stringtranslate.com

Фермент

Ленточная диаграмма гликозидазы со стрелкой, показывающей расщепление субстрата мальтозы на два продукта глюкозы.
Фермент глюкозидаза преобразует сахар мальтозу в два сахара глюкозы . Остатки активного центра обозначены красным, субстрат мальтозы — черным, а кофактор НАД — желтым. ( PDB : 1OBB ​)

Ферменты ( / ˈ ɛ n z aɪ m z / ) — это белки , которые действуют как биологические катализаторы , ускоряя химические реакции . Молекулы , на которые могут действовать ферменты, называются субстратами , а фермент преобразует субстраты в различные молекулы, известные как продукты . Почти все метаболические процессы в клетке нуждаются в ферментативном катализе , чтобы происходить со скоростью, достаточной для поддержания жизни. [1] : 8.1  Метаболические пути зависят от ферментов, катализирующих отдельные этапы. Изучение ферментов называется энзимологией , а область псевдоферментного анализа признает, что в ходе эволюции некоторые ферменты утратили способность осуществлять биологический катализ, что часто отражается в их аминокислотных последовательностях и необычных «псевдокаталитических» свойствах. [2] [3]

Известно, что ферменты катализируют более 5000 типов биохимических реакций. [4]

Другие биокатализаторы — это каталитические молекулы РНК , также называемые рибозимами . Иногда их описывают как тип фермента, а не как фермент, но даже в десятилетия, прошедшие с момента открытия рибозимов в 1980–1982 годах, само слово фермент часто означает конкретно тип белка (как это используется в этой статье).

Специфичность фермента обусловлена ​​его уникальной трехмерной структурой .

Определение ферментов по ИЮПАК

Как и все катализаторы, ферменты увеличивают скорость реакции , снижая ее энергию активации . Некоторые ферменты могут заставить свое превращение субстрата в продукт происходить во много миллионов раз быстрее. Крайним примером является оротидин 5'-фосфатдекарбоксилаза , которая позволяет реакции, которая в противном случае заняла бы миллионы лет, происходить за миллисекунды. [5] [6] Химически ферменты подобны любому катализатору и не расходуются в химических реакциях, а также не изменяют равновесие реакции. Ферменты отличаются от большинства других катализаторов тем, что они гораздо более специфичны. На активность фермента могут влиять другие молекулы: ингибиторы — это молекулы, которые снижают активность фермента, а активаторы — это молекулы, которые повышают активность. Многие терапевтические препараты и яды являются ингибиторами ферментов. Активность фермента заметно снижается за пределами его оптимальной температуры и pH , и многие ферменты (навсегда) денатурируются при воздействии чрезмерного тепла, теряя свою структуру и каталитические свойства.

Некоторые ферменты используются в коммерческих целях, например, в синтезе антибиотиков . Некоторые бытовые продукты используют ферменты для ускорения химических реакций: ферменты в биологических стиральных порошках расщепляют пятна белка, крахмала или жира на одежде, а ферменты в размягчителе мяса расщепляют белки на более мелкие молекулы, что облегчает пережевывание мяса.

Этимология и история

Фотография Эдуарда Бухнера.
Эдуард Бухнер

К концу XVII и началу XVIII веков были известны процессы переваривания мяса желудочными секретами [7] и превращения крахмала в сахара растительными экстрактами и слюной , но механизмы, посредством которых это происходит, не были идентифицированы. [8]

Французский химик Ансельм Пайен был первым, кто открыл фермент диастазу в 1833 году. [ 9] Несколько десятилетий спустя, изучая ферментацию сахара в спирт дрожжами , Луи Пастер пришел к выводу, что это брожение было вызвано жизненной силой, содержащейся в дрожжевых клетках, называемых «ферментами», которые, как считалось, функционируют только внутри живых организмов. Он писал, что «спиртовое брожение — это акт, связанный с жизнью и организацией дрожжевых клеток, а не со смертью или гниением клеток». [10]

В 1877 году немецкий физиолог Вильгельм Кюне (1837–1900) впервые использовал термин «фермент» , который происходит от древнегреческого ἔνζυμον (энзим)  « заквашенный , на дрожжах», для описания этого процесса. [11] Слово «фермент» позже стало использоваться для обозначения неживых веществ, таких как пепсин , а слово «фермент» стало использоваться для обозначения химической активности, производимой живыми организмами. [12]

Эдуард Бухнер представил свою первую работу по изучению дрожжевых экстрактов в 1897 году. В серии экспериментов в Берлинском университете он обнаружил, что сахар сбраживался дрожжевыми экстрактами даже тогда, когда в смеси не было живых дрожжевых клеток. [13] Он назвал фермент, вызывающий сбраживание сахарозы, « зимазой ». [14] В 1907 году он получил Нобелевскую премию по химии за «открытие бесклеточной ферментации». Следуя примеру Бухнера, ферменты обычно называют в соответствии с реакцией, которую они выполняют: суффикс -аза сочетается с названием субстрата ( например, лактаза — это фермент, расщепляющий лактозу ) или с типом реакции (например, ДНК-полимераза образует ДНК-полимеры). [15]

Биохимическая идентичность ферментов была еще неизвестна в начале 1900-х годов. Многие ученые наблюдали, что ферментативная активность связана с белками, но другие (например, лауреат Нобелевской премии Ричард Вильштеттер ) утверждали, что белки были просто носителями для настоящих ферментов и что белки сами по себе неспособны к катализу. [16] В 1926 году Джеймс Б. Самнер показал, что фермент уреаза является чистым белком, и кристаллизовал его; он сделал то же самое для фермента каталазы в 1937 году. Вывод о том, что чистые белки могут быть ферментами, был окончательно продемонстрирован Джоном Говардом Нортропом и Венделлом Мередитом Стэнли , которые работали над пищеварительными ферментами пепсином (1930), трипсином и химотрипсином . Эти три ученых были удостоены Нобелевской премии по химии 1946 года. [17]

Открытие того, что ферменты могут быть кристаллизованы, в конечном итоге позволило решить их структуры с помощью рентгеновской кристаллографии . Впервые это было сделано для лизоцима , фермента, обнаруженного в слезах, слюне и яичных белках , который переваривает оболочку некоторых бактерий; структура была решена группой под руководством Дэвида Чилтона Филлипса и опубликована в 1965 году. [18] Эта структура лизоцима с высоким разрешением ознаменовала начало области структурной биологии и попытки понять, как работают ферменты на атомном уровне детализации. [19]

Классификация и номенклатура

Ферменты можно классифицировать по двум основным критериям: либо по сходству аминокислотной последовательности (и, следовательно, по эволюционному родству), либо по ферментативной активности.

Активность фермента . Название фермента часто происходит от его субстрата или химической реакции, которую он катализирует, при этом слово заканчивается на -аза . [1] : 8.1.3  Примерами являются лактаза , алкогольдегидрогеназа и ДНК-полимераза . Различные ферменты, катализирующие одну и ту же химическую реакцию, называются изоферментами . [1] : 10.3 

Международный союз биохимии и молекулярной биологии разработал номенклатуру для ферментов, номера EC (для «Комиссии по ферментам») . Каждый фермент описывается «EC», за которым следует последовательность из четырех чисел, которые представляют иерархию ферментативной активности (от очень общей до очень конкретной). То есть, первое число в целом классифицирует фермент на основе его механизма, в то время как другие цифры добавляют все больше и больше специфичности. [20]

Классификация высшего уровня:

Эти разделы подразделяются по другим признакам, таким как субстрат, продукты и химический механизм . Фермент полностью определяется четырьмя числовыми обозначениями. Например, гексокиназа (EC 2.7.1.1) представляет собой трансферазу (EC 2), которая добавляет фосфатную группу (EC 2.7) к гексозному сахару, молекуле, содержащей спиртовую группу (EC 2.7.1). [21]

Сходство последовательностей . Категории EC не отражают сходство последовательностей. Например, две лигазы с одинаковым номером EC, катализирующие абсолютно одну и ту же реакцию, могут иметь совершенно разные последовательности. Независимо от их функции, ферменты, как и любые другие белки, были классифицированы по сходству последовательностей в многочисленные семейства. Эти семейства были задокументированы в десятках различных баз данных белков и семейств белков, таких как Pfam . [22]

Негомологичные изофункциональные ферменты . Неродственные ферменты, которые имеют одинаковую ферментативную активность, называются негомологичными изофункциональными ферментами . [23] Горизонтальный перенос генов может распространять эти гены на неродственные виды, особенно бактерии, где они могут заменять эндогенные гены той же функции, что приводит к гомологичному замещению генов.

Структура

График, показывающий, что скорость реакции экспоненциально увеличивается с температурой до тех пор, пока денатурация не приведет к ее дальнейшему снижению.
Активность фермента первоначально увеличивается с ростом температуры ( коэффициент Q10 ) до тех пор, пока структура фермента не развернется ( денатурация ), что приведет к оптимальной скорости реакции при промежуточной температуре.

Ферменты, как правило, представляют собой глобулярные белки , действующие по отдельности или в составе более крупных комплексов . Последовательность аминокислот определяет структуру, которая, в свою очередь, определяет каталитическую активность фермента. [24] Хотя структура определяет функцию, новую ферментативную активность пока нельзя предсказать только по структуре. [25] Структуры ферментов разворачиваются ( денатурируют ) при нагревании или воздействии химических денатурантов, и это нарушение структуры обычно приводит к потере активности. [26] Денатурация ферментов обычно связана с температурами выше обычного уровня для вида; в результате ферменты из бактерий, живущих в вулканических средах, таких как горячие источники, ценятся промышленными пользователями за их способность функционировать при высоких температурах, что позволяет катализируемым ферментами реакциям работать с очень высокой скоростью.

Ферменты обычно намного больше своих субстратов. Размеры варьируются от всего лишь 62 аминокислотных остатков, для мономера 4-оксалокротонаттаутомеразы , [ 27] до более чем 2500 остатков в синтазе жирных кислот животных . [28] Только небольшая часть их структуры (около 2–4 аминокислот) напрямую участвует в катализе: каталитический сайт. [29] Этот каталитический сайт расположен рядом с одним или несколькими сайтами связывания , где остатки ориентируют субстраты. Каталитический сайт и сайт связывания вместе составляют активный сайт фермента . Оставшаяся большая часть структуры фермента служит для поддержания точной ориентации и динамики активного сайта. [30]

В некоторых ферментах аминокислоты не участвуют напрямую в катализе; вместо этого фермент содержит сайты для связывания и ориентации каталитических кофакторов . [30] Структуры ферментов могут также содержать аллостерические сайты , где связывание небольшой молекулы вызывает конформационное изменение , которое увеличивает или уменьшает активность. [31]

Существует небольшое количество биологических катализаторов на основе РНК , называемых рибозимами , которые снова могут действовать самостоятельно или в комплексе с белками. Наиболее распространенной из них является рибосома , которая представляет собой комплекс белковых и каталитических компонентов РНК. [1] : 2.2 

Механизм

Лизоцим представлен в виде непрозрачной шарообразной поверхности с выраженной щелью, в которую плотно входит субстрат, изображенный в виде стержневой диаграммы.
Организация структуры фермента и пример лизоцима . Связывающие участки обозначены синим цветом, каталитический участок — красным, а субстрат пептидогликана — черным. ( PDB : 9LYZ ​)

Связывание субстрата

Ферменты должны связывать свои субстраты, прежде чем они смогут катализировать любую химическую реакцию. Ферменты обычно очень специфичны в отношении того, какие субстраты они связывают, а затем катализируют химическую реакцию. Специфичность достигается путем связывания карманов с комплементарной формой, зарядом и гидрофильными / гидрофобными характеристиками с субстратами. Поэтому ферменты могут различать очень похожие молекулы субстрата, чтобы быть хемоселективными , региоселективными и стереоспецифичными . [32]

Некоторые из ферментов, демонстрирующих наивысшую специфичность и точность, участвуют в копировании и экспрессии генома . Некоторые из этих ферментов имеют механизмы « корректировки ». Здесь фермент, такой как ДНК-полимераза, катализирует реакцию на первом этапе, а затем проверяет правильность продукта на втором этапе. [ 33] Этот двухэтапный процесс приводит к среднему уровню ошибок менее 1 ошибки на 100 миллионов реакций в полимеразах млекопитающих с высокой точностью. [1] : 5.3.1  Аналогичные механизмы корректуры также обнаружены в РНК-полимеразе , [34] аминоацил-тРНК-синтетазах [35] и рибосомах . [36]

Наоборот, некоторые ферменты проявляют ферментативную неразборчивость , имея широкую специфичность и действуя на ряд различных физиологически значимых субстратов. Многие ферменты обладают небольшими побочными активностями, которые возникли случайно (т.е. нейтрально ), что может быть отправной точкой для эволюционного отбора новой функции. [37] [38]

Гексокиназа представлена ​​в виде непрозрачной поверхности с выраженной открытой щелью связывания рядом с несвязанным субстратом (вверху) и того же фермента с более закрытой щелью, которая окружает связанный субстрат (внизу)
Фермент изменяет форму путем индуцированного соответствия при связывании субстрата с образованием комплекса фермент-субстрат. Гексокиназа имеет большое индуцированное движение соответствия, которое замыкается над субстратами аденозинтрифосфатом и ксилозой . Места связывания синие, субстраты черные и кофактор Mg 2+ желтый. ( PDB : 2E2N ​, 2E2Q ​)

Модель «замок и ключ»

Чтобы объяснить наблюдаемую специфичность ферментов, в 1894 году Эмиль Фишер предположил, что и фермент, и субстрат обладают определенными дополнительными геометрическими формами, которые точно соответствуют друг другу. [39] Это часто называют моделью «замка и ключа». [1] : 8.3.2  Эта ранняя модель объясняет специфичность ферментов, но не может объяснить стабилизацию переходного состояния, которого достигают ферменты. [40]

Модель индуцированного соответствия

В 1958 году Дэниел Кошланд предложил модификацию модели замка и ключа: поскольку ферменты являются довольно гибкими структурами, активный центр непрерывно перестраивается за счет взаимодействия с субстратом, когда субстрат взаимодействует с ферментом. [41] В результате субстрат не просто связывается с жестким активным центром; боковые цепи аминокислот , составляющие активный центр, формируются в точные положения, которые позволяют ферменту выполнять свою каталитическую функцию. В некоторых случаях, таких как гликозидазы , молекула субстрата также немного меняет форму, когда она входит в активный центр. [42] Активный центр продолжает изменяться до тех пор, пока субстрат не будет полностью связан, после чего определяется окончательная форма и распределение заряда. [43] Индуцированное соответствие может повысить точность молекулярного распознавания в присутствии конкуренции и шума через механизм конформационной корректуры . [44]

Катализ

Ферменты могут ускорять реакции несколькими способами, каждый из которых снижает энергию активации (ΔG ‡ , свободную энергию Гиббса ) [45]

  1. Стабилизируя переходное состояние:
    • Создание среды с распределением заряда, дополнительным к распределению заряда в переходном состоянии, для снижения его энергии [46]
  2. Предоставляя альтернативный путь реакции:
    • Временно реагирует с субстратом, образуя ковалентный промежуточный продукт, чтобы обеспечить переходное состояние с более низкой энергией [47]
  3. Дестабилизируя основное состояние субстрата:
    • Деформация связанного субстрата(ов) в их переходное состояние для уменьшения энергии, необходимой для достижения переходного состояния [48]
    • Ориентируя субстраты в продуктивное расположение для уменьшения изменения энтропии реакции [49] (вклад этого механизма в катализ относительно невелик) [50]

Ферменты могут использовать несколько из этих механизмов одновременно. Например, протеазы , такие как трипсин, выполняют ковалентный катализ с использованием каталитической триады , стабилизируют накопление заряда в переходных состояниях с использованием оксианионной дырки , осуществляют полный гидролиз с использованием ориентированного водного субстрата. [51]

Динамика

Ферменты не являются жесткими, статическими структурами; вместо этого они имеют сложные внутренние динамические движения, то есть движения частей структуры фермента, таких как отдельные аминокислотные остатки, группы остатков, образующие белковую петлю или единицу вторичной структуры , или даже целый домен белка . Эти движения приводят к образованию конформационного ансамбля немного отличающихся структур, которые взаимопревращаются друг с другом в равновесии . Различные состояния внутри этого ансамбля могут быть связаны с различными аспектами функции фермента. Например, различные конформации фермента дигидрофолатредуктазы связаны со связыванием субстрата, катализом, высвобождением кофактора и этапами высвобождения продукта каталитического цикла, [52] что согласуется с теорией каталитического резонанса .

Презентация субстрата

Представление субстрата — это процесс, при котором фермент изолируется от своего субстрата. Ферменты могут изолироваться в плазматической мембране от субстрата в ядре или цитозоле. Или внутри мембраны фермент может изолироваться в липидных плотах от своего субстрата в неупорядоченной области. Когда фермент высвобождается, он смешивается со своим субстратом. В качестве альтернативы фермент может изолироваться около своего субстрата для активации фермента. Например, фермент может быть растворимым и при активации связываться с липидом в плазматической мембране, а затем воздействовать на молекулы в плазматической мембране.

Аллостерическая модуляция

Аллостерические сайты — это карманы на ферменте, отличные от активного сайта, которые связываются с молекулами в клеточной среде. Затем эти молекулы вызывают изменение конформации или динамики фермента, которое трансдуцируется в активный сайт и, таким образом, влияет на скорость реакции фермента. [53] Таким образом, аллостерические взаимодействия могут либо ингибировать, либо активировать ферменты. Аллостерические взаимодействия с метаболитами выше или ниже по течению в метаболическом пути фермента вызывают регуляцию обратной связи , изменяя активность фермента в соответствии с потоком через остальную часть пути. [54]

Кофакторы

Пирофосфат тиамина представлен в виде непрозрачной шаровидной поверхности с открытой щелью связывания, в которую вписываются субстрат и кофактор, изображенные в виде стержневых диаграмм.
Химическая структура тиаминпирофосфата и структура белка транскетолазы . Кофактор тиаминпирофосфата выделен желтым цветом, а субстрат ксилулозо-5-фосфата — черным. ( PDB : 4KXV ​)

Некоторые ферменты не нуждаются в дополнительных компонентах для проявления полной активности. Другим для активности требуются небелковые молекулы, называемые кофакторами. [55] Кофакторы могут быть как неорганическими (например, ионы металлов и кластеры железа и серы ), так и органическими соединениями (например, флавин и гем ). Эти кофакторы служат многим целям; например, ионы металлов могут помочь в стабилизации нуклеофильных видов в активном центре. [56] Органические кофакторы могут быть либо коферментами , которые высвобождаются из активного центра фермента во время реакции, либо простетическими группами , которые прочно связаны с ферментом. Органические простетические группы могут быть ковалентно связаны (например, биотин в ферментах, таких как пируваткарбоксилаза ). [57]

Примером фермента, содержащего кофактор, является карбоангидраза , которая использует цинковый кофактор, связанный как часть ее активного центра. [58] Эти прочно связанные ионы или молекулы обычно находятся в активном центре и участвуют в катализе. [1] : 8.1.1  Например, кофакторы флавина и гема часто участвуют в окислительно-восстановительных реакциях. [1] : 17 

