РНК-интерференция

Биологический процесс регуляции генов

Лентивирусная доставка разработанных shRNA и механизм РНК-интерференции в клетках млекопитающих.

РНК-интерференция ( РНКи ) — это биологический процесс, в котором молекулы РНК участвуют в специфичном для последовательности подавлении экспрессии генов с помощью двухцепочечной РНК посредством репрессии трансляции или транскрипции. Исторически РНКи была известна под другими названиями, включая ко-супрессию , посттранскрипционное молчание генов (PTGS) и подавление . Детальное изучение каждого из этих, казалось бы, разных процессов показало, что все эти явления на самом деле были РНКи. Эндрю Файер и Крейг К. Мелло получили Нобелевскую премию по физиологии и медицине 2006 года за работу над РНКи у нематод Caenorhabditis elegans , которую они опубликовали в 1998 году. С момента открытия РНКи и ее регуляторного потенциала стало очевидно, что РНКи имеет огромный потенциал в подавлении желаемых генов. РНКи теперь известна как точная, эффективная, стабильная и лучшая антисмысловая терапия для подавления генов. ^[1] Антисмысловая РНК , продуцируемая внутриклеточно с помощью вектора экспрессии, может быть разработана и найти применение в качестве новых терапевтических агентов. ^[2]

Два типа малых молекул рибонуклеиновой кислоты (РНК), микроРНК (миРНК) и малая интерферирующая РНК ( миРНК ), играют центральную роль в компонентах пути РНКи. Как только мРНК деградирует, происходит посттранскрипционное молчание, поскольку трансляция белка предотвращается. Транскрипция может ингибироваться с помощью механизма претранскрипционного молчания РНКи, посредством которого ферментный комплекс катализирует метилирование ДНК в геномных положениях, комплементарных комплексным миРНК или микроРНК. РНКи играет важную роль в защите клеток от паразитных нуклеотидных последовательностей (например, вирусов или транспозонов ), а также влияет на развитие организмов.

Путь РНКи — это естественный процесс, обнаруженный во многих эукариотах и ​​клетках животных. Он инициируется ферментом Dicer , который расщепляет длинные молекулы двухцепочечной РНК (дцРНК) на короткие двухцепочечные фрагменты, состоящие примерно из 21–23 нуклеотидов siRNA. Каждая миРНК раскручивается на две одноцепочечные РНК (оцРНК): пассажирскую (смысловую) цепь и направляющую (антисмысловую) цепь. Пассажирская цепь затем расщепляется белком Argonaute 2 (Ago2). Пассажирская цепь разрушается, а направляющая цепь включается в РНК-индуцированный комплекс молчания (RISC). Затем сборка RISC связывает и разрушает целевую мРНК. В частности, это достигается, когда направляющая цепь спаривается с комплементарной последовательностью в молекуле мРНК и индуцирует расщепление с помощью Ago2, каталитического компонента RISC. У некоторых организмов этот процесс распространяется системно, несмотря на изначально ограниченные молярные концентрации миРНК. ^[3]

РНКи является ценным исследовательским инструментом как в клеточной культуре , так и в живых организмах , поскольку синтетическая дцРНК, введенная в клетки, может избирательно и надежно вызывать подавление определенных представляющих интерес генов. РНКи может использоваться для крупномасштабных скринингов, которые систематически отключают каждый ген (и последующие белки, которые он кодирует) в клетке, что может помочь идентифицировать компоненты, необходимые для конкретного клеточного процесса или такого события, как деление клетки . Путь также используется в качестве практического инструмента для производства продуктов питания, лекарств и инсектицидов . ^[4]

Клеточный механизм

Белок Dicer из Giardia интестиналис , который катализирует расщепление дцРНК до миРНК. Домены РНКазы окрашены в зеленый цвет, домен PAZ — в желтый, домен платформы — в красный, а спираль соединителя — в синий цвет . ^[5]

RNAi представляет собой РНК-зависимый процесс молчания генов , который контролируется RISC и инициируется короткими двухцепочечными молекулами РНК в цитоплазме клетки, где они взаимодействуют с каталитическим компонентом RISC Argonaute . ^[6] Когда дцРНК является экзогенной (поступающей в результате заражения вирусом с РНК-геномом или лабораторных манипуляций), РНК импортируется непосредственно в цитоплазму и расщепляется на короткие фрагменты с помощью Dicer. Инициирующая дцРНК также может быть эндогенной (происходящей из клетки), как в случае пре-микроРНК, экспрессируемых из РНК-кодирующих генов в геноме. Первичные транскрипты таких генов сначала процессируются с образованием характерной структуры «стебель-петля » пре-миРНК в ядре , а затем экспортируются в цитоплазму. Таким образом, два пути дцРНК, экзогенный и эндогенный, сходятся в RISC. ^[7]

Экзогенная дцРНК инициирует РНКи путем активации белка рибонуклеазы Dicer ^[8] , который связывает и расщепляет дцРНК у растений или короткие шпильковые РНК (shRNA) у людей, с образованием двухцепочечных фрагментов из 20–25 пар оснований с выступающим 2-нуклеотидом. на 3'-конце. ^[9] Биоинформатические исследования геномов множества организмов показывают, что такая длина максимизирует специфичность целевого гена и сводит к минимуму неспецифические эффекты. ^[10] Эти короткие двухцепочечные фрагменты называются миРНК . Эти миРНК затем разделяются на отдельные цепи и интегрируются в активный RISC с помощью RISC-загрузочного комплекса (RLC). RLC включает Dicer-2 и R2D2 и имеет решающее значение для объединения Ago2 и RISC. ^[11] Фактор 11, ассоциированный с ТАТА-связывающим белком (TAF11), собирает RLC, облегчая тетрамеризацию Dcr-2-R2D2, что увеличивает аффинность связывания с миРНК в 10 раз. Ассоциация с TAF11 превратит комплекс R2-D2-инициатор (RDI) в RLC. ^[12] R2D2 несет тандемные двухцепочечные РНК-связывающие домены для распознавания термодинамически стабильного конца дуплексов siRNA , тогда как Dicer-2 - другой менее стабильный конец. Загрузка асимметрична: домен MID Ago2 распознает термодинамически стабильный конец siRNA. Следовательно, «пассажирская» (смысловая) цепь, 5'-конец которой отбрасывается MID, выбрасывается, в то время как сохраненная «ведущая» (антисмысловая) цепь взаимодействует с AGO, образуя RISC. ^[11]

После интеграции в RISC основания миРНК соединяются с целевой мРНК и расщепляют ее, тем самым предотвращая ее использование в качестве матрицы трансляции . ^[13] В отличие от siRNA , комплекс RISC, нагруженный микроРНК, сканирует цитоплазматические мРНК на предмет потенциальной комплементарности. Вместо деструктивного расщепления (посредством Ago2) микроРНК скорее нацелены на области 3'-нетранслируемой области (UTR) мРНК, где они обычно связываются с несовершенной комплементарностью, тем самым блокируя доступ рибосом для трансляции. ^[14]

Экзогенная дцРНК обнаруживается и связывается эффекторным белком, известным как RDE-4 у C. elegans и R2D2 у дрозофилы , который стимулирует активность Dicer. ^[15] Механизм, обеспечивающий такую ​​специфичность длины, неизвестен, и этот белок связывает только длинные дцРНК. ^[15]

У C. elegans этот ответ инициации усиливается за счет синтеза популяции «вторичных» миРНК , во время которого инициирующие или «первичные» миРНК, продуцируемые Dicer, используются в качестве матриц. ^[16] Эти «вторичные» миРНК структурно отличаются от миРНК , продуцируемых Dicer , и, по-видимому, продуцируются РНК-зависимой РНК-полимеразой (RdRP). ^{[17] [18]}

микроРНК

Вторичная структура «стебель-петля» пре- микроРНК из Brassica oleracea .

МикроРНК (миРНК) представляют собой геномно кодируемые некодирующие РНК , которые помогают регулировать экспрессию генов , особенно во время развития . ^[19] Феномен РНКи в широком смысле включает в себя эндогенно индуцированные эффекты подавления генов микроРНК, а также подавление, вызванное чужеродной дцРНК. Зрелые микроРНК структурно сходны с siРНК, продуцируемыми из экзогенной дсРНК, но прежде чем достичь зрелости, микроРНК должны сначала подвергнуться обширной посттранскрипционной модификации . МикроРНК экспрессируется из гораздо более длинного гена, кодирующего РНК, в виде первичного транскрипта , известного как при-миРНК , который обрабатывается в ядре клетки до 70-нуклеотидной структуры «стебель-петля» , называемой пре-миРНК , микропроцессорным комплексом . Этот комплекс состоит из фермента РНКазы III , называемого Дроша , и дцРНК-связывающего белка DGCR8 . Часть дсРНК этой пре-миРНК связывается и расщепляется Dicer с образованием зрелой молекулы микроРНК, которая может быть интегрирована в комплекс RISC; таким образом, miRNA и siRNA используют один и тот же нижестоящий клеточный механизм. ^[20] Впервые микроРНК, кодируемая вирусом, была описана у вируса Эпштейна-Барра (EBV). ^[21] После этого в вирусах было описано все больше микроРНК. VIRmiRNA представляет собой обширный каталог, охватывающий вирусные микроРНК, их мишени и противовирусные микроРНК ^[22] (см. также ресурс VIRmiRNA: http://crdd.osdd.net/servers/virmirna/).

siRNA, полученные из предшественников длинных дцРНК, отличаются от miRNA тем, что miRNA, особенно у животных, обычно имеют неполное спаривание оснований с мишенью и ингибируют трансляцию многих различных мРНК со схожими последовательностями. Напротив, siRNA обычно идеально спаривают основания и индуцируют расщепление мРНК только в одной специфической мишени. ^[23] У Drosophila и C. elegans микроРНК и миРНК процессируются различными белками Argonaute и ферментами Dicer. ^{[24] [25]}

Три основных нетранслируемых региона и микроРНК

Три первичных нетранслируемых участка (3'UTR) мРНК часто содержат регуляторные последовательности, которые посттранскрипционно вызывают РНКи. Такие 3'-UTR часто содержат сайты связывания как для микроРНК , так и для регуляторных белков. Связываясь со специфическими сайтами внутри 3'-UTR, микроРНК могут снижать экспрессию генов различных мРНК, либо ингибируя трансляцию, либо непосредственно вызывая деградацию транскрипта. 3'-UTR также может иметь участки сайленсера, которые связывают белки-репрессоры, ингибирующие экспрессию мРНК.

3'-UTR часто содержит элементы ответа микроРНК (MRE) . MRE — это последовательности, с которыми связываются микроРНК. Это преобладающие мотивы в 3'-UTR. Среди всех регуляторных мотивов внутри 3'-UTR (например, включая сайленсеры), MRE составляют около половины мотивов.

По состоянию на 2023 год на веб-сайте miRBase ^[26] , представляющем собой архив последовательностей и аннотаций микроРНК , было перечислено 28 645 записей о 271 биологическом виде. Из них 1917 микроРНК находились в аннотированных локусах микроРНК человека. Было предсказано, что микроРНК содержат в среднем около четырехсот целевых мРНК (влияющих на экспрессию нескольких сотен генов). ^[27] Фридман и др. ^[27] подсчитали, что > 45 000 целевых сайтов микроРНК в 3'UTR мРНК человека консервативны выше фоновых уровней, и > 60% генов, кодирующих белки человека, находились под селективным давлением для поддержания спаривания с микроРНК.

Прямые эксперименты показывают, что одна микроРНК может снизить стабильность сотен уникальных мРНК. ^[28] Другие эксперименты показывают, что одна микроРНК может подавлять продукцию сотен белков, но эта репрессия часто относительно мягкая (менее чем в 2 раза). ^{[29] [30]}

Эффекты нарушения регуляции экспрессии генов микроРНК, по-видимому, важны при раке. ^[31] Например, при раке желудочно-кишечного тракта девять микроРНК были идентифицированы как эпигенетически измененные и эффективные в подавлении ферментов репарации ДНК. ^[32]

Эффекты нарушения регуляции экспрессии генов микроРНК также кажутся важными при нервно-психических расстройствах, таких как шизофрения, биполярное расстройство, большая депрессия, болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера и расстройства аутистического спектра. ^{[33] [34] [35]}

Активация и катализ RISC

Экзогенная дцРНК обнаруживается и связывается эффекторным белком, известным как RDE-4 у C. elegans и R2D2 у дрозофилы , который стимулирует активность Dicer. ^[15] Этот белок связывает только длинные дцРНК, но механизм, обеспечивающий такую ​​специфичность длины, неизвестен. ^[15] Этот РНК-связывающий белок затем облегчает перенос расщепленных миРНК в комплекс RISC. ^[36]

У C. elegans этот ответ инициации усиливается за счет синтеза популяции «вторичных» миРНК , во время которого инициирующие или «первичные» миРНК, продуцируемые Dicer, используются в качестве матриц. ^[16] Эти «вторичные» миРНК структурно отличаются от миРНК , продуцируемых Dicer , и, по-видимому, продуцируются РНК-зависимой РНК-полимеразой (RdRP). ^{[17] [18]}

Биогенез малых РНК : первичные микроРНК (при-миРНК) транскрибируются в ядре и складываются обратно в виде шпилек, которые затем обрезаются в ядре микропроцессорным комплексом с образованием шпильки пре-РНК размером ~60-70 нуклеотидов. Эта пре-миРНК транспортируется через комплекс ядерных пор (NPC) в цитоплазму, где Дайсер далее разрезает ее до дуплекса микроРНК ~20 нт (пре-миРНК также вступают в путь на этом этапе). Этот дуплекс затем загружается в Ago с образованием «пре-RISC (РНК-индуцируемого комплекса молчания)», а пассажирская цепь высвобождается с образованием активного RISC . ^{[ нужна ссылка на изображение ]}

Слева: полноразмерный белок Argonaute из вида архей Pyrococcus Furiosus . Справа: домен PIWI белка Argonaute в комплексе с двухцепочечной РНК .

