопулу, Э. (2007). «Методы визуализации онтологии. Обзор» (PDF) . Обзоры вычислительной техники ACM . 39 (4): 10. CiteSeerX 10.1.1.330.3281 . дои : 10.1145/1287620.1287621. S2CID  14205872. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 года. 
  27. ^ Дудас, М.; Ломанн, С.; Сватек, В.; Павлов, Д. (2018). «Методы и инструменты визуализации онтологий: обзор современного состояния дел». Обзор инженерии знаний . 33 (e10). doi :10.1017/S0269888918000073. S2CID  52965103.
  28. ^ Фу, Бо; Ной, Наталья Ф.; Стори, Маргарет-Энн (2013). «Отступы дерева или графа? Исследование удобства использования методов визуализации онтологий в контексте оценки отображения классов». Семантическая паутина – ISWC 2013: 12-я Международная конференция по семантической паутине, Сидней, Новый Южный Уэльс, Австралия, 21–25 октября 2013 г., Труды, часть I. Конспект лекций по информатике. Том 8218. Берлин: Springer. стр. 117–134. doi : 10.1007/978-3-642-41335-3_8 . ISBN 978-3-642-41335-3.
  29. ^ Негру, Стефан; Ломанн, Штеффен; Хааг, Флориан (7 апреля 2014 г.). "VOWL: Визуальная нотация для онтологий OWL: спецификация версии 2.0". Visual Data Web .
  30. ^ Пушар, Лайн; Ивезич, Ненад; Шленофф, Крейг (март 2000 г.). «Разработка онтологий для распределенного взаимодействия в производстве» (PDF) . Труды конференции AIS2000 .
  31. ^ Гомес-Перес, Аскуньон; Фернандес-Лопес, Мариано; Корчо, Оскар (2004). Онтологическая инженерия: с примерами из областей управления знаниями, электронной коммерции и семантической сети (1-е изд.). Спрингер. п. 403. ИСБН 978-1-85233-551-9.
  32. ^ Де Никола, Антонио; Миссикофф, Мишель; Навильи, Роберто (2009). «Подход к разработке программного обеспечения для построения онтологий» (PDF) . Информационные системы . 34 (2). Elsevier: 258–275. doi :10.1016/j.is.2008.07.002.
  33. ^ Алатриш, Эмхимед (2013). «Сравнение некоторых редакторов онтологий» (PDF) . Системы управления информацией . 8 (2): 18–24.
  34. ^ Krallinger, M; Leitner, F; Vazquez, M; Salgado, D; Marcelle, C; Tyers, M; Valencia, A; Chatr-Aryamontri, A (2012). «Как связать онтологии и белок-белковые взаимодействия с литературой: подходы к интеллектуальному анализу текста и опыт биотворчества». База данных . 2012 : bas017. doi :10.1093/database/bas017. PMC 3309177. PMID  22438567 . 
  35. ^ "SADL". SourceForge . Получено 10 февраля 2011 г. .
  36. ^ Джаррар, Мустафа (2021). «Арабская онтология — арабская сеть слов с онтологически чистым содержанием». Прикладная онтология . 16 : 1–26. arXiv : 2205.09664 . doi : 10.3233/AO-200241. S2CID  231886117.
  37. ^ "AURUM - Информационная безопасность Онтология" . Получено 29 января 2016 г.
  38. ^ "Базовая формальная онтология (BFO)". Институт формальной онтологии и медицинской информатики (IFOMIS).
  39. ^ "BioPAX". Архивировано из оригинала 25 июня 2011 г. Получено 10 февраля 2011 г.
  40. ^ Остервальдер, Александр; Пиньёр, Ив (17–19 июня 2002 г.). Онтология модели электронного бизнеса для моделирования электронного бизнеса (PDF) . 15-я Бледская электронная конференция , Словения . Архивировано из оригинала (PDF) 2011-04-19.
  41. ^ Upward, Энтони; Джонс, Питер (2016). «Онтология для строго устойчивых бизнес-моделей: определение корпоративной структуры, совместимой с естественными и социальными науками». Организация и окружающая среда . 29 (1): 97–123. doi :10.1177/1086026615592933. S2CID  145089240.
  42. ^ "О CCO и GexKB". Семантическая системная биология. Архивировано из оригинала 2012-07-30.