Ферменты, которым требуется кофактор, но которые не имеют ни одной связи, называются апоферментами или апопротеинами . Фермент вместе с кофактором(ами), необходимыми для активности, называется голоферментом (или галоферментом). Термин голофермент может также применяться к ферментам, которые содержат несколько белковых субъединиц, таких как ДНК-полимеразы ; здесь голофермент — это полный комплекс, содержащий все субъединицы, необходимые для активности. [1] : 8.1.1 

Коферменты

Коферменты — это небольшие органические молекулы, которые могут быть слабо или прочно связаны с ферментом. Коферменты переносят химические группы от одного фермента к другому. [59] Примерами являются НАДН , НАДФН и аденозинтрифосфат (АТФ). Некоторые коферменты, такие как флавинмононуклеотид (ФМН), флавинадениндинуклеотид (ФАД), тиаминпирофосфат (ТФП) и тетрагидрофолат (ТГФ), получены из витаминов . Эти коферменты не могут быть синтезированы организмом de novo , и близкородственные соединения (витамины) должны быть получены из пищи. Переносимые химические группы включают:

Поскольку коферменты химически изменяются в результате действия ферментов, полезно рассматривать коферменты как особый класс субстратов или вторых субстратов, которые являются общими для многих различных ферментов. Например, известно, что около 1000 ферментов используют кофермент НАДН. [60]

Коферменты обычно непрерывно регенерируются, и их концентрации поддерживаются на постоянном уровне внутри клетки. Например, НАДФН регенерируется через пентозофосфатный путь , а S- аденозилметионин - метионин-аденозилтрансферазой . Эта непрерывная регенерация означает, что небольшие количества коферментов могут использоваться очень интенсивно. Например, человеческое тело ежедневно перерабатывает собственный вес в АТФ. [61]

Термодинамика

Двумерный график координаты реакции (ось x) против энергии (ось y) для катализируемых и некатализируемых реакций. Энергия системы неуклонно увеличивается от реагентов (x = 0) до достижения максимума в переходном состоянии (x = 0,5) и неуклонно уменьшается к продуктам (x = 1). Однако в реакции, катализируемой ферментом, связывание генерирует комплекс фермент-субстрат (с немного сниженной энергией), затем увеличивается до переходного состояния с меньшим максимумом, чем в некатализируемой реакции.
Энергии стадий химической реакции . Некатализированные (пунктирная линия) субстраты требуют много энергии активации для достижения переходного состояния , которое затем распадается на продукты с более низкой энергией. При катализе ферментом (сплошная линия) фермент связывает субстраты (ES), затем стабилизирует переходное состояние (ES ‡ ), чтобы уменьшить энергию активации, необходимую для производства продуктов (EP), которые в конечном итоге высвобождаются.

Как и все катализаторы, ферменты не изменяют положение химического равновесия реакции. В присутствии фермента реакция протекает в том же направлении, что и без фермента, просто быстрее. [1] : 8.2.3  Например, карбоангидраза катализирует свою реакцию в любом направлении в зависимости от концентрации ее реагентов: [62]

Скорость реакции зависит от энергии активации, необходимой для образования переходного состояния , которое затем распадается на продукты. Ферменты увеличивают скорость реакции, понижая энергию переходного состояния. Во-первых, связывание образует низкоэнергетический комплекс фермент-субстрат (ES). Во-вторых, фермент стабилизирует переходное состояние таким образом, что для его достижения требуется меньше энергии по сравнению с некатализируемой реакцией (ES ‡ ). Наконец, комплекс фермент-продукт (EP) диссоциирует, высвобождая продукты. [1] : 8.3 

Ферменты могут объединять две или более реакции, так что термодинамически благоприятная реакция может быть использована для «управления» термодинамически неблагоприятной, так что объединенная энергия продуктов будет ниже, чем у субстратов. Например, гидролиз АТФ часто используется для управления другими химическими реакциями. [63]

Кинетика

Кинетика ферментов — это исследование того, как ферменты связывают субстраты и превращают их в продукты. [64] Данные о скорости, используемые в кинетическом анализе, обычно получают из ферментативных анализов . В 1913 году Леонор Михаэлис и Мод Леонора Ментен предложили количественную теорию кинетики ферментов, которая называется кинетикой Михаэлиса–Ментен . [65] Основным вкладом Михаэлиса и Ментен было представление ферментативных реакций в две стадии. На первой стадии субстрат обратимо связывается с ферментом, образуя комплекс фермент-субстрат. Это иногда называют комплексом Михаэлиса–Ментен в их честь. Затем фермент катализирует химическую стадию реакции и высвобождает продукт. Эта работа была далее развита Г. Э. Бриггсом и Дж. Б. С. Холдейном , которые вывели кинетические уравнения, которые широко используются и сегодня. [66]

Скорости фермента зависят от условий раствора и концентрации субстрата . Чтобы найти максимальную скорость ферментативной реакции, концентрацию субстрата увеличивают до тех пор, пока не будет видна постоянная скорость образования продукта. Это показано на кривой насыщения справа. Насыщение происходит потому, что по мере увеличения концентрации субстрата все больше и больше свободного фермента преобразуется в связанный с субстратом комплекс ES. При максимальной скорости реакции ( V max ) фермента все активные центры фермента связаны с субстратом, а количество комплекса ES равно общему количеству фермента. [1] : 8,4 

V max — это лишь один из нескольких важных кинетических параметров. Количество субстрата, необходимое для достижения заданной скорости реакции, также важно. Оно определяется константой Михаэлиса-Ментен ( K m ), которая представляет собой концентрацию субстрата, необходимую для того, чтобы фермент достиг половины своей максимальной скорости реакции; как правило, каждый фермент имеет характерную K M для данного субстрата. Другая полезная константа — k cat , также называемая числом оборотов , которое представляет собой число молекул субстрата, обрабатываемых одним активным центром в секунду. [1] : 8,4 

Эффективность фермента может быть выражена в терминах k cat / K m . Это также называется константой специфичности и включает константы скорости для всех этапов реакции вплоть до первого необратимого этапа. Поскольку константа специфичности отражает как сродство, так и каталитическую способность, она полезна для сравнения различных ферментов друг с другом или одного и того же фермента с различными субстратами. Теоретический максимум константы специфичности называется пределом диффузии и составляет около 10 8 - 10 9 (M −1 s −1 ). В этой точке каждое столкновение фермента с его субстратом приведет к катализу, и скорость образования продукта ограничена не скоростью реакции, а скоростью диффузии. Ферменты с этим свойством называются каталитически совершенными или кинетически совершенными . Примерами таких ферментов являются триозофосфатизомераза , карбоангидраза , ацетилхолинэстераза , каталаза , фумараза , β-лактамаза и супероксиддисмутаза . [1] : 8.4.2  Оборот таких ферментов может достигать нескольких миллионов реакций в секунду. [1] : 9.2  Но большинство ферментов далеки от совершенства: средние значения и составляют около и соответственно. [67]

Кинетика Михаэлиса-Ментена основана на законе действия масс , который выводится из предположений о свободной диффузии и термодинамически обусловленном случайном столкновении. Многие биохимические или клеточные процессы значительно отклоняются от этих условий из-за макромолекулярной скученности и ограниченного молекулярного движения. [68] Более поздние, сложные расширения модели пытаются исправить эти эффекты. [69]

Ингибирование

Скорость ферментативной реакции можно снизить с помощью различных типов ингибиторов ферментов. [70] : 73–74 

Виды торможения

Конкурентоспособный

Конкурентный ингибитор и субстрат не могут связываться с ферментом одновременно. [71] Часто конкурентные ингибиторы сильно напоминают реальный субстрат фермента. Например, препарат метотрексат является конкурентным ингибитором фермента дигидрофолатредуктазы , который катализирует восстановление дигидрофолата до тетрагидрофолата. [72] Сходство между структурами дигидрофолата и этого препарата показано на сопроводительном рисунке. Этот тип ингибирования можно преодолеть с помощью высокой концентрации субстрата. В некоторых случаях ингибитор может связываться с сайтом, отличным от сайта связывания обычного субстрата, и оказывать аллостерический эффект, изменяя форму обычного сайта связывания. [73]

Неконкурентный

Неконкурентный ингибитор связывается с сайтом, отличным от того, где связывается субстрат. Субстрат все еще связывается с его обычным сродством, и, следовательно, K m остается прежним. Однако ингибитор снижает каталитическую эффективность фермента, так что V max уменьшается. В отличие от конкурентного ингибирования, неконкурентное ингибирование не может быть преодолено высокой концентрацией субстрата. [70] : 76–78 

Неконкурентоспособный

Неконкурентный ингибитор не может связываться со свободным ферментом, только с комплексом фермент-субстрат; следовательно, эти типы ингибиторов наиболее эффективны при высокой концентрации субстрата. В присутствии ингибитора комплекс фермент-субстрат неактивен. [70] : 78  Этот тип ингибирования встречается редко. [74]

смешанный

Смешанный ингибитор связывается с аллостерическим сайтом, и связывание субстрата и ингибитора влияет друг на друга. Функция фермента снижается, но не устраняется при связывании с ингибитором. Этот тип ингибитора не подчиняется уравнению Михаэлиса–Ментен. [70] : 76–78 

Необратимый

Необратимый ингибитор навсегда инактивирует фермент, обычно путем образования ковалентной связи с белком. [75] Пенициллин [76] и аспирин [77] являются распространенными препаратами, которые действуют таким образом.

