Фермент метаболического пути гликолиза
Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (сокращенно GAPDH ) ( EC 1.2.1.12) представляет собой фермент массой около 37 кДа, который катализирует шестой этап гликолиза и, таким образом, служит для расщепления глюкозы для получения энергии и молекул углерода. В дополнение к этой давно установленной метаболической функции, GAPDH недавно был вовлечен в несколько неметаболических процессов, включая активацию транскрипции , инициацию апоптоза , [4] перемещение пузырьков ЭР-Гольджи и быстрый аксональный или аксоплазматический транспорт . [5] В сперме экспрессируется специфичный для яичек изофермент GAPDHS .
Структура
В нормальных клеточных условиях цитоплазматический GAPDH существует в основном в виде тетрамера . Эта форма состоит из четырех идентичных 37- кДа субъединиц, содержащих по одной каталитической тиоловой группе каждая, и имеет решающее значение для каталитической функции фермента. [6] [7] Ядерный GAPDH имеет повышенную изоэлектрическую точку (pI) pH 8,3–8,7. [7] Следует отметить, что остаток цистеина C152 в активном центре фермента необходим для индукции апоптоза окислительным стрессом . [7] Примечательно, что посттрансляционные модификации цитоплазматического GAPDH способствуют его функциям за пределами гликолиза. [6]
GAPDH кодируется одним геном, который производит один транскрипт мРНК с 8 вариантами сплайсинга, хотя изоформа существует как отдельный ген, который экспрессируется только в сперматозоидах . [7]
Реакция
Соединение C00118 в базе данных путей KEGG . Фермент 1.2.1.12 в базе данных путей KEGG . Реакция R01063 в базе данных путей KEGG . Соединение C00236 в базе данных путей KEGG .
Двухэтапное преобразование G3P
Первая реакция — окисление глицеральдегид-3-фосфата (G3P) в положении 1 (на схеме он показан как 4-й углерод гликолиза), в котором альдегид превращается в карбоновую кислоту (ΔG°'=-50 кДж/моль (−12 ккал/моль)), а НАД+ одновременно восстанавливается эндергонически до НАДН.
Энергия, высвобождаемая в результате этой высокоэкзергонической реакции окисления, запускает вторую эндергоническую реакцию (ΔG°'=+50 кДж/моль (+12 ккал/моль)), в которой молекула неорганического фосфата переносится на промежуточное соединение GAP с образованием продукта с высоким потенциалом переноса фосфорила: 1,3-бисфосфоглицерата (1,3-BPG).
Это пример фосфорилирования, сопряженного с окислением, и общая реакция является несколько эндергонической (ΔG°'=+6,3 кДж/моль (+1,5)). Энергетическое сопряжение здесь становится возможным благодаря GAPDH.
Механизм
GAPDH использует ковалентный катализ и общий основный катализ для снижения очень большой энергии активации второго этапа (фосфорилирования) этой реакции.
1: Окисление
Во-первых, остаток цистеина в активном центре GAPDH атакует карбонильную группу G3P, создавая промежуточное соединение гемитиоацеталь (ковалентный катализ).
Гемитиоацеталь депротонируется остатком гистидина в активном центре фермента (общий основный катализ). Депротонирование способствует восстановлению карбонильной группы в последующем тиоэфирном промежуточном соединении и выбросу гидрид-иона .
Затем соседняя, прочно связанная молекула НАД + принимает ион гидрида , образуя НАДН , в то время как гемитиоацеталь окисляется до тиоэфира .
Этот тиоэфирный вид гораздо более энергичен (менее стабилен), чем вид карбоновой кислоты , который получился бы при окислении G3P в отсутствие GAPDH (вид карбоновой кислоты настолько низкоэнергетичен, что энергетический барьер для второго этапа реакции (фосфорилирования) был бы слишком высок, а реакция, следовательно, слишком медленной и неблагоприятной для живого организма).
2: Фосфорилирование
NADH покидает активный сайт и заменяется другой молекулой NAD + , положительный заряд которой стабилизирует отрицательно заряженный карбонильный кислород в переходном состоянии следующего и конечного шага. Наконец, молекула неорганического фосфата атакует тиоэфир и образует тетраэдрический промежуточный продукт, который затем разрушается с высвобождением 1,3-бисфосфоглицерата и тиоловой группы остатка цистеина фермента.
