stringtranslate.com

вирус гепатита С

Вирус гепатита С ( HCV ) [3] — это небольшой ( размером 55–65 нм ), оболочечный , одноцепочечный РНК-вирус с положительной полярностью из семейства Flaviviridae . Вирус гепатита С является причиной гепатита С и некоторых видов рака, таких как рак печени ( гепатоцеллюлярная карцинома , сокращенно ГЦК) и лимфомы у людей. [4] [5]

Таксономия

Вирус гепатита С принадлежит к роду Hepacivirus , члену семейства Flaviviridae . До 2011 года он считался единственным членом этого рода. Однако представитель этого рода был обнаружен у собак : собачий гепацивирус . [6] Также в этом роде есть по крайней мере один вирус, который заражает лошадей. [7] Несколько дополнительных вирусов в этом роде были описаны у летучих мышей и грызунов. [8] [9]

Структура

Структура вируса гепатита С

Частица вируса гепатита С состоит из липидной мембранной оболочки диаметром от 55 до 65 нм. [10] [11] Два вирусных оболочечных гликопротеина , E1 и E2 , встроены в липидную оболочку. [12] Они принимают участие в прикреплении вируса и проникновении в клетку. [10] Внутри оболочки находится икосаэдрическое ядро ​​диаметром от 33 до 40 нм. [11] Внутри ядра находится РНК-материал вируса. [10]

Гликопротеины E1 и E2

E1 и E2 ковалентно связаны при внедрении в оболочку вируса гепатита С и стабилизируются дисульфидными связями . E2 имеет шаровидную форму и, судя по изображениям, полученным с помощью электронного микроскопа, выступает на 6 нм из мембраны оболочки. [11]

Эти гликопротеины играют важную роль во взаимодействии гепатита С с иммунной системой. Гипервариабельный регион , гипервариабельный регион 1 (HVR1), можно найти на гликопротеине E2. [10] HVR1 является гибким и вполне доступным для окружающих молекул. [13] HVR1 помогает E2 защищать вирус от иммунной системы. Он не дает CD81 зацепиться за соответствующий рецептор на вирусе. [13] Кроме того, E2 может защищать E1 от иммунной системы. [13] Хотя HVR1 довольно изменчив по аминокислотной последовательности, этот регион имеет схожие химические, физические и конформационные характеристики во многих гликопротеинах E2. [14]

Геном

Структура IRES, расположенного в 5′-UTR вируса гепатита С

Вирус гепатита С имеет одноцепочечный РНК- геном с положительным смыслом . Геном состоит из одной открытой рамки считывания длиной 9600 нуклеотидных оснований. [15] Эта единственная открытая рамка считывания транслируется для получения одного белкового продукта, который затем дополнительно обрабатывается для получения более мелких активных белков. Вот почему в общедоступных базах данных, таких как Европейский институт биоинформатики , вирусный протеом состоит только из 2 белков. [ необходима цитата ]

На 5′ и 3′ концах РНК находятся нетранслируемые области (UTR), которые не транслируются в белки, но важны для трансляции и репликации вирусной РНК. 5′ UTR имеет сайт связывания рибосомы [16] или внутренний сайт входа рибосомы (IRES), который инициирует трансляцию очень длинного белка, содержащего около 3000 аминокислот. Основной домен IRES HCV содержит четырехсторонний спиральный узел Холлидея , который интегрирован в предсказанный псевдоузел . [17] Конформация этого основного домена ограничивает ориентацию открытой рамки считывания для позиционирования на рибосомальной субъединице 40S . Большой пре-белок позже расщепляется клеточными и вирусными протеазами на 10 более мелких белков, которые обеспечивают репликацию вируса внутри клетки-хозяина или собираются в зрелые вирусные частицы. [18] Структурные белки, вырабатываемые вирусом гепатита С, включают основной белок, E1 и E2; неструктурные белки включают NS2 , NS3 , NS4A , NS4B , NS5A и NS5B . [ необходима ссылка ]

Молекулярная биология

Организация генома вируса гепатита С
Схема строения частицы вируса гепатита С

Белки этого вируса расположены вдоль генома в следующем порядке: N-терминал-ядро-оболочка (E1)–E2–p7-неструктурный белок 2 (NS2)–NS3–NS4A–NS4B–NS5A–NS5B–C-терминал. Генерация зрелых неструктурных белков (NS2–NS5B) зависит от активности вирусных протеиназ. [19] Соединение NS2/NS3 расщепляется металлозависимой автокаталитической протеиназой, кодируемой в NS2 и N-конце NS3. Остальные расщепления ниже по течению от этого сайта катализируются сериновой протеазой, также содержащейся в N-концевой области NS3.

Также был описан 11-й белок. [27] [28] Этот белок кодируется сдвигом рамки +1 в гене капсида. Он, по-видимому, является антигенным, но его функция неизвестна.

Репликация

Упрощенная схема цикла репликации вируса гепатита С

Репликация вируса гепатита С включает несколько этапов. Вирус реплицируется в основном в гепатоцитах печени , где , по оценкам, ежедневно каждая инфицированная клетка производит около пятидесяти вирионов (вирусных частиц) с расчетным общим количеством вирионов, составляющим один триллион. Вирус также может реплицироваться в мононуклеарных клетках периферической крови , что потенциально объясняет высокие уровни иммунологических нарушений, обнаруженных у хронически инфицированных пациентов с вирусом гепатита С. В печени частицы вируса гепатита С попадают в печеночные синусоиды с током крови. Эти синусоиды соседствуют с клетками гепатоцитов. [10] Вирус гепатита С способен проходить через эндотелий синусоидов и достигать базолатеральной поверхности клеток гепатоцитов. [10]

HCV имеет большое разнообразие генотипов и быстро мутирует из-за высокой частоты ошибок со стороны РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса . Частота мутаций приводит к появлению стольких вариантов вируса, что его считают квазивидом , а не обычным видом вируса. [29] Проникновение в клетки-хозяева происходит посредством сложных взаимодействий между вирионами, особенно через их гликопротеины, и молекулами клеточной поверхности CD81 , рецептором ЛПНП , SR-BI , DC-SIGN , клаудином-1 и окклюдином . [30] [31]