Функции ингибиторов

Во многих организмах ингибиторы могут действовать как часть механизма обратной связи . Если фермент производит слишком много одного вещества в организме, это вещество может действовать как ингибитор для фермента в начале пути, который его производит, вызывая замедление или остановку производства вещества, когда его достаточно. Это форма отрицательной обратной связи . Основные метаболические пути, такие как цикл лимонной кислоты, используют этот механизм. [1] : 17.2.2 

Поскольку ингибиторы модулируют функцию ферментов, их часто используют в качестве лекарств. Многие из таких лекарств являются обратимыми конкурентными ингибиторами, которые напоминают собственный субстрат фермента, подобно метотрексату , указанному выше; другие известные примеры включают статины, используемые для лечения высокого уровня холестерина , [78] и ингибиторы протеазы, используемые для лечения ретровирусных инфекций, таких как ВИЧ . [79] Распространенным примером необратимого ингибитора, который используется в качестве лекарства, является аспирин , который ингибирует ферменты ЦОГ-1 и ЦОГ-2 , которые производят мессенджер воспаления простагландин . [77] Другие ингибиторы ферментов являются ядами. Например, яд цианид является необратимым ингибитором фермента, который соединяется с медью и железом в активном центре фермента цитохром с оксидазы и блокирует клеточное дыхание . [80]

Факторы, влияющие на активность ферментов

Поскольку ферменты состоят из белков, их действие чувствительно к изменению многих физико-химических факторов, таких как pH, температура, концентрация субстрата и т. д.

В следующей таблице показаны оптимальные значения pH для различных ферментов. [81]

Биологическая функция

Ферменты выполняют широкий спектр функций внутри живых организмов. Они незаменимы для передачи сигнала и регуляции клеток, часто через киназы и фосфатазы . [82] Они также генерируют движение, при этом миозин гидролизует аденозинтрифосфат (АТФ) для создания мышечного сокращения , а также транспортируют грузы по клетке как часть цитоскелета . [ 83] Другие АТФазы в клеточной мембране являются ионными насосами, участвующими в активном транспорте . Ферменты также участвуют в более экзотических функциях, таких как люцифераза, генерирующая свет у светлячков . [84] Вирусы также могут содержать ферменты для инфицирования клеток, такие как интеграза и обратная транскриптаза ВИЧ , или для высвобождения вируса из клеток, как нейраминидаза вируса гриппа . [85]

Важная функция ферментов находится в пищеварительной системе животных. Такие ферменты, как амилазы и протеазы, расщепляют большие молекулы ( крахмал или белки соответственно) на более мелкие, чтобы они могли быть усвоены кишечником. Молекулы крахмала, например, слишком велики, чтобы быть усвоенными из кишечника, но ферменты гидролизуют цепи крахмала на более мелкие молекулы, такие как мальтоза и, в конечном итоге, глюкоза , которые затем могут быть усвоены. Различные ферменты переваривают различные пищевые вещества. У жвачных животных , которые питаются травоядными , микроорганизмы в кишечнике вырабатывают другой фермент, целлюлазу , чтобы расщеплять стенки целлюлозных клеток растительных волокон. [86]

Метаболизм

Схематическая диаграмма гликолитического метаболического пути, начинающегося с глюкозы и заканчивающегося пируватом через несколько промежуточных химических веществ. Каждый шаг в пути катализируется уникальным ферментом.
Метаболический путь гликолиза высвобождает энергию путем преобразования глюкозы в пируват через ряд промежуточных метаболитов. Каждая химическая модификация (красный ящик) выполняется отдельным ферментом.

Несколько ферментов могут работать вместе в определенном порядке, создавая метаболические пути . [1] : 30.1  В метаболическом пути один фермент берет продукт другого фермента в качестве субстрата. После каталитической реакции продукт затем передается другому ферменту. Иногда более одного фермента могут катализировать одну и ту же реакцию параллельно; это может позволить более сложную регуляцию: например, с низкой постоянной активностью, обеспечиваемой одним ферментом, но индуцируемой высокой активностью от второго фермента. [87]

Ферменты определяют, какие этапы происходят в этих путях. Без ферментов метаболизм не развивался бы по тем же этапам и не мог бы регулироваться для обслуживания потребностей клетки. Большинство центральных метаболических путей регулируются на нескольких ключевых этапах, как правило, с помощью ферментов, чья активность включает гидролиз АТФ. Поскольку эта реакция высвобождает так много энергии, другие реакции, которые термодинамически неблагоприятны, могут быть связаны с гидролизом АТФ, управляя общей серией связанных метаболических реакций. [1] : 30.1 

Контроль деятельности

Существует пять основных способов контроля активности ферментов в клетке. [1] : 30.1.1 

Регулирование

Ферменты могут быть либо активированы , либо ингибированы другими молекулами. Например, конечный продукт(ы) метаболического пути часто являются ингибиторами для одного из первых ферментов пути (обычно первого необратимого шага, называемого предопределенным шагом), таким образом регулируя количество конечного продукта, произведенного путями. Такой регуляторный механизм называется механизмом отрицательной обратной связи , поскольку количество произведенного конечного продукта регулируется его собственной концентрацией. [88] : 141–48  Механизм отрицательной обратной связи может эффективно регулировать скорость синтеза промежуточных метаболитов в соответствии с потребностями клеток. Это помогает эффективно распределять материалы и экономить энергию, а также предотвращает избыточное производство конечных продуктов. Как и другие гомеостатические устройства , контроль ферментативного действия помогает поддерживать стабильную внутреннюю среду в живых организмах. [88] : 141 

Посттрансляционная модификация

Примеры посттрансляционной модификации включают фосфорилирование , миристоилирование и гликозилирование . [88] : 149–69  Например, в ответ на инсулин фосфорилирование нескольких ферментов, включая гликогенсинтазу , помогает контролировать синтез или деградацию гликогена и позволяет клетке реагировать на изменения уровня сахара в крови . [89] Другим примером посттрансляционной модификации является расщепление полипептидной цепи. Химотрипсин , пищеварительная протеаза , вырабатывается в неактивной форме как химотрипсиноген в поджелудочной железе и транспортируется в этой форме в желудок , где он активируется. Это останавливает фермент от переваривания поджелудочной железы или других тканей до того, как он попадет в кишечник. Этот тип неактивного предшественника фермента известен как зимоген [ 88] : 149–53  или профермент.

Количество

Выработка ферментов ( транскрипция и трансляция генов ферментов) может быть усилена или уменьшена клеткой в ​​ответ на изменения в среде клетки. Эта форма регуляции генов называется индукцией ферментов . Например, бактерии могут стать устойчивыми к антибиотикам, таким как пенициллин , потому что индуцируются ферменты, называемые бета-лактамазами , которые гидролизуют важное бета-лактамное кольцо в молекуле пенициллина. [90] Другой пример — ферменты в печени , называемые цитохром P450 оксидазами , которые важны в метаболизме лекарств . Индукция или ингибирование этих ферментов может вызывать лекарственные взаимодействия . [91] Уровни ферментов также можно регулировать, изменяя скорость деградации ферментов . [1] : 30.1.1  Противоположностью индукции ферментов является репрессия ферментов .

Субклеточное распределение

Ферменты могут быть разделены на компартменты, при этом в разных клеточных компартментах происходят различные метаболические пути . Например, жирные кислоты синтезируются одним набором ферментов в цитозоле , эндоплазматическом ретикулуме и аппарате Гольджи и используются другим набором ферментов в качестве источника энергии в митохондриях посредством β-окисления . [92] Кроме того, перемещение фермента в разные компартменты может изменить степень протонирования (например, нейтральная цитоплазма и кислая лизосома ) или окислительное состояние (например, окисление периплазмы или восстановление цитоплазмы ), что, в свою очередь, влияет на активность фермента. [93] В отличие от разделения на связанные с мембраной органеллы, субклеточная локализация фермента также может быть изменена посредством полимеризации ферментов в макромолекулярные цитоплазматические филаменты. [94] [95]

Специализация органов

У многоклеточных эукариот клетки в разных органах и тканях имеют разные паттерны экспрессии генов и, следовательно, разные наборы ферментов (известных как изоферменты ), доступных для метаболических реакций. Это обеспечивает механизм регулирования общего метаболизма организма. Например, гексокиназа , первый фермент в пути гликолиза , имеет специализированную форму, называемую глюкокиназой, экспрессируемую в печени и поджелудочной железе , которая имеет меньшее сродство к глюкозе, но более чувствительна к концентрации глюкозы. [96] Этот фермент участвует в определении уровня сахара в крови и регулировании выработки инсулина. [97]

Участие в заболевании

Ленточная диаграмма фенилаланингидроксилазы со связанным кофактором, коферментом и субстратом
В фенилаланингидроксилазе более 300 различных мутаций по всей структуре вызывают фенилкетонурию . Субстрат фенилаланина и кофермент тетрагидробиоптерин показаны черным цветом, а кофактор Fe 2+ — желтым. ( PDB : 1KW0 ​)
Наследственные дефекты ферментов обычно наследуются по аутосомному типу, поскольку не-Х-хромосом больше, чем Х-хромосом, и по рецессивному типу, поскольку ферментов из непораженных генов, как правило, достаточно для предотвращения симптомов у носителей.

