Этот словарь клеточной и молекулярной биологии представляет собой список определений терминов и понятий, обычно используемых при изучении клеточной биологии , молекулярной биологии и смежных дисциплин, включая генетику , биохимию и микробиологию . [1] Он разделен на две статьи:
На этой странице « Глоссарий клеточной и молекулярной биологии (0–L)» перечислены термины, начинающиеся с цифр и букв от A до L.
Глоссарий предназначен как вводный материал для новичков; более конкретные и технические подробности см. в статье, соответствующей каждому термину. Перекрывающиеся и родственные глоссарии включают Глоссарий эволюционной биологии , Глоссарий вирусологии и Глоссарий химии .
Один из двух концов одной линейной цепи ДНК или РНК , а именно конец, на котором цепь нуклеотидов заканчивается у третьего атома углерода в фуранозном кольце дезоксирибозы или рибозы (т.е. конец, на котором 3'-углерод не присоединен). к другому нуклеотиду через фосфодиэфирную связь ; in vivo 3'-углерод часто все еще связан с гидроксильной группой). По соглашению, последовательности и структуры, расположенные ближе к 3'-концу относительно других, называются нижележащими. Контрастный 5'-конец .
Рибозное кольцо с атомами углерода, пронумерованными от 1 до 5 в соответствии с химическим соглашением . Говорят, что 5'-углерод находится выше по течению ; Говорят, что 3'-углерод находится ниже по течению . Также показаны связи с родовым основанием и фосфатной группой.
Специально измененный нуклеотид , прикрепленный к 5'-концу некоторых первичных транскриптов РНК, как часть набора посттранскрипционных модификаций , которые превращают необработанные транскрипты в зрелые продукты РНК. Точная структура 5'-кэпа сильно различается в зависимости от организма; у эукариот самый основной кэп состоит из метилированного гуанинового нуклеозида , связанного с трифосфатной группой, которая завершает 5'-конец последовательности РНК. Помимо других функций, кэпирование помогает регулировать экспорт зрелых РНК из ядра , предотвращать их деградацию экзонуклеазами и способствовать трансляции в цитоплазме. Зрелые мРНК также могут быть декепированы .
Один из двух концов одной линейной цепи ДНК или РНК , а именно конец, на котором цепь нуклеотидов заканчивается у пятого атома углерода в фуранозном кольце дезоксирибозы или рибозы (т.е. конец, на котором 5'-углерод не присоединен). к другому нуклеотиду через фосфодиэфирную связь ; in vivo 5'-углерод часто все еще связан с фосфатной группой). По соглашению, последовательности и структуры, расположенные ближе к 5'-концу относительно других, называются вышележащими . Контрастный 3'-конец .
Биохимическое соединение, состоящее из молекулы кофермента А, в которой имеется ацетильная группа ( -COCH 3) присоединяется посредством высокоэнергетической тиоэфирной связи. Ацетилирование кофермента А происходит как часть метаболизма белков , углеводов (гликолиз) и жирных кислот ( бета-окисление), после чего он участвует в качестве переносчика энергии в нескольких важных биохимических путях, особенно в цикле лимонной кислоты, в котором гидролиз ацетильная группа высвобождает энергию, которая в конечном итоге улавливается в 11 АТФ и одном ГТФ.
Химическая структура ацетил-КоА , ацетильная группа выделена синим цветом.
Ковалентное присоединение ацетильной группы ( –COCH 3) в химическое соединение, белок или другую биомолекулу посредством реакции этерификации уксусной кислотой , спонтанно или посредством ферментативного катализа. Ацетилирование играет важную роль в нескольких метаболических путях и в модификации гистонов. Контрастное деацетилирование .
Любой из класса ферментов трансфераз , которые катализируют ковалентное связывание ацетильной группы ( -COCH 3) в другое соединение, белок или биомолекулу — процесс, известный как ацетилирование.
(линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Наличие центромеры, расположенной очень близко к одному концу хромосомы, а не на конце или в середине . [2]
Тип фактора транскрипции , который увеличивает транскрипцию гена или набора генов. Большинство активаторов действуют путем связывания со специфической последовательностью , расположенной внутри или рядом с энхансером или промотором , и облегчая связывание РНК-полимеразы и других транскрипционных механизмов в той же области. См. также коактиватор ; контрастный репрессор .
Область фермента, с которой связывается одна или несколько молекул субстрата, заставляя субстрат или другую молекулу подвергаться химической реакции. Эта область обычно состоит из одного или нескольких аминокислотных остатков (обычно трех или четырех), которые при правильном сворачивании фермента способны образовывать временные химические связи с атомами молекулы субстрата; он также может включать один или несколько дополнительных остатков, которые при взаимодействии с субстратом способны катализировать специфическую реакцию с участием субстрата. Хотя активный центр составляет лишь небольшую часть всех остатков, составляющих фермент, его специфичность к конкретным субстратам и реакциям отвечает за биологическую функцию фермента.
Пуриновое нуклеиновое основание , используемое в качестве одного из четырех стандартных нуклеиновых оснований как в молекулах ДНК, так и в РНК . Аденин образует пару оснований с тимином в ДНК и с урацилом в РНК.
Один из четырех стандартных нуклеозидов , используемых в молекулах РНК , состоящий из аденинового основания, азот N 9 которого связан с углеродом C 1 сахара рибозы . Аденин, связанный с дезоксирибозой, известен как дезоксиаденозин, версия, используемая в ДНК.
Органическое соединение, полученное из аденина, которое действует как основной источник энергии для химических реакций внутри живых клеток. Он встречается во всех формах жизни, и его часто называют «молекулярной валютой» внутриклеточной передачи энергии.
Одна из трех основных биологически активных структурных конформаций двойной спирали ДНК, наряду с B-ДНК и Z-ДНК . Спираль А-формы имеет правостороннюю закрутку с 11 парами оснований на полный оборот, лишь немного более компактна, чем В-ДНК, но ее основания резко наклонены относительно оси спирали. Это часто предпочтительнее в обезвоженных условиях и в последовательностях последовательных пуриновых нуклеотидов (например, GAAGGGGA ); это также первичная конформация, принятая двухцепочечной РНК и гибридами РНК-ДНК . [3]
Любая пара организмов, генетически связанных между собой и обладающих одним и тем же признаком . Например, два двоюродных брата, у которых оба голубые глаза, являются затронутой родственной парой, поскольку на них обоих влияет аллель, кодирующая голубые глаза.
Одна из множества альтернативных версий отдельного гена, каждая из которых представляет собой жизнеспособную последовательность ДНК, занимающую определенное положение или локус на хромосоме. Например, у людей один аллель гена цвета глаз отвечает за голубые глаза, а другой аллель того же гена отвечает за карие глаза.
Также половая хромосома , гетерохромосома или идиохромосома .
Любая хромосома, отличающаяся от обычной аутосомы размером, формой или поведением и отвечающая за определение пола организма. У человека Х-хромосома и Y-хромосома являются половыми хромосомами.
Общий структурный мотив во вторичных структурах белков , состоящий из конформации правосторонней спирали, возникающей в результате образования водородных связей между аминокислотными остатками, которые не примыкают непосредственно друг к другу.
Также дифференциальное сращивание или просто сращивание .
Регулируемый феномен экспрессии генов эукариот, при котором определенные экзоны или части экзонов одного и того же первичного транскрипта по-разному включаются в окончательный зрелый транскрипт информационной РНК или удаляются из него . Класс посттранскрипционных модификаций , альтернативный сплайсинг, позволяет одному гену кодировать несколько изоформ белка и значительно увеличивает разнообразие белков, которые могут производиться отдельным геномом. См. также Сплайсинг РНК .
Любое из класса органических соединений, основная структурная формула которых включает центральный атом углерода, связанный с амино- и карбоксильными функциональными группами , а также с переменной боковой цепью . Из почти 500 известных аминокислот набор из 20 кодируется стандартным генетическим кодом и включается в длинные полимерные цепи в качестве строительных блоков пептидов и, следовательно, полипептидов и белков . Конкретные последовательности аминокислот в полипептидных цепях, образующих белок, в конечном итоге ответственны за определение структуры и функции белка.
Каждая аминокислота имеет одну и ту же базовую структурную формулу, состоящую из центрального атома углерода (α), связанного с тремя основными заместителями: одной аминогруппой (синий), одной карбоксильной группой (красный) и одной вариабельной боковой цепью (зеленый). Боковая цепь, которая может варьироваться от простой метильной группы ( аланин ) до более сложных функциональных групп, таких как индол с двойным кольцом ( триптофан ), придает каждой конкретной аминокислоте уникальную индивидуальность. Во время трансляции аминокислоты соединяются в линейную цепь посредством реакций конденсации, которые создают пептидные связи между карбоксильной группой одной аминокислоты и аминогруппой соседней аминокислоты. Говорят, что первая и последняя аминокислоты в цепи являются N-концевыми и C-концевыми соответственно в отношении несвязанной аминогруппы первой аминокислоты и несвязанной карбоксильной группы последней.
Любой из набора ферментов, катализирующих реакцию переэтерификации , приводящую к присоединению определенной аминокислоты (или ее предшественника) к одной из родственных ей молекул транспортной РНК , образуя аминоацил-тРНК. Каждая из 20 различных аминокислот, используемых в генетическом коде, распознается и прикрепляется своим собственным специфическим ферментом синтетазой, и большинство синтетаз родственны нескольким различным тРНК в соответствии с их специфическими антикодонами.
Транспортная РНК , с которой химически связана родственная аминокислота; т.е. продукт реакции переэтерификации, катализируемой аминоацил-тРНК-синтетазой. Аминоацил-тРНК связываются с аминоацильным участком рибосомы во время трансляции .
Любая последовательность или фрагмент ДНК или РНК, которая является источником и/или продуктом реакции амплификации. Этот термин чаще всего используется для описания многочисленных копируемых фрагментов, которые являются продуктами полимеразной цепной реакции или лигазной цепной реакции, хотя он также может относиться к последовательностям, которые естественным образом амплифицируются внутри генома, например, путем дупликации гена.
усиление
Репликация биомолекулы, в частности, производство одной или нескольких копий последовательности нуклеиновой кислоты , известной как ампликон, либо естественным путем (например, путем спонтанной дупликации), либо искусственно (например, с помощью ПЦР ), и, в частности, подразумевающее множество повторяющихся событий репликации, приводящих к в тысячах, миллионах или миллиардах копий целевой последовательности, о которой затем говорят, что она амплифицирована .
Неспособность одной или нескольких пар сестринских хроматид или гомологичных хромосом правильно мигрировать к противоположным сторонам клетки во время анафазы митоза или мейоза из-за дефекта веретенообразного аппарата . Следовательно, обе дочерние клетки анеуплоидны: в одной отсутствует одна или несколько хромосом (создается моносомия ) , а в другой имеется одна или несколько дополнительных копий тех же хромосом (создается полисомия ) .
анеуцентрический
(линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Наличие аномального количества центромер, т.е. более одной. [4]
Состояние клетки или организма, имеющего аномальное количество одной или нескольких определенных хромосом (но исключая аномальное количество полных наборов хромосом, которое вместо этого известно как эуплоидия).
Гибридизация двух одноцепочечных молекул нуклеиновой кислоты , содержащих комплементарные последовательности, создает двухцепочечную молекулу со спаренными нуклеиновыми основаниями . Этот термин используется, в частности, для описания этапов лабораторных методов, таких как полимеразная цепная реакция , когда двухцепочечные молекулы ДНК многократно денатурируются в одиночные цепи путем нагревания, а затем подвергаются воздействию более низких температур, заставляя цепи повторно связываться друг с другом или с комплементарными цепями. праймеры . Точная температура, при которой происходит отжиг, сильно зависит от длины и конкретной последовательности отдельных нитей.
Ряд из трех последовательных нуклеотидов в транспортной РНК , которые дополняют три нуклеотида кодона транскрипта мРНК . Во время трансляции каждая тРНК, рекрутируемая в рибосому , содержит один триплет антикодона, который спаривается с комплементарным ему кодоном из последовательности мРНК, что позволяет каждому кодону указывать конкретную аминокислоту, которую необходимо добавить к растущей пептидной цепи. Антикодоны, содержащие инозин в первом положении, способны спариваться более чем с одним кодоном из-за явления, известного как спаривание оснований колебания .
Любая молекула, которая действует как антагонист метаболического процесса , ограничивая или ингибируя нормальный клеточный метаболизм; т.е. метаболический яд. [4]
Ген, который помогает регулировать рост клеток и подавлять опухоли при правильном функционировании, поэтому его отсутствие или неисправность могут привести к неконтролируемому росту клеток и, возможно, к раку. [5] Сравните онкоген .
Ориентация двух цепей двухцепочечной нуклеиновой кислоты (и, в более общем смысле, любой пары биополимеров ), параллельных друг другу, но с противоположной направленностью. Например, две комплементарные цепи молекулы ДНК идут бок о бок, но в противоположных направлениях: одна цепь ориентирована 5’-к-3’, а другая – 3’-к-5’.
Транспортный белок , который осуществляет обмен двух разных ионов или небольших молекул через мембрану в противоположных направлениях одновременно или последовательно. [6]
Также антисмысловой транскрипт и антисмысловой олигонуклеотид (ASO) .
Одноцепочечная некодирующая молекула РНК, содержащая антисмысловую последовательность, которая комплементарна смысловой цепи, такой как информационная РНК , с которой она легко гибридизуется, тем самым ингибируя дальнейшую активность смысловой цепи (например, трансляцию в белок). Многие различные классы встречающихся в природе РНК, такие как миРНК , функционируют по этому принципу, что делает их мощными сайленсерами генов в различных механизмах регуляции генов. Синтетическая антисмысловая РНК также нашла широкое применение в исследованиях нокдауна генов и в практических приложениях, таких как антисмысловая терапия .
безъядерный
Тоже безъядерный .
(клетки или организма) Отсутствие ядра , т.е. дискретной, связанной с мембраной органеллы, содержащей геномную ДНК клетки, используемой, в частности, для клеток, которые обычно имеют ядро, но из которых ядро было удалено (например, при искусственном переносе ядра ), а также специализированных типов клеток, которые развиваются без ядер, несмотря на то, что клетки других тканей, входящих в тот же организм, обычно имеют ядра (например, эритроциты млекопитающих ).
Любой процесс, при котором химические соединения, содержащие различные незаменимые элементы (C, H, O, N, P, S, Se, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Mo или другие олигоэлементы), поглощаются микроорганизмами и включаются в организм. сложные биомолекулы с целью синтеза различных клеточных компонентов. Напротив, диссимиляционный процесс использует энергию, выделяемую при разложении экзогенных молекул, для обеспечения клеточного метаболизма , а затем выводит остаточные или токсичные соединения из клетки, вместо того, чтобы повторно использовать их для создания новых молекул.
асинапсис
Неспособность гомологичных хромосом правильно спариваться друг с другом во время мейоза . [4] Сравните синапсис и десинапсис .
прилагается X
Также соединение X.
Одна моноцентрическая хромосома, содержащая две или более физически прикрепленные копии нормальной Х-хромосомы в результате естественной внутренней дупликации или любого из множества методов генной инженерии. Полученная составная хромосома эффективно несет две или более дозы всех генов и последовательностей, включенных в X, но во всех других отношениях функционирует как одна хромосома, а это означает, что гаплоидные гаметы «XX» (а не обычные гаметы «X») будут вырабатывается путем мейоза и наследуется потомством. В таких механизмах, как генный баланс, при котором пол организма определяется общей дозой X-сцепленных генов, аномальная зигота «XXY» , оплодотворенная одной гаметой XX и одной гаметой Y, разовьется в самку.