Оболочка вируса гепатита С похожа на липопротеины очень низкой плотности (ЛПОНП) и липопротеины низкой плотности (ЛПНП). [10] Из-за этого сходства считается, что вирус может связываться с аполипопротеинами . Он может окружать себя липопротеинами, частично покрывая E1 и E2. Недавние исследования показывают, что эти аполипопротеины взаимодействуют с рецептором-мусорщиком B1 (SR-B1). SR-B1 способен удалять липиды из липопротеинов вокруг вируса, чтобы лучше обеспечить контакт HVR1. Клаудин 1, который является белком плотного контакта , и CD81 связываются, создавая комплекс, подготавливая их к последующим процессам заражения вирусом гепатита С. Когда активируется иммунная система, макрофаги увеличивают количество TNF-α вокруг инфицированных гепатоцитов. Это запускает миграцию окклюдина, который является другим комплексом плотного контакта, к базолатеральной мембране. Частица HCV готова проникнуть в клетку. [10]

Эти взаимодействия приводят к эндоцитозу вирусной частицы. Этот процесс осуществляется с помощью белков клатрина. Попав внутрь ранней эндосомы, эндосома и вирусная оболочка сливаются, и РНК попадает в цитоплазму. [10]

HCV берет на себя часть внутриклеточного механизма для репликации. [32] Геном HCV транслируется для получения одного белка из примерно 3011 аминокислот. Затем полипротеин протеолитически обрабатывается вирусными и клеточными протеазами для получения трех структурных (ассоциированных с вирионом) и семи неструктурных (NS) белков. В качестве альтернативы может произойти сдвиг рамки считывания в регионе Core для получения белка альтернативной рамки считывания (ARFP). [33] HCV кодирует две протеазы, цистеиновую аутопротеазу NS2 и сериновую протеазу NS3-4A. Затем белки NS рекрутируют вирусный геном в комплекс репликации РНК, который связан с перестроенными цитоплазматическими мембранами. Репликация РНК происходит через вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу NS5B, которая производит промежуточную отрицательную цепь РНК. Затем отрицательная цепь РНК служит шаблоном для получения новых вирусных геномов с положительной цепью. Зарождающиеся геномы затем могут быть транслированы, далее реплицированы или упакованы в новые вирусные частицы. [ необходима цитата ]

Вирус реплицируется на внутриклеточных липидных мембранах. [34] Эндоплазматический ретикулум, в частности, деформируется в мембранные структуры уникальной формы, называемые «мембранными сетями». Эти структуры могут быть вызваны единственной экспрессией вирусного белка NS4B. [35] Основной белок ассоциируется с липидными каплями и использует микротрубочки и динеины для изменения их расположения на перинуклеарное распределение. [36] Высвобождение из гепатоцита может включать секреторный путь ЛПОНП. [37] Другая гипотеза утверждает, что вирусная частица может секретироваться из эндоплазматического ретикулума через эндосомальный сортировочный комплекс, необходимый для транспорта (ESCRT). [10] Этот путь обычно используется для отпочкования везикул из клетки. Единственным ограничением этой гипотезы является то, что этот путь обычно используется для клеточного почкования , и неизвестно, как вирус гепатита С может захватить путь ESCRT для использования с эндоплазматическим ретикулумом. [10]

Генотипы

На основании генетических различий между изолятами HCV вирус гепатита C классифицируется на шесть генотипов (1–6) с несколькими подтипами в каждом генотипе (обозначенными строчными буквами). [38] [39] Подтипы далее подразделяются на квазивиды на основе их генетического разнообразия. Генотипы различаются на 30–35% нуклеотидных участков по всему геному. [40] Разница в геномном составе подтипов генотипа обычно составляет 20–25%. Подтипы 1a и 1b встречаются во всем мире и вызывают 60% всех случаев. [ необходима цитата ]

Клиническое значение

Генотип клинически важен для определения потенциального ответа на терапию на основе интерферона и необходимой продолжительности такой терапии. Генотипы 1 и 4 менее восприимчивы к лечению на основе интерферона, чем другие генотипы (2, 3, 5 и 6). [41] Продолжительность стандартной терапии на основе интерферона для генотипов 1 и 4 составляет 48 недель, тогда как лечение для генотипов 2 и 3 завершается за 24 недели. Устойчивые вирусологические ответы наблюдаются в 70% случаев генотипа 1, ~90% генотипов 2 и 3, ~65% генотипа 4 и ~80% генотипа 6. [42] Кроме того, люди африканского происхождения гораздо реже реагируют на лечение при инфицировании генотипами 1 или 4. [43] Предполагается, что значительная часть этого отсутствия ответа на лечение вызвана однонуклеотидным полиморфизмом (SNP) на хромосоме 19 генома человека, который является предиктором успеха лечения. [44] Генотипы HCV 1 и 4 были эндемично распространены в перекрывающихся районах Западной и Центральной Африки, заражая на протяжении столетий популяции людей, несущих рассматриваемый генетический полиморфизм. Это побудило ученых предположить, что длительное сохранение генотипов HCV 1 и 4 у людей африканского происхождения является эволюционной адаптацией HCV на протяжении многих столетий к иммуногенетическим реакциям этих популяций. [45]

Инфекция одним генотипом не дает иммунитета против других, и возможна одновременная инфекция двумя штаммами. В большинстве этих случаев один из штаммов вытесняет другой за короткое время. Это открытие может быть полезным при лечении, при замене штаммов, не поддающихся лечению, другими, которые легче поддаются лечению. [46]

Рекомбинация

Когда два вируса заражают одну и ту же клетку, может произойти генетическая рекомбинация . [47] Хотя это и нечасто, рекомбинация вируса гепатита С наблюдалась между различными генотипами, между подтипами одного и того же генотипа и даже между штаммами одного и того же подтипа. [47]

Эпидемиология

Вирус гепатита С преимущественно передается через кровь , с очень низким риском половой или вертикальной передачи . [48] Из-за этого способа распространения основными группами риска являются потребители инъекционных наркотиков (ПИН), получатели продуктов крови и иногда пациенты на гемодиализе . Распространенной средой передачи ВГС также является внутрибольничная ( нозокомиальная ) передача, когда в клинике не соблюдаются правила гигиены и стерилизации . [49] Ряд культурных или ритуальных практик были предложены в качестве потенциального исторического способа распространения ВГС, включая обрезание, калечащие операции на половых органах, ритуальную шрамирование, традиционную татуировку и иглоукалывание. [48] Также утверждалось, что, учитывая чрезвычайно длительные периоды персистенции ВГС у людей, даже очень низкие и неопределяемые показатели механической передачи через кусающих насекомых могут быть достаточными для поддержания эндемичной инфекции в тропиках, где люди получают большое количество укусов насекомых. [50]

Эволюция

Определение происхождения этого вируса было сложным, но генотипы 1 и 4, по-видимому, имеют общее происхождение. [51] Байесовский анализ предполагает, что основные генотипы разошлись около 300–400 лет назад от общего предкового вируса. [52] Второстепенные генотипы разошлись около 200 лет назад от своих основных генотипов. Все существующие генотипы, по-видимому , произошли от генотипа 1 подтипа 1b. [ необходима цитата ]

Исследование штаммов генотипа 6 предполагает более раннюю дату эволюции: приблизительно от 1100 до 1350 лет до настоящего времени . [53] Оценочная скорость мутации составила 1,8 × 10−4 . Экспериментальное исследование оценило скорость мутации в 2,5–2,9 × 10−3 замен оснований на сайт в год. [54] Этот генотип может быть предком других генотипов. [53]

Исследование европейских, американских и японских изолятов показало, что дата происхождения генотипа 1b приблизительно приходится на 1925 год. [55] Предполагаемые даты происхождения типов 2a и 3a — 1917 и 1943 годы соответственно. Время расхождения типов 1a и 1b оценивалось в 200–300 лет. [ необходима цитата ]

Исследование генотипов 1a и 1b оценило даты происхождения как 1914–1930 для типа 1a и 1911–1944 для типа 1b. [56] Оба типа 1a и 1b претерпели массивное расширение своей эффективной численности популяции между 1940 и 1960 годами. Расширение подтипа HCV 1b предшествовало расширению подтипа 1a по крайней мере на 16 лет. Оба типа, по-видимому, распространились из развитого мира в развивающийся.

Штаммы генотипа 2 из Африки можно разделить на четыре клады, которые коррелируют со страной их происхождения: (1) Камерун и Центральноафриканская Республика (2) Бенин, Гана и Буркина-Фасо (3) Гамбия, Гвинея, Гвинея-Бисау и Сенегал (4) Мадагаскар. [57] Также имеются веские доказательства распространения генотипа 2 вируса гепатита С из Западной Африки в страны Карибского бассейна посредством трансатлантической работорговли . [58]

Считается, что генотип 3 возник в Юго-Восточной Азии. [59]

Эти даты из этих разных стран предполагают, что этот вирус мог развиться в Юго-Восточной Азии и был распространен в Западную Африку торговцами из Западной Европы. [60] Позднее он был завезен в Японию, как только была снята самоизоляция этой страны . После того, как вирус был завезен в страну, на его распространение повлияли многие местные факторы, включая переливание крови, программы вакцинации, внутривенное употребление наркотиков и режимы лечения. Учитывая снижение скорости распространения после внедрения скрининга на ВГС в продуктах крови в 1990-х годах, можно предположить, что ранее переливание крови было важным методом распространения. Требуется дополнительная работа для определения дат эволюции различных генотипов и сроков их распространения по всему миру. [ необходима цитата ]

Вакцинация

В отличие от гепатита А и В, в настоящее время не существует вакцины для профилактики заражения гепатитом С. [61]

Текущие исследования

Изучение вируса гепатита С затруднено из-за узкого круга хозяев вируса гепатита С. [62] Использование репликонов оказалось успешным, но они были обнаружены лишь недавно. [63] ВГС, как и большинство РНК-вирусов, существует как вирусный квазивид , что делает очень сложным выделение одного штамма или типа рецептора для изучения. [64] [65]

Текущие исследования сосредоточены на ингибиторах малых молекул вирусной протеазы , РНК-полимеразы и других неструктурных генов. Два агента — боцепревир от Merck [66] и телапревир от Vertex Pharmaceuticals — оба ингибитора протеазы NS3 были одобрены для использования 13 мая 2011 г. и 23 мая 2011 г. соответственно.

Сообщалось о возможной связи между низким уровнем витамина D и плохим ответом на лечение. [67] [68] [69] [70] Исследования in vitro показали, что витамин D может снижать репликацию вируса. [71] Хотя эта работа выглядит многообещающей [72] [73], результаты клинических испытаний еще не получены. [74] [75] Однако было высказано предположение, что добавление витамина D важно в дополнение к стандартному лечению для улучшения ответа на лечение. [76]

Нарингенин , флавоноид, содержащийся в грейпфруте и других фруктах и ​​травах, как было показано, блокирует сборку внутриклеточных инфекционных вирусных частиц, не влияя на внутриклеточные уровни вирусной РНК или белка. [76]

Другие исследуемые агенты включают ингибиторы аналогов нуклеозидов и нуклеотидов и ненуклеозидные ингибиторы РНК-зависимой РНК-полимеразы, ингибиторы NSP5A и соединения, нацеленные на хозяина, такие как ингибиторы циклофилина и силибинин . [77]