Поскольку жесткий контроль активности ферментов необходим для гомеостаза , любая неисправность (мутация, перепроизводство, недопроизводство или делеция) одного критического фермента может привести к генетическому заболеванию. Неисправность всего лишь одного типа фермента из тысяч типов, присутствующих в организме человека, может быть фатальной. Примером фатального генетического заболевания, вызванного недостаточностью фермента, является болезнь Тея-Сакса , при которой у пациентов отсутствует фермент гексозаминидаза . [98] [99]

Одним из примеров дефицита фермента является наиболее распространенный тип фенилкетонурии . Множество различных мутаций отдельных аминокислот в ферменте фенилаланингидроксилазе , который катализирует первый шаг в деградации фенилаланина , приводят к накоплению фенилаланина и связанных с ним продуктов. Некоторые мутации находятся в активном центре, напрямую нарушая связывание и катализ, но многие находятся далеко от активного центра и снижают активность, дестабилизируя структуру белка или влияя на правильную олигомеризацию. [100] [101] Это может привести к умственной отсталости , если болезнь не лечить. [102] Другим примером является дефицит псевдохолинэстеразы , при котором нарушается способность организма расщеплять препараты эфира холина. [103] Пероральное введение ферментов может использоваться для лечения некоторых функциональных дефицитов ферментов, таких как недостаточность поджелудочной железы [104] и непереносимость лактозы . [105]

Другой способ, которым сбои в работе ферментов могут вызывать заболевания, происходит из-за мутаций зародышевой линии в генах, кодирующих ферменты репарации ДНК . Дефекты в этих ферментах вызывают рак, потому что клетки менее способны восстанавливать мутации в своих геномах . Это вызывает медленное накопление мутаций и приводит к развитию рака . Примером такого наследственного ракового синдрома является пигментная ксеродерма , которая вызывает развитие рака кожи в ответ даже на минимальное воздействие ультрафиолетового света . [106] [107]

Эволюция

Подобно любому другому белку, ферменты со временем изменяются посредством мутаций и расхождения последовательностей. Учитывая их центральную роль в метаболизме , эволюция ферментов играет решающую роль в адаптации . Поэтому ключевым вопросом является то, могут ли ферменты и каким образом одновременно изменять свою ферментативную активность. Общепринято, что многие новые ферментативные активности развились посредством дупликации генов и мутации дублированных копий, хотя эволюция может происходить и без дупликации. Одним из примеров фермента, который изменил свою активность, является предок метиониламинопептидазы (MAP) и креатинамидиногидролазы ( креатиназа ), которые явно гомологичны, но катализируют совершенно разные реакции (MAP удаляет аминоконцевой метионин в новых белках, в то время как креатиназа гидролизует креатин до саркозина и мочевины ). Кроме того, MAP зависит от ионов металлов, в то время как креатиназа — нет, поэтому это свойство также было утрачено со временем. [108] Небольшие изменения ферментативной активности чрезвычайно распространены среди ферментов. В частности, специфичность связывания субстрата (см. выше) может легко и быстро меняться с помощью изменений отдельных аминокислот в их субстратсвязывающих карманах. Это часто наблюдается в основных классах ферментов, таких как киназы . [109]

Искусственная (in vitro) эволюция в настоящее время широко используется для изменения активности или специфичности ферментов в промышленных целях (см. ниже).

Промышленное применение

Ферменты используются в химической промышленности и других промышленных приложениях, когда требуются чрезвычайно специфические катализаторы. Ферменты в целом ограничены в количестве реакций, которые они развили для катализа, а также в связи с их недостаточной стабильностью в органических растворителях и при высоких температурах. Как следствие, белковая инженерия является активной областью исследований и включает попытки создания новых ферментов с новыми свойствами либо посредством рационального проектирования, либо посредством эволюции in vitro . [110] [111] Эти усилия начали приносить успех, и несколько ферментов теперь были разработаны «с нуля» для катализа реакций, которые не встречаются в природе. [112]

