Молекулярный логический вентиль — это молекула , которая выполняет логическую операцию на основе по крайней мере одного физического или химического входа и одного выхода. Область продвинулась от простых логических систем, основанных на одном химическом или физическом входе, до молекул, способных выполнять комбинаторные и последовательные операции, такие как арифметические операции (т. е. молекулярные логические вентили и алгоритмы хранения данных). [1] Молекулярные логические вентили работают с входными сигналами, основанными на химических процессах , и с выходными сигналами, основанными на спектроскопических явлениях.
Логические вентили являются фундаментальными строительными блоками электрических цепей . Они могут использоваться для построения цифровых архитектур с различной степенью сложности с помощью каскада от нескольких до нескольких миллионов логических вентилей и по сути являются физическими устройствами, которые производят единичный двоичный выход после выполнения логических операций на основе булевых функций на одном или нескольких двоичных входах. Концепция молекулярных логических вентилей, расширяющая применимость логических вентилей к молекулам, направлена на преобразование химических систем в вычислительные единицы. [2] [3] Область развилась для реализации нескольких практических приложений в таких областях, как молекулярная электроника , биосенсорика , ДНК-вычисления , наноробототехника и визуализация клеток .
Для логических вентилей с одним входом существует четыре возможных выходных шаблона. Когда вход равен 0, выход может быть либо 0, либо 1. Когда вход равен 1, выход снова может быть 0 или 1. Четыре выходных битовых шаблона соответствуют определенному логическому типу: PASS 0, YES, NOT и PASS 1. PASS 0 и PASS 1 всегда выводят 0 и 1 соответственно, независимо от входа. YES выводит 1, когда вход равен 1, а NOT является инверсией YES — он выводит 0, когда вход равен 1. [ необходима цитата ]
AND , OR , XOR , NAND , NOR , XNOR и INH — это двухвходовые логические вентили. Вентили AND , OR и XOR являются фундаментальными логическими вентилями, а вентили NAND , NOR и XNOR являются дополнительными к вентилям AND, OR и XOR соответственно. Вентиль INH (INH) — это специальный условный логический вентиль, который включает запрещающий вход. Когда запрещающий вход отсутствует, производимый выход зависит исключительно от другого входа. [ необходима цитата ]
Одна из самых ранних идей использования π-сопряженных молекул в молекулярных вычислениях была предложена Ари Авирамом из IBM в 1988 году. [5]
Первая практическая реализация молекулярной логики была осуществлена де Сильвой и др . в их основополагающей работе, в которой они сконструировали молекулярный фотоионный вентиль И с флуоресцентным выходом. [6] Хотя молекулярный логический вентиль ДА может преобразовывать сигналы из их ионной в фотонную форму, они являются системами с одним входом и одним выходом. Для построения более сложных архитектур молекулярной логики необходимы вентили с двумя входами, а именно вентили И и ИЛИ. Некоторые ранние работы достигли определенного прогресса в этом направлении, но они не смогли реализовать полную таблицу истинности, поскольку их протонированные ионные формы не могли связываться с субстратом в каждом случае. [7] [8] Де Сильва и др. сконструировали вентиль И на основе антрацена , состоящий из третичного амина и бензо-18-краун-6 единиц, оба из которых, как известно, демонстрируют процессы фотоиндуцированного переноса электронов (ПЭТ). Две молекулы действовали как рецепторы, которые были связаны с флуорофором на основе антрацена алкильными спейсерами . ПЭТ гасится при координации с протонами [9] и ионами натрия [10] соответственно для двух рецепторов и может вызвать флуоресценцию антраценовой единицы .
Пример логического вентиля YES включает бензо-краун-эфир, соединенный с цианозамещенным антраценовым блоком. Выход 1 (флуоресценция) получается только тогда, когда в растворе присутствуют ионы натрия (что указывает на вход 1). Ионы натрия инкапсулируются краун-эфиром , что приводит к тушению процесса ПЭТ и вызывает флуоресценцию антраценового блока. [11]
Этот молекулярный логический вентиль иллюстрирует прогресс от редокс-флуоресцентных переключателей к многовходовым логическим вентилям с электрохимическим переключателем, обнаруживающим присутствие кислот. Этот двухвходовой логический вентиль И включает в себя третичный аминный протонный рецептор и тетратиафульваленовый редокс-донор. Эти группы, будучи присоединенными к антрацену, могут одновременно обрабатывать информацию, касающуюся концентрации кислоты и окислительной способности раствора. [12]
Де Сильва и др. сконструировали молекулярный логический вентиль OR, используя рецептор аза-краун-эфира и ионы натрия и калия в качестве входов. Любой из двух ионов мог связываться с краун-эфиром, вызывая гашение ПЭТ и включение флуоресценции. Поскольку любой из двух ионов (вход «1») мог вызывать флуоресценцию (выход «1»), система напоминала логический вентиль OR. [6]
Логический вентиль INH включает ион Tb 3+ в хелатном комплексе. Этот двухвходовой логический вентиль демонстрирует некоммутативное поведение с химическими входами и фосфоресцентным выходом. Всякий раз, когда присутствует дикислород (вход «1»), система гасится и фосфоресценция не наблюдается (выход «0»). Второй вход, H + , также должен присутствовать для того, чтобы наблюдался выход «1». [13]
Паркер и Уильямс сконструировали логический вентиль NAND на основе сильного излучения тербиевого комплекса фенантридина . Когда кислота и кислород (два входа) отсутствуют (вход «0»), центр тербия флуоресцирует (выход «1»). [14]
Аккая и его коллеги продемонстрировали молекулярный NOR-воротный элемент с использованием системы борадиазаиндацена. Было обнаружено, что флуоресценция высокоэмиссионного борадиазаиндацена (вход «1») гасится в присутствии либо соли цинка [Zn(II)], либо трифторуксусной кислоты (TFA). [15]
Де Сильва и МакКленаган разработали арифметическое устройство для проверки принципа действия на основе молекулярных логических вентилей. Соединение A представляет собой двухтактный олефин с верхним рецептором, содержащим четыре группы анионов карбоновой кислоты (и нераскрытые противокатионы), способные связываться с кальцием . Нижняя часть представляет собой молекулу хинолина , которая является рецептором для ионов водорода. Логический вентиль работает следующим образом: без какого-либо химического ввода Ca2 + или H + хромофор показывает максимальное поглощение в УФ/видимой спектроскопии при 390 нм . При введении кальция происходит гипсохромный сдвиг ( синий сдвиг ), а поглощение при 390 нм уменьшается; аналогично, добавление протонов вызывает батохромный сдвиг ( красный сдвиг ). Когда оба катиона находятся в воде, конечным результатом является поглощение на исходной длине волны 390 нм. Эта система представляет собой логический вентиль XNOR в поглощении и логический вентиль XOR в пропускании . [16]
В другой системе логических вентилей XOR химия основана на псевдоротаксане . В органическом растворе электронодефицитная соль диазапирения (стержень) и электронобогащенные 2,3-диоксинафталиновые единицы краун -эфира (кольцо) самоорганизуются путем образования комплекса переноса заряда . Добавленный третичный амин , такой как трибутиламин, образует аддукт 1:2 с диазапиреном, и комплекс расщепляется. Этот процесс сопровождается увеличением интенсивности излучения при 343 нм в результате освобождения краун-эфира. Добавленная трифторметансульфоновая кислота реагирует с амином, и процесс возвращается в исходное состояние. Избыточная кислота блокирует краун-эфир путем протонирования , и комплекс снова расщепляется. [17]
В соединении B нижняя часть содержит третичную аминогруппу , которая способна связываться с протонами. В этой системе флуоресценция возникает только при наличии обоих катионов. Присутствие обоих катионов препятствует ПЭТ, позволяя соединению B флуоресцировать. При отсутствии любого из ионов флуоресценция гасится ПЭТ, что включает перенос электронов либо от атома азота, либо от атомов кислорода, либо от обоих к антраценильной группе. Когда оба рецептора связаны с ионами кальция и протонами соответственно, оба канала ПЭТ отключаются. Общий результат соединения B представляет собой логику И, поскольку выход «1» (флуоресценция) возникает только тогда, когда в растворе присутствуют и Ca 2+, и H + , то есть имеют значения как «1». При параллельной работе обеих систем и мониторинге пропускания для системы A и флуоресценции для системы B результатом является полусумматор, способный воспроизводить уравнение 1 + 1 = 2. [16]
В модификации системы B три химических входа одновременно обрабатываются в логическом вентиле И. Усиленный сигнал флуоресценции наблюдается только в присутствии избыточных протонов, ионов цинка и натрия через взаимодействия с их соответствующими амино, фенилдиаминокарбоксилатными и краун-эфирными рецепторами. Режим обработки работает аналогично тому, как обсуждалось выше — флуоресценция наблюдается из-за предотвращения конкурирующих реакций ПЭТ от рецепторов к возбужденному антраценовому флуорофору. Отсутствие какого-либо ионного входа приводит к низкому выходу флуоресценции. Каждый рецептор избирателен для своего конкретного иона, поскольку увеличение концентрации других ионов не дает высокой флуоресценции. Для достижения флуоресцентного выхода в соответствии с комбинаторной логикой И должен быть достигнут определенный порог концентрации каждого входа. [18]
Молекулярный логический вентиль может обрабатывать модуляторы, во многом похожие на установку, показанную в доказательстве принципа де Сильвы [16], но включение различных логических вентилей в одну и ту же молекулу является сложной задачей. Такая функция называется интегрированной логикой и иллюстрируется логическим вентилем на основе BODIPY , полувычитающим логическим вентилем, проиллюстрированным Коскуном, Аккайей и их коллегами. При мониторинге на двух разных длинах волн, 565 и 660 нм, операции логических вентилей XOR и INH реализуются на соответствующих длинах волн. Оптические исследования этого соединения в тетрагидрофуране показывают пик поглощения при 565 нм и пик испускания при 660 нм. Добавление кислоты приводит к гипсохромному сдвигу обоих пиков, поскольку протонирование третичного амина приводит к внутреннему переносу заряда. Цвет наблюдаемого испускания — желтый. При добавлении сильного основания фенольная гидроксильная группа депротонируется, вызывая ПЭТ, который делает молекулу неэмиссионной. При добавлении кислоты и основания наблюдается, что молекула испускает красное излучение, поскольку третичный амин не будет протонирован, в то время как гидроксильная группа останется протонированной, что приведет к отсутствию как ПЭТ, так и внутримолекулярного переноса заряда (ВЗ). Из-за большой разницы в интенсивности излучения эта одиночная молекула способна осуществлять вычитание на наноуровне. [19]
Полная система сумматора на основе флуоресцеина была также построена Шанцером и др. Система способна вычислять 1+1+1=3. [1]
На протяжении многих лет молекулярные логические вентили исследовались в широком спектре областей, таких как химическое и биологическое обнаружение, фармацевтическая и пищевая промышленность, а также новые области наноматериалов и химических вычислений . [20] [21] [22] [23] [24]
Фторидные (F - ) и ацетатные (CH 3 COO - ) анионы являются одними из самых важных в контексте здоровья и благополучия человека. Первый, широко используемый в здравоохранении, известен своей токсичностью и коррозионностью. Последний может вызывать алкалоз и влиять на метаболические пути за пределами определенной концентрации. Следовательно, крайне важно разработать методы обнаружения этих анионов в водной среде. Бхат и др . сконструировали INH-ворота с рецепторами, которые селективно связываются с анионами F ‑ и CH 3 COO - . Система использовала изменения поглощения в качестве колориметрического выхода для обнаружения концентрации анионов. [25]
Вэнь и его коллеги разработали молекулярный логический вентиль INH с Fe 3+ и EDTA в качестве входов и флуоресцентным выходом для обнаружения ионов железа в растворах. Флуоресценция системы гасится только в том случае, если присутствует вход Fe 3+ и отсутствует EDTA. [26]
Ионы тяжелых металлов представляют постоянную угрозу для здоровья человека из-за их присущей токсичности и низкой разлагаемости. Было создано несколько систем на основе молекулярных логических вентилей для обнаружения таких ионов, как Cd 2+ , [27] Hg 2+ / Pb 2+ , [28] и Ag + . [29] В своей работе Чен и др . продемонстрировали, что системы на основе логических вентилей могут использоваться для обнаружения ионов Cd 2+ в образцах риса. [27]
Эффективность таких методов, как химиотерапия для лечения рака, имеет тенденцию к плато через некоторое время, поскольку клетки подвергаются молекулярным изменениям, которые делают их нечувствительными к воздействию противораковых препаратов, [30] делая раннее обнаружение раковых клеток важным. Биомаркер, микроРНК (миРНК), имеет решающее значение в этом обнаружении через его паттерны экспрессии. [31] Чжан и др. продемонстрировали каскад вентилей INH-OR для этой цели, [32] Юэ и др . использовали вентиль AND для построения системы с двумя входами miRNA и выходом фотолюминесценции квантовой точки , [33] а Пэн и др. также построили двухвходовую систему на основе вентиля AND для одновременного обнаружения miRNA из опухолевых клеток. [34]
Аккая и др. проиллюстрировали применение логического вентиля для фотодинамической терапии в своей работе. Краситель BODIPY, прикрепленный к краун-эфиру и двум пиридильным группам, разделенным спейсерами, работает в соответствии с логическим вентилем И. Молекула работает как фотодинамический агент при облучении на длине волны 660 нм в условиях относительно высоких концентраций ионов натрия и протона, преобразуя триплетный кислород в цитотоксический синглетный кислород . Этот прототипический пример использует более высокие уровни натрия и более низкий pH в опухолевой ткани по сравнению с уровнями в нормальных клетках. Когда эти два связанных с раком клеточных параметра удовлетворяются, наблюдается изменение в спектре поглощения. [35]
Концепция ДНК-вычислений возникла в результате решения проблем плотности хранения из-за увеличения объемов информации о данных. Теоретически, грамм одноцепочечной ДНК способен хранить более 400 экзабайт данных с плотностью два бита на нуклеотид . [36] Леонарду Адлеману приписывают создание этой области в 1994 году. [37] В последнее время молекулярные логические вентильные системы используются в моделях ДНК-вычислений. [38]
Massey et al . сконструировали фотонные молекулярные логические схемы ДНК, используя каскады молекулярных логических вентилей AND, OR, NAND и NOR. [39] Они использовали комплексы лантаноидов в качестве флуоресцентных маркеров, и их люминесцентные выходы были обнаружены устройствами на основе FRET на концах цепей ДНК. Работы Campbell et al. по демонстрации логических систем NOT, AND, OR и XNOR, основанных на кроссоверных плитках ДНК, [40] Bader et al . по манипулированию структурой G-квадруплекса ДНК для реализации логических операций YES, AND и OR, [41] и Chatterjee и соавторов по построению логических вентилей с использованием реактивных шпилек ДНК на поверхностях ДНК-оригами являются некоторыми примерами вычислений на основе логических вентилей ДНК. [42]
Нанороботы обладают потенциалом для преобразования процессов доставки лекарств и биологических вычислений . [43] Ллопис-Лоренте и др . разработали наноробота, который может выполнять логические операции и обрабатывать информацию о глюкозе и мочевине . [44] Тубагере и др . разработали наноробота на основе молекулы ДНК, способного сортировать химические грузы. Система могла работать без дополнительной энергии, поскольку робот мог ходить по поверхности ДНК-оригами на двух ногах. У него также была рука для транспортировки груза. [45]
Маргулис и др . продемонстрировали молекулярную последовательную логику, где они создали молекулярный замок с клавиатурой, напоминающий возможности обработки электронного устройства безопасности, что эквивалентно включению нескольких взаимосвязанных логических вентилей И параллельно. Молекула имитирует электронную клавиатуру банкомата . Выходные сигналы зависят не только от наличия входов, но и от правильного порядка; т. е. должен быть введен правильный пароль. Молекула была разработана с использованием пирена и флуорофоров флуоресцеина, соединенных сидерофором , который связывается с Fe(III), а кислотность раствора изменяет флуоресцентные свойства флуорофора флуоресцеина. [46]
Молекулярные логические системы вентилей теоретически могут преодолеть проблемы, возникающие, когда полупроводники приближаются к наноразмерам . Молекулярные логические вентили более универсальны, чем их кремниевые аналоги, с такими явлениями, как наложенная логика, недоступными для полупроводниковой электроники. [24] Сухие молекулярные вентили, такие как продемонстрированные Авурисом и коллегами, оказываются возможными заменителями полупроводниковых устройств из-за их малого размера, схожей инфраструктуры и возможностей обработки данных. Авурис показал логический вентиль НЕ, состоящий из пучка углеродных нанотрубок . Нанотрубки легированы по-разному в смежных областях, создавая два дополнительных полевых транзистора , и пучок работает как логический вентиль НЕ только при соблюдении удовлетворительных условий. [47]
{{cite journal}}
: Цитировать журнал требует |journal=
( помощь )