Софосбувир для использования против хронической инфекции гепатита С был одобрен FDA 6 декабря 2013 года. Сообщается, что это первый препарат, который продемонстрировал безопасность и эффективность для лечения определенных типов инфекции ВГС без необходимости совместного введения интерферона. [78] 22 ноября FDA одобрило симепревир для использования в сочетании с пегинтерфероном-альфа и рибавирином . [79] Симепревир был одобрен в Японии для лечения хронической инфекции гепатита С, генотип 1. [80]

Также проводятся экспериментальные исследования немедикаментозных методов лечения. Например, оксиматрин — это экстракт корня, найденный на азиатском континенте, который, как сообщается, обладает противовирусной активностью против вируса гепатита С в клеточных культурах и исследованиях на животных. Небольшие и многообещающие испытания на людях показали положительные результаты и отсутствие серьезных побочных эффектов, но они были слишком малы, чтобы делать обобщенные выводы. [76]

5 октября 2020 года было объявлено, что Харви Дж. Альтер , Майкл Хоутон и Чарльз М. Райс были удостоены Нобелевской премии по физиологии и медицине 2020 года за открытие вируса гепатита С. [81]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ "Hepacivirus C". Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) . Получено 3 января 2022 г.
  2. ^ Смит, Дональд Б. и др. (23 июня 2016 г.). «Создать 13 новых видов в роде Hepacivirus и переименовать 1 вид (семейство Flaviviridae)» (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Получено 13 марта 2019 г.
  3. ^ "Род: Hepacivirus". Международный комитет по таксономии вирусов . Июль 2018 г. Архивировано из оригинала 19 февраля 2020 г.
  4. ^ Ферри, Клодовео (2015). «Синдром HCV: совокупность органоспецифических и неорганоспецифических аутоиммунных расстройств, В-клеточная неходжкинская лимфома и рак». World Journal of Hepatology . 7 (3): 327–43. doi : 10.4254/wjh.v7.i3.327 . ISSN  1948-5182. PMC 4381161. PMID  25848462 . 
  5. ^ Rusyn I, Lemon SM (2014). «Механизмы рака печени, вызванного вирусом гепатита С: что мы узнали из исследований in vitro и на животных?». Cancer Lett . 345 (2): 210–5. doi :10.1016/j.canlet.2013.06.028. PMC 3844040. PMID  23871966 . 
  6. ^ Капур А. и др. (2011). «Характеристика собачьего гомолога вируса гепатита С». Proc Natl Acad Sci USA . 108 (28): 11608–13. Bibcode : 2011PNAS..10811608K. doi : 10.1073/pnas.1101794108 . PMC 3136326. PMID  21610165 . 
  7. ^ Burbelo PD, Dubovi EJ, Simmonds P и др. (июнь 2012 г.). «Обнаружение генетически разнообразных гепацивирусов у нового хозяина с помощью серологии». J. Virol . 86 (11): 6171–8. doi :10.1128/JVI.00250-12. PMC 3372197. PMID  22491452 . 
  8. ^ Quan PL, Firth C, Conte JM и др. (май 2013 г.). «Летучие мыши являются основным естественным резервуаром гепацивирусов и пегивирусов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 110 (20): 8194–9. Bibcode : 2013PNAS..110.8194Q . doi : 10.1073/pnas.1303037110 . PMC 3657805. PMID  23610427. 
  9. ^ Капур А., Симмондс П., Шил ТК. и др. (2013). «Идентификация гомологов вируса гепатита С и пегивирусов у грызунов». mBio . 4 (2): e00216–13. doi :10.1128/mBio.00216-13. PMC 3622934 . PMID  23572554. 
  10. ^ abcdefghijk Дюбюиссон, Жан; Коссе, Франсуа-Луик (2014). «Вирусология и клеточная биология жизненного цикла вируса гепатита С – обновление». Журнал гепатологии . 61 (1): S3–S13. doi : 10.1016/j.jhep.2014.06.031 . hdl : 20.500.12210/28720 . PMID  25443344.
  11. ^ abc Kaito, Masahiko; Ishida, Satoshi; Tanaka, Hideaki; Horiike, Shinichiro; Fujita, Naoki; Adachi, Yukihiko; Kohara, Michinori; Konishi, Masayoshi; Watanabe, Shozo (июнь 2006 г.). «Морфология частиц вируса гепатита C и гепатита B, обнаруженная с помощью иммунозолотой электронной микроскопии». Medical Molecular Morphology . 39 (2): 63–71. doi : 10.1007/s00795-006-0317-8 . ISSN  1860-1480. PMID  16821143. S2CID  24668769.
  12. ^ Op De Beeck A, Dubuisson J (2003). «Топология гликопротеинов оболочки вируса гепатита С». Rev. Med. Virol . 13 (4): 233–41. doi :10.1002/rmv.391. PMID  12820185. S2CID  22280227.
  13. ^ abc Кастелли, Маттео; Клементи, Никола; Пфафф, Дженнифер; Саутто, Джузеппе А.; Диотти, Роберта А.; Буриони, Роберто ; Доранц, Бенджамин Дж.; Даль Пераро, Маттео; Клементи, Массимо (16 марта 2017 г.). «Биологически подтвержденная структурная модель гетеродимера E1E2 HCV». Научные отчеты . 7 (1): 214. Бибкод : 2017НацСР...7..214С. дои : 10.1038/s41598-017-00320-7. ISSN  2045-2322. ПМЦ 5428263 . ПМИД  28303031. 