Смотрите также

Базы данных ферментов

Ссылки

  1. ^ abcdefghijklmnopqrstu Страйер Л., Берг Дж.М., Тимочко Дж.Л. (2002). Биохимия (5-е изд.). Сан-Франциско: WH Freeman. ISBN 0-7167-4955-6.Значок открытого доступа
  2. ^ Murphy JM, Farhan H, Eyers PA (апрель 2017 г.). «Биозомби: рост псевдоферментов в биологии». Труды биохимического общества . 45 (2): 537–544. doi :10.1042/bst20160400. PMID  28408493.
  3. ^ Murphy JM, Zhang Q, Young SN, Reese ML, Bailey FP, Eyers PA и др. (январь 2014 г.). «Надежная методология подклассификации псевдокиназ на основе их нуклеотидсвязывающих свойств». The Biochemical Journal . 457 (2): 323–334. doi :10.1042/BJ20131174. PMC 5679212 . PMID  24107129. 
  4. ^ Schomburg I, Chang A, Placzek S, Söhngen C, Rother M, Lang M и др. (январь 2013 г.). «BRENDA в 2013 г.: интегрированные реакции, кинетические данные, данные о функциях ферментов, улучшенная классификация заболеваний: новые возможности и содержание в BRENDA». Nucleic Acids Research . 41 (выпуск базы данных): D764–D772. doi :10.1093/nar/gks1049. PMC 3531171 . PMID  23203881. 
  5. ^ Radzicka A, Wolfenden R (январь 1995). "A proficient genetic genetics". Science . 267 (5194): 90–93. Bibcode :1995Sci...267...90R. doi :10.1126/science.7809611. PMID  7809611. S2CID  8145198.
  6. ^ Callahan BP, Miller BG (декабрь 2007 г.). «OMP-декарбоксилаза — загадка сохраняется». Биоорганическая химия . 35 (6): 465–469. doi :10.1016/j.bioorg.2007.07.004. PMID  17889251.
  7. ^ де Реомюр РА (1752). «Наблюдения за пищеварением жиров». История Королевской академии наук . 1752 : 266, 461.
  8. ^ Уильямс ХС (1904). История науки: в пяти томах. Том IV: Современное развитие химических и биологических наук. Harper and Brothers.
  9. ^ Пайен А, Персоз Дж. Ф. (1833). «Mémoire sur la diastase, les principaux produits de ses réactions et leurs application aux arts industriels» [Мемуары о диастазе, основных продуктах ее реакций и их применении в промышленном искусстве]. Анналы химии и телосложения . 2-й (на французском языке). 53 : 73–92.
  10. ^ Manchester KL (декабрь 1995 г.). «Луи Пастер (1822–1895) — случайность и подготовленный разум». Тенденции в биотехнологии . 13 (12): 511–515. doi :10.1016/S0167-7799(00)89014-9. PMID  8595136.
  11. ^ Кюне ввел слово «фермент» в: Kühne W (1877). «Über das Verhalten verschiedenerorganisirter und sog. ungeformter Fermente» [О поведении различных организованных и так называемых неоформленных ферментов]. Verhandlungen des Naturhistorisch-medicinischen Vereins zu Heidelberg . новая серия (на немецком языке). 1 (3): 190–193.Соответствующий отрывок на странице 190: «Um Missverständnissen vorzubeugen und lästige Umschreibungen zu vermeiden schlägt Vortragender vor, die ungeformten oder nicht Organisirten Fermente, deren Wirkung ohne Anwesenheit von Organismen und ausserhalb derselben erfolgen kann, als Enzyme zu be» zeichnen." (Перевод: Во избежание недоразумений и во избежание громоздких перифраз [автор, преподаватель университета] предлагает обозначать «ферментами» неоформленные или неорганизованные ферменты, действие которых может происходить без присутствия организмов и вне их.)
  12. ^ Холмс FL (2003). «Ферменты». В Heilbron JL (ред.). Оксфордский компаньон по истории современной науки . Оксфорд: Oxford University Press. стр. 270. ISBN 9780199743766.
  13. ^ "Эдуард Бухнер". Биография лауреата Нобелевской премии . Nobelprize.org . Получено 23 февраля 2015 г.
  14. ^ "Эдуард Бухнер – Нобелевская лекция: Бесклеточная ферментация". Nobelprize.org . 1907. Получено 23 февраля 2015 г.
  15. ^ Наименование ферментов путем добавления суффикса «-аза» к субстрату, на который действует фермент, восходит к французскому ученому Эмилю Дюкло (1840–1904), который намеревался почтить память первооткрывателей диастазы — первого выделенного фермента — введя эту практику в своей книге Duclaux E (1899). Traité de microbiologie: Diastases, toxines et venins [ Трактат по микробиологии: диастазы, токсины и яды ] (на французском языке). Париж, Франция: Masson and Co.См. Главу 1, особенно страницу 9.
  16. ^ Вильштеттер Р. (1927). «Лекция Фарадея. Проблемы и методы исследования ферментов». Журнал химического общества (возобновлено) : 1359–1381. doi :10.1039/JR9270001359.цитируется в Blow D (апрель 2000 г.). «Итак, понимаем ли мы, как работают ферменты?». Структура . 8 (4): R77–R81. doi : 10.1016/S0969-2126(00)00125-8 . PMID  10801479.
  17. ^ "Нобелевские премии и лауреаты: Нобелевская премия по химии 1946 года". Nobelprize.org . Получено 23 февраля 2015 г. .
  18. ^ Blake CC, Koenig DF, Mair GA, North AC, Phillips DC, Sarma VR (май 1965). «Структура лизоцима куриного яйца. Трехмерный синтез Фурье с разрешением 2 Ангстрема». Nature . 206 (4986): 757–761. Bibcode :1965Natur.206..757B. doi :10.1038/206757a0. PMID  5891407. S2CID  4161467.
  19. ^ Джонсон Л. Н., Пецко ГА (июль 1999 г.). «Дэвид Филлипс и происхождение структурной энзимологии». Тенденции в биохимических науках . 24 (7): 287–289. doi :10.1016/S0968-0004(99)01423-1. PMID  10390620.
  20. ^ Moss GP. «Рекомендации Номенклатурного комитета Международного союза биохимии и молекулярной биологии по номенклатуре и классификации ферментов по реакциям, которые они катализируют». Международный союз биохимии и молекулярной биологии . Получено 28 августа 2021 г.
  21. ^ Номенклатурный комитет. "EC 2.7.1.1". Международный союз биохимии и молекулярной биологии (NC-IUBMB) . Факультет биологических и химических наук, Королева Мэри, Лондонский университет. Архивировано из оригинала 1 декабря 2014 года . Получено 6 марта 2015 года .
  22. ^ Mulder NJ (28 сентября 2007 г.). "Protein Family Databases". eLS . Чичестер, Великобритания: John Wiley & Sons, Ltd. стр. a0003058.pub2. doi :10.1002/9780470015902.a0003058.pub2. ISBN 978-0-470-01617-6.
  23. ^ Омельченко МВ, Гальперин МЮ, Вольф ЮИ, Кунин ЕВ (апрель 2010). "Негомологичные изофункциональные ферменты: систематический анализ альтернативных решений в эволюции ферментов". Biology Direct . 5 (1): 31. doi : 10.1186/1745-6150-5-31 . PMC 2876114 . PMID  20433725. 
  24. ^ Anfinsen CB (июль 1973). «Принципы, управляющие сворачиванием белковых цепей». Science . 181 (4096): 223–230. Bibcode :1973Sci...181..223A. doi :10.1126/science.181.4096.223. PMID  4124164.
  25. ^ Dunaway-Mariano D (ноябрь 2008). "Открытие функции фермента". Структура . 16 (11): 1599–1600. doi : 10.1016/j.str.2008.10.001 . PMID  19000810.
  26. ^ Petsko GA, Ringe D (2003). "Глава 1: От последовательности к структуре". Структура и функция белка . Лондон: New Science. стр. 27. ISBN 978-1405119221.
  27. ^ Chen LH, Kenyon GL, Curtin F, Harayama S, Bembenek ME, Hajipour G, Whitman CP (сентябрь 1992 г.). «4-оксалокротонаттаутомераза, фермент, состоящий из 62 аминокислотных остатков на мономер». Журнал биологической химии . 267 (25): 17716–17721. doi : 10.1016/S0021-9258(19)37101-7 . PMID  1339435.
  28. ^ Смит С. (декабрь 1994 г.). «Синтаза жирных кислот животных: один ген, один полипептид, семь ферментов». FASEB Journal . 8 (15): 1248–1259. doi : 10.1096/fasebj.8.15.8001737 . PMID  8001737. S2CID  22853095.
  29. ^ "The Catalytic Site Atlas". Европейский институт биоинформатики. Архивировано из оригинала 27 сентября 2018 года . Получено 4 апреля 2007 года .
  30. ^ ab Suzuki H (2015). "Глава 7: Структура активного сайта". Как работают ферменты: от структуры к функции . Boca Raton, FL: CRC Press. стр. 117–140. ISBN 978-981-4463-92-8.
  31. ^ Krauss G (2003). «Регулирование активности ферментов». Биохимия передачи и регуляции сигналов (3-е изд.). Weinheim: Wiley-VCH. С. 89–114. ISBN 9783527605767.
  32. ^ Jaeger KE, Eggert T (август 2004 г.). «Энантиоселективный биокатализ, оптимизированный направленной эволюцией». Current Opinion in Biotechnology . 15 (4): 305–313. doi :10.1016/j.copbio.2004.06.007. PMID  15358000.
  33. ^ Шевелев IV, Хюбшер U (май 2002). "3' 5' экзонуклеазы". Nature Reviews. Молекулярная клеточная биология . 3 (5): 364–376. doi :10.1038/nrm804. PMID  11988770. S2CID  31605786.
  34. ^ Зенкин Н., Юзенкова Ю., Северинов К. (июль 2006 г.). «Транскрипционная корректура с использованием транскрипта». Science . 313 (5786): 518–520. Bibcode :2006Sci...313..518Z. doi :10.1126/science.1127422. PMID  16873663. S2CID  40772789.
  35. ^ Ибба М., Солл Д. (2000). «Синтез аминоацил-тРНК». Annual Review of Biochemistry . 69 : 617–650. doi : 10.1146/annurev.biochem.69.1.617. PMID  10966471.
  36. ^ Роднина МВ, Винтермейер В (2001). «Точность выбора аминоацил-тРНК на рибосоме: кинетические и структурные механизмы». Annual Review of Biochemistry . 70 : 415–435. doi :10.1146/annurev.biochem.70.1.415. PMID  11395413.
  37. ^ Херсонский О, Тауфик ДС (2010). «Промискуитет ферментов: механистическая и эволюционная перспектива». Annual Review of Biochemistry . 79 : 471–505. doi :10.1146/annurev-biochem-030409-143718. PMID  20235827.
  38. ^ O'Brien PJ, Herschlag D (апрель 1999). «Каталитическая разнородность и эволюция новых ферментативных активностей». Химия и биология . 6 (4): R91–R105. doi : 10.1016/S1074-5521(99)80033-7 . PMID  10099128.
  39. ^ Фишер Э (1894). «Einfluss der Configuration auf die Wirkung der Enzyme» [Влияние конфигурации на действие ферментов]. Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft zu Berlin (на немецком языке). 27 (3): 2985–93. дои : 10.1002/cber.18940270364.Со страницы 2992: «Um ein Bild zu gebrauchen, will ich sagen, dass Enzym und Glucosid wie Schloss und Schlüssel zu einander passen müssen, um eine chemische Wirkung auf einander ausüben zu können». (Используя образ, я скажу, что фермент и глюкозид [т. е. производное глюкозы] должны подходить друг другу как замок и ключ, чтобы иметь возможность оказывать друг на друга химическое воздействие.)
  40. ^ Cooper GM (2000). "Глава 2.2: Центральная роль ферментов как биологических катализаторов". Клетка: молекулярный подход (2-е изд.). Вашингтон (округ Колумбия): ASM Press. ISBN 0-87893-106-6.
  41. ^ Koshland DE (февраль 1958). «Применение теории специфичности ферментов к синтезу белков». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 44 (2): 98–104. Bibcode : 1958PNAS... 44 ...98K. doi : 10.1073/pnas.44.2.98 . PMC 335371. PMID  16590179. 
  42. ^ Vasella A, Davies GJ, Böhm M (октябрь 2002 г.). «Механизмы гликозидазы». Current Opinion in Chemical Biology . 6 (5): 619–629. doi :10.1016/S1367-5931(02)00380-0. PMID  12413546.
  43. ^ Boyer R (2002). "Глава 6: Ферменты I, Реакции, Кинетика и Ингибирование". Концепции в биохимии (2-е изд.). Нью-Йорк, Чичестер, Вайнхайм, Брисбен, Сингапур, Торонто.: John Wiley & Sons, Inc. стр. 137–8. ISBN 0-470-00379-0. OCLC  51720783.
  44. ^ Savir Y, Tlusty T (май 2007 г.). Scalas E (ред.). "Конформационная корректура: влияние конформационных изменений на специфичность молекулярного распознавания". PLOS ONE . ​​2 (5): e468. Bibcode :2007PLoSO...2..468S. doi : 10.1371/journal.pone.0000468 . PMC 1868595 . PMID  17520027. 
  45. ^ Фершт А (1985). Структура и механизм фермента . Сан-Франциско: WH Freeman. С. 50–2. ISBN 978-0-7167-1615-0.
  46. ^ Warshel A, Sharma PK, Kato M, Xiang Y, Liu H, Olsson MH (август 2006 г.). «Электростатическая основа ферментативного катализа». Chemical Reviews . 106 (8): 3210–3235. doi :10.1021/cr0503106. PMID  16895325.
  47. ^ Cox MM, Nelson DL (2013). "Глава 6.2: Как работают ферменты". Lehninger Principles of Biochemistry (6-е изд.). Нью-Йорк, Нью-Йорк: WH Freeman. стр. 195. ISBN 978-1464109621.
  48. ^ Benkovic SJ, Hammes-Schiffer S (август 2003 г.). «Перспектива ферментативного катализа». Science . 301 (5637): 1196–1202. Bibcode :2003Sci...301.1196B. doi :10.1126/science.1085515. PMID  12947189. S2CID  7899320.
  49. ^ Дженкс WP (1987). Катализ в химии и энзимологии . Минеола, Нью-Йорк: Дувр. ISBN 978-0-486-65460-7.
  50. ^ Villa J, Strajbl M, Glennon TM, Sham YY, Chu ZT, Warshel A (октябрь 2000 г.). «Насколько важны энтропийные вклады в ферментативный катализ?». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (22): 11899–11904. Bibcode :2000PNAS...9711899V. doi : 10.1073/pnas.97.22.11899 . PMC 17266 . PMID  11050223. 
  51. ^ Полгар Л. (октябрь 2005 г.). «Каталитическая триада сериновых пептидаз». Cellular and Molecular Life Sciences . 62 (19–20): 2161–2172. doi :10.1007/s00018-005-5160-x. PMC 11139141 . PMID  16003488. S2CID  3343824. 
  52. ^ Ramanathan A, Savol A, Burger V, Chennubhotla CS, Agarwal PK (январь 2014 г.). «Конформационные популяции белков и функционально значимые подсостояния». Accounts of Chemical Research . 47 (1): 149–156. doi :10.1021/ar400084s. OSTI  1565147. PMID  23988159.
  53. ^ Tsai CJ, Del Sol A, Nussinov R (март 2009). «Аллостерия белков, передача сигналов и динамика: схема классификации аллостерических механизмов». Molecular BioSystems . 5 (3): 207–216. doi :10.1039/b819720b. PMC 2898650 . PMID  19225609. 
  54. ^ Changeux JP, Edelstein SJ (июнь 2005 г.). «Аллостерические механизмы передачи сигнала». Science . 308 (5727): 1424–1428. Bibcode :2005Sci...308.1424C. doi :10.1126/science.1108595. PMID  15933191. S2CID  10621930.
  55. ^ de Bolster MW (1997). "Глоссарий терминов, используемых в бионеорганической химии: кофактор". Международный союз теоретической и прикладной химии. Архивировано из оригинала 21 января 2017 года . Получено 30 октября 2007 года .
  56. ^ Voet D, Voet J, Pratt C (2016). Основы биохимии . Хобокен, Нью-Джерси: John Wiley & Sons, Inc. стр. 336. ISBN 978-1-118-91840-1.
  57. ^ Chapman-Smith A, Cronan JE (сентябрь 1999 г.). «Ферментативное биотинилирование белков: посттрансляционная модификация исключительной специфичности». Trends in Biochemical Sciences . 24 (9): 359–363. doi :10.1016/s0968-0004(99)01438-3. PMID  10470036.
  58. ^ Fisher Z, Hernandez Prada JA, Tu C, Duda D, Yoshioka C, An H и др. (февраль 2005 г.). «Структурная и кинетическая характеристика гистидина активного центра как протонного челнока в катализе человеческой карбоангидразы II». Биохимия . 44 (4): 1097–1105. doi :10.1021/bi0480279. PMID  15667203.
  59. ^ аб Вагнер А.Л. (1975). Витамины и коферменты . ISBN Krieger Pub Co. 0-88275-258-8.
  60. ^ "БРЕНДА Комплексная информационная система по ферментам" . Технический университет Брауншвейга . Проверено 23 февраля 2015 г.
  61. ^ Törnroth-Horsefield S, Neutze R (декабрь 2008 г.). «Открытие и закрытие ворот метаболита». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (50): 19565–19566. Bibcode : 2008PNAS..10519565T. doi : 10.1073/pnas.0810654106 . PMC 2604989. PMID  19073922 . 
  62. ^ McArdle WD, Katch F, Katch VL (2006). "Глава 9: Легочная система и упражнения". Основы физиологии упражнений (3-е изд.). Балтимор, Мэриленд: Lippincott Williams & Wilkins. стр. 312–3. ISBN 978-0781749916.
  63. ^ Фергюсон С.Дж., Николлс Д., Фергюсон С. (2002). Биоэнергетика 3 (3-е изд.). Сан-Диего: Академик. ISBN 0-12-518121-3.
  64. ^ Bisswanger H (2017). Кинетика ферментов: принципы и методы (Третье, расширенное и улучшенное изд.). Weinheim, Германия: Wiley-VCH. ISBN 9783527806461. OCLC  992976641.
  65. ^ Михаэлис Л., Ментен М. (1913). "Die Kinetik der Invertinwirkung" [Кинетика действия инвертазы]. Biochem. Z. (на немецком языке). 49 : 333–369.; Михаэлис Л., Ментен М.Л., Джонсон К.А., Гуди Р.С. (октябрь 2011 г.). «Оригинальная константа Михаэлиса: перевод статьи Михаэлиса-Ментен 1913 г.». Биохимия . 50 (39): 8264–8269. doi :10.1021/bi201284u. PMC 3381512. PMID  21888353 . 
  66. ^ Бриггс GE, Холдейн Дж. Б. (1925). «Заметка о кинетике действия ферментов». Биохимический журнал . 19 (2): 338–339. doi :10.1042/bj0190338. PMC 1259181. PMID  16743508 . 
  67. ^ Bar-Even A, Noor E, Savir Y, Liebermeister W, Davidi D, Tawfik DS, Milo R (май 2011 г.). «Умеренно эффективный фермент: эволюционные и физико-химические тенденции, формирующие параметры фермента». Биохимия . 50 (21): 4402–4410. doi :10.1021/bi2002289. PMID  21506553.
  68. ^ Ellis RJ (октябрь 2001 г.). «Макромолекулярная теснота: очевидная, но недооцененная». Trends in Biochemical Sciences . 26 (10): 597–604. doi :10.1016/S0968-0004(01)01938-7. PMID  11590012.
  69. ^ Копельман Р. (сентябрь 1988 г.). «Фрактальная реакционная кинетика». Science . 241 (4873): 1620–1626. Bibcode :1988Sci...241.1620K. doi :10.1126/science.241.4873.1620. PMID  17820893. S2CID  23465446.
  70. ^ abcd Корниш-Боуден А (2004). Основы ферментативной кинетики (3-е изд.). Лондон: Portland Press. ISBN 1-85578-158-1.
  71. ^ Прайс NC (1979). «Что подразумевается под «конкурентным ингибированием»?». Тенденции в биохимических науках . 4 (11): N272–N273. doi :10.1016/0968-0004(79)90205-6.
  72. ^ Goodsell DS (1 августа 1999 г.). «Молекулярная перспектива: метотрексат». The Oncologist . 4 (4): 340–341. doi : 10.1634/theoncologist.4-4-340 . PMID  10476546.
  73. ^ Wu P, Clausen MH, Nielsen TE (декабрь 2015 г.). «Аллостерические ингибиторы малых молекул киназы» (PDF) . Фармакология и терапия . 156 : 59–68. doi :10.1016/j.pharmthera.2015.10.002. PMID  26478442. S2CID  1550698.
  74. ^ Корниш-Боуден А. (июль 1986 г.). «Почему неконкурентное ингибирование встречается так редко? Возможное объяснение, имеющее значение для разработки лекарств и пестицидов». FEBS Letters . 203 (1): 3–6. doi :10.1016/0014-5793(86)81424-7. PMID  3720956. S2CID  45356060.
  75. ^ Strelow JM (январь 2017 г.). «Взгляд на кинетику ковалентного и необратимого ингибирования». SLAS Discovery . 22 (1): 3–20. doi : 10.1177/1087057116671509 . PMID  27703080.
  76. ^ Фишер Дж. Ф., Меруэх СО, Мобашери С. (февраль 2005 г.). «Бактериальная устойчивость к бета-лактамным антибиотикам: убедительный оппортунизм, убедительная возможность». Chemical Reviews . 105 (2): 395–424. doi :10.1021/cr030102i. PMID  15700950.
  77. ^ ab Johnson DS, Weerapana E, Cravatt BF (июнь 2010 г.). «Стратегии обнаружения и снижения риска ковалентных необратимых ингибиторов ферментов». Future Medicinal Chemistry . 2 (6): 949–964. doi :10.4155/fmc.10.21. PMC 2904065. PMID 20640225  . 
  78. ^ Endo A (ноябрь 1992 г.). «Открытие и разработка ингибиторов HMG-CoA-редуктазы». Journal of Lipid Research . 33 (11): 1569–1582. doi : 10.1016/S0022-2275(20)41379-3 . PMID  1464741.
  79. ^ Влодавер А., Вондрасек Дж. (1998). «Ингибиторы протеазы ВИЧ-1: крупный успех структурно-ассистированного дизайна лекарств». Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure . 27 : 249–284. doi :10.1146/annurev.biophys.27.1.249. PMID  9646869. S2CID  10205781.
  80. ^ Yoshikawa S, Caughey WS (май 1990). «Инфракрасные доказательства связывания цианида с железными и медными участками цитохрома с оксидазы бычьего сердца. Последствия, касающиеся восстановления кислорода». Журнал биологической химии . 265 (14): 7945–7958. doi : 10.1016/S0021-9258(19)39023-4 . PMID  2159465.
  81. ^ Jain JL (май 1999). Основы биохимии . Нью-Дели: S. Chand and Co. ISBN 8121903432. OCLC  818809626.
  82. ^ Hunter T (январь 1995). «Протеинкиназы и фосфатазы: инь и ян фосфорилирования и сигнализации белков». Cell . 80 (2): 225–236. doi : 10.1016/0092-8674(95)90405-0 . PMID  7834742. S2CID  13999125.