Регулирование
Этот белок может использовать модель аллостерической регуляции морфеина . [8]
Функция
Метаболический
Как следует из названия, глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (GAPDH) катализирует превращение глицеральдегид-3-фосфата в D - глицерат-1,3-бисфосфат . Это 6-й шаг в гликолитическом расщеплении глюкозы, важном пути подачи энергии и молекул углерода, который происходит в цитозоле эукариотических клеток. Превращение происходит в два сопряженных шага. Первый является благоприятным и позволяет произойти второму неблагоприятному шагу.
Адгезия
Одной из дополнительных функций GAPDH является его роль в адгезии и связывании с другими партнерами. Известно, что бактериальный GAPDH из Mycoplasma и Streptococcus и грибковый GAPDH из Paracoccidioides brasiliensis связываются с компонентом внеклеточного матрикса человека и участвуют в адгезии. [9] [10] [11] Обнаружено, что GAPDH связан с поверхностью, способствуя адгезии, а также конкурентному исключению вредных патогенов. [12] Обнаружено, что GAPDH из Candida albicans связан с клеточной стенкой и связывается с фибронектином и ламинином . [13] Известно, что GAPDH из пробиотических видов связывается с муцином толстой кишки человека и ECM, что приводит к усилению колонизации пробиотиков в кишечнике человека. [14] [15] [16] Patel D. et al. показали, что GAPDH Lactobacillus acidophilus связывается с муцином, участвуя в адгезии. [17]
Транскрипция и апоптоз
GAPDH может сам по себе активировать транскрипцию . Комплекс коактиватора транскрипции OCA-S содержит GAPDH и лактатдегидрогеназу , два белка, которые ранее считались участвующими только в метаболизме . GAPDH перемещается между цитозолем и ядром и, таким образом, может связывать метаболическое состояние с транскрипцией генов. [18]
В 2005 году Хара и др. показали, что GAPDH инициирует апоптоз . Это не третья функция, но ее можно рассматривать как активность, опосредованную связыванием GAPDH с ДНК , как при активации транскрипции, обсуждавшейся выше. Исследование показало, что GAPDH S-нитрозилируется NO в ответ на клеточный стресс, что заставляет его связываться с белком SIAH1 , убиквитинлигазой . Комплекс перемещается в ядро, где Siah1 нацеливается на ядерные белки для деградации , тем самым инициируя контролируемое отключение клетки. [19] В последующем исследовании группа продемонстрировала, что депренил , который использовался клинически для лечения болезни Паркинсона , сильно снижает апоптотическое действие GAPDH, предотвращая его S-нитрозилирование и, таким образом, может использоваться в качестве лекарственного средства. [20]
Метаболический переключатель
GAPDH действует как обратимый метаболический переключатель при окислительном стрессе. [21] Когда клетки подвергаются воздействию окислителей , им требуется избыточное количество антиоксидантного кофактора НАДФН . В цитозоле НАДФН восстанавливается из НАДФ+ несколькими ферментами, три из которых катализируют первые этапы пентозофосфатного пути . Обработка оксидантами вызывает инактивацию GAPDH. Эта инактивация временно перенаправляет метаболический поток с гликолиза на пентозофосфатный путь, позволяя клетке генерировать больше НАДФН. [22] В условиях стресса НАДФН необходим некоторым антиоксидантным системам, включая глутаредоксин и тиоредоксин , а также необходим для рециркуляции глутатиона .
Транспорт из ЭР в аппарат Гольджи
GAPDH также, по-видимому, участвует в транспорте везикул из эндоплазматического ретикулума (ER) в аппарат Гольджи , который является частью маршрута доставки секретируемых белков. Было обнаружено, что GAPDH рекрутируется rab2 в везикулярно - трубчатые кластеры ER, где он помогает формировать везикулы COP 1. GAPDH активируется посредством фосфорилирования тирозина Src . [23]
Дополнительные функции
GAPDH, как и многие другие ферменты, имеет множество функций. Помимо катализа 6-го этапа гликолиза , недавние данные указывают на участие GAPDH в других клеточных процессах. Было описано, что GAPDH проявляет многофункциональность более высокого порядка в контексте поддержания гомеостаза клеточного железа [24] , в частности, как шаперонный белок для лабильного гема внутри клеток. [25] Это стало неожиданностью для исследователей, но с эволюционной точки зрения имеет смысл повторно использовать и адаптировать существующие белки вместо того, чтобы разрабатывать новый белок с нуля.
Использовать как контроль загрузки
Поскольку ген GAPDH часто стабильно и конститутивно экспрессируется на высоких уровнях в большинстве тканей и клеток, он считается геном домашнего хозяйства . По этой причине GAPDH обычно используется биологическими исследователями в качестве контроля нагрузки для вестерн-блоттинга и в качестве контроля для qPCR . Однако исследователи сообщили о различной регуляции GAPDH при определенных условиях. [26] Например, было показано , что фактор транскрипции MZF-1 регулирует ген GAPDH. [27] Гипоксия также сильно повышает регуляцию GAPDH. [28] Поэтому использование GAPDH в качестве контроля нагрузки следует рассматривать с осторожностью.
Распределение по клеточному каналу
Все этапы гликолиза происходят в цитозоле , как и реакция, катализируемая GAPDH. В эритроцитах GAPDH и несколько других гликолитических ферментов собираются в комплексы на внутренней стороне клеточной мембраны . Процесс, по-видимому, регулируется фосфорилированием и оксигенацией. [29] Ожидается, что сближение нескольких гликолитических ферментов друг с другом значительно увеличит общую скорость расщепления глюкозы. Недавние исследования также показали, что GAPDH экспрессируется в зависимости от железа на внешней стороне клеточной мембраны, где он играет роль в поддержании гомеостаза клеточного железа. [30] [31]
Клиническое значение
Рак
GAPDH сверхэкспрессируется при множественных видах рака у человека, таких как кожная меланома , и его экспрессия положительно коррелирует с прогрессированием опухоли. [32] [33] Его гликолитические и антиапоптотические функции способствуют пролиферации и защите опухолевых клеток, способствуя возникновению опухолей . В частности, GAPDH защищает от укорочения теломер , вызванного химиотерапевтическими препаратами, которые стимулируют сфинголипидный церамид . Между тем, такие состояния, как окислительный стресс , нарушают функцию GAPDH, что приводит к старению и смерти клеток. [7] Более того, истощение GAPDH удалось вызвать старение в опухолевых клетках, тем самым представляя новую терапевтическую стратегию для контроля роста опухоли. [34]
Нейродегенерация
GAPDH вовлечен в несколько нейродегенеративных заболеваний и расстройств, в основном через взаимодействия с другими белками, специфичными для этого заболевания или расстройства. Эти взаимодействия могут влиять не только на энергетический метаболизм, но и на другие функции GAPDH. [6] Например, взаимодействия GAPDH с белком-предшественником бета-амилоида (betaAPP) могут мешать его функции в отношении цитоскелета или мембранного транспорта, в то время как взаимодействия с хантингтином могут мешать его функции в отношении апоптоза, ядерного транспорта тРНК , репликации ДНК и репарации ДНК . Кроме того, ядерная транслокация GAPDH была зарегистрирована при болезни Паркинсона (БП), и несколько антиапоптотических препаратов для БП, таких как разагилин , действуют, предотвращая ядерную транслокацию GAPDH. Предполагается, что гипометаболизм может быть одним из факторов, способствующих БП, но точные механизмы, лежащие в основе участия GAPDH в нейродегенеративных заболеваниях, еще предстоит выяснить. [35] Однонуклеотидный полиморфизм rs3741916 в 5'- нетранслируемой области гена GAPDH может быть связан с поздним началом болезни Альцгеймера . [36]
Взаимодействия
Партнеры по связыванию белков
GAPDH участвует в ряде биологических функций посредством белок-белковых взаимодействий с:
- тубулин для облегчения связывания микротрубочек; [6]
- актин для облегчения полимеризации актина; [6]
- VDAC1 индуцирует проницаемость митохондриальной мембраны (ММП) и апоптоз; [6]
- Рецептор инозитола 1,4,5-трифосфата для регуляции внутриклеточной сигнализации Ca2+ ; [6]
- Oct-1 формирует коактиваторный комплекс OCA-S, который необходим для синтеза гистона H2B во время фазы S клеточного цикла ; [7]
- p22 помогает в организации микротрубочек ; [7]
- Rab2 для облегчения транспорта эндоплазматического ретикулума (ЭР) – Гольджи ; [7]
- Трансферрин на поверхности различных клеток и во внеклеточной жидкости; [7] [31] [37]
- Лактатдегидрогеназа ; [7]
- Лактоферрин; [38]
- Апуриновая/апиримидиновая эндонуклеаза ( APE1 ), таким образом преобразующая окисленный APE1 в его восстановленную форму, чтобы перезапустить его эндонуклеазную активность; [7]
- Промиелоцитарный лейкозный белок (ПМЛ) в РНК -зависимой форме; [7]
- Rheb для секвестрации ГТФазы в условиях низкого уровня глюкозы; [7]
- Siah1 образует комплекс, который перемещается в ядро, где он убиквитинирует и разрушает ядерные белки в условиях нитрозативного стресса; [7]
- Конкурент GAPDH белка Siah улучшает жизнь (GOSPEL), блокируя взаимодействие GAPDH с Siah1 и, таким образом, гибель клеток в ответ на окислительный стресс; [7]
- p300/ CREB-связывающий белок (CBP), который ацетилирует GAPDH и, в свою очередь, усиливает ацетилирование дополнительных апоптотических мишеней; [7]
- специфическая для скелетных мышц Ca2+/кальмодулин-зависимая протеинкиназа; [7]
- Акт ; [7]
- Белок -предшественник бета-амилоида (betaAPP); [35]
- Хантингтин . [35]
- GAPDH может самоассоциироваться в гомотипические олигомеры/агрегаты
Партнеры по связыванию нуклеиновых кислот
GAPDH связывается с одноцепочечной РНК [39] и ДНК, а также был идентифицирован ряд партнеров по связыванию нуклеиновых кислот: [7]
Ингибиторы
Интерактивная карта маршрутов
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. [§ 1]
- ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «GlycolysisGluconeogenesis_WP534».
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000111640 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Тарз А., Денио А., Ле Брас М., Майье Э., Молле Д., Ларошетт Н., Замзами Н., Ян Г., Кремер Г., Бреннер С. (апрель 2007 г.). «GAPDH, новый регулятор проапоптотической проницаемости митохондриальных мембран». Онкоген . 26 (18): 2606–2620. дои : 10.1038/sj.onc.1210074. PMID 17072346. S2CID 20291542.
- ^ Зала Д., Хинкельман М.В., Ю Х., Лира да Кунья М.М., Лиот Г., Кордельер Ф.П., Марко С., Сауду Ф. (январь 2013 г.). «Везикулярный гликолиз обеспечивает запас энергии для быстрого аксонального транспорта». Клетка . 152 (3): 479–491. дои : 10.1016/j.cell.2012.12.029 . ПМИД 23374344.
- ^ abcdefg Tristan C, Shahani N, Sedlak TW, Sawa A (февраль 2011 г.). «Разнообразные функции GAPDH: взгляды из разных субклеточных компартментов». Cellular Signalling . 23 (2): 317–323. doi : 10.1016 /j.cellsig.2010.08.003. PMC 3084531. PMID 20727968.
- ^ abcdefghijklmnopqrs Nicholls C, Li H, Liu JP (август 2012 г.). «GAPDH: общий фермент с необычными функциями». Клиническая и экспериментальная фармакология и физиология . 39 (8): 674–679. doi :10.1111/j.1440-1681.2011.05599.x. PMID 21895736. S2CID 23499684.
- ^ Selwood T, Jaffe EK (март 2012). «Динамические диссоциирующие гомоолигомеры и контроль функции белка». Архивы биохимии и биофизики . 519 (2): 131–143. doi :10.1016/j.abb.2011.11.020. PMC 3298769. PMID 22182754 .
- ^ Dumke R, Hausner M, Jacobs E (август 2011 г.). «Роль глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы Mycoplasma pneumoniae (GAPDH) в опосредовании взаимодействий с внеклеточным матриксом человека». Микробиология . 157 (ч. 8): 2328–2338. doi : 10.1099/mic.0.048298-0 . PMID 21546586.
- ^ Brassard J, Gottschalk M, Quessy S (август 2004 г.). «Клонирование и очистка глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы Streptococcus suis серотипа 2 и ее участие в качестве адгезина». Ветеринарная микробиология . 102 (1–2): 87–94. doi :10.1016/j.vetmic.2004.05.008. PMID 15288930.
- ^ Barbosa MS, Báo SN, Andreotti PF, de Faria FP, Felipe MS, dos Santos Feitosa L, Mendes-Giannini MJ, Soares CM (январь 2006 г.). «Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа Paracoccidioides brasiliensis — это белок клеточной поверхности, участвующий в адгезии грибов к белкам внеклеточного матрикса и взаимодействии с клетками». Инфекция и иммунитет . 74 (1): 382–389. doi :10.1128/IAI.74.1.382-389.2006. PMC 1346668. PMID 16368993 .
- ^ Ramiah K, van Reenen CA, Dicks LM (1 июля 2008 г.). «Поверхностно-связанные белки Lactobacillus plantarum 423, способствующие адгезии клеток Caco-2, и их роль в конкурентном исключении и вытеснении Clostridium sporogenes и Enterococcus faecalis». Исследования в области микробиологии . 159 (6): 470–475. doi : 10.1016/j.resmic.2008.06.002 . PMID 18619532.
- ^ Gozalbo D, Gil-Navarro I, Azorín I, Renau-Piqueras J, Martínez JP, Gil ML (май 1998). «Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа, ассоциированная с клеточной стенкой Candida albicans, также является белком, связывающим фибронектин и ламинин». Инфекция и иммунитет . 66 (5): 2052–2059. doi :10.1128/IAI.66.5.2052-2059.1998. PMC 108162. PMID 9573088 .
- ^ Deng Z, Dai T, Zhang W, Zhu J, Luo XM, Fu D, Liu J, Wang H (декабрь 2020 г.). «Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа увеличивает адгезию Lactobacillus reuteri к муцину хозяина для усиления пробиотических эффектов». Международный журнал молекулярных наук . 21 (24): 9756. doi : 10.3390/ijms21249756 . PMC 7766874. PMID 33371288 .
- ^ Киносита Х, Учида Х, Каваи Ю, Кавасаки Т, Вакахара Н, Мацуо Х, Ватанабе М, Китазава Х, Онума С, Миура К, Хории А, Сайто Т (июнь 2008 г.). «Клеточная поверхность Lactobacillus plantarum LA 318 глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (GAPDH) прикрепляется к муцину толстой кишки человека». Журнал прикладной микробиологии . 104 (6): 1667–1674. дои : 10.1111/j.1365-2672.2007.03679.x. PMID 18194256. S2CID 22346488.
- ^ Киносита Х, Вакахара Н, Ватанабэ М, Кавасаки Т, Мацуо Х, Каваи И, Китазава Х, Онума С, Миура К, Хории А, Сайто Т (1 ноября 2008 г.). "Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа клеточной поверхности (GAPDH) Lactobacillus plantarum LA 318 распознает антигены групп крови человека A и B". Исследования в области микробиологии . 159 (9–10): 685–691. doi : 10.1016/j.resmic.2008.07.005 . PMID 18790050.
- ^ Patel DK, Shah KR, Pappachan A, Gupta S, Singh DD (октябрь 2016 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика муцин-связывающего GAPDH из Lactobacillus acidophilus». International Journal of Biological Macromolecules . 91 : 338–346. doi : 10.1016/j.ijbiomac.2016.04.041. PMID 27180300.
- ^ Zheng L, Roeder RG, Luo Y (июль 2003 г.). «Активация S-фазы промотора гистона H2B с помощью OCA-S, коактиваторного комплекса, содержащего GAPDH в качестве ключевого компонента». Cell . 114 (2): 255–266. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00552-X . PMID 12887926. S2CID 5543647.
- ^ Hara MR, Agrawal N, Kim SF, Cascio MB, Fujimuro M, Ozeki Y, Takahashi M, Cheah JH, Tankou SK, Hester LD, Ferris CD, Hayward SD, Snyder SH, Sawa A (июль 2005 г.). «S-нитрозилированный GAPDH инициирует апоптотическую гибель клеток путем ядерной транслокации после связывания Siah1». Nature Cell Biology . 7 (7): 665–674. doi :10.1038/ncb1268. PMID 15951807. S2CID 1922911.
- ^ Hara MR, Thomas B, Cascio MB, Bae BI, Hester LD, Dawson VL, Dawson TM, Sawa A, Snyder SH (март 2006 г.). «Нейропротекция путем фармакологической блокады каскада смерти GAPDH». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (10): 3887–3889. Bibcode : 2006PNAS..103.3887H. doi : 10.1073/pnas.0511321103 . PMC 1450161. PMID 16505364 .
- ^ Agarwal AR, Zhao L, Sancheti H, Sundar IK, Rahman I, Cadenas E (ноябрь 2012 г.). «Кратковременное воздействие сигаретного дыма вызывает обратимые изменения в энергетическом метаболизме и клеточном окислительно-восстановительном статусе независимо от воспалительных реакций в легких мышей». American Journal of Physiology. Lung Cellular and Molecular Physiology . 303 (10): L889–L898. doi :10.1152/ajplung.00219.2012. PMID 23064950.
- ^ Ralser M, Wamelink MM, Kowald A, Gerisch B, Heeren G, Struys EA, Klipp E, Jakobs C, Breitenbach M, Lehrach H, Krobitsch S (декабрь 2007 г.). «Динамическое изменение маршрута потока углеводов является ключом к противодействию окислительному стрессу». Journal of Biology . 6 (4): 10. doi : 10.1186/jbiol61 . PMC 2373902 . PMID 18154684.
- ^ Tisdale EJ, Artalejo CR (июнь 2007 г.). «Мутант GAPDH, дефектный в Src-зависимом фосфорилировании тирозина, препятствует событиям, опосредованным Rab2». Traffic . 8 (6): 733–741. doi :10.1111/j.1600-0854.2007.00569.x. PMC 3775588 . PMID 17488287.
- ^ Boradia VM, Raje M, Raje CI (декабрь 2014 г.). «Подработка белка в метаболизме железа: глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (GAPDH)». Труды биохимического общества . 42 (6): 1796–1801. doi :10.1042/BST20140220. PMID 25399609.
- ^ Sweeny EA, Singh AB, Chakravarti R, Martinez-Guzman O, Saini A, Haque MM, Garee G, Dans PD, Hannibal L, Reddi AR, Stuer DJ (сентябрь 2018 г.). «Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа — это шаперон, который распределяет лабильный гем в клетках». Журнал биологической химии . 293 (37): 14557–14568. doi : 10.1074/jbc.RA118.004169 . PMC 6139559. PMID 30012884 .
- ^ Barber RD, Harmer DW, Coleman RA, Clark BJ (май 2005 г.). «GAPDH как ген домашнего хозяйства: анализ экспрессии мРНК GAPDH в панели из 72 тканей человека». Physiological Genomics . 21 (3): 389–395. CiteSeerX 10.1.1.459.7039 . doi :10.1152/physiolgenomics.00025.2005. PMID 15769908.
- ^ Piszczatowski RT, Rafferty BJ, Rozado A, Tobak S, Lents NH (август 2014). «Ген глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (GAPDH) регулируется миелоидным цинковым пальцем 1 (MZF-1) и индуцируется кальцитриолом». Biochemical and Biophysical Research Communications . 451 (1): 137–141. doi :10.1016/j.bbrc.2014.07.082. PMID 25065746.
- ^ Saygin D, Tabib T, Bittar HE, Valenzi E, Sembrat J, Chan SY, Rojas M, Lafyatis R (2008). «Транскрипционное профилирование популяций клеток легких при идиопатической легочной артериальной гипертензии». Легочное кровообращение . 10 (1): 239–243. doi :10.1007/s11684-008-0045-7. PMC 7052475. PMID 32166015. S2CID 85327763 .
- ^ Campanella ME, Chu H, Low PS (февраль 2005 г.). «Сборка и регуляция комплекса гликолитических ферментов на мембране эритроцитов человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (7): 2402–2407. Bibcode : 2005PNAS..102.2402C. doi : 10.1073/pnas.0409741102 . PMC 549020. PMID 15701694 .
- ^ Sirover MA (декабрь 2014 г.). «Структурный анализ функционального разнообразия глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 57 : 20–26. doi : 10.1016/j.biocel.2014.09.026. PMC 4268148. PMID 25286305 .
- ^ ab Kumar S, Sheokand N, Mhadeshwar MA, Raje CI, Raje M (январь 2012 г.). «Характеристика глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы как нового рецептора трансферрина». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 44 (1): 189–199. doi :10.1016/j.biocel.2011.10.016. PMID 22062951.
- ^ Рамос Д., Пеллин-Карселен А., Агусти Дж., Мурги А., Хорда Э., Пеллин А., Монтеагудо С. (январь 2015 г.). «Дерегуляция экспрессии глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы во время прогрессирования опухоли меланомы кожи человека». Противораковые исследования . 35 (1): 439–444. ПМИД 25550585.
- ^ Wang D, Moothart DR, Lowy DR, Qian X (2013). «Экспрессия генов глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы, ассоциированной с клеточным циклом (GACC), коррелирует со стадией рака и плохой выживаемостью у пациентов с солидными опухолями». PLOS ONE . 8 (4): e61262. Bibcode :2013PLoSO...861262W. doi : 10.1371/journal.pone.0061262 . PMC 3631177 . PMID 23620736.
- ^ Phadke M, Krynetskaia N, Mishra A, Krynetskiy E (июль 2011 г.). «Фенотип ускоренного клеточного старения клеток карциномы легких человека с истощенным GAPDH». Biochemical and Biophysical Research Communications . 411 (2): 409–415. doi :10.1016/j.bbrc.2011.06.165. PMC 3154080. PMID 21749859 .
- ^ abc Mazzola JL, Sirover MA (октябрь 2002 г.). «Изменение внутриклеточной структуры и функции глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы: общий фенотип нейродегенеративных расстройств?». Neurotoxicology . 23 (4–5): 603–609. doi :10.1016/s0161-813x(02)00062-1. PMID 12428732.
- ^ Allen M, Cox C, Belbin O, Ma L, Bisceglio GD, Wilcox SL, Howell CC, Hunter TA, Culley O, Walker LP, Carrasquillo MM, Dickson DW, Petersen RC, Graff-Radford NR, Younkin SG, Ertekin-Taner N (январь 2012 г.). «Ассоциация и гетерогенность в локусе GAPDH при болезни Альцгеймера». Neurobiology of Aging . 33 (1): 203.e25–203.e33. doi :10.1016/j.neurobiolaging.2010.08.002. PMC 3017231. PMID 20864222 .
- ^ Raje CI, Kumar S, Harle A, Nanda JS, Raje M (февраль 2007 г.). «Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа поверхности макрофагальных клеток — новый рецептор трансферрина». Журнал биологической химии . 282 (5): 3252–3261. doi : 10.1074/jbc.M608328200 . PMID 17121833.
- ^ Чаухан AS, Рават P, Малхотра H, Шеоканд N, Кумар M, Патидар A, Чаудхари S, Джакхар P, Радже CI, Радже M (декабрь 2015 г.). «Секретная многофункциональная глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа секвестрирует лактоферрин и железо в клетки через неканонический путь». Scientific Reports . 5 : 18465. Bibcode :2015NatSR...518465C. doi :10.1038/srep18465. PMC 4682080 . PMID 26672975.
- ^ White MR, Khan MM, Deredge D, Ross CR, Quintyn R, Zucconi BE, Wysocki VH, Wintrode PL, Wilson GM, Garcin ED (январь 2015 г.). «Мутация интерфейса димера в глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназе регулирует ее связывание с AU-богатой РНК». Журнал биологической химии . 290 (3): 1770–1785. doi : 10.1074/jbc.M114.618165 . PMC 4340419. PMID 25451934 .
- ^ abc Gerlach M, Reichmann H, Riederer P (2012). «Критический обзор доказательств доклинических различий между разагилином и селегилином». Базальные ганглии . 2 (4): S9–S15. doi :10.1016/j.baga.2012.04.032.
Дальнейшее чтение
- Воет Д., Воет Дж.Г. (2010). Биохимия . Нью-Йорк: Уайли. ISBN 978-0-470-57095-1.
- Stryer L, Berg JM, Tymoczko JL (2002). Биохимия, пятое издание и тетрадь лекций . Сан-Франциско: WH Freeman. ISBN 978-0-7167-9804-0.
- диаграмма механизма реакции GAPDH из Lodish MCB на книжной полке NCBI
- похожая диаграмма из книги Альберта «Клетка» на книжной полке NCBI
Внешние ссылки
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы человека.