  14. ^ Basu, Arnab; Beyene, Aster; Meyer, Keith; Ray, Ranjit (май 2004 г.). «Гипервариабельный регион 1 гликопротеина E2 вируса гепатита C связывается с гликозаминогликанами, но это связывание не приводит к инфицированию в системе псевдотипа». Journal of Virology . 78 (9): 4478–4486. doi :10.1128/JVI.78.9.4478-4486.2004. ISSN  0022-538X. PMC 387685 . PMID  15078928. 
  15. ^ Като Н (2000). «Геном вируса гепатита С человека (HCV): организация генов, разнообразие последовательностей и вариации». Microb. Comp. Genom . 5 (3): 129–51. doi :10.1089/mcg.2000.5.129. PMID  11252351.
  16. ^ Jubin R (2001). «Гепатит C IRES: перевод перевода в терапевтическую цель». Curr. Opin. Mol. Ther . 3 (3): 278–87. PMID  11497352.
  17. ^ Berry KE, Waghray S, Mortimer SA, Bai Y, Doudna JA (октябрь 2011 г.). «Кристаллическая структура центрального домена IRES HCV раскрывает стратегию позиционирования стартового кодона». Structure . 19 (10): 1456–66. doi :10.1016/j.str.2011.08.002. PMC 3209822 . PMID  22000514. 
  18. ^ Dubuisson J (2007). «Белки вируса гепатита С». World J. Gastroenterol . 13 (17): 2406–15. doi : 10.3748/wjg.v13.i17.2406 . PMC 4146758. PMID  17552023 . 
  19. ^ Де Франческо Р. (1999). «Молекулярная вирусология вируса гепатита С». J Hepatol . 31 (Suppl 1): 47–53. doi :10.1016/S0168-8278(99)80374-2. PMID  10622560.
  20. ^ Gupta G, Qin H, Song J (2012). «Внутренне неструктурированный домен 3 вируса гепатита C NS5A образует «нечеткий комплекс» с доменом VAPB-MSP, который несет мутации, вызывающие БАС». PLOS ONE . ​​7 (6): e39261. Bibcode :2012PLoSO...739261G. doi : 10.1371/journal.pone.0039261 . PMC 3374797 . PMID  22720086. 
  21. ^ Jin, Z; Leveque, V; Ma, H; Johnson, KA; Klumpp, K (2012). «Сборка, очистка и предстационарный кинетический анализ активного РНК-зависимого комплекса удлинения РНК-полимеразы». Журнал биологической химии . 287 (13): 10674–83. doi : 10.1074/jbc.M111.325530 . PMC 3323022. PMID  22303022 . 
  22. ^ Moradpour D, Penin F, Rice CM (июнь 2007 г.). «Репликация вируса гепатита С». Nat. Rev. Microbiol . 5 (6): 453–63. doi :10.1038/nrmicro1645. PMID  17487147. S2CID  13176201.
  23. ^ Ригат К, Ван И, Худыма Т.В. и др. (ноябрь 2010 г.). «Изменения структуры полимеразы NS5B вируса гепатита С, вызванные лигандом». Antiviral Res . 88 (2): 197–206. doi :10.1016/j.antiviral.2010.08.014. PMID  20813137.
  24. ^ Biswal BK, Cherney MM, Wang M и др. (май 2005 г.). «Кристаллические структуры РНК-зависимой РНК-полимеразы генотипа 2a вируса гепатита C выявляют две конформации и предполагают механизмы ингибирования ненуклеозидными ингибиторами». J. Biol. Chem . 280 (18): 18202–10. doi : 10.1074/jbc.M413410200 . PMID  15746101.
  25. ^ O'Farrell D, Trowbridge R, Rowlands D, Jäger J (февраль 2003 г.). «Комплексы субстратов РНК-полимеразы вируса гепатита C (HC-J4): структурные доказательства импорта нуклеотидов и инициации de-novo». J. Mol. Biol . 326 (4): 1025–35. doi :10.1016/s0022-2836(02)01439-0. PMID  12589751.
  26. ^ Biswal BK, Wang M, Cherney MM и др. (август 2006 г.). «Ненуклеозидные ингибиторы, связывающиеся с полимеразой NS5B вируса гепатита С, открывают новый механизм ингибирования». J. Mol. Biol . 361 (1): 33–45. doi :10.1016/j.jmb.2006.05.074. PMID  16828488.
  27. ^ Валевски Дж. Л., Келлер ТР, Стамп Д. Д., Бранч А. Д. (2001). «Доказательства нового антигена вируса гепатита С, закодированного в перекрывающейся рамке считывания». РНК . 7 (5): 710–721. doi :10.1017/S1355838201010111. PMC 1370123. PMID  11350035 . 
  28. ^ Багбани-арани Ф., Рухванд Ф., Агасадеги М.Р., Эйди А., Амини С., Мотевалли Ф., Садат С.М., Мемарнеджадиан А., Халили Г. и др. (2012). «Экспрессия и характеристика белка ARFP/F вируса гепатита С, полученного из Escherichia coli». Мол Биол (Моск) . 46 (2): 251–9. дои : 10.1134/S0026893312020033. PMID  22670521. S2CID  7379944.
  29. ^ Bartenschlager R, Lohmann V (июль 2000 г.). «Репликация вируса гепатита С». J. Gen. Virol . 81 (Pt 7): 1631–48. CiteSeerX 10.1.1.319.8775 . doi :10.1099/0022-1317-81-7-1631 (неактивен 2024-09-18). PMID  10859368. Архивировано из оригинала 2009-12-03 . Получено 2010-07-16 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI inactive as of September 2024 (link)
  30. ^ Zeisel, M.; Barth, H.; Schuster, C.; Baumert, T. (2009). «Проникновение вируса гепатита C: молекулярные механизмы и цели для противовирусной терапии». Frontiers in Bioscience . 14 (8): 3274–3285. Bibcode : 2009CNSNS..14.3274H. doi : 10.1016/j.cnsns.2008.11.006. PMC 3235086. PMID  19273272. 