Активными компонентами РНК-индуцированного комплекса молчания (RISC) являются эндонуклеазы , называемые белками Argonaute, которые расщепляют целевую цепь мРНК , комплементарную связанной с ними миРНК . ^[6] Поскольку фрагменты, продуцируемые Dicer, являются двухцепочечными, каждый из них теоретически может производить функциональную миРНК . Однако только одна из двух цепей, известная как направляющая цепь , связывает Аргонавта и управляет молчанием генов. Другая антинаправляющая или пассажирская цепь разрушается во время активации RISC. ^[37] Хотя сначала считалось, что эти две цепи разделяет АТФ -зависимая хеликаза , ^[38] этот процесс оказался АТФ-независимым и осуществлялся непосредственно белковыми компонентами RISC. ^{[3] [39]} Однако кинетический анализ РНКи in vitro в присутствии и в отсутствие АТФ показал, что АТФ может потребоваться для раскручивания и удаления расщепленной цепи мРНК из комплекса RISC после катализа. ^[40] Направляющей цепью обычно является та, чей 5'-конец менее стабильно спарен с комплементом, ^[41] но на выбор цепи не влияет направление, в котором Дайсер расщепляет дцРНК перед включением RISC. ^[42] Вместо этого белок R2D2 может служить дифференцирующим фактором, связывая более стабильный 5'-конец цепи-пассажира. ^[43]

Структурную основу связывания РНК с белком Argonaute исследовали с помощью рентгеновской кристаллографии связывающего домена РНК-связанного Argonaute. Здесь фосфорилированный 5'-конец цепи РНК входит в консервативный основной поверхностный карман и устанавливает контакты через двухвалентный катион (атом с двумя положительными зарядами), такой как магний , и посредством ароматической укладки (процесс, который позволяет более чем одному атому совместно использовать электрон, пропуская его туда и обратно) между 5'-нуклеотидом в миРНК и консервативным остатком тирозина . Считается, что этот сайт образует сайт нуклеации для связывания миРНК с ее мишенью мРНК. ^[44] Анализ ингибирующего эффекта несовпадений на 5'- или 3'-конце направляющей цепи показал, что 5'-конец направляющей цепи, вероятно, отвечает за сопоставление и связывание целевой мРНК, тогда как 3'-конец отвечает за физическое расположение целевой мРНК в благоприятной для расщепления области RISC. ^[40]

Непонятно, как активированный комплекс RISC находит комплементарные мРНК внутри клетки. Хотя предполагается, что процесс расщепления связан с трансляцией , трансляция мРНК-мишени не является существенной для деградации, опосредованной РНКи. ^[45] Действительно, RNAi может быть более эффективным против мишеней мРНК, которые не транслируются. ^[46] Белки Argonaute локализованы в определенных областях цитоплазмы, называемых P-тельцами (также цитоплазматические тельца или тельца GW), которые представляют собой области с высокой скоростью распада мРНК; ^[47] Активность микроРНК также сосредоточена в Р-тельцах. ^[48] ​​Разрушение P-тельц снижает эффективность RNAi, что позволяет предположить, что они являются критическим местом в процессе RNAi. ^[49]

Транскрипционное молчание

Фермент Dicer обрезает двухцепочечную РНК с образованием небольшой интерферирующей РНК или микроРНК . Эти процессированные РНК включаются в комплекс РНК-индуцированного молчания (RISC), который нацелен на информационную РНК для предотвращения трансляции . ^[50]

Компоненты пути РНКи используются у многих эукариот для поддержания организации и структуры их геномов . Модификация гистонов и связанная с ней индукция образования гетерохроматина служат для подавления претранскрипционной регуляции генов ; ^[51] этот процесс называется РНК-индуцированным транскрипционным молчанием (RITS) и осуществляется комплексом белков, называемым комплексом RITS. У делящихся дрожжей этот комплекс содержит Argonaute, хромодоменный белок Chp1 и белок Tas3 неизвестной функции. ^[52] Как следствие, для индукции и распространения гетерохроматических областей необходимы белки Argonaute и RdRP. ^[53] Действительно, делеция этих генов у делящихся дрожжей S. pombe нарушает метилирование гистонов и образование центромер , ^[54] вызывая медленную или остановленную анафазу во время клеточного деления . ^[55] В некоторых случаях наблюдалось, что аналогичные процессы, связанные с модификацией гистонов, активируют транскрипцию генов. ^[56]

Механизм, с помощью которого комплекс RITS индуцирует образование и организацию гетерохроматина, недостаточно изучен. Большинство исследований были сосредоточены на области типа спаривания у делящихся дрожжей, которая может не отражать активность других геномных областей/организмов. Поддерживая существующие области гетерохроматина, RITS образует комплекс с siRNAs , комплементарными локальным генам, и стабильно связывает локальные метилированные гистоны, действуя котранскрипционно, разрушая любые возникающие транскрипты пре-мРНК, которые инициируются РНК-полимеразой . Формирование такой области гетерохроматина, хотя и не ее поддержание, является Dicer-зависимым, по-видимому, потому, что Dicer необходим для генерации начального набора siRNAs, которые нацелены на последующие транскрипты. ^[57] Было высказано предположение, что поддержание гетерохроматина функционирует как самоусиливающаяся петля обратной связи, поскольку новые siRNA образуются из случайных возникающих транскриптов с помощью RdRP для включения в локальные комплексы RITS. ^[58] Актуальность наблюдений за областями и центромерами типа спаривания делящихся дрожжей для млекопитающих не ясна, поскольку поддержание гетерохроматина в клетках млекопитающих может быть независимым от компонентов пути RNAi. ^[59]

Перекрестные помехи при редактировании РНК

Тип редактирования РНК , который наиболее распространен у высших эукариот, конвертирует аденозиновые нуклеотиды в инозин в дцРНК с помощью фермента аденозиндезаминазы (ADAR). ^[60] Первоначально в 2000 году было высказано предположение, что пути редактирования РНК RNAi и A→I могут конкурировать за общий субстрат дцРНК. ^[61] Некоторые пре-микроРНК подвергаются редактированию A→I РНК ^{[62] [63]} , и этот механизм может регулировать процессинг и экспрессию зрелых микроРНК. ^[63] Кроме того, по крайней мере, один ADAR млекопитающих может изолировать siRNA из компонентов пути RNAi. ^[64] Дополнительную поддержку этой модели дают исследования на штаммах C. elegans , не имеющих ADAR , показывающие, что редактирование РНК A→I может противодействовать подавлению РНКи эндогенных генов и трансгенов. ^[65]

Иллюстрация основных различий между подавлением генов растений и животных. Нативно экспрессируемая микроРНК или экзогенная малая интерферирующая РНК процессируется Dicer и интегрируется в комплекс RISC , который обеспечивает молчание генов. ^[66]

Различия между организмами

Организмы различаются по своей способности захватывать чужеродную дцРНК и использовать ее в пути РНКи. Эффекты РНКи могут быть как системными, так и наследственными у растений и C. elegans , но не у дрозофилы или млекопитающих. Считается, что у растений РНКи распространяются путем переноса миРНК между клетками через плазмодесмы (каналы в клеточных стенках, которые обеспечивают связь и транспорт). ^[38] Наследственность обусловлена ​​метилированием промоторов, на которые нацелена РНКи; новый образец метилирования копируется в каждом новом поколении клетки. ^[67] Широкое общее различие между растениями и животными заключается в нацеливании эндогенно продуцируемых микроРНК; у растений микроРНК обычно идеально или почти идеально комплементарны своим генам-мишеням и индуцируют прямое расщепление мРНК с помощью RISC, в то время как микроРНК животных имеют тенденцию быть более дивергентными по последовательности и вызывать репрессию трансляции. ^[66] Этот трансляционный эффект может быть достигнут путем ингибирования взаимодействия факторов инициации трансляции с полиадениновым хвостом мРНК . ^[68]

У некоторых эукариотических простейших , таких как Leishmania major и Trypanosoma cruzi, путь RNAi полностью отсутствует. ^{[69] [70]} Большинство или все компоненты также отсутствуют в некоторых грибах , особенно в модельном организме Saccharomyces cerevisiae . ^[71] Присутствие РНКи у других видов почкующихся дрожжей, таких как Saccharomyces castellii и Candida albicans , дополнительно демонстрирует, что индуцирование двух РНКи-родственных белков из S. castellii облегчает РНКи у S. cerevisiae . ^[72] Тот факт, что у некоторых аскомицетов и базидиомицетов отсутствуют пути РНКи, указывает на то, что белки, необходимые для подавления РНК, были потеряны независимо от многих грибных линий , возможно, из-за эволюции нового пути с аналогичной функцией или из-за отсутствия селективного преимущества у некоторых грибковых линий. ниши . ^[73]

Родственные прокариотические системы

На экспрессию генов у прокариот влияет система на основе РНК, в некоторых отношениях сходная с РНКи. Здесь гены, кодирующие РНК, контролируют численность или трансляцию мРНК, производя комплементарную РНК, которая отжигается с мРНК. Однако эти регуляторные РНК обычно не считаются аналогами микроРНК, поскольку в них не участвует фермент Dicer. ^[74] Было высказано предположение, что системы интерференции CRISPR у прокариот аналогичны эукариотическим системам РНКи, хотя ни один из белковых компонентов не является ортологичным . ^[75]

Биологические функции

Иммунитет

РНКи является жизненно важной частью иммунного ответа на вирусы и другой чужеродный генетический материал , особенно у растений, где она также может предотвращать саморазмножение транспозонов. ^[76] Такие растения, как Arabidopsis thaliana, экспрессируют множество гомологов Dicer , которые специализируются на различной реакции, когда растение подвергается воздействию различных вирусов. ^[77] Еще до того, как путь РНКи был полностью понятен, было известно, что индуцированное молчание генов в растениях может распространяться по всему растению с системным эффектом и может передаваться от подвоя к привойным растениям посредством прививки . ^[78] С тех пор это явление было признано особенностью иммунной системы растения, которая позволяет всему растению реагировать на вирус после первоначального локального контакта. ^[79] В ответ многие вирусы растений развили сложные механизмы подавления ответа РНКи. ^[80] К ним относятся вирусные белки, которые связывают короткие двухцепочечные фрагменты РНК с одноцепочечными выступающими концами, например, те, что производятся Dicer. ^[81] Некоторые геномы растений также экспрессируют эндогенные миРНК в ответ на заражение определенными типами бактерий . ^[82] Эти эффекты могут быть частью генерализованной реакции на патогены, которая подавляет любой метаболический процесс в организме хозяина, который способствует процессу инфекции. ^[83]

Хотя животные обычно экспрессируют меньше вариантов фермента Dicer, чем растения, у некоторых животных РНКи вызывает противовирусный ответ. И у ювенильных, и у взрослых дрозофил РНКи важна для противовирусного врожденного иммунитета и активна против таких патогенов, как вирус дрозофилы X. ^{[84] [85]} Аналогичная роль в иммунитете может действовать и у C. elegans , поскольку активность белков Argonaute повышается в ответ на вирусы и черви, которые сверхэкспрессируют компоненты пути RNAi, устойчивые к вирусной инфекции. ^{[86] [87]}

Роль РНКи во врожденном иммунитете млекопитающих плохо изучена, и данных относительно мало. Однако существование вирусов, кодирующих гены, способные подавлять РНКи-ответ в клетках млекопитающих, может свидетельствовать в пользу РНКи-зависимого иммунного ответа млекопитающих, ^{[88] [89]} , хотя эта гипотеза была оспорена как малообоснованная. ^[90] Были представлены доказательства существования функционального противовирусного пути РНКи в клетках млекопитающих. ^{[91] [92]}

Существуют и другие функции РНКи в вирусах млекопитающих, такие как микроРНК, экспрессируемые вирусом герпеса , которые могут действовать как триггеры организации гетерохроматина , опосредующие латентный период вируса. ^[93]

Подавление генов

Эндогенно экспрессируемые микроРНК, включая как интронные , так и межгенные микроРНК, наиболее важны для репрессии трансляции ^[66] и регуляции развития, особенно для определения времени морфогенеза и поддержания недифференцированных или неполностью дифференцированных типов клеток, таких как стволовые клетки . ^[94] Роль эндогенно экспрессируемой микроРНК в подавлении экспрессии генов была впервые описана у C. elegans в 1993 году. ^[95] У растений эта функция была обнаружена, когда было показано, что «микроРНК JAW» Arabidopsis участвует в регуляции нескольких гены, контролирующие форму растений. ^[96] У растений большинство генов, регулируемых микроРНК, являются факторами транскрипции ; ^[97] таким образом, активность микроРНК особенно широка и регулирует целые генные сети во время развития путем модуляции экспрессии ключевых регуляторных генов, включая факторы транскрипции, а также белки F-box . ^[98] Во многих организмах, включая человека, микроРНК связаны с образованием опухолей и нарушением регуляции клеточного цикла . Здесь микроРНК могут функционировать как онкогены , так и супрессоры опухолей . ^[99]

Эволюция

На основании филогенетического анализа, основанного на экономии , самый последний общий предок всех эукариот , скорее всего, уже обладал ранним путем RNAi; Считается, что отсутствие этого пути у некоторых эукариот является производной характеристикой. ^[100] Эта предковая система RNAi, вероятно, содержала по крайней мере один белок типа Dicer, один белок Argonaute, один белок PIWI и РНК-зависимую РНК-полимеразу , которая, возможно, также играла другие клеточные роли. Крупномасштабное сравнительное геномное исследование также показывает, что коронная группа эукариот уже обладала этими компонентами, которые затем могли иметь более тесные функциональные связи с генерализованными системами деградации РНК, такими как экзосома . ^[101] Это исследование также предполагает, что семейство РНК-связывающих белков Argonaute, которое является общим для эукариот, большинства архей и, по крайней мере, некоторых бактерий (таких как Aquifex aeolicus ), гомологичны компонентам системы инициации трансляции и первоначально произошли от них. .

Приложения

Путь РНКи для нокдауна генов

Нокдаун генов — это метод, используемый для снижения экспрессии специфических генов организма. Это достигается за счет использования естественного процесса РНКи. ^[6] В этом методе нокдауна гена используется двухцепочечная молекула миРНК, которая синтезируется с последовательностью, комплементарной интересующему гену. Каскад РНКи начинается, когда фермент Dicer начинает обрабатывать миРНК. Конечный результат процесса приводит к деградации мРНК и уничтожению всех инструкций, необходимых для построения определенных белков. Используя этот метод, исследователи могут уменьшить (но не полностью устранить) экспрессию целевого гена. Изучение эффектов этого снижения экспрессии может показать физиологическую роль или влияние продуктов целевых генов. ^{[102] [103]}

Нецелевые эффекты нокдауна гена

Обширные усилия в области вычислительной биологии были направлены на разработку успешных реагентов дцРНК, которые максимизируют нокдаун генов, но минимизируют «нецелевые» эффекты. Нецелевые эффекты возникают, когда введенная РНК имеет последовательность оснований, которая может спариваться и, таким образом, снижать экспрессию нескольких генов. Такие проблемы возникают чаще, когда дцРНК содержит повторяющиеся последовательности. На основе изучения геномов человека, C. elegans и S. pombe было подсчитано , что около 10% возможных миРНК оказывают существенное нецелевое воздействие. ^[10] Было разработано множество программных инструментов, реализующих алгоритмы для создания общих ^{[104] [105]} специфичных для млекопитающих, ^[106] и вирус-специфичных ^[107] миРНК , которые автоматически проверяются на возможную перекрестную реактивность.

В зависимости от организма и экспериментальной системы экзогенная РНК может представлять собой длинную цепь, предназначенную для расщепления Dicer, или короткие РНК, предназначенные для использования в качестве субстратов миРНК . В большинстве клеток млекопитающих используются более короткие РНК, поскольку длинные двухцепочечные молекулы РНК индуцируют у млекопитающих интерфероновую реакцию — форму врожденного иммунитета , которая неспецифически реагирует на чужеродный генетический материал. ^[108] Мышиные ооциты и клетки ранних эмбрионов мыши лишены этой реакции на экзогенную дцРНК и поэтому являются общей модельной системой для изучения эффектов нокдауна генов млекопитающих. ^[109] Также были разработаны специализированные лабораторные методы для повышения применимости РНКи в системах млекопитающих за счет исключения прямого введения миРНК , например, путем стабильной трансфекции плазмидой, кодирующей соответствующую последовательность, из которой можно транскрибировать миРНК , ^[110] или с помощью более сложных лентивирусных векторных систем, позволяющих индуцируемую активацию или деактивацию транскрипции, известных как условные РНКи . ^{[111] [112]}

Лекарства

Обычная взрослая муха -дрозофила — распространенный модельный организм, используемый в экспериментах с РНКи.

Хронология использования РНКи в медицине с 1996 по 2017 год.

Методика подавления генов с помощью терапии РНКи продемонстрировала успех в рандомизированных контролируемых клинических исследованиях. Эти лекарства представляют собой растущий класс препаратов на основе миРНК, которые снижают экспрессию белков, кодируемых определенными генами. На сегодняшний день регулирующими органами США и Европы одобрено пять препаратов РНКи: патисиран (2018 г.), гивосиран (2019 г.), лумасиран (2020 г. ), инклисиран (2020 г. в Европе с ожидаемым одобрением в США в 2021 г.) и вутрисиран (2022 г. ). ). ^{[113] [114] [115] [116]}

В то время как все одобренные регулирующими органами РНКи-терапевтические препараты направлены на заболевания, возникающие в печени, дополнительные исследуемые лекарства нацелены на множество областей заболеваний, включая сердечно-сосудистые заболевания, нарушения свертываемости крови, расстройства, связанные с употреблением алкоголя, муковисцидоз, подагру, карциному и заболевания глаз. .