Любая хромосома, не являющаяся аллосомой и, следовательно, не участвующая в определении пола организма . В отличие от половых хромосом, аутосомы в диплоидной клетке существуют парами, причем члены каждой пары имеют одинаковую структуру, морфологию и генетические локусы.
Клетка или организм, гомозиготный по локусу, в котором две гомологичные аллели идентичны по происхождению, причем обе произошли от одного гена у общего предка. [4] Контрастная аллозигота .
Описание клеточной культуры, в которой присутствует только один вид, разновидность или штамм и которая, следовательно, полностью свободна от загрязняющих организмов, включая симбиотов и паразитов.
Любая нештатная молекула ядерной ДНК , которая не является дубликатом и не гомологична какому-либо стандартному набору нормальных хромосом «А», составляющих геном. Обычно очень маленькие и лишенные структурных генов, В-хромосомы по определению не необходимы для жизни. Хотя они встречаются в природе у многих видов эукариот, они не наследуются стабильно и поэтому сильно различаются по количеству копий даже между близкородственными особями. [4]
обратная мутация
Мутация , которая обращает вспять эффект предыдущей мутации, инактивировавшей ген, тем самым восстанавливая функцию дикого типа . [7] См. также обратную мутацию .
Разведение гибридного организма с одним из его родителей или особью, генетически сходной с одним из своих родителей, часто преднамеренно как вид селекционного разведения с целью получения потомства с генетической идентичностью, более близкой к генетической идентичности родителя. Репродуктивное событие и полученное потомство называются обратным скрещиванием , которое в генетике часто сокращается до символа BC .
Пара двух азотистых оснований на комплементарных цепях ДНК или РНК , связанных друг с другом водородными связями . Способность последовательных пар оснований укладываться друг на друга способствует образованию длинноцепочечных двойных спиральных структур, наблюдаемых как в двухцепочечных молекулах ДНК, так и в двухцепочечных молекулах РНК.
базовый уровень
A measure of the gene expression level of a gene or genes prior to a perturbation in an experiment, as in a negative control. Baseline expression may also refer to the expected or historical measure of expression for a gene.
A computer algorithm widely used in bioinformatics for aligning and comparing primary biological sequence information such as the nucleotide sequences of DNA or RNA or the amino acid sequences of proteins. BLAST programs enable scientists to quickly check for homology between two or more sequences by directly comparing the nucleotides or amino acids present at each position within each sequence; a common use is to search for matches between a specific query sequence and a digital sequence database such as a genome library, with the program returning a list of sequences from the database which resemble the query sequence above a specified threshold of similarity. Such comparisons can permit the identification of an organism from an unknown sample or the inference of evolutionary relationships between genes, proteins, or species.
The "standard" or classical structural conformation of the DNA double helix in vivo, thought to represent an average of the various distinct conformations assumed by very long DNA molecules under physiological conditions.[3] The B-form double helix has a right-handed twist with a diameter of 23.7 ångströms and a pitch of 35.7 ångströms or about 10.5 base pairs per full turn, such that each nucleotide pair is rotated 36° around the helical axis with respect to its neighboring pairs. See also A-DNA and Z-DNA.
The three principal biologically active conformations of DNA molecules: A-DNA, B-DNA, and Z-DNA (left to right), as viewed from the side and down the axis of the double helix.
A common mechanism of DNA replication in which two replication forks move in opposite directions away from the same origin; this results in a bubble-like region where the duplex molecule is locally separated into two single strands.[4]
Сообщество симбиотических микроорганизмов, особенно бактерий, где клетки производят и внедряются в слизистый, липкий внеклеточный матрикс, состоящий из различных высокомолекулярных биополимеров , прилипающих друг к другу, а иногда и к субстрату , который может быть биотической или абиотической поверхностью. . [8] Многие бактерии могут существовать либо как независимые одиночные клетки, либо переходить к физиологически отличному фенотипу биопленки; те, кто создает биопленки, часто делают это, чтобы защитить себя от вредной окружающей среды. Клетки, находящиеся внутри биопленок, могут легко обмениваться питательными веществами и общаться, а субпопуляции клеток могут дифференцироваться для выполнения специализированных функций, поддерживающих всю биопленку. [9]
Измеримый индикатор некоторого биологического состояния, особенно соединения или биомолекулы, присутствие или отсутствие которых в биологической системе является надежным признаком нормального или аномального процесса, состояния или заболевания. [10] Прямые измерения концентрации определенного соединения или молекулы в образце ткани или жидкости часто являются информативными, но характерные физиологические, гистологические или рентгенографические сигналы (например, изменение частоты сердечных сокращений или отчетливая морфология под микроскопом) могут быть информативными. также служат биомаркерами. Они регулярно используются в качестве прогностических или диагностических инструментов в клинической медицине и лабораторных исследованиях.
Любой из множества методов молекулярной биологии, с помощью которых электрофоретически или хроматографически разделенные образцы ДНК, РНК или белка переносятся из поддерживающей среды, такой как полиакриламидный или агарозный гель, на иммобилизирующий носитель, такой как нитроцеллюлоза или мембрана из ПВДФ . Некоторые методы включают перенос молекул посредством капиллярного действия (например, Саузерн- и нозерн-блоттинг ), тогда как другие полагаются на транспорт заряженных молекул посредством электрофореза (например, вестерн-блоттинг ). Перенесенные молекулы затем визуализируются с помощью окрашивания красителем, авторадиографии или путем обнаружения специфических последовательностей или эпитопов с помощью гибридизационных зондов или антител, связанных с хемилюминесцентными репортерами. [4]
Термин, используемый для описания конца двухцепочечной молекулы ДНК, где концевые азотистые основания на каждой цепи спарены друг с другом, так что ни одна цепь не имеет одноцепочечного «навеса» из неспаренных оснований, в отличие от такового. - так называемый « липкий конец », когда выступ создается за счет того, что одна прядь на одно или несколько оснований длиннее другой. Тупые и липкие концы актуальны при лигировании нескольких молекул ДНК, например, при рестрикционном клонировании , поскольку молекулы с липкими концами не будут легко отжигаться друг с другом, если у них нет совпадающих выступов; Молекулы с тупыми концами таким образом не отжигаются, поэтому необходимо использовать специальные процедуры, чтобы гарантировать, что фрагменты с тупыми концами соединятся в правильных местах.
Регуляторный ген, который ограничивает экспрессию других генов в определенных тканях или частях тела организма, обычно путем производства генных продуктов, которые по-разному ингибируют или разрешают транскрипцию других генов в разных типах клеток. [4] Этот термин чаще всего используется в генетике растений .
Ген, расположение которого на хромосоме связано с определенным фенотипом (часто фенотипом, связанным с заболеванием), и поэтому предполагается, что он вызывает или способствует фенотипу. Гены-кандидаты часто выбираются для исследования на основе априорных знаний или предположений об их функциональной значимости для исследуемого признака или заболевания.
Мембранный белок , который действует как переносчик , связываясь с растворенным веществом и облегчая его перемещение через мембрану , претерпевая ряд конформационных изменений. [6]
Высококонсервативная регуляторная последовательность ДНК расположена примерно на 75 пар оснований выше (т.е. -75) от места начала транскрипции для многих эукариотических генов. [2]
Раздел биологии , изучающий структуру, функции, процессы и свойства биологических клеток — самостоятельных единиц жизни, общих для всех живых организмов.
Специализированный слой цитоплазматических белков, выстилающий внутреннюю поверхность клеточной мембраны в большинстве эукариотических клеток, состоящий в основном из актиновых микрофиламентов и моторных белков миозина и обычно толщиной 100–1000 нанометров, который действует как модулятор поведения мембраны и свойств клеточной поверхности.
Процесс, посредством которого живые клетки выращиваются и поддерживаются или «культивируются» в тщательно контролируемых условиях, как правило, за пределами их естественной среды. Оптимальные условия роста сильно различаются для разных типов клеток, но обычно состоят из подходящего сосуда (например, культуральной пробирки или чашки Петри ), содержащего специально разработанный субстрат или питательную среду, которая поставляет все питательные вещества, необходимые для жизни (аминокислоты, углеводы, витамины, минералы и т. д.), а также любые желательные факторы роста и гормоны, обеспечивает газообмен (при необходимости) и регулирует окружающую среду, поддерживая постоянные физико-химические свойства (например , pH , осмотическое давление и температуру). Некоторым типам клеток для размножения требуется твердая поверхность, к которой они могут прилипать, в то время как другие можно выращивать свободно плавая в жидкой или желеобразной суспензии . Большинство клеток имеют генетически детерминированный предел размножения, но иммортализованные клетки будут делиться бесконечно, если им обеспечить оптимальные условия.
Разделение отдельной родительской клетки на две дочерние каким-либо процессом. Деление клетки обычно происходит в результате сложной, тщательно структурированной последовательности событий, включающей реорганизацию внутреннего содержимого родительской клетки, физическое расщепление цитоплазмы и плазматической мембраны , а также равномерное распределение содержимого между двумя образовавшимися клетками, так что каждая в конечном итоге содержит примерно половину исходного материала исходной клетки. Обычно это подразумевает размножение посредством репликации генетического материала родительской клетки до деления, хотя клетки также могут делиться без репликации своей ДНК. В прокариотических клетках бинарное деление является основной формой клеточного деления. В эукариотических клетках бесполое деление происходит путем митоза и цитокинеза, тогда как определенные линии клеток, предназначенные для полового размножения, могут дополнительно делиться посредством мейоза . [6]
Полупроницаемая липидная мембрана , окружающая все клетки, определяющая внешнюю границу клетки и физически отделяющая цитоплазму от внеклеточной среды. [12] Клеточная мембрана представляет собой гибкий листовой фосфолипидный бислой с мембранными белками , углеводами и множеством других молекул, встроенных в него или иным образом взаимодействующих с ним как с внутренней, так и с внешней стороны. Встроенные молекулы часто могут свободно перемещаться в двух измерениях рядом с липидами мембраны. Хотя клеточную мембрану могут пассивно пересекать многие небольшие молекулы, большинству других требуется активный транспорт через специальные поры или каналы, чтобы войти в клетку или выйти из нее, обычно это очень большие или электрически заряженные молекулы, такие как белки и нуклеиновые кислоты. Помимо создания организованного внутреннего пространства, в котором осуществляется деятельность по поддержанию жизни, клеточная мембрана играет фундаментальную роль во всех взаимодействиях клетки с внешней средой, что делает ее важной в передаче сигналов клетки, ее подвижности , защите и делении, а также во многих других процессах. .
Разнообразный набор процессов, с помощью которых клетки передают и получают информацию от себя, других клеток или окружающей среды. Передача сигнала происходит во всех типах клеток, как прокариотических, так и эукариотических, и имеет решающее значение для способности клетки ориентироваться и выживать в физическом окружении. Бесчисленные механизмы передачи сигналов развились у разных организмов, и их часто классифицируют в зависимости от близости между отправителем и реципиентом (аутокринные, интракринные, юкстакринные, паракринные или эндокринные).
Преобразование полностью дифференцированной клетки из одного тканеспецифического типа клеток в другой. Это предполагает дедифференцировку до плюрипотентного состояния; примером является перевод соматических клеток мыши в недифференцированное эмбриональное состояние, которое зависит от транскрипционных факторов Oct4 , Sox2 , Myc и Klf4 . [13]
Единица измерения генетического сцепления, определяемая как расстояние между хромосомными локусами, для которого ожидаемое среднее количество промежуточных хромосомных кроссинговеров в одном поколении составляет 0,01. Хотя это и не является фактической мерой физического расстояния, оно используется для определения фактического расстояния между двумя локусами на основе очевидной вероятности возникновения кроссинговера между ними.
Обобщенная основа для понимания потока генетической информации между макромолекулами в биологических системах. Центральная догма излагает фундаментальный принцип, согласно которому информация о последовательности, закодированная в трех основных классах биополимеров — ДНК, РНК и белках , — может передаваться между этими тремя классами только определенными способами, а не другими: в частности, передача информации между нуклеиновые кислоты и от нуклеиновой кислоты к белку возможны, но перенос от белка к белку или от белка обратно к любому типу нуклеиновой кислоты невозможен и не происходит естественным путем.
Возможные типы передачи информации согласно центральной догме молекулярной биологии . Во всех живых клетках регулярно происходят три основных вида передачи (отмечены красным): ДНК-в-ДНК (репликация ДНК), ДНК-в-РНК ( транскрипция ) и РНК-в-белок ( трансляция ). Известно, что три особых переноса, выделенных синим цветом, происходят только у вирусов или в лаборатории: РНК-на-РНК ( репликация РНК ), РНК-на-ДНК ( обратная транскрипция ) и ДНК-белок (прямая трансляция без промежуточное соединение мРНК). Считается, что еще три переноса вообще невозможны: белок-белок, белок-РНК и белок-ДНК, хотя утверждалось, что существуют исключения, при которых могут произойти все три.
Цилиндрическая органелла , состоящая из микротрубочек , присутствующая только у некоторых эукариот. Пара центриолей мигрирует и определяет два противоположных полюса делящейся клетки, где, как часть центросомы, они инициируют рост веретенообразного аппарата .
Специализированная последовательность ДНК внутри хромосомы, связывающая пару сестринских хроматид . Основная функция центромеры — служить местом сборки кинетохор, белковых комплексов, которые направляют прикрепление волокон веретена к центромере и облегчают сегрегацию хроматид во время митоза или мейоза .
центромерный индекс
Доля общей длины хромосомы, охватываемая ее коротким плечом , обычно выражается в процентах; например, хромосома с центромерным индексом 15 является акроцентрической, с коротким плечом, составляющим только 15% ее общей длины. [4]
Тип трансмембранного белка , форма которого образует водную пору в мембране , позволяющую проходить определенным растворенным веществам, часто небольшим ионам, через мембрану в одном или обоих направлениях. [6]
Набор аксиом, которые утверждают, что в ДНК любой хромосомы, вида или организма общее количество остатков аденина ( А ) будет примерно равно общему количеству остатков тимина ( Т ) и количеству гуанина ( G ) остатков будет равно числу остатков цитозина ( C ); соответственно, общее количество пуринов ( А + G ) будет равно общему количеству пиримидинов ( Т + С ). Эти наблюдения иллюстрируют весьма специфическую природу комплементарного спаривания оснований, которое происходит во всех дуплексных молекулах ДНК: хотя нестандартные спаривания технически возможны, они исключительно редки, поскольку в большинстве условий предпочтение отдается стандартным. Тем не менее, эквивалентность 1:1 редко бывает точной, поскольку в любой момент времени соотношения нуклеиновых оснований неизбежно искажаются в некоторой небольшой степени из-за неустраненных несоответствий , отсутствующих оснований и неканонических оснований. Присутствие одноцепочечных полимеров ДНК также меняет пропорции, поскольку последовательность отдельной цепи может содержать любое количество любых оснований.
заряженная тРНК
Транспортная РНК , к которой присоединена аминокислота; т.е. аминоацилированную тРНК. В незаряженных тРНК отсутствуют аминокислоты. [4]
Ненаправленное случайное изменение в движении молекулы, клетки или организма в ответ на химический стимул, например, изменение скорости в результате воздействия определенного химического соединения.
Направленное, неслучайное изменение в движении молекулы, клетки или организма в ответ на химический стимул, например, в сторону или от области с высокой концентрацией определенного химического соединения. [6]
Крестообразное соединение, которое образует физическую точку контакта между двумя несестринскими хроматидами, принадлежащими гомологичным хромосомам, во время синапса . Помимо обеспечения правильного разделения хромосом, эти соединения также являются точками разрыва, в которых может произойти хромосомный кроссинговер во время митоза или мейоза , что приводит к взаимному обмену ДНК между синапсированными хроматидами.
Наличие двух и более популяций клеток с различными генотипами в отдельном организме, известном как химера , развившаяся в результате слияния клеток, происходящих из отдельных зигот ; каждая популяция клеток сохраняет свой собственный геном, так что организм в целом представляет собой смесь генетически неидентичных тканей. Генетический химеризм может передаваться по наследству (например, при слиянии нескольких эмбрионов во время беременности) или приобретаться после рождения (например, при аллогенной трансплантации клеток, тканей или органов от генетически неидентичного донора); у растений это может быть результатом прививки или ошибок деления клеток. Он похож на мозаицизм , но отличается от него .
Набор молекул ДНК, содержащихся в хлоропластах, типе фотосинтетических пластидных органелл , расположенных внутри клеток некоторых эукариот, таких как растения и водоросли, представляющих собой полуавтономный геном, отдельный от генома внутри ядра клетки. Как и другие типы пластидной ДНК, хпДНК обычно существует в форме небольших кольцевых плазмид .
Одна копия вновь скопированной хромосомы, которая соединена с исходной хромосомой центромерой. Парные копии одной и той же отдельной хромосомы известны как сестринские хроматиды .
Комплекс ДНК, РНК и белка , обнаруженный в эукариотических клетках и являющийся основным веществом, составляющим хромосомы. Хроматин действует как средство упаковки очень длинных молекул ДНК в высокоорганизованные и плотно сжатые формы, что предотвращает запутывание нитей, укрепляет ДНК во время деления клеток, помогает предотвратить повреждение ДНК и играет важную роль в регуляции экспрессии генов и Репликация ДНК.
Центральная аморфная масса политенных хромосом , обнаруженная в ядрах клеток слюнных желез личинок дрозофилы и возникающая в результате слияния гетерохроматических участков, окружающих центромеры соматически парных хромосом, с расходящимися наружу дистальными эухроматическими плечами. [4]
Область хромосомы, которая была локально уплотнена или свернута в хроматин, заметная под микроскопом как «бусинка», узел или темная полоса, особенно по сравнению с близлежащими неуплотненными цепочками ДНК.
Молекула ядерной ДНК, содержащая часть или весь генетический материал организма. Хромосомы можно рассматривать как своего рода молекулярную «упаковку» для переноса ДНК внутри ядра клетки . У большинства эукариот они состоят из длинных нитей ДНК, свернутых упаковочными белками, которые связываются и конденсируют нити, чтобы предотвратить их превращение в неуправляемую структуру. запутывать. Хромосомы легче всего различать и изучать в их полностью конденсированных формах, возникающих только при делении клеток. Некоторые простые организмы имеют только одну хромосому, состоящую из кольцевой ДНК, тогда как у большинства эукариот есть несколько хромосом, состоящих из линейной ДНК.
конденсация хромосом
Процесс, при котором эукариотические хромосомы становятся короче, толще, плотнее и более заметными под микроскопом во время профазы из-за системного скручивания и суперспирализации хроматических нитей ДНК при подготовке к делению клетки .
Процесс, при котором сестринские хроматиды или парные гомологичные хромосомы отделяются друг от друга и мигрируют к противоположным сторонам делящейся клетки во время митоза или мейоза .
Тонкий, нитевидный, ограниченный мембраной выступ, отходящий от поверхности эукариотической клетки, длиннее микроворсинки , но короче жгутика. Большинство эукариотических клеток имеют по крайней мере одну первичную ресничку , выполняющую сенсорные или сигнальные функции; некоторые клетки используют тысячи подвижных ресничек , покрывающих всю их поверхность, чтобы обеспечить передвижение или переместить внеклеточный материал мимо клетки.
кольцевая ДНК
Любая молекула ДНК, одноцепочечная или двухцепочечная, образующая непрерывную замкнутую петлю без концов; например, бактериальные хромосомы , митохондриальная и пластидная ДНК , а также многие другие разновидности внехромосомной ДНК, включая плазмиды и некоторые вирусные ДНК. Контрастная линейная ДНК .
Любые фрагменты внеклеточной ДНК, полученные из опухолевых клеток, свободно циркулирующие в кровотоке.
цис
На той же стороне; прилегающий к; действующий от одной и той же молекулы. Контрастный транс .
цис -действующий
Воздействие на ген или последовательность той же молекулы нуклеиновой кислоты. Локус или последовательность внутри конкретной молекулы ДНК, такой как хромосома, называется цис -действующей, если она влияет или действует на другие последовательности, расположенные на коротких расстояниях (т.е. физически поблизости, обычно, но не обязательно ниже по ходу транскрипции) на той же молекуле или хромосоме; или, в самом широком смысле, если он влияет или действует на другие последовательности, расположенные где угодно (не обязательно на небольшом расстоянии) на той же хромосоме гомологичной пары. Цис -действующие факторы часто участвуют в регуляции экспрессии генов, ингибируя или облегчая транскрипцию . Противопоставление трансакции .
цис -доминантная мутация
Мутация , происходящая внутри цис-регуляторного элемента (например, оператора ), которая изменяет функционирование близлежащего гена или генов на той же хромосоме. Цис -доминантные мутации влияют на экспрессию генов, поскольку они происходят в сайтах, контролирующих транскрипцию, а не внутри самих генов.
Любой из класса уплощенных, связанных с мембраной везикул или мешочков гладкой и шероховатой эндоплазматической сети и аппарата Гольджи. Проходя через одну или несколько цистерн, каждая из которых содержит отдельный набор ферментов, вновь созданные белки и полисахариды подвергаются химическим модификациям, таким как фосфорилирование и гликозилирование, которые используются в качестве упаковочных сигналов для направления их транспорта в определенные пункты назначения внутри клетки. [14]
Раздел генетики, основанный исключительно на наблюдении видимых результатов репродуктивных действий, в отличие от того, что стало возможным благодаря современным методам и методам молекулярной биологии . Сравните молекулярную генетику .
Процесс производства естественным или искусственным путем отдельных организмов или клеток, генетически идентичных друг другу. Клоны являются результатом всех форм бесполого размножения , а клетки, подвергающиеся митозу , производят дочерние клетки, которые являются клонами родительской клетки и друг друга. Клонирование может также относиться к биотехнологическим методам, которые искусственно создают копии организмов или клеток или, при молекулярном клонировании , копии фрагментов ДНК или других молекул.
Также смысловая цепь , положительная (+) смысловая цепь и нешаблонная цепь .
Цепь двухцепочечной молекулы ДНК, нуклеотидная последовательность которой непосредственно соответствует последовательности транскрипта РНК, образующегося в ходе транскрипции (за исключением того, что в молекуле РНК тиминовые основания заменены на урациловые основания). Хотя она сама не транскрибируется, кодирующая цепь по соглашению является цепью, используемой при отображении последовательности ДНК из-за прямой аналогии между ее последовательностью и кодонами продукта РНК. Контрастная шаблонная прядь ; см. также смысл .
Ряд из трех последовательных нуклеотидов в кодирующей области последовательности нуклеиновой кислоты . Каждый из этих триплетов кодирует определенную аминокислоту или сигнал остановки во время синтеза белка . Молекулы ДНК и РНК записываются на языке с использованием четырех «букв» (четырех разных азотистых оснований ), но язык, используемый для построения белков, включает 20 «букв» (20 различных аминокислот). Кодоны предоставляют ключ, который позволяет этим двум языкам переводиться друг в друга. В общем, каждый кодон соответствует одной аминокислоте (или стоп-сигналу). Полный набор кодонов называется генетическим кодом.
Предпочтительное использование определенного кодона для кодирования определенной аминокислоты, а не альтернативных кодонов, которые являются синонимами одной и той же аминокислоты, о чем свидетельствуют различия между организмами в частотах синонимичных кодонов, встречающихся в их кодирующей ДНК. Поскольку генетический код вырожден, большинство аминокислот могут кодироваться несколькими кодонами. Тем не менее, некоторые кодоны имеют тенденцию быть перепредставленными (а другие недостаточно) у разных видов.
Многоядерная масса цитоплазмы, ограниченная клеточной стенкой и возникающая в результате непрерывного роста цитоплазмы и повторного деления ядер без цитокинеза, обнаруженная у некоторых видов водорослей и грибов, например Vaucheria и Physarum . [11]
Относительно небольшая независимая молекула, которая связывается со специфическим ферментом и участвует в реакции, которую катализирует фермент, часто образуя ковалентную связь с субстратом . Примеры включают биотин , НАД + и кофермент А. [6]
Свойство биополимеров нуклеиновых кислот , при котором две полимерные цепи или « нити », выровненные антипараллельно друг другу, имеют тенденцию образовывать пары оснований, состоящие из водородных связей между отдельными азотистыми основаниями , составляющими каждую цепь, причем каждый тип нуклеиновых оснований спаривается почти исключительно с одним другим типом нуклеиновых оснований. nucleobase; например, в двухцепочечных молекулах ДНК пары A соединяются только с T , а пары C - только с G. Пряди, спаренные таким образом, и сами основания называются комплементарными . Степень комплементарности между двумя цепями сильно влияет на стабильность дуплексной молекулы; определенные последовательности также могут быть внутренне комплементарными, что может привести к связыванию одной цепи самой с собой . Комплементарность имеет основополагающее значение для механизмов, управляющих репликацией, транскрипцией и репарацией ДНК.
ДНК, которая синтезируется из матрицы одноцепочечной РНК (обычно мРНК или микроРНК ) в реакции, катализируемой ферментом обратной транскриптазой . кДНК производится как естественным путем с помощью ретровирусов , так и искусственно с помощью определенных лабораторных методов, в частности молекулярного клонирования . В биоинформатике этот термин также может использоваться для обозначения последовательности транскрипта мРНК, выраженной в виде аналога его кодирующей цепи ДНК (т.е. с заменой урацила тимином ).
Рассчитанный порядок наиболее частых остатков ( нуклеотидов или аминокислот), обнаруженных в каждом положении при общем выравнивании последовательностей и полученный путем сравнения нескольких близкородственных выравниваний последовательностей.
консервативная репликация
Гипотетический способ репликации ДНК , при котором две родительские цепи исходной двухцепочечной молекулы ДНК в конечном итоге остаются комплементарными друг другу в конце процесса репликации, а две дочерние цепи в конечном итоге образуют свою собственную отдельную молекулу; следовательно, одна молекула состоит из обеих исходных цепей, а другая полностью состоит из вновь синтезированных цепей. В этом отличие от полуконсервативной репликации , при которой каждая молекула представляет собой гибрид одной старой и одной новой цепи. См. также дисперсионную репликацию .
Последовательность нуклеиновой кислоты или белка , которая очень похожа или идентична у многих видов или внутри генома, что указывает на то, что она оставалась относительно неизменной на протяжении длительного периода эволюции.
сородичей
Принадлежность к одному и тому же виду.
конститутивное выражение
1. Непрерывная транскрипция гена в отличие от факультативной экспрессии, при которой ген транскрибируется только по мере необходимости. Ген, который транскрибируется непрерывно, называется конститутивным геном .
2. Ген, экспрессия которого зависит только от эффективности его промотора в связывании РНК-полимеразы [4] , а не от каких-либо факторов транскрипции или других регуляторных элементов, которые могут способствовать или ингибировать его транскрипцию.
Явление, при котором участки генома повторяются, а количество повторов варьируется у разных особей в популяции, обычно в результате событий дупликации или делеции, которые затрагивают целые гены или участки хромосом. Вариации числа копий играют важную роль в создании генетических вариаций внутри популяции.
корегулятор
Белок, который работает вместе с одним или несколькими факторами транскрипции , регулируя экспрессию генов.
Последовательность ДНК, в которой за нуклеотидом цитозина сразу следует нуклеотид гуанина на той же цепи в направлении от 5'-к-3'; «p» в CpG относится просто к промежуточной фосфатной группе, соединяющей два последовательных нуклеотида.
Аномальная химическая связь между двумя или более нуклеиновыми основаниями на противоположных цепях двухцепочечной молекулы ДНК ( межцепочечная ) или между основаниями на одной и той же цепи ( внутрицепочечная ), в частности, посредством образования ковалентных связей , которые более прочны, чем водородные связи оснований. спаривание. Сшивки могут создаваться различными экзогенными и эндогенными агентами и иметь тенденцию мешать нормальным клеточным процессам, таким как репликация и транскрипция ДНК . Они являются общими мишенями путей репарации ДНК.
Конец линейной цепи аминокислот (т.е. пептида ), который заканчивается свободной карбоксильной группой ( -COOH ) последней аминокислоты, которая будет добавлена к цепи во время трансляции . Эту аминокислоту называют С-концевой . По соглашению, последовательности, домены, активные сайты или любая другая структура, расположенная ближе к С-концу полипептида или свернутого белка , который он образует, относительно других, описываются как расположенные ниже. Контрастный N-конец .
Общее количество ДНК, содержащееся в гаплоидном ядре (например, гамете) конкретного организма или вида, выраженное в количестве пар оснований или в единицах массы (обычно пикограммах ); или, что эквивалентно, половина количества в диплоидной соматической клетке . Для простых диплоидных эукариот этот термин часто используется как синоним размера генома, но в некоторых случаях, например, в гибридных полиплоидах , произошедших от родителей разных видов, значение C может фактически обозначать два или более различных генома, содержащихся в одном ядре. Значения C применимы только к геномной ДНК и, в частности, исключают внеядерную ДНК.
Термин, используемый для описания разнообразных вопросов, касающихся огромных различий в значении ядерного C или размера генома среди видов эукариот, в частности наблюдения о том, что размер генома не коррелирует с воспринимаемой сложностью организмов и не обязательно с количеством генов. они обладают; например, геномы многих одноклеточных протистов содержат в тысячи раз больше ДНК, чем геном человека . Это считалось парадоксальным до тех пор, пока не было обнаружено, что геномы эукариот состоят в основном из некодирующей ДНК , в которой полностью отсутствуют гены. С тех пор фокус загадки сместился на понимание того, почему и как геномы оказались заполнены таким большим количеством некодирующей ДНК и почему некоторые геномы имеют более высокое содержание генов, чем другие.
Один из четырех стандартных нуклеозидов , используемых в молекулах РНК , состоящий из цитозинового основания, азот N 9 которого связан с углеродом C 1 сахара рибозы . Цитозин, связанный с дезоксирибозой, известен как дезоксицитидин, который является версией, используемой в ДНК.
The branch of cell biology involving the detection and identification of the various structures and components within cells by means of biochemical analysis and visualization, in particular the localization of cellular constituents by using techniques such as chemical staining and immunostaining, spectrophotometry and spectroscopy, radioautography, and electron microscopy.
The final stage of cell division in both mitosis and meiosis, usually immediately following the division of the nucleus, during which the cytoplasm of the parent cell is cleaved and divided approximately evenly between two daughter cells. In animal cells, this process occurs by the closing of a microfilament contractile ring in the equatorial region of the dividing cell. Contrast karyokinesis.
The study of the morphology, processes, and life history of living cells, particularly by means of light and electron microscopy.[11] The term is also sometimes used as a synonym for the broader field of cell biology.
The interdisciplinary field that studies cell biology, cytology, and biochemistry at the level of an individual cell by making use of single-cell molecular techniques and advanced microscopy to visualize the interactions of cellular components in vivo.[15]
The flow of the cytoplasm inside a cell, driven by forces exerted upon cytoplasmic fluids by the cytoskeleton. This flow functions partly to speed up the transport of molecules and organelles suspended in the cytoplasm to different parts of the cell, which would otherwise have to rely on passive diffusion for movement. It is most commonly observed in very large eukaryotic cells, for which there is a greater need for transport efficiency.
An enucleated eukaryotic cell; or all other cellular components besides the nucleus (i.e. the cell membrane, cytoplasm, organelles, etc.) considered collectively. The term is most often used in the context of nuclear transfer experiments, during which the cytoplast can sometimes remain viable in the absence of a nucleus for up to 48 hours.[16]
Пиримидиновое нуклеиновое основание , используемое в качестве одного из четырех стандартных нуклеиновых оснований как в молекулах ДНК, так и в РНК . Цитозин образует пару оснований с гуанином.
Спонтанная мутация в геноме отдельного организма, новая для линии этого организма, впервые появившаяся в зародышевой клетке одного из родителей организма или в оплодотворенной яйцеклетке, из которой развивается организм; т.е. мутация, которой не было в геноме ни одного из родителей. [4]
Сборка синтетической последовательности нуклеиновой кислоты из свободных нуклеотидов без использования существующей цепи-матрицы , т.е. de novo , с помощью любого из множества лабораторных методов. Синтез de novo теоретически позволяет создавать полностью искусственные молекулы без встречающихся в природе эквивалентов и без ограничений по размеру или последовательности. Это обычно выполняется при коммерческом производстве индивидуальных, изготовленных на заказ олигонуклеотидных последовательностей, таких как праймеры .
Избыточность генетического кода проявляется в множественности разных кодонов, определяющих одну и ту же аминокислоту. Например, в стандартном генетическом коде аминокислота серин определяется шестью уникальными кодонами ( UCA , UCG , UCC , UCU , AGU и AGC ). Вырожденность кодонов объясняет существование синонимичных мутаций .
Процесс, при котором нуклеиновые кислоты или белки теряют свою четвертичную , третичную и/или вторичную структуру обратимо или необратимо в результате воздействия какого-либо внешнего химического или механического воздействия, например, при нагревании, взбалтывании или воздействии сильной кислоты или основания. , все из которых могут разрушать межмолекулярные силы, такие как водородные связи , и тем самым изменять или разрушать химическую активность. Денатурированные белки могут быть как причиной, так и следствием гибели клеток. Денатурация также может быть нормальным процессом; Например, денатурация двухцепочечных молекул ДНК, которая разрывает водородные связи между парами оснований и вызывает разделение дуплексной молекулы на две одиночные цепи , является необходимым этапом репликации и транскрипции ДНК и, следовательно, обычно выполняется такими ферментами, как as helicases. Тот же механизм является фундаментальным для лабораторных методов, таких как ПЦР .
Один из четырех стандартных дезоксирибонуклеозидов, используемых в молекулах ДНК, состоящий из аденинового основания с азотом N 9 , связанным с углеродом C 1 сахара дезоксирибозы. Аденин, связанный с рибозой , образует альтернативное соединение, известное просто как аденозин, которое используется в РНК .
Один из четырех стандартных дезоксирибонуклеозидов, используемых в молекулах ДНК, состоящий из цитозинового основания с азотом N 9 , связанным с углеродом C 1 сахара дезоксирибозы. Цитозин, связанный с рибозой , образует альтернативное соединение, известное просто как цитидин, которое используется в РНК .
Один из четырех стандартных дезоксирибонуклеозидов, используемых в молекулах ДНК, состоящий из гуанинового основания с азотом N 9 , связанным с углеродом C 1 сахара дезоксирибозы. Гуанин, связанный с рибозой , образует альтернативное соединение, известное просто как гуанозин, которое используется в РНК .
Любой из класса нуклеазных ферментов, которые катализируют гидролитическое расщепление фосфодиэфирных связей в молекулах ДНК, тем самым разрывая цепи дезоксирибонуклеотидов и вызывая распад полимеров ДНК на более мелкие компоненты. Сравните рибонуклеазы .
Полимерная молекула нуклеиновой кислоты , состоящая из ряда дезоксирибонуклеотидов, каждый из которых включает одно из четырех канонических азотистых оснований : аденин ( А ), гуанин ( G ), цитозин ( С ) и тимин ( Т ). ДНК чаще всего встречается в двухцепочечной форме, которая состоит из двух комплементарных антипараллельных нуклеотидных цепей, в которых каждое из нуклеиновых оснований на каждой отдельной цепи спарено посредством водородных связей с одним на противоположной цепи; эта структура обычно имеет форму двойной спирали. ДНК может существовать и в одноцепочечной форме. Храня и кодируя генетическую информацию в последовательности своих нуклеотидов, ДНК служит универсальной молекулярной основой биологического наследования и фундаментальной матрицей, на основе которой строятся все белки, клетки и живые организмы.
Нуклеотид , содержащий дезоксирибозу в качестве компонента пентозного сахара и мономерную субъединицу молекул дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Дезоксирибонуклеотиды канонически включают любое из четырех азотистых оснований : аденин ( А ), гуанин ( G ), цитозин ( С ) и тимин ( Т ). Сравните рибонуклеотид .
Моносахаридный сахар, полученный из рибозы путем потери одного атома кислорода. D-дезоксирибоза в форме пентозного кольца является одной из трех основных функциональных групп дезоксирибонуклеотидов и, следовательно, молекул дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК).
Дезоксирибоза отличается от рибозы только 2'-углеродом, где у рибозы есть атом кислорода, которого нет у дезоксирибозы (отсюда и ее название).
Специализированный клеточный контакт между соседними эпителиальными клетками, в котором клетки удерживаются вместе сетью кератиновых нитей и структурных белков, перекрывающих разрыв между плазматическим мембранами. [17]
вектор назначения
десинапсис
Неспособность гомологичных хромосом, которые нормально синапсировали во время пахинемы , оставаться парными во время диплонемы. Десинапсис обычно возникает из-за неправильного формирования хиазм. [4] Контрастная асинапсис .
В мейозе — пятая и последняя подстадия профазы I , следующая за диплонемой и предшествующая метафазе I. В ходе диакинеза хромосомы еще больше конденсируются, две центросомы достигают противоположных полюсов клетки, и веретенообразный аппарат начинает простираться от полюсов к экватору. [4]
дицентрик
(линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Наличие двух центромер вместо нормальной. [2]
Мейоз — четвёртая из пяти подстадий профазы I , следующая за пахинемой и предшествующей диакинезу. При диплонеме синаптонемный комплекс распадается, и парные гомологичные хромосомы начинают отделяться друг от друга, хотя они остаются прочно связанными в хиазмах, где произошел кроссинговер.
Любые два или более повторения определенной последовательности нуклеотидов , встречающиеся в одной и той же ориентации (т.е. точно в том же порядке и не перевернутые) и на одной и той же цепи , разделенные промежуточными нуклеотидами или нет. Примером может служить последовательность TACCG nnnnnn TACCG , в которой TACCG встречается дважды, хотя и разделена шестью нуклеотидами, не являющимися частью повторяющейся последовательности. Прямой повтор, в котором повторения непосредственно примыкают друг к другу, известен как тандемный повтор .
Химическая ориентация «конец-в-конец» одной линейной цепи или последовательности полимера нуклеиновой кислоты или полипептида . Номенклатура, используемая для указания направленности нуклеиновой кислоты, основана на химическом соглашении идентификации отдельных атомов углерода в рибозных или дезоксирибозных сахарах нуклеотидов, в частности, 5'-углерода и 3'-углерода пентозного кольца. Последовательность нуклеотидов в полимерной цепи можно читать или интерпретировать в направлении от 5'-к 3', т.е. начиная с концевого нуклеотида, в котором 5'-углерод не связан с другим нуклеотидом, и переходя к другому концевому нуклеотиду. , в котором 3'-углерод не связан с другим нуклеотидом - или в противоположном направлении от 3' к 5'. Большинство типов синтеза нуклеиновых кислот, включая репликацию и транскрипцию ДНК , работают исключительно в направлении 5'-к-3', поскольку участвующие ферменты могут катализировать только добавление свободных нуклеотидов к открытому 3'-концу предыдущего нуклеотида. цепь. По этой причине при написании любой последовательности нуклеиновой кислоты принято представлять ее в направлении 5'-к-3' слева направо. В двухцепочечных нуклеиновых кислотах две парные цепи должны быть ориентированы в противоположных направлениях, чтобы образовать пару оснований друг с другом. Направленность полипептидов аналогичным образом основана на маркировке функциональных групп аминокислот, в частности аминогруппы, образующей N-конец , и карбоксильной группы, образующей С-конец; Аминокислотные последовательности во время трансляции собираются в направлении от N к C и почти всегда записываются в одном и том же направлении.
Любой экзергонический процесс микробного катаболизма, при котором окислительно -восстановительные химические соединения участвуют в окислительно-восстановительных реакциях (обмене электронами), обеспечивая клетку энергией, необходимой для поддержания метаболической активности. Внешние вещества поглощаются клеткой из окружающей среды, а затем разлагаются с выделением энергии, а побочные продукты впоследствии выводятся из клетки. Это контрастирует с ассимиляционным процессом, при котором атомы внешних веществ повторно используются в синтезе биомолекул или производстве клеточных компонентов.
мера расстояния
Любая величина, используемая для измерения различий между уровнями экспрессии разных генов. [18]
Метод таксономической идентификации, при котором короткие последовательности ДНК одного или нескольких специфических генов выделяют из неидентифицированных образцов и затем сравнивают с последовательностями из справочной библиотеки, чтобы однозначно идентифицировать вид или другой таксон, из которого произошли образцы. Последовательности, используемые для сравнения, тщательно выбираются из генов, которые широко консервативны и демонстрируют большую изменчивость между видами, чем внутри вида, например, ген цитохром-с-оксидазы для эукариот или определенные гены рибосомальной РНК для прокариот. Эти гены присутствуют почти во всех живых организмах, но имеют тенденцию вызывать различные мутации у разных видов, так что уникальный вариант последовательности может быть связан с одним конкретным видом, эффективно создавая уникальный идентификатор, аналогичный розничному штрих-коду . Штрих-кодирование ДНК позволяет идентифицировать неизвестные образцы из неразличимых в противном случае тканей или частей тела, где идентификация по морфологии была бы трудной или невозможной, а библиотека штрих-кодов организмов в настоящее время достаточно обширна, чтобы даже организмы, ранее неизвестные науке, часто можно с уверенностью классифицировать филогенетически . . Одновременная идентификация нескольких разных видов из смешанной выборки известна как метабаркодирование .
Высокопроизводительная технология, используемая для измерения уровней экспрессии транскриптов мРНК или обнаружения определенных изменений в нуклеотидной последовательности . Он состоит из множества тысяч микроскопических пятен олигонуклеотидов ДНК , называемых признаками , каждое из которых содержит пикомоли определенной последовательности ДНК. Это может быть короткий участок гена или любой другой элемент ДНК, который используется в качестве зонда для гибридизации образца кДНК, кРНК или геномной ДНК (называемого мишенью ) в условиях высокой строгости . Гибридизацию зонда-мишени обычно выявляют и количественно определяют путем флуоресцентного обнаружения мишеней, меченных флуорофором.
Любой из класса ферментов, синтезирующих молекулы ДНК из отдельных дезоксирибонуклеотидов. ДНК-полимеразы необходимы для репликации ДНК и обычно работают парами, создавая идентичные копии двух цепей исходной двухцепочечной молекулы. Они строят длинные цепи ДНК, добавляя нуклеотиды по одному к 3'-концу цепи ДНК, обычно полагаясь на матрицу, обеспечиваемую комплементарной цепью, для точного копирования нуклеотидной последовательности.
Набор процессов, с помощью которых клетка идентифицирует и исправляет структурные повреждения или мутации в молекулах ДНК, кодирующих ее геном. Способность клетки восстанавливать свою ДНК жизненно важна для целостности генома и нормального функционирования организма.
Процесс определения с помощью любого из множества различных методов и технологий порядка оснований в длинной цепи нуклеотидов, составляющей последовательность ДНК .
оборот ДНК
Любой механизм, с помощью которого последовательности ДНК заменяются невзаимно (например, посредством конверсии генов, транспозиции или неравного кроссинговера ), который вызывает постоянные колебания числа копий мотивов ДНК в течение жизни организма. Такие механизмы часто являются основными движущими силами видообразования между популяциями. [16]
Любой полипептид или белок , содержащий один или несколько доменов, способных химически взаимодействовать с одной или несколькими частями молекулы ДНК и, следовательно, обладающих специфическим или общим сродством к одно- и/или двухцепочечной ДНК. ДНК-связывающая активность часто зависит от присутствия и физической доступности определенной последовательности нуклеиновых оснований и в основном возникает в большой бороздке , поскольку она обнажает больше функциональных групп, которые однозначно идентифицируют основания. На связывание также влияют пространственная конформация цепи ДНК и присутствие других белков рядом с местом связывания; многие белки не могут связываться с ДНК, не претерпев предварительно структурных изменений, вызванных взаимодействием с другими молекулами.
Любой механизм, с помощью которого организмы нейтрализуют большую разницу в дозах генов, вызванную наличием разного количества половых хромосом у разных полов, тем самым уравнивая экспрессию сцепленных с полом генов, так что представители каждого пола получают одинаковое или одинаковое количество половых хромосом. продукты таких генов. Примером является Х-инактивация у самок млекопитающих.
Форма, которую чаще всего принимают двухцепочечные молекулы нуклеиновой кислоты , напоминающая лестницу, закрученную на своей длинной оси, со ступенями лестницы, состоящими из парных нуклеиновых оснований . Эта вторичная структура представляет собой наиболее энергетически стабильную конформацию двухцепочечных форм как ДНК, так и РНК в большинстве естественных условий, возникающую вследствие первичной структуры фосфодиэфирного остова и укладки связанных с ним нуклеотидов . В B-ДНК, наиболее распространенном варианте ДНК, встречающемся в природе, двойная спираль имеет правостороннее закручивание примерно с 10 парами оснований на полный оборот, а молекулярная геометрия приводит к чередующемуся рисунку «бороздок» разной ширины (рис. большая бороздка и малая бороздка ) между параллельными основами.
Двухцепочечная ДНК чаще всего имеет форму двойной спирали .
Потеря непрерывности фосфатно-сахарного остова в обеих цепях двухцепочечной молекулы ДНК, особенно когда два разрыва происходят в участках, которые расположены непосредственно напротив друг друга или очень близко друг к другу на комплементарных цепях. [16] Контрастный однонитевой разрыв .
двухцепочечный
Состоит из двух антипараллельных комплементарных молекул или цепей нуклеиновой кислоты (либо ДНК-ДНК, РНК-РНК или гибрида ДНК-РНК), которые удерживаются вместе за счет водородных связей между комплементарными азотистыми основаниями каждой цепи, что известно как спаривание оснований. Сравните одноцепочечные .
Любая молекула ДНК, состоящая из двух антипараллельных комплементарных дезоксирибонуклеотидных полимеров, известных как нити , которые связаны друг с другом водородными связями между комплементарными азотистыми основаниями . Хотя ДНК может существовать в виде одной цепи , она, как правило, более стабильна и чаще встречается в двухцепочечной форме. В большинстве случаев комплементарная пара оснований заставляет двойные нити скручиваться друг вокруг друга в форме двойной спирали.
Любая молекула РНК , состоящая из двух антипараллельных комплементарных рибонуклеотидных полимеров, известных как нити , которые связаны друг с другом водородными связями между комплементарными азотистыми основаниями . Хотя РНК обычно встречается в одноцепочечной форме , она также способна образовывать дуплексы так же, как ДНК; примером является спаривание транскрипта мРНК с антисмысловой версией того же транскрипта, которое эффективно подавляет ген, из которого была транскрибирована мРНК, путем предотвращения трансляции. Как и в дцДНК, спаривание оснований в дцРНК обычно приводит к тому, что двойные нити скручиваются друг вокруг друга в форме двойной спирали.
понижающее регулирование
Также репрессии или подавления .
Любой процесс, естественный или искусственный, который снижает уровень экспрессии определенного гена. Ген, экспрессия которого наблюдается на относительно низких уровнях (например, путем обнаружения более низких уровней его транскриптов мРНК ) в одном образце по сравнению с другим образцом, считается подавленным . Повышение контрастности .
ниже по течению
Ближе к 3'-концу цепи нуклеотидов или к С-концу пептидной цепи . Контраст вверх по течению .
дцДНК
См. двухцепочечную ДНК .
дсРНК
См. двухцепочечную РНК .
дуплекс
См. двухцепочечный .
дублирование
Производство второй копии части или всей нуклеотидной последовательности или аминокислотной последовательности естественным или искусственным путем и сохранение обеих копий; особенно когда и копия, и исходная последовательность сохраняются in situ внутри одной и той же молекулы, часто, но не обязательно, рядом друг с другом. См. также дупликацию гена , хромосомную дупликацию и повтор .
Изменение роста, поведения или организации клеток внутри ткани или наличие клеток аномального типа, приводящие к нарушению состояния ткани [6] — событие, которое часто предшествует развитию рака ; аномальный рост или развитие ткани или органа.
Молекула, выходящая на поверхность клетки, которая эффективно маркирует клетку для фагоцитоза, побуждая фагоциты поглощать или «съедать» ее. Присутствие окисленных фосфолипидов или фосфатидилсерина или отсутствие сиаловой кислоты в гликопротеинах или гликолипидах клеточной поверхности обычно используются в качестве сигналов «съешь меня» в определенных типах клеток. См. также сигнал «найди меня» .
Метод молекулярной биологии, при котором сильное электрическое поле применяется к живым клеткам с целью временного увеличения проницаемости их клеточных мембран, позволяя экзогенным нуклеиновым кислотам, белкам или химическим соединениям легко проходить через мембрану и тем самым проникать в клетки. Это распространенный метод трансформации и трансфекции .
Любой процесс, посредством которого вещество активно поглощается клеткой или попадает внутрь клетки, пересекая плазматическую мембрану из внеклеточного пространства во внутриклеточное пространство, включая подклассы пиноцитоза , фагоцитоза и различных рецептор-опосредованных процессов. Все они обычно включают окружение внеклеточной молекулы, белка или даже другой клетки или организма с расширением или впячиванием клеточной мембраны, которая затем «отпочковывается» или отделяется от остальной части мембраны на цитоплазматической стороне, образуя мембрану. -закрытый везикула , содержащая проглоченные материалы. Благодаря этому механизму материал может пересекать липидный бислой, не подвергаясь воздействию гидрофобного пространства между ними, вместо этого оставаясь во взвешенном состоянии в жидкости внеклеточного пространства. Эндоцитоз — это способ, с помощью которого в клетку транспортируются многие крупные полярные макромолекулы, которые не могут просто диффундировать через мембрану, такие как метаболиты и гормоны. Его отличают от альтернативных путей, таких как прохождение через белковые каналы или сопровождение транспортных белков . Обратный процесс называется экзоцитозом.
Любая мембрана , окружающая внутриклеточную органеллу или везикулу , например мембрану эндоплазматического ретикулума, аппарата Гольджи, лизосому, вакуоль , ядро ( ядерную оболочку ) и т. д. [11]
Любой фермент, активность которого заключается в расщеплении фосфодиэфирных связей внутри цепи нуклеотидов , включая те, которые расщепляют относительно неспецифично (без учета последовательности ), и те, которые расщепляют только очень специфические последовательности (так называемые эндонуклеазы рестрикции ). Когда требуется распознавание определенной последовательности, эндонуклеазы разрезают ее в середине последовательности. Контрастная экзонуклеаза .
Подкласс длинных некодирующих РНК, транскрибируемых с участков ДНК, содержащих энхансерные последовательности. Экспрессия данной еРНК обычно коррелирует с активностью соответствующего энхансера в усилении транскрипции его генов-мишеней, указывая тем самым, что еРНК играют активную роль в регуляции генов в цис- или транс -гене .
энуклеировать
Искусственное удаление ядра из клетки, например, с помощью микроманипуляций в лаборатории или путем разрушения его путем облучения ультрафиолетовым светом, в результате чего клетка становится безъядерной. [11]
1. Другое название плазмиды , особенно той, которая способна интегрироваться в хромосому.
2. У эукариот — любая неинтегрированная внехромосомная кольцевая молекула ДНК, которая стабильно поддерживается и реплицируется в ядре одновременно с остальной частью клетки-хозяина. Такие молекулы могут включать вирусные геномы, бактериальные плазмиды и аберрантные хромосомные фрагменты.
Коллективное действие нескольких генов, взаимодействующих во время экспрессии генов. Эпистаз, форма действия генов, может быть аддитивным или мультипликативным по своему влиянию на определенные фенотипические признаки .
Относительно открытая, слегка уплотненная форма хроматина, в которой ДНК лишь спорадически связывается с нуклеосомами и, таким образом, широко доступна для связывания и манипуляций со стороны белков и других молекул. Эухроматиновые области генома часто обогащены генами и активно подвергаются транскрипции , в отличие от гетерохроматина, который относительно беден генами, богат нуклеосомами и менее доступен для транскрипционного аппарата.
Состояние клетки или организма, имеющего аномальное количество полных наборов хромосом, возможно, исключая половые хромосомы . Эуплоидия отличается от анеуплоидии, при которой клетка или организм имеет аномальное количество одной или нескольких конкретных отдельных хромосом.
Изменение наследственных характеристик биологических популяций на протяжении последующих поколений. В самом традиционном смысле это происходит путем изменения частот аллелей в генофонде популяции.
Ферментативное удаление полинуклеотидной последовательности из одной или нескольких цепей нуклеиновой кислоты или полипептидной последовательности из белка , обычно подразумевающее как разрыв полимерной молекулы в двух местах, так и последующее воссоединение двух точек разрыва после последовательности между их удалили. Этот термин можно использовать для описания широкого спектра процессов, выполняемых различными ферментами, включая большинство путей сплайсинга и репарации ДНК. [4]
Любой активный транспортный процесс, посредством которого вещество секретируется из клетки или выводится из нее, пересекая плазматическую мембрану изнутри клетки во внеклеточное пространство, особенно тот, который происходит путем слияния мембраны, окружающей секреторный пузырь , с более крупным клеточная мембрана. Это слияние приводит к слиянию внутривезикулярного пространства с внеклеточной жидкостью, высвобождая содержимое пузырька на внешнюю сторону клетки, не подвергая его воздействию гидрофобного пространства между липидным бислоем. В более узком смысле этот термин может относиться, в частности, к массовому транспорту большого количества молекул из клетки одновременно, часто метаболитов или гормонов, которые слишком велики и полярны, чтобы самостоятельно пассивно диффундировать через мембрану. Обратный процесс, при котором материалы внедряются в клетку, известен как эндоцитоз.
Любая часть гена, которая кодирует часть окончательной зрелой информационной РНК , продуцируемой этим геном после удаления интронов путем альтернативного сплайсинга. Этот термин относится как к последовательности, существующей внутри молекулы ДНК, так и к соответствующей последовательности в транскриптах РНК.
Любой фермент, активность которого заключается в расщеплении фосфодиэфирных связей внутри цепи нуклеотидов , включая те, которые расщепляются только при распознавании определенной последовательности (так называемые экзонуклеазы рестрикции ). Экзонуклеазы разрезают либо 3'-, либо 5'-конец последовательности (а не посередине, как у эндонуклеаз).
экзосома
1. ( белковый комплекс ) Внутриклеточный мультибелковый комплекс, который выполняет функцию расщепления различных типов молекул РНК .
2. ( везикула ) Тип мембраносвязанной внеклеточной везикулы, образующийся во многих эукариотических клетках путем отпочкования эндосомы внутрь и последующего слияния эндосомы с плазматической мембраной , вызывающий высвобождение везикулы в различные внеклеточные пространства, в том числе биологические. жидкости, такие как кровь и слюна, где они могут выполнять любую из самых разнообразных физиологических функций, от удаления отходов до межклеточной передачи сигналов.
Плазмидная карта вектора экспрессии размером 3756 п.н., используемого для экспрессии трансгена , вырабатывающего зеленый флуоресцентный белок (GFP). Вектор также включает ген lac- репрессора (lacI) и ген, придающий устойчивость к антибиотику канамицину (KanR), а также различные промоторы для управления экспрессией этих генов.
Любая часть аминокислотной последовательности, которая сохраняется в полипептиде -предшественнике , т.е. не вырезается в результате посттрансляционного сплайсинга белка и, следовательно, присутствует в зрелом белке , аналогично экзонам транскриптов РНК. Контрастный интеин .
расширение
См. удлинение .
внеклеточный
Вне плазматической мембраны клетки или клеток; т.е. расположены или происходят снаружи клетки. Контраст внутриклеточный ; см. также межклеточные .
Сеть взаимодействующих макромолекул и минералов, секретируемых и существующих снаружи и между клетками в многоклеточных структурах, таких как ткани и биопленки, образующая гидратированную, сетчатую, полутвердую суспензию, которая не только удерживает клетки вместе организованным образом, но и обеспечивает структурную и биохимическую поддержку, действуя как эластичный, сжимаемый буфер против внешних стрессов, а также регулируя и влияя на многочисленные аспекты поведения клеток, в том числе клеточную адгезию, подвижность , метаболизм , деление и межклеточную связь. Состав и свойства ЕСМ сильно различаются в зависимости от организма и типа ткани, но обычно он имеет форму полисахаридного геля, в который встроены различные волокнистые белки (особенно коллаген и эластин ), ферменты и гликопротеины. Сами клетки одновременно производят компоненты матрикса и постоянно реагируют на локальный состав матрикса, являющийся источником обратной связи с окружающей средой, которая имеет решающее значение для дифференцировки, организации тканей и развития. [11] [19]
Любая ДНК, которая не содержится в хромосомах или ядре клетки и, следовательно, не является геномной ДНК. Это может включать ДНК, содержащуюся в плазмидах или органеллах , таких как митохондрии или хлоропласты, или, в самом широком смысле, ДНК, введенную вирусной инфекцией . Внехромосомная ДНК обычно демонстрирует значительные структурные отличия от ядерной ДНК в том же организме.
Ф
факультативное выражение
Транскрипция гена только по мере необходимости, в отличие от конститутивной экспрессии, при которой ген транскрибируется непрерывно . Ген, который транскрибируется по мере необходимости, называется факультативным геном .
Молекула, выходящая на поверхность клетки, предназначенная для апоптоза, которая используется для привлечения фагоцитов для поглощения и уничтожения клетки путем фагоцитоза . См. также сигнал «Съешь меня» .
пятипростая кепка
См. крышку 5 футов .
Пять премий
Смотрите 5'-энд .
пятизначная непереведенная область
См. 5' нетранслируемую область .
фиксация
1. ( гистология ) Сохранение биологического материала путем обработки его химическим фиксатором, который предотвращает или замедляет естественные посмертные процессы распада (например, аутолиз и гниение ), которые в противном случае в конечном итоге привели бы к потере клеток, тканей и биомолекул их характерных структур и характеристики. Биологические образцы обычно фиксируются с широкой целью остановить или замедлить биохимические реакции на время, достаточное для их детального изучения, по сути, «замораживая» клеточные процессы в их естественном состоянии в определенный момент времени, сводя при этом к минимуму нарушение существующих структур и механизмов. все это может улучшить последующее окрашивание и микроскопию фиксированных образцов. Хотя фиксация имеет тенденцию необратимо прекращать любые текущие реакции, убивая тем самым фиксированные клетки, она позволяет получить информацию о молекулярных деталях, которые происходят слишком быстро или кратковременно, чтобы их можно было изучать на живых образцах. Обычные фиксаторы, такие как формальдегид, действуют путем отключения протеолитических ферментов, коагуляции и денатурации макромолекул, создания поперечных связей между ними и защиты образцов от разложения бактериями и грибками.
2. ( популяционная генетика ) Процесс, при котором частота одной аллели определенного гена с множеством различных аллелей увеличивается в данной популяции, так что она становится навсегда единственной аллелью в этом локусе в генофонде популяции.
Экспериментальный подход в молекулярной генетике , при котором исследователь начинает с конкретного известного фенотипа и пытается определить генетическую основу этого фенотипа с помощью любого из множества лабораторных методов, обычно путем индукции случайных мутаций в геноме организма и последующего скрининга изменений в геноме организма. интересующий фенотип. Предполагается, что наблюдаемые фенотипические изменения являются результатом мутации(й), присутствующих в проверенном образце, которые затем можно сопоставить с конкретными геномными локусами и, в конечном счете, с одним или несколькими конкретными генами-кандидатами. Эта методология контрастирует с обратной генетикой , в которой конкретным геном или его генным продуктом манипулируют индивидуально, чтобы определить функцию гена.
Тип мутации в последовательности нуклеиновой кислоты , вызванный вставкой или удалением ряда нуклеотидов , не кратного трем. Из-за триплетной природы, с помощью которой нуклеотиды кодируют аминокислоты, мутация такого типа вызывает сдвиг рамки считывания нуклеотидной последовательности, в результате чего последовательность кодонов после места мутации полностью отличается от исходной.
Организация, которая работает вместе с другими «над разработкой стандартов качества, аннотирования и обмена данными биологических исследований», а также программных инструментов, облегчающих их использование. [20]
Метод, используемый в цитогенетике для получения видимого кариотипа путем окрашивания конденсированных хромосом красителем Гимзы . Окрашивание создает последовательные и различимые узоры из темных и светлых «полос» в областях хроматина, что позволяет легко различать определенные хромосомы.
Гаплоидная клетка, представляющая собой мейотический продукт зародышевой клетки-предшественника и конечный продукт зародышевой линии у многоклеточных организмов , размножающихся половым путем . Гаметы — это средство, с помощью которого организм передает свою генетическую информацию потомству; при оплодотворении две гаметы (по одной от каждого родителя) сливаются в одну диплоидную зиготу .
Любой сегмент или набор сегментов молекулы нуклеиновой кислоты , который содержит информацию, необходимую для контролируемого производства функционального транскрипта РНК . В живых организмах гены часто считаются фундаментальными единицами наследственности и обычно закодированы в ДНК. Отдельный ген может иметь несколько разных версий или аллелей, и один ген может привести к образованию генного продукта, который влияет на множество различных фенотипов .
Количество копий определенного гена, присутствующего в геноме. Дозировка генов напрямую влияет на количество генного продукта, которое способна экспрессировать клетка, хотя появились различные средства контроля, которые жестко регулируют экспрессию генов. Изменения в дозировке генов, вызванные мутациями, включают изменения числа копий.
Набор процессов, с помощью которых информация, закодированная в гене, используется в синтезе генного продукта, такого как белок или некодирующая РНК , или иным образом становится доступной для воздействия на один или несколько фенотипов . Канонически первым шагом является транскрипция , в результате которой образуется молекула информационной РНК, комплементарная молекуле ДНК, в которой кодируется ген; для генов, кодирующих белок, вторым этапом является трансляция , при которой информационная РНК считывается рибосомой с образованием белка . Однако информация, содержащаяся в последовательности ДНК, не обязательно должна быть транскрибирована и транслирована, чтобы оказать влияние на молекулярные события; более широкие определения охватывают огромное количество других способов выражения генетической информации.
Объединение, либо путем естественной мутации, либо с помощью рекомбинантных лабораторных методов, двух или более ранее независимых генов, которые кодируют разные генные продукты, так что они становятся объектом контроля со стороны одних и тех же регуляторных систем. Полученная гибридная последовательность известна как слитый ген. [4]
Любой из множества методов, используемых для точного определения местоположения конкретного гена в молекуле ДНК (например, хромосомы) и/или физических расстояний или расстояний сцепления между ним и другими генами.
ген интереса (GOI)
Ген изучается в научном эксперименте, особенно в центре внимания метода генной инженерии, такой как клонирование .
Любой биохимический материал, образующийся в результате экспрессии гена, чаще всего интерпретируется как функциональный транскрипт мРНК , полученный в результате транскрипции гена, или полностью сконструированный белок , полученный в результате трансляции транскрипта, хотя некодирующие молекулы РНК, такие как транспортные РНК , могут также можно считать генными продуктами. Измерение количества данного генного продукта, обнаруживаемого в клетке или ткани, иногда используется для вывода о том, насколько активен соответствующий ген.
Широкий спектр механизмов, используемых клетками для контроля активности своих генов, особенно для разрешения, запрета, увеличения или уменьшения производства или экспрессии определенных генных продуктов, таких как РНК или белки . Генная регуляция повышает универсальность и адаптивность организма, позволяя его клеткам экспрессировать различные генные продукты, когда этого требуют изменения в окружающей среде. В многоклеточных организмах регуляция экспрессии генов также стимулирует клеточную дифференцировку и морфогенез у эмбриона , что позволяет создавать разнообразные типы клеток из одного и того же генома.
Любой механизм регуляции генов, который резко снижает или полностью предотвращает экспрессию определенного гена. Замалчивание генов может происходить естественным образом во время транскрипции или трансляции . Лабораторные методы часто используют естественные механизмы молчания для достижения нокдауна генов.
Вставка функционального гена или гена дикого типа или части гена в организм (особенно пациента) с целью исправления генетического дефекта либо путем прямой замены дефектного гена, либо путем добавления второй функциональной версии. [16]
Высокопроизводительная технология, используемая для одновременной инактивации, идентификации и сообщения об экспрессии целевого гена в геноме млекопитающих путем введения инсерционной мутации, состоящей из беспромоторного репортерного гена и/или селектируемого генетического маркера, фланкированного вышестоящим сайтом сплайсинга и нижележащая полиаденилированная терминирующая последовательность.
1. В любом данном организме - единый репродуктивный цикл или фаза между двумя последовательными репродуктивными событиями, т. е. между воспроизводством отдельного организма и потомством этого воспроизводства; или фактическая или средняя продолжительность времени, необходимая для завершения одного репродуктивного цикла, либо для конкретной линии, либо для популяции или вида в целом.
2. В данной популяции — те особи (часто, но не обязательно, живущие одновременно), которые в равной степени удалены от данного общего предка в силу одинакового числа репродуктивных событий, произошедших между ними и этим предком. [16]
Набор правил, по которым информация, закодированная в нуклеиновых кислотах , преобразуется живыми клетками в белки . Эти правила определяют, как последовательности триплетов нуклеотидов , называемые кодонами, определяют, какая аминокислота будет добавлена следующей во время синтеза белка . Подавляющее большинство живых организмов используют один и тот же генетический код (иногда называемый «стандартным» генетическим кодом ), но существуют варианты кодов .
Любая болезнь, заболевание или другая проблема со здоровьем, непосредственно вызванная одним или несколькими аномалиями в геноме организма, которые являются врожденными (присутствующими при рождении) и не приобретенными в более позднем возрасте. Причины могут включать мутацию одного или нескольких генов или хромосомные аномалии, такие как анеуплоидия определенной хромосомы. Ответственная мутация может возникнуть спонтанно во время эмбрионального развития или может быть унаследована от одного или обоих родителей, и в этом случае генетическое нарушение также классифицируется как наследственное заболевание. Хотя сама аномалия присутствует еще до рождения, фактическое заболевание, которое она вызывает, может развиться гораздо позже в жизни; некоторые генетические нарушения не обязательно гарантируют возможное заболевание, а просто увеличивают риск его развития.
Мера генетического расхождения между видами, популяциями внутри вида или особями, используемая особенно в филогенетике для выражения либо времени, прошедшего с момента существования общего предка , либо степени дифференциации последовательностей ДНК, составляющих геномы каждой популяции, или индивидуальный.
Также генетическая модификация или генетические манипуляции .
Прямые, преднамеренные манипуляции с генетическим материалом организма с использованием любого из множества биотехнологических методов, включая вставку или удаление генов, перенос генов внутри вида и между видами, мутацию существующих последовательностей и создание новых последовательностей с использованием искусственных синтез генов. Генная инженерия включает в себя широкий набор технологий, с помощью которых генетический состав отдельных клеток, тканей или целых организмов может быть изменен для различных целей, обычно для изучения функций и экспрессии отдельных генов, для производства гормонов, вакцин и других лекарства, а также создавать генетически модифицированные организмы для использования в исследованиях и сельском хозяйстве.
Специфический, легко идентифицируемый и обычно высокополиморфный ген или другая последовательность ДНК с известным расположением на хромосоме, которая может быть использована для идентификации обладающего им индивидуума или вида.
Любая рекомбинация или обмен генетическим материалом внутри отдельного организма или между особями одного или разных видов, особенно тот, который создает генетические вариации. В самом широком смысле этот термин охватывает разнообразный класс встречающихся в природе механизмов, с помощью которых последовательности нуклеиновых кислот копируются или физически переносятся в различные генетические среды, включая гомологичную рекомбинацию во время мейоза или митоза или как нормальную часть репарации ДНК; события горизонтального переноса генов, такие как бактериальная конъюгация, вирусная трансдукция или трансформация ; или ошибки в репликации ДНК или делении клеток. Искусственная рекомбинация занимает центральное место во многих методах генной инженерии, позволяющих производить рекомбинантную ДНК .
Избыточное кодирование двух или более различных генных продуктов, которые в конечном итоге выполняют одну и ту же биохимическую функцию. Мутации в одном из этих генов могут оказывать меньшее влияние на приспособленность, чем можно было бы ожидать, поскольку избыточные гены часто компенсируют любую потерю функции и устраняют любое приращение функции.
График , показывающий регуляторную сложность экспрессии генов. Вершины (узлы) представлены различными регуляторными элементами и продуктами генов, а ребра (связи) представлены их взаимодействиями. Эти сетевые структуры также представляют функциональные отношения, аппроксимируя скорость транскрипции генов .
Также тестирование ДНК или генетический скрининг .
Широкий класс различных процедур, используемых для выявления особенностей конкретных хромосом, генов или белков человека с целью определения происхождения или происхождения , диагностики уязвимости к наследственным заболеваниям или обнаружения мутантных аллелей, связанных с повышенным риском развития генетических нарушений. Генетическое тестирование широко используется в медицине, сельском хозяйстве и биологических исследованиях.
Любой организм, генетический материал которого был изменен с помощью методов генной инженерии, особенно таким образом, который не происходит естественным путем в результате спаривания или естественной генетической рекомбинации.
Полный набор генетического материала, содержащегося в хромосомах организма, органеллы или вируса . Этот термин также используется для обозначения коллективного набора генетических локусов, общих для каждого члена популяции или вида, независимо от различных аллелей, которые могут присутствовать в этих локусах у разных людей.
Общее количество ДНК, содержащееся в одной копии генома, обычно измеряется по массе (в пикограммах или дальтонах ) или по общему количеству пар оснований (в килобазах или мегабазах ). Для диплоидных организмов размер генома часто используется как синоним C-значения.
ДНК, содержащаяся в хромосомах, в отличие от внехромосомной ДНК, содержащейся в отдельных структурах, таких как плазмиды или органеллы, такие как митохондрии или хлоропласты.
Эпигенетическое явление, вызывающее экспрессию генов способом, зависящим от конкретного родителя, от которого этот ген был унаследован. Это происходит, когда эпигенетические метки, такие как метилирование ДНК или гистонов, устанавливаются или «впечатываются» в зародышевые клетки родительского организма и впоследствии сохраняются посредством клеточных делений в соматических клетках потомства организма; в результате ген в потомстве, унаследованный от отца, может экспрессироваться иначе, чем другая копия того же гена, унаследованная от матери.
Способность некоторых химических агентов вызывать повреждение генетического материала внутри живой клетки (например, посредством одно- или двухцепочечных разрывов, сшивания или точечных мутаций ), что может привести или не привести к постоянной мутации . Хотя все мутагены генотоксичны, не все генотоксичные соединения являются мутагенными.
Процесс определения различий в генотипе человека путем изучения последовательностей ДНК в геноме человека с помощью биоанализа и сравнения их с последовательностями другого человека или эталонной последовательностью.
Любая клетка, дающая начало гаметам организма, размножающегося половым путем . Зародышевые клетки — это сосуды для генетического материала, который в конечном итоге будет передан потомкам организма, и их обычно отличают от соматических клеток , которые полностью отделены от зародышевой линии.
1. В многоклеточных организмах субпопуляция клеток, которые способны передавать свой генетический материал потомству организма и поэтому (по крайней мере теоретически) отличаются от соматических клеток , которые не могут передавать свой генетический материал кроме своей собственной непосредственной митотической дочерней клетки . клетки. Клетки зародышевой линии называются половыми клетками.
2. Линия зародышевых клеток, охватывающая многие поколения и содержащая генетический материал, переданный человеку от его предков.
Единица длины нуклеиновой кислоты , равная одному миллиарду (1 × 109 ) оснований в одноцепочечных молекулах или один миллиард пар оснований в дуплексных молекулах, таких как двухцепочечная ДНК.
Любая аминокислота, которая может быть преобразована в глюкозу посредством глюконеогенеза, в отличие от кетогенных аминокислот, которые могут быть преобразованы в кетоновые тела. У человека 18 из 20 аминокислот являются глюкогенными; только лейцин и лизин не являются таковыми. Пять аминокислот ( фенилаланин , изолейцин , треонин , триптофан и тирозин ) являются как глюкогенными, так и кетогенными.
Цепь метаболических реакций, приводящая к образованию глюкозы из некоторых неуглеводных углеродных субстратов, включая глюкогенные аминокислоты. Это один из двух основных путей , используемых большинством животных для поддержания уровня сахара в крови (второй — гликогенолиз), особенно в периоды голодания, голодания и интенсивных физических упражнений.
Метаболический путь , в котором углеводные сахара, такие как глюкоза, расщепляются на более простые молекулы, высвобождая химическую энергию, которая затем может быть использована для различных клеточных функций. В серии из десяти ферментативно-катализируемых реакций каждая молекула глюкозы превращается в две молекулы пирувата , причем освобождающаяся при этом свободная энергия одновременно используется для образования высокоэнергетических связей в двух молекулах восстановленного никотинамидадениндинуклеотида (НАДН). и две молекулы аденозинтрифосфата (АТФ). В аэробных условиях пируват и НАДН дополнительно окисляются в митохондриях ; в анаэробных условиях НАДН сам впоследствии восстанавливает пируват до лактата .
Любое химическое соединение, в котором молекула углевода ковалентно связана с другой молекулой, содержащей гидроксильную группу (включая другие углеводы), посредством одной или нескольких гликозидных связей C–O . Когда обе молекулы представляют собой углеводы, гликозид представляет собой дисахарид или полисахарид . [11]
Пуриновая нуклеобаза , используемая в качестве одной из четырех стандартных нуклеобаз как в молекулах ДНК, так и в РНК . Гуанин образует пару оснований с цитозином.
Доля азотных оснований в нуклеиновой кислоте , которые являются гуанином ( G ) или цитозином ( C ), обычно экспрессируются в процентах. Молекулы ДНК и РНК с более высоким содержанием GC обычно более термостабильны , чем молекулы с более низким содержанием GC, из-за молекулярных взаимодействий, которые происходят во время укладки оснований. [23]
Один из четырех стандартных нуклеозидов , используемых в молекулах РНК , состоящий из гуанинового основания, азот N 9 которого связан с углеродом C 1 сахара рибозы . Гуанин, связанный с дезоксирибозой, известен как дезоксигуанозин, версия, используемая в ДНК.
Любой представитель класса АТФ-зависимых моторных белков , которые направленно движутся вдоль основной цепи ДНК и катализируют разделение двух комплементарных цепей двухцепочечных молекул, обеспечивая выполнение широкого спектра жизненно важных процессов, например, транскрипции , репликации и репарации. . [16]
В диплоидном организме имеется только один аллель в данном генетическом локусе (обычно их два). Гемизиготность может наблюдаться, когда в нормальной диплоидной клетке или организме присутствует только одна копия хромосомы, или когда сегмент хромосомы, содержащий одну копию аллеля, удален, или когда ген расположен на половой хромосоме в гетерогаметном организме . пол (при котором половые хромосомы не существуют в совпадающих парах); например, у мужчин с нормальными хромосомами почти все Х-сцепленные гены называются гемизиготными, поскольку имеется только одна Х-хромосома , а на Y-хромосоме существует лишь несколько таких же генов .
Хранение, передача и выражение молекулярной информации в биологических организмах [16] , проявляющееся в передаче фенотипических признаков от родителей к потомству посредством полового или бесполого размножения . Говорят, что потомственные клетки или организмы наследуют генетическую информацию своих родителей.
Белок или белковый домен, состоящий из двух разных полипептидов , спаренных друг с другом в четвертичной структуре мультимерного комплекса. [4] Контрастный гомодимер .
Многоядерная клетка, содержащая ядра с разными генотипами, образующаяся в результате слияния двух или более генетически различных клеток либо естественным путем (например, при определенных типах полового размножения ), либо искусственно (например, при генной инженерии ). [11]
Экспрессия чужеродного гена или любой другой чужеродной последовательности ДНК в организме-хозяине, который в природе не содержит тот же ген. Вставка чужеродных трансгенов в гетерологичных хозяев с использованием рекомбинантных векторов является распространенным биотехнологическим методом изучения структуры и функции генов.
В диплоидном организме имеется два разных аллеля в одном генетическом локусе. В сокращении генетики гетерозиготные генотипы представлены парой несовпадающих букв или символов, часто прописной буквой (обозначающей доминантный аллель) и строчной буквой (обозначающей рецессивный аллель ), например «Aa» или «Bb». Контраст гомозиготный .
Изучение или анализ микроскопической анатомии биологических тканей или клеток внутри тканей, в частности, с использованием специализированных методов для различения структур и функций на основе визуальной морфологии и дифференциального окрашивания. На практике этот термин иногда используется в более широком смысле и включает в себя цитологию.
Любой представитель класса высокощелочных белков , отвечающих за упаковку ядерной ДНК в структурные единицы, называемые нуклеосомами в эукариотических клетках. Гистоны являются основными белковыми компонентами хроматина, где они объединяются в восьмичленные комплексы, действующие как «катушки», вокруг которых наматывается линейная молекула ДНК. Они играют важную роль в регуляции и экспрессии генов.
гистоновое ядро
Также гистоновый октамер и коровая частица .
Комплекс из восьми белков-гистонов, вокруг которых двухцепочечная ДНК обертывается внутри нуклеосомы . Канонический октамер гистонов состоит из двух гистонов H2A , H2B , H3 и H4 , которые соединяются друг с другом симметрично, образуя шарообразный кластер, вокруг которого ДНК обвивается посредством взаимодействия с поверхностными доменами гистонов, хотя варианты гистонов могут заменять их. их аналоги в определенных контекстах.
(линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Не имеет единой центромеры, а имеет несколько мест сборки кинетохор, рассредоточенных по всей длине хромосомы. При делении клеток хроматиды голоцентрических хромосом расходятся параллельно и не образуют классических V-образных структур, типичных для моноцентрических хромосом.
Любой класс последовательностей ДНК длиной около 180 пар оснований, встречающийся вблизи 3'-конца некоторых эукариотических генов и кодирующий домен из 60 аминокислот, который способен связываться с ДНК или РНК посредством характерного мотива спираль-поворот-спираль. в белках, содержащих его. Гены, содержащие гомеобокс, транслируются в белки, содержащие гомеодомен, которые обычно регулируют транскрипцию или трансляцию путем связывания с другими генами или информационными РНК, содержащими специфические элементы, чувствительные к гомеобоксу. Продукты многих гомеозисных генов, примером которых являются Hox-гены, имеют решающее значение в путях развития. [4]
Тип домена, связывающего нуклеиновую кислоту, обычно длиной 60 аминокислот, обнаруженный в некоторых эукариотических белках , характеризующийся высококонсервативным мотивом спираль-поворот-спираль , который с сильным сродством связывается с основной цепью специфических последовательностей распознавания в молекулах ДНК или РНК. . Белок может иметь один или несколько гомеодоменов, обычно расположенных ближе к С-концу содержащего его полипептида. Многие гомеодомен-содержащие белки действуют как факторы транскрипции , связываясь с последовательностями внутри промоторов и блокируя или привлекая другие белки, такие как РНК-полимераза , в комплекс инициации транскрипции . Гомеодомены — это переведенные версии гомеобоксов, хотя эти термины часто используются как синонимы.
Белок или белковый домен, состоящий из двух идентичных полипептидов , спаренных друг с другом в четвертичной структуре мультимерного комплекса. [4] Контрастный гетеродимер .
Набор из двух совпадающих хромосом, одной материнской и одной отцовской, которые соединяются друг с другом внутри ядра во время мейоза . Они имеют одинаковые гены в одних и тех же локусах, но могут иметь разные аллели.
Тип генетической рекомбинации, при которой происходит обмен нуклеотидными последовательностями между двумя сходными или идентичными («гомологичными») молекулами ДНК, особенно между гомологичными хромосомами. Этот термин может относиться к рекомбинации, которая происходит как часть любого из ряда различных клеточных процессов, чаще всего восстановления ДНК или хромосомного кроссовера во время мейоза у эукариот и горизонтального переноса генов у прокариот. Контрастная негомологичная рекомбинация .
В диплоидном организме имеется два идентичных аллеля в данном генетическом локусе. В генетике гомозиготные генотипы обозначаются парой совпадающих букв или символов, таких как «АА» или «аа». Контраст гетерозиготный .
Любой процесс, посредством которого генетический материал передается между одноклеточными и/или многоклеточными организмами, кроме вертикальной передачи от родителя к потомству, например бактериальная конъюгация .
Любой конститутивный ген, который транскрибируется на относительно постоянном уровне во многих или всех известных состояниях и типах клеток. Продукты генов домашнего хозяйства обычно играют решающую роль в поддержании целостности клеток и основных метаболических функций. Обычно предполагается, что на их экспрессию не влияют экспериментальные или патологические условия.
Подмножество высококонсервативных гомеобокс-содержащих генов, которые необходимы для правильной организации строения тела у развивающихся эмбрионов животных, гарантируя формирование правильных структур в правильных местах. Hox-гены обычно располагаются на хромосоме в виде тандемных массивов и экспрессируются последовательно во время развития, при этом последовательность активации генов соответствует их физическому расположению внутри генома и/или физическому расположению тканей, в которых они экспрессируются, вдоль передней части организма. – задняя ось. [4]
Совместный международный научно-исследовательский проект, целью которого является секвенирование всей хромосомной ДНК, идентификация и картирование всех генов в клетках человека и, в конечном итоге, сборка полного эталонного генома человеческого вида. Проект был запущен в 1990 году консорциумом федеральных агентств, университетов и исследовательских институтов и был объявлен завершенным в 2003 году. Поскольку каждый отдельный человек имеет уникальный геном, готовый эталонный геном представляет собой мозаику последовательностей , полученных путем отбора образцов ДНК из тысяч людей по всему миру и не представляет какого-либо отдельного человека.
Потомство , возникающее в результате объединения качеств двух организмов разных родов , видов , пород или разновидностей путем полового размножения . Гибриды могут возникать естественным или искусственным путем, например, при селекции домашних животных и растений. Репродуктивные барьеры обычно предотвращают гибридизацию между отдаленно родственными организмами или, по крайней мере, гарантируют, что гибридное потомство будет стерильным, но плодовитые гибриды могут привести к видообразованию .
1. Процесс получения гибридного организма из двух организмов разных родов, видов, пород или разновидностей.
2. Процесс, при котором две или более одноцепочечные молекулы нуклеиновой кислоты с комплементарными нуклеотидными последовательностями спариваются друг с другом в растворе, образуя двухцепочечные или трехцепочечные молекулы посредством образования водородных связей между комплементарными нуклеиновыми основаниями каждой цепи. В некоторых лабораторных условиях, особенно в тех, в которых длинные цепи гибридизуются с короткими олигонуклеотидными праймерами , гибридизацию часто называют отжигом.
3. Этап некоторых экспериментальных анализов, на котором препарат одноцепочечной ДНК или РНК добавляется к поверхности массива и отжигается с комплементарным зондом гибридизации.
Мутантный аллель, который обеспечивает субнормальную экспрессию нормального фенотипа гена, например, кодируя нестабильный фермент, который слишком быстро деградирует, чтобы полностью выполнять свою функцию, но который, тем не менее, функционален в некоторых ограниченных возможностях, образуясь в количествах, достаточных для медленного протекания его реакции. или на низком уровне. [4]
Встречающееся в природе неканоническое пуриновое нуклеиновое основание , которое используется в некоторых молекулах РНК и образует пары со стандартными нуклеиновыми основаниями в явлении, известном как спаривание оснований качания . Его нуклеозидная форма известна как инозин, поэтому его обычно сокращают буквой I в последовательности.
Схематический или схематический кариотип всего набора хромосом внутри клетки или генома, в котором аннотированные иллюстрации изображают каждую хромосому в ее наиболее идеализированной форме (например, с прямыми линиями и явными центромерами), чтобы облегчить идентификацию последовательностей и структурных особенностей. и физические расстояния, которые могут быть менее заметны на микрофотографиях реальных хромосом.
(научного эксперимента или исследования) Проводится, производится или анализируется посредством компьютерного моделирования или симуляции, в отличие от реальных испытаний.
(научного эксперимента или биологического процесса) Происходящий или созданный в естественной, неконтролируемой обстановке или в естественном или исходном положении или месте, а не в чужеродной клетке или типе ткани или в искусственной среде.
(научного эксперимента или биологического процесса) Происходящий или возникший в лабораторном сосуде или другой контролируемой искусственной среде, например, в пробирке или чашке Петри, а не внутри живого организма или в естественных условиях.
(научного эксперимента или биологического процесса) Происходящий или возникающий внутри клеток или тканей живого организма; или, в самом широком смысле, в любой естественной, неконтролируемой обстановке. Сравните ex vivo и in vitro .
1. (гена или последовательности) Читается или транскрибируется в той же рамке считывания , что и другой ген или последовательность; не требуется сдвиг рамки считывания для обеспечения разборчивости или получения функционального пептида .
Любая нуклеотидная последовательность, которая естественным или искусственным образом вставлена в другую последовательность. Этот термин используется, в частности, для обозначения части мобильного элемента , которая кодирует белки, непосредственно участвующие в процессе транспозиции, например фермент транспозазу . Кодирующая область в мобильной инсерционной последовательности обычно фланкирована короткими инвертированными повторами, а структура более крупных мобильных элементов может включать пару фланкирующих инсерционных последовательностей, которые сами по себе являются инвертированными.
Изменение последовательности ДНК путем вставки в последовательность одного или нескольких нуклеотидов природного или искусственного происхождения. В зависимости от точного местоположения вставки в целевой последовательности, вставки могут частично или полностью инактивировать или даже активировать генный продукт или биохимический путь или же они могут быть нейтральными , что вообще не приводит к существенным изменениям. Многие методы генной инженерии основаны на вставке экзогенного генетического материала в клетки-хозяева с целью изучения функции и экспрессии генов. [4]
Любой из класса мембранных белков , которые постоянно встроены в клеточную мембрану или прикреплены к ней (в отличие от тех, которые прикреплены только временно ). Интегральные мембранные белки можно подразделить на интегральные политопные белки, которые охватывают всю мембрану, и интегральные монотопные белки, которые прикрепляются только к одной стороне.
Любой представитель класса интегральных мембранных белков, которые каким-либо образом постоянно прикреплены к одной стороне клеточной мембраны, но не полностью покрывают мембрану. Контрастный интегральный политопный белок .
Любой представитель класса интегральных мембранных белков, которые охватывают всю клеточную мембрану, простираясь от внутренней или цитозольной стороны мембраны до внешней или внеклеточной стороны. Трансмембранные белки обычно имеют гидрофильные домены, открытые с каждой стороны, а также один или несколько гидрофобных доменов, пересекающих неполярное пространство внутри липидного бислоя, на основании чего их далее классифицируют как однопроходные или многопроходные мембранные белки. По существу, многие трансмембранные белки функционируют как закрытые каналы или транспортеры , разрешая или запрещая движение определенных молекул или ионов через мембрану, часто претерпевая при этом конформационные изменения, или как рецепторы в клеточных сигнальных путях. Контрастный интегральный монотопный белок .
Мобильный генетический элемент, состоящий из генной кассеты, содержащей ген сайт-специфической рекомбиназы , сайты специфического узнавания интегразы и промотор , который управляет экспрессией одного или нескольких генов, придающих клетке-хозяину адаптивные признаки. Интегроны обычно существуют в форме кольцевых эписомальных фрагментов ДНК, посредством которых они способствуют быстрой адаптации бактерий, обеспечивая горизонтальный перенос генов устойчивости к антибиотикам между различными видами бактерий. [4]
Любая последовательность одной или нескольких аминокислот в полипептиде- предшественнике , которая вырезается в результате сплайсинга белка во время посттрансляционной модификации и, следовательно, отсутствует в зрелом белке, аналогично интронам, сплайсированным из транскриптов РНК. [4] Контрастный экстеин .
Любое химическое соединение (например, бромид этидия ), которое нарушает выравнивание и спаривание оснований в комплементарных цепях молекулы ДНК, встраиваясь между основаниями. [2]
Вставка, естественная или искусственная, химических соединений между плоскими основаниями молекулы ДНК, которая обычно разрушает водородные связи, необходимые для спаривания оснований.
межклеточный
Между двумя и более ячейками. Контраст внутриклеточный ; см. также внеклеточный .
межцистронная область
Любая последовательность ДНК, расположенная между стоп-кодоном одного гена и старт-кодоном следующего гена в полицистронной единице транскрипции. [4] См. также межгенная область .
пересекать
Скрещивание, при котором родители мужского и женского пола гетерозиготны по определенному локусу. [4]
Сокращенная пауза в активности, связанной с делением клеток, которая возникает во время мейоза у некоторых видов между первым и вторым мейотическим делением (т. е. мейозом I и мейозом II). Во время интеркинеза репликация ДНК не происходит, в отличие от нормальной интерфазы, которая предшествует мейозу I и митозу . [4]
Последовательность, присутствующая в некоторых информационных РНК , которая позволяет распознавать рибосому и , таким образом, инициировать трансляцию даже при отсутствии 5'-кэпа, который у эукариот в противном случае необходим для сборки инициирующего комплекса. Элементы IRES часто располагаются в 5'-нетранслируемой области, но могут быть обнаружены и в других положениях.
Все стадии клеточного цикла, за исключением деления клеток. Типичная клетка проводит большую часть своей жизни в интерфазе, во время которой она осуществляет повседневную метаболическую деятельность , а также полную репликацию своего генома при подготовке к митозу или мейозу .
внутриклеточный
Внутри клетки или ячеек; т.е. внутри плазматической мембраны . Контраст межклеточного и внеклеточного .
Любая нуклеотидная последовательность внутри функционального гена, которая удаляется в результате сплайсинга РНК во время посттранскрипционной модификации первичного транскрипта мРНК и, следовательно, отсутствует в окончательной зрелой мРНК. Этот термин относится как к последовательности, существующей внутри молекулы ДНК, так и к соответствующей последовательности в транскриптах РНК. Контрастный экзон .
Складывание мембраны внутрь клетки или органеллы или листа клеток внутрь развивающегося эмбриона, ткани или органа, образующее отчетливый выстланный мембраной карман. В случае отдельных клеток инвагинированный карман может полностью отделиться от исходной мембраны, создавая мембраносвязанный везикулы внутри клетки, как при эндоцитозе. [11]
Нуклеотидная последовательность , следующая за той же цепью , имеет собственный обратный комплемент . Исходная последовательность и обратный комплемент могут быть разделены любым количеством нуклеотидов или могут находиться непосредственно рядом друг с другом; в последнем случае составная последовательность также называется палиндромной последовательностью . Инвертированные повторы по определению самодополнительны , и это свойство включает их во многие биологические функции и дисфункции. Contrast direct repeat .
Тип трансмембранного белкового комплекса, который образует водную пору или канал, охватывающий липидный бислой мембраны, через который определенные неорганические электрически заряженные ионы могут диффундировать по своим электрохимическим градиентам. [6]
Любое химическое соединение или макромолекула, которая облегчает перемещение ионов через биологические мембраны, или, более конкретно, любые химические соединения, которые обратимо связывают электрически заряженные атомы или молекулы. Многие ионофоры представляют собой жирорастворимые белки , которые катализируют транспорт одновалентных и двухвалентных катионов через гидрофобные липидные бислои, окружающие клетки и везикулы. [11]
Большой участок геномной ДНК с относительно однородным составом пар оснований, отличающийся от других участков долей пар G - C или A - T . Геномы большинства растений и позвоночных животных состоят из разных классов изохор, богатых GC и AT. [4]
Тип аномальной хромосомы, при которой плечи хромосомы являются зеркальным отражением друг друга. Формирование изохромосомы эквивалентно одновременным событиям дупликации и делеции, так что две копии либо длинного, либо короткого плеча составляют результирующую хромосому.
Любой фермент из класса, который катализирует превращение молекулы из одного изомера в другой, так что продукт реакции имеет ту же молекулярную формулу, что и исходный субстрат, но отличается связностью или пространственным расположением его атомов.
изомерные гены
Два или более гена, которые эквивалентны и избыточны в том смысле, что, несмотря на кодирование различных генных продуктов, каждый из них приводит к одному и тому же фенотипу , если установлен в одном и том же генетическом фоне. Если в одном генотипе присутствует несколько изомерных генов, они могут иметь как кумулятивный, так и некумулятивный вклад в фенотип. [16]
Любая последовательность ДНК, которая, по-видимому, не имеет известной биологической функции или действует таким образом, что не оказывает положительного или отрицательного влияния на приспособленность генома, в котором она расположена. Этот термин когда-то использовался более широко для обозначения всей некодирующей ДНК , хотя позже было обнаружено, что большая часть ее имеет определенную функцию; в современном использовании это слово обычно относится к поврежденным или рудиментарным последовательностям и эгоистичным генетическим элементам , включая интроны, псевдогены , межгенную ДНК и фрагменты транспозонов и ретровирусов , которые вместе составляют значительную часть геномов большинства эукариот. Несмотря на то, что эти последовательности не вносят продуктивного вклада в организм хозяина, они способны бесконечно сохраняться внутри геномов, поскольку недостатки продолжения их копирования слишком малы, чтобы на них мог воздействовать естественный отбор .
мусорная РНК
Любая последовательность, кодируемая РНК, особенно транскрипт , которая, по-видимому, не имеет известной биологической функции или функция которой не оказывает положительного или суммарного отрицательного влияния на приспособленность генома, из которого она транскрибируется. Несмотря на то, что многие некодирующие РНК остаются нетранслируемыми , они по-прежнему выполняют важные функции, тогда как мусорные РНК действительно бесполезны: часто они являются продуктом случайной транскрипции мусорной последовательности ДНК или могут возникнуть в результате посттранскрипционной обработки первичных транскриптов , как в случае с сплайсированные интроны. Мусорная РНК обычно быстро разрушается рибонуклеазами и другими цитоплазматическими ферментами.
Кариотип, который изображает весь набор хромосом в клетке или организме с помощью микрофотографий реальных хромосом, как они появляются in vivo (обычно во время метафазы , в их наиболее конденсированных формах), в отличие от идеализированных иллюстраций хромосом, используемых в идиограммах. Микрофотографии часто по-прежнему располагаются парами и по размеру для облегчения идентификации конкретных хромосом, тогда как в реальном ядре редко наблюдается какая-либо видимая организация.
The number and appearance of chromosomes within the nucleus of a eukaryotic cell, especially as depicted in an organized karyogram or idiogram (in pairs and arranged by size and by position of the centromere). The term is also used to refer to the complete set of chromosomes in a species or individual organism or to any test that detects this complement or measures the chromosome number.
The karyotype of a typical human male, as visualized in a karyogram using Giemsa staining
Any amino acid that can be converted directly into acetyl-CoA, which can then be oxidized for energy or used as a precursor for many compounds containing ketone groups. This is in contrast to the glucogenic amino acids, which can be converted into glucose. In humans, seven of the 20 amino acids are ketogenic, though only leucine and lysine are exclusively ketogenic; the other five (phenylalanine, isoleucine, threonine, tryptophan, and tyrosine) are both ketogenic and glucogenic.
A unit of nucleic acid length equal to one thousand (1×103) bases in single-stranded molecules or one thousand base pairs in duplex molecules such as double-stranded DNA.
Any of a class of enzymes which catalyze the transfer of phosphate groups from high-energy, phosphate-donating molecules such as ATP to one or more specific substrates, a process known as phosphorylation. The opposite process, known as dephosphorylation, is catalyzed by phosphatase enzymes.
Any movement or change in activity by a cell or a population of cells in response to a stimulus, such that the rate of the movement or activity is dependent on the intensity of the stimulus but not on the direction from which the stimulus occurs. Kinesis is often defined as any non-specific, non-directional response, in contrast to taxis and tropism.
A disc-shaped protein complex which assembles around the centromere of a chromosome during prometaphase of mitosis and meiosis, where it functions as the attachment point for microtubules of the spindle apparatus.
knob
В цитогенетике - увеличенная, сильно окрашивающаяся хромомера, которую можно использовать в качестве визуального маркера, позволяющего легко идентифицировать определенные хромосомы в ядре. [4]
Метод генной инженерии, с помощью которого нормальная скорость экспрессии одного или нескольких генов организма снижается либо путем прямой модификации последовательности ДНК, либо путем обработки реагентом, таким как короткий олигонуклеотид ДНК или РНК с последовательностью, комплементарной либо транскрипт мРНК или ген .
Метод генной инженерии, при котором организм модифицируется, чтобы нести гены, которые были выведены из строя («выбиты»), так что их экспрессия нарушается в какой-то момент пути производства генных продуктов, и организм лишается своей нормальной функции. последствия. Контраст стучит .
Высококонсервативный мотив последовательности нуклеиновой кислоты , который действует как сайт узнавания для инициации трансляции в большинстве эукариотических информационных РНК , обычно это последовательность из 10 оснований, непосредственно окружающая и включающая стартовый кодон : GCC R CCAUGG . Когда преинициативный комплекс сканирует транскрипт, узнавание этой последовательности (или близкого варианта) заставляет комплекс приступить к полной сборке рибосомы и началу трансляции. Последовательность Козака отличается от других последовательностей распознавания, имеющих отношение к трансляции, таких как сайты связывания рибосом и внутренние сайты входа в рибосомы. [24]
Химическое прикрепление высокоселективного вещества, известного как метка , метка или зонд , к конкретной клетке, белку, аминокислоте или другой интересующей молекуле, естественным или искусственным путем, in vivo или in vitro . Естественная маркировка — это основной механизм, с помощью которого биомолекулы специфически идентифицируют другие биомолекулы и взаимодействуют с ними; важные примеры включают метилирование , ацетилирование и убиквитинирование . Маркировка также является распространенным лабораторным методом, где метка обычно представляет собой реакционноспособное производное природного флуоресцентного соединения (например, зеленого флуоресцентного белка ), красителя, фермента, антитела, радиоактивной молекулы или любого другого вещества, которое каким-либо образом делает мишень различимой. Таким образом, помеченные цели отделяются от немаркированного окружения, что позволяет легко их обнаружить, идентифицировать, количественно оценить или изолировать для дальнейшего изучения.
При репликации ДНК зарождающаяся цепь , для которой направление синтеза ДНК-полимеразы направлено в сторону от репликационной вилки , что требует сложного и прерывистого процесса в отличие от упорядоченного и непрерывного синтеза другой зарождающейся цепи, известной как ведущая цепь, которая происходит одновременно. Поскольку ДНК-полимераза работает только в направлении от 5' к 3', но общее направление удлинения цепи отстающей цепи в конечном итоге должно быть противоположным (т.е. от 3' к 5', в сторону репликационной вилки), элонгация должна происходить по непрямому механизму. При этом фермент примаза синтезирует короткие праймеры РНК, комплементарные матричной ДНК, а ДНК-полимераза затем удлиняет загрунтованные сегменты в короткие цепочки нуклеотидов, известные как фрагменты Оказаки . Затем праймеры РНК удаляются и заменяются ДНК, а фрагменты Оказаки соединяются ДНК-лигазой.
При репликации ДНК возникающая цепь , для которой как направление синтеза ДНК-полимеразой, так и направление общего удлинения цепи направлены к репликационной вилке ; т.е. оба происходят в направлении от 5' к 3', что приводит к единому непрерывному процессу удлинения с небольшими перерывами или без них. Напротив, другая возникающая цепь, известная как отстающая цепь, собирается в ходе прерывистого процесса, включающего лигирование коротких фрагментов ДНК , синтезируемых в противоположном направлении, вдали от репликационной вилки. [4]
левый соединительный узел
Также донорское место сплайсинга или донорское место сплайсинга .
Граница между левым концом (условно 5'-концом) интрона и правым (3') концом соседнего экзона в транскрипте пре-мРНК .
В мейозе — первая из пяти подстадий профазы I , следующая за интерфазой и предшествующей зигонеме . При лептонеме реплицированные хромосомы конденсируются из диффузного хроматина в длинные тонкие нити, которые гораздо более заметны внутри ядра .
летальная мутация
Любая мутация , приводящая к преждевременной гибели организма, ее несущего. Рецессивные летальные мутации фатальны только для гомозигот, тогда как доминантные летальные мутации фатальны даже для гетерозигот. [4]
В биохимии — любая молекула, которая связывается или взаимодействует с определенным участком белка или другой биомолекулы, обычно обратимо посредством межмолекулярных сил; [6] или любое вещество, образующее комплекс с биомолекулой в рамках биологического процесса. Связывание специфических лигандов с ДНК или белками важно во многих биохимических путях; например, связывание белок-лиганд может привести к тому, что белок претерпит конформационные изменения, которые изменят его функцию или сродство к другим молекулам.
Класс ферментов, которые катализируют соединение больших молекул, таких как нуклеиновые кислоты , путем образования между ними одной или нескольких химических связей, обычно связей C–C , C–O , C–S или C–N посредством реакций конденсации . Примером может служить ДНК-лигаза, которая катализирует образование фосфодиэфирных связей между соседними нуклеотидами на одной или обеих цепях молекулы ДНК (реакция, известная как лигирование).
Тенденция последовательностей ДНК, физически расположенных рядом друг с другом на одной хромосоме, наследоваться вместе во время мейоза . Поскольку физическое расстояние между ними относительно невелико, вероятность того, что любые две близлежащие части последовательности ДНК (часто локусы или генетические маркеры) будут разделены на разные хроматиды во время хромосомного кроссинговера, статистически очень мала; тогда говорят, что такие локусы более связаны , чем локусы, которые находятся дальше друг от друга. Локусы, находящиеся в совершенно разных хромосомах, называются совершенно несвязанными . Стандартной единицей измерения генетического сцепления является сантиморган (см).
1. Короткий синтетический дуплекс ДНК, содержащий последовательность узнавания определенного фермента рестрикции . [4] При молекулярном клонировании линкеры часто намеренно включаются в рекомбинантные молекулы, чтобы сделать их легко модифицируемыми, позволяя расщеплять и вставлять чужеродные последовательности в точных местах. Сегмент сконструированной плазмиды , содержащий множество таких сайтов рестрикции, иногда называют полилинкером .
2. Участок хромосомной ДНК, соединяющий соседние нуклеосомы путем связывания с гистоном Н1 . [4]
Число раз, когда две нити кольцевой двойной спиральной молекулы ДНК пересекают друг друга, эквивалентно числу скручивания (которое измеряет кручение двойной спирали) плюс числу извиваний (которое измеряет степень сверхспирали). Связующее число замкнутой молекулы невозможно изменить без разрыва и повторного соединения нитей. Молекулы ДНК, которые идентичны, за исключением числа связей, известны как топологические изомеры . [4]
В конденсированных хромосомах, где расположение центромеры создает два сегмента или «плеча» неравной длины, более длинное из двух плеч хроматиды. Контрастная короткая рука .
Любой представитель большого семейства ретротранспозонов , не относящихся к LTR , которые вместе составляют один из наиболее распространенных мобильных генетических элементов в геномах эукариот. Каждая вставка LINE имеет длину в среднем около 7000 пар оснований.
Класс некодирующих РНК , состоящий из всех транскриптов длиной более 200 нуклеотидов , которые не транслируются . Этот предел отличает днРНК от многочисленных более мелких некодирующих РНК, таких как микроРНК . См. также длинную промежуточную некодирующую РНК .
Разрушение и разложение плазматической мембраны , окружающей клетку, или, в более общем смысле, любой связанной с мембраной органеллы или пузырька , особенно под действием осмотических , ферментативных или других химических или механических процессов, которые нарушают целостность мембраны и тем самым вызывают беспрепятственный обмен содержимого. внутриклеточного и внеклеточного пространства. Лизис обычно подразумевает полную и необратимую утрату внутриклеточной организации в результате высвобождения внутренних компонентов клетки и разбавления цитозоля и, следовательно, гибель клетки. Такая клетка называется лизированной , а жидкость, содержащая содержимое лизированных клеток (обычно включая нуклеиновые кислоты , белки и многие другие органические молекулы), называется лизатом . Лизис может происходить как естественным, так и искусственным путем и является нормальной частью жизненного цикла клетки.
^ «Говорящий глоссарий геномных и генетических терминов». genome.gov. 8 октября 2017 г. Проверено 8 октября 2017 г.
^ abcde Klug, Уильям С.; Каммингс, Майкл Р. (1986). Концепции генетики (2-е изд.). Гленвью, Иллинойс: Скотт, Форесман и компания. ISBN0-673-18680-6.
^ аб Ассери, Дэвид В. «Структура ДНК: семейства спиралей A-, B- и Z-ДНК». Люнгбю, Дания: Датский технический университет.
^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am King, Роберт С.; Стэнсфилд, Уильям Д.; Маллиган, Памела К. (2006). Генетический словарь (7-е изд.). Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. ISBN978-0-19-530762-7.
^ "Словарь генетических терминов NCI" . Национальный институт рака . Редакционная коллегия PDQ® по генетике рака.
^ abcdefghi Альбертс, Брюс; Джонсон, Александр; Льюис, Джулиан; Рафф, Мартин; Робертс, Кейт; Уолтер, Питер (2002). Молекулярная биология клетки (доступно в Национальном центре биотехнологической информации) (4-е изд.). Нью-Йорк: Garland Science.
^ Аб Левин, Бенджамин (2003). Гены VIII . Река Аппер-Седл, Нью-Джерси: Пирсон Прентис Холл. ISBN0-13-143981-2.
^ Лопес Д., Вламакис Х., Колтер Р. (июль 2010 г.). «Биопленки». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 2 (7): а000398. doi : 10.1101/cshperspect.a000398. ПМК 2890205 . ПМИД 20519345.
^ Момени Б (июнь 2018 г.). «Разделение труда: как микробы разделяют свою ответственность». Современная биология . 28 (12): 697–699 рэндов. дои : 10.1016/j.cub.2018.05.024 . PMID 29920261. S2CID 49315067.
^ "Словарь терминов, посвященных раку, NCI" . www.cancer.gov . Национальный институт рака. 2 февраля 2011 г.
^ abcdefghijkl Маклин, Норман (1987). Словарь генетики и клеточной биологии. Нью-Йорк: Издательство Нью-Йоркского университета. ISBN0-8147-5438-4.
^ SwissBioPics. «Животная клетка». www.swissbiopics.org . Швейцарский институт биоинформатики (SIB).
^ Нисикава, С. (2007). «Перепрограммирование в цифрах». Природная биотехнология . 25 (8): 877–878. дои : 10.1038/nbt0807-877. PMID 17687365. S2CID 39773318.
^ Коннерли, PL (2010). «Как белки перемещаются через аппарат Гольджи?». Природное образование . 3 (9): 60.
^ Валет, Гюнтер (2005). «Цитомика: вход в биологию биомедицинских клеточных систем». Цитометрия Часть А. 63А (2): 67–68. doi : 10.1002/cyto.a.20110 . ISSN 1552-4922. ПМИД 15657925.
^ Лэки, Дж. М. (2013). Словарь клеточной и молекулярной биологии (5-е изд.). Амстердам: Академическая пресса/Эльзевир. ISBN978-0-12-384931-1.
^ Принс, И.; Маймон, О.; Бен-Гал, И. (2007). «Оценка кластеризации экспрессии генов с помощью меры взаимного информационного расстояния». БМК Биоинформатика . 8 : 111. дои : 10.1186/1471-2105-8-111 . ПМЦ 1858704 . ПМИД 17397530.
^ Альбертс Б., Брэй Д., Хопин К., Джонсон А., Льюис Дж., Рафф М., Робертс К., Уолтер П. (2004). «Ткани и рак» . Основная клеточная биология . Нью-Йорк и Лондон: Garland Science . ISBN978-0-8153-3481-1.
^ «Общество данных функциональной геномики - Общество FGED» .
^ Эдгар, Р; Домрачев М; Лэш, А.Е. (1 января 2002 г.). «Омнибус экспрессии генов: хранилище данных экспрессии генов NCBI и массива гибридизации». Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 207–10. дои : 10.1093/нар/30.1.207. ПМК 99122 . ПМИД 11752295.
^ Козак, М. (февраль 1989 г.). «Модель сканирования для перевода: обновление». Журнал клеточной биологии . 108 (2): 229–241. дои : 10.1083/jcb.108.2.229. ISSN 0021-9525. ПМК 2115416 . ПМИД 2645293.
дальнейшее чтение
Бадд, А. (2012). «Введение в биологию генома: особенности, процессы и структуры». Эволюционная геномика . Методы молекулярной биологии. Том. 855. стр. 3–4. дои : 10.1007/978-1-61779-582-4_1. ISBN 978-1-61779-581-7. ПМИД 22407704.
Внешние ссылки
Говорящий словарь геномных и генетических терминов Национального института исследований генома человека (NHGRI)
Интерактивная маркированная диаграмма животной клетки от SwissBioPics.