  31. ^ Кохаар, И.; Плосс, А.; Король, Э.; Му, К.; Шоггинс, Дж.; О'Брайен, Т.; Райс, К.; Прокунина-Олссон, Л. (2010). «Разнообразие сплайсинга гена OCLN человека и его биологическое значение для проникновения вируса гепатита С». Журнал вирусологии . 84 (14): 6987–6994. doi :10.1128/JVI.00196-10. PMC 2898237. PMID  20463075 . 
  32. ^ Линденбах Б., Райс К. (2005). «Раскрытие репликации вируса гепатита С от генома до функции». Nature . 436 (7053): 933–8. Bibcode :2005Natur.436..933L. doi : 10.1038/nature04077 . PMID  16107832.
  33. ^ Бранч, А.Д.; Стамп, Д.Д.; Гутьеррес, Дж.А.; Энг, Ф.; Валевски, Дж.Л. (2005). «Альтернативная рамка считывания вируса гепатита С (ARF) и ее семейство новых продуктов: белок альтернативной рамки считывания/F-белок, белок с двойным сдвигом рамки считывания и другие». Семинары по болезням печени . 25 (1): 105–117. doi :10.1055/s-2005-864786. PMID  15732002. S2CID  260316882.
  34. ^ Dubuisson J, Penin F, Moradpour D (2002). «Взаимодействие белков вируса гепатита С с мембранами и липидами клеток-хозяев». Trends Cell Biol . 12 (11): 517–523. doi :10.1016/S0962-8924(02)02383-8. PMID  12446113.
  35. ^ Egger D, Wölk B, Gosert R, Bianchi L, Blum HE, Moradpour D, Bienz K (2002). «Экспрессия белков вируса гепатита C вызывает различные изменения мембраны, включая потенциальный вирусный комплекс репликации». J Virol . 76 (12): 5974–84. doi :10.1128/JVI.76.12.5974-5984.2002. PMC 136238 . PMID  12021330. 
  36. ^ Boulant S, Douglas MW, Moody L, Budkowska A, Targett-Adams P, McLauchlan J (2008). «Основной белок вируса гепатита С индуцирует перераспределение липидных капель в зависимости от микротрубочек и динеина». Traffic . 9 (8): 1268–82. doi : 10.1111/j.1600-0854.2008.00767.x . PMID  18489704. S2CID  20609887.
  37. ^ Syed GH, Amako Y, Siddiqui A (2010). «Вирус гепатита С захватывает метаболизм липидов хозяина». Trends Endocrinol Metab . 21 (1): 33–40. doi :10.1016/j.tem.2009.07.005. PMC 2818172. PMID 19854061  . 
  38. ^ Simmonds P, Holmes EC, Cha TA и др. (ноябрь 1993 г.). «Классификация вируса гепатита С на шесть основных генотипов и ряд подтипов с помощью филогенетического анализа региона NS-5» (PDF) . J. Gen. Virol . 74 (Pt 11): 2391–9. CiteSeerX 10.1.1.325.7888 . doi :10.1099/0022-1317-74-11-2391. PMID  8245854. S2CID  17597460 . Получено 10 июля 2020 г. . 
  39. ^ Накано, Тацунори; Лау, Джиллиан MG; Лау, Грейс ML; Сугияма, Масая; Мизоками, Масаши (9 октября 2011 г.). «Обновленный анализ генотипов и подтипов вируса гепатита С на основе полной кодирующей области». Liver International . 32 (2): 339–45. doi :10.1111/j.1478-3231.2011.02684.x. PMID  22142261. S2CID  23271017.
  40. ^ Ohno O, Mizokami M, Wu RR, Saleh MG, Ohba K, Orito E, Mukaide M, Williams R, Lau JY и др. (2007). «Новая система генотипирования вируса гепатита С (HCV), которая позволяет идентифицировать генотипы HCV 1a, 1b, 2a, 2b, 3a, 3b, 4, 5a и 6a». J Clin Microbiol . 35 (1): 201–7. doi :10.1128/JCM.35.1.201-207.1997. PMC 229539. PMID  8968908 . 
  41. ^ Симмондс П; Бух Дж; Комбет С; Делеаж Ж; Эномото Н; Фейнстон С; Халфон П; Инчауспе Г; Куйкен С; Мартенс Г; Мизоками М; Мерфи, генеральный директор; Окамото, Х; Павлоцкий, Дж. М.; Пенин, Ф; Саблон, Э; Шин-И, Т; Стайвер, LJ; Тиль, Х.Дж.; Вязов С; Вайнер, Эй Джей; Уайделл, А. (2005). «Консенсусные предложения по единой системе номенклатуры генотипов вируса гепатита С». Гепатология . 42 (4): 962–73. дои : 10.1002/hep.20819 . PMID  16149085. S2CID  21393716.
  42. ^ Yu ML, Chuang WL (2009). «Лечение хронического гепатита С в Азии: когда Восток встречается с Западом». J Gastroenterol Hepatol . 24 (3): 336–345. doi : 10.1111/j.1440-1746.2009.05789.x . PMID  19335784. S2CID  27333980.
  43. ^ Muir, AJ; Bornstein, JD; Killenberg, PG; Atlantic Coast Hepatitis Treatment Group (2004). «Пегинтерферон альфа-2b и рибавирин для лечения хронического гепатита С у чернокожих и неиспаноязычных белых». N Engl J Med . 350 (22): 2265–71. doi : 10.1056/NEJMoa032502 . PMID  15163776.Исправление: doi :10.1056/nejm200409163511229
  44. ^ Ge, D; Fellay, J; Thompson, AJ; Simon, SJ; Shianna, KV; Urban, TJ; Heinzen, EL; et al. (2009). «Генетическая вариация IL28B предсказывает клиренс вируса, вызванный лечением гепатита C». Nature . 461 (7262): 399–401. Bibcode :2009Natur.461..399G. doi :10.1038/nature08309. PMID  19684573. S2CID  1707096.
  45. ^ Rose, R; Markov, PV; Lam, TT; Pybus, OG (2013). «Вирусная эволюция объясняет ассоциации между генотипом вируса гепатита С, клиническими исходами и генетическими вариациями человека». Infect Genet Evol . 20 : 418–21. Bibcode : 2013InfGE..20..418R. doi : 10.1016/j.meegid.2013.09.029. hdl : 10722/221827 . PMID  24140473.
  46. ^ Laskus T, Wang LF, Radkowski M, Vargas H, Nowicki M, Wilkinson J, Rakela J (2001). «Воздействие РНК-позитивных реципиентов вируса гепатита С (HCV) на доноров крови, положительных по РНК-HCV, приводит к быстрому преобладанию штамма одного донора и исключению и/или подавлению штамма реципиента». Журнал вирусологии . 75 (5): 2059–66. doi :10.1128/JVI.75.5.2059-2066.2001. PMC 114790 . PMID  11160710. 
  47. ^ ab Гонсалес-Канделас Ф, Лопес-Лабрадор FX, Брачо М.А. (октябрь 2011 г.). «Рекомбинация вируса гепатита С». Вирусы . 3 (10): 2006–24. дои : 10.3390/v3102006 . ПМК 3205392 . ПМИД  22069526. {{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  48. ^ ab Shepard, CW; Finelli, L; Alter, MJ (сентябрь 2005 г.). «Глобальная эпидемиология инфекции вируса гепатита С». Lancet Infect Dis . 5 (9): 558–67. doi :10.1016/S1473-3099(05)70216-4. PMID  16122679.
  49. ^ Alter, MJ (ноябрь 2011 г.). «Пути передачи вируса гепатита С: что посеешь, то и пожнешь». Semin Liver Dis . 31 (4): 340–6. doi :10.1055/s-0031-1297923. PMID  22189974. S2CID  260310609.
  50. ^ Pybus, OG; Markov, PV; Wu, A; Tatem, AJ (июль 2007 г.). «Исследование эндемической передачи вируса гепатита С». Int J Parasitol . 37 (8–9): 839–49. doi :10.1016/j.ijpara.2007.04.009. PMID  17521655.
  51. ^ Салеми М., Вандамм А.М. (2002). «Эволюционные закономерности вируса гепатита С, изученные с помощью анализа последовательностей полного генома». J Mol Evol . 54 (1): 62–70. Bibcode : 2002JMolE..54...62S. doi : 10.1007/s00239-001-0018-9 . PMID  11734899. S2CID  35899454.
  52. ^ Sarwar MT, et al. (2011). «Белок NS4A как маркер истории HCV предполагает, что различные генотипы HCV изначально произошли от генотипа 1b». Virol. J . 8 : 317. doi : 10.1186/1743-422X-8-317 . PMC 3145594 . PMID  21696641. 
  53. ^ ab Пибус О.Г., Барнс Э., Таггарт Р., Леми П., Марков П.В., Расачак Б., Сихавонг Б., Петсувана Р., Шеридан И. и др. (2009). «Генетическая история вируса гепатита С в Восточной Азии». Дж Вирол . 83 (2): 1071–82. дои : 10.1128/JVI.01501-08. ПМЦ 2612398 . ПМИД  18971279. 
  54. ^ Като Н., Уэда Й., Сэдзима Х., Гу В., Сато С., Дансако Х., Икеда М., Шимотоно К. (2019) Исследование множественных генетических вариаций, вызванных постоянной репликацией вируса гепатита С в долгосрочной культуре клеток. Arch Virol
  55. ^ Simmonds P, Smith DB (1997). «Исследование характера разнообразия вируса гепатита С в зависимости от времени передачи». Journal of Viral Hepatitis . 4 (Suppl 1): 69–74. doi :10.1111/j.1365-2893.1997.tb00163.x. PMID  9097281. S2CID  41594303.
  56. ^ Магиоркинис Г., Магиоркинис Е., Параскевис Д. и др. (декабрь 2009 г.). «Глобальное распространение вируса гепатита С 1a и 1b: филодинамический и филогеографический анализ». ПЛОС Мед . 6 (12): e1000198. doi : 10.1371/journal.pmed.1000198 . ПМЦ 2795363 . ПМИД  20041120. 
  57. ^ Марков П.В., Пепин Дж., Фрост Э., Десландес С., Лаббе AC, Pybus OG (сентябрь 2009 г.). «Филогеография и молекулярная эпидемиология генотипа 2 вируса гепатита С в Африке». Дж. Генерал Вирол . 90 (Часть 9): 2086–96. дои : 10.1099/vir.0.011569-0 . ПМИД  19474244.
  58. ^ Марков, П.В.; ван де Лаар, Ти Джей; Томас, XV; Аронсон, С.Дж.; Вигинк, CJ; ван ден Берк, GE; Принс, М.; и др. (2012). «Колониальная история и современная передача формируют генетическое разнообразие генотипа 2 вируса гепатита С в Амстердаме». Дж Вирол . 86 (14): 7677–7687. дои : 10.1128/JVI.06910-11. ПМК 3416291 . ПМИД  22573865. 
  59. ^ Simmonds P (ноябрь 2004 г.). «Генетическое разнообразие и эволюция вируса гепатита С — 15 лет спустя». J. Gen. Virol . 85 (Pt 11): 3173–88. doi : 10.1099/vir.0.80401-0 . PMID  15483230.
  60. ^ Simmonds P (2001). «Реконструкция происхождения вирусов гепатита человека». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 356 (1411): 1013–26. doi :10.1098/rstb.2001.0890. PMC 1088496. PMID  11516379 . 
  61. ^ Yu CI, Chiang BL (2010). «Новый взгляд на разработку вакцины против гепатита С». J. Biomed. Biotechnol . 2010 : 1–12. doi : 10.1155/2010/548280 . PMC 2896694. PMID  20625493 . 
  62. ^ Раух, А.; Гаудиери, С.; Тио, К.; Бохуд, П. Ю. (2009). «Генетические детерминанты хозяина спонтанного очищения от гепатита С». Фармакогеномика . 10 (11): 1819–1837. doi :10.2217/pgs.09.121. PMID  19891557.
  63. ^ Мейер В., Рамадори Г. (апрель 2009 г.). «Вирусология вируса гепатита С и новые цели лечения». Expert Rev Anti Infect Ther . 7 (3): 329–50. doi :10.1586/eri.09.12. PMID  19344246. S2CID  38411966.
  64. ^ Manns MP, Foster GR, Rockstroh JK, Zeuzem S, Zoulim F, Houghton M (декабрь 2007 г.). «Путь вперед в лечении HCV — поиск правильного пути». Nat Rev Drug Discov . 6 (12): 991–1000. doi : 10.1038/nrd2411 . PMID  18049473. S2CID  52874660.
  65. ^ Ахмед, Али Махмуд; Дохейм, Мохамед Фахми; Маттар, Омар Мохамед; Шериф, Нурин Али; Труонг, Дуй Хьеу; Фам ТЛ, Хоа; Хираяма, Кенджи; Хуй, Нгуен Тиен (май 2018 г.). «Беклабувир в сочетании с асунапревиром и даклатасвиром при инфекции вируса гепатита С генотипа 1: систематический обзор и метаанализ». J Med Virol . 90 (5): 907–918. doi :10.1002/jmv.24947. PMID  28892235. S2CID  3829214.
  66. ^ "FDA одобряет препарат Виктрелис для лечения гепатита С" (пресс-релиз) . FDA. 13 мая 2011 г.
  67. ^ Gutierrez JA, Parikh N, Branch AD (2011). «Классические и новые роли витамина D при инфекции вируса гепатита C». Semin Liver Dis . 31 (4): 387–398. doi :10.1055/s-0031-1297927. PMC 4107414. PMID 22189978  . 
  68. ^ Lange CM, Bojunga J, Ramos-Lopez E, von Wagner M, Hassler A, Vermehren J, Herrmann E, Badenhoop K, Zeuzem S и др. (2011). «Дефицит витамина D и полиморфизм промотора CYP27B1-1260 связаны с хроническим гепатитом C и плохим ответом на терапию на основе интерферона-альфа». J Hepatol . 54 (5): 887–893. doi :10.1016/j.jhep.2010.08.036. PMID  21145801. Получено 10 июля 2020 г.
  69. ^ Baur K, Mertens JC, Schmitt J, et al. (2012). «Ген рецептора витамина D bAt (CCA) гаплотип ухудшает ответ на терапию на основе пегилированного интерферона/рибавирина у пациентов с хроническим гепатитом C». Antivir. Ther . 17 (3): 541–7. doi : 10.3851/IMP2018 . PMID  22300961. S2CID  32175340.
  70. ^ Bitetto D, Fattovich G, Fabris C, Ceriani E, Falleti E, Fornasiere E, Pasino M, Ieluzzi D, Cussigh A и др. (2011). «Взаимодополняющая роль дефицита витамина D и полиморфизма интерлейкина-28B rs12979860 C/T в прогнозировании противовирусного ответа при хроническом гепатите C». Гепатология . 53 (4): 1118–26. doi : 10.1002/hep.24201 . PMID  21480318. S2CID  5329252.
  71. ^ Гал-Танамы М, Бахметов Л, Равид А, Корен Р, Эрман А, Тур-Каспа Р, Земель Р (2011). «Витамин D: врожденный противовирусный агент, подавляющий вирус гепатита С в гепатоцитах человека». Гепатология . 54 (5): 1570–9. doi : 10.1002/hep.24575 . PMID  21793032. S2CID  10090454.
  72. ^ Абу-Муч С., Файрман З., Ярчовски Дж., Зейна АР., Асси Н. (2011). «Добавки витамина D улучшают устойчивый вирусологический ответ у пациентов, не имевших опыта лечения хронического гепатита С (генотип 1)». World J Gastroenterol . 17 (47): 5184–90. doi : 10.3748/wjg.v17.i47.5184 . PMC 3243885. PMID  22215943 . 
  73. ^ Битетто Д., Фабрис С., Форнасьер Е., Пипан С., Фумоло Е., Кассиг А., Бигнулин С., Cmet С., Фонтанини Е. и др. (2011). «Добавка витамина D улучшает ответ на противовирусное лечение рецидивирующего гепатита С». Транспл Инт . 24 (1): 43–50. дои : 10.1111/j.1432-2277.2010.01141.x. PMID  20649944. S2CID  22124427.
  74. ^ Cholongitas E, Theocharidou E, Goulis J, Tsochatzis E, Akriviadis E, Burroughs K (март 2012 г.). «Обзорная статья: внескелетные эффекты витамина D при хроническом гепатите C». Aliment. Pharmacol. Ther . 35 (6): 634–46. doi : 10.1111/j.1365-2036.2012.05000.x . PMID  22316435. S2CID  25534747.
  75. ^ Какопардо Б, Камма С, Петта С, Пинцоне М.Р., Каппеллани А, Занги А, Николози А, Нуннари Г (2012). «Диагностическая и терапевтическая роль витамина D при хронической инфекции вируса гепатита С». Фронт Биосци . 1 (4): 1276–1286. дои : 10.2741/e458. ПМИД  22201953.
  76. ^ abc Halegoua-De Marzio, Dina; Fenkel, Jonathan (27 января 2014 г.). «Альтернативные лекарства при инфекции гепатита С». World Journal of Hepatology . 6 (1): 9–16. doi : 10.4254/wjh.v6.i1.9 . PMC 3953807. PMID  24653790 . 
  77. ^ Sarrazin C, Hézode C, Zeuzem S, Pawlotsky JM (2012). «Противовирусные стратегии при инфекции вируса гепатита C». J. Hepatol . 56 (Suppl 1): S88–100. doi :10.1016/S0168-8278(12)60010-5. PMID  22300469.
  78. ^ "Пресс-релиз, FDA, 6 декабря 2013 г.". Управление по контролю за продуктами и лекарствами .
  79. ^ "FDA одобряет новое лечение вируса гепатита С". Управление по контролю за продуктами и лекарствами . 22 ноября 2013 г.
  80. ^ "Медивир: Симепревир одобрен в Японии для лечения хронического гепатита С генотипа 1". The Wall Street Journal. 27 сентября 2013 г.
  81. ^ "Нобелевская премия по физиологии и медицине 2020 года". NobelPrize.org .

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме «Вирус гепатита С» .
Wikispecies содержит информацию, связанную с вирусом гепатита С.