Патисиран — первый препарат на основе двухцепочечной миРНК, одобренный в 2018 году и разработанный компанией Alnylam Pharmaceuticals . Патисиран использует каскад РНКи для подавления гена, кодирующего TTR (транстриетин). Мутации в этом гене могут вызвать неправильное сворачивание белка, ответственного за наследственный ATTR-амилоидоз . Для достижения терапевтического ответа патирисан заключен в мембрану из липидных наночастиц , которая облегчает переход в цитоплазму. Попав внутрь клетки, миРНК начинает обработку ферментом Dicer. Патирисан вводится медицинским работником путем внутривенной инфузии в дозировке, рассчитанной в зависимости от массы тела. Предупреждения и меры предосторожности включают риск инфузионных реакций и снижение уровня витамина А (в сыворотке). ^[117]

В 2019 году FDA и EMA одобрили гивосиран для лечения острой печеночной порфирии (ОГП) у взрослых. ^[118] В ноябре 2019 года FDA также предоставило гивосирану статус прорывной терапии , статус приоритетного обзора и статус орфанного препарата для лечения острой печеночной порфирии (ОГП) . ^[119] К 2020 году гибосиран получил одобрение EMA. ^[120] Гивосиран представляет собой миРНК, которая расщепляет мРНК синтазы аминолевулиновой кислоты 1 (ALAS1) в печени. Разрушение мРНК ALAS1 предотвращает накопление токсинов (ответственных за нейровисцеральные приступы и болезнь АГП), таких как аминолевулиновая кислота (АЛК) и порфобилиноген (ПБГ). ^{[121] [122] [123] [124]} Для облегчения проникновения в цитоплазму гивосиран использует лиганды GalNAc и проникает в клетки печени. Лекарство вводится подкожно медицинским работником в зависимости от массы тела. Предупреждения и меры предосторожности включают риск анафилактических реакций, печеночной токсичности, почечной токсичности и реакций в месте инъекции. ^[125]

Лумасиран был одобрен как препарат на основе миРНК в 2020 году для использования как в Европейском Союзе, так и в США. ^{[126] [127]} Этот препарат используется для лечения первичной гипероксалурии типа 1 (PH1) у детей и взрослых. Препарат предназначен для снижения выработки оксалатов в печени и уровня оксалатов в моче посредством РНКи путем воздействия на мРНК оксидазы гидроксикислот 1 (HAO1) ​​для разрушения. Снижение уровня фермента HAO1 снижает окисление гликолята в глиоксилат (который является субстратом оксалата). Лумасиран вводится медицинским работником подкожно в зависимости от массы тела. ^[128] Данные рандомизированных контролируемых клинических исследований показывают, что наиболее распространенной побочной реакцией, о которой сообщалось, были реакции в месте инъекции. Эти реакции были легкими и присутствовали у 38 процентов пациентов, принимавших лумасиран. ^[129]

В 2022 году FDA и EMA одобрили вутрисиран для лечения взрослых с наследственным транстиретин-опосредованным амилоидозом с полиневропатией 1 или 2 стадии. ^{[130] [131]} Вутрисиран предназначен для расщепления мРНК, кодирующей транстиретин .

Другие исследуемые препараты, использующие РНКи, разрабатываются такими фармацевтическими компаниями, как Arrowhead Pharmaceuticals , Dicerna, Alnylam Pharmaceuticals , Amgen и Sylentis. Эти лекарства поражают различные цели посредством РНКи и заболеваний.

Исследуемые РНКи-терапевтические средства в разработке:

Правовая категоризация и правовые вопросы в ближайшем будущем

В настоящее время и микроРНК, и миРНК синтезируются химическим путем и поэтому по закону в ЕС и США относятся к категории «простых» лекарственных препаратов. Но поскольку биоинженерные миРНК (BERA) находятся в стадии разработки, они будут классифицироваться как биологические лекарственные средства, по крайней мере, в ЕС. Развитие технологии BERAS ставит вопрос о категоризации лекарств, имеющих одинаковый механизм действия, но получаемых химическим или биологическим путем. Эту несогласованность следует устранить. ^[132]

Механизмы доставки

Для реализации клинического потенциала РНКи миРНК должна эффективно транспортироваться в клетки тканей-мишеней. Однако существуют различные препятствия, которые необходимо устранить, прежде чем его можно будет использовать в клинических целях. Например, «голая» миРНК подвержена нескольким препятствиям, которые снижают ее терапевтическую эффективность. ^[133] Кроме того, как только миРНК попадает в кровоток, голая РНК может разрушаться сывороточными нуклеазами и стимулировать врожденную иммунную систему. ^[133] Из-за своего размера и высокой полианионной (содержащей отрицательные заряды в нескольких сайтах) природы немодифицированные молекулы миРНК не могут легко проникать в клетки через клеточную мембрану. Следовательно, необходимо использовать искусственную или инкапсулированную в наночастицы миРНК . Если миРНК переносится через клеточную мембрану, может возникнуть непреднамеренная токсичность, если терапевтические дозы не оптимизированы, а миРНК могут проявлять нецелевые эффекты (например, непреднамеренное подавление генов с частичной комплементарностью последовательностей ). ^[134] Даже после попадания в клетки требуется повторное введение дозы, поскольку их действие ослабевает при каждом делении клеток. В ответ на эти потенциальные проблемы и препятствия два подхода помогают облегчить доставку миРНК к клеткам-мишеням: липидные наночастицы и конъюгаты. ^[135]

Липидные наночастицы

Липидные наночастицы (ЛНЧ) основаны на липосомоподобных структурах, которые обычно состоят из водного центра, окруженного липидной оболочкой. ^[136] Подмножество липосомальных структур, используемых для доставки лекарств к тканям, находится в больших однослойных везикулах (LUV), размер которых может достигать 100 нм. Механизмы доставки LNP становятся все более растущим источником оболочек нуклеиновых кислот и могут включать плазмиды , CRISPR и мРНК . ^[137]

Первое одобренное использование липидных наночастиц в качестве механизма доставки лекарств началось в 2018 году с препарата siRNA патисиран, разработанного Alnylam Pharmaceuticals. Dicerna Pharmaceuticals, Persomics , Sanofi и Sirna Therapeutics также работали над выводом на рынок РНКи-терапии. ^{[138] [139]}

Другие недавние применения включают две одобренные FDA вакцины против COVID-19: мРНК-1273, разработанную Moderna . и BNT162b , разработанный в результате сотрудничества компаний Pfizer и BioNtech . ^[140] Эти две вакцины используют липидные наночастицы для доставки мРНК антигена. Инкапсулирование молекулы мРНК в липидные наночастицы стало решающим прорывом в производстве жизнеспособных мРНК-вакцин, разрешив ряд ключевых технических барьеров в доставке молекулы мРНК в клетку-хозяина, которая распределялась через аполипопротеин Е (апоЕ) в рецепторе липопротеинов низкой плотности (ЛПНП). ). В декабре 2020 года компания Novartis объявила, что положительные результаты исследований эффективности III фазы считают, что инклисиран является средством лечения гетерозиготной семейной гиперхолестеринемии (ГеСГ) и атеросклеротических сердечно-сосудистых заболеваний (АСССЗ). ^[141]

Конъюгаты

Помимо ЛНЧ, РНКи-терапевтические средства имеют целевую доставку через конъюгаты миРНК (например, GalNAc, углеводы, пептиды, аптамеры, антитела). ^[142] Терапия с использованием конъюгатов миРНК была разработана для лечения редких или генетических заболеваний, таких как острая печеночная порфирия (ОГП), гемофилия , первичная гипероксалурия (ПГ) и наследственный ATTR- амилоидоз , а также других кардиометаболических заболеваний, таких как гипертония и неалкогольный стеатогепатит ( 142). НАШ). ^[143]

Биотехнология

РНКи использовалась для множества других применений, включая продукты питания, сельскохозяйственные культуры и инсектициды. Использование пути RNAi позволило разработать множество продуктов, таких как арктические яблоки , табак без никотина, кофе без кофеина, растительность, обогащенная питательными веществами, и гипоаллергенные культуры. ^{[144] [145] [146]} Новое использование РНКи может привести к разработке многих других продуктов для будущего использования.

Вирусная инфекция

Противовирусное лечение является одним из первых предложенных медицинских применений на основе РНКи, и были разработаны два разных типа. Первый тип нацелен на вирусные РНК. Многие исследования показали, что нацеливание на вирусные РНК может подавлять репликацию многочисленных вирусов, включая ВИЧ , ^[147] ВПЧ , ^[148] гепатит А , ^[149] гепатит В , ^[150] вирус гриппа , ^{[151] [152] [153] ] [154]} респираторно-синцитиальный вирус (РСВ), ^[154] коронавирус атипичной пневмонии (SARS-CoV), ^[154] аденовирус ^[154] и вирус кори . ^[155] Другая стратегия заключается в блокировании первоначальных проникновений вируса путем воздействия на гены клетки-хозяина. ^[156] Например, подавление хемокиновых рецепторов ( CXCR4 и CCR5 ) на клетках-хозяевах может предотвратить проникновение вируса ВИЧ. ^[157]

Рак

Хотя традиционная химиотерапия может эффективно убивать раковые клетки, отсутствие специфичности в различении нормальных и раковых клеток в этих методах лечения обычно приводит к серьезным побочным эффектам. Многочисленные исследования показали, что RNAi может обеспечить более специфический подход к подавлению роста опухоли путем воздействия на гены, связанные с раком (т. е. онкогены ). ^[158] Также было высказано предположение, что RNAi может повысить чувствительность раковых клеток к химиотерапевтическим агентам , обеспечивая комбинаторный терапевтический подход с химиотерапией. ^[159] Еще одним потенциальным методом лечения на основе РНКи является ингибирование инвазии и миграции клеток . ^[160]

По сравнению с химиотерапией или другими противораковыми препаратами у препарата siRNA есть много преимуществ. ^[161] SiRNA действует на посттранскрипционной стадии экспрессии генов, поэтому она не модифицирует и не изменяет ДНК с вредным эффектом. ^[161] SiRNA также можно использовать для получения специфического ответа определенным способом, например, путем снижения степени подавления экспрессии генов. ^[161] В одной раковой клетке миРНК может вызвать резкое подавление экспрессии генов всего несколькими копиями. ^[161] Это происходит путем подавления генов, способствующих раку, с помощью РНКи, а также воздействия на последовательность мРНК. ^[161]

Препараты RNAi лечат рак, подавляя определенные гены, способствующие развитию рака. ^[161] Это достигается путем дополнения раковых генов РНКи, например, сохранения последовательностей мРНК в соответствии с препаратом РНКи. ^[161] В идеале РНКи следует инъецировать и/или химически модифицировать, чтобы РНКи могла более эффективно достигать раковых клеток. ^[161] Поглощение и регуляция РНКи контролируются почками. ^[161]

Неврологические заболевания

Стратегии РНКи также демонстрируют потенциал для лечения нейродегенеративных заболеваний . Исследования на клетках и мышах показали, что специфическое воздействие РНКи на гены, продуцирующие бета-амилоид (например, BACE1 и APP), может значительно снизить количество пептида Aβ, что коррелирует с причиной болезни Альцгеймера . ^{[162] [163] [164]} Кроме того, подходы, основанные на подавлении звука, также дают многообещающие результаты в лечении болезни Паркинсона и полиглутаминовой болезни . ^{[165] [166] [167]}

Стимуляция иммунного ответа

Иммунная система человека делится на две отдельные ветви: врожденную иммунную систему и адаптивную иммунную систему. ^[168] Врожденная иммунная система является первой защитой от инфекции и реагирует на патогены общим образом. ^[168] С другой стороны, адаптивная иммунная система, система, которая развилась позже, чем врожденная, состоит в основном из высокоспециализированных В- и Т-клеток, которые обучены реагировать на определенные части патогенных молекул. ^[168]

Борьба между старыми и новыми патогенами помогла создать систему защищенных клеток и частиц, называемую безопасной основой. ^[168] Эта структура дала людям армию систем, которые ищут и уничтожают частицы-захватчики, такие как патогены, микроскопические организмы, паразиты и инфекции. ^[168] Была разработана безопасная система для млекопитающих, включающая миРНК в качестве инструмента для выявления вирусного заражения, что позволило миРНК создавать интенсивный врожденный иммунный ответ. ^[168]

siRNA контролируется врожденной иммунной системой, которую можно разделить на острые воспалительные реакции и противовирусные реакции. ^[168] Воспалительная реакция создается сигналами малых сигнальных молекул или цитокинов. ^[168] К ним относятся интерлейкин-1 (IL-1), интерлейкин-6 (IL-6), интерлейкин-12 (IL-12) и фактор некроза опухоли α (TNF-α). ^[168] Врожденная иммунная система генерирует воспалительные и противовирусные реакции, которые вызывают высвобождение рецепторов распознавания образов (PRR). ^[168] Эти рецепторы помогают определить, какие патогены являются вирусами, грибами или бактериями. ^[168] Более того, важность миРНК и врожденной иммунной системы заключается в том, чтобы включать больше PRR, чтобы помочь распознавать различные структуры РНК. ^[168] Это повышает вероятность того, что миРНК вызовет иммуностимулирующий ответ в случае воздействия патогена. ^[168]

Еда

РНКи использовалась для генетической инженерии растений для производства более низких уровней естественных растительных токсинов. Такие методы используют преимущества стабильного и наследуемого фенотипа RNAi в растительных запасах. Семена хлопка богаты пищевым белком , но, естественно, содержат токсичный терпеноидный продукт госсипол , что делает их непригодными для потребления человеком. RNAi использовалась для производства хлопчатника, семена которого содержат пониженный уровень дельта-кадиненсинтазы , ключевого фермента в производстве госсипола, не влияя при этом на выработку фермента в других частях растения, где госсипол сам по себе важен для предотвращения повреждения растений вредителями. ^[169]

Усилия в области разработки позволили успешно снизить уровень аллергенов в растениях томата ^[170] и обогатить такие растения, как томаты, диетическими антиоксидантами . ^[171] Замалчивание альфа-амилазы с помощью RNAi также использовалось для уменьшения роста грибков Aspergillus flavus в кукурузе, которые в противном случае загрязнили бы зерна опасными афлатоксинами . ^[172] Замалчивание синтазы слезоточивого фактора в луке привело к образованию лука без слез, а РНКи использовалась в генах BP1 семян рапса для улучшения фотосинтеза. ^[173] Гены SBEIIa и SBEIIb в пшенице были нацелены на пшеницу с целью производства более высоких уровней амилозы для улучшения функции кишечника ^[174] и Travella et al. В 2006 году РНКи использовалась для функциональной геномики при исследовании гексаплоидных хлебных рас , тогда как индуцированное вирусом подавление генов (VIGS, подтип РНКи) использовалось Скофилдом и соавт. 2005 г. для исследования механизма устойчивости Lr21 к листовой ржавчине у гексаплоидной пшеницы . ^[175]

Инсектициды

РНКи находится в стадии разработки как инсектицид , с использованием нескольких подходов, включая генную инженерию и местное применение. ^[4] Клетки средней кишки некоторых насекомых поглощают молекулы дцРНК в процессе, называемом РНКи окружающей среды. ^[176] У некоторых насекомых эффект носит системный характер, поскольку сигнал распространяется по всему телу насекомого (так называемый системный РНКи). ^[177]

Животные, подвергшиеся воздействию РНКи в дозах, в миллионы раз превышающих ожидаемые уровни воздействия для человека, не показали никаких побочных эффектов. ^[178] RNAi оказывает различное действие на разные виды чешуекрылых (бабочек и мотыльков). ^[179]

Виды Drosophila , Bombyx mori , Locusta spp., Spodoptera spp., Tribolium castaneum , Nilaparvata lugens , Helicoverpa Armigera и Apis mellifera — это модели, которые широко использовались для изучения того, как RNAi работает в определенных таксонах насекомых. Musca Domestica имеет двагена Ago2 , а Glossina morsitans — три, как обнаружили Льюис и др. 2016 и Хейн и др. 2010. ^{[180] [181]} В случаепути микроРНК Diuraphis noxia имеет два Ago1 , M. Domestica — два Dcr1 , Acyrthosiphon pisum — по два Ago1 , Loqs и Dcr1 и четыре Pasha . В то время какв piRNA G. morsitans и A. pisum имеют по два или три Ago3 каждый. ^[181] Это привело к определению будущих целей разработки инсектицидов , а также способов действия и причин устойчивости к инсектицидам других инсектицидов. ^[181]

Трансгенные растения

Были созданы трансгенные культуры для экспрессии дцРНК, тщательно отобранные для подавления важных генов целевых вредителей. Эти дцРНК предназначены для воздействия только на насекомых, экспрессирующих определенные последовательности генов. В качестве доказательства принципа в 2009 году исследование показало РНК, которые могут убить любой из четырех видов плодовых мух, не причиняя вреда остальным трем. ^[4]

Актуальный

Альтернативно, дцРНК можно получить без генной инженерии. Один из подходов — добавлять их в поливную воду. Молекулы всасываются в сосудистую систему растений и отравляют питающихся ими насекомых. Другой подход предполагает распыление дсРНК, как обычного пестицида. Это позволит быстрее адаптироваться к сопротивлению. Такие подходы потребуют недорогих источников дцРНК, которых в настоящее время не существует. ^[4]