  83. ^ Berg JS, Powell BC, Cheney RE (апрель 2001 г.). «Тысячелетняя перепись миозина». Молекулярная биология клетки . 12 (4): 780–794. doi :10.1091/mbc.12.4.780. PMC 32266. PMID  11294886 . 
  84. ^ Meighen EA (март 1991). «Молекулярная биология бактериальной биолюминесценции». Microbiological Reviews . 55 (1): 123–142. doi :10.1128/MMBR.55.1.123-142.1991. PMC 372803. PMID  2030669 . 
  85. ^ De Clercq E (апрель 2002 г.). «Основные моменты в разработке новых противовирусных агентов». Mini Reviews in Medicinal Chemistry . 2 (2): 163–175. doi :10.2174/1389557024605474. PMID  12370077.
  86. ^ Mackie RI, White BA (октябрь 1990 г.). «Последние достижения в области микробной экологии и метаболизма рубца: потенциальное влияние на выход питательных веществ». Journal of Dairy Science . 73 (10): 2971–2995. doi : 10.3168/jds.S0022-0302(90)78986-2 . PMID  2178174.
  87. ^ Rouzer CA, Marnett LJ (апрель 2009 г.). «Циклооксигеназы: структурные и функциональные идеи». Journal of Lipid Research . 50 (Suppl): S29–S34. doi : 10.1194/jlr.R800042-JLR200 . PMC 2674713. PMID  18952571 . 
  88. ^ abcd Suzuki H (2015). "Глава 8: Контроль активности ферментов". Как работают ферменты: от структуры к функции . Boca Raton, FL: CRC Press. стр. 141–69. ISBN 978-981-4463-92-8.
  89. ^ Doble BW, Woodgett JR (апрель 2003 г.). «GSK-3: приемы работы с многозадачной киназой». Journal of Cell Science . 116 (Pt 7): 1175–1186. doi :10.1242/jcs.00384. PMC 3006448 . PMID  12615961. 
  90. ^ Беннетт П.М., Чопра И. (февраль 1993 г.). «Молекулярная основа индукции бета-лактамаз у бактерий». Антимикробные агенты и химиотерапия . 37 (2): 153–158. doi : 10.1128 /aac.37.2.153. PMC 187630. PMID  8452343. 
  91. ^ Skett P, Gibson GG (2001). "Глава 3: Индукция и ингибирование метаболизма лекарств". Введение в метаболизм лекарств (3-е изд.). Челтнем, Великобритания: Nelson Thornes Publishers. стр. 87–118. ISBN 978-0748760114.
  92. ^ Faergeman NJ, Knudsen J (апрель 1997 г.). «Роль длинноцепочечных жирных ацил-КоА-эстеров в регуляции метаболизма и клеточной сигнализации». The Biochemical Journal . 323 (Pt 1) (Pt 1): 1–12. doi :10.1042/bj3230001. PMC 1218279. PMID  9173866 . 
  93. ^ Suzuki H (2015). «Глава 4: Влияние pH, температуры и высокого давления на ферментативную активность». Как работают ферменты: от структуры к функции . Boca Raton, FL: CRC Press. стр. 53–74. ISBN 978-981-4463-92-8.
  94. ^ Noree C, Sato BK, Broyer RM, Wilhelm JE (август 2010 г.). «Идентификация новых белков, формирующих филаменты, в Saccharomyces cerevisiae и Drosophila melanogaster». Журнал клеточной биологии . 190 (4): 541–551. doi :10.1083/jcb.201003001. PMC 2928026. PMID  20713603 . 
  95. ^ Aughey GN, Liu JL (2015). «Метаболическая регуляция посредством ферментной филаментации». Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology . 51 (4): 282–293. doi :10.3109/10409238.2016.1172555. PMC 4915340. PMID  27098510 . 
  96. ^ Камата К, Мицуя М, Нишимура Т, Эйки Дж, Нагата Й (март 2004 г.). «Структурная основа аллостерической регуляции мономерного аллостерического фермента человеческой глюкокиназы». Структура . 12 (3): 429–438. doi : 10.1016/j.str.2004.02.005 . PMID  15016359.
  97. ^ Froguel P, Zouali H, Vionnet N, Velho G, Vaxillaire M, Sun F и др. (март 1993 г.). «Семейная гипергликемия, вызванная мутациями в глюкокиназе. Определение подтипа сахарного диабета». The New England Journal of Medicine . 328 (10): 697–702. doi : 10.1056/NEJM199303113281005 . PMID  8433729.
  98. ^ Okada S, O'Brien JS (август 1969). «Болезнь Тея-Сакса: генерализованное отсутствие компонента бета-DN-ацетилгексозаминидазы». Science . 165 (3894): 698–700. Bibcode :1969Sci...165..698O. doi :10.1126/science.165.3894.698. PMID  5793973. S2CID  8473726.
  99. ^ "Изучение болезни Тея-Сакса". Национальный институт исследований генома человека США . Получено 1 марта 2015 г.
  100. ^ Erlandsen H, Stevens RC (октябрь 1999). «Структурная основа фенилкетонурии». Молекулярная генетика и метаболизм . 68 (2): 103–125. doi :10.1006/mgme.1999.2922. PMID  10527663.
  101. ^ Flatmark T, Stevens RC (август 1999). «Структурный анализ гидроксилаз ароматических аминокислот и их мутантных форм, связанных с заболеваниями». Chemical Reviews . 99 (8): 2137–2160. doi :10.1021/cr980450y. PMID  11849022.
  102. ^ "Фенилкетонурия". Гены и болезни [Интернет] . Бетесда (Мэриленд): Национальный центр биотехнологической информации (США). 1998–2015.
  103. ^ "Дефицит псевдохолинэстеразы". Национальная медицинская библиотека США . Получено 5 сентября 2013 г.
  104. ^ Fieker A, Philpott J, Armand M (2011). «Заместительная ферментная терапия при недостаточности поджелудочной железы: настоящее и будущее». Клиническая и экспериментальная гастроэнтерология . 4 : 55–73. doi : 10.2147/CEG.S17634 . ​​PMC 3132852. PMID  21753892 . 
  105. ^ Misselwitz B, Pohl D, Frühauf H, Fried M, Vavricka SR, Fox M (июнь 2013 г.). «Нарушение всасывания и непереносимость лактозы: патогенез, диагностика и лечение». United European Gastroenterology Journal . 1 (3): 151–159. doi :10.1177/2050640613484463. PMC 4040760. PMID  24917953 . 
  106. ^ Cleaver JE (май 1968). «Дефектная репарация репликации ДНК при пигментной ксеродерме». Nature . 218 (5142): 652–656. Bibcode :1968Natur.218..652C. doi :10.1038/218652a0. PMID  5655953. S2CID  4171859.
  107. ^ Джеймс В.Д., Элстон Д., Бергер Т.Г. (2011). Болезни кожи Эндрюса: клиническая дерматология (11-е изд.). Лондон: Saunders/Elsevier. стр. 567. ISBN 978-1437703146.
  108. ^ Мурзин АГ (ноябрь 1993). «Могут ли гомологичные белки проявлять различную ферментативную активность?». Тенденции в биохимических науках . 18 (11): 403–405. doi :10.1016/0968-0004(93)90132-7. PMID  8291080.
  109. ^ Ochoa D, Bradley D, Beltrao P (февраль 2018 г.). «Эволюция, динамика и нарушение регуляции сигнализации киназы». Current Opinion in Structural Biology . 48 : 133–140. doi :10.1016/j.sbi.2017.12.008. PMID  29316484.
  110. ^ Ренугопалакришнан В., Гардуньо-Хуарес Р., Нарасимхан Г., Верма Ч.С., Вэй Х., Ли П. (ноябрь 2005 г.). «Рациональный дизайн термостабильных белков: отношение к бионанотехнологии». Журнал нанонауки и нанотехнологии . 5 (11): 1759–1767. doi :10.1166/jnn.2005.441. PMID  16433409.
  111. ^ Hult K, Berglund P (август 2003 г.). «Сконструированные ферменты для улучшенного органического синтеза». Current Opinion in Biotechnology . 14 (4): 395–400. doi :10.1016/S0958-1669(03)00095-8. PMID  12943848.
  112. ^ Цзян Л., Альтхофф Э.А., Клементе Ф.Р., Дойл Л., Ретлисбергер Д., Зангеллини А. и др. (март 2008 г.). «Вычислительный дизайн ретро-альдольных ферментов de novo». Наука . 319 (5868): 1387–1391. Бибкод : 2008Sci...319.1387J. дои : 10.1126/science.1152692. ПМЦ 3431203 . ПМИД  18323453. 
  113. ^ ab Sun Y, Cheng J (май 2002 г.). «Гидролиз лигноцеллюлозных материалов для производства этанола: обзор». Bioresource Technology . 83 (1): 1–11. Bibcode : 2002BiTec..83....1S. doi : 10.1016/S0960-8524(01)00212-7. PMID  12058826.
  114. ^ ab Kirk O, Borchert TV, Fuglsang CC (август 2002 г.). «Промышленные применения ферментов». Current Opinion in Biotechnology . 13 (4): 345–351. doi :10.1016/S0958-1669(02)00328-2. PMID  12323357.
  115. ^ abc Briggs DE (1998). Солод и солодовня (1-е изд.). Лондон: Blackie Academic. ISBN 978-0412298004.
  116. ^ Dulieu C, Moll M, Boudrant J, Poncelet D (2000). «Улучшение характеристик и управление брожением пива с использованием инкапсулированной альфа-ацетолактатдекарбоксилазы и моделирования». Biotechnology Progress . 16 (6): 958–965. doi : 10.1021/bp000128k . PMID  11101321. S2CID  25674881.
  117. ^ Tarté R (2008). Свойства, функциональность и применение ингредиентов в мясных продуктах . Нью-Йорк: Springer. С. 177. ISBN 978-0-387-71327-4.
  118. ^ "Chymosin – GMO Database". GMO Compass . Европейский союз. 10 июля 2010 г. Архивировано из оригинала 26 марта 2015 г. Получено 1 марта 2015 г.
  119. ^ Molimard P, Spinnler HE (февраль 1996 г.). «Обзор: Соединения, участвующие во вкусе сыров, созревших на поверхности с плесенью: происхождение и свойства». Journal of Dairy Science . 79 (2): 169–184. doi : 10.3168/jds.S0022-0302(96)76348-8 .
  120. ^ Гусман-Мальдонадо Х, Паредес-Лопес О (сентябрь 1995 г.). «Амилолитические ферменты и продукты, полученные из крахмала: обзор». Критические обзоры в области пищевой науки и питания . 35 (5): 373–403. doi :10.1080/10408399509527706. PMID  8573280.
  121. ^ ab "Protease – GMO Database". GMO Compass . Европейский союз. 10 июля 2010 г. Архивировано из оригинала 24 февраля 2015 г. Получено 28 февраля 2015 г.
  122. ^ Alkorta I, Garbisu C, Llama MJ, Serra JL (январь 1998 г.). «Промышленное применение пектиновых ферментов: обзор». Process Biochemistry . 33 (1): 21–28. doi :10.1016/S0032-9592(97)00046-0.
  123. ^ Bajpai P (март 1999). «Применение ферментов в целлюлозно-бумажной промышленности». Biotechnology Progress . 15 (2): 147–157. doi :10.1021/bp990013k. PMID  10194388. S2CID  26080240.
  124. ^ Begley CG, Paragina S, Sporn A (март 1990). «Анализ ферментных очистителей контактных линз». Журнал Американской оптометрической ассоциации . 61 (3): 190–194. PMID  2186082.
  125. ^ Farris PL (2009). "Экономический рост и организация крахмальной промышленности США". В BeMiller JN, Whistler RL (ред.). Крахмальная химия и технология (3-е изд.). Лондон: Academic. ISBN 9780080926551.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки