stringtranslate.com

Аптамер

Слева: Несвязанный аптамер. Справа: аптамер, связанный с целевым белком. Белок выделен желтым цветом. Части аптамера, которые меняют форму при связывании с целевым белком, выделены синим цветом, а неизменные части — оранжевым. Части аптамера, которые контактируют с белком, выделены красным цветом.
Клетки рака груди , инкубированные с аптамерами, которые селективно связываются с биомаркерами на раковых клетках, но не со здоровыми клетками. Аптамеры связаны с Alexa Fluor 594 , молекулой, которая светится красным в УФ- свете. Этот тип теста позволяет врачу или исследователю идентифицировать раковые клетки в образце ткани пациента .

Аптамеры — это олигомеры искусственных одноцепочечных ДНК , РНК , XNA или пептидов , которые связывают конкретную целевую молекулу или семейство целевых молекул. Они проявляют ряд сродств ( K D в диапазоне от пМ до мкМ), [1] [2] с различными уровнями нецелевого связывания [3] и иногда классифицируются как химические антитела . Аптамеры и антитела могут использоваться во многих из тех же приложений, но структура аптамеров на основе нуклеиновых кислот , которые в основном являются олигонуклеотидами , сильно отличается от структуры антител на основе аминокислот , которые являются белками . Это различие может сделать аптамеры лучшим выбором, чем антитела для некоторых целей (см. замена антител).

Аптамеры используются в биологических лабораторных исследованиях и медицинских тестах . Если несколько аптамеров объединить в один анализ , они могут измерять большое количество различных белков в образце . Их можно использовать для идентификации молекулярных маркеров заболеваний или они могут функционировать как лекарства , системы доставки лекарств и системы контролируемого высвобождения лекарств . Они также находят применение в других задачах молекулярной инженерии .

Большинство аптамеров происходят из SELEX , семейства экспериментов в пробирках для поиска полезных аптамеров в огромном пуле различных последовательностей ДНК. Этот процесс во многом похож на естественный отбор , направленную эволюцию или искусственный отбор. В SELEX исследователь многократно выбирает лучшие аптамеры из начальной библиотеки ДНК, состоящей примерно из квадриллиона различных случайно сгенерированных фрагментов ДНК или РНК . После SELEX исследователь может мутировать или изменить химию аптамеров и сделать еще один выбор, или может использовать рациональные процессы проектирования для разработки улучшений. Существуют также не-SELEX методы обнаружения аптамеров.

Исследователи оптимизируют аптамеры для достижения различных полезных свойств. Наиболее важным свойством является специфическое и чувствительное связывание с выбранной целью. Когда аптамеры подвергаются воздействию биологических жидкостей, как в сывороточных тестах или аптамерной терапии, для них часто важно противостоять перевариванию ДНК- и РНК-разрушающими белками . Терапевтические аптамеры часто должны быть модифицированы для медленного выведения из организма . Аптамеры, которые резко меняют свою форму при связывании со своей целью, полезны в качестве молекулярных переключателей для включения и выключения датчика. Некоторые аптамеры спроектированы так, чтобы вписаться в биосенсор или в тест биологического образца . В некоторых случаях может быть полезно, чтобы аптамер достигал заранее определенного уровня или скорости связывания. Поскольку выход синтеза, используемого для получения известных аптамеров, быстро сокращается для более длинных последовательностей, [4] исследователи часто усекают аптамеры до минимальной связывающей последовательности, чтобы снизить стоимость производства.

Этимология

Слово «аптамер» — это неологизм, придуманный Эндрю Эллингтоном и Джеком Шостаком в их первой публикации по этой теме. Они не дали точного определения, заявив: «Мы назвали эти отдельные последовательности РНК «аптамерами», от латинского « aptus » — подходить». [5]

Однако само слово происходит от греческого слова ἅπτω , «связывать» или «подгонять» (как использовал Гомер (ок. VIII в. до н. э.) [6] [7] ), и μέρος, «компонент чего-то большего». [8]

Классификация

Типичный аптамер — это синтетически созданный лиганд , использующий комбинаторное разнообразие ДНК, РНК, XNA или пептида для достижения сильного специфического связывания с определенной целевой молекулой или семейством целевых молекул. Аптамеры иногда классифицируются как «химические антитела» или «имитаторы антител» . [9] Однако большинство аптамеров имеют небольшой размер, молекулярный вес 6–30 кДа, в отличие от размера антител 150 кДа, и содержат один сайт связывания, а не два соответствующих антигенсвязывающих региона типичного антитела.

История

Джек Шостак, лауреат Нобелевской премии и один из изобретателей SELEX и аптамеров.

С момента своего первого применения в 1967 году [10] методологии направленной эволюции использовались для разработки биомолекул с новыми свойствами и функциями. Ранние примеры включают модификацию системы репликации бактериофага Qbeta и генерацию рибозимов с измененной активностью расщепления . [11]

В 1990 году две команды независимо друг от друга разработали и опубликовали методы SELEX ( систематическая эволюция лигандов путем экспоненциального обогащения ) и создали РНК-аптамеры: лаборатория Ларри Голда, использовавшая термин SELEX для своего процесса отбора РНК- лигандов против ДНК-полимеразы T4 [12] , и лаборатория Джека Шостака , выбиравшая РНК-лиганды против различных органических красителей . [5] [13] Два года спустя лаборатория Шостака и Gilead Sciences , действуя независимо друг от друга, использовали схемы отбора in vitro для создания ДНК-аптамеров для органических красителей [14] и человеческого тромбина [15] соответственно. В 2001 году SELEX был автоматизирован Дж. Колином Коксом в лаборатории Эллингтона, что сократило продолжительность недельного эксперимента по отбору до всего трех дней. [16] [17] [18]

В 2002 году две группы под руководством Рональда Брейкера и Евгения Нудлера опубликовали первое окончательное доказательство существования рибосвитча , генетического регуляторного элемента на основе нуклеиновой кислоты , существование которого ранее предполагалось. Рибосвитчи обладают схожими свойствами молекулярного распознавания с аптамерами. Это открытие добавило поддержку гипотезе Мира РНК , постулируемой стадии во времени в происхождении жизни на Земле . [19]

Характеристики

Структура

Сложная и разнообразная вторичная и третичная структура аптамеров, показанная на этой схеме вторичной структуры аптамера, позволяет им прочно и специфично связывать свою цель. Комплементарное спаривание оснований видно в черных линиях, соединяющих некоторые основания GC и AT. Это свойство нуклеиновых кислот, которого нет в аминокислотах антител. Оно помогает аптамерам формировать эти уникальные структуры. Шпильковые области (красные), которые полагаются на это спаривание оснований, повышают стабильность аптамера при различных температурах. На этом изображении также показаны примеры химических модификаций базового аптамера. Два неестественных основания, которые повышают долговечность, показаны желтым цветом. Молекула биотина чрезвычайно прочно связывается со стрептавидином , что позволяет аптамеру прикрепляться к другим молекулам или к поверхности в датчиках и анализах.

Большинство аптамеров основаны на определенной олигомерной последовательности из 20-100 оснований и 3-20 кДа . Некоторые из них имеют химические модификации для функциональных улучшений или совместимости с более крупными сконструированными молекулярными системами. Химия ДНК, РНК, XNA и пептидных аптамеров может предлагать различные профили с точки зрения стабильности при хранении, долговечности в сыворотке или in vivo , специфичности и чувствительности, стоимости, простоты генерации, амплификации и характеристики, а также знакомства с пользователями. Как правило, аптамеры на основе ДНК и РНК проявляют низкую иммуногенность , амплифицируются с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) и имеют сложную вторичную структуру и третичную структуру . [20] [21] [22] [23] Аптамеры на основе ДНК и XNA демонстрируют превосходную стабильность при хранении. Аптамеры на основе XNA могут вносить дополнительное химическое разнообразие для увеличения сродства связывания или большей долговечности в сыворотке или in vivo .

Поскольку существует 22 генетически закодированных и более 500 природных аминокислот , пептидные аптамеры, а также антитела, обладают гораздо большим потенциалом комбинаторного разнообразия на единицу длины по сравнению с 4 нуклеиновыми кислотами в ДНК или РНК. [24] Химические модификации оснований нуклеиновых кислот или остовов увеличивают химическое разнообразие стандартных оснований нуклеиновых кислот. [25]

Сплит-аптамеры состоят из двух или более цепей ДНК, которые являются частями более крупного родительского аптамера, который был разорван на две части молекулярным надрезом . [ 26] Способность каждой составляющей цепи связывать мишени будет зависеть от местоположения надреза, а также от вторичной структуры дочерних цепей. [27] Наличие целевой молекулы поддерживает соединение фрагментов ДНК. Это может быть использовано в качестве основы для биосенсоров. [28] После сборки две отдельные цепи ДНК могут быть лигированы в одну цепь.

Немодифицированные аптамеры быстро выводятся из кровотока , с периодом полураспада от нескольких секунд до нескольких часов. Это происходит в основном из-за деградации нуклеазы , которая физически разрушает аптамеры, а также из-за выведения почками , что является результатом низкой молекулярной массы и размера аптамера . Несколько модификаций, таких как 2'-фторзамещенные пиримидины и полиэтиленгликолевая (ПЭГ) связь, позволяют увеличить период полураспада в сыворотке от нескольких дней до нескольких недель. ПЭГилирование может добавить достаточную массу и размер, чтобы предотвратить выведение почками in vivo . Немодифицированные аптамеры могут лечить нарушения коагуляции . Проблема выведения и переваривания нуклеазой уменьшается, когда они применяются к глазу , где концентрация нуклеазы ниже, а скорость выведения ниже. [29] Быстрое выведение из сыворотки также может быть полезным в некоторых приложениях, таких как диагностическая визуализация in vivo . [30]

В исследовании аптамеров [31], разработанных для связывания с белками, связанными с инфекцией Эбола, было проведено сравнение трех аптамеров, выделенных по их способности связывать целевой белок EBOV sGP. Хотя эти аптамеры различаются как по последовательности, так и по структуре, они демонстрируют удивительно схожее относительное сродство к sGP из EBOV и SUDV, а также к EBOV GP1.2. Примечательно, что эти аптамеры продемонстрировали высокую степень специфичности к продуктам гена GP. Один аптамер, в частности, оказался эффективным в качестве элемента распознавания в электрохимическом сенсоре, позволяя обнаруживать sGP и GP1.2 в растворе, а также GP1.2 в мембранном контексте. Результаты этого исследования указывают на интригующую возможность того, что определенные области на поверхности белков могут обладать аптатропными свойствами. Выявление ключевых особенностей таких участков в сочетании с улучшенными трехмерными структурными прогнозами для аптамеров имеет потенциал для повышения точности прогнозирования участков взаимодействия аптамеров с белками. Это, в свою очередь, может помочь идентифицировать аптамеры с повышенной вероятностью связывания белков с высокой аффинностью, а также пролить свет на мутации белков, которые могут существенно повлиять на связывание аптамеров. Это всестороннее понимание структурных взаимодействий между аптамерами и белками имеет жизненно важное значение для уточнения вычислительной предсказуемости связывания аптамеров с белками. Более того, оно может в конечном итоге устранить необходимость в экспериментальном протоколе SELEX.

Цели

Мишенями аптамеров могут быть малые молекулы и ионы тяжелых металлов , более крупные лиганды, такие как белки, и даже целые клетки. [32] [33] К этим мишеням относятся лизоцим , [34] тромбин , [35] [36] транс-действующий чувствительный элемент вируса иммунодефицита человека ( TAR ВИЧ ), [37] гемин , [38] интерферон γ , [39] фактор роста эндотелия сосудов (VEGF), [40] [41] специфический антиген простаты (PSA), [42] [43] дофамин , [44] и неклассический онкоген , фактор теплового шока 1 (HSF1). [45]

Аптамеры были созданы против раковых клеток, [46] прионов , [47] бактерий, [48] и вирусов. Вирусные цели аптамеров включают вирусы гриппа A и B , [49] респираторно-синцитиальный вирус (RSV), [49] коронавирус SARS (SARS-CoV) [49] и SARS-CoV-2 . [50]

Аптамеры могут быть особенно полезны для экологической протеомики. [51] Антитела, как и другие белки, сложнее секвенировать, чем нуклеиновые кислоты. Они также дороги в обслуживании и производстве и подвержены постоянному риску загрязнения, поскольку производятся с помощью клеточной культуры или собираются из сыворотки животных. По этой причине исследователи, интересующиеся малоизученными белками и видами, могут обнаружить, что компании не будут производить, поддерживать или адекватно проверять качество антител против их интересующей цели. [52] Напротив, аптамеры просты в секвенировании и не требуют затрат на поддержание, поскольку их точная структура может храниться в цифровом виде и синтезироваться по требованию. Это может сделать их более экономически целесообразными в качестве исследовательских инструментов для недостаточно финансируемых объектов биологических исследований. Аптамеры существуют для растительных соединений, таких как теофиллин (содержится в чае ) [53] и абсцизовая кислота (растительный иммунный гормон). [54] Был разработан аптамер против α-аманитина (токсина, вызывающего смертельное отравление мухоморами ), пример аптамера против гриба- мишени. [55]

Приложения аптамеров можно грубо сгруппировать в категории зондирования, терапии, производства реагентов и инженерии. Приложения зондирования важны в экологических, биомедицинских, эпидемиологических , биобезопасных и фундаментальных исследовательских приложениях, где аптамеры действуют как зонды в анализах, методах визуализации, диагностических анализах и биосенсорах. [32] [56] [57] [58] [59] [60] В терапевтических приложениях и прецизионной медицине аптамеры могут функционировать как лекарственные средства, [61] как средства целевой доставки лекарств , [62] как механизмы контролируемого высвобождения и как реагенты для открытия лекарств с помощью высокопроизводительного скрининга малых молекул [63] и белков. [64] [65] Аптамеры применяются для мониторинга производства белков, контроля качества и очистки. [66] [67] [68] Они могут функционировать в приложениях молекулярной инженерии как способ модификации белков, например, для улучшения ДНК-полимеразы, чтобы сделать ПЦР более надежной. [69] [70] [71] [72]

Поскольку сродство аптамера также влияет на его динамический диапазон и предел обнаружения, аптамеры с более низким сродством могут быть желательны при анализе высоких концентраций целевой молекулы. [73] Аффинная хроматография также зависит от способности аффинного реагента, такого как аптамер, связывать и высвобождать свою цель, и более низкое сродство может способствовать высвобождению целевой молекулы. [74] Таким образом, конкретные приложения определяют полезный диапазон для сродства аптамера.

Замена антител

Аптамеры могут заменять антитела во многих биотехнологических приложениях. [75] [52] В лабораторных исследованиях и клинической диагностике их можно использовать в основанных на аптамерах версиях иммуноанализов , включая иммуноферментный анализ (ИФА) , [76] вестерн-блот , [77] иммуногистохимию (ИГХ) , [78] и проточную цитометрию . [79] В качестве терапевтических средств они могут функционировать как агонисты или антагонисты своего лиганда. [80] В то время как антитела являются знакомой технологией с хорошо развитым рынком, аптамеры являются относительно новой технологией для большинства исследователей, и аптамеры были созданы только против части важных исследовательских целей. [81] В отличие от антител, немодифицированные аптамеры более восприимчивы к перевариванию нуклеазой в сыворотке и почечному клиренсу in vivo . Аптамеры намного меньше по размеру и массе, чем антитела, что может быть важным фактором при выборе того, что лучше всего подходит для данного приложения. Когда аптамеры доступны для конкретного применения, их преимущества перед антителами включают потенциально более низкую иммуногенность, большую воспроизводимость и более низкую стоимость, более высокий уровень контроля благодаря условиям отбора in vitro и способность эффективно конструироваться для обеспечения долговечности, специфичности и чувствительности. [82]

Кроме того, аптамеры способствуют сокращению использования исследовательских животных . [83] Хотя антитела часто полагаются на животных для первоначального открытия, а также для производства в случае поликлональных антител , как отбор, так и производство аптамеров обычно не требуют животных. Однако методы фагового дисплея позволяют отбирать антитела in vitro , а затем производить их из моноклональной клеточной линии, полностью избегая использования животных. [84]

Контролируемое высвобождение терапевтических средств

Способность аптамеров обратимо связывать молекулы, такие как белки, вызвала растущий интерес к их использованию для облегчения контролируемого высвобождения терапевтических биомолекул, таких как факторы роста . Это может быть достигнуто путем настройки силы связывания для пассивного высвобождения факторов роста, [85] наряду с активным высвобождением посредством таких механизмов, как гибридизация аптамера с комплементарными олигонуклеотидами [86] или развертывание аптамера за счет клеточных сил тяги. [87]

АптаБиД

AptaBiD (Aptamer-Facilitated Biomarker Discovery) — это метод обнаружения биомаркеров на основе аптамеров . [88]

Пептидные аптамеры

В то время как большинство аптамеров основаны на ДНК, РНК или XNA, пептидные аптамеры [89] представляют собой искусственные белки, выбранные или спроектированные для связывания определенных целевых молекул.

Структура

Пептидные аптамеры состоят из одной или нескольких пептидных петель переменной последовательности, отображаемых белковым каркасом. Производные, известные как головастики, в которых «головки» пептидного аптамера ковалентно связаны с уникальными последовательностями двухцепочечных ДНК «хвостов», позволяют количественно определять редкие молекулы-мишени в смесях с помощью ПЦР (используя, например, количественную полимеразную цепную реакцию в реальном времени ) их ДНК-хвостов. [90] Пептиды, которые образуют вариабельные области аптамера, синтезируются как часть той же полипептидной цепи, что и каркас, и ограничены на своих N- и C-концах путем связывания с ним. Это двойное структурное ограничение уменьшает разнообразие трехмерных структур, которые могут принимать вариабельные области, [91] и это уменьшение структурного разнообразия снижает энтропийную стоимость молекулярного связывания , когда взаимодействие с целью заставляет вариабельные области принимать однородную структуру.

Выбор

Наиболее распространенной системой отбора пептидных аптамеров является дрожжевая двухгибридная система . Пептидные аптамеры также могут быть выбраны из комбинаторных пептидных библиотек, созданных с помощью фагового дисплея и других технологий поверхностного дисплея, таких как дисплей мРНК , рибосомный дисплей , бактериальный дисплей и дрожжевой дисплей . Эти экспериментальные процедуры также известны как биопэннинг . Все пептиды, пэнированные из комбинаторных пептидных библиотек, были сохранены в базе данных MimoDB . [92] [93]

Приложения

Библиотеки пептидных аптамеров использовались в качестве «мутагенов» в исследованиях, в которых исследователь вводит библиотеку, которая экспрессирует различные пептидные аптамеры в клеточную популяцию, выбирает желаемый фенотип и идентифицирует те аптамеры, которые вызывают фенотип. Затем исследователь использует эти аптамеры в качестве приманок, например, в дрожжевых двухгибридных скринингах для идентификации клеточных белков, на которые нацелены эти аптамеры. Такие эксперименты идентифицируют конкретные белки, связанные аптамерами, и белковые взаимодействия, которые аптамеры нарушают, чтобы вызвать фенотип. [94] [95] Кроме того, пептидные аптамеры, дериватизированные с соответствующими функциональными группами, могут вызывать специфическую посттрансляционную модификацию своих целевых белков или изменять субклеточную локализацию мишеней. [96]

Этот анализ проверяет способность двух различных типов аптамеров (V и I) обнаруживать соответствующие им белковые мишени (VEGF и IFN-y). Метки Apt1, Apt2, Apt3 и Apt4 расположены в порядке убывания силы связывания (т. е. Apt1 является самым сильным аптамером). Буквы DD, AD, DA и AA означают, что они имеют разные комбинации неестественных пар оснований. Это обуславливает разницу в силе связывания. В столбцах «-» нет белка, а в столбцах «+» есть белок. Аптамер с белком (+) и без белка (-) загружается в лунки геля и перемещается по дорожкам колонок. Если присутствует мишень, они связываются и перемещаются медленнее из-за заряда аптамера и массы белка. В противном случае несвязанный аптамер быстро перемещается в конец дорожки. Разница в положении между полосами «+» и «-» является «сдвигом подвижности». Это позволяет исследователю обнаружить наличие или отсутствие белка. Более темная полоса в самых левых полосах V и I показывает, что более сильное связывание аптамера с мишенью облегчает обнаружение мишени при заданном количестве целевого белка в образце. Нижнее изображение включает денатурирующую мочевину в геле, которая нарушает связывание аптамера с мишенью в более слабых аптамерах I, показывая, что связывание аптамера с белком действительно является причиной изменения подвижности.