Функциональная геномика

Подходы к созданию полногеномных библиотек РНКи могут потребовать большей сложности, чем создание одной миРНК для определенного набора экспериментальных условий. Искусственные нейронные сети часто используются для создания библиотек siRNA ^[182] и для прогнозирования их вероятной эффективности при нокдауне генов. ^[183] ​​Массовый геномный скрининг широко рассматривается как многообещающий метод аннотации генома и послужил толчком к разработке высокопроизводительных методов скрининга на основе микрочипов . ^{[184] [185]}

Геномный скрининг

Исследования РНКи в масштабе генома основаны на технологии высокопроизводительного скрининга (HTS). Технология RNAi HTS позволяет проводить полногеномный скрининг потери функции и широко используется для идентификации генов, связанных с конкретными фенотипами. Эта технология была провозглашена потенциальной второй волной геномики после первой волны геномики, основанной на микрочипах экспрессии генов и платформах для обнаружения полиморфизма одиночных нуклеотидов . ^[186] Одним из основных преимуществ скрининга РНКи в масштабе генома является его способность одновременно опрашивать тысячи генов. Благодаря возможности генерировать большое количество данных за эксперимент, скрининг РНКи в масштабе генома привел к взрывному росту скорости генерации данных. Использование таких больших наборов данных является фундаментальной задачей, требующей подходящих методов статистики/биоинформатики. Основной процесс клеточного скрининга РНКи включает выбор библиотеки РНКи, надежных и стабильных типов клеток, трансфекцию агентами РНКи, обработку/инкубацию, обнаружение сигнала, анализ и идентификацию важных генов или терапевтических мишеней. ^[187]

История

Открытие РНКи

Пример растений петунии , у которых гены пигментации подавляются РНКи. Левое растение — дикого типа ; правильные растения содержат трансгены , которые вызывают подавление экспрессии как трансгенных, так и эндогенных генов, что приводит к появлению непигментированных белых участков цветка. ^[188]

Процесс РНКи назывался «совместным подавлением» и «подавлением», если он наблюдался до того, как был известен механизм, связанный с РНК. Открытию РНКи предшествовали наблюдения ингибирования транскрипции антисмысловой РНК, экспрессируемой в трансгенных растениях, ^[189] и, более непосредственно, сообщения о неожиданных результатах экспериментов, проведенных учеными-растоводителями в США и Нидерландах в начале 1990-х годов. ^[190] Пытаясь изменить цвет цветков петуний , исследователи ввели дополнительные копии гена, кодирующего халконсинтазу , ключевой фермент, отвечающий за пигментацию цветков , в растения петунии с обычно розовым или фиолетовым цветом цветов. Ожидалось, что сверхэкспрессия гена приведет к более темным цветам, но вместо этого привела к тому, что некоторые цветы стали иметь менее видимый фиолетовый пигмент, иногда с пестрыми узорами, что указывает на то, что активность халконсинтазы существенно снизилась или подавлялась в зависимости от контекста. Позже это будет объяснено как результат вставки трансгена рядом с промоторами в противоположном направлении в различных положениях по всему геному некоторых трансформантов, что приводит к экспрессии антисмысловых транскриптов и молчанию генов, когда эти промоторы активны. ^{[ нужна цитация ]} Еще одно раннее наблюдение RNAi произошло в результате изучения гриба Neurospora crassa , ^[191] , хотя его родственность не была сразу признана. Дальнейшее исследование этого явления на растениях показало, что подавление было связано с посттранскрипционным ингибированием экспрессии генов за счет повышенной скорости деградации мРНК. ^[192] Это явление было названо ко-супрессией экспрессии генов , но молекулярный механизм остался неизвестным. ^[193]

Вскоре после этого вирусологи растений , работающие над повышением устойчивости растений к вирусным заболеваниям, заметили аналогичное неожиданное явление. Хотя было известно, что растения, экспрессирующие вирусспецифичные белки, демонстрируют повышенную толерантность или устойчивость к вирусной инфекции, не ожидалось, что растения, несущие только короткие некодирующие участки последовательностей вирусной РНК, будут демонстрировать аналогичные уровни защиты. Исследователи полагали, что вирусная РНК, продуцируемая трансгенами, также может ингибировать репликацию вируса. ^[194] Обратный эксперимент, в котором короткие последовательности растительных генов были введены в вирусы, показал, что целевой ген подавлялся в инфицированном растении. ^[195] Это явление было названо «вирус-индуцированным молчанием генов» (VIGS), ^[175] а совокупность таких явлений получила общее название « посттранскрипционное молчание генов». ^[196]

После этих первоначальных наблюдений на растениях лаборатории начали искать это явление у других организмов. ^{[197] [198]} Первый случай молчания РНК у животных был задокументирован в 1996 году, когда Гуо и Кемфуес заметили, что введение смысловой и антисмысловой РНК в мРНК par-1 у Caenorhabditis elegans вызывало деградацию сообщения par-1. ^[199] Считалось, что эта деградация была вызвана одноцепочечной РНК (оцРНК), но два года спустя, в 1998 году, Файер и Мелло обнаружили, что эта способность подавлять экспрессию гена par-1 на самом деле была вызвана двухцепочечной РНК. РНК (дцРНК). ^[199] Крейг К. Мелло и Эндрю Файр в статье Nature 1998 года сообщили о мощном эффекте подавления генов после инъекции двухцепочечной РНК в C. elegans . ^[200] Исследуя регуляцию производства мышечного белка, они заметили, что ни инъекции мРНК, ни антисмысловой РНК не оказали влияния на производство белка, но двухцепочечная РНК успешно подавляла целевой ген. В результате этой работы они придумали термин RNAi . Это открытие стало первой идентификацией возбудителя этого явления. Файер и Мелло были удостоены Нобелевской премии по физиологии и медицине 2006 года . ^{[6] [201]}

РНКи терапия

Сразу после новаторского открытия Файера и Мелло Эльбашир и др. обнаружили, что с помощью синтетически созданной малой интерферирующей РНК (миРНК) можно нацелиться на подавление определенных последовательностей в гене, а не на подавление всего гена. ^[202] Всего год спустя Маккаффри и его коллеги продемонстрировали, что это специфическое для последовательности молчание имеет терапевтическое применение, воздействуя на последовательность вируса гепатита С у трансгенных мышей. ^[203] С тех пор многие исследователи пытались расширить терапевтическое применение РНКи, в частности, стремясь воздействовать на гены, вызывающие различные типы рака . ^{[204] [205]} К 2006 году первые клинические испытания были проведены при лечении дегенерации желтого пятна и респираторно-синцитиального вируса . ^[206] Четыре года спустя было начато первое клиническое испытание фазы I на людях, в котором использовалась система доставки наночастиц для воздействия на солидные опухоли . ^[207]

FDA одобрило первый препарат на основе миРНК ( патисиран ) в 2018 году. Гивосиран и лумасиран позже получили одобрение FDA для лечения AHP и PH1 в 2019 и 2020 годах соответственно. ^[113] Инклисиран получил одобрение EMA в 2020 году для лечения высокого уровня холестерина и в настоящее время находится на рассмотрении FDA. ^[208]

Смотрите также

• Биологический портал
• Портал вирусов

• ДНК-направленная интерференция РНК

Рекомендации

1. Саураб С., Видьярти А.С., Прасад Д. (март 2014 г.). «Интерференция РНК: от концепции к реальности в улучшении урожая». Планта . 239 (3): 543–64. Бибкод : 2014Plant.239..543S. дои : 10.1007/s00425-013-2019-5 . ПМИД  24402564.
2. Вайс Б., Давидкова Г., Чжоу Л.В. (март 1999 г.). «Генная терапия антисмысловыми РНК для изучения и модуляции биологических процессов». Клеточные и молекулярные науки о жизни . 55 (3): 334–58. дои : 10.1007/s000180050296. PMID  10228554. S2CID  9448271.
3. Матранга С., Томари Ю., Шин С., Бартель Д.П., Замор П.Д. (ноябрь 2005 г.). «Расщепление цепи-пассажира облегчает сборку миРНК в Ago2-содержащие ферментные комплексы РНКи». Клетка . 123 (4): 607–20. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.044 . ПМИД  16271386.
4. Купфершмидт К. (август 2013 г.). «Смертельная доза РНК». Наука . 341 (6147): 732–3. Бибкод : 2013Sci...341..732K. дои : 10.1126/science.341.6147.732 . ПМИД  23950525.
5. Макрэ И.Дж., Чжоу К., Ли Ф., Репик А., Брукс А.Н., Канде В.З., Адамс П.Д., Дудна Дж.А. (январь 2006 г.). «Структурная основа процессинга двухцепочечной РНК с помощью Dicer». Наука . 311 (5758): 195–8. Бибкод : 2006Sci...311..195M. дои : 10.1126/science.1121638. PMID  16410517. S2CID  23785494.
6. Дэнехольт Б. «Дополнительная информация: вмешательство РНК». Нобелевская премия по физиологии и медицине 2006 года . Архивировано из оригинала 20 января 2007 года . Проверено 25 января 2007 г.
7. Багасра О, Приллиман КР (август 2004 г.). «РНК-интерференция: молекулярная иммунная система». Журнал молекулярной гистологии . 35 (6): 545–53. CiteSeerX 10.1.1.456.1701 . doi : 10.1007/s10735-004-2192-8. PMID  15614608. S2CID  2966105. 
8. Бернштейн Э., Коди А.А., Хаммонд С.М., Хэннон Г.Дж. (январь 2001 г.). «Роль бидентатной рибонуклеазы на этапе инициации РНК-интерференции». Природа . 409 (6818): 363–6. Бибкод : 2001Natur.409..363B. дои : 10.1038/35053110. PMID  11201747. S2CID  4371481.
9. Сиоми Х, Сиоми MC (январь 2009 г.). «На пути к чтению кода РНК-интерференции». Природа . 457 (7228): 396–404. Бибкод : 2009Natur.457..396S. дои : 10.1038/nature07754. PMID  19158785. S2CID  205215974.
   Замор П.Д., Тушл Т., Шарп П.А., Бартель Д.П. (март 2000 г.). «РНКи: двухцепочечная РНК направляет АТФ-зависимое расщепление мРНК с интервалами от 21 до 23 нуклеотидов». Клетка . 101 (1): 25–33. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80620-0 . ПМИД  10778853.
   Вермюлен А., Белен Л., Рейнольдс А., Вольфсон А., Маршалл В.С., Карпилов Дж., Хворова А. (май 2005 г.). «Вклад структуры дцРНК в специфичность и эффективность Dicer». РНК . 11 (5): 674–82. дои : 10.1261/rna.7272305. ПМК  1370754 . ПМИД  15811921.
   Кастанотто Д., Росси Дж.Дж. (январь 2009 г.). «Обещания и подводные камни терапии, основанной на РНК-интерференции». Природа . 457 (7228): 426–33. Бибкод : 2009Natur.457..426C. дои : 10.1038/nature07758. ПМК  2702667 . ПМИД  19158789.
10. Цю С., Адема СМ, ​​Лейн Т (2005). «Вычислительное исследование нецелевых эффектов РНК-интерференции». Исследования нуклеиновых кислот . 33 (6): 1834–47. дои : 10.1093/nar/gki324. ПМЦ 1072799 . ПМИД  15800213. 
11. Наканиши К. (сентябрь 2016 г.). «Анатомия RISC: как малые РНК и шапероны активируют белки Argonaute?». Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК . 7 (5): 637–60. дои : 10.1002/wrna.1356. ПМК 5084781 . ПМИД  27184117. 
12. Лян С., Ван Ю, Мурота Ю, Лю Х, Смит Д, Сиоми MC, Лю Q (сентябрь 2015 г.). «TAF11 собирает загрузочный комплекс RISC для повышения эффективности RNAi». Молекулярная клетка . 59 (5): 807–18. doi :10.1016/j.molcel.2015.07.006. ПМК 4560963 . ПМИД  26257286. 
13. Алквист П. (май 2002 г.). «РНК-зависимые РНК-полимеразы, вирусы и подавление РНК». Наука . 296 (5571): 1270–3. Бибкод : 2002Sci...296.1270A. дои : 10.1126/science.1069132. PMID  12016304. S2CID  42526536.
14. Робертс TC (2015). «Машина микроРНК». МикроРНК: Фундаментальная наука . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 887. стр. 15–30. дои : 10.1007/978-3-319-22380-3_2. ISBN 978-3-319-22379-7. ПМИД  26662984.
15. Паркер Г., Эккерт Д., Басс Б. (2006). «RDE-4 преимущественно связывает длинную дсРНК, и ее димеризация необходима для расщепления дсРНК до миРНК». РНК . 12 (5): 807–18. дои : 10.1261/rna.2338706. ПМК 1440910 . ПМИД  16603715. 
16. Баулкомб, округ Колумбия (январь 2007 г.). «Молекулярная биология. Усиленное замалчивание». Наука . 315 (5809): 199–200. дои : 10.1126/science.1138030. PMID  17218517. S2CID  46285020.
17. Pak J, Fire A (январь 2007 г.). «Различные популяции первичных и вторичных эффекторов во время RNAi у C. elegans». Наука . 315 (5809): 241–4. Бибкод : 2007Sci...315..241P. дои : 10.1126/science.1132839. PMID  17124291. S2CID  46620298.
18. Сиджен Т., Штайнер Ф.А., Тийссен К.Л., Пластерк Р.Х. (январь 2007 г.). «Вторичные миРНК возникают в результате синтеза непраймированной РНК и образуют отдельный класс». Наука . 315 (5809): 244–7. Бибкод : 2007Sci...315..244S. дои : 10.1126/science.1136699. PMID  17158288. S2CID  9483460.
19. Ван QL, Ли ZH (май 2007 г.). «Функции микроРНК у растений». Границы бионауки . 12 : 3975–82. дои : 10.2741/2364. ПМЦ 2851543 . PMID  17485351. S2CID  23014413. 
    Чжао Ю., Шривастава Д. (апрель 2007 г.). «Взгляд на функцию микроРНК, связанный с развитием». Тенденции биохимических наук . 32 (4): 189–97. doi :10.1016/j.tibs.2007.02.006. ПМИД  17350266.
20. Грегори Р.И., Чендримада Т.П., Шихаттар Р. (2006). «Биогенез микроРНК: выделение и характеристика микропроцессорного комплекса». Протоколы микроРНК . Методы молекулярной биологии. Том. 342. стр. 33–47. дои : 10.1385/1-59745-123-1:33. ISBN 978-1-59745-123-9. ПМИД  16957365.
21. Пфеффер С., Заволан М., Грассер Ф.А., Чиен М., Руссо Дж.Дж., Джу Дж., Джон Б., Энрайт А.Дж., Маркс Д., Сандер С., Тушль Т. (апрель 2004 г.). «Идентификация микроРНК, кодируемых вирусом». Наука . 304 (5671): 734–6. Бибкод : 2004Sci...304..734P. дои : 10.1126/science.1096781. PMID  15118162. S2CID  25287167.
22. Куреши А, Тхакур Н, Монга I, Тхакур А, Кумар М (1 января 2014 г.). «VIRmiRNA: комплексный ресурс экспериментально подтвержденных вирусных микроРНК и их мишеней». База данных . 2014 : бау103. дои : 10.1093/база данных/bau103. ПМК 4224276 . ПМИД  25380780. 
23. Пиллаи Р.С., Бхаттачария С.Н., Филипович В. (2007). «Репрессия синтеза белка микроРНК: сколько механизмов?». Тенденции клеточной биологии . 17 (3): 118–26. дои : 10.1016/j.tcb.2006.12.007. ПМИД  17197185.
24. Окамура К., Исидзука А., Сиоми Х., Сиоми М. (2004). «Особая роль белков Argonaute в путях расщепления РНК, направленных на малые РНК». Генс Дев . 18 (14): 1655–66. дои : 10.1101/gad.1210204. ПМЦ 478188 . ПМИД  15231716. 
25. Ли Ю, Накахара К, Фам Дж, Ким К, Хе З, Сонтхаймер Э, Картью Р (2004). «Различные роли Drosophila Dicer-1 и Dicer-2 в путях молчания siRNA/miRNA». Клетка . 117 (1): 69–81. дои : 10.1016/S0092-8674(04)00261-2 . ПМИД  15066283.
26. miRBase.org
27. Фридман Р.К., Фарх К.К., Бердж CB, Бартель Д.П. (2009). «Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями микроРНК». Геном Рез . 19 (1): 92–105. дои : 10.1101/гр.082701.108. ПМЦ 2612969 . ПМИД  18955434. 
28. Лим Л.П., Лау, Северная Каролина, Гаррет-Энгеле П., Гримсон А., Шелтер Дж.М., Касл Дж., Бартель Д.П., Линсли П.С., Джонсон Дж.М. (февраль 2005 г.). «Анализ микрочипов показывает, что некоторые микроРНК подавляют большое количество целевых мРНК». Природа . 433 (7027): 769–73. Бибкод : 2005Natur.433..769L. дои : 10.1038/nature03315. PMID  15685193. S2CID  4430576.
29. Зельбах М., Шванхойссер Б., Тирфельдер Н., Фанг З., Ханин Р., Раевски Н. (сентябрь 2008 г.). «Широко распространенные изменения в синтезе белка, вызванные микроРНК». Природа . 455 (7209): 58–63. Бибкод : 2008Natur.455...58S. дои : 10.1038/nature07228. PMID  18668040. S2CID  4429008.
30. Пэк Д., Виллен Дж., Шин С., Камарго Ф.Д., Гиги С.П., Бартель Д.П. (сентябрь 2008 г.). «Влияние микроРНК на выход белка». Природа . 455 (7209): 64–71. Бибкод : 2008Natur.455...64B. дои : 10.1038/nature07242. ПМК 2745094 . ПМИД  18668037. 
31. Палмеро Э.И., де Кампос С.Г., Кампос М., де Соуза, Северная Каролина, Геррейро И.Д., Карвальо А.Л., Маркес М.М. (июль 2011 г.). «Механизмы и роль дерегуляции микроРНК в возникновении и прогрессировании рака». Генетика и молекулярная биология . 34 (3): 363–70. дои : 10.1590/S1415-47572011000300001. ПМК 3168173 . ПМИД  21931505. 
32. Бернштейн C, Бернштейн H (май 2015 г.). «Эпигенетическое снижение восстановления ДНК при прогрессировании рака желудочно-кишечного тракта». Всемирный журнал желудочно-кишечной онкологии . 7 (5): 30–46. дои : 10.4251/wjgo.v7.i5.30 . ПМЦ 4434036 . ПМИД  25987950. 
33. Маффиолетти Э, Тардито Д, Дженнарелли М, Боккио-Кьяветто Л (2014). «Микрошпионы от мозга к периферии: новые данные исследований микроРНК при нервно-психических расстройствах». Границы клеточной нейронауки . 8 : 75. дои : 10.3389/fncel.2014.00075 . ПМЦ 3949217 . ПМИД  24653674. 
34. Меллиос Н., Сур М. (2012). «Новая роль микроРНК при шизофрении и расстройствах аутистического спектра». Границы в психиатрии . 3 : 39. doi : 10.3389/fpsyt.2012.00039 . ПМК 3336189 . ПМИД  22539927. 
35. Гиган М., Кэрнс MJ (август 2015 г.). «МикроРНК и посттранскрипционная дисрегуляция в психиатрии». Биологическая психиатрия . 78 (4): 231–9. doi : 10.1016/j.biopsych.2014.12.009 . hdl : 1959.13/1335073 . ПМИД  25636176.
36. Лю Кью, Рэнд Т.А., Калидас С., Ду Ф, Ким Х.Э., Смит Д.П., Ван X (сентябрь 2003 г.). «R2D2, мост между инициирующим и эффекторным этапами пути РНКи дрозофилы». Наука . 301 (5641): 1921–5. Бибкод : 2003Sci...301.1921L. дои : 10.1126/science.1088710. PMID  14512631. S2CID  41436233.
37. Грегори Р.И., Чендримада Т.П., Куч Н., Шихаттар Р. (ноябрь 2005 г.). «Человеческий RISC сочетает биогенез микроРНК и посттранскрипционное молчание генов». Клетка . 123 (4): 631–40. дои : 10.1016/j.cell.2005.10.022 . ПМИД  16271387.
38. Лодиш Х., Берк А., Мацудайра П., Кайзер К.А., Кригер М., Скотт М.П., ​​Зипуркси С.Л., Дарнелл Дж. (2004). Молекулярно-клеточная биология (5-е изд.). WH Фриман: Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. ISBN 978-0-7167-4366-8.
39. Лейшнер П.Дж., Амерес С.Л., Куенг С., Мартинес Дж. (март 2006 г.). «Расщепление пассажирской цепи siRNA во время сборки RISC в клетках человека». Отчеты ЭМБО . 7 (3): 314–20. дои : 10.1038/sj.embor.7400637. ПМЦ 1456892 . ПМИД  16439995. 
40. Хейли Б., Замор PD (июль 2004 г.). «Кинетический анализ ферментного комплекса РНКи». Структурная и молекулярная биология природы . 11 (7): 599–606. дои : 10.1038/nsmb780. PMID  15170178. S2CID  12400060.
41. Шварц Д.С., Хутвагнер Г., Ду Т, Сюй З, Аронин Н., Замор П.Д. (октябрь 2003 г.). «Асимметрия сборки ферментного комплекса РНКи». Клетка . 115 (2): 199–208. дои : 10.1016/S0092-8674(03)00759-1 . ПМИД  14567917.
42. Preall JB, He Z, Gorra JM, Sontheimer EJ (март 2006 г.). «Выбор короткой интерферирующей цепи РНК не зависит от полярности процессинга дцРНК во время РНКи у дрозофилы». Современная биология . 16 (5): 530–5. Бибкод : 2006CBio...16..530P. дои : 10.1016/j.cub.2006.01.061 . ПМИД  16527750.
43. Томари Ю, Матранга С, Хейли Б, Мартинес Н, Замор П.Д. (ноябрь 2004 г.). «Белковый сенсор асимметрии миРНК». Наука . 306 (5700): 1377–80. Бибкод : 2004Sci...306.1377T. дои : 10.1126/science.1102755. PMID  15550672. S2CID  31558409.
44. Ма JB, Юань Ю.Р., Мейстер Г., Пей Ю., Тушл Т., Патель DJ (март 2005 г.). «Структурная основа специфического распознавания 5'-конца направляющей РНК белком Piwi A. fulgidus». Природа . 434 (7033): 666–70. Бибкод : 2005Natur.434..666M. дои : 10.1038/nature03514. ПМЦ 4694588 . ПМИД  15800629. 
45. Сен Г, Верман Т, Блау Х (2005). «Трансляция мРНК не является обязательным условием для расщепления мРНК, опосредованного малой интерферирующей РНК». Дифференциация . 73 (6): 287–93. дои : 10.1111/j.1432-0436.2005.00029.x. PMID  16138829. S2CID  41117614.
46. Гу С, Росси Дж (2005). «Отключение РНКи от активной трансляции в клетках млекопитающих». РНК . 11 (1): 38–44. дои : 10.1261/rna.7158605. ПМК 1370689 . ПМИД  15574516. 
47. Сен Г, Блау Х (2005). «Argonaute 2/RISC находится в местах распада мРНК млекопитающих, известных как цитоплазматические тельца». Nat Cell Biol . 7 (6): 633–6. дои : 10.1038/ncb1265. PMID  15908945. S2CID  6085169.
48. Лиан С., Джекимив А., Эйстатиой Т., Хамель Дж., Фрицлер М., Чан Э. (2006). «Тела GW, микроРНК и клеточный цикл». Клеточный цикл . 5 (3): 242–5. дои : 10.4161/cc.5.3.2410 . ПМИД  16418578.
49. Jakymiw A, Lian S, Eystathioy T, Li S, Satoh M, Hamel J, Fritzler M, Chan E (2005). «Нарушение P-телец ухудшает интерференцию РНК млекопитающих». Nat Cell Biol . 7 (12): 1267–74. дои : 10.1038/ncb1334. PMID  16284622. S2CID  36630239.
50. Хаммонд С., Бернштейн Э., Бич Д., Хэннон Дж. (2000). «РНК-направленная нуклеаза опосредует посттранскрипционное молчание генов в клетках дрозофилы». Природа . 404 (6775): 293–6. Бибкод : 2000Natur.404..293H. дои : 10.1038/35005107. PMID  10749213. S2CID  9091863.
51. Холмквист GP, Эшли Т (2006). «Организация хромосом и модификация хроматина: влияние на функцию и эволюцию генома». Цитогенетические и геномные исследования . 114 (2): 96–125. дои : 10.1159/000093326. PMID  16825762. S2CID  29910065.
52. Вердель А., Цзя С., Гербер С., Сугияма Т., Гиги С., Гревал С.И., Моазед Д. (январь 2004 г.). «РНКи-опосредованное нацеливание на гетерохроматин комплексом RITS». Наука . 303 (5658): 672–6. Бибкод : 2004Sci...303..672В. дои : 10.1126/science.1093686. ПМК 3244756 . ПМИД  14704433. 
53. Ирвин Д.В., Заратиеги М., Толия Н.Х., Гото Д.Б., Читвуд Д.Х., Вон М.В., Джошуа-Тор Л., Мартиенссен Р.А. (август 2006 г.). «Нарезка аргонавта необходима для гетерохроматического подавления и распространения». Наука . 313 (5790): 1134–7. Бибкод : 2006Sci...313.1134I. дои : 10.1126/science.1128813. PMID  16931764. S2CID  42997104.
54. Вольпе Т.А., Киднер С., Холл И.М., Тенг Г., Гревал С.И., Мартиенссен Р.А. (сентябрь 2002 г.). «Регуляция гетерохроматического молчания и метилирования гистона H3 лизина-9 с помощью РНКи». Наука . 297 (5588): 1833–7. Бибкод : 2002Sci...297.1833V. дои : 10.1126/science.1074973 . PMID  12193640. S2CID  2613813.
55. Вольпе Т., Шрамке В., Гамильтон Г.Л., Уайт С.А., Тенг Г., Мартиенссен Р.А., Олшир RC (2003). «РНК-интерференция необходима для нормальной функции центромеры у делящихся дрожжей». Хромосомные исследования . 11 (2): 137–46. дои : 10.1023/А: 1022815931524. PMID  12733640. S2CID  23813417.
56. Ли LC, Окино С.Т., Чжао Х., Пукот Д., Плейс РФ, Ураками С., Энокида Х., Дахия Р. (ноябрь 2006 г.). «Маленькие дцРНК индуцируют активацию транскрипции в клетках человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (46): 17337–42. Бибкод : 2006PNAS..10317337L. дои : 10.1073/pnas.0607015103 . ПМК 1859931 . ПМИД  17085592. 
57. Нома К., Сугияма Т., Кэм Х., Вердель А., Зофалл М., Цзя С., Моазед Д., Гревал С.И. (ноябрь 2004 г.). «RITS действует в цис-цис-системе, способствуя транскрипционному и посттранскрипционному молчанию, опосредованному РНК-интерференцией». Природная генетика . 36 (11): 1174–80. дои : 10.1038/ng1452 . ПМИД  15475954.
58. Сугияма Т., Кэм Х., Вердель А., Моазед Д., Гревал С.И. (январь 2005 г.). «РНК-зависимая РНК-полимераза является важным компонентом самоподдерживающейся петли, соединяющей сборку гетерохроматина с производством миРНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (1): 152–7. Бибкод : 2005PNAS..102..152S. дои : 10.1073/pnas.0407641102 . ПМК 544066 . ПМИД  15615848. 
59. Ван Ф., Кояма Н., Нисида Х., Харагути Т., Рейт В., Цукамото Т. (июнь 2006 г.). «Сборка и поддержание гетерохроматина, инициируемая повторами трансгена, не зависит от пути РНК-интерференции в клетках млекопитающих». Молекулярная и клеточная биология . 26 (11): 4028–40. дои : 10.1128/MCB.02189-05. ПМК 1489094 . ПМИД  16705157. 
60. Бас Б.Л. (2002). «Редактирование РНК аденозиндезаминазами, действующими на РНК». Ежегодный обзор биохимии . 71 : 817–46. doi :10.1146/annurev.biochem.71.110601.135501. ПМК 1823043 . ПМИД  12045112. 
61. Бас Б.Л. (апрель 2000 г.). «Двухцепочечная РНК как матрица для подавления генов». Клетка . 101 (3): 235–8. дои : 10.1016/S0092-8674(02)71133-1 . ПМИД  10847677.
62. Лучано DJ, Мирски Х, Вендетти Нью-Джерси, Маас С (август 2004 г.). «Редактирование РНК предшественника микроРНК». РНК . 10 (8): 1174–7. дои : 10.1261/rna.7350304. ПМК 1370607 . ПМИД  15272117. 
63. Ян В., Чендримада Т.П., Ван К., Хигучи М., Сибург П.Х., Шихаттар Р., Нисикура К. (январь 2006 г.). «Модуляция процессинга и экспрессии микроРНК посредством редактирования РНК деаминазами ADAR». Структурная и молекулярная биология природы . 13 (1): 13–21. дои : 10.1038/nsmb1041. ПМЦ 2950615 . ПМИД  16369484. 
64. Ян В., Ван К., Хауэлл К.Л., Ли Дж.Т., Чо Д.С., Мюррей Дж.М., Нисикура К. (февраль 2005 г.). «РНК-дезаминаза ADAR1 ограничивает эффективность коротких интерферирующих РНК в клетках млекопитающих». Журнал биологической химии . 280 (5): 3946–53. дои : 10.1074/jbc.M407876200 . ПМЦ 2947832 . ПМИД  15556947. 
65. Нисикура К. (декабрь 2006 г.). «Редактор встречает глушитель: перекрестные помехи между редактированием РНК и вмешательством РНК». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 7 (12): 919–31. дои : 10.1038/nrm2061. ПМЦ 2953463 . ПМИД  17139332. 
66. Saumet A, Леселье CH (2006). «Противовирусное подавление РНК: мы похожи на растения?». Ретровирусология . 3 (1): 3. дои : 10.1186/1742-4690-3-3 . ПМЦ 1363733 . ПМИД  16409629. 
67. Джонс Л., Рэтклифф Ф., Баулкомб, округ Колумбия (май 2001 г.). «РНК-направленное подавление транскрипционных генов у растений может наследоваться независимо от РНК-триггера и для поддержания требуется Met1». Современная биология . 11 (10): 747–57. Бибкод : 2001CBio...11..747J. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00226-3 . PMID  11378384. S2CID  16789197.
68. Хамфрис Д.Т., Вестман Б.Дж., Мартин Д.И., Прейсс Т. (ноябрь 2005 г.). «МикроРНК контролируют инициацию трансляции, ингибируя фактор инициации эукариот 4E/cap и функцию поли(А) хвоста». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (47): 16961–6. Бибкод : 2005PNAS..10216961H. дои : 10.1073/pnas.0506482102 . ПМК 1287990 . ПМИД  16287976. 
69. DaRocha WD, Оцу К., Тейшейра С.М., Донельсон Дж.Э. (февраль 2004 г.). «Тесты цитоплазматической РНК-интерференции (РНКи) и конструирования индуцируемой тетрациклином системы промотора Т7 у Trypanosoma cruzi». Молекулярная и биохимическая паразитология . 133 (2): 175–86. doi :10.1016/j.molbiopara.2003.10.005. ПМИД  14698430.
70. Робинсон К.А., Беверли С.М. (май 2003 г.). «Повышение эффективности трансфекции и тестирование подходов РНК-интерференции (РНКи) у простейших паразитов Leishmania». Молекулярная и биохимическая паразитология . 128 (2): 217–28. дои : 10.1016/S0166-6851(03)00079-3. ПМИД  12742588.
71. Аравинд Л., Ватанабэ Х., Липман DJ, Кунин Е.В. (октябрь 2000 г.). «Линейно-специфическая потеря и расхождение функционально связанных генов у эукариот». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (21): 11319–24. Бибкод : 2000PNAS...9711319A. дои : 10.1073/pnas.200346997 . ПМК 17198 . ПМИД  11016957. 
72. Дринненберг И.А., Вайнберг Д.Е., Се К.Т., Мауэр Дж.П., Вулф К.Х., Финк Г.Р., Бартель Д.П. (октябрь 2009 г.). «РНКи в почкующихся дрожжах». Наука . 326 (5952): 544–550. Бибкод : 2009Sci...326..544D. дои : 10.1126/science.1176945. ПМЦ 3786161 . ПМИД  19745116. 
73. Накаяшики Х, Кадотани Н, Маяма С (июль 2006 г.). «Эволюция и диверсификация белков, подавляющих РНК, у грибов» (PDF) . Журнал молекулярной эволюции . 63 (1): 127–35. Бибкод : 2006JMolE..63..127N. дои : 10.1007/s00239-005-0257-2. PMID  16786437. S2CID  22639035. Архивировано из оригинала (PDF) 6 августа 2020 г. . Проверено 4 декабря 2019 г.
74. Морита Т., Мочизуки Ю., Айба Х. (март 2006 г.). «Трансляционная репрессия достаточна для подавления генов малыми некодирующими РНК бактерий при отсутствии разрушения мРНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (13): 4858–63. Бибкод : 2006PNAS..103.4858M. дои : 10.1073/pnas.0509638103 . ПМЦ 1458760 . ПМИД  16549791. 
75. Макарова К.С., Гришин Н.В., Шабалина С.А., Вольф Ю.И., Кунин Е.В. (март 2006 г.). «Предполагаемая иммунная система прокариот, основанная на РНК-интерференции: вычислительный анализ предсказанного ферментативного механизма, функциональные аналогии с эукариотическими РНКи и гипотетические механизмы действия». Биология Директ . 1 :7. дои : 10.1186/1745-6150-1-7 . ПМК 1462988 . ПМИД  16545108. 
76. Страм Ю., Кузцова Л. (июнь 2006 г.). «Ингибирование вирусов интерференцией РНК». Гены вирусов . 32 (3): 299–306. doi : 10.1007/s11262-005-6914-0. ПМЦ 7088519 . ПМИД  16732482. 
77. Блевинс Т., Раджесваран Р., Шивапрасад П.В., Бекназарианц Д., Си-Аммур А., Парк Х.С., Васкес Ф., Робертсон Д., Майнс Ф., Хон Т., Пуггин М.М. (2006). «Четыре растительных Dicer опосредуют биогенез вирусных малых РНК и подавление ДНК-вируса». Исследования нуклеиновых кислот . 34 (21): 6233–46. doi : 10.1093/nar/gkl886. ПМК 1669714 . ПМИД  17090584. 
78. Палауки Дж.К., Эльмаян Т., Поллиен Дж.М., Вошере Х. (август 1997 г.). «Системное приобретенное молчание: специфичное для трансгенов посттранскрипционное молчание передается путем прививки от замолчавших подвоев к не замолчавшим привоям». Журнал ЭМБО . 16 (15): 4738–45. дои : 10.1093/emboj/16.15.4738. ПМК 1170100 . ПМИД  9303318. 
79. Войнет О (август 2001 г.). «Замалчивание РНК как иммунная система растений против вирусов». Тенденции в генетике . 17 (8): 449–59. дои : 10.1016/S0168-9525(01)02367-8. ПМИД  11485817.
80. Люси AP, Го HS, Ли WX, Дин SW (апрель 2000 г.). «Подавление посттранскрипционного молчания генов растительным вирусным белком, локализованным в ядре». Журнал ЭМБО . 19 (7): 1672–80. дои : 10.1093/emboj/19.7.1672. ПМК 310235 . ПМИД  10747034. 
81. Мерай З., Кереньи З., Кертес С., Магна М., Лакатос Л., Силхави Д. (июнь 2006 г.). «Связывание двухцепочечной РНК может быть общей вирусной стратегией растительной РНК для подавления молчания РНК». Журнал вирусологии . 80 (12): 5747–56. дои : 10.1128/JVI.01963-05. ПМЦ 1472586 . ПМИД  16731914. 
82. Катияр-Агарвал С., Морган Р., Дальбек Д., Борсани О., Вильегас А., Чжу Дж.К., Стаскавич Б.Дж., Джин Х. (ноябрь 2006 г.). «Индуцируемая патогеном эндогенная миРНК в иммунитете растений». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (47): 18002–7. Бибкод : 2006PNAS..10318002K. дои : 10.1073/pnas.0608258103 . ПМК 1693862 . ПМИД  17071740. 
83. Фриц Дж.Х., Жирардин С.Е., Филпотт-ди-джей (июнь 2006 г.). «Врожденная иммунная защита посредством вмешательства РНК». СТКЭ науки . 2006 (339): пе27. дои : 10.1126/stke.3392006pe27. PMID  16772641. S2CID  33972766.
84. Замбон Р.А., Вахариа В.Н., Ву Л.П. (май 2006 г.). «РНКи представляет собой противовирусный иммунный ответ против вируса дцРНК у Drosophila melanogaster». Клеточная микробиология . 8 (5): 880–9. дои : 10.1111/j.1462-5822.2006.00688.x . PMID  16611236. S2CID  32439482.
85. Ван XH, Алияри Р., Ли WX, Ли HW, Ким К., Картью Р., Аткинсон П., Дин С.В. (апрель 2006 г.). «РНК-интерференция направляет врожденный иммунитет против вирусов у взрослой дрозофилы». Наука . 312 (5772): 452–4. Бибкод : 2006Sci...312..452W. дои : 10.1126/science.1125694. ПМК 1509097 . ПМИД  16556799. 
86. Лу Р, Мадуро М, Ли Ф, Ли ХВ, Бройтман-Мадуро Г, Ли WX, Дин СВ (август 2005 г.). «Репликация вируса животных и противовирусное подавление, опосредованное РНКи, у Caenorhabditis elegans». Природа . 436 (7053): 1040–1043. Бибкод : 2005Natur.436.1040L. дои : 10.1038/nature03870. ПМЦ 1388260 . ПМИД  16107851. 
87. Уилкинс С., Дишонг Р., Мур С.К., Уитт М.А., Чоу М., Мачака К. (август 2005 г.). «РНК-интерференция является механизмом противовирусной защиты у Caenorhabditis elegans». Природа . 436 (7053): 1044–7. Бибкод : 2005Natur.436.1044W. дои : 10.1038/nature03957. PMID  16107852. S2CID  4431035.
88. Беркхаут Б, Хааснут Дж (май 2006 г.). «Взаимодействие между вирусной инфекцией и механизмом интерференции клеточной РНК». Письма ФЭБС . 580 (12): 2896–902. doi :10.1016/j.febslet.2006.02.070. ПМЦ 7094296 . ПМИД  16563388. 
89. Шютц С., Сарнов П. (январь 2006 г.). «Взаимодействие вирусов с путем интерференции РНК млекопитающих». Вирусология . 344 (1): 151–7. дои : 10.1016/j.virol.2005.09.034 . ПМИД  16364746.
90. Каллен БР (июнь 2006 г.). «Участвует ли РНК-интерференция во внутреннем противовирусном иммунитете у млекопитающих?». Природная иммунология . 7 (6): 563–7. дои : 10.1038/ni1352. PMID  16715068. S2CID  23467688.
91. Майяр П.В., Чаудо С., Марше А., Ли Ю, Джей Ф, Дин С.В., Войннет О (октябрь 2013 г.). «Противовирусная РНК-интерференция в клетках млекопитающих». Наука . 342 (6155): 235–8. Бибкод : 2013Sci...342..235M. дои : 10.1126/science.1241930. ПМЦ 3853215 . ПМИД  24115438. 
92. Ли Ю, Лу Дж, Хан Ю, Фань Х, Дин С.В. (октябрь 2013 г.). «РНК-интерференция действует как механизм противовирусного иммунитета у млекопитающих». Наука . 342 (6155): 231–4. Бибкод : 2013Sci...342..231L. дои : 10.1126/science.1241911. ПМЦ 3875315 . ПМИД  24115437. 
93. Ли Х.В., Дин С.В. (октябрь 2005 г.). «Противовирусное молчание у животных». Письма ФЭБС . 579 (26): 5965–73. doi :10.1016/j.febslet.2005.08.034. ПМК 1350842 . ПМИД  16154568. 
94. Кэррингтон Дж. К., Амброс В. (июль 2003 г.). «Роль микроРНК в развитии растений и животных». Наука . 301 (5631): 336–8. Бибкод : 2003Sci...301..336C. дои : 10.1126/science.1085242. PMID  12869753. S2CID  43395657.
95. Ли Р.К., Фейнбаум Р.Л., Амброс В. (декабрь 1993 г.). «Гетерохронный ген lin-4 C. elegans кодирует малые РНК с антисмысловой комплементарностью lin-14». Клетка . 75 (5): 843–54. дои : 10.1016/0092-8674(93)90529-Y . ПМИД  8252621.
96. Палатник Дж. Ф., Аллен Э., Ву X, Шоммер С., Шваб Р., Кэррингтон Дж. К., Вайгель Д. (сентябрь 2003 г.). «Контроль морфогенеза листьев с помощью микроРНК». Природа . 425 (6955): 257–63. Бибкод : 2003Natur.425..257P. дои : 10.1038/nature01958. PMID  12931144. S2CID  992057.
97. Чжан Б., Пан X, Кобб ГП, Андерсон Т.А. (январь 2006 г.). «Растительная микроРНК: маленькая регуляторная молекула с большим влиянием». Биология развития . 289 (1): 3–16. дои : 10.1016/j.ydbio.2005.10.036 . ПМИД  16325172.
98. Джонс-Роудс М.В., Бартель Д.П., Бартель Б. (2006). «МикроРНК и их регуляторная роль в растениях». Ежегодный обзор биологии растений . 57 : 19–53. doi : 10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218. PMID  16669754. S2CID  13010154.
99. Чжан Б., Пан X, Кобб ГП, Андерсон Т.А. (февраль 2007 г.). «микроРНК как онкогены и супрессоры опухолей». Биология развития . 302 (1): 1–12. дои : 10.1016/j.ydbio.2006.08.028 . ПМИД  16989803.
100. Черутти Х, Касас-Моллано Х.А. (август 2006 г.). «О происхождении и функциях РНК-опосредованного молчания: от протистов к человеку». Современная генетика . 50 (2): 81–99. дои : 10.1007/s00294-006-0078-x. ПМК 2583075 . ПМИД  16691418. 
101. Анантараман В., Кунин Е.В., Аравинд Л. (апрель 2002 г.). «Сравнительная геномика и эволюция белков, участвующих в метаболизме РНК». Исследования нуклеиновых кислот . 30 (7): 1427–64. дои : 10.1093/нар/30.7.1427. ПМК 101826 . ПМИД  11917006. 
102. Вурхув П.М., Агами Р. (январь 2003 г.). «Нокдаун встает». Тенденции в биотехнологии . 21 (1): 2–4. дои : 10.1016/S0167-7799(02)00002-1. ПМИД  12480342.
103. Мункачи Г, Штупински З, Герман П, Бан Б, Пенцвалто З, Сарвас Н, Дьерфи Б (сентябрь 2016 г.). «Проверка эффективности подавления РНКи с использованием данных генного массива показывает 18,5% частоты неудач в 429 независимых экспериментах». Молекулярная терапия: нуклеиновые кислоты . 5 (9): е366. дои : 10.1038/mtna.2016.66. ПМК 5056990 . ПМИД  27673562. 
104. Наито Ю, Ямада Т, Мацумия Т, Уи-Тей К, Сайго К, Моришита С (июль 2005 г.). «dsCheck: высокочувствительное программное обеспечение для поиска нецелевых РНК-интерференции, опосредованной двухцепочечной РНК». Исследования нуклеиновых кислот . 33 (проблема с веб-сервером): W589–91. дои : 10.1093/nar/gki419. ПМК 1160180 . ПМИД  15980542. 
105. Хеншель А, Бухгольц Ф, Хаберманн Б (июль 2004 г.). «DEQOR: веб-инструмент для разработки и контроля качества миРНК». Исследования нуклеиновых кислот . 32 (проблема с веб-сервером): W113–20. дои : 10.1093/nar/gkh408. ПМЦ 441546 . ПМИД  15215362. 
106. Наито Ю, Ямада Т, Уи-Тей К, Моришита С, Сайго К (июль 2004 г.). «siDirect: высокоэффективное программное обеспечение для разработки целевых миРНК для интерференции РНК млекопитающих». Исследования нуклеиновых кислот . 32 (проблема с веб-сервером): W124–9. дои : 10.1093/nar/gkh442. ПМК 441580 . ПМИД  15215364. 
107. Наито Ю, Уи-Тей К, Нишикава Т, Такэбе Ю, Сайго К (июль 2006 г.). «siVirus: сетевое программное обеспечение для разработки антивирусных миРНК для сильно расходящихся вирусных последовательностей». Исследования нуклеиновых кислот . 34 (проблема с веб-сервером): W448–50. дои : 10.1093/nar/gkl214. ПМЦ 1538817 . ПМИД  16845046. 
108. Рейнольдс А, Андерсон Э.М., Вермюлен А, Федоров Ю., Робинсон К., Лик Д., Карпилов Дж., Маршалл В.С., Хворова А. (июнь 2006 г.). «Индукция интерферонового ответа с помощью миРНК зависит от типа клеток и длины дуплекса». РНК . 12 (6): 988–93. дои : 10.1261/rna.2340906. ПМЦ 1464853 . ПМИД  16611941. 
109. Штейн П., Цзэн Ф., Пан Х., Шульц Р.М. (октябрь 2005 г.). «Отсутствие неспецифических эффектов РНК-интерференции, вызванной длинной двухцепочечной РНК в ооцитах мыши». Биология развития . 286 (2): 464–71. дои : 10.1016/j.ydbio.2005.08.015 . ПМИД  16154556.
110. Бруммелькамп Т.Р., Бернардс Р. , Агами Р. (апрель 2002 г.). «Система стабильной экспрессии коротких интерферирующих РНК в клетках млекопитающих». Наука . 296 (5567): 550–3. Бибкод : 2002Sci...296..550B. дои : 10.1126/science.1068999. hdl : 1874/15573 . PMID  11910072. S2CID  18460980.
111. Тискорния Г, Тергаонкар В, Галими Ф, Верма ИМ (май 2004 г.). «Интерференция РНК, индуцируемая рекомбиназой CRE, опосредованная лентивирусными векторами». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (19): 7347–51. Бибкод : 2004PNAS..101.7347T. дои : 10.1073/pnas.0402107101 . ПМК 409921 . ПМИД  15123829. 
112. Вентура А., Мейснер А., Диллон С.П., Макманус М., Шарп П.А., Ван Парийс Л., Джениш Р., Джекс Т. (июль 2004 г.). «Условная РНК-интерференция, регулируемая Cre-lox, со стороны трансгенов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (28): 10380–5. Бибкод : 2004PNAS..10110380V. дои : 10.1073/pnas.0403954101 . ПМЦ 478580 . ПМИД  15240889. 
113. Адамс, Дэвид; и другие. (5 июля 2018 г.). «Патисиран, терапевтическое средство РНКи для лечения наследственного транстиретинового амилоидоза». Медицинский журнал Новой Англии . 379 (1): 11–21. дои : 10.1056/NEJMoa1716153 . hdl : 2445/138257 . PMID  29972753. S2CID  205102839.
114. Балвани, Маниша; Сардх, Элиан; Вентура, Паоло; Пейро, Паула Агилера; Рис, Дэвид С.; Штёльцель, Ульрих; Бисселл, Д. Монтгомери; Бонковский, Герберт Л.; Виндыга, Ежи; Андерсон, Карл Э.; Паркер, Чарльз; Сильвер, Сэмюэл М.; Кил, Сиобан Б.; Ван, Цзяан-Дер; Штейн, Пенелопа Э. (11 июня 2020 г.). «Фаза 3 исследования терапевтического препарата Гивосиран РНКи при острой перемежающейся порфирии». Медицинский журнал Новой Англии . 382 (24): 2289–2301. дои : 10.1056/NEJMoa1913147. ISSN  0028-4793. ПМИД  32521132.
115. Гаррелфс, Сандер Ф.; Фришберг, Яаков; Халтон, Салли А.; Корен, Майкл Дж.; О'Риордан, Уильям Д.; Коша, Пьер; Дешен, Жорж; Шаша-Лавский, Хадас; Саланд, Джеффри М.; Вант Хофф, Уильям Г.; Фустер, Дэниел Г.; Маген, Даниэлла; Мочхала, Шаббир Х.; Шалк, Геса; Симкова, Ева (1 апреля 2021 г.). «Лумасиран, РНКи-терапевтическое средство от первичной гипероксалурии типа 1». Медицинский журнал Новой Англии . 384 (13): 1216–1226. дои : 10.1056/NEJMoa2021712. ISSN  1533-4406. ПМИД  33789010.
116. Адамс, Дэвид; Турнев Ивайло Л.; Тейлор, Марк С.; Коэльо, Тереза; Планте-Борденёв, Виолен; Берк, Джон Л.; Гонсалес-Дуарте, Алехандра; Гиллмор, Джулиан Д.; Лоу, Сун-Чай; Сэкидзима, Ёсики; Обичи, Лаура; Чен, Чуншу; Бадри, Праджакта; Арум, Сет М.; Вест, Джон (март 2023 г.). «Эффективность и безопасность вутрисирана для пациентов с наследственным транстиретин-опосредованным амилоидозом с полиневропатией: рандомизированное клиническое исследование». Амилоид . 30 (1): 18–26. дои : 10.1080/13506129.2022.2091985. ISSN  1744-2818. ПМИД  35875890.
117. «ЭТИКЕТКА: ONPATTRO- инъекция патисирана, липидный комплекс» . Дейли Мед . 10 мая 2021 г.
118. «Пакет одобрения препарата: инъекция ГИВЛААРИ (гивосиран)» . FDA .
119. Гонсалес-Асегиноласа, Глория (11 июня 2020 г.). «Гивосиран — вмешательство в РНК для борьбы с приступами порфирии». Медицинский журнал Новой Англии . 382 (28–4793): 2366–2367. дои : 10.1056/NEJMe2010986. PMID  32521139. S2CID  219592948.
120. "Гивлаари". Европейское агентство по лекарственным средствам .
121. Пюи, Х; Гуя, Л; Дейбах, Дж. К. (2010). «Порфирии». Ланцет . 375 (9718): 924–937. дои : 10.1016/S0140-6736(09)61925-5. PMID  20226990. S2CID  208791867.
122. Саймон, А; Помпил, Ф; Керб, В; Вэй, А; Стрзок, С; Пенц, К; Хау, Д.Л.; Хангейт, младший; Ким, Дж.Б.; Агарвал, С; Маркиз, П. (2018). «Точка зрения пациента на острую интермиттирующую порфирию с частыми приступами: заболевание с интермиттирующими и хроническими проявлениями». Пациент . 11 (5): 527–537. дои : 10.1007/s40271-018-0319-3. ПМК 6132435 . ПМИД  29915990. 
123. Пищик, Э; Кауппинен, Р. (2015). «Обновление клинического ведения острой интермиттирующей порфирии». Применение клинической генетики . 8 : 201–214. дои : 10.2147/TACG.S48605 . ПМЦ 4562648 . ПМИД  26366103. 
124. Бисселл, DM; Лай, JC; Мейстер, РК; Блан, П. Д. (2015). «Роль дельта-аминолевулиновой кислоты в симптомах острой порфирии». Американский медицинский журнал . 128 (3): 313–317. doi : 10.1016/j.amjmed.2014.10.026. ПМЦ 4339446 . ПМИД  25446301. 
125. «ЭТИКЕТКА: GIVLAARI-гивосиран натрия для инъекций, раствор» . Дейли Мед . 5 апреля 2022 г.
126. «Пакет одобрения лекарств: OXLUMO» . FDA .
127. "Окслюмо". Европейское агентство по лекарственным средствам .
128. «ЭТИКЕТКА: OXLUMO-люмазиран для инъекций, раствор» . Дейли Мед . 2 декабря 2021 г.
129. Гаррелфс, Сандер Ф.; Фришберг, Яаков; Халтон, Салли А.; Корен, Майкл Дж.; О'Риордан, Уильям Д.; Коша, Пьер; Дешен, Жорж; Шаша-Лавский, Хадас; Саланд, Джеффри М.; Вант Хофф, Уильям Г.; Фустер, Дэниел Г.; Маген, Даниэлла; Мочхала, Шаббир Х.; Шалк, Геса; Симкова, Ева; Гроотофф, Яап В.; Сас, Дэвид Дж.; Мелиамбро, Кристин А.; Лу, Цзяндун; Свитсер, Марианна Т.; Гарг, Пушкаль П.; Вайшнау, Акшай К.; Ганснер, Джон М.; МакГрегор, Трейси Л.; Лиске, Джон К.; Соавторы ILLUMINATE-A (1 апреля 2021 г.). «Лумасиран, РНКи-терапевтическое средство от первичной гипероксалурии типа 1». Медицинский журнал Новой Англии . 384 (13): 1216–1226. дои : 10.1056/NEJMoa2021712 . PMID  33789010. S2CID  232482623.
130. Исследования, Центр оценки лекарств и (27 ноября 2023 г.). «Снимки испытаний наркотиков: AMVUTTRA». FDA .
131. "Амвуттра | Европейское агентство лекарственных средств" . www.ema.europa.eu . Проверено 11 января 2024 г.
132. Геррио, Матье; Кохли, Эвелин (2022). «Лекарства на основе РНК и регулирование: на пути к необходимой эволюции определений, данных в законодательстве Европейского союза». Границы в медицине . 9 . дои : 10.3389/fmed.2022.1012497 . ISSN  2296-858X. ПМЦ 9618588 . ПМИД  36325384. 
133. Канасти Р., Доркин-младший, Вегас А., Андерсон Д. (ноябрь 2013 г.). «Материалы для доставки миРНК-терапевтических средств». Природные материалы . 12 (11): 967–77. Бибкод : 2013NatMa..12..967K. дои : 10.1038/nmat3765. ПМИД  24150415.
134. Виттруп А, Либерман Дж (сентябрь 2015 г.). «Нобизирующая болезнь: отчет о прогрессе в области терапии siRNA». Обзоры природы Генетика . 16 (9): 543–52. дои : 10.1038/nrg3978. ПМЦ 4756474 . ПМИД  26281785. 
135. Де-Соуза Э.А., Камара Х., Салгейро В.Г., Моро Р.П., Книттель Т.Л., Тонон Дж. и др. (май 2019 г.). «РНК-интерференция может привести к неожиданным фенотипам у Caenorhabditis elegans». Исследования нуклеиновых кислот . 47 (8): 3957–3969. дои : 10.1093/nar/gkz154. ПМК 6486631 . ПМИД  30838421. 
136. Ли, В; Сока, ФК (24 марта 2007 г.). «Наночастицы на основе липидов для доставки нуклеиновых кислот». Фарм Рес . 24 (3): 438–449. doi : 10.1007/s11095-006-9180-5. PMID  17252188. S2CID  9995555.
137. Люнг, АК; Тэм, ГГ; Каллис, PR (2014). «Липидные наночастицы для доставки коротких интерферирующих РНК». Адв Генет . Достижения генетики. 88 : 71–110. дои : 10.1016/B978-0-12-800148-6.00004-3. ISBN 9780128001486. ПМК  7149983 . ПМИД  25409604.
138. Джон ЛаМаттина (15 апреля 2014 г.). «Включение RNAi в крупных фармацевтических компаниях показывает, что новые технологии не гарантируют успех исследований и разработок». Форбс .
139. Эрик Бендер (1 сентября 2014 г.). «Второе пришествие RNAi». Ученый .
140. Баден, ЛР (2021). «Эффективность и безопасность вакцины мРНК-1273 SARS-CoV-2». Медицинский журнал Новой Англии . 384 (5): 403–416. дои : 10.1056/NEJMoa2035389. ПМЦ 7787219 . ПМИД  33378609. 
141. Фицджеральд, К; Белый, С; Бородовский А; Беттанкур, БР; Страс, А; Клаузен, В. (январь 2017 г.). «Высокостойкий терапевтический ингибитор RNAi PCSK9». Медицинский журнал Новой Англии . 376 (1): 41–51. дои : 10.1056/NEJMoa1609243. ПМЦ 5778873 . ПМИД  27959715. 
142. Круспе, С; Джангранде, П. (2017). «Химеры аптамер-миРНК: открытие, прогресс и перспективы». Биомедицины . 5 (4): 45. doi : 10.3390/biomedicines5030045 . ПМЦ 5618303 . ПМИД  28792479. 
143. Балвани, Маниша; и другие. (11 июня 2020 г.). «Фаза 3 исследования терапевтического препарата Гивосиран РНКи при острой перемежающейся порфирии». Медицинский журнал Новой Англии . 382 (24): 2289–2301. дои : 10.1056/NEJMoa1913147 . PMID  32521132. S2CID  219586624.
144. Андерссон, М; Меландер, М; Поймарк, П; Ларссон, Х; Бюлов, Л; Хофвандер, П. (2006). «Направленное подавление генов с помощью РНК-интерференции: эффективный метод получения линий картофеля с высоким содержанием амилозы». Журнал биотехнологии . 123 (2): 137–148. doi : 10.1016/j.jbiotec.2005.11.001. ПМИД  16466822.
145. Фриззи, А; Хуанг, С. (2010). «Использование путей подавления РНК для биотехнологии растений». Журнал биотехнологии растений . 8 (6): 655–677. дои : 10.1111/j.1467-7652.2010.00505.x . ПМИД  20331529.
146. Пэрротт, В.; Часси, Б; Лигон, Дж; Мейер, Л; Патрик, Дж; Чжоу, Дж; Герман, Р; Делани, Б; Левин, М. (2010). «Применение принципов оценки безопасности пищевых продуктов и кормов для оценки трансгенных подходов к модуляции генов сельскохозяйственных культур». Британская ассоциация промышленных биологических исследований . 48 (7): 1773–1790. дои : 10.1016/j.fct.2010.04.017. ПМИД  20399824.
147. Берхаут Б (апрель 2004 г.). «РНК-интерференция как противовирусный подход: воздействие на ВИЧ-1». Современное мнение о молекулярной терапии . 6 (2): 141–5. ПМИД  15195925.
148. Цзян М., Милнер Дж. (сентябрь 2002 г.). «Селективное подавление экспрессии вирусных генов в ВПЧ-положительных клетках карциномы шейки матки человека, обработанных миРНК, праймером РНК-интерференции». Онкоген . 21 (39): 6041–8. дои : 10.1038/sj.onc.1205878 . ПМИД  12203116.
149. Кусов Ю., Канда Т., Палменберг А., Сгро Ю., Гаусс-Мюллер В. (июнь 2006 г.). «Подавление инфекции вируса гепатита А с помощью малых интерферирующих РНК». Журнал вирусологии . 80 (11): 5599–610. дои : 10.1128/jvi.01773-05. ПМЦ 1472172 . ПМИД  16699041. 
150. Цзя Ф, Чжан Ю.З., Лю СМ (октябрь 2006 г.). «Система на основе ретровирусов, обеспечивающая стабильное подавление генов вируса гепатита B посредством интерференции РНК». Биотехнологические письма . 28 (20): 1679–85. дои : 10.1007/s10529-006-9138-z . PMID  16900331. S2CID  34511611.
151. Ли Ю.К., Конг Л.Х., Ченг Б.З., Ли КС (декабрь 2005 г.). «Конструирование векторов экспрессии миРНК вируса гриппа и их ингибирующее действие на размножение вируса гриппа». Птичьи болезни . 49 (4): 562–73. дои : 10.1637/7365-041205R2.1. PMID  16405000. S2CID  86214047.
152. Ханна М, Саксена Л, Раджпут Р, Кумар Б, Прасад Р (2015). «Замалчивание генов: терапевтический подход к борьбе с вирусными инфекциями гриппа». Будущая микробиология . 10 (1): 131–40. дои : 10.2217/fmb.14.94. ПМИД  25598342.
153. Раджпут Р., Ханна М., Кумар П., Кумар Б., Шарма С., Гупта Н., Саксена Л. (декабрь 2012 г.). «Маленькая интерферирующая РНК, нацеленная на транскрипт неструктурного гена 1, ингибирует репликацию вируса гриппа А у экспериментальных мышей». Нуклеиновая кислотная терапия . 22 (6): 414–22. дои : 10.1089/nat.2012.0359. ПМИД  23062009.
154. Аша К., Кумар П., Саникас М., Месеко К.А., Ханна М., Кумар Б. (декабрь 2018 г.). «Достижения в области терапии на основе нуклеиновых кислот против респираторных вирусных инфекций». Журнал клинической медицины . 8 (1): 6. дои : 10.3390/jcm8010006 . ПМК 6351902 . ПМИД  30577479. 
155. Ху Л, Ван З, Ху С, Лю Х, Яо Л, Ли В, Ци Ю (2005). «Ингибирование размножения вируса кори в культуре клеток с помощью РНК-интерференции». Акта вирусологика . 49 (4): 227–34. ПМИД  16402679.
156. Куреши А, Тхакур Н, Монга I, Тхакур А, Кумар М (2014). «VIRmiRNA: комплексный ресурс экспериментально подтвержденных вирусных микроРНК и их мишеней». База данных . 2014 . дои : 10.1093/база данных/bau103. ПМК 4224276 . ПМИД  25380780. 
157. Кроу С. (2003). «Подавление экспрессии хемокиновых рецепторов с помощью РНК-интерференции позволяет ингибировать репликацию ВИЧ-1, Мартинес и др.». СПИД . 17 (Приложение 4): S103–5. дои : 10.1097/00002030-200317004-00014 . ПМИД  15080188.
158. Фукс Ю, Дамм-Велк С, Боркхардт А (август 2004 г.). «Замалчивание генов, связанных с болезнями, с помощью малых интерферирующих РНК». Современная молекулярная медицина . 4 (5): 507–17. дои : 10.2174/1566524043360492. ПМИД  15267222.
159. Чока Д.П., Аоки Ю., Кийосава К. (февраль 2003 г.). «РНК-интерференция - это функциональный путь с терапевтическим потенциалом в клеточных линиях миелолейкоза человека». Генная терапия рака . 10 (2): 125–33. дои : 10.1038/sj.cgt.7700544 . ПМИД  12536201.
160. Лаптева Н., Ян А.Г., Сандерс Д.Е., Струбе Р.В., Чен С.Ю. (январь 2005 г.). «Нокдаун CXCR4 небольшой интерферирующей РНК прекращает рост опухоли молочной железы in vivo». Генная терапия рака . 12 (1): 84–9. дои : 10.1038/sj.cgt.7700770 . ПМИД  15472715.
161. Сюй CF, Ван Дж (1 февраля 2015 г.). «Системы доставки для разработки лекарств siRNA для терапии рака». Азиатский журнал фармацевтических наук . 10 (1): 1–12. дои : 10.1016/j.ajps.2014.08.011 .
162. Сингер О, Марр Р.А., Рокенштейн Э, Крюс Л, Коуфаль Н.Г., Гейдж Ф.Х., Верма И.М., Маслия Э (октябрь 2005 г.). «Нацеливание на BACE1 с помощью siRNA улучшает невропатологию болезни Альцгеймера на трансгенной модели». Природная неврология . 8 (10): 1343–9. дои : 10.1038/nn1531. PMID  16136043. S2CID  6978101.
163. Родригес-Леброн Э., Гувион СМ, Мур С.А., Дэвидсон Б.Л., Полсон Х.Л. (сентябрь 2009 г.). «Аллель-специфическая РНКи смягчает фенотипическое прогрессирование в трансгенной модели болезни Альцгеймера». Молекулярная терапия . 17 (9): 1563–73. дои : 10.1038/м.2009.123. ПМЦ 2835271 . ПМИД  19532137. 
164. Пьедрахита Д., Эрнандес И., Лопес-Тобон А., Федоров Д., Обара Б., Маньюнат Б.С., Будро Р.Л., Дэвидсон Б., Лаферла Ф., Гальего-Гомес Х.К., Косик К.С., Кардона-Гомес Г.П. (октябрь 2010 г.). «Выключение CDK5 уменьшает нейрофибриллярные клубки у трансгенных мышей с болезнью Альцгеймера». Журнал неврологии . 30 (42): 13966–76. doi : 10.1523/jneurosci.3637-10.2010. ПМЦ 3003593 . ПМИД  20962218. 
165. Рауль С., Баркер С.Д., Эбишер П. (март 2006 г.). «Вирусное моделирование и коррекция нейродегенеративных заболеваний с помощью РНК-интерференции». Генная терапия . 13 (6): 487–95. дои : 10.1038/sj.gt.3302690 . ПМИД  16319945.
166. Харпер С.К., Стабер П.Д., Хе X, Элиасон С.Л., Мартинс И.Х., Мао К., Ян Л., Котин Р.М., Полсон Х.Л., Дэвидсон Б.Л. (апрель 2005 г.). «РНК-интерференция улучшает двигательные и невропатологические нарушения на мышиной модели болезни Хантингтона». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (16): 5820–5. Бибкод : 2005PNAS..102.5820H. дои : 10.1073/pnas.0501507102 . ПМК 556303 . ПМИД  15811941. 
167. Будро Р.Л., Родригес-Леброн Э., Дэвидсон Б.Л. (апрель 2011 г.). «РНКи-медицина для мозга: прогресс и проблемы». Молекулярная генетика человека . 20 (Р1): Р21–7. дои : 10.1093/hmg/ddr137. ПМК 3095054 . ПМИД  21459775. 
168. Уайтхед К.А., Дальман Дж.Э., Лангер Р.С., Андерсон Д.Г. (2011). «Замалчивание или стимуляция? Доставка миРНК и иммунная система». Ежегодный обзор химической и биомолекулярной инженерии . 2 : 77–96. doi : 10.1146/annurev-chembioeng-061010-114133. PMID  22432611. S2CID  28803811.
169. Сунилкумар Г., Кэмпбелл Л.М., Пукхабер Л., Стипанович Р.Д., Ратор К.С. (ноябрь 2006 г.). «Разработка семян хлопка для использования в питании человека путем тканеспецифического снижения токсичного госсипола». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (48): 18054–9. дои : 10.1073/pnas.0605389103 . ПМЦ 1838705 . ПМИД  17110445. 
170. Le LQ, Лоренц Й, Шерер С, Фётиш К, Энрике Э, Бартра Дж, Бимельт С, Витс С, Зонневальд У (март 2006 г.). «Создание плодов томата со сниженной аллергенностью за счет опосредованного dsRNAi ингибирования экспрессии ns-LTP (Lyc e 3)». Журнал биотехнологии растений . 4 (2): 231–42. дои : 10.1111/j.1467-7652.2005.00175.x . ПМИД  17177799.
171. Ниггевег Р., Майкл А.Дж., Мартин С. (июнь 2004 г.). «Технические растения с повышенным содержанием антиоксиданта хлорогеновой кислоты». Природная биотехнология . 22 (6): 746–54. дои : 10.1038/nbt966. PMID  15107863. S2CID  21588259.
172. Гилберт М.К., Маджумдар Р., Раджасекаран К., Чен ЗЮ, Вэй К., Сиклер К.М., Лебар М.Д., Кэри Дж.В., Фрейм BR, Ван К. (июнь 2018 г.). «Замалчивание гена альфа-амилазы (amy1) в Aspergillus flavus на основе РНК-интерференции снижает рост грибков и выработку афлатоксина в зернах кукурузы». Планта . 247 (6): 1465–1473. Бибкод : 2018Plant.247.1465G. дои : 10.1007/s00425-018-2875-0. PMID  29541880. S2CID  3918937.
173. Каточ Р., Тхакур Н. (март 2013 г.). «РНК-интерференция: многообещающий метод улучшения традиционных сельскохозяйственных культур». Международный журнал пищевых наук и питания . 64 (2): 248–59. дои : 10.3109/09637486.2012.713918. PMID  22861122. S2CID  45212581.
174. Каточ Р., Тхакур Н. (март 2013 г.). «Достижения в области технологии РНК-интерференции и ее влияние на улучшение питания, борьбу с болезнями и насекомыми у растений». Прикладная биохимия и биотехнология . 169 (5): 1579–605. дои : 10.1007/s12010-012-0046-5. PMID  23322250. S2CID  23733295.
175. Дауни, Ровена С.; Лин, Мин; Корси, Беатрис; Фик, Андреа; Лиллемо, Мортен; Оливер, Ричард П.; Фан, Хуен Т.Т.; Тан, Кар-Чун; Кокрам, Джеймс (27 июля 2021 г.). «Septoria Nodorum Пятнистость пшеницы: борьба с болезнями и селекция устойчивости перед лицом меняющейся динамики заболеваний и меняющейся окружающей среды». Фитопатология . 111 (6). Американское фитопатологическое общество : PHYTO–07–20–028. doi : 10.1094/phyto-07-20-0280-rvw. hdl : 20.500.11937/83208 . ISSN  0031-949X. PMID  33245254. S2CID  227181536.
176. Ивашута С., Чжан Ю., Виггинс Б.Е., Рамасешадри П., Сегерс Г.К., Джонсон С., Мейер С.Э., Керстеттер Р.А., Макналти BC, Болоньези Р., Хек Г.Р. (май 2015 г.). «Экологические РНКи у травоядных насекомых». РНК . 21 (5): 840–50. дои : 10.1261/rna.048116.114. ПМЦ 4408792 . ПМИД  25802407. 
177. Миллер С.С., Мията К., Браун С.Дж., Томоясу Ю. (2012). «Исследование системной РНК-интерференции у красного мучного жука Tribolium castaneum: параметры, влияющие на эффективность РНКи». ПЛОС ОДИН . 7 (10): е47431. Бибкод : 2012PLoSO...747431M. дои : 10.1371/journal.pone.0047431 . ПМЦ 3484993 . ПМИД  23133513. 
178. Петрик Дж.С., Фридрих Г.Е., Карлтон С.М., Кессенич С.Р., Сильванович А., Чжан Ю., Кох М.С. (ноябрь 2016 г.). «Активная РНК кукурузного жука DvSnf7: оценка пероральной токсикологии повторной дозы в поддержку безопасности человека и млекопитающих». Нормативная токсикология и фармакология . 81 : 57–68. дои : 10.1016/j.yrtph.2016.07.009 . ПМИД  27436086.
179. Терениус О, Папаниколау А, Гарбутт Дж.С., Элефтерианос I, Хувенн Х., Кангинакудру С. и др. (февраль 2011 г.). «РНК-интерференция у чешуекрылых: обзор успешных и неудачных исследований и значение для дизайна эксперимента». Журнал физиологии насекомых . 57 (2): 231–45. дои : 10.1016/j.jinsphys.2010.11.006. hdl : 1854/LU-1101411 . ПМИД  21078327.
180. Монджелли, Ванеса; Салех, Мария-Карла (29 сентября 2016 г.). «Ошибки нельзя замалчивать: пути малых РНК и противовирусные реакции у насекомых» (PDF) . Ежегодный обзор вирусологии . 3 (1). Годовые обзоры : 573–589. doi : 10.1146/annurev-virology-110615-042447. ISSN  2327-056X. PMID  27741406. S2CID  38499958.
181. Чжу, Кун Янь; Палли, Субба Редди (7 января 2020 г.). «Механизмы, применение и проблемы интерференции РНК насекомых». Ежегодный обзор энтомологии . 65 (1). Годовые обзоры : 293–311. doi : 10.1146/annurev-ento-011019-025224. ISSN  0066-4170. ПМЦ 9939233 . PMID  31610134. S2CID  204702574. 
182. Хьюскен Д., Ланге Дж., Миканин С., Вейлер Дж., Ассельбергс Ф., Уорнер Дж., Мелун Б., Энгель С., Розенберг А., Коэн Д., Лабоу М., Рейнхардт М., Натт Ф., Холл Дж. (август 2005 г.). «Разработка полногеномной библиотеки миРНК с использованием искусственной нейронной сети». Природная биотехнология . 23 (8): 995–1001. дои : 10.1038/nbt1118. PMID  16025102. S2CID  11030533.
183. Ge G, Вонг GW, Луо Б (октябрь 2005 г.). «Прогнозирование эффективности нокдауна siRNA с использованием моделей искусственных нейронных сетей». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 336 (2): 723–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.08.147. ПМИД  16153609.
184. Яниц М., Ванхеке Д., Лерах Х. (2006). «Высокопроизводительная РНК-интерференция в функциональной геномике». РНК на пути к медицине . Справочник по экспериментальной фармакологии. Том. 173. С. 97–104. дои : 10.1007/3-540-27262-3_5. ISBN 978-3-540-27261-8. ПМИД  16594612.
185. Ванхеке Д., Яниц М. (февраль 2005 г.). «Функциональная геномика с использованием высокопроизводительной РНК-интерференции». Открытие наркотиков сегодня . 10 (3): 205–12. дои : 10.1016/S1359-6446(04)03352-5. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-86E7-8 . PMID  15708535. S2CID  9934291.
186. Мэтсон РС (2005). Применение технологии геномных и протеомных микрочипов для открытия лекарств . ЦРК Пресс. п. 6. ISBN 978-0-8493-1469-8.
187. Чжан XHD (2011). Оптимальный высокопроизводительный скрининг: практический дизайн эксперимента и анализ данных для исследования РНКи в масштабе генома. Издательство Кембриджского университета. стр. ix – xiii. ISBN 978-0-521-73444-8.
188. Мацке М.А., Мацке А.Дж. (2004). «Посадка семян новой парадигмы». ПЛОС Биол . 2 (5): е133. дои : 10.1371/journal.pbio.0020133 . ПМК 406394 . ПМИД  15138502. 
189. Экер-младший, Дэвис Р.В. (август 1986 г.). «Ингибирование экспрессии генов в растительных клетках путем экспрессии антисмысловой РНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (15): 5372–6. Бибкод : 1986PNAS...83.5372E. дои : 10.1073/pnas.83.15.5372 . ПМК 386288 . ПМИД  16593734. 
190. Наполи С, Лемье С, Йоргенсен Р (апрель 1990 г.). «Введение химерного гена халконсинтазы в петунию приводит к обратимой совместной супрессии гомологичных генов в транс». Растительная клетка . 2 (4): 279–289. дои : 10.1105/tpc.2.4.279. ПМК 159885 . ПМИД  12354959. 
191. Романо Н., Мачино Дж. (ноябрь 1992 г.). «Подавление: временная инактивация экспрессии генов Neurospora crassa путем трансформации гомологичными последовательностями». Молекулярная микробиология . 6 (22): 3343–53. doi :10.1111/j.1365-2958.1992.tb02202.x. PMID  1484489. S2CID  31234985.
192. Ван Блокланд Р., Ван дер Гест Н., Мол Дж.Н., Кутер Дж.М. (1994). «Трансген-опосредованное подавление экспрессии халконсинтазы у Petunia Hybrida является результатом увеличения оборота РНК». Плант Дж . 6 (6): 861–77. дои : 10.1046/j.1365-313X.1994.6060861.x .
193. Мол Дж.Н., ван дер Крол А.Р. (1991). Антисмысловые нуклеиновые кислоты и белки: основы и применение . М. Деккер. стр. 4, 136. ISBN. 978-0-8247-8516-1.
194. Кови С., Аль-Кафф Н., Лангара А., Тернер Д. (1997). «Растения борются с инфекцией путем подавления генов». Природа . 385 (6619): 781–2. Бибкод : 1997Natur.385..781C. дои : 10.1038/385781a0. S2CID  43229760.
195. Кумагай М.Х., Донсон Дж., Делла-Чоппа Г., Харви Д., Хэнли К., Гриль Л.К. (февраль 1995 г.). «Цитоплазматическое ингибирование биосинтеза каротиноидов с помощью РНК вирусного происхождения». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (5): 1679–83. Бибкод : 1995PNAS...92.1679K. дои : 10.1073/pnas.92.5.1679 . ПМК 42583 . ПМИД  7878039. 
196. Рэтклифф Ф., Харрисон Б.Д., Баулкомб, округ Колумбия (июнь 1997 г.). «Сходство между вирусной защитой и подавлением генов у растений». Наука . 276 (5318): 1558–60. дои : 10.1126/science.276.5318.1558. ПМИД  18610513.
197. Го С., Кемфуес KJ (май 1995 г.). «par-1, ген, необходимый для установления полярности у эмбрионов C. elegans, кодирует предполагаемую киназу Ser/Thr, которая распределена асимметрично». Клетка . 81 (4): 611–20. дои : 10.1016/0092-8674(95)90082-9 . ПМИД  7758115.
198. Пал-Бхадра М, Бхадра У, Бирчлер Дж. А. (август 1997 г.). «Косупрессия у дрозофилы: подавление гена алкогольдегидрогеназы трансгенами белого Adh зависит от Polycomb». Клетка . 90 (3): 479–90. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80508-5 . ПМИД  9267028.
199. Sen GL, Blau HM (июль 2006 г.). «Краткая история РНКи: молчание генов». Журнал ФАСЭБ . 20 (9): 1293–9. дои : 10.1096/fj.06-6014рев . PMID  16816104. S2CID  12917676.
200. Файр А, Сюй С, Монтгомери МК, Костас С.А., Драйвер С.Е., Мелло CC (февраль 1998 г.). «Мощное и специфическое генетическое вмешательство двухцепочечной РНК в Caenorhabditis elegans». Природа . 391 (6669): 806–11. Бибкод : 1998Natur.391..806F. дои : 10.1038/35888. PMID  9486653. S2CID  4355692.
201. Дэнехольт Б (2 октября 2006 г.). «Нобелевская премия по физиологии и медицине 2006 г.». nobelprize.org . Проверено 30 октября 2017 г.
202. Эльбашир С., Харборт Дж., Лендекель В. и др. (2001). «Дуплексы 21-нуклеотидных РНК опосредуют РНК-интерференцию в культивируемых клетках млекопитающих». Природа . 411 (6836): 494–498. Бибкод : 2001Natur.411..494E. дои : 10.1038/35078107. PMID  11373684. S2CID  710341.
203. Маккаффри А.П., Мейс Л., Фам Т.Т., Конклин Д.С., Хэннон Г.Дж. , Кей М.А. (июль 2002 г.). «РНК-интерференция у взрослых мышей». Природа . 418 (6893): 38–9. Бибкод : 2002Natur.418...38M. дои : 10.1038/418038a. PMID  12097900. S2CID  4361399.
204. Деви GR (сентябрь 2006 г.). «Подходы на основе миРНК в терапии рака». Генная терапия рака . 13 (9): 819–29. дои : 10.1038/sj.cgt.7700931 . ПМИД  16424918.
205. Wall NR, Ши Ю (октябрь 2003 г.). «Малая РНК: можно ли использовать интерференцию РНК для терапии?». Ланцет . 362 (9393): 1401–3. дои : 10.1016/s0140-6736(03)14637-5. PMID  14585643. S2CID  25034627.
206. Сах Д. (2006). «Терапевтический потенциал РНК-интерференции при неврологических расстройствах». Наука о жизни . 79 (19): 1773–80. дои : 10.1016/j.lfs.2006.06.011. ПМИД  16815477.
207. Дэвис М.Э. , Цукерман Дж.Э., Чой CH, Селигсон Д., Толчер А., Алаби Калифорния , Йен Ю., Хидель Дж.Д., Рибас А. (апрель 2010 г.). «Доказательства существования РНКи у людей из системно вводимых миРНК через целевые наночастицы». Природа . 464 (7291): 1067–70. Бибкод : 2010Natur.464.1067D. дои : 10.1038/nature08956. ПМЦ 2855406 . ПМИД  20305636. 
208. «Новартис получает одобрение ЕС на Леквио (инклисиран), первую в своем классе миРНК для снижения уровня холестерина при приеме двух доз в год» . Новартис . 11 декабря 2020 г.

Внешние ссылки

• Обзор процесса RNAi, из книги « Обнаженные ученые» Кембриджского университета.
• Анимация процесса РНКи из природы
• NOVA scienceNOW объясняет RNAi – 15-минутное видео трансляции Nova , вышедшей в эфир на канале PBS , 26 июля 2005 г.
• Замалчивание геномов. Архивировано 10 августа 2019 г. в экспериментах Wayback Machine по РНК-интерференции (RNAi) и биоинформатике на C. elegans в образовательных целях. Из Центра изучения ДНК Долана лаборатории Колд-Спринг-Харбор.
• Скрининг РНКи у C. elegans в 96-луночном жидкостном формате и их применение для систематической идентификации генетических взаимодействий (протокол)
• 2. Американские «люди-черви» получили Нобелевскую премию за работу в области РНК, по версии «Нью-Йорк Таймс»
• Интернет-направление «Молекулярная терапия»: «Развитие РНКи как терапевтической стратегии», сборник бесплатных статей о РНКи как терапевтической стратегии.
• GenomeRNAi: база данных фенотипов, полученных в результате экспериментов по скринингу РНК-интерференции у Drosophila melanogaster и Homo sapiens.
• Инструменты RNAi. Архивировано 19 июня 2018 г. на Wayback Machine. Предварительно разработанные и специальные инструменты для интерференции РНК.