Рецепторы, сопряженные с G-белком ( GPCR ), также известные как рецепторы с семью трансмембранными доменами , рецепторы 7TM , гептаспиральные рецепторы , серпантинные рецепторы и рецепторы, сопряженные с G-белком ( GPLR ), образуют большую группу эволюционно связанных белков , которые являются рецепторами клеточной поверхности , которые обнаруживают молекулы вне клетки и активируют клеточные ответы. Они сопряжены с G-белками . Они проходят через клеточную мембрану семь раз в форме шести петель [2] (три внеклеточные петли, взаимодействующие с молекулами лиганда , три внутриклеточные петли, взаимодействующие с G-белками, N-концевая внеклеточная область и C-концевая внутриклеточная область [2] ) аминокислотных остатков , поэтому их иногда называют семитрансмембранными рецепторами. [3] Лиганды могут связываться либо с внеклеточным N-концом и петлями (например, рецепторы глутамата), либо с сайтом связывания внутри трансмембранных спиралей ( семейство родопсиноподобных ). Все они активируются агонистами , хотя также наблюдалась спонтанная автоактивация пустого рецептора. [3]
Рецепторы, сопряженные с G-белком, встречаются только у эукариот , включая дрожжи и хоанофлагелляты . [4] Лиганды , которые связывают и активируют эти рецепторы, включают светочувствительные соединения, запахи , феромоны , гормоны и нейротрансмиттеры и различаются по размеру от небольших молекул до пептидов и крупных белков . Рецепторы, сопряженные с G-белком, участвуют во многих заболеваниях.
Существует два основных пути передачи сигнала с участием рецепторов, сопряженных с G-белком:
Когда лиганд связывается с GPCR, он вызывает конформационное изменение в GPCR, что позволяет ему действовать как фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF). Затем GPCR может активировать связанный с ним белок G , обменивая GDP, связанный с белком G, на GTP . Субъединица α белка G вместе со связанным GTP затем может диссоциировать от субъединиц β и γ для дальнейшего воздействия на внутриклеточные сигнальные белки или целевые функциональные белки напрямую в зависимости от типа субъединицы α ( G αs , G αi/o , G αq/11 , G α12/13 ). [6] : 1160
GPCR являются важной мишенью для лекарств, и приблизительно 34% [7] всех одобренных Управлением по контролю за продуктами и лекарствами (FDA) лекарств нацелены на 108 членов этого семейства. По оценкам, глобальный объем продаж этих лекарств составляет 180 миллиардов долларов США по состоянию на 2018 год [обновлять]. [7] Предполагается, что GPCR являются мишенями для примерно 50% лекарств, которые в настоящее время находятся на рынке, в основном из-за их участия в сигнальных путях, связанных со многими заболеваниями, т. е. психическими, метаболическими, включая эндокринологические расстройства, иммунологические, включая вирусные инфекции, сердечно-сосудистые, воспалительные, расстройства чувств и рак. Давно обнаруженная связь между GPCR и многими эндогенными и экзогенными веществами, приводящая, например, к анальгезии, является еще одной динамично развивающейся областью фармацевтических исследований. [3]
С определением первой структуры комплекса между рецептором, сопряженным с G-белком (GPCR), и тримером G-белка (Gαβγ) в 2011 году была открыта новая глава исследований GPCR для структурных исследований глобальных переключателей с более чем одним исследуемым белком. Предыдущие прорывы включали определение кристаллической структуры первого GPCR, родопсина, в 2000 году и кристаллической структуры первого GPCR с диффундирующим лигандом (β 2 AR) в 2007 году. Способ, которым семь трансмембранных спиралей GPCR организованы в пучок, предполагался на основе модели низкого разрешения родопсина лягушки из исследований двумерных кристаллов с помощью криогенной электронной микроскопии . Кристаллическая структура родопсина, которая появилась три года спустя, не была сюрпризом, за исключением наличия дополнительной цитоплазматической спирали H8 и точного местоположения петли, покрывающей сайт связывания ретиналя. Однако он предоставил основу, которая, как надеялись, станет универсальным шаблоном для моделирования гомологии и разработки лекарств для других GPCR, однако эта идея оказалась слишком оптимистичной.
Семь лет спустя кристаллизация β 2 -адренергического рецептора (β 2 AR) с диффундирующим лигандом принесла удивительные результаты, поскольку она выявила совершенно иную форму внеклеточной стороны рецептора, чем у родопсина. Эта область важна, поскольку она отвечает за связывание лиганда и является мишенью многих лекарств. Более того, сайт связывания лиганда был гораздо более просторным, чем в структуре родопсина, и был открыт наружу. В других рецепторах, кристаллизованных вскоре после этого, связывающая сторона была еще более легкодоступна для лиганда. Новые структуры, дополненные биохимическими исследованиями, раскрыли механизмы действия молекулярных переключателей, которые модулируют структуру рецептора, приводя к состояниям активации для агонистов или к состояниям полной или частичной инактивации для обратных агонистов. [3]
Нобелевская премия по химии 2012 года была присуждена Брайану Кобилке и Роберту Лефковицу за их работу, которая была «решающей для понимания того, как функционируют рецепторы, сопряженные с G-белком». [8] Было по крайней мере семь других Нобелевских премий, присужденных за некоторые аспекты сигнализации, опосредованной G-белком. По состоянию на 2012 год, два из десяти самых продаваемых в мире препаратов ( Advair Diskus и Abilify ) действуют, воздействуя на рецепторы, сопряженные с G-белком. [9]
Точный размер суперсемейства GPCR неизвестен, но по данным анализа последовательности генома было предсказано, что по крайней мере 831 различных человеческих генов (или около 4% всего генома , кодирующего белок ) кодируют их . [10] [11] Хотя было предложено множество схем классификации, суперсемейство классически делится на три основных класса (A, B и C) без обнаруживаемой общей гомологии последовательностей между классами.
Самый большой класс на сегодняшний день — это класс A, на который приходится почти 85% генов GPCR. Из GPCR класса A более половины, как предполагается, кодируют обонятельные рецепторы , в то время как остальные рецепторы лигандируются известными эндогенными соединениями или классифицируются как сиротские рецепторы . Несмотря на отсутствие гомологии последовательностей между классами, все GPCR имеют общую структуру и механизм передачи сигнала . Очень большая группа родопсина A была далее разделена на 19 подгрупп ( A1-A19 ). [12]
Согласно классической системе AF, GPCR можно сгруппировать в шесть классов на основе гомологии последовательностей и функционального сходства: [13] [14] [15] [16]
Совсем недавно была предложена альтернативная система классификации GPCR позвоночных под названием GRAFS ( Glutamate , Rhodopsin , Adhesion , Frizzled / Taste2 , Secretin ). [10] Они соответствуют классическим классам C, A, B2, F и B. [17]
Раннее исследование, основанное на доступной последовательности ДНК, предположило, что геном человека кодирует около 750 рецепторов, связанных с G-белком, [18] около 350 из которых обнаруживают гормоны, факторы роста и другие эндогенные лиганды. Примерно 150 GPCR, обнаруженных в геноме человека, имеют неизвестные функции.
Некоторые веб-серверы [19] и методы прогнозирования биоинформатики [20] [21] использовались для прогнозирования классификации GPCR только на основе их аминокислотной последовательности с помощью подхода псевдоаминокислотного состава .
GPCR участвуют в самых разных физиологических процессах. Вот некоторые примеры их физиологических ролей:
GPCR являются интегральными мембранными белками , которые обладают семью доменами, охватывающими мембрану, или трансмембранными спиралями . [26] [27] Внеклеточные части рецептора могут быть гликозилированы . Эти внеклеточные петли также содержат два высококонсервативных остатка цистеина , которые образуют дисульфидные связи для стабилизации структуры рецептора. Некоторые белки с семью трансмембранными спиралями ( каналродопсин ), которые напоминают GPCR, могут содержать ионные каналы внутри своего белка.
В 2000 году была решена первая кристаллическая структура млекопитающего GPCR, бычьего родопсина ( 1F88 ). [28] В 2007 году была решена первая структура человеческого GPCR [29] [1] [30] Эта структура человеческого β 2 -адренергического рецептора GPCR оказалась очень похожей на бычий родопсин. Также были определены структуры активированных или связанных с агонистом GPCR. [31] [32] [33] [34] Эти структуры показывают, как связывание лиганда на внеклеточной стороне рецептора приводит к конформационным изменениям на цитоплазматической стороне рецептора. Самым большим изменением является внешнее перемещение цитоплазматической части 5-й и 6-й трансмембранной спирали (TM5 и TM6). Структура активированного бета-2-адренергического рецептора в комплексе с Gs подтвердила , что Gα связывается с полостью, созданной этим движением. [35]
GPCR демонстрируют структуру, похожую на структуру некоторых других белков с семью трансмембранными доменами , таких как микробные родопсины и рецепторы адипонектина 1 и 2 ( ADIPOR1 и ADIPOR2 ). Однако эти рецепторы и каналы 7TMH (7-трансмембранные спирали) не ассоциируются с G-белками . Кроме того, ADIPOR1 и ADIPOR2 ориентированы противоположно GPCR в мембране (т. е. GPCR обычно имеют внеклеточный N-конец , цитоплазматический C-конец , тогда как ADIPOR инвертированы). [36]
С точки зрения структуры, GPCR характеризуются внеклеточным N-концом , за которым следуют семь трансмембранных (7-TM) α-спиралей (TM-1 к TM-7), соединенных тремя внутриклеточными (IL-1 к IL-3) и тремя внеклеточными петлями (EL-1 к EL-3), и, наконец, внутриклеточным C-концом . GPCR организуется в третичную структуру, напоминающую бочку, с семью трансмембранными спиралями, образующими полость внутри плазматической мембраны, которая служит доменом связывания лиганда , который часто покрыт EL-2. Однако лиганды могут также связываться в другом месте, как в случае более объемных лигандов (например, белков или крупных пептидов ), которые вместо этого взаимодействуют с внеклеточными петлями или, как показано на примере метаботропных глутаматных рецепторов класса C (mGluR), с N-концевым хвостом. Класс C GPCR отличается своим большим N-концевым хвостом, который также содержит домен связывания лиганда. При связывании глутамата с mGluR N-концевой хвост претерпевает конформационное изменение, которое приводит к его взаимодействию с остатками внеклеточных петель и доменов TM. Конечным эффектом всех трех типов активации, вызванной агонистом, является изменение относительной ориентации спиралей TM (подобное скручивающему движению), что приводит к более широкой внутриклеточной поверхности и «раскрытию» остатков внутриклеточных спиралей и доменов TM, имеющих решающее значение для функции передачи сигнала (т. е. сопряжения G-белка). Обратные агонисты и антагонисты также могут связываться с рядом различных участков, но конечным эффектом должно быть предотвращение этой переориентации спирали TM. [3]
Структура N- и C-концевых хвостов GPCR может также выполнять важные функции помимо связывания лиганда. Например, C-конец мускариновых рецепторов M3 достаточен , а шестиаминокислотный полиосновный домен (KKKRRK) в C-конце необходим для его предварительной сборки с белками Gq . [ 37] В частности, C-конец часто содержит остатки серина (Ser) или треонина (Thr), которые при фосфорилировании увеличивают сродство внутриклеточной поверхности к связыванию белков-скаффолдеров, называемых β- аррестинами (β-arr). [38] После связывания β-аррестины как стерически предотвращают связывание G-белка, так и могут привлекать другие белки, что приводит к созданию сигнальных комплексов, участвующих в активации пути киназы, регулируемой внеклеточным сигналом ( ERK ), или эндоцитозе рецептора (интернализации). Поскольку фосфорилирование этих остатков Ser и Thr часто происходит в результате активации GPCR, опосредованное β-arr разделение G-белка и интернализация GPCR являются важными механизмами десенсибилизации . [ 39] Кроме того, существуют интернализованные «мегакомплексы», состоящие из одного GPCR, β-arr (в конформации хвоста), [40] [41] и гетеротримерного G-белка, которые могут отвечать за передачу белковых сигналов от эндосом. [42] [43]
Последняя общая структурная тема среди GPCR — пальмитоилирование одного или нескольких участков C-концевого хвоста или внутриклеточных петель. Пальмитоилирование — это ковалентная модификация остатков цистеина (Cys) посредством добавления гидрофобных ацильных групп , и имеет эффект нацеливания рецептора на богатые холестерином и сфинголипидами микродомены плазматической мембраны, называемые липидными плотами . Поскольку многие из нижестоящих трансдукторных и эффекторных молекул GPCR (включая те, которые участвуют в путях отрицательной обратной связи ) также нацелены на липидные плоты, это имеет эффект облегчения быстрой рецепторной сигнализации.
GPCR реагируют на внеклеточные сигналы, опосредованные огромным разнообразием агонистов, от белков до биогенных аминов и протонов , но все они передают этот сигнал через механизм сопряжения G-белка. Это становится возможным благодаря домену фактора обмена гуанин -нуклеотидов ( GEF ), в первую очередь образованному комбинацией IL-2 и IL-3 вместе с соседними остатками связанных с ними спиралей TM.
Рецептор, связанный с G-белком, активируется внешним сигналом в форме лиганда или другого сигнального посредника. Это создает конформационное изменение в рецепторе, вызывая активацию G-белка . Дальнейший эффект зависит от типа G-белка. G-белки впоследствии инактивируются активирующими GTPase белками, известными как RGS-белки .
GPCR включают один или несколько рецепторов для следующих лигандов: медиаторы сенсорных сигналов (например, световые и обонятельные стимулирующие молекулы); аденозин , бомбезин , брадикинин , эндотелин , γ-аминомасляная кислота ( ГАМК ), фактор роста гепатоцитов ( HGF ), меланокортины , нейропептид Y , опиоидные пептиды, опсины , соматостатин , GH , тахикинины , члены семейства вазоактивных кишечных пептидов и вазопрессин ; биогенные амины (например, дофамин , адреналин , норадреналин , гистамин , серотонин и мелатонин ); глутамат ( метаботропный эффект); глюкагон ; ацетилхолин ( мускариновый эффект); хемокины ; липидные медиаторы воспаления (например, простагландины , простаноиды , фактор активации тромбоцитов и лейкотриены ); пептидные гормоны (например, кальцитонин , анафилатоксин C5a , фолликулостимулирующий гормон [ФСГ], гонадотропин-рилизинг-гормон [ГнРГ], нейрокинин , тиреотропин-рилизинг-гормон [ТРГ] и окситоцин ); и эндоканнабиноиды .
GPCR, действующие как рецепторы для стимулов, которые еще не идентифицированы, известны как сиротские рецепторы .
Однако, в отличие от других типов рецепторов, которые были изучены, где лиганды связываются снаружи с мембраной, лиганды GPCR обычно связываются внутри трансмембранного домена. Однако, активируемые протеазой рецепторы активируются путем расщепления части их внеклеточного домена. [45]
Передача сигнала через мембрану рецептором не полностью изучена. Известно, что в неактивном состоянии GPCR связан с гетеротримерным комплексом G-белка. Связывание агониста с GPCR приводит к конформационному изменению рецептора, которое передается связанной субъединице G α гетеротримерного белка G через динамику белкового домена . Активированная субъединица G α обменивает GTP вместо GDP , что, в свою очередь, запускает диссоциацию субъединицы G α от димера G βγ и от рецептора. Диссоциированные субъединицы G α и G βγ взаимодействуют с другими внутриклеточными белками, продолжая каскад передачи сигнала, в то время как освобожденный GPCR способен повторно связываться с другим гетеротримерным белком G, образуя новый комплекс, который готов инициировать еще один раунд передачи сигнала. [46]
Считается, что молекула рецептора существует в конформационном равновесии между активным и неактивным биофизическими состояниями. [47] Связывание лигандов с рецептором может смещать равновесие в сторону активных состояний рецептора. Существует три типа лигандов: агонисты — это лиганды, которые смещают равновесие в пользу активных состояний; обратные агонисты — это лиганды, которые смещают равновесие в пользу неактивных состояний; и нейтральные антагонисты — это лиганды, которые не влияют на равновесие. Пока неизвестно, чем именно отличаются друг от друга активные и неактивные состояния.
Когда рецептор неактивен, домен GEF может быть связан с также неактивной α-субъединицей гетеротримерного G-белка . Эти «G-белки» представляют собой тример субъединиц α, β и γ (известных как Gα, Gβ и Gγ соответственно), который становится неактивным при обратимом связывании с гуанозиндифосфатом (GDP) (или, альтернативно, без гуаниннуклеотида), но активным при связывании с гуанозинтрифосфатом (GTP). После активации рецептора домен GEF, в свою очередь, аллостерически активирует G-белок, способствуя обмену молекулы GDP на GTP в α-субъединице G-белка. Клетка поддерживает соотношение цитозольного GTP:GDP 10:1, поэтому обмен на GTP обеспечивается. В этот момент субъединицы G-белка диссоциируют от рецептора, а также друг от друга, образуя мономер Gα-GTP и тесно взаимодействующий димер Gβγ , которые теперь могут свободно модулировать активность других внутриклеточных белков. Однако степень, в которой они могут диффундировать , ограничена из-за пальмитоилирования Gα и наличия изопреноидной части, ковалентно добавленной к C-концам Gγ.
Поскольку Gα также обладает способностью к медленному гидролизу GTP→GDP , неактивная форма α-субъединицы (Gα-GDP) в конечном итоге регенерируется, что позволяет реассоциироваться с димером Gβγ для образования «отдыхающего» G-белка, который может снова связываться с GPCR и ожидать активации. Скорость гидролиза GTP часто ускоряется из-за действий другого семейства аллостерических модулирующих белков, называемых регуляторами сигнализации G-белка , или белками RGS, которые являются типом белка, активирующего GTPase , или GAP. Фактически, многие из первичных эффекторных белков (например, аденилатциклазы ), которые активируются/инактивируются при взаимодействии с Gα-GTP, также обладают активностью GAP. Таким образом, даже на этой ранней стадии процесса сигнализация, инициированная GPCR, имеет способность к самопрекращению.
Было показано, что нисходящие сигналы GPCR, возможно, взаимодействуют с сигналами интегрина , такими как FAK . [48] Сигналы интегрина будут фосфорилировать FAK, что затем может снизить активность GPCR G αs .
Если рецептор в активном состоянии сталкивается с G-белком , он может активировать его. Некоторые данные свидетельствуют о том, что рецепторы и G-белки на самом деле предварительно связаны. [37] Например, связывание G-белков с рецепторами влияет на сродство рецептора к лигандам. Активированные G-белки связаны с GTP .
Дальнейшая передача сигнала зависит от типа G-белка. Фермент аденилатциклаза является примером клеточного белка, который может регулироваться G-белком, в данном случае G-белком G s . Активность аденилатциклазы активируется, когда она связывается с субъединицей активированного G-белка. Активация аденилатциклазы заканчивается, когда G-белок возвращается в GDP -связанное состояние.
Аденилатциклазы (из которых у человека известны 9 мембраносвязанных и одна цитозольная формы) могут также активироваться или ингибироваться другими способами (например, связыванием Ca2+/ кальмодулина ), что может изменять активность этих ферментов аддитивным или синергическим образом вместе с G-белками.
Сигнальные пути, активируемые через GPCR, ограничены первичной последовательностью и третичной структурой самого GPCR, но в конечном итоге определяются конкретной конформацией, стабилизированной конкретным лигандом , а также доступностью молекул -трансдьюсеров . В настоящее время считается, что GPCR используют два основных типа трансдьюсеров: G-белки и β-аррестины . Поскольку β-аррестины имеют высокое сродство только к фосфорилированной форме большинства GPCR (см. выше или ниже), большая часть сигнализации в конечном итоге зависит от активации G-белка. Однако возможность взаимодействия позволяет осуществлять сигнализацию, независимую от G-белка.
Существует три основных сигнальных пути, опосредованных G-белком, опосредованных четырьмя подклассами G-белков, отличающихся друг от друга гомологией последовательностей ( G αs , G αi/o , G αq/11 и G α12/13 ). Каждый подкласс G-белка состоит из нескольких белков, каждый из которых является продуктом нескольких генов или вариаций сплайсинга , которые могут придавать им различия от едва заметных до отчетливых в отношении сигнальных свойств, но в целом они, по-видимому, разумно сгруппированы в четыре класса. Поскольку свойства передачи сигнала различных возможных комбинаций βγ, по-видимому, не отличаются радикально друг от друга, эти классы определяются в соответствии с изоформой их α-субъединицы. [6] : 1163
Хотя большинство GPCR способны активировать более одного подтипа Gα, они также демонстрируют предпочтение одного подтипа перед другим. Когда активированный подтип зависит от лиганда, связанного с GPCR, это называется функциональной селективностью (также известной как агонист-направленный трафик или конформационно-специфический агонизм). Однако связывание любого отдельного конкретного агониста может также инициировать активацию нескольких различных G-белков, поскольку он может быть способен стабилизировать более одной конформации домена GEF GPCR , даже в течение одного взаимодействия. Кроме того, конформация, которая предпочтительно активирует одну изоформу Gα, может активировать другую, если предпочтительная менее доступна. Кроме того, пути обратной связи могут приводить к модификациям рецептора (например, фосфорилированию), которые изменяют предпочтение G-белка. Независимо от этих различных нюансов, предпочтительный партнер по связыванию GPCR обычно определяется в соответствии с G-белком, наиболее очевидно активированным эндогенным лигандом в большинстве физиологических или экспериментальных условий.
Приведенные выше описания игнорируют эффекты Gβγ -сигнализации, которые также могут быть важны, в частности, в случае активированных G αi/o -сопряженных GPCR. Первичными эффекторами Gβγ являются различные ионные каналы, такие как регулируемые G-белком внутренние выпрямляющие каналы K + (GIRK), P / Q - и N-типа потенциалзависимые каналы Ca 2+ , а также некоторые изоформы AC и PLC, наряду с некоторыми изоформами фосфоинозитид-3-киназы (PI3K).
Хотя они классически считаются работающими только вместе, GPCR могут передавать сигналы через независимые от G-белка механизмы, а гетеротримерные G-белки могут играть функциональные роли независимо от GPCR. GPCR могут передавать сигналы независимо через многие белки, уже упомянутые для их ролей в зависимой от G-белка сигнализации, такие как β-arrs , GRK и Srcs . Было показано, что такая сигнализация физиологически значима, например, сигнализация β-аррестина, опосредованная хемокиновым рецептором CXCR3, была необходима для полной эффективности хемотаксиса активированных Т-клеток. [49] Кроме того, дополнительные белки-каркасы, участвующие в субклеточной локализации GPCR (например, белки, содержащие домен PDZ ), также могут действовать как передатчики сигнала. Чаще всего эффектор является членом семейства MAPK .
В конце 1990-х годов начали накапливаться доказательства, позволяющие предположить, что некоторые GPCR способны передавать сигналы без G-белков. Было показано, что митоген-активируемая протеинкиназа ERK2 , ключевой медиатор передачи сигнала ниже по течению от активации рецептора во многих путях, активируется в ответ на опосредованную цАМФ активацию рецептора в слизистой плесени D. discoideum, несмотря на отсутствие связанных α- и β-субъединиц G-белка. [50]
В клетках млекопитающих было продемонстрировано, что хорошо изученный β2 - адренорецептор активирует путь ERK2 после опосредованного аррестином разъединения сигнализации, опосредованной G-белком. Поэтому кажется вероятным, что некоторые механизмы, которые ранее считались связанными исключительно с десенсибилизацией рецепторов, на самом деле являются примерами переключения рецепторами своего сигнального пути, а не просто выключения.
В клетках почек было показано, что рецептор брадикинина B2 напрямую взаимодействует с протеиновой тирозиновой фосфатазой. Наличие тирозин-фосфорилированной последовательности ITIM (иммунорецепторный тирозин-основанный ингибирующий мотив) в рецепторе B2 необходимо для опосредования этого взаимодействия и, следовательно, антипролиферативного эффекта брадикинина. [51]
Хотя это относительно незрелая область исследований, похоже, что гетеротримерные G-белки также могут принимать участие в передаче сигналов, не связанной с GPCR. Имеются данные о ролях в качестве передатчиков сигналов почти во всех других типах рецептор-опосредованной передачи сигналов, включая интегрины , рецепторные тирозинкиназы (RTK), рецепторы цитокинов ( JAK/STAT ), а также модуляцию различных других «вспомогательных» белков, таких как GEF , ингибиторы диссоциации гуанин-нуклеотидов (GDI) и протеинфосфатазы . Могут быть даже специфические белки этих классов, чья основная функция является частью GPCR-независимых путей, называемых активаторами сигнализации G-белка (AGS). Как повсеместность этих взаимодействий, так и важность субъединиц Gα и Gβγ для этих процессов до сих пор неясны.
Существует два основных пути передачи сигнала с участием рецепторов, связанных с G-белком : сигнальный путь цАМФ и сигнальный путь фосфатидилинозитола . [5]
Передача сигнала цАМФ включает пять основных элементов: рецептор стимулирующего гормона (Rs) или рецептор ингибирующего гормона (Ri); стимулирующий регуляторный G-белок (Gs) или ингибирующий регуляторный G-белок (Gi); аденилатциклаза ; протеинкиназа А (PKA); и фосфодиэстераза цАМФ .
Рецептор стимулирующего гормона (Rs) — это рецептор, который может связываться со стимулирующими сигнальными молекулами, тогда как рецептор ингибирующего гормона (Ri) — это рецептор, который может связываться с ингибирующими сигнальными молекулами.
Стимулирующий регуляторный G-белок — это G-белок, связанный с рецептором стимулирующего гормона (Rs), и его α-субъединица при активации может стимулировать активность фермента или другого внутриклеточного метаболизма. Напротив, ингибирующий регуляторный G-белок связан с рецептором ингибирующего гормона, и его α-субъединица при активации может ингибировать активность фермента или другого внутриклеточного метаболизма.
Аденилатциклаза — это 12-трансмембранный гликопротеин, который катализирует превращение АТФ в цАМФ с помощью кофактора Mg 2+ или Mn 2+ . Образующийся цАМФ является вторичным мессенджером в клеточном метаболизме и аллостерическим активатором протеинкиназы А.
Протеинкиназа А является важным ферментом в клеточном метаболизме из-за своей способности регулировать клеточный метаболизм путем фосфорилирования определенных комитированных ферментов в метаболическом пути. Она также может регулировать экспрессию определенных генов, клеточную секрецию и проницаемость мембран. Белковый фермент содержит две каталитические субъединицы и две регуляторные субъединицы. Когда нет цАМФ, комплекс неактивен. Когда цАМФ связывается с регуляторными субъединицами, их конформация изменяется, вызывая диссоциацию регуляторных субъединиц, что активирует протеинкиназу А и допускает дальнейшие биологические эффекты.
Затем эти сигналы могут быть прекращены фосфодиэстеразой цАМФ, которая представляет собой фермент, расщепляющий цАМФ до 5'-АМФ и инактивирующий протеинкиназу А.
В сигнальном пути фосфатидилинозитола внеклеточная сигнальная молекула связывается с рецептором G-белка (Gq ) на поверхности клетки и активирует фосфолипазу C , которая расположена на плазматической мембране . Липаза гидролизует фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат (PIP2) на два вторичных мессенджера: инозитол-1,4,5-трифосфат (IP3) и диацилглицерол (DAG). IP3 связывается с рецептором IP3 в мембране гладкого эндоплазматического ретикулума и митохондрий, открывая каналы Ca2 + . DAG помогает активировать протеинкиназу C (PKC), которая фосфорилирует многие другие белки, изменяя их каталитическую активность, что приводит к клеточным ответам.
Эффекты Ca 2+ также примечательны: он взаимодействует с DAG при активации PKC и может активировать путь киназы CaM , в котором модулируемый кальцием белок кальмодулин (CaM) связывает Ca 2+ , претерпевает изменение конформации и активирует киназу CaM II, которая обладает уникальной способностью увеличивать свою связывающую способность с CaM путем автофосфорилирования, делая CaM недоступным для активации других ферментов. Затем киназа фосфорилирует целевые ферменты, регулируя их активность. Два сигнальных пути связаны вместе Ca 2+ -CaM, который также является регуляторной субъединицей аденилатциклазы и фосфодиэстеразы в сигнальном пути цАМФ.
GPCR становятся десенсибилизированными при воздействии их лиганда в течение длительного периода времени. Существует две признанные формы десенсибилизации: 1) гомологичная десенсибилизация , при которой активированный GPCR подавляется; и 2) гетерологичная десенсибилизация , при которой активированный GPCR вызывает подавление другого GPCR. Ключевой реакцией этого подавления является фосфорилирование внутриклеточного (или цитоплазматического ) домена рецептора протеинкиназами .
Циклические АМФ-зависимые протеинкиназы ( протеинкиназа А ) активируются сигнальной цепью, исходящей от белка G (который был активирован рецептором) через аденилатциклазу и циклический АМФ (цАМФ). В механизме обратной связи эти активированные киназы фосфорилируют рецептор. Чем дольше рецептор остается активным, тем больше киназ активируется и тем больше рецепторов фосфорилируется. В β2 - адренорецепторах это фосфорилирование приводит к переключению связи с класса Gs G -белка на класс Gi . [52] Фосфорилирование , опосредованное цАМФ-зависимым PKA, может вызывать гетерологичную десенсибилизацию в рецепторах, отличных от активированных. [53]
Связанные с G -белком рецепторные киназы (GRK) являются протеинкиназами, которые фосфорилируют только активные GPCR. [54] Связанные с G-белком рецепторные киназы (GRK) являются ключевыми модуляторами сигнализации рецепторов, связанных с G-белком (GPCR). Они составляют семейство из семи серин-треониновых протеинкиназ млекопитающих, которые фосфорилируют рецептор, связанный с агонистом. Фосфорилирование рецепторов, опосредованное GRK, быстро инициирует глубокое нарушение сигнализации рецепторов и десенсибилизацию. Активность GRK и субклеточное нацеливание жестко регулируются взаимодействием с доменами рецепторов, субъединицами G-белка, липидами, якорными белками и кальций-чувствительными белками. [55]
Фосфорилирование рецептора может иметь два последствия:
Как упоминалось выше, G-белки могут прекращать свою собственную активацию из-за их внутренней способности к гидролизу GTP→GDP . Однако эта реакция протекает с низкой скоростью (≈0,02 раза/сек), и, таким образом, для дезактивации любого отдельного G-белка потребовалось бы около 50 секунд, если бы не вступили в игру другие факторы. Действительно, существует около 30 изоформ белков RGS , которые при связывании с Gα через свой домен GAP ускоряют скорость гидролиза до ≈30 раз/сек. Это 1500-кратное увеличение скорости позволяет клетке реагировать на внешние сигналы с высокой скоростью, а также с пространственным разрешением из-за ограниченного количества вторичного мессенджера , который может быть сгенерирован, и ограниченного расстояния, на которое G-белок может диффундировать за 0,03 секунды. По большей части, белки RGS беспорядочны в своей способности дезактивировать G-белки, в то время как RGS, участвующий в данном сигнальном пути, по-видимому, больше определяется тканью и вовлеченным GPCR, чем чем-либо еще. Кроме того, белки RGS выполняют дополнительную функцию увеличения скорости обмена ГТФ-ГДФ в GPCR (т.е. действуют как своего рода ко-ГЭФ), что дополнительно способствует временному разрешению сигнализации GPCR.
Кроме того, GPCR может быть десенсибилизирован сам по себе. Это может произойти как:
После того, как β-аррестин связывается с GPCR, он претерпевает конформационное изменение, что позволяет ему служить в качестве белка-каркаса для комплекса адаптеров, называемого AP-2 , который, в свою очередь, рекрутирует другой белок, называемый клатрином . Если достаточное количество рецепторов в локальной области рекрутируют клатрин таким образом, они агрегируют, и мембрана отпочковывается внутрь в результате взаимодействия между молекулами клатрина в процессе, называемом опсонизацией . Как только ямка была отщипнута от плазматической мембраны из-за действия двух других белков, называемых амфифизином и динамином , она теперь является эндоцитарной пузырькой . В этот момент молекулы адаптера и клатрин диссоциируют , и рецептор либо транспортируется обратно к плазматической мембране, либо направляется в лизосомы для деградации .
В любой точке этого процесса β-аррестины могут также привлекать другие белки, такие как нерецепторная тирозинкиназа (nRTK), c-SRC , которая может активировать ERK1/2 или другую митоген-активируемую протеинкиназу (MAPK), сигнализирующую, например, через фосфорилирование малой GTPase , Ras , или привлекать белки каскада ERK напрямую (то есть Raf-1 , MEK , ERK-1/2), в точке которой инициируется сигнализация из-за их близкого расположения друг к другу. Другой целью c-SRC являются молекулы динамина, участвующие в эндоцитозе. Динамины полимеризуются вокруг шейки входящей везикулы, и их фосфорилирование c-SRC обеспечивает энергию, необходимую для конформационного изменения, позволяющего окончательно «отщепить» от мембраны.
Десенсибилизация рецептора опосредуется посредством комбинации фосфорилирования, связывания β-arr и эндоцитоза, как описано выше. Понижающая регуляция происходит, когда эндоцитированный рецептор встраивается в эндосому, которая перемещается для слияния с органеллой, называемой лизосомой. Поскольку лизосомальные мембраны богаты протонными насосами, их внутренняя часть имеет низкий pH (≈4,8 по сравнению с pH≈7,2 цитозоля), что действует на денатурацию GPCR. Кроме того, лизосомы содержат много деградирующих ферментов , включая протеазы, которые могут функционировать только при таком низком pH, и поэтому пептидные связи, соединяющие остатки GPCR вместе, могут быть расщеплены. Будет ли данный рецептор перемещен в лизосому, задержан в эндосомах или перемещен обратно в плазматическую мембрану, зависит от множества факторов, включая тип рецептора и величину сигнала. Регуляция GPCR дополнительно опосредована факторами транскрипции генов. Эти факторы могут увеличивать или уменьшать транскрипцию генов и, таким образом, увеличивать или уменьшать генерацию новых рецепторов (повышающая или понижающая регуляция), которые перемещаются к клеточной мембране.
Олигомеризация рецепторов, сопряженных с G-белком, является широко распространенным явлением. Одним из наиболее изученных примеров является метаботропный рецептор GABA B. Этот так называемый конститутивный рецептор образуется путем гетеродимеризации субъединиц GABA B R1 и GABA B R2 . Экспрессия GABA B R1 без GABA B R2 в гетерологичных системах приводит к удержанию субъединицы в эндоплазматическом ретикулуме . Экспрессия только субъединицы GABA B R2, тем временем, приводит к поверхностной экспрессии субъединицы, хотя и без функциональной активности (т. е. рецептор не связывает агонист и не может инициировать ответ после воздействия агониста). Экспрессия двух субъединиц вместе приводит к экспрессии функционального рецептора на плазматической мембране. Было показано, что связывание GABA B R2 с GABA B R1 вызывает маскировку сигнала удержания [60] функциональных рецепторов. [61]
Передача сигнала , опосредованная суперсемейством GPCR, восходит к истокам многоклеточности . GPCR, подобные млекопитающим, обнаружены у грибов и были классифицированы в соответствии с системой классификации GRAFS, основанной на отпечатках GPCR. [17] Идентификация членов суперсемейства в эукариотическом домене и сравнение мотивов, специфичных для семейства, показали, что суперсемейство GPCR имеет общее происхождение. [62] Характерные мотивы указывают на то, что три из пяти семейств GRAFS, Rhodopsin , Adhesion и Frizzled , произошли от рецепторов цАМФ Dictyostelium discoideum до разделения опистоконтов . Позже семейство Secretin произошло от семейства рецепторов Adhesion GPCR до разделения нематод . [17] GPCR насекомых, по-видимому, находятся в своей собственной группе, а Taste2 идентифицирован как происходящий от родопсина . [62] Обратите внимание, что разделение секретин / адгезия основано на предполагаемой функции, а не на сигнатуре, поскольку классический класс B (7tm_2, Pfam PF00002) используется для идентификации обоих в исследованиях.
на молекулярные и математические модели для первоначального ответа рецептора
Данные, диаграммы и веб-инструменты для рецепторов, сопряженных с G-белком (GPCR).; Мунк С., Исберг В., Мордальски С., Харпсё К., Ратаж К., Хаузер А.С. и др. (июль 2016 г.). «GPCRdb: база данных рецепторов, связанных с G-белком - введение». Британский журнал фармакологии . 173 (14): 2195–207. дои : 10.1111/bph.13509. ПМЦ 4919580 . ПМИД 27155948.
GPCR
Инициатива по структуре белка: Центр биологической сети, направленный на определение трехмерных структур репрезентативных белков семейства GPCR