Промышленность и научно-исследовательское сообщество

Коммерческие продукты и компании, основанные на аптамерах, включают препарат Macugen (пегаптаниб) [97] и клиническую диагностическую компанию SomaLogic. [98] Международное общество по аптамерам (INSOAP), профессиональное общество для сообщества исследователей аптамеров, издает журнал, посвященный этой теме, Aptamers . Apta-index [99] — это текущая база данных, каталогизирующая и упрощающая процесс заказа более 700 аптамеров.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Rhodes, Andrew; Smithers, Nick; Chapman, Trevor; Parsons, Sarah; Rees, Stephen (2001-10-05). «Генерация и характеристика антагонистических РНК-аптамеров к MCP-1». FEBS Letters . 506 (2): 85–90. doi :10.1016/S0014-5793(01)02895-2. ISSN  0014-5793. PMID  11591377. S2CID  36797240.
  2. ^ Столтенбург, Регина; Николаус, Надя; Штрельиц, Беате (2012-12-30). «Capture-SELEX: Выбор ДНК-аптамеров для аминогликозидных антибиотиков». Журнал аналитических методов в химии . 2012 : e415697. doi : 10.1155/2012/415697 . ISSN  2090-8865. PMC 3544269. PMID  23326761 . 
  3. ^ Кривиану-Гайта В., Томпсон М. (ноябрь 2016 г.). «Аптамеры, антитела scFv и фрагменты антител Fab: обзор и сравнение трех самых универсальных элементов биораспознавания биосенсоров». Биосенсоры и биоэлектроника . 85 : 32–45. doi : 10.1016/j.bios.2016.04.091. PMID  27155114.
  4. ^ "Синтез ДНК-олигонуклеотидов". Millipore Sigma . Получено 4 июля 2022 г.
  5. ^ ab Ellington AD, Szostak JW (август 1990). «In vitro селекция молекул РНК, связывающих специфические лиганды». Nature . 346 (6287): 818–822. Bibcode :1990Natur.346..818E. doi :10.1038/346818a0. PMID  1697402. S2CID  4273647.
  6. ^ "ἅπτω", Βικιλεξικό (на греческом), 12 марта 2023 г. , получено 21 марта 2024 г.
  7. ^ "Οδύσσεια/φ - Βικιθήκη" . el.wikisource.org (на греческом языке) . Проверено 21 марта 2024 г.
  8. ^ "μέρος", Викисловарь, бесплатный словарь , 2023-05-31 , получено 2024-03-21
  9. ^ Zhou G, Wilson G, Hebbard L, Duan W, Liddle C, George J, Qiao L (март 2016 г.). «Аптамеры: перспективные химические антитела для терапии рака». Oncotarget . 7 (12): 13446–13463. doi :10.18632/oncotarget.7178. PMC 4924653 . PMID  26863567. S2CID  16618423. 
  10. ^ Mills DR, Peterson RL, Spiegelman S (июль 1967). «Внеклеточный дарвиновский эксперимент с самодублирующейся молекулой нуклеиновой кислоты». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 58 (1): 217–224. Bibcode :1967PNAS...58..217M. doi : 10.1073/pnas.58.1.217 . PMC 335620 . PMID  5231602. 
  11. ^ Джойс GF (октябрь 1989). «Усиление, мутация и селекция каталитической РНК». Gene . 82 (1): 83–87. doi :10.1016/0378-1119(89)90033-4. PMID  2684778.
  12. ^ Tuerk C, Gold L (август 1990). «Систематическая эволюция лигандов путем экспоненциального обогащения: лиганды РНК к ДНК-полимеразе бактериофага T4». Science . 249 (4968): 505–510. Bibcode :1990Sci...249..505T. doi :10.1126/science.2200121. PMID  2200121.
  13. ^ Столтенбург Р., Рейнеманн К., Штрелиц Б. (октябрь 2007 г.). «SELEX — (р)эволюционный метод получения высокоаффинных лигандов нуклеиновых кислот». Biomolecular Engineering . 24 (4): 381–403. doi :10.1016/j.bioeng.2007.06.001. PMID  17627883.
  14. ^ Эллингтон AD, Шостак JW (февраль 1992). «Выбор in vitro одноцепочечных молекул ДНК, которые складываются в специфические лигандсвязывающие структуры». Nature . 355 (6363): 850–852. Bibcode :1992Natur.355..850E. doi :10.1038/355850a0. PMID  1538766. S2CID  4332485.
  15. ^ Bock LC, Griffin LC, Latham JA, Vermaas EH, Toole JJ (февраль 1992 г.). «Выбор одноцепочечных молекул ДНК, которые связывают и ингибируют человеческий тромбин». Nature . 355 (6360): 564–566. Bibcode :1992Natur.355..564B. doi :10.1038/355564a0. PMID  1741036. S2CID  4349607.
  16. ^ Cox JC, Ellington AD (октябрь 2001 г.). «Автоматизированный выбор анти-белковых аптамеров». Bioorganic & Medicinal Chemistry . 9 (10): 2525–2531. doi :10.1016/s0968-0896(01)00028-1. PMID  11557339.
  17. ^ Cox JC, Rajendran M, Riedel T, Davidson EA, Sooter LJ, Bayer TS и др. (июнь 2002 г.). «Автоматизированное получение последовательностей аптамеров». Комбинаторная химия и высокопроизводительный скрининг . 5 (4): 289–299. doi :10.2174/1386207023330291. PMID  12052180.
  18. ^ Cox JC, Hayhurst A, Hesselberth J, Bayer TS, Georgiou G, Ellington AD (октябрь 2002 г.). «Автоматизированный отбор аптамеров против белковых мишеней, транслируемых in vitro: от гена к аптамеру». Nucleic Acids Research . 30 (20): 108e–108. doi :10.1093/nar/gnf107. PMC 137152. PMID  12384610 . 
  19. ^ Breaker RR (февраль 2012 г.). «Рибопереключатели и мир РНК». Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 4 (2): a003566. doi :10.1101/cshperspect.a003566. PMC 3281570. PMID  21106649 . 
  20. ^ Свигель Р., Досси Н., Тониоло Р., Миранда-Кастро Р., де-Лос-Сантос-Альварес Н., Лобо-Кастанон М.Дж. (сентябрь 2018 г.). «Выбор антиглютеновых ДНК-аптамеров в глубоком эвтектическом растворителе». Ангеванде Хеми . 57 (39): 12850–12854. Бибкод : 2018AngCh.13013032S. дои : 10.1002/ange.201804860. hdl : 10651/49996 . PMID  30070419. S2CID  240281828.
  21. ^ Neves MA, Reinstein O, Saad M, Johnson PE (декабрь 2010 г.). «Определение вторичных структурных требований к аптамера, связывающего кокаин, с помощью термодинамического и мутационного исследования». Биофизическая химия . 153 (1): 9–16. doi :10.1016/j.bpc.2010.09.009. PMID  21035241.
  22. ^ Baugh C, Grate D, Wilson C (август 2000 г.). «2.8 Кристаллическая структура аптамера малахитового зеленого». Журнал молекулярной биологии . 301 (1): 117–128. doi :10.1006/jmbi.2000.3951. PMID  10926496.
  23. ^ Dieckmann T, Fujikawa E, Xhao X, Szostak J, Feigon J (1995). «Структурные исследования аптамеров РНК и ДНК в растворе». Журнал клеточной биохимии . 59 : 13–81. doi :10.1002/jcb.240590703. S2CID  221833821.
  24. ^ Mascini M, Palchetti I, Tombelli S (февраль 2012 г.). «Аптамеры нуклеиновых кислот и пептидов: основы и биоаналитические аспекты». Angewandte Chemie . 51 (6): 1316–1332. doi :10.1002/anie.201006630. PMID  22213382.
  25. ^ Lipi F, Chen S, Chakravarthy M, Rakesh S, Veedu RN (декабрь 2016 г.). «Эволюция in vitro химически модифицированных аптамеров нуклеиновых кислот: за и против, и комплексные стратегии отбора». RNA Biology . 13 (12): 1232–1245. doi :10.1080/15476286.2016.1236173. PMC 5207382 . PMID  27715478. 
  26. ^ Чен А, Ян М, Ян С (2016). «Расщепленные аптамеры и их применение в сэндвич-аптасенсорах». TrAC Trends in Analytical Chemistry . 80 : 581–593. doi :10.1016/j.trac.2016.04.006.
  27. ^ Кент AD, Спиропулос NG, Хеемстра JM (октябрь 2013 г.). «Общий подход к проектированию расщепленных аптамеров ДНК, связывающих малые молекулы». Аналитическая химия . 85 (20): 9916–9923. doi :10.1021/ac402500n. PMID  24033257.
  28. ^ Debiais M, Lelievre A, Smietana M, Müller S (апрель 2020 г.). «Расщепление аптамеров и ферментов нуклеиновых кислот для разработки современных биосенсоров». Nucleic Acids Research . 48 (7): 3400–3422. doi :10.1093/nar/gkaa132. PMC 7144939. PMID  32112111 . 
  29. ^ Drolet DW, Green LS, Gold L, Janjic N (июнь 2016 г.). «Fit for the Eye: Aptamers in Ocular Disorders». Nucleic Acid Therapeutics . 26 (3): 127–146. doi :10.1089/nat.2015.0573. PMC 4900223 . PMID  26757406. 
  30. ^ Wang AZ, Farokhzad OC (март 2014). «Текущий прогресс молекулярной визуализации на основе аптамеров». Журнал ядерной медицины . 55 (3): 353–356. doi :10.2967/jnumed.113.126144. PMC 4110511. PMID  24525205 . 
  31. ^ Баннерджи, С.; Хеммат, МА; Шубхам, С.; Госай, А.; Девараконда, С.; Цзян, Н.; Гикиянаге, К.; Диллард, ДЖ.А.; Мори, В.; Шротрия, П.; и др. Структурно различные, но функционально схожие: аптамеры, специфичные для растворимого гликопротеина вируса Эбола и GP1,2, и их применение в электрохимическом зондировании. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 4627. https://doi.org/10.3390/ijms24054627
  32. ^ ab Kaur H, Shorie M (июнь 2019 г.). «Аптасенсоры на основе наноматериалов для клинических и экологических диагностических приложений». Nanoscale Advances . 1 (6): 2123–2138. Bibcode : 2019NanoA...1.2123K. doi : 10.1039 /C9NA00153K . PMC 9418768. PMID  36131986. 
  33. ^ Малликарачи П. (январь 2017 г.). «Эволюция комплексной целевой SELEX для идентификации аптамеров против антигенов поверхности клеток млекопитающих». Molecules . 22 (2): 215. doi : 10.3390/molecules22020215 . PMC 5572134 . PMID  28146093. 
  34. ^ Potty AS, Kourentzi K, Fang H, Jackson GW, Zhang X, Legge GB, Willson RC (февраль 2009 г.). «Биофизическая характеристика взаимодействий ДНК-аптамеров с фактором роста эндотелия сосудов». Biopolymers . 91 (2): 145–156. doi :10.1002/bip.21097. PMID  19025993. S2CID  23670.
  35. ^ Long SB, Long MB, White RR, Sullenger BA (декабрь 2008 г.). «Кристаллическая структура РНК-аптамера, связанного с тромбином». РНК . 14 (12): 2504–2512. doi :10.1261/rna.1239308. PMC 2590953 . PMID  18971322. 
  36. ^ Kohn, Eric M.; Konovalov, Kirill; Gomez, Christian A.; Hoover, Gillian N.; Yik, Andrew Kai-hei; Huang, Xuhui; Martell, Jeffrey D. (2023-08-02). «Концевые алкин-модифицированные ДНК-аптамеры с улучшенным сродством к связыванию белков». ACS Chemical Biology . 18 (9): 1976–1984. doi :10.1021/acschembio.3c00183. ISSN  1554-8929. PMID  37531184.
  37. ^ Darfeuille F, Reigadas S, Hansen JB, Orum H, Di Primo C, Toulmé JJ (октябрь 2006 г.). «Аптамеры, нацеленные на шпильку РНК, демонстрируют улучшенную специфичность по сравнению с специфичностью комплементарных олигонуклеотидов». Biochemistry . 45 (39): 12076–12082. doi :10.1021/bi0606344. PMID  17002307.
  38. ^ Лю М., Кагахара Т., Абе Х., Ито Й. (2009). «Прямой in vitro отбор гемин-связывающего ДНК-аптамера с пероксидазной активностью». Бюллетень химического общества Японии . 82 : 99–104. doi :10.1246/bcsj.82.99.
  39. ^ Min K, Cho M, Han SY, Shim YB, Ku J, Ban C (июль 2008 г.). «Простое и прямое электрохимическое обнаружение интерферона-гамма с использованием его РНК- и ДНК-аптамеров». Биосенсоры и биоэлектроника . 23 (12): 1819–1824. doi :10.1016/j.bios.2008.02.021. PMID  18406597.
  40. ^ Ng EW, Shima DT, Calias P, Cunningham ET, Guyer DR, Adamis AP (февраль 2006 г.). «Pegaptanib, a targeted anti-VEGF aptamer for ocular vascular disease». Nature Reviews. Drug Discovery . 5 (2): 123–132. doi :10.1038/nrd1955. PMID  16518379. S2CID  8833436.
  41. ^ Могадам, Фатеме Мортазави; Рахайе, Махди (май 2019 г.). «Сигнальный нанобиосенсор для обнаружения VEGF165 на основе супрачастичных медных нанокластеров, сформированных на двухвалентном аптамере». Биосенсоры и биоэлектроника . 132 : 186–195. doi : 10.1016/j.bios.2019.02.046. PMID  30875630. S2CID  80613434.
  42. ^ Savory N, Abe K, Sode K, Ikebukuro K (декабрь 2010 г.). «Выбор ДНК-аптамера против специфического антигена простаты с использованием генетического алгоритма и применение для зондирования». Биосенсоры и биоэлектроника . 26 (4): 1386–1391. doi :10.1016/j.bios.2010.07.057. PMID  20692149.
  43. ^ Jeong S, Han SR, Lee YJ, Lee SW (март 2010 г.). «Выбор РНК-аптамеров, специфичных к активному простатоспецифическому антигену». Biotechnology Letters . 32 (3): 379–385. doi :10.1007/s10529-009-0168-1. PMID  19943183. S2CID  22201181.
  44. ^ Walsh R, DeRosa MC (октябрь 2009 г.). «Сохранение функции в ДНК-гомологе РНК-дофаминового аптамера». Biochemical and Biophysical Research Communications . 388 (4): 732–735. doi :10.1016/j.bbrc.2009.08.084. PMID  19699181.
  45. ^ Salamanca HH, Antonyak MA, Cerione RA, Shi H, Lis JT (2014). «Ингибирование фактора теплового шока 1 в клетках рака человека с помощью мощного РНК-аптамера». PLOS ONE . 9 (5): e96330. Bibcode : 2014PLoSO...996330S. doi : 10.1371/journal.pone.0096330 . PMC 4011729. PMID  24800749 . 
  46. ^ Farokhzad OC, Karp JM, Langer R (май 2006 г.). «Биоконъюгаты наночастиц-аптамеров для воздействия на рак». Мнение эксперта по доставке лекарств . 3 (3): 311–324. doi :10.1517/17425247.3.3.311. PMID  16640493. S2CID  37058942.
  47. ^ Proske D, Gilch S, Wopfner F, Schätzl HM, Winnacker EL, Famulok M (август 2002 г.). «Аптамер, специфичный к прионному белку, снижает образование PrPSc». ChemBioChem . 3 (8): 717–725. doi :10.1002/1439-7633(20020802)3:8<717::AID-CBIC717>3.0.CO;2-C. PMID  12203970. S2CID  36801266.
  48. ^ Kaur H, Shorie M, Sharma M, Ganguli AK, Sabherwal P (декабрь 2017 г.). «Функционализированный аптасенсор на основе мостиковой арматуры из графена для обнаружения патогенных E. coli O78:K80:H11». Биосенсоры и биоэлектроника . 98 : 486–493. doi :10.1016/j.bios.2017.07.004. PMID  28728009.
  49. ^ abc Asha K, Kumar P, Sanicas M, Meseko CA, Khanna M, Kumar B (декабрь 2018 г.). «Достижения в терапии на основе нуклеиновых кислот против респираторных вирусных инфекций». Журнал клинической медицины . 8 (1): 6. doi : 10.3390/jcm8010006 . PMC 6351902. PMID  30577479 . 
  50. ^ Schmitz A, Weber A, Bayin M, Breuers S, Fieberg V, Famulok M, Mayer G (апрель 2021 г.). «Аптамер ДНК, связывающий шипы SARS-CoV-2, который ингибирует инфекцию псевдовируса с помощью механизма, независимого от RBD*». Angewandte Chemie . 60 (18): 10279–10285. doi :10.1002/anie.202100316. PMC 8251191. PMID  33683787 . 
  51. ^ Dhar P, Samarasinghe RM, Shigdar S (апрель 2020 г.). «Антитела, нанотела или аптамеры — что лучше всего подходит для расшифровки протеомов немодельных видов?». International Journal of Molecular Sciences . 21 (7): 2485. doi : 10.3390/ijms21072485 . PMC 7177290. PMID  32260091 . 
  52. ^ ab Bauer M, Strom M, Hammond DS, Shigdar S (ноябрь 2019 г.). «Все, что вы можете сделать, я могу сделать лучше: могут ли аптамеры заменить антитела в клинических диагностических приложениях?». Molecules . 24 (23): 4377. doi : 10.3390/molecules24234377 . PMC 6930532. PMID  31801185 . 
  53. ^ Feng S, Chen C, Wang W, Que L (май 2018). «Микросенсор с аптамером и нанопорами для обнаружения теофиллина». Биосенсоры и биоэлектроника . 105 : 36–41. doi : 10.1016/j.bios.2018.01.016 . PMID  29351868.
  54. ^ Song C (2017). «Обнаружение фитогормона абсцизовой кислоты (ABA) с использованием оптического датчика на основе аптамеров с микрофлюидным капиллярным интерфейсом». 2017 IEEE 30-я Международная конференция по микроэлектромеханическим системам (MEMS) . стр. 370–373. doi :10.1109/MEMSYS.2017.7863418. ISBN 978-1-5090-5078-9. S2CID  20781208.
  55. ^ Мушиньска К., Островска Д., Бартницки Ф., Ковальска Е., Бодашевска-Любас М., Германович П. и др. (2017). «Выбор и анализ ДНК-аптамера, связывающего α-аманитин из Amanita phalloides». Акта Биохимика Полоника . 64 (3): 401–406. дои : 10.18388/abp.2017_1615 . PMID  28787470. S2CID  3638299.
  56. ^ Пеннер Г. (июль 2012 г.). «Коммерциализация диагностического теста на основе аптамеров» (PDF) . NeoVentures .
  57. ^ Wei H, Li B, Li J, Wang E, Dong S (сентябрь 2007 г.). «Простое и чувствительное колориметрическое зондирование белка на основе аптамеров с использованием немодифицированных золотых наночастиц». Chemical Communications (36): 3735–3737. doi :10.1039/B707642H. PMID  17851611.
  58. ^ Cheng H, Qiu X, Zhao X, Meng W, Huo D, Wei H (март 2016 г.). «Функциональный зонд нуклеиновой кислоты для параллельного мониторинга K(+) и протопорфирина IX в живых организмах». Аналитическая химия . 88 (5): 2937–2943. doi :10.1021/acs.analchem.5b04936. PMID  26866998.
  59. ^ Xiang Y, Lu Y (июль 2011 г.). «Использование персональных глюкометров и функциональных ДНК-датчиков для количественной оценки различных аналитических целей». Nature Chemistry . 3 (9): 697–703. Bibcode :2011NatCh...3..697X. doi :10.1038/nchem.1092. PMC 3299819 . PMID  21860458. 
  60. ^ Агниво Госаи, Брендан Шин Хау Йе, Марит Нильсен-Гамильтон, Пранав Шротрия, «Обнаружение тромбина без метки в присутствии высокой концентрации альбумина с использованием нанопористой мембраны, функционализированной аптамером», Биосенсоры и биоэлектроника , том 126, 2019, стр. 88–95, ISSN  0956-5663, doi : 10.1016/j.bios.2018.10.010.
  61. ^ Amero P, Khatua S, Rodriguez-Aguayo C, Lopez-Berestein G (октябрь 2020 г.). «Аптамеры: новые терапевтические средства и потенциальная роль в нейроонкологии». Cancers . 12 (10): 2889. doi : 10.3390/cancers12102889 . PMC 7600320 . PMID  33050158. 
  62. ^ Fattal E, Hillaireau H, Ismail SI (сентябрь 2018 г.). «Аптамеры в терапии и доставке лекарств». Advanced Drug Delivery Reviews . 134 : 1–2. doi : 10.1016/j.addr.2018.11.001. PMID  30442313. S2CID  53562925.
  63. ^ Хафнер М., Вианини Э., Альбертони Б., Маркетти Л., Грюне И., Глокнер К., Фамулок М. (2008). «Замещение связанных с белком аптамеров малыми молекулами, экранированными с помощью поляризации флуоресценции». Nature Protocols . 3 (4): 579–587. doi :10.1038/nprot.2008.15. PMID  18388939. S2CID  4997899.
  64. ^ Хуан Z, Цю L, Чжан T, Тан W (2021-02-03). «Интеграция ДНК-нанотехнологий с аптамерами для биологических и биомедицинских приложений». Matter . 4 (2): 461–489. doi : 10.1016/j.matt.2020.11.002 . ISSN  2590-2385. S2CID  234061584.
  65. ^ Рейно Л., Буше-Спинелли А., Рейлон С., Бухот А. (август 2020 г.). «Ощущение с помощью нанопор и аптамеров: путь вперед». Датчики . 20 (16): 4495. Bibcode : 2020Senso..20.4495R . doi : 10.3390/s20164495 . PMC 7472324. PMID  32796729. 
  66. ^ Yang Y, Yin S, Li Y, Lu D, Zhang J, Sun C (2017). «Применение аптамеров при обнаружении и хроматографической очистке антибиотиков в различных матрицах». TrAC Trends in Analytical Chemistry . 95 : 1–22. doi :10.1016/j.trac.2017.07.023 . Получено 4 июля 2022 г.
  67. ^ Murphy MB, Fuller ST, Richardson PM, Doyle SA (сентябрь 2003 г.). «Улучшенный метод in vitro эволюции аптамеров и применение в обнаружении и очистке белков». Nucleic Acids Research . 31 (18): 110e–110. doi :10.1093/nar/gng110. PMC 203336. PMID 12954786  . 
  68. ^ Chen K, Zhou J, Shao Z, Liu J, Song J, Wang R и др. (июль 2020 г.). «Аптамеры как универсальные молекулярные инструменты для мониторинга и контроля качества продукции антител». Журнал Американского химического общества . 142 (28): 12079–12086. doi :10.1021/jacs.9b13370. PMID  32516525. S2CID  219564070.
  69. ^ Keijzer JF, Albada B (март 2022 г.). «Сайт-селективная модификация белков с помощью ДНК». Биополимеры . 113 (3): e23483. doi :10.1002/bip.23483. PMC 9285461. PMID 34878181.  S2CID 244954278  . 
  70. ^ Smith D, Collins BD, Heil J, Koch TH (январь 2003 г.). «Чувствительность и специфичность фотоаптамерных зондов». Молекулярная и клеточная протеомика . 2 (1): 11–18. doi : 10.1074/mcp.m200059-mcp200 . PMID  12601078. S2CID  13406870.
  71. ^ Винкенборг Дж.Л., Майер Г., Фамулок М. (сентябрь 2012 г.). «Аффинное мечение белков на основе аптамеров». Ангеванде Хеми . 51 (36): 9176–9180. дои : 10.1002/anie.201204174 . ПМИД  22865679.
  72. ^ Keijzer JF, Firet J, Albada B (декабрь 2021 г.). «Сайт-селективное и индуцируемое ацилирование тромбина с использованием конъюгатов аптамер-катализатор». Chemical Communications . 57 (96): 12960–12963. doi : 10.1039/d1cc05446e . PMID  34792071. S2CID  243998479.
  73. ^ Уилсон, Брэндон Д.; Сох, Х. Том (2020-08-01). «Переоценка общепринятых взглядов на анализы связывания». Тенденции в биохимических науках . 45 (8): 639–649. doi :10.1016/j.tibs.2020.04.005. ISSN  0968-0004. PMC 7368832. PMID  32402748 . 
  74. ^ Янсон, Ян-Кристер (2012-01-03). Очистка белков: принципы, методы высокого разрешения и приложения. John Wiley & Sons. ISBN 978-1-118-00219-3.
  75. ^ Чен А, Ян С (сентябрь 2015 г.). «Замена антител аптамерами в иммуноферментном анализе с латеральным потоком». Биосенсоры и биоэлектроника . 71 : 230–242. doi : 10.1016/j.bios.2015.04.041. PMID  25912679.
  76. ^ Toh SY, Citartan M, Gopinath SC, Tang TH (февраль 2015 г.). «Аптамеры как замена антителам в иммуноферментном анализе». Biosensors & Bioelectronics . 64 : 392–403. doi :10.1016/j.bios.2014.09.026. PMID  25278480.
  77. ^ Бруно Дж. Г., Сивилс Дж. К. (2016). «Аптамеры «Вестерн»-блоттинг для белков внешней мембраны E. coli и ключевых факторов вирулентности у патогенных серотипов E. coli». Аптамеры и синтетические антитела .
  78. ^ Бауэр М., Макдональд Дж., Генри Дж., Дуань В., Шигдар С. (июнь 2016 г.). «Применение аптамеров в иммуногистохимии». Nucleic Acid Therapeutics . 26 (3): 120–126. doi :10.1089/nat.2015.0569. PMID  26862683.
  79. ^ Meyer M, Scheper T, Walter JG (август 2013 г.). «Аптамеры: универсальные зонды для проточной цитометрии». Прикладная микробиология и биотехнология . 97 (16): 7097–7109. doi :10.1007/s00253-013-5070-z. PMID  23838792. S2CID  13996688.
  80. ^ Zhou J, Rossi J (март 2017 г.). «Аптамеры как таргетные терапевтические средства: текущий потенциал и проблемы». Nature Reviews. Drug Discovery . 16 (3): 181–202. doi :10.1038/nrd.2016.199. PMC 5700751. PMID 27807347  . 
  81. ^ Bruno JG (апрель 2015 г.). «Предсказание неопределенного будущего диагностики и терапии на основе аптамеров». Molecules . 20 (4): 6866–6887. doi : 10.3390/molecules20046866 . PMC 6272696 . PMID  25913927. 
  82. ^ Wang T, Chen C, Larcher LM, Barrero RA, Veedu RN (2019). «Три десятилетия технологий аптамеров нуклеиновых кислот: извлеченные уроки, прогресс и возможности в разработке аптамеров». Biotechnology Advances . 37 (1): 28–50. doi : 10.1016/j.biotechadv.2018.11.001 . PMID  30408510. S2CID  53242220.
  83. ^ Melbourne J, Bishop P, Brown J, Stoddart G (октябрь 2016 г.). «Многогранный подход к достижению глобального признания методов исследования без использования животных». Альтернативы лабораторным животным . 44 (5): 495–498. doi : 10.1177/026119291604400511 . PMID  27805832. S2CID  1002312.
  84. ^ Alfaleh MA, Alsaab HO, Mahmoud AB, Alkayyal AA, Jones ML, Mahler SM, Hashem AM (2020). «Моноклональные антитела, полученные с помощью фагового дисплея: от скамьи до постели больного». Frontiers in Immunology . 11 : 1986. doi : 10.3389/fimmu.2020.01986 . PMC 7485114. PMID  32983137 . 
  85. ^ Soontornworajit B, Zhou J, Shaw MT, Fan TH, Wang Y (март 2010 г.). «Функционализация гидрогеля с помощью ДНК-аптамеров для устойчивого высвобождения PDGF-BB». Chemical Communications . 46 (11): 1857–1859. doi :10.1039/B924909E. PMID  20198232.
  86. ^ Battig MR, Soontornworajit B, Wang Y (август 2012 г.). «Программируемое высвобождение множественных белковых препаратов из гидрогелей, функционализированных аптамерами, посредством гибридизации нуклеиновых кислот». Журнал Американского химического общества . 134 (30): 12410–12413. doi :10.1021/ja305238a. PMID  22816442.
  87. ^ Stejskalová A, Oliva N, England FJ, Almquist BD (февраль 2019 г.). «Биологически вдохновленное селективное высвобождение факторов роста, захваченных аптамерами, с помощью сил тяги». Advanced Materials . 31 (7): e1806380. Bibcode :2019AdM....3106380S. doi :10.1002/adma.201806380. PMC 6375388 . PMID  30614086. 
  88. ^ Березовский МВ, Лехманн М, Мушеев МЮ, Мак ТВ, Крылов СН (июль 2008). «Обнаружение биомаркеров с помощью аптамеров (AptaBiD)». Журнал Американского химического общества . 130 (28): 9137–9143. doi :10.1021/ja801951p. PMID  18558676.
  89. ^ Colas P, Cohen B, Jessen T, Grishina I, McCoy J, Brent R (апрель 1996 г.). «Генетический отбор пептидных аптамеров, которые распознают и ингибируют циклин-зависимую киназу 2». Nature . 380 (6574): 548–550. Bibcode :1996Natur.380..548C. doi :10.1038/380548a0. PMID  8606778. S2CID  4327303.
  90. ^ Nolan GP (январь 2005 г.). «Головастики за хвост». Nature Methods . 2 (1): 11–12. doi :10.1038/nmeth0105-11. PMID  15782163. S2CID  1423778.
  91. ^ Spolar RS, Record MT (февраль 1994). «Связь локального сворачивания с сайт-специфическим связыванием белков с ДНК». Science . 263 (5148): 777–784. Bibcode :1994Sci...263..777S. doi :10.1126/science.8303294. PMID  8303294.
  92. ^ Huang J, Ru B, Zhu P, Nie F, Yang J, Wang X и др. (январь 2012 г.). «MimoDB 2.0: база данных мимотопов и не только». Nucleic Acids Research . 40 (выпуск базы данных): D271–D277. doi :10.1093/nar/gkr922. PMC 3245166. PMID 22053087  . 
  93. ^ "MimoDB: база данных мимотопов и не только". immunityt.cn . Архивировано из оригинала 2012-11-16 . Получено 2016-02-03 .
  94. ^ Geyer CR, Colman-Lerner A, Brent R (июль 1999 г.). ««Мутагенез» пептидными аптамерами идентифицирует членов генетической сети и связи путей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (15): 8567–8572. Bibcode : 1999PNAS...96.8567G. doi : 10.1073 /pnas.96.15.8567 . PMC 17557. PMID  10411916. 
  95. ^ Dibenedetto S, Cluet D, Stebe PN, Baumle V, Léault J, Terreux R и др. (июль 2013 г.). «Кальциневрин A против домена NS5A-TP2/HD, содержащего 2: исследование случая направленного низкочастотного случайного мутагенеза для выявления целевой специфичности пептидных аптамеров». Molecular & Cellular Proteomics . 12 (7): 1939–1952. doi : 10.1074/mcp.M112.024612 . PMC 3708177 . PMID  23579184. 
  96. ^ Colas P, Cohen B, Ko Ferrigno P, Silver PA, Brent R (декабрь 2000 г.). «Целевая модификация и транспортировка клеточных белков». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (25): 13720–13725. Bibcode : 2000PNAS...9713720C. doi : 10.1073/pnas.97.25.13720 . PMC 17642. PMID  11106396 . 
  97. ^ "FDA одобряет препарат Eyetech/Pfizer Macugen". Обзор офтальмологии . Получено 30 июня 2022 г.
  98. ^ Датт С. «SomaLogic и Illumina объединяют усилия для продвижения инноваций в протеомике». BioSpace . Получено 30 июня 2022 г.
  99. ^ "Apta-Index™ (База данных аптамеров) - Библиотека из 500+ аптамеров". APTAGEN, LLC . Получено 16.12.2022 .

Дальнейшее чтение