  43. ^ "CContology" . Получено 10 февраля 2011 г.
  44. ^ "Концептуальная эталонная модель CIDOC (CRM)" . Получено 10 февраля 2011 г.
  45. ^ "COSMO". MICRA Inc. Получено 10 февраля 2011 г.
  46. ^ Osborne, JD; Flatow, J; Holko, M; Lin, SM; Kibbe, WA; Zhu, LJ; Danila, MI; Feng, G; Chisholm, RL (2009). «Аннотирование генома человека с помощью онтологии заболеваний». BMC Genomics . 10 (Suppl 1): S6. doi : 10.1186/1471-2164-10-S1-S6 . PMC 2709267. PMID  19594883 . 
  47. ^ Ломбардо, Винченцо; Дамиано, Россана; Пиццо, Антонио (2018). «Драма: всеобъемлющий онтологический ресурс по драме». Семантическая паутина — ISWC 2018. Конспект лекций по информатике. Том 11137. Springer. С. 103–118. doi :10.1007/978-3-030-00668-6_7. ISBN 978-3-030-00667-9. Получено 11 июля 2024 г. .
  48. ^ "Financial Industry Business Ontology (FIBO)" . Получено 15 марта 2017 г. .
  49. ^ "Основные, основные и лингвистические онтологии" . Получено 10 февраля 2011 г.
  50. ^ "Foundational Model of Anatomy" . Получено 10 февраля 2011 г. .
  51. ^ "Car Extension". Архивировано из оригинала 8 декабря 2018 года . Получено 15 июня 2017 года .
  52. ^ "ЗОЛОТО: запись на FAIRsharing.org" . Получено 29 июля 2024 г. .
  53. ^ "Обобщенная верхняя модель" . Получено 10 февраля 2011 г.
  54. ^ "The IDEAS Group Website". Архивировано из оригинала 16 декабря 2018 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  55. ^ "Linkbase". Архивировано из оригинала 18 сентября 2008 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  56. ^ Справочное руководство по консоли конфигурации: язык шаблонов Landmark (LPL) Архивировано 04.02.2020 на Wayback Machine . Получено 4 февраля 2020 г.
  57. ^ "Биопортал". Национальный центр биологической онтологии (NCBO). Архивировано из оригинала 2009-06-12 . Получено 2013-10-24 .
  58. ^ «Браузер онтологий для большинства открытых биологических и биомедицинских онтологий». Проект Berkeley Bioinformatics Open Source (BBOP).
  59. ^ ab «Открытые биологические и биомедицинские онтологии». Проект Berkeley Bioinformatics Open Source (BBOP).
  60. ^ "OMNIBUS Ontology". Архивировано из оригинала 19 июля 2012 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  61. ^ "ONSTR". Архивировано из оригинала 16 апреля 2014 года . Получено 16 апреля 2014 года .
  62. ^ "Plant Ontology" . Получено 10 февраля 2011 г. .
  63. ^ "PRO". Архивировано из оригинала 10 марта 2011 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  64. ^ "ProbOnto" . Получено 1 июля 2017 г.
  65. ^ Swat, MJ; Grenon, P; Wimalaratne, S (2016). «ProbOnto: онтология и база знаний вероятностных распределений». Биоинформатика . 32 (17): 2719–21. doi :10.1093/bioinformatics/btw170. PMC 5013898. PMID  27153608 . 
  66. ^ "Protein Ontology". Архивировано из оригинала 10 марта 2011 г. Получено 10 февраля 2011 г.
  67. ^ Нембавер, Виктория; Мазанду, Гастон К.; Хочкисс, Джейд; Сафари Серуфури, Жан-Мишель; Кент, Джилл; Кенгне, Андре Паскаль; Ани, Кофи; Мунунг, Нчангви Синтия; Букини, Дайма; Битунги, Валентина Жозиан Нго; Мунубе, Деогратиас (01 октября 2020 г.). «Онтология серповидноклеточной болезни: обеспечение совместных исследований и совместной разработки новых приложений для планетарного здравоохранения». OMICS: Журнал интегративной биологии . 24 (10): 559–567. дои : 10.1089/omi.2020.0153. ПМК 7549008 . ПМИД  33021900. 
  68. ^ Eilbeck K, Lewis SE , Mungall CJ, Yandell M, Stein L , Durbin R , Ashburner M (2005). «Онтология последовательностей: инструмент для объединения аннотаций генома». Genome Biology . 6 (5): R44. doi : 10.1186/gb-2005-6-5-r44 . PMC 1175956. PMID  15892872 . 
  69. ^ Найлз, И. и Пиз, А. (2001), На пути к стандартной верхней онтологии, в Трудах 2-й Международной конференции по формальной онтологии в информационных системах (FOIS-2001), под ред. Криса Уэлти и Барри Смита, стр. 2–9.
  70. ^ "SWEET" . Получено 11 марта 2022 г. .
  71. ^ "SSN" . Получено 10 ноября 2021 г.
  72. ^ Mungall, CJ; Torniai, C; Gkoutos, GV; Lewis, SE; Haendel, MA (2012). «Uberon, интегративная многовидовая анатомическая онтология». Genome Biol . 13 (1): R5. doi : 10.1186/gb-2012-13-1-r5 . PMC 3334586. PMID  22293552 . 
  73. ^ "YAMATO". Архивировано из оригинала 3 марта 2011 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  74. ^ "COLORE". Архивировано из оригинала 28 августа 2011 года . Получено 4 мая 2011 года .
  75. ^ "DAML Ontology Library" . Получено 10 февраля 2011 г. .
  76. ^ "ODP Library". Архивировано из оригинала 13 октября 2015 года . Получено 21 февраля 2013 года .
  77. ^ "Protege Ontology Library" . Получено 10 февраля 2011 г. .
  78. ^ "SchemaWeb". Архивировано из оригинала 10 августа 2011 г. Получено 10 февраля 2011 г.
  79. ^ Смит, Б .; Эшбёрнер, М .; Россе, К.; Бард, Дж.; Баг, В.; Кёстерс, В.; Голдберг, Л.Дж.; Эйлбек, К.; Айрленд, А.; Мангалл, К.Дж.; Леонтис, Н.; Рокка-Серра, П.; Руттенберг, А.; Сансоне, С.А.; Шейерманн, Р.Х.; Шах, Н.; Ветцель, ПЛ; Льюис, С. (2007). «OBO Foundry: Скоординированная эволюция онтологий для поддержки интеграции биомедицинских данных». Nature Biotechnology . 25 (11): 1251–1255. doi :10.1038/nbt1346. PMC 2814061. PMID  17989687 .  Значок открытого доступа
  80. ^ "OntoSelect". Архивировано из оригинала 11 ноября 2010 года . Получено 10 февраля 2011 года .
  81. ^ "Онтария" . Получено 10 февраля 2011 г.
  82. ^ "OpenOntologyRepository - OntologPSMW". ontologforum.org . Получено 28.03.2019 .
  83. ^ Хан, Зубейда Касмод; Кит, С. Мария (2013). "Библиотека фундаментальных онтологий ROMULUS". Model and Data Engineering . Lecture Notes in Computer Science. Vol. 8216. pp. 200–211. doi :10.1007/978-3-642-41366-7_17. ISBN 978-3-642-41365-0. S2CID  1925510 . Получено 25 июня 2023 г. .
  84. ^ Оберле, Дэниел (2014). «Как онтологии приносят пользу корпоративным приложениям» (PDF) . Semantic Web . 5 (6). IOS Press: 473–491. doi :10.3233/SW-130114.
  85. ^ Фрэнк, Эндрю У. (2001). «Уровни онтологии и ограничения согласованности в географических информационных системах». Международный журнал географической информационной науки . 15 (7): 667–678. Bibcode : 2001IJGIS..15..667F. doi : 10.1080/13658810110061144. S2CID  6616354.
  86. ^ Стивенсон, Марк; Го, Икунь (2010). «Устранение неоднозначности неоднозначных биомедицинских терминов с использованием примеров, полученных из метатезауруса UMLS». Журнал биомедицинской информатики . 43 (5): 762–773. doi : 10.1016/j.jbi.2010.06.001 . PMID  20541624.
  87. ^ Боденрейдер, О.; Митчелл, JA; МакКрей, AT (2003). «Биомедицинские онтологии». Биокомпьютинг 2004. С. 164–165. doi :10.1142/9789812704856_0016. ISBN 978-981-238-598-7. PMC  4300097 . PMID  15759615.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме «Онтология» .
В Scholia имеется тематический профиль по онтологии (информатика) .