Запрограммированная клеточная смерть ( PCD ; иногда называемая клеточным самоубийством [1] ) — это смерть клетки в результате событий внутри клетки, таких как апоптоз или аутофагия . [2] [3] PCD осуществляется в ходе биологического процесса , который обычно дает преимущества в течение жизненного цикла организма . Например, дифференцировка пальцев рук и ног у развивающегося человеческого эмбриона происходит вследствие апоптоза клеток между пальцами рук ; в результате цифры становятся отдельными. PCD выполняет фундаментальные функции в процессе развития тканей как растений , так и животных .
Апоптоз и аутофагия являются формами запрограммированной гибели клеток. [4] Некроз — это гибель клетки, вызванная внешними факторами, такими как травма или инфекция, и встречается в нескольких различных формах. Долгое время некроз рассматривался как нефизиологический процесс, возникающий в результате инфекции или травмы, [4] но в 2000-х годах форма запрограммированного некроза, называемая некроптозом , [5] была признана альтернативной формой запрограммированной гибели клеток. . Предполагается, что некроптоз может служить резервной копией апоптоза при гибели клеток, когда передача сигналов апоптоза блокируется эндогенными или экзогенными факторами, такими как вирусы или мутации. Совсем недавно были обнаружены и другие типы регулируемого некроза, которые имеют несколько общих сигнальных событий с некроптозом и апоптозом. [6]
Концепция «запрограммированной гибели клеток» была использована Локшином и Уильямсом [7] в 1964 году в отношении развития тканей насекомых , примерно за восемь лет до того, как был придуман термин «апоптоз». Однако термин PCD был источником путаницы, и Дюран и Рэмси [8] разработали эту концепцию, предоставив механистические и эволюционные определения. PCD стал общим термином, обозначающим все различные типы гибели клеток, имеющие генетический компонент.
Первое понимание механизма пришло в результате изучения BCL2 , продукта предполагаемого онкогена , активируемого хромосомными транслокациями , часто встречающимися при фолликулярной лимфоме . В отличие от других генов рака, которые способствуют раку , стимулируя пролиферацию клеток, BCL2 способствует развитию рака, не давая клеткам лимфомы уничтожить себя. [9]
ПКС является предметом растущего внимания и исследовательских усилий. Эта тенденция была подчеркнута присуждением Нобелевской премии по физиологии и медицине в 2002 году Сидни Бреннеру ( Великобритания ) , Х. Роберту Хорвицу (США) и Джону Э. Салстону (Великобритания). [10]
Апоптоз — это процесс запрограммированной гибели клеток (ПКС), который может происходить в многоклеточных организмах . [12] Биохимические события приводят к характерным изменениям клеток ( морфологии ) и их гибели. Эти изменения включают пузырение , сокращение клеток, фрагментацию ядра , конденсацию хроматина и фрагментацию хромосомной ДНК . Сейчас считается, что в контексте развития клетки побуждаются к совершению самоубийства, находясь в гомеостатическом контексте; отсутствие определенных факторов выживания может стать толчком к самоубийству. По-видимому, существуют некоторые различия в морфологии и биохимии этих путей самоубийства; некоторые идут по пути «апоптоза», другие следуют более общему пути делеции, но оба обычно имеют генетическую и синтетическую мотивацию. Есть некоторые свидетельства того, что определенные симптомы «апоптоза», такие как активация эндонуклеазы, могут быть ложно индуцированы без участия генетического каскада, однако предположительно истинный апоптоз и запрограммированная гибель клеток должны быть генетически опосредованы. Также становится ясно, что митоз и апоптоз каким-то образом переключаются или связаны между собой и что достигнутый баланс зависит от сигналов, полученных от соответствующих факторов роста или выживания. [13]
Макроаутофагия , часто называемая аутофагией , представляет собой катаболический процесс, который приводит к аутофагосомно - лизосомной деградации основного содержимого цитоплазмы , аномальным белковым агрегатам и избытку или повреждению органелл .
Аутофагия обычно активируется в условиях дефицита питательных веществ , но также связана с физиологическими и патологическими процессами, такими как развитие, дифференцировка, нейродегенеративные заболевания , стресс , инфекции и рак .
Критическим регулятором индукции аутофагии является киназа mTOR , которая при активации подавляет аутофагию , а когда не активируется, стимулирует ее. Три родственные серин / треониновые киназы, UNC-51-подобные киназы -1, -2 и -3 (ULK1, ULK2, UKL3), которые играют ту же роль, что и дрожжевой Atg1 , действуют ниже комплекса mTOR . ULK1 и ULK2 образуют большой комплекс с гомологом продукта гена, связанного с аутофагией (Atg) млекопитающих (mAtg13) и каркасным белком FIP200. Комплекс PI3K класса III, содержащий hVps34, Beclin-1 , p150 и Atg14-подобный белок или ген, связанный с устойчивостью к ультрафиолетовому облучению (UVRAG), необходим для индукции аутофагии.
Гены ATG контролируют образование аутофагосом посредством комплексов ATG12 - ATG5 и LC3-II ( ATG8 - II ). ATG12 конъюгируется с ATG5 в ходе убиквитин -подобной реакции, для которой необходимы ATG7 и ATG10 . Конъюгат Atg12-Atg5 затем нековалентно взаимодействует с ATG16, образуя большой комплекс. LC3/ ATG8 расщепляется на С-конце протеазой ATG4 с образованием цитозольного LC3-I. LC3-I конъюгируется с фосфатидилэтаноламином (PE) также в ходе убиквитиноподобной реакции, для которой требуются Atg7 и Atg3. Липидированная форма LC3, известная как LC3-II, прикрепляется к мембране аутофагосомы.
Аутофагия и апоптоз связаны как положительно, так и отрицательно, и между ними существует обширное перекрестное взаимодействие. При дефиците питательных веществ аутофагия действует как механизм выживания, однако чрезмерная аутофагия может привести к гибели клеток — процессу, морфологически отличному от апоптоза . Некоторые проапоптотические сигналы , такие как TNF , TRAIL и FADD , также вызывают аутофагию. Кроме того, Bcl-2 ингибирует Beclin-1 -зависимую аутофагию, тем самым действуя как регулятор, способствующий выживанию, и как антиаутофагический регулятор.
Помимо двух вышеупомянутых типов ПКС, были обнаружены и другие пути. [14] Названные «неапоптотической запрограммированной смертью клеток» (или « каспазо -независимой запрограммированной смертью клеток» или «некроптозом»), эти альтернативные пути смерти так же эффективны, как апоптоз, и могут функционировать либо как резервные механизмы, либо как основной механизм. тип ПКД.
Другие формы запрограммированной гибели клеток включают аноикис , почти идентичный апоптозу, за исключением его индукции; ороговение , форма гибели клеток, затрагивающая только глаза; эксайтотоксичность ; ферроптоз , железозависимая форма гибели клеток [15] и валлеровская дегенерация .
Некроптоз — это запрограммированная форма некроза или воспалительной гибели клеток. Традиционно некроз связан с незапрограммированной гибелью клеток в результате повреждения клеток или проникновения патогенов, в отличие от упорядоченной, запрограммированной гибели клеток посредством апоптоза . Немоз — еще одна запрограммированная форма некроза, происходящая в фибробластах . [16]
Эриптоз – форма суицидальной гибели эритроцитов . [17]
Апонекроз представляет собой гибрид апоптоза и некроза и относится к неполному апоптотическому процессу, который завершается некрозом. [18]
НЕТоз — это процесс гибели клеток, вызванный СЭТ . [19]
Параптоз — это еще один тип неапоптотической гибели клеток, опосредованный МАРК посредством активации IGF-1 . Для него характерно внутриклеточное образование вакуолей и набухание митохондрий. [20]
Пироптоз , воспалительный тип гибели клеток, уникальным образом опосредуется каспазой 1 , ферментом, не участвующим в апоптозе, в ответ на инфекцию определенными микроорганизмами. [20]
Растительные клетки подвергаются особым процессам ПКС, подобным аутофагической гибели клеток. Однако некоторые общие черты PCD высоко консервативны как у растений, так и у многоклеточных животных.
Атрофический фактор – это сила, вызывающая гибель клетки . Только естественные силы, действующие на клетку, считаются атрофическими факторами, тогда как, например, агенты механического или химического воздействия или лизис клетки не считаются атрофическими факторами. [ кем? ] Распространенными типами атрофических факторов являются: [21]
Первоначальное расширение развивающейся нервной системы уравновешивается удалением нейронов и их отростков. [22] Во время развития нервной системы почти 50% развивающихся нейронов естественным образом удаляются в результате запрограммированной гибели клеток (PCD). [23] PCD в нервной системе был впервые обнаружен в 1896 году Джоном Бирдом. [24] С тех пор было предложено несколько теорий, объясняющих его биологическое значение во время развития нервной системы . [25]
ПКС в развивающейся нервной системе наблюдается как в пролиферирующих, так и в постмитотических клетках. [22] Одна теория предполагает, что PCD является адаптивным механизмом регулирования количества клеток-предшественников . У человека ПКС в клетках-предшественниках начинается на 7-й неделе беременности и сохраняется до первого триместра. [26] Этот процесс гибели клеток был обнаружен в зародышевых областях коры головного мозга , мозжечка , таламуса , ствола головного мозга и спинного мозга , а также в других областях. [25] На 19–23 неделе беременности ПКС наблюдается в постмитотических клетках. [27] Преобладающей теорией, объясняющей это наблюдение, является нейротрофическая теория, которая утверждает, что PCD необходим для оптимизации связи между нейронами и их афферентными входами и эфферентными мишенями. [25] Другая теория предполагает, что ПКС развития в нервной системе возникает для исправления ошибок в нейронах, которые мигрировали эктопически, иннервировали неправильные цели или имеют аксоны , которые пошли не так во время поиска пути. [28] Возможно, что PCD в процессе развития нервной системы выполняет различные функции, определяемые стадией развития, типом клеток и даже видом. [25]
Нейротрофическая теория является ведущей гипотезой, используемой для объяснения роли запрограммированной гибели клеток в развивающейся нервной системе. [29] Он постулирует, что для обеспечения оптимальной иннервации мишеней сначала образуется излишек нейронов, которые затем конкурируют за ограниченное количество защитных нейротрофических факторов , и только часть из них выживает, в то время как другие умирают в результате запрограммированной гибели клеток. [26] Более того, теория утверждает, что заранее определенные факторы регулируют количество выживших нейронов, а размер иннервирующей популяции нейронов напрямую коррелирует с влиянием их целевого поля. [30]
Основная идея о том, что клетки-мишени секретируют привлекательные или индуцирующие факторы и что их конусы роста обладают хемотаксической чувствительностью, была впервые выдвинута Сантьяго Рамоном-и-Кахалем в 1892 году . [31] Кахаля представил эту идею как объяснение появления «разумной силы» аксонов. что нужно предпринять при поиске цели, но признал, что у него нет эмпирических данных. [31] Теория приобрела большую привлекательность, когда экспериментальные манипуляции с аксонами привели к гибели всех иннервирующих нейронов. Это разработало концепцию целевой регуляции, которая стала основным принципом нейротрофической теории. [32] [33] Эксперименты, которые еще раз подтвердили эту теорию, привели к идентификации первого нейротрофического фактора, фактора роста нервов (NGF). [34]
Различные механизмы регулируют ПКС в периферической нервной системе (ПНС) и в центральной нервной системе (ЦНС). В ПНС иннервация мишени пропорциональна количеству высвобождаемых мишенью нейротрофических факторов NGF и NT3 . [35] [36] Экспрессия рецепторов нейротрофинов, TrkA и TrkC , достаточна для индукции апоптоза в отсутствие их лигандов . [23] Таким образом, предполагается, что PCD в ПНС зависит от высвобождения нейротрофических факторов и, таким образом, соответствует концепции нейротрофической теории.
Запрограммированная гибель клеток в ЦНС не зависит от внешних факторов роста , а вместо этого зависит от внутренних сигналов. В неокортексе соотношение возбуждающих и тормозных интернейронов 4:1 поддерживается апоптотическим механизмом, который, по-видимому, не зависит от окружающей среды. [36] Подтверждающие доказательства были получены в эксперименте, в котором предшественники интернейронов были либо трансплантированы в неокортекс мыши, либо культивированы in vitro . [37] Трансплантированные клетки погибли в возрасте двух недель, в том же возрасте, в котором эндогенные интернейроны подвергаются апоптозу. Независимо от размера трансплантата доля клеток, подвергающихся апоптозу, оставалась постоянной. Более того, разрушение TrkB , рецептора нейротрофического фактора головного мозга (Bdnf), не влияло на гибель клеток. Также было показано, что у мышей с нулевым уровнем проапоптотического фактора Bax (белок X, ассоциированный с Bcl-2) выжил больший процент интернейронов по сравнению с мышами дикого типа. [37] В совокупности эти данные указывают на то, что запрограммированная гибель клеток в ЦНС частично использует Bax-опосредованную передачу сигналов и не зависит от BDNF и окружающей среды. Механизмы апоптоза в ЦНС до сих пор недостаточно изучены, однако считается, что апоптоз интернейронов представляет собой автономный процесс.
Запрограммированную гибель клеток можно уменьшить или устранить в развивающейся нервной системе путем целенаправленного удаления проапоптотических генов или сверхэкспрессии антиапоптотических генов. Отсутствие или уменьшение PCD может вызвать серьезные анатомические пороки развития, но также может привести к минимальным последствиям в зависимости от целевого гена, популяции нейронов и стадии развития. [25] Чрезмерная пролиферация клеток-предшественников, которая приводит к грубым аномалиям головного мозга, часто приводит к летальному исходу, как это наблюдается у мышей с нокаутом каспазы-3 или каспазы-9 , у которых развивается экзэнцефалия в переднем мозге . [38] [39] Ствол головного мозга, спинной мозг и периферические ганглии этих мышей развиваются нормально, однако это позволяет предположить, что участие каспаз в PCD во время развития зависит от области мозга и типа клеток. [40] Нокаут или ингибирование апоптотического фактора активации протеазы 1 ( APAF1 ) также приводит к порокам развития и повышенной эмбриональной смертности. [41] [42] [43] Манипулирование белками-регуляторами апоптоза Bcl-2 и Bax (сверхэкспрессия Bcl-2 или делеция Bax) приводит к увеличению количества нейронов в определенных областях нервной системы, таких как сетчатка , ядро тройничного нерва , мозжечок и спинной мозг. [44] [45] [46] [47] [48] [49] [50] Однако PCD нейронов из-за делеции Bax или сверхэкспрессии Bcl-2 не приводит к заметным морфологическим или поведенческим аномалиям у мышей. Например, мыши со сверхэкспрессией Bcl-2 в целом имеют нормальные двигательные навыки и зрение и демонстрируют нарушения только в сложном поведении, таком как обучение и тревога. [51] [52] [53] Нормальные поведенческие фенотипы этих мышей позволяют предположить, что для компенсации избытка нейронов может быть задействован адаптивный механизм. [25]
Изучение PCD у различных видов имеет важное значение для понимания эволюционных основ и причин апоптоза в развитии нервной системы. В процессе развития нервной системы беспозвоночных ПКС играет разную роль у разных видов. [54] Сходство асимметричного механизма гибели клеток у нематод и пиявок указывает на то, что ПКС может иметь эволюционное значение в развитии нервной системы. [55] У нематод ПКС возникает в первый час развития, что приводит к уничтожению 12% негонадных клеток, включая нейрональные линии. [56] Гибель клеток у членистоногих сначала происходит в нервной системе, когда клетки эктодермы дифференцируются и одна дочерняя клетка становится нейробластом , а другая подвергается апоптозу. [57] Кроме того, гибель клеток, направленная на пол, приводит к разной нейрональной иннервации конкретных органов у мужчин и женщин. [58] У дрозофилы PCD важен для сегментации и спецификации во время развития.
Установлено, что в отличие от беспозвоночных у позвоночных механизм запрограммированной гибели клеток более консервативен . Обширные исследования, проведенные на различных позвоночных, показывают, что ПКС нейронов и глии возникает в большинстве частей нервной системы во время развития. Это наблюдалось до и во время синаптогенеза в центральной нервной системе, а также в периферической нервной системе. [25] Однако между видами позвоночных есть несколько различий. Например, у млекопитающих наблюдается обширное разветвление с последующим PCD в сетчатке, а у птиц этого не происходит. [59] Хотя совершенствование синапсов в системах позвоночных во многом зависит от PCD, другие эволюционные механизмы также играют роль. [25]
Запрограммированная гибель клеток у растений имеет ряд молекулярных сходств с апоптозом животных , но имеет и различия, наиболее очевидными из которых являются наличие клеточной стенки и отсутствие иммунной системы , удаляющей кусочки мертвой клетки. Вместо иммунного ответа умирающая клетка синтезирует вещества для своего расщепления и помещает их в вакуоль, которая разрывается при смерти клетки. [60]
В работе «APL регулирует идентичность сосудистой ткани арабидопсиса » [61] Мартин Бонке и его коллеги заявили, что одна из двух систем транспорта на большие расстояния в сосудистых растениях , ксилема , состоит из нескольких типов клеток, «дифференциация которых включает отложение сложных утолщений клеточных стенок и запрограммированной клеточной смерти». Авторы подчеркивают, что продукты ПХД растений играют важную структурную роль.
Основные морфологические и биохимические особенности ПКС сохранились как в растительном, так и в животном царстве . [62] Определенные типы растительных клеток реализуют уникальные программы клеточной гибели. Они имеют общие черты с апоптозом животных (например, деградация ядерной ДНК ), но имеют и свои особенности, такие как ядерная деградация, вызванная коллапсом вакуоли в трахеарных элементах ксилемы. [63]
Яннеке Балк и Кристофер Дж. Ливер с факультета наук о растениях Оксфордского университета провели исследование мутаций в митохондриальном геноме клеток подсолнечника . Результаты этого исследования показывают, что митохондрии играют ту же ключевую роль в ПКС сосудистых растений, что и в других эукариотических клетках. [64]
Во время опыления растения применяют самонесовместимость ( СИ ) как важное средство предотвращения самооплодотворения . Исследования кукурузного мака ( Papaver rhoeas ) показали, что белки пестика , на который приземляется пыльца , взаимодействуют с пыльцой и вызывают ПКС в несовместимой (то есть собственной ) пыльце. Исследователи Стивен Г. Томас и Верноника Э. Франклин-Тонг также обнаружили, что реакция включает быстрое ингибирование роста пыльцевых трубок с последующим PCD. [65]
Социальная слизевика Dictyostelium discoideum имеет особенность либо принимать хищническое поведение, подобное амебе , в своей одноклеточной форме, либо сливаться в подвижную слизнеподобную форму при распространении спор , которые дадут начало следующему поколению . [66]
Стебель состоит из мертвых клеток, подвергшихся типу PCD, который имеет многие черты аутофагической клеточной смерти: внутри клеток образуются массивные вакуоли, степень конденсации хроматина , но нет фрагментации ДНК . [67] Структурная роль остатков, оставленных мертвыми клетками, напоминает продукты ПКС в тканях растений.
D. discoideum — это слизевика, часть ветви, которая могла возникнуть от предков эукариот примерно за миллиард лет до настоящего времени. По-видимому, они возникли после того, как дифференцировались предки зеленых растений и предки грибов и животных. Но, помимо их места в эволюционном древе , тот факт, что ПКС наблюдался у скромного, простого шестихромосомного D. discoideum , имеет дополнительное значение: это позволяет изучить путь развития ПКС, который не зависит от каспаз. характерен для апоптоза. [68]
Возникновение запрограммированной гибели клеток у простейших возможно, [69] [70] , но остается спорным. Некоторые относят смерть этих организмов к нерегулируемой гибели клеток, подобной апоптозу. [71] [72]
Биологи давно подозревали, что митохондрии произошли от бактерий , которые влились в качестве эндосимбионтов («живут вместе внутри») в более крупные эукариотические клетки. Именно Линн Маргулис с 1967 года отстаивала эту теорию , которая с тех пор получила широкое признание. [73] Наиболее убедительным доказательством этой теории является тот факт, что митохондрии обладают собственной ДНК , генами и аппаратом репликации .
Этот эволюционный шаг был бы рискованным для примитивных эукариотических клеток, которые начали поглощать производящие энергию бактерии, а также опасным шагом для предков митохондрий, которые начали вторгаться в своих протоэукариотических хозяев . Этот процесс все еще очевиден сегодня между человеческими лейкоцитами и бактериями . Большую часть времени вторгшиеся бактерии уничтожаются лейкоцитами; однако нередко химическая война , которую ведут прокариоты , приводит к успеху, что приводит к заражению в результате повреждения.
Одно из этих редких эволюционных событий, произошедшее примерно за два миллиарда лет до настоящего времени, позволило некоторым эукариотам и прокариотам, производящим энергию, сосуществовать и получать взаимную выгоду от своего симбиоза . [74]
Митохондриальные эукариотические клетки живут на грани между жизнью и смертью, поскольку митохондрии все еще сохраняют свой репертуар молекул , которые могут вызвать клеточное самоубийство. [75] Неясно, почему механизм апоптоза сохраняется в современных одноклеточных организмах. Теперь этот процесс разработан так, чтобы происходить только тогда, когда он запрограммирован. [76] к клеткам (например, в результате обратной связи от соседей, стресса или повреждения ДНК ), митохондрии высвобождают активаторы каспаз , которые запускают биохимический каскад , вызывающий гибель клеток . Таким образом, механизм клеточного самоубийства теперь имеет решающее значение для всей нашей жизни.
Было обнаружено, что онкоген BCR-ABL участвует в развитии рака у человека. [77]
c-Myc участвует в регуляции апоптоза посредством подавления гена Bcl-2 . Его роль – нарушение роста тканей. [77]
Молекулярной характеристикой метастатических клеток является измененная экспрессия нескольких апоптотических генов . [77]
{{cite journal}